VIRUS RNA

dr. Primasari, SpMK

 KARAKTERISTIK
 merupakan asam nukleat untai tunggal yang terdiri dari unit-unit
pembangun berupa mononukleotida

 Setiap nukleotida terdiri atas satu gugus fosfat, satu gugus pentosa, dan
satu gugus basa Nitrogen (N)

 RNA merupakan hasil transkripsi dari suatu fragmen DNA, sehingga

kedudukan RNA ialah sebagai polimer dan jauh lebih pendek dibanding
DNA

 RNA ditemukan berada di dalam sitoplasma, khususnya di ribosom

 hanya memiliki asam ribonukleat

PICORNAVIRIDA
E
 MORFOLOGI VIRUS
 Berukuran kecil antara 20-40nm

 Tahan terhadap eter

 Single stranded RNA

 Struktur simetri kubikal

 Tidak berenvelop

 Ikosahedral dengan asam nukleat RNA positif dengan berat

molekul antara 2-3 juta dalton.
 Keasamam :
- Enterovirus stabil pada pH asam
- Rinovirus labil pada pH asam
 Terhadap panas :
- Semua enterovirus dan beberapa rhivirus
dinonaktifkan dengan pemanasan pada suhu
55°C selama 30 mnt
 ENTEROVIR
US GROUP

COXSACKIEVIRU ENTEROVIRUSES
POLIOVIRUS S 68-72

ECHOVIRUS PARECHOVIRUS
 POLIOVIRUS
 Penyebab penyakit poliomyelitis
 Penyakit virus yang dalam stadium beratnya menyebabkan
kelumpuhan karena kerusakan sel-sel saraf baik dalam sumsum
tulang, tulang punggung maupun otak.
 Sangat infeksius
 Penularan melalui kontak langsung orang ke orang, dengan
lendir, dahak, feces, yang terinfeksi atau oleh kontak dengan
makanan dan air yang terkontaminasi oleh feces dari individu
lain yang terinfeksi
 Replikasi terjadi di saluran cerna
 Disebut juga penyakit Hiene-Meidin (berdasarkan nama 2 orang penemu)
 TANDA DAN GEJALA
 Berbeda tergantung pada luas infeksi

 Masa inkubasi 7-14 hari

 Infeksi tanpa gejala  terjadi paling umum 91-96%

 Sekitar 5% pasien yang terinfeksi berkembang menjadi

minor gejala  demam, malaise, sakit tenggorok,
anoreksia, myalgia dan sakit kepala
 TANDA DAN GEJALA
 Terbagi menjadi 3 polio :
1. Polio yang melumpuhkan (paralytic) :
- terjadi pada kira-kira 2% dari orang-orang yang terinfeksi
dengan virus polio
- merupakan penyakit yang jauh lebih serius
- Gejala-gejala terjadi sebagai akibat dari sistim syaraf dan
infeksi peradangan sumsum tulang belakang (spinal cord)
- Pasien yang telah sembuh dari polio, dapat berkembang
menjadi postpoliomyelitis stl 20-40 th setelah terinfeksi
 TANDA DAN GEJALA
2. Polio yang tidak melumpuhkan (nonparalytic) :
- asymptomatic atau mengembangkan
- hanya muncul gejala-gejala seperti flu yang
ringan, termasuk kelelahan, malaise, demam,
sakit kepala,sakit tenggorokan, dan muntah,
nyeri ekstremitas bawah.
 TANDA DAN GEJALA
3. Sindrom pasca polio

- Sekelompok tanda atau gejala yang bisa menyebabkan

kelumpuhan pada seseorang setelah beberapa tahun

mengalami serangan polio.

- Biasanya, kelumpuhan ini akan datang 15-35 tahun

- Beberapa gejala umum dari sindrom pasca polio dapat berupa

kelemahan sendi, sulit bernapas atau sulit menelan, depresi, serta

mudah lelah.
 PENYEBAB
 Disebabkan oleh polio virus yang umumnya masuk melalui
makanan atau minuman yang terkontaminasi dengan tinja yang
mengandung virus tersebut, juga dapat melalui tetesan cairan
yang keluar saat penderitanya batuk atau bersin

 Hanya menjangkiti manusia

 Virus polio menjangkiti tenggorokan dan usus

 dapat menyebar ke aliran darah dan menyerang sistem saraf.

 FAKTOR RESIKO
 Mudah terjadi pada anak-anak, wanita hamil, orang dengan
immunocompromised, terutama tanpa program imunisasi dan
hygine yang tidak baik

 Orang tanpa imunisasi gampang tertular apabila  serumah

dengan orang polio, system kekebalan menurun, setelah
bepergian ke tempat orang terjangkiti polio

 Angka mortalitas meningkat pada orang polio dengan

kelumpuhan, krn sering kali tdk dapat bernafas sendiri
 DIAGNOSIS
 Prognosis tergantung kepada jenis polio dan bagian
tubuh yang terkena

 Jika menyerang otak atau korda spinalis 

kegawatdaruratan terjadinya kelumpuhan atau kematian

 Jika tidak menyerang otak atau korda spinalis 

kemungkinan sembuh total

 Diagnosa berdasarkan klinis

 DIAGNOSIS
LABORATORIUM
Isolasi virus
 Spesimen : swab tenggorokan ( sampai 1 mgg sakit) atau swab
rektal/feses, LCS (sampai 6-8 minggu), darah (jarang)
 Menggunakan sel ginjal monyet paling direkomendasikan
 Pertumbuhannya dapat diidentifikasikan dgn beberapa metode :
- Efek sitopatogenik (muncul 3-6 hari)
- Deteksi antigen
- Deteksi gen spesifik dengan PCR
- Deteksi antibodi
 PENCEGAHAN
 Vaksin polio merupakan vaksin wajin untuk
anak di Indonesia

 Ada 2 jenis vaksin Polio :

1. Vaksin Salk  vaksin virus polio yang tidak

aktif

2. Vaksin Sabin  vaksin virus polio hidup

 PENCEGAHAN
 Vaksin polio merupakan vaksin wajin untuk anak di Indonesia
 Ada 2 jenis vaksin Polio :
1. Vaksin Salk  vaksin virus polio yang tidak
aktif
2. Vaksin Sabin  vaksin virus polio hidup

 Kekebalan lebih baik (sampai lebih dari 90%)

 Lebih disukai adalah vaksin Sabin per-oral

 Tidak diberikan pada orang dengan daya tahan tubuh rendah

atau pasien autoimun karena dapat menimbulkan polio
REOVIRIDAE
 MORFOLOGI
 Merupakan virus dengan ukuran 60-80nm

 Double stranded RNA

 Kapsid icosahedral dan merupakan virus naked

 Mempunyai banyak lapisan protein

 Tahan terhadap eter

 Biasanya menyebabkan infeksi di saluran cerna dan saluran nafas

MORFOLOGI
 ROTAVIRUS
 Menginfeksi saluran cerna terutama pada anak-anak sekitar
usia 5 th

 Bisa terkena lebih dr sekali, tp infeksi pertama kali biasanya

lebih parah

 gejala yang muncul diare dan sakit perut  gastroenteritis

[parah

 Dapat menyebabkan kematian ± 500.000 anak di dunia setiap

tahunnya
 SEJARAH
 1973 : Virus diidentifikasi oleh Ruth Bishop dkk

 1974 : Dimanakan oleh Thomas Henry Flewett

 1981 : Rotavirus dari manusia pertama kali

ditumbuhkan dalam kultur sel yang berasal dari ginjal
monyet
KLASIFIKASI DAN
IDENTIFIKASI

Identifikasi menggunakan :
• Tes serologi
• Rotavirus detection kit
• Feces test
 PENYEBARAN DAN
MASA INKUBASI
 Penularan rotavirus ini sangat mudah

 Menyebar melalui kontak dengan feses yang terinfeksi

 Feses – tangan/ mainan – mulut  infeksi

 Masa inkubasi 2 hari

 GEJALA
 Demam
 Muntah
 Diare cair
 Nyeri perut
 Dehidrasi  ditandai dengan mulut kering, menangis
tanpa air mata, merasa haus trs, produksi urine yang
berkurang
 Kadang-kadang dapat disertai dengan darah pada BAB
 PENATALAKSANAAN
 Tidak ada terapi khusus untuk infeksi ini
 Antibiotik tidak akan membantu infeksi rotavirus
 Biasaya infeksi akan sembuh dalam waktu 3-8 hari
 Infeksi ini dapat menjadi berat atau bahkan dapat terjadi
kematian karena faktor dehidrasi
 Jadi dehidrasi merupakan perhatian terbesar untuk
infeksi ini
 VAKSIN
 Ada 2 vaksin rotavirus :
1. Rota Teq • Diberikan peroral
• Tidak memerlukan injeksi
2. Rotarix • Paling efektif jika dosis pertama
diberikan sebelum usia 15 minggu

 Rota Teq (RV5) diberikan tiga kali pada usia 2 bulan, 4

bulan dan 6 bulan
 Rotarix (RV1) diberikan 2x pada usia 2 bulan dan 4
bulan
CORONAVIRIDAE
STRUKTUR DAN KOMPOSISI
 Family Coronaviridae
- Genus Coronavirus
- Genus Torovirus
 Merupakan virus envelop
 Bentuk seperti mahkota/corona matahari bila dilihat dibawah
mikroskop elektron
 120-160 nm
 Virus untai tunggal positif RNA (27-32 kb), ukuran yg besar utk
virus
 Replikasi terjadi di sitoplasma
 Sulit ditumbuhkan dengan kultur
STRUKTUR DAN KOMPOSISI
 Dapat menyebabkan gejala pilek dan severe acut
respiratory sindrom (SARS)

 Morfologi virus ini dibuat oleh peplomer (lonjakan

virus) yang merupakan protein

 Protein yang berkontribusi pada struktur keseluruhan

dari semua coronavirus adalah spike (S), envelope (E),
membran (M) dan nucleocapsid (N).
 SEJARAH
 Coronavirus pertama kali dideskripsikan pada 1960-an dari
rongga hidung pasien flu biasa.
 Virus-virus ini kemudian dinamai human coronavirus 229E
dan human coronavirus OC43.
 Coronavirus terutama menginfeksi saluran pernapasan atas
dan saluran pencernaan mamalia dan burung.
 Enam jenis virus corona yang diketahui saat ini menginfeksi
manusia.
 SEJARAH
 Coronavirus manusia yang paling baru dipublikasikan, SARS-
CoV yang menyebabkan SARS, memiliki patogenesis yang
unik karena menyebabkan infeksi saluran pernapasan atas dan
bawah dan juga dapat menyebabkan gastroenteritis.
 Coronavirus diyakini merupakan penyebabkan tersering dari
semua flu biasa pada manusia dewasa
 Coronavirus bahkan dapat menyebabkan pneumonia, baik
pneumonia virus langsung atau pneumonia bakteri sekunder
 OUTBREAK
 Pada November 2002, pneumonia atipikal yang sangat
menular dan parah diamati di Provinsi Guangdong di Cina
selatan
 Virus ini menyebar ke Hong Kong pada Februari 2003 dengan
pasien seorang dokter yang meninggal 10 hari setelah masuk
ke rumah sakit setempat  kematian misterius
 Wabah serupa terjadi di komunitas lokal yang berbeda
 Virus ini diidentifikasi di Hong Kong, AS dan Jerman pada
Maret 2003
 OUTBREAK
 "Zona panas" yang menjadi warning pada saat itu adalah Vietnam,
Hong Kong, Singapura, Toronto, dan China
 Korban di usia muda dilaporkan Di Hong Kong
 Sekelompok anak muda meninggal karena Sars menimbulkan
kekhawatiran
 Lebih banyak negara melaporkan kasus, termasuk India dan
Afrika Selatan.
 Di Tiongkok, situasinya tampak paling parah
 Di seluruh dunia, 8.450 kasus telah dilaporkan, menyebabkan
810 kematian di 33 negara
REPLIKASI
 REPLIKASI
 Replikasi virus terjadi di sitoplasma
 Virus mengikat sel mell interaksi antara protein S dan reseptor
 Virus masuk ke dlm sel  genom virus RNA keluar dari selaput virus
 Sebagian genom RNA  mRNA dan sebagian lagi sbg template utnuk
sintesa RNA negatif
 Genome yg berfungsi sbg mRNA akan translasi menjadi protein yg
berfungsi sbg pembentuk tubuh virus dan yang berfungsi utk proses
replikasi RNA
 Yang RNA negative akan dijadikan menjadi template sintesa RNA
positif
 Demikian seterusnya proses ini berulang
 RNA positif menjadi banyak  dibungkus oleh protein pembentuk
tubuh voirus  virus baru
 NOVEL HUMAN
 CRORNAVIRUS
Bertahun-tahun para ilmuwan hanya mengetahui 2 virus
corona pada manusia, yaitu HCoV-229E dan HCoV-OC43
 Penemuan SARS-CoV menambah penemuan virus ke3
 Tahun 2004,ada 3 peneliti laboratorium yang menemukan
virus ke 4, disebut NL63, NL dan coronavirus heaven
 Awal 2005 peneliti di Universitas Hongkong menemukan
virus ke5 dari 2 pasien pneumonia  Human coronavirus
HKU1
 Tahun 2012 virus ke6 ditemukan dan diidentifikasi sebagai
Novel Coronavirus 2012 dan sekarang resmi disebut
MERS-CoV (Middle East respiratory syndrome coronavirus )
 DAFTAR HUMAN
CORORNAVIRUS
 Human Coronavirus 229E
 Human Coronavirus OC43
 SARS-CoV
 Human Coronavirus NL63 (HCOV-NL63, Coronavirus
heaven)
 Human Coronavirus HKU1
 MERS-CoV dan HCOV-EM
 TAKSONOMI
 Genus: Alphacoronavirus : type species:
Alphacoronavirus 1
Spesies : Human coronavirus 229E, Human coronavirus
NL63
 Genus : Betacoronavirus : type species: Murine coronavirus
Species:Human coronavirus HKU1, Human coronavirus OC43,
MERS-CoV
 Genus Gammacoronavirus
 Genus Deltacoronavirus
 LABORATPRIUM
 ELISA  tidak dapat melihat ada atau tidaknya infeksi
sebelumnya
 Pemeriksaan darah lengkap
 PCR
 Kultur virus  sulit dilakukan, karena membutuhkan
keahlian lebih
 SEVERE ACUT
RESPIRATORY SYNDROM
(SARS-CoV)
KLB pertama terjadi di Asia Tenggara


Hongkong dan Singapura yang melaporkan pertama


kali
 Penyakit ini berasal dari China
 Berawal dari pasar binatang liar di China  Luwak
sawit (Paradoxurus hermaphroditus), Rakun (Nyctereus
procyonoides)
 SEVERE ACUT
RESPIRATORY SYNDROM
(SARS-CoV)
Juga merupakan virus kelelawar


Kelelawar Rhinolophus sirik



 Tidak dapat dilakukan isolasi pada

virus ini
 Pengambilan sampel untuk
pemeriksaan PCR menggunakan
swan anal
 Serologi
SARS CoV
 KLASIFIKASI
CORONAVIRUS
Order Nidovirales
 Family Coronaviridae
 Genus Coronavirus
 Non-segmented (+) ssRNA virus

 Ada 4 kelompok besar dalam coronavirus:

 kelompok 1- HCoV-229E (6 spesies)
 kelompok 2- HCoV-OC43 (7 spesies)
 grup 3- Avian CoV (1 spesies)
 SARS- CoV (1 spesies)- bertanggung jawab atas epidemiologi
SARS pada tahun 2003
 PATOGENESIS DAN

GEJALA
Virus ini ditularkan melalui saluran pernafasan dan
kontak dengan tinja pasien SARS-CoV
 Infeksi SARS-CoV yang sangat pathogen ini
menyebabkan gejala mirip flu tapi parah dan dapat
berkembang menjadi gangguan pernafasan akut
(ARDS), pneumonia, gagal ginjal dan kematian
 Gejala paling umum :
- Demam
- Batuk dan sesak
 Masa inkubasi 2-11 hari
 PATOGENESIS
 Temuan patologis dari bagian jaringan paru-paru.
 A: Kongesti dan edema paru (pewarnaan Hematoxylin&eosin,
perbesaran asli x100).
 B: Infiltrasi limfositik interstisial derajat ringan. Lesi eksudatif
yang mengatur intra-alveolar kadang-kadang ditemukan.
Pneumosit atipikal terpisah ditunjukkan oleh panah (pewarnaan
H&E, perbesaran asli x200).
 C: Pneumosit multinukleus atipikal kadang-kadang
diidentifikasi. Inklusi virus yang pasti tidak terlihat (pewarnaan
H&E, perbesaran asli x400).
 D: Fibrin trombi sering ditemukan di arteri pulmonalis kecil dan
arteriol (pewarnaan H&E, perbesaran asli x200).
PATOGENESIS DAN
GEJALA
 GEJALA
Perjalanan klinis:
 masa inkubasi pendek (6 hari)
 periode waktu dari paparan hingga timbulnya gejala mulai dari 2 hingga 16
hari
 perawatan intensif biasanya diperlukan sekitar 10 hari setelah timbulnya
gejala
 Secara umum ada 3 fase:
- minggu 1: gejala seperti pilek, demam, mialgia, kedinginan, dan
sakit tenggorokan
- minggu ke-2, demam berulang. Onset diare, dan desaturasi
oksigen
- hanya 20% pasien yang mencapai fase ini, membutuhkan
dukungan ventilasi
Tingkat kematian sekitar 10% setelah infeksi www.health24.com/ images/center/sars_flu.j
APAKAH SARS-CoV MERUPAKAN
IMUNOPATOGENESIS
 TERAPI ANTIVIRUS DAN
VAKSIN
 Saat ini belum ada terapi antivirus yang pasti untuk SARS
CoV
 Vaksin sedang dalam proses pengembangan:
 Di China, tahap ke2 percobaan pada manuasia dengan
menggunakan virus SARS CoV yang dilemahkan
 terdapat masalah keamanan
 Uji coba vaksin pertama di USA, dengan menggunakan
rekombinan plasmid utnukmekspresi protein S
 Eksperimental baksin berbasis Virus Stomatitis
Vesikuler (VSV) yang dilemahkan
 HOST ASAL SARS CoV
Musang Paguma larvata
 Pada awalnya ditemukan virus SARS dengan metode
PCR dari 6 spesies
 SARS-CoV ini mirip dengan SARS-CoV pada manusia
dengan kesamaan nuklotida hampir > 99%
 Akhirnya sebanyak 10.000 musang dan hewan lain yang
dicurigai membawa virus ini dibunuh
 Musang sawit bukan reservoir SARS
 Musang tidak memiliki kekebalan terhadap SARS-CoV
 SARS mungkin berasal dari kelelawar tapal kuda liar di China
 Indikasi: 92% mirip dengan virus SARS pada manusia dari
tiga spesies kelelawar yang ditemukan di Zoology di Chinese
Academy of Sciences, Beijing
 Kelelawar yang terinfeksi menunjukkan sedikit atau tanpa
gejala
 Infeksi pada manusia secara langsung tidak mungkin terjadi
 Kemungkinan virus tersebut berasal dari hewan perantara
seperti musang dan beradaptasi sedemikian rupa sehingga
mampu menginfeksi manusia.
 Kelelawar tapal kuda dianggap sebagai inang reservoir alami
SARS
 TRANSMISI
 SARS-CoV dapat menular melalui cairan yang keluar
dari tubuh pasien terinfeksi yang kontak langsung atau
tidak langsung
 Lebih kecil kemungkinannya dengan transmisi oral-
feses transmisi fekal atau udara
 Viral load memuncak pada sekitar 10 hari dan 13 -14
hari dalam tinja
 Kasus wanita Toronto pulang ke Toronto dari Hong
Kong, dia meninggal 9 hari kemudian setelah gejala 5
dari 6 anggota keluarga menunjukkan gejala SARS
MERS-CoV(Middle East Respiratory
Syndrome-Corona Virus)
MERS-CoV(Middle East Respiratory
Syndrome-Corona Virus)
 SPEKTRUM KLINIS PENYAKIT HCOV :
229E, NL-63, OC-43, HKU1

 Paling sering dikaitkan dengan terjadinya infeksi sal

nafas bagian atas pada anak2

 Dapat terjadi pneumonia pada orang dewasa dengan

gangguan imun dan pada lansia

 Dapat terjadi juga pada kekambuhan pneumonia

dengan penyaklit yang mendasarinya
EPIDEMIOLOGI HCOV : 229E, NL-63, OC-
43, HKU1

 Terjadi di seluruh dunia

 Terutama pada musin dingin dan musim semi di negara

beriklim sedang

 Dapat mudah terpapar pada anak2 usia muda

 Penularan dapat terjadi dengan droplet, kontak langsung

dan tidak langsung

 Masa inkubasi 2-5 hari

 KASUS PERTAMA YANG DILAPORKAN

 Pria Saudi usia 60 th

 Ditemukan pada tgl 13 Juli dengan demam 7 hari dengan

batuk dan sesak nafas

 Adanya peningkatan urea darah(BUN) dan kreatinin pada

sakit H3

 Awal sakit lekosit normal dan meningkat pada H10 dengan

neutrofilia, limfopenia dan trombositopenia progresif
 SEJARAH

 Berasal dari negara Arab Saudi

 menyebar ke negara2 Timur Tengah (Yordania, Kuwait,

Oman, Qatar, Uni Emirat Arab), ke negara2 lain seperti
Perancis, Jerman, Yunani, Italia, Inggris, Tunisia,
Filipina.
 GEJALA

Menyerang saluran napas, karena itu setelah terinfeksi kurang

lebih 1 minggu akan menunjukkan gejala:
1. Demam-demam tinggi berlangsung 1-2 hari
2. Sesak napas, Batuk, Pilek: bila beratsesak napas tjd pada
hari ke-3
Jika terjadi sesak segera ke RS sebab daya tahan tubuh sangat
jelek, virus ganas dan banyak, beresiko meninggal dunia
kurang dari 7 hari jika tidak mendapat pertolongan.
Banyak menyerang usia > 50 thn, 65 % laki
 PENANGANAN

 Vaksin dan obat belum ditemukan

 Jika terindikasi MERS,penderita harus diisolasi supaya

tidak menyebar. Selanjutnya dilakukan pertolongan
dengan pemberian oksigen.

 Pemberian obat antipiretik untuk demamnya

 Pemberian nutrisi melalui infus untuk meningkatkan

daya tahan tubuhnya
 DIAGNOSA

 Untuk memastikan diagnosa dilakukan pemeriksaan

laboratorium, diambil cairan dari belakang hidung atau
tenggorokan untuk diperiksa kumannya apakah identik
dg Corona Virus
 PENCEGAHAN

• Cuci tangan dengan sabun setiap kali mau makan dan setelah
memeganmg benda yang ada disekitar yang mungkin
terkontaminasi virus
• -Jangan makan daging mentah atau setengah matang
• Gunakan masker, terutama bila dekat dengan orang yang batuk
pilek atau terkena influenza
• Makan makanan bergizi dan cukup istirahat
• Menjaga kebersihan diri dan lingkungan
• Jauhi hewan penyebar virus yaitu unta dan kelelawar,
termasuk hindari mengkonsumsi daging dan susu unta.