Keragaman Antibodi: Tempat Bergabung dan Mutasi Somatik

Adanya keanekaragaman sekuen asam amino pada molekul antibodi dengan

sekuen segmen gen yang diprediksi mengkode antibodi tersebut menunjukkan bahwa
terdapat lebih banyak variasi sekuen asam amino pada V-J junction dibanding dengan
prediksi melalui sekuen nukleotida. Banyaknya keragaman ini ditunjukkan melalui
variasi dalam tapak rekombinasi selama penggabungan V-J. Contoh adanya interaksi
alternasi tapak penggabungan segmen gen Vk dan segmen gen Jk pada tikus.
Selama segmen gen VK41 dan J5 bergabung, menunjukkan rekombinasi yang
berlangsung antara empat posisi nukleotida yang berdekatan di situs junction. Selama
asam amino 96 bergabung di daerah rantai antibodi yang terlibat dalam ikatan
antigen. Dengan demikian, penggunaan situs alternatif selama peristiwa rekombinasi
yang terlibat dalam kumpulan gen antibodi dewasa menyediakan sebuah mekanisme
tambahan untuk menghasilkan keanekaragaman antibodi.

Regulasi dari Transkripsi: Sebuah jaringan-Khusus

Dalam kasus gen rantai berat nampak bahwa proses penataan kembali
membawa promotor yang terletak di upstream dari segmen gen LH - VH berpengaruh
ke berbagai elemen enhancher yang terletak di intron antara segmen gen JH dan
segmen gen CHµ. Setiap segmen gen LV - VH mengandung promotor upstream.
Namun, sebelum peristiwa penataan kembali genomik yang mengarah pada sintesis
rantai berat, enhancher ini terdiri dari lebih 100.000 pasang nukleotida. Enhancher ini
dapat langsung mengaktifkan transkripsi dari promotor yang terletak di upstream dari
segmen gen LH - VH. Enhancher yang terlibat dalam aktivasi sintesis rantai berat
adalah jaringan tertentu; yang akan mengaktifkan transkripsi hanya terdapat dalam
limfosit dan tidak memiliki efek pada sel yang berasal dari jaringan lain.
Pemilihan Klonal
Seleksi klonal merupakan mekanisme yang
dilakukan oleh suatu organisme untuk melalukan
inisiasi sintesis antibodi spesifik terhadap antigen
yang belum pernah diketahui sebelumnya. Semua
antibodi dihasilkan oleh limfosit B tunggal yang
mempunyai spesifikasi sisi pelekatan antigen yang
sama, tetapi sel tersebut akan mengalami penyusunan
genomik yang berbeda sehingga menghasilkan
produksi antibodi yang berbeda pula. Teori seleksi
klonal menyatakan bahwa pengikatan antigen asing
khusus pada suatu antibodi di permukaan limfosit B
akan merangsang terjadinya pembelahan sel, untuk
menghasilkan sejumlah besar sel limfosit B (“tiruan”
dari sel yang identik) sehingga akan ada banyak
limfosit B yang mengenali antigen tersebut.

Gambar 1. Diagram skematik

dari peran seleksi klonal pada
respon imun

Penyimpangan pada Alel

Masing-masing limfosit B hanya membuat satu jenis antibodi. Sel mamalia
berupa diploid; mereka membawa dua set informasi kode genetik untuk masing-
masing rantai antibodi. Tetapi, hanya satu genom produktif yang menyusun kembali
sekuen pengkode rantai ringan dan satu genom produktif yang menyusun kembali
sekuen pengkode rantai berat yang terjadi pada masing-masing limfosit B. Fenomena
ini disebut dengan penyimpangan pada alel karena satu “alel” menyimpang dari yg
diekspresikan.
Variasi Reseptor Sel T
Limfosit T memperantarai respon imun seluler. Sel-sel T mengenali antigen
pada permukaan sel dan membunuh sel yang membawa antigen. Sel-sel T
menghasilkan membran-terikat reseptor yang sangat mirip dengan antibodi yang
diproduksi oleh limfosit B. Selain itu, keragaman spesifisitas reseptor sel T yang
diproduksi oleh penyusunan ulang genom analog dengan mereka yang terlibat dalam
produksi antibodi. Reseptor sel T terdiri atas dua rantai polipeptida, α dan β, masing-
masing dikodekan oleh L-V, D, J, dan segmen gen C seperti rantai antibodi. α- dan β-
polipeptida, seperti rantai antibodi, mengandung daerah variabel yang membentuk
situs pengikatan antigen dan daerah konstan agar pembawa berita reseptor ada di
permukaan sel (Gambar 4a).

Gambar 2. Diagram menunjukkan (a) struktur dari reseptor sel T berlabuh di

membran sel dan (b) daerah dari protein reseptor α dan β yang dikodekan oleh
L-V, D, J dan segmen gen C
Daerah variabel dari reseptor sel T dikode oleh beberapa segmen gen L-V, D,
dan J; daerah konstan dikode oleh sejumlah kecil segmen gen C. Gen reseptor sel T
disusun oleh penyusunan kembali genom yang terjadi selama dferensiasi oleh limfosit
T oleh stem sel seperti pada kasus gen antibodi pada perkembangan limfosit beta.
Protein reseptor alpha dan beta, dikode oleh segmen gen yang berbaris pada
kelompok pada masing-masing kromosom 14 dan 7.
Struktur dari kelompok gen reseptor sel T pada manusia sangat mirip dengan
tikus. Organisasi alur penyakit pada segmen gen yang mengkode beta polipeptida
reseptor sel T ditunjukkan pada gambar 5a. Organisasi fungsional penyusunan
kembali beta polipeptida gen ditunjukkan pada gambar 5b. Urutan pensinyalan
heptamer dan nonamer yang sangat mirip tersebut sama pada kontrol penyusunan
kembali gen antibodi yang juga hadir secara esensial pada lokasi yang sama pada
kelompok gen reseptor sel T. Kehadiran kedua kelompok gen memberi kesan bahwa
mekanisme yang sama pada penggabungan segmen gen yang dipekerjakan selama
penyusunan kembali, baik gen antibodi maupun gen reseptor sel T. Ada kemungkinan
bahwa variabilitas pada reseptor sel T agak kurang daripada antibodi. Daerah variabel
gen reseptor sel T dikode oleh sekitar 30 segmen gen V, sedangkan ada sekitar 300
segmen gen V baik pada rantai ringan Kappa maupun rantai berat antibodi.

Gambar 3. Organisasi lokus kompleks tikus yang mengkode polipeptida

reseptor beta sel T

Major Histocompability Complex (MHC)

Sejumlah besar komponen dari respon imun seperti halnya antigen transplantasi
yang secara garis besar bertanggung jawab untuk rejeksi jaringan asing pada proses
transplantasi yang dikontrol oleh multigen kompleks disebut dengan Major
Histocompability Complex (MHC). Pada manusia, protein MHC dikode oleh lokus
HLA (Human Leukocyte Antigen) pada kromosom 6. Pada tikus, lokus MHC
ditetapkan H-2 (histocompatibility lokus 2) yang terletak pada kromosom 17. Baik
tikus maupun manusia, lokus MHC sangat besar (> 2 x 10 6 pasang nukleotida) dan
mengandung sejumlah besar gen. Gen-gen MHC sangat polimorfik karena banyaknya
alel dari gen individu yang biasanya memisahkan dalam populasi tertentu.
Gen-gen MHC mengkode tiga kelas yang berbeda dari protein yang terlibat
dalam berbagai aspek dari respon imun. Struktur lokus MHC manusia (HLA) dan
lokasi relatif gen yang menyandikan kelas yang berbeda dari antigen
histokompatibilitas ditunjukkan pada Gambar 6. Protein MHC kelas I merupakan
antigen yang bertanggung jawab untuk rejeksi jaringan asing pada transplan jaringan
dan organ. Seperti diilustrasikan dalam Gambar 6, antigen memainkan peran kunci
dalam pengenalan dan kerusakan sel yang membawa antigen asing oleh limfosit T
sitotoksik. Sebuah reseptor T tunggal sel mengenali antigen asing dan antigen
histokompatibilitas kelas I selama respon imun sel T sitotoksik.
Gen MHC kelas II mengkode polipeptida yang terletak dekat pada permukaan
limfosit B dan makrofag. Protein MHC kelas II menyediakan tipe khusus T limfosit
yang disebut "sel T helper" dengan kapasitas untuk pengenalan diri dan memfasilitasi
komunikasi antara berbagai jenis sel yang terlibat dalam respon imun. Akhirnya, gen
MHC kelas III mengkode protein komplemen yang berinteraksi dengan kompleks
antigen-antibodi dan menginduksi lisis sel.
Antigen MHC kelas I dan kelas II yang berada di membran sel memiliki
struktur yang sangat mirip dengan struktur reseptor sel T (lihat Gambar 6). Namun,
keragaman antigen MHC jauh lebih sedikit dibandingkan dengan antibodi dan
reseptor sel T, dan tidak ada penyusunan kembali genom yang terlibat dalam kontrol
genetik keragaman antigen MHC.
 Gambar 4. Organisasi MHC (HLA) pada kromosom 6 manusia
Perubahan Genetik Dalam Diferensiasi Kekebalan Sel Vertebrata
Di Mamalia, sistem kekebalan tubuh terdiri dari beberapa jenis sel yang berasal
dari stem sel yang berada di dalam sumsum tulang yang berbeda. Stem sel
menghasilkan berbagai jenis sel imun serta prekursor sel-sel imun tubuh. Dua kelas
yang penting dari sel-sel kekebalan tubuh berpartisipasi langsung dalam perang
melawan menyerang patogen.
1. Sel plasma B menghasilkan dan mengeluarkan protein yang disebut
imunoglobulin, juga dikenal sebagai antibodi
2. Sel T pembunuh memproduksi protein bertindak sebagai reseptor untuk berbagai
zat.
Antibodi sel B dan reseptor sel T mampu mengenali molekul-molekul lain,
misalnya bahan asing yang diperkenalkan oleh patogen melalui mekanisme lock and
keys. Molekul Asing yang disebut antigen, adalah key yang cocok dan tepat dengan
lock yang dibentuk oleh antibodi sel B atau reseptor sel T.
 Gambar 5. Struktur molekul antibodi
Rantai ringan dan berat paada antibody dikode oleh lokus yang berbeda dalam
genom. Pada manusia, ada dua lokus rantai pendek, lokus kappa (α) pada kromosom
2 dan lokus lambda (γ) pada kromosom 22, dan ada satu rantai berat lokus, terletak
pada kromosom 14. Setiap dari lokus ini terdiri dari serangkaian gen segmen yang
panjang.
Kappa polipeptida dikodekan oleh tiga jenis gen segmen:
1. segmen gen Lk Vk, yang mengkode peptida utama dan amino terminal 95 daerah
asam amino rantai ringan kappa; peptida utama akan dihapus dari rantai ringan
kappa oleh pembelahan kemudian membawa polipeptida yang baru melalui
membran endoplasma dalam sintesis antibodi sel plasma.
2. Jk segmen gen, yang mengkode asam amino terakhir 13 daerah rantai ringan
kappa; simbol Jk digunakan untuk segmen gen ini karena peptida itu encode
bergabung amino-terminal peptida yang dikodekan oleh segmen Lk Vk untuk
peptida karboksi-terminal yang dikodekan oleh jenis segmen gen berikutnya.
3. Ck gen segmen, yang mengkode wilayah konstan rantai ringan kappa.

Dalam manusia, lokus kappa berisi 76 Lk Vk segmen gen (walaupun hanya 40

fungsional), lima Jk gen segmen, dan segmen gen Ck tunggal. Jk segmen gen terletak
antara segmen gen Lk Vk dan Ck gen segmen. Dalam sel grem-line, segmen Jk lima
dipisahkan dari segmen Lk Vk dengan urutan panjang noncoding, dan dari segmen gen
Ck oleh panjang urutan noncoding kira-kira 2 kb (gambar 8). Selama pengembangan
sel B, rantai ringan kappa gen yang akan dinyatakan dikumpulkan dari segmen satu
Lk Vk, satu Jk segmen, dan segmen Ck tunggal oleh proses somatik rekombinasi. Salah
satu dari 40 fungsional Lk Vk gen segmen dapat bergabung dengan salah satu dari
lima segmen Jk dalam proses ini; DNA antara segmen bergabung (gambar 9).
peristiwa bergabung disebut recombination signal sequence (RSS), yang berdekatan
dengan masing-masing segmen gen. Situs ini terdiri dari 7 atau 9 panjang basa
dipisahkan oleh spacer panjang 12 atau 23 pasangan basa. Rekombinasi
mengaktifkan gen protein 1 dan 2 (RAG1 dan RAG2) merupakan komponen penting
dari kompleks ini; bersama-sama, mengontrol kekhasan peristiwa rekombinasi.

Gambar 6. Genetik control pada antibodi rantai ringan kappa manusia

Gambar 7. Model penggambungan Lk Vk-Jk

 Bersatunya Lk Vk dan Jk oleh peristiwa rekombinasi dari rantai ringan kappa.
Seluruh urutan DNA Lk Vk-Jk, pemotongan noncoding Ck di lokus kappa kemudian
dipindahkan. Urutan noncoding antara segmen Lk Vk Jk menyatu dan segmen C akan
dihapus selama pemrosesan RNA, seperti intron, dan dihasilkan mRNA
diterjemahkan polipeptida. Jumlah total fungsional rantai ringan kappa yang dapat
diproduksi oleh mekanisme ini adalah 40 (jumlah fungsional Lk Vk gen segmen) 5
(jumlah segmen gen Jk) 1 (jumlah segmen gen Ck). Dengan cara yang sama,
rekombinasi gen segmen dapat membuat 120 lambda rantai ringan dan 6600 rantai
berat yang berbeda. kumpulan Kombinatorial semua rantai ini menjadikannya
mungkin bagi manusia untuk menghasilkan 320 (200+120) 6600 -2,112,000 antibodi
yang berbeda.

Pertanyaan: Mochammad Abdul Hafidh

1. Bagaimanakah mekanisme pembentukan antibodi dengan susunan
beranekaragam?
Jawab: Keragaman susunan antibodi dihasilkan melalui penggabungan kelompok
besar segmen gen V, D, dan J, serta penggunaan alternatif posisi rekombinasi
posisi selama penggabungan. Sedangkan mekanisme lain yang harus terlibat dalam
menghasilkan keragamanan antibodi yaitu dengan membandingkan sekuen-
sekuen pasangan nukleotida dari gen-gen yang diekspresikan dengan sekuen
segmen-segmen gen germ line, serta sekuen-sekuen asam amino yang sebenarnya
dari rantai antibodi dengan sekuen-sekuen asam amino yang diprediksikan dari
sekuen-sekuen nukleotida gen.
2. Apa saja segmen gen yang mengkode kappa polypeptide, dan bagaimana
proses fusi segment anti bodi kappa pada manusia?
Jawab: Kappa polipeptida dikodekan oleh tiga jenis gen segmen:
a. segmen gen Lk Vk, yang mengkode peptida utama dan amino terminal 95
daerah asam amino rantai ringan kappa; peptida utama akan dihapus dari
rantai ringan kappa oleh pembelahan kemudian membawa polipeptida yang
baru melalui membran endoplasma dalam sintesis antibodi sel plasma.
b. Jk segmen gen, yang mengkode asam amino terakhir 13 daerah rantai ringan
kappa; simbol Jk digunakan untuk segmen gen ini karena peptida itu encode
bergabung amino-terminal peptida yang dikodekan oleh segmen Lk Vk untuk
peptida karboksi-terminal yang dikodekan oleh jenis segmen gen berikutnya.
c. Ck gen segmen, yang mengkode wilayah konstan rantai ringan kappa.
Lokus kappa berisi 76 Lk Vk segmen gen (walaupun hanya 40 fungsional), lima
Jk gen segmen, dan segmen gen Ck tunggal. Jk segmen gen terletak antara segmen
gen Lk Vk dan Ck gen segmen. Dalam sel grem-line, segmen Jk lima dipisahkan dari
segmen Lk Vk dengan urutan panjang noncoding, dan dari segmen gen Ck oleh
panjang urutan noncoding kira-kira 2 kb (gambar 2). Selama pengembangan sel B,
rantai ringan kappa gen yang akan dinyatakan dikumpulkan dari segmen satu L k
Vk, satu Jk segmen, dan segmen Ck tunggal oleh proses somatik rekombinasi. Salah
satu dari 40 fungsional Lk Vk gen segmen dapat bergabung dengan salah satu dari
lima segmen Jk dalam proses ini; DNA antara segmen bergabung (gambar 3).
peristiwa bergabung disebut recombination signal sequence (RSS), yang
berdekatan dengan masing-masing segmen gen. Situs ini terdiri dari 7 atau 9
panjang basa dipisahkan oleh spacer panjang 12 atau 23 pasangan basa.
Rekombinasi mengaktifkan gen protein 1 dan 2 (RAG1 dan RAG2) merupakan
komponen penting dari kompleks ini; bersama-sama, mengontrol kekhasan
peristiwa rekombinasi.