Tugas Biologi sel dan molekuler

Jurnal Polimorfisme KLP 2

1. Alfani Maring Datu

2. Regina
3. Suleha
4. Liya sari
5. Masriadi
6. Samaruddin
7. Fortuna
8. Yuniarti
9. Nurul Hidayah S. B.
 Genetic Variability and Its Vulnerability in Tuberculosis Infection

Banyak polimorfisme berkontribusi pada kecenderungan infeksi TB di beberapa populasi

Kerentanan genetik dan respon protektif host terhadap interaksi patogen yang terlibat dalam
tuberkulosis merupakan multifaktorial di mana keseimbangan antara faktor genetik dan lingkungan
memainkan peran penting olehkarena itu itu sulit untuk mendeteksi mekanisme genetik yang
terlibat dalam kekebalan. Studi terbaru menggunakan model hewan dan manusia melalui teknik
manipulasi genetik seperti teknologi DNA rekombinan akan meningkatkan pemahaman tentang
patogen dan mekanisme genetik host

Polimorfisme dalam urutan DNA pada bagian yang berbeda pada HLA menyebabkan variasi
alel dan pengenalan antigen karena ikatan protein yang berbeda. Sejak Patogenesis
tuberkulosis paru disebabkan oleh respon imun yang diperantarai sel yang berbahaya, sejumlah
pengamatan telah dilakukan menggambarkan pengaruh kuat polimorfisme kelas II HLA pada
predisposisi tuberkulosis

Efek Polimorfisme memberikan kerentanan satu populasi dan proteksi terhadap poopulasi
lainnya yang mugkin diakibatkan oleh ketidakseimbangan.

Alfani Maring Datu/P062211008

Immunological Characterization of Proteins Expressed by Genes Located in Mycobacterium
tuberculosis-Specific Genomic Regions Encoding the ESAT6-like Proteins

Early secreted antigen target 6kDa (ESAT6) memiliki berat molekul rendah dan
memiliki sifat protein imunogenik yang tinggi terhadap M. Tuberculosis yang relevan
dalam diagnosis tuberkolosis dan pengembangan sub unit vaksin.

Gen yang mengkode protein ESAT6 berada pada bagian genom spesifik M.
Tuberculosis yang dikenal sebagai Region of Difference (RD)1. Terdapat 11 RDs
Spesifik M. Tuberculosis yang tidak terdapat dalam strain vaksin BCG, dan tiga
diantaranya (RD1,RD7, dan RD9) yang mengkode protein imudominan (29
Protein). Setiap RDs tersebut memiliki gen untuk berpasangan dengan ESAT6-like
proteins

Karakterisasi Imunologi dari semua protein yang mungkin dikodekan oleh gen dalam RD1,
RD7, dan RD9 menunjukkan bahwa selain ESAR-6 like proteins, beberapa protein lain
merupakan antigen mayor yang berguna untuk pengembangan sub unit vaksin untuk
melengkapi atau menggantikan BCG

Alfani Maring Datu/P062211008

Pembuatan Vaksin DNA berdasarkan Mycobacterium tuberculosis gen
fusiAg85A/MPT64 dan evaluasi imunogenisitasnya

Sebuah generasi baru vaksin DNA telah dikembangkan dan telah menunjukkan keuntungan yang
signifikan dalam pencegahan dan pengobatan berbagai penyakit menular dan kanker. Salah satu
prasyarat untuk pengembangan vaksin yang efektif adalah pemilihan antigen yang sangat
imunogenik. Protein filtrat kultur MTB (CFP) telah digunakan sebagai komposisi antigen untuk
pencegahan TB dan dalam reagen diagnostik . Telah ditemukan bahwa kompleks Ag85 adalah
antigen protein utama yang disekresikan MTB terhitung 30% dari total protein yang disekresi.
Respon spesifik antigen CD4+ dan CD8+ Sel T pada vaksin DNA Ag85A pada tikus BALB/c
menunjukkan bahwa vaksin DNA Ag85A mampu menghasilkan respon sel T dan aktivitas CTL yang
kuat dan luas . MTB mensekresi protein MTB 64 (MPT64), yang merupakan protein utama yang
disekresikan dalam filtrat kultur awal MTB, terhitung 8% dari total protein yang disekresikan. Protein
MPT64 memiliki aktivitas superoksida dismutase dan aktivitas imun seluler yang kuat dengan
spesifisitas lebih tinggi daripada turunan protein termurnikan tuberkulin (PPD). Pada tahun 1999,
Kamath dkk melaporkan bahwa imunisasi tikus dengan vaksin DNA MPT64 menginduksi sel limpa
untuk memproduksiγ IFN-dan juga menginduksi aktivitas CTL spesifik MPT64

Regina Andini M
 PENCARIAN FAKTOR GENETIK YANG BERHUBUNGAN DENGAN
PENYAKIT PEMULIHAN KEKEBALAN PADA PASIEN HIV KOINFEKSI
DENGAN MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS
Hasilnya penelitian ini menunjukkan pola asosiasi yang berbeda dalam dua populasi. Sebagai contoh;
pembawa varian alel di SLC11A1 D543N memberikan perlindungan dari kejadian IRD di Kamboja
tetapi tidak ada efek pada pasien India. SNP ini telah dikaitkan dengan kerentanan terhadap penyakit
inflamasi seperti penyakit Crohn pada pasien Yunani dan borok Buruli pada pasien Ghana.
Pengangkutan varian alel di IL18-607 memberikan peningkatan risiko hampir 4 kali lipat untuk
mengembangkan kejadian IRD pada pasien India, tetapi tidak berpengaruh pada orang Kamboja.
Tidak ada hubungan seperti itu yang diamati dalam kohort pasien TB paru India HIV-negatif, tetapi
dalam kohort TB paru Cina Han tanpa HIV, pembawa varian alel di IL18-607 dikaitkan dengan
penurunan risiko pengembangan TB
jadi ada pemisahan yang jelas antara peran haplotipe TNF pada IRD yang terkait dengan TB di
negara berkembang dan mikobakteri non-TB di Australia. secara keseluruhan ada hubungan
antara polimorfisme pada gen yang berhubungan dengan kekebalan dan TB-IRD, tetapi
tidak ada yang berlaku di kedua etnis. Meskipun kohortnya kecil, dapat dikatakan bahwa efek
yang cukup kuat untuk digunakan dalam praktik klinis seharusnya muncul. Studi selanjutnya harus
menyelidiki pola ketidakseimbangan hubungan untuk menentukan apakah asosiasi yang diamati
di sini mencerminkan perbedaan etnis dalam struktur haplotipik di seluruh gen kritis.
Suleha : P062211016
JUDUL : HUMAN GENETICS FACTORS IN
TUBERCULOSIS AN UPDATE
Penyebab Polimorfisme: TLR, KIR, VDR, ASAP1, AGMO, FOXP1, dan UBLCP1

Proses Mekanisme

Empat polimorfisme situs restriksi endonuklease untuk ApaI, TaqI,

Hubungan anatra polimorfisme
gen inang dengan genotipe
bakteri menunjukkan bahwa
polimorfisme gen TLR 2 (misalnya
C-T597C) berhubungan dengan
infeksi yang disebabkan oleh
galur MTBC yang berbeda.
BsmI dan FokI di VDR dan dari tiga polimorfisme rs4588A/C/T
(Thr420Lys), rs7041G/T (Asp416Glu) dan rs4725C/T (Cys299Cys) di
protein pengikat reseptor vitamin D (VDBP) pada 198 pasien TB
dan 170 kontrol sehat dari populasi Han Taiwan. Varian TaqI,
BsmI (VDR) dan rs7041G/T (Asp416Glu) (VDBP) secara signifikan
terkait dengan kerentanan terhadap TB [29]. Meskipun
polimorfisme VDR tidak terkait dengan kerentanan terhadap TB
pada populasi Iran, defisiensi vitamin D sangat terkait dengan
kerentanan TB
Suleha : P062211016
JUDUL : GEN MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS DI SELURUH GENOM YANG
TIDAK BIAS, PENDEKATAN EKSPRESI UTNUK MENEMUKAN ANTIGEN YANG
DITARGETKAN

Penyebab Polimorfisme: Lpr1 dan SP110b

Proses
Gen yang dipilih diekspresikan
dalam satu set data tetapi tidak
dalam kumpulan data,
sehingga memilih
Mycobacterium Tuberculosis
gen yang diekspresikan secara
berbeda karena kerentanan
inang genetik atau variasi
fenotipe infeksi.
Mekanisme
Multiplikasi M. Tubeculosis pada magrofag rentan dan
menginduksi peralihan dari kematian sel nekrotik ke
apoptosis. Asosiai studi genetik yg dilakukan di Afrika
Barat mengidentifikasi 3 polimorfisme pd gen Sp110b
yg terkait dengan kerentanan genetik terhadap TB.
Studi yang dilakukan di Ghana, Rusia, dan Afrika
Selatan juga ditemukan pada sapi yang berkorelasi
dengan kerentanan terhadap Mycobacterium avium
sp, paratuberkulosis.
 POLIMORFISME GENETIK IFNG DAN IFNGR1
PADA INFEKSI TUBERKULOSIS LATEN
• Ketika patogen M.TB menyerang inang,respon imun akan diaktifkan, yang
meliputi. produksi IFNG oleh natural killer (NK) dan NK T sel. IFNG adalah gen
yang paling banyak dipelajari dalam hal hubungannya dengan TB. Namun,
hasil studi sebelumnya tidak konsisten. Dalam penelitian ini, dua -SNPs
(rs1861494 dan rs2069718) dari IFNG digenotipe. IFNG rs1861494, terletak di
intron 3, Disarankan bahwa rs1861494 dapat mengubah transkripsi gen,
yang mungkin memiliki Hubungan fungsional pada ekspresi IFNG.

LIYASARI : P062211015
 GENETIC RESISTANCE TO MYCOBACTERIUM
TUBERCULOSIS INFECTION AND DISEASE

Bahwa variabilitas antar individu dalam presentasi merespon infeksi TB tergantung

pada empat faktor, yaitu mikrobiologis, ekologis, imunologis, dan genetik.
komponen genetik manusia dalam kerentanan infeksi M. tuberculosis dan
perkembangan menjadi aktif penyakit tidak dapat disangkal. Temuan dari genetika
klinis, genetik epidemiologi, populasi dan genetika fungsional memiliki semua
berkontribusi untuk mengidentifikasi gen kerentanan TB. Lebih menarik adalah sisi lain
dari koin fenotip—yaitu perlawanan terhadap baik infeksi awal atau, setelah infeksi,
resistensi terhadap perkembangan untuk penyakit. Meskipun fenomena itu sekarang
diakui,varian genetik yang tepat dan mekanisme yang berkontribusi Masih
memerlukan penjelasan. Pendekatan yang paling sukses dalam investigasi
resistensi/kerentanan telah difokuskan pada fenotipe infeksi dan penyakit dan
fenotipe resister mungkin memegang kunci penemuan varian genetik yang dapat
ditindaklanjuti di TB infeksi dan penyakit

LIYASARI : P062211015
 FOUR-GENE PAN-AFRICAN BLOOD
SIGNATURE PREDICTS PROGRESSION
TO TUBERCULOSIS
• Pasangan transkrip yang merekapitulasi kinerja prediktif RISK4 tercermin
sinyal komplementer dalam memprediksi risiko perkembangan TB. RISK4
terdiri dari GAS6 dan SEPT4 (diregulasi) dan BLK dan CD1C
(diregulasi). CD1C dan GAS6 (ligan pengaktif AXL) adalah diekspresikan
dalam dua sel dendritik (DC) yang berbeda bagian di mana ekspresi GAS6
mendefinisikan a AXL yang baru ditandai (reseptor AXL tirosin kinase)1
SIGLEC6 (asam sialat mengikat Ig seperti lektin 6)1 populasi DC (38),
menunjukkan bahwa patogenesis TB mungkin melibatkan redistribusi sirkulasi
himpunan bagian DC. Protein SEPT4 memiliki fungsi antiapoptosis, dan
penghapusannya peningkatan penyembuhan luka pada tikus ,
menunjukkan kemungkinan hubungan dengan paru-paru penyembuhan
selama perkembangan TB. BLK adalah kinase reseptor sel B, dan
downregulation-nya konsisten dengan pengurangan proporsi sel B dalam
darah selama TB.

LIYASARI : P062211015
J.1: Novel Biomarkers Distinguishing Active Tuberculosis from Latent Infection Identified by Gene Expression Profile of Peripheral Blood Mononuclear Cells
MASRIADI
P062211019
PENYEBAB, PROSES DAN MEKANISME TERJADINYA POLIMORFISME

Penyebab mutasi adalah pembersihan patogen dan perkembangan penyakit dari infeksi laten

Gambar 2. Analisis klaster hierarkis tanpa pengawasan dari 506 gen yang
diekspresikan secara berbeda dalam perbandingan berpasangan. Ada 4
sampel di setiap kelompok (HC, LTBI, TB)
Gambar 1. Diagram Venn gen yang diekspresikan secara berbeda dalam Warna semu menunjukkan ekspresi diferensial
sampel peripheral blood mononuclear cells (PBMC) setelah stimulasi Merah: regulasi naik
menggunakan analisis microarray, secara komprehensif menentukan Hijau: regulasi turun
perbedaan transkripsi dalam Purified Protein Derivative (PPD) dan Hitam: tidak ada perubahan ekspresi
perubahan lipatan .2.0
J.2 : Genes and Genetics of Tuberculosis MASRIADI
PENYEBAB, PROSES DAN MEKANISME TERJADINYA POLIMORFISME P062211019
Penyebab mutasi adalah defisiensi imun, gen yang merusak jalur pensinyalan IFN γ

Genome wide association studies (GWAS) adalah untuk mengidentifikasi varian DNA terkait penyakit secara luas genom. GWAS pertama untuk tuberkulosis yang dilakukan
pada populasi Afrika dari Ghana dan Gambia, mengidentifikasi SNP intergenik rs 4331426 pada wilayah kromosom 18q11.2 [42]. Namun implikasi biologis dari SNPS ini tidak
diketahui karena terletak di daerah gurun gen. Populasi Ghana dan Gambia mengidentifikasi SNP non-coding lain rs 2057178 yang dikaitkan dengan resistensi terhadap TB [45].
Hal ini menunjukkan bahwa varian ini dapat mengubah ekspresi ASAP1 dalam sel dendritik yang mempengaruhi migrasi [46]. Populasi Rusia tidak menunjukkan hubungan apa
pun dengan SNP di lokus 18q11 yang sebelumnya dilaporkan pada populasi Afrika. SNP yang diidentifikasi pada populasi Afrika gagal untuk mereplikasi pada populasi Thailand
dan Jepang. Populasi Thailand menyajikan bukti keterkaitan pada 20q12. Ketika pasien dikelompokkan berdasarkan usia (lebih dari 45 tahun), pasien tuberkulosis muda
menunjukkan hubungan yang signifikan dengan SNP rs 6071980 pada 20q12 [21]. Gen terdekat HSPEP1-MAFB adalah kandidat potensial untuk kerentanan TB. Baru-baru ini,
sekuensing mendalam dari wilayah 20q13-12.3 mengidentifikasi rs13830 dan rs1127354 pada gen ITPA yang menunjukkan hubungan dengan pasien TB muda (usia <45 tahun)
[48] di Jepang. Dua SNP rs1568952 dan rs2726600 yang terletak di intron gen TOX secara signifikan terkait dengan tuberkulosis. Hubungan tersebut bahkan lebih kuat pada
pasien dengan usia kurang dari 25 tahun. TOX diperlukan untuk pengembangan garis keturunan CD4 T. Hasil direplikasi dalam keluarga inti Madagaskar dengan onset awal TB
[50]. Studi perbandingan dilakukan dgn kohort yang dari orang-orang dari Uganda dan Tanzania, yang terdiri dari pasien TB koinfeksi HIV dan hanya individu yang terinfeksi
HIV yang tidak mengembangkan infeksi TB meskipun pajanan dekat dengan pasien TB [51]
• TUGAS BIOLOGI SEL DAN MOLEKULER
SAMARUDDIN
P062211037
 APA ITU POLIMORFISME?
Kehadiran lebih dari satu alel pada lokus tertentu dalam populasi tertentu disebut polimorfisme.
Jika frekuensi alel minor dari alel tertentu dalam populasi lebih dari 1%, situasi ini disebut sebagai
polimorfisme. Di sisi lain, polimorfisme juga dapat dianggap sebagai variasi genetik yang
terputus-putus. Selama variasi genetik yang terputus-putus, beberapa bentuk individu yang lebih
tajam dapat diidentifikasi dalam suatu populasi. Organisme tertinggi dapat dibagi menjadi dua
jenis kelamin sebagai jantan dan betina sebagai akibat dari variasi genetik yang terputus-putus.
Kelompok darah manusia juga merupakan contoh variasi genetik yang terputus-putus.

Polimorfisme bertahan dari generasi ke generasi karena tidak dipengaruhi oleh seleksi alam. Itu
berarti polimorfisme tidak membawa keuntungan maupun kerugian bagi individu. Teknik biokimia
diperlukan untuk membedakan antara beberapa polimorfisme karena mereka tidak membawa
manifestasi yang terlihat. Cara nutrisi serangga sosial adalah contoh dari jenis polimorfisme ini.
 JUDUL : VARIABILITAS GENETIK DAN KERENTANANNYA PADA INFEKSI
TUBERKULOSIS

Abstrak
Tuberkulosis (TB) merupakan penyakit menular yang mendunia. Diamenyebabkan 10,4 juta
kematian pada tahun 2016. Penelitian ini bertujuan untukmenjelaskan beberapa gen yang terlibat
dalam perkembanganpenyakit TB pada populasi manusia. Studi ini tidakhanya berguna dalam
memahami patogenesispenyakit dan mengidentifikasi risiko populasi, tetapi jugamembuka jalan
untuk pengobatan yang lebih baik bagi yang sakitindividu.Kata kunci: Tuberkulosis; Gen;
Patogenesis; ManusiaPopulasi
 Polimorfisme dalam Urutan DNA
disitus yang berbeda di HLA
menyebabkan variasi alelik dan
antigenpengakuan karena protein
pengikat difereNSIASI.

Makrofag yang terletak pada epitel alveolus paru menghasilkansejumlah besar vitamin
D3 yang membantu dalam pembentukandari granuloma. Beberapa penelitian pada
populasi yang berbeda telahtelah dibuat pada lokus gen Fok1 dan Taq1. Fok1 dan
Taq1polimorfisme dengan kadar vitamin D3 serum yang rendah mengurangiFungsi
VDR yang pada gilirannya sangat terkait dengan TB.Banyak studi tinjauan
mengungkapkan hubungan antara VDR polimorfisme dan TB menjadi protektif atau
rentan
 JUDUL :
Efek Antimetastatik Kurkumin pada
Kanker Mulut dan Gastrointestinal

Kanker Gastrointestinal (GI) dikenal sebagai tumor ganas padat yang sering terjadi yang dapat
menyebabkan angka kematian yang tinggi di dunia. Metastasis adalah fitur destruktif yang
signifikan dari sel tumor, yang secara langsung berkorelasi dengan penurunan prognosis dan
kelangsungan hidup. Curcumin, yang ditemukan dalam kunyit, telah diidentifikasi sebagai
senyawa bioaktif alami terapeutik yang kuat (Curcuma longa). Ini telah diterapkan secara
tradisional selama berabad-abad untuk mengobati berbagai penyakit, dan telah menunjukkan
kemanjuran untuk sifat antikankernya. Sejumlah penelitian telah mengungkapkan bahwa kurkumin
menghambat migrasi dan metastasis sel kanker GI dengan memodulasi berbagai gen dan protein,
yaitu faktor pertumbuhan, sitokin inflamasi dan reseptornya, berbagai jenis enzim, caspases,
molekul adhesi sel, dan protein siklus sel. Di sini, kami merangkum efek antimetastatik kurkumin
pada kanker GI, termasuk kanker pankreas, kanker lambung, kanker kolorektal, kanker mulut, dan
kanker kerongkongan.
Regulasi Metastasis pada Kanker Pankreas oleh CurcuminEfek yang dimediasi
kurkumin pada metastasis dalam sel kanker pankreas dikaitkan dengan sifat mereka
pada berbagai sel heterotipik — sel-sel ini, termasuk sel endotel, makrofag, fibroblas
terkait kanker (CAF). CAF telah terlibat dalam keganasan yang berbeda, seperti
adenokarsinoma duktus pankreas (PDAC), kanker payudara, dan karsinoma lambung
(Kasashima et al., 2014; Sun et al., 2014). Dengan menargetkan berbagai peristiwa
seluler dalam sel kanker seperti viabilitas sel, pertumbuhan tumor, metastasis,
revaskularisasi, pengawasan kekebalan, dan CAF, kurkumin memainkan peran penting
dalam mengatur perilaku tumor (Lunardi et al., 2014)
Kesimpulan
Selama berabad-abad, kurkumin telah banyak digunakan sebagai bumbu
makanan, dan studi penelitian kontemporer telah mengkonfirmasi
kemanjurannya dalam terapi kanker. Efek antikanker adalah sifat paling penting
dari kurkumin, yang mempengaruhi berbagai tahap perkembangan kanker,
termasuk pembentukan sel kanker, proliferasi, dan invasi tumor. Menurut
penelitian ekstensif, kurkumin dapat menekan metastasis pada kanker GI melalui
pengaturan berbagai jalur pensinyalan. Kurkumin memiliki fungsi penting dalam
pencegahan metastasis dengan beberapa mekanisme, termasuk mencegah faktor
transkripsi serta jalur pensinyalannya (misalnya, NF-κB, STAT3, AP-1),
beberapa protease (misalnya, MMPs, uPA), sitokin inflamasi (misalnya, ,
CXCL1, IL-6, CXCL2, IL-8), modulasi miRNA (misalnya, miR181b, miR21),
beberapa protein kinase (misalnya, FAK, MAPKs), dan protein kejutan panas
(HLJ1). Menurut penelitian, pengobatan kurkumin menyebabkan peningkatan
yang signifikan dalam volume penampang tumor metastasis (70%) dan zona
(46%). Kurkumin dapat meningkatkan pertumbuhan metastasis LLC pada tikus
dengan meningkatkan konsentrasi VEGF, faktor angiogenik, monosit
chemotactic protein-1 (MCP-1), dan IL-1β.Selain efek farmasi yang mungkin
dari kurkumin, keamanan dan dosis terapeutik yang relevan juga harus
ditetapkan, mengingat laporan tentang efek samping kurkumin dalam terapi
kanker. Investigasi klinis dan praklinis di masa depan pada sifat anti-metastasis
kurkumin harus dirancang dengan cara yang menunjukkan keamanan dan
efektivitas kurkumin dalam menghambat metastasis kanker.Telah ditemukan
bahwa nanopartikel kurkumin meningkatkan sifat antikankernya melalui
peningkatan penyerapan sel kanker, internalisasi zona target, dan bioavailabilitas
yang tinggi. Nanopartikel polimer, misel polimer, dan liposom adalah pembawa
nano biasa yang dieksploitasi untuk enkapsulasi kurkumin. Diperlukan lebih
banyak upaya untuk meningkatkan nanopartikel kurkumin untuk terapi sel
kanker yang ditargetkan (misalnya, pelapisan nanopartikel dengan
peptida/antibodi yang mengikat reseptor yang diregulasi pada permukaan sel
kanker) di masa depan.
Fortuna Dwiningsih_ P062211025

THE ONTARIO UNIVERSAL TYPING OF

TUBERCULOSIS (OUT-TB) SURVEILLANCE
• Program Surveilans Ontario Universal PROGRAM
Typing of Tuberculosis (OUT-TB) bertujuan • Genotipe universal dilakukan
untuk meningkatkan surveilans dan menggunakan tiga metode:
pengendalian penyakit tuberkulosis (TB)
di Ontario dengan mengkarakterisasi spoligotyping, analisis mycobacterial
Mycobacterium tuberculosis kompleks interspersed repetitif unitvariable-
(MTBC) mengisolasi dari setiap kasus baru number tandem repeat (MIRU-VNTR),
TB di Ontario dengan seperangkat alat dan IS6110 RFLP.
genotipe molekuler.
Fortuna Dwiningsih_ P062211025
TRANSCRIPTIONAL BIOMARKERS FOR PREDICTING
DEVELOPMENT OF TUBERCULOSIS: PROGRESS AND
CLINICAL CONSIDERATIONS
• (Whole blood transcriptional
biomarkers) biomarker transkripsi darah
utuh menandai kemajuan yang jelas
dalam memprediksi perkembangan
klinis penyakit. Tes berbasis biomarker
transkripsi menjanjikan untuk memilih
individu berisiko TB tinggi untuk terapi
pencegahan.
• Selama dekade terakhir sejumlah besar
penelitian yang memanfaatkan
sekuensing RNA atau microarray untuk
penemuan biomarker telah
mengidentifikasi transkrip mRNA dalam
darah lengkap yang membedakan
mereka dengan TB paru klinis dan aktif
dari mereka dengan infeksi laten atau
penyakit lain.
• Tes berbasis biomarker transkripsi
mungkin juga dapat digunakan untuk
triase pasien simtomatik atau mereka
dengan CXR abnormal yang sedang
dievaluasi untuk TB, dengan lebih tepat
mengidentifikasi mereka yang
memerlukan diagnostik lebih lanjut
untuk konfirmasi bakteriologis.
• Masih belum jelas apakah tes berbasis
biomarker transkripsi harus digunakan
untuk memandu terapi pencegahan
pada individu dengan gangguan
imunitas seluler, seperti orang yang
hidup dengan HIV, pasien pra-
transplantasi dan mereka yang
menggunakan agen penghambat
faktor nekrosis tumor.
Yuniarti Arbain
BRCA MUTATIONS AND SURVIVAL IN BREAST CANCER: AN
UPDATED SYSTEMATIC REVIEW AND META-ANALYSIS

• BRCA1 dan BRCA2 adalah gen supresor tumor

dimana kedua gen tersebut adalah terletak di
kromosom 17q dan 13q, masing-masing, dan
mengkodekan faktor-faktor yang menghambat
pertumbuhan sel.
• Faktor-faktor tersebut juga terlibat dalam kontrol siklus
sel, transkripsi gen regulasi, perbaikan kerusakan DNA,
apoptosis dan lainnya proses seluler yang penting.
• Garis germinal umum mutasi BRCA1 adalah 5382 ins C,
185 del AG, 3819 del 5 dan 4153 del A, sedangkan
mutasi germline umum dari BRCA2 termasuk 4075 del
GT dan 5802 del4 [5].
• Garis keturunan mutasi gen ini memberikan
peningkatan risiko seumur hidup untuk sejumlah tumor
ganas, terutama kanker payudaradan kanker ovarium
Yuniarti Arbain THE ADVENT OF SALIVARY BREAST
CANCER BIOMARKER DETECTION USING
AFFINITY SENSORS

• MicroRNA atau mRNA adalah urutan pendek nukleotida RNA non-coding (panjang
21-25 pasangan basa). Mereka berfungsi sebagai regulator ekspresi gen pada
tingkat pasca-transkripsi.
• mRNA memiliki fungsi penting dalam perkembangan tumor; tumor memperkuat
mRNA onkogenik produksi sambil menekan produksi mRNA anti-tumor, sehingga
menciptakan tangan mRNA yang berbeda yang dapat digunakan untuk
mengidentifikasi subtipe molekul tumor dan berperan dalam inisiasi tumor,
metastasis, dan resistensi obat.
• Berkenaan dengan diagnosis, lebih dari 133 mRNA menunjukkan ekspresi abnormal
dalam jaringan BC bila dibandingkan dengan jaringan payudara normal.
• Terdapat delapan mRNA yang berbeda (CSTA, TPT1, IGF2BP1, GRM1, GRIK1, H6PD,
MDM4, S100A8) pada saliva yang dapat digunakan untuk deteksi dan identifikasi BC
Yuniarti Arbain
INTERACTIONS OF MULTIDOMAIN PRO-
APOPTOTIC AND ANTI-APOPTOTIC
PROTEINS IN CANCER CELL DEATH

• Dua jalur apoptosis seluler utama yang ditargetkan dalam terapi kanker bersifat intrinsik dan
ekstrinsik.
• Kedua jalur ini diatur oleh berbagai jenis protein, protein pro-apoptosis multidomain (Bak, Bax, dan
Bok), protein pro-apoptosis BH3 (Bid, Bim, Bad, Noxa, dan Puma), dan protein anti-apoptosis (Mcl-1,
Bfl-1, Bcl-XL, Bcl-2, Bcl-w, dan Bcl-B).
• Regulasi apoptosis tergantung pada ekspresi beberapa protein anti-apoptosis seperti Mcl-1, Bfl-1,
Bcl-XL, Bcl-2, Bcl-w, dan Bcl-B.
• Protein anti-apoptosis ini mencegah apoptosis melalui penghambatan atau inaktivasi protein
apoptosis (Bak, Bax, dan Bok).
• Bak, Bax, dan Bok adalah protein apoptosis yang fungsinya untuk memicu apoptosis.
• Ketiga jenis protein apoptosis ini melakukan fungsi yang sama, yaitu bertanggung jawab terhadap
permeabiltas membran luari mitokondria yang menghasilkan pelepasan sitokrom c.
• Selain itu, ada lima inisiator protein pro-apoptosis selain BH3 yaitu termasuk Bid, Bim, Bad, Noxa,
dan Puma.
• Fungsi protein pro-apoptosis ini adalah untuk memicu apoptosis melalui penghambatan anti-
apoptosis
NURUL HIDAYAH S.B

Polimerfisme Gen yang Berhubungan

dengan Infeksi TB
GEN MBL

Gen Mannose-Binding Lectin (MBL) sangat penting bagi tubuh dalam melawan
invasi patogen, terdiri dari MBL1 dan MBL2.

Gen MBL2 merupakan gen yang mengkode protein MBL. Perbedaan kadar
MBL serum antar individu terutama disebabkan oleh mutasi titik MBL2 kode
ekson 52 (rs5030737), 54 (rs1800451), dan 57 (rs1800450).

Studi asosiasi terkait populasi di Afrika Selatan, Denmark, dan Turki juga telah
menunjukkan bahwa ketiga mutasi tersebut berhubungan dengan infeksi MTB,
terutama pada pasien dengan TB otak.

Interaksi antara MBL, NRAMP1, dan VDR (Vit. D Receptor) terkait dengan
kerentanan terhadap TB, namun hubungan antara gen belum diketahui
NURUL HIDAYAH S.B

GEN SLC11A1
• The Solute Carrier Family 11 member 1 (SLC11A1)  natural resistance-associated macrophage
protein 1 (NRAMP1).
• Merupakan determinan penting dalam gen rentan TB, dan salah satu gen yang paling dipelajari
secara meluas mengenai kerentanan TB pada gen non-HLA (Human leukocyte antigens).
• Sekuen 3′ yang tidak diterjemahkan (3′UTR) dari Gen SLC11A1 di Afrika Barat, Asia, dan Afrika
Selatan menunjukkan bahwa mutasi SLC11A1 3′UTR dapat secara signifikan meningkatkan risiko
penyakit TB paru.
• Beberapa penelitian lain juga menunjukkan bahwa Gen SLC11A1 tidak hanya dikaitkan dengan
kerentanan dan perkembangan TB paru tetapi juga dapat berperan peran dalam kemunculan
dan perkembangan TB yang resistan terhadap obat.
• Gen SLC11A1 pada populasi Afrika-Amerika dan Kaukasia Amerika menunjukkan bahwa ada
dua SNPs kerentanan TB — rs17221959 dan rs3731863—pada populasi Kaukasia, sementara
rs3731865 rentan terhadap TB pada populasi Afrika-Amerika.