PCR PASCA PANDEMI COVID-19 : UJI DNA PORCINE 24 November 2021 Heryani, S.Si., M.T.Pn Manajer Laboratorium LPPOM MUI Outline Regulasi Halal
Persyaratan Laboratorium Molekuler
Acuan Metode Uji DNA Porcine
Validasi dan Verifikasi
Jaminan Mutu Pengujian
Regulasi Halal • UU No. 33/2014 (Jaminan Produk Halal) • UU No. 11/2020 (Cipta Kerja) • PP No. 39/2021 (Penyelenggaraan Bidang Jaminan Produk Halal) • PMK No. 57/2021 (Tarif Layanan BLU BPJPH) • KMA No. 748/2021 (Jenis Produk Wajib Sertifikasi) • Kep KaBadan No. 57/2021 (Kriteria SJPH) Regulasi Halal Proses sertifikasi halal: 1. Persiapan sertifikasi halal oleh perusahaan terhadap pemenuhan Sistem Jaminan Halal (SJH / HAS 23000) 2. Pendaftaran melalui BPJPH (SIHALAL) dan LPPOM MUI (CEROL) 3. Pemeriksaan halal : Pembayaran biaya sertifikasi Pemeriksaan Pre Audit Audit dan Pengambilan sampel* Evaluasi hasil audit / post audit dan Pengujian sampel* Keputusan SJH & Ketetapan Halal Penerbitan Status/Sertifikat SJH dan Ketetapan Halal 4. Penerbitan Sertifikat Halal di BPJPH Regulasi Halal Pengujian laboratorium dilakukan terhadap : 1. Bahan yang diragukan kehalalannya (PP No. 39/2021 Pasal 71, SK18/Dir/LPPOM MUI/X/20) 2. Produk tertentu seperti produk berbahan hewan (olahan daging, gelatin, enzim, dll), minuman, kosmetika, tinta pilkada, dll (SK18/Dir/LPPOM MUI/X/20) 3. Fasilitas : Validasi pencucian Persyaratan Laboratorium Molekuler Acuan Metode Uji DNA Porcine • ISO/TS 20224-3:2020 • SNI ISO 20224-3:2021 • GSO CD 05/2018 • MS 2627:2017 • GB/T 25165-2010 Acuan Metode Uji DNA Porcine Metode Ekstraksi Acuan Metode Uji DNA Porcine Acuan Metode Uji DNA Porcine Reaksi PCR Acuan Metode Uji DNA Porcine Acuan Metode Uji DNA Porcine Validasi dan Verifikasi Validasi Verifikasi Parameter Broeders et. al., 2014 BVL, 2016 FDA, 2019 KAN K-03.06 Spesifisitas/Selektivitas √ √ √ Sensitivitas/LOD √ √ √ √ PCR Efficiency (ɛ) √ Linearitas (R2) √ Robustness √ √ √ False Positive/Negative Rate √ √ √ √ Extraction Efficiency √ Presisi (Repitabilitas & √ Reprodusibilitas) Validasi dan Verifikasi • Spesivitas/selektivitas : mengevaluasi cross-reactivity dengan DNA non target yang serupa/dekat Theoritical/In-silico test : cek sekuens primer dan probe pada data base (ex. BLAST pada GenBank) Experimental test : menguji pada sejumlah sampel target dan non target • False Positive/Negative Rate : Validasi dan Verifikasi • Sensitivitas/LOD : pengenceran DNA target berseri pada DNA background (opsional) yang menghasilkan hasil positif pada 12 ulangan (LOD95%). • Linearitas : R2 ≥ 0,98 dengan nilai slope berada pada rentang -3,9 ≤ slope ≤ -2,9. • PCR Efficiency (ɛ) : 80 – 120 % berlaku untuk kualitatif dengan multiplex PCR (Broeders et al. 2014). 1 − 𝑠𝑙𝑜𝑝𝑒 ɛ = 100 𝑥 (10 − 1) • Efisiensi ekstraksi : spike analit target pada matriks sebelum proses ekstraksi untuk memastikan apakah metode ekstraksi cukup dan reproducible. • Repeatability: pengujian berulang untuk mendapatkan hasil yang sama, misal 3 sampel negatif dan 3 sampel positif pada operator dan/atau waktu yang berbeda. (hasil: 100% sama) • Reproducability: kemampuan metode pengujian untuk memberikan hasil yang konsisten melalui pengujian 3 sampel negatif dan 3 sampel positif dengan protokol, reagen dan kontrol yang sama oleh 3 laboratorium yang berbeda pada waktu yang bersamaan. (hasil: 100% sama) Validasi dan Verifikasi • Robustness: Dilakukan dengan perubahan kecil beberapa parameter yang tetap menghasilkan true positive dan true negative menggunakan DNA target yang di-spike dalam DNA non target pada titik LOD. Jaminan Mutu Pengujian • Implementasi GLP laboratorium Molekuler. Kontrol kontaminasi dengan: Metode fisik : kondisi ruangan (layout, workflow, air pressure), laminar/BSC, filter tip, UV Metode kimia : Uracil-DNA-glycosylase (UDG) mencegah false positive • Kontrol positif PCR : dari DNA target • Kontrol inhibitor PCR : penggunaan exogenous internal positive control dan DNA template-nya mencegah false negatif • Kontrol negatif PCR : nuclease-free water • Kontrol negatif metoda/Blanko Ekstraksi : nuclease-free water yang diekstraksi bersamaan dengan sampel • Replikasi pengujian • Jaminan mutu tahunan : uji profisiensi, uji banding, uji spiking, uji kontrol lingkungan, dll TERIMA KASIH