OLEH :
O O O O
H2O, H+
NHCHC NHCHC H2NCHC + H2NCHCO H
H O2H
kalor 2H
R R' R R'
H2N C H
Gugus α-amino
R variasi struktur
terjad dalam rantai
samping
CHO
CO2H
HO C H H2N C H
CH2OH R
CO2H
Dalam Asam
Dalam Basa
Klasifikasi asam amino menurut fungsi biologisnya
NH2
arginina* arg H2NCNHCH2CH2CH2CHCO2H
NH2 NH2
O
NH2
Nama Singkatan Struktur
asam aspatat asp HO2CCH2CHCO2H
NH2
sisteina cys HSCH2CHCO2H
(cysteine)
NH2
glu HO2CCH2CH2CHCO2H
asam glutamat
O NH2
gln H2NCCH2CH2CHCO2H
glutamina
NH2
gly CH2CO2H
glisina
NH2
Nama Singkatan Struktur
N
histidina* his CH2CHCO2H
N
H
CH3 NH2
NH2
NH2
lisina* lys H2NCH2CH2CH2CH2CHCO2H
NH2
NH2
Nama Singkatan Struktur
pro CO2H
N
pirolina H
ser HOCH2CHCO2H
serina
NH2
thr OH
treonina*
CH3CHCHCO 2H
NH2
Nama Singkatan Struktur
CH2CHCO2H
triptofan* try
N NH2
H
tirosina tyr
(tyrosine) HO CH2CHCO2H
NH2
NH2
ikatan peptida
O O O O
-H2O
H2NCHCOH + H2NCH2COH H2NCHC NHCH2COH
CH3 CH3
CH3 CH3
alanilglisina glisilalanina
Asam amino dengan gugus amino bebas biasanya ditaruh
pada ujung kiri struktur itu. Asam amino ini disebut asam
amino N-ujung.
Asam amino dengan gugus karboksil bebas ditaruh diujung
kanan disebut asam amino C-ujung.
H2NCHC NHCH2COH
NHCHC
CH3 CH2 OH
alaniltirosilglisina
STRUKTUR PROTEIN
PRIMER, SEKUNDER (HELIKS), TERSIER (GLOBULER) ATAU KUARTERNER
(POLIGLOBULER
URUTAN ASAM AMINO
STRUKTUR
PRIMER
ATAU
STRUKTUR
SEKUNDER
KUMPARAN TAK BERATURAN
α HELIKS ATAU
LEMBARAN BERLIPAT
SUB UNIT
MIOGLOBIN HEMOGLOBIN
H Protein Secondary Structure:
N
C H Helix
O
C
N C H
C
H O N +
C H
-O H O
N
C C O H N C N C OH
C C
H
C H
H
O N C C
O H C H C H
H H HO H
H C N
C N C OB
O
H
N
Protein Secondary Structure:
C
C
H Helix
O N C
C
H
O
C N - +
H O H O
H
N C H N C N C OH
C H O
CO N H C H C
C H C H
C
O
H C H H HO H
H C N
C N C O
O
Protein Secondary Structure:
Helix
R
R
R groups stick out R
R
from the helix R
influencing R
R
higher levels of R
protein R R
organization R
R R
R
Protein Secondary Structure:
Pleated Sheet
O H O H O H O H
C N C N C N C N
C C C C C C C C
N C N C N C N C
H O H O H O H O
O H O H O H O H
C C N C C N C C N C C N
N C C N C C N C C N C C
H O H O H O H O
Protein Secondary Structure:
Pleated Sheet
O H O H O H O H
C N C N C N C N
C N C C C N C C C C
C C N C N C
H H H O H O
O O
O H O H O H O H
C C N N N N
C C C C C C
N C C C C C C C C
N N N
H O H O H O H O
O H O O H
H O
C N C C
C C C C C N
N N C C N
H O H
H O H
N C N
C C C
C N C
O H
O
Protein sequencing
Leu