Anda di halaman 1dari 1

ISOLASI DAN KONSTRUKSI DNA REKOMBINAN GEN THYROID STIMULATING HORMONE

RECEPTOR (TSHR) PADA PLASMID pET28a


Seminar Hasil Penelitian dan Pengabdian Kepada Masyarakat, LPPM Unsyiah Tahun 2017

Zulkarnain
Sumber Dana : APBN (DRPM)

PENDAHULUAN BAHAN DAN METODE


 Autoimmune Thyroid Disease (AITD) : Kelainan au- Bahan :
toimun spesifik pada organ tiroid, ditandai terbentuknya ® TM
DNeasy Blood & Tissue kit(qiagen); Elite Competent Cells BL21
Thyroid Stimulating Antibody (TSAb) yg dpt berinteraksi (DE3) LB Broth; bacterial culture media LB Agar; bacterial culture
antigen Thyroid Stimulating Hormone Receptor media 100 bp DNA ladder (Promega); BamH1 (Fermentas); Xho1
(TSHR) . (Fermentas); Agarose powder (Fermentas); IPTG 0,1 M (Sigma); TBE
 Fragmen TSHR ekson 4 (residu 107-129) : salah satu (Tris-Borate EDTA) buffer 10X (Sigma); Primer R & F gen TSHR;
daerah conserved region dan bagian epitope dari Primer R & F konstrak gen TSHR ekson 4 (Genetika Science
TSHR. Indonesia).
 Fragmen ini memiliki potensi yang spesifik sebagai tar-
PENELITIAN - KESEHATAN

get antigen untuk mengenali dan berikatan dengan


Metode :
TSAb.
 Isolasi gen TSHR dari sampel darah menggunakan DNeasy Blood
 Pengembangan serodiagnostik berbasis antigen TSHR & Tissue kit.
untuk mengenali TSAb diharapkan dapat membantu  Amplifikasi DNA dengan metode PCR menggunakan primer TSHR
para klinisi dalam deteksi dini AITD — Peningkatan pe- -F-BamH1-137431 dan TSHR-R-Xho1-137500, yang didesain spe-
layanan kesehatan terhadap penderita AITD di Indone- sifik mengenali bagian ekson 4.
sia.  Produk PCR disekuensing dan dianalisis kesamaannya dengan
gen bank menggunakan BioEdit.
 Target ekson 4 disisipi kedalam plasmid pET-28a menggunakan
DNA ligase dibantu enzim retriksi BamH1 dan Xho1.
HASIL CAPAIAN  Isolasi plasmid hasil transformasi kedalam E.coli BL21.
 Evaluasi keberhasilan isolasi plasmid dilakukan dengan uji kuanti-
1. Publikasi jurnal internasional terindeks scopus tatif (nanophotometer) dan uji kualitatif dengan elektroforesisi gel
(Bioinformatics, IF: 7,307) — submitted agarose 1%.
th
2. Diseminasi dalam seminar internasional : 4 Interna-  Konfirmasi TSHR rekombinan melalu metode PCR dan RFLP.
tional Conference on Advanced Molecular Bioscience  Analisis interaksi molekuler dilakukan dengan pendekatan bioin-
and Biomedical Engineering, Malang-Indonesia. formatik menggunakan aplikasi HADDOCK.
3. Prototype serodiagnostik

DOKUMENTASI KEGIATAN

KESIMPULAN
1. Sekuen nukleotida fragmen TSHR ekson 4 yang telah diisolasi dari sampel darah manusia etnis Jawa memiliki sedikit perbe-
daan dengan native, sehingga mempengaruhi konformasi protein ekson 4.
2. Hasil analisis molecular docking menunjukkan bahwa isolat ekson 4 bersifat favourable dan masih mampu mengenali TSAb.

DAFTAR PUSTAKA
Kleinau G, Krause G. 2009. Thyrotropin and homologous glycoprotein hormone receptors: structural and functional aspects of ex-
tracellular signaling mechanisms. Endocrine Reviews, 30(2):133-151.
Morshed SA, Latif R, and Davies TF. 2012. Delineating the autoimmune mechanisms in Graves disease. Immunologic Research,
54(1-3):191-203.
Sambrook J, and Russel DW. 2001. Expression of cloned genes in Escherichia coli (chapter 15). In : Molecular Cloning : A
th
Laboratory Manual. 3 Edition. New York: Cold Spring Harbor Laboratory Press. Hal.15.36-47.
Sanders J, Chirgadze DY, Sanders P, Baker S, Sullivan A, Bhardwaja A, Bolton J, Reeve M, Nakatake N, Evans M, Richards
T, Powell M, Miguel RN, Blundell TL, Furmaniak J, and Smith BR. 2007. Crystal structure of the TSH
receptor in complex with a thyroid-stimulating autoantibody. Thyroid, 17(5):395-410.
Vanderpump MP. 2011. The epidemiology of thyroid disease. British Medical Bulletin, 99:39-51.

Anda mungkin juga menyukai