Machine Translated by Google

Tingkat Organisasi Tubuh

Manusia (Kimiawi, Sel, Jaringan,
Organ dan Sistem Organ}

dr. Marhaen Hardjo, M. Biomed, PhD

Bagian Biokimia Fakultas Kedokteran
Universitas Hasanuddin Makassar
Satu
Machine Translated by Google

Biokimia
• Kimia organisme hidup. • Studi
biologi pada tingkat molekuler.
Machine Translated by Google

Apa itu Biokimia?

• Biokimia adalah aplikasi kimia untuk mempelajari proses
biologis pada tingkat seluler dan molekuler.

•
Ini muncul sebagai disiplin yang berbeda sekitar
awal abad ke-20 ketika para ilmuwan
menggabungkan kimia, fisiologi dan biologi untuk
menyelidiki kimia sistem kehidupan dengan:
A. Mempelajari struktur dan perilaku molekul kompleks yang
ditemukan dalam bahan biologis dan

B. cara molekul-molekul ini berinteraksi untuk membentuk sel, jaringan, dan

seluruh organisme

3
Machine Translated by Google

Prinsip Biokimia
• Sel (unit struktural dasar organisme hidup) sangat
sumber energi yang terorganisir dan konstan diperlukan untuk
mempertahankan keadaan teratur.

• Proses kehidupan mengandung ribuan jalur kimia.

Regulasi yang tepat dan integrasi jalur ini diperlukan untuk
mempertahankan kehidupan

• Jalur penting tertentu misalnya Glikolisis ditemukan di hampir semua

organisme.

• Semua organisme menggunakan jenis molekul yang sama: karbohidrat,

protein, lipid & asam nukleat.

• Instruksi untuk pertumbuhan, reproduksi dan perkembangan untuk setiap

organisme dikodekan dalam DNA mereka

4
Machine Translated by Google

Organisme, Organ, Sel

Organisme

Organ

5
Machine Translated by Google

Sel Nukleus hanya ada

pada sel eukariotik.
RE memodifikasi protein, membuat makromolekul, dan Berisi sebagian besar
mentransfer zat ke seluruh sel. materi genetik sel.

Ribosom menerjemahkan
mRNA menjadi rantai polipeptida
(misalnya, protein).

Mitokondria
memproduksi adenosin trifosfat
(ATP), yang digunakan sebagai
sumber • sekitar 100 triliun (1014) sel dalam organisme manusia
energi. • 200 bentuk sel yang berbeda
6
Machine Translated by Google

Sel
• Blok bangunan dasar kehidupan
• Unit hidup terkecil dari suatu organisme
• Tumbuh, berkembang biak, menggunakan energi, beradaptasi, menanggapi lingkungan mereka

• Banyak yang tidak bisa dilihat dengan mata telanjang

• Sebuah sel dapat berupa keseluruhan organisme atau mungkin salah satu dari
miliaran sel yang membentuk organisme

• Jenis Dasar Sel

7
Machine Translated by Google

Daerah nukleoid mengandung DNA Mengandung 3 struktur dasar sel: •

Membran sel & dinding sel Mengandung Nukleus • Membran Sel • Sitoplasma
ribosom (tanpa membran) untuk dengan organel
membuat protein dalam sitoplasmanya

8
Machine Translated by Google

Dua Jenis Utama Sel Eukariotik

9
Machine Translated by Google

Karakteristik Bio-membran dan Organel

Membran plasma
Kompleks lipid/protein/karbohidrat, menyediakan penghalang
dan mengandung sistem transportasi dan pensinyalan.
Inti
Membran ganda yang mengelilingi kromosom dan nukleolus.
Pori-pori memungkinkan komunikasi khusus dengan
sitoplasma. Nukleolus adalah situs untuk sintesis RNA yang membent

Mitokondria
Dikelilingi oleh membran ganda dengan serangkaian lipatan
disebut krista. Berfungsi dalam produksi energi melalui metabolisme.
Mengandung DNA-nya sendiri, dan diyakini berasal dari bakteri yang
ditangkap.

Kloroplas (plastida)
Dikelilingi oleh membran ganda, mengandung membran tilakoid
bertumpuk. Bertanggung jawab untuk fotosintesis, perangkap energi
cahaya untuk sintesis gula. Mengandung DNA, dan seperti mitokondria
diyakini berasal dari bakteri yang ditangkap.

10
.
Machine Translated by Google

Retikulum Endoplasma Kasar (RER)

Jaringan membran yang saling berhubungan membentuk saluran di dalam
sel. Ditutupi dengan ribosom (menyebabkan penampilan "kasar") yang
sedang dalam proses mensintesis protein untuk sekresi atau lokalisasi
dalam membran.
Ribosom
Kompleks protein dan RNA yang bertanggung jawab untuk sintesis protein

Retikulum endoplasma halus (SER)

Jaringan membran yang saling berhubungan membentuk saluran di dalam
sel. Tempat untuk sintesis dan metabolisme lipid. Juga mengandung
enzim untuk detoksifikasi bahan kimia termasuk obat-obatan dan pestisida.

Aparatus Golgi
Serangkaian membran bertumpuk. Vesikel (kantong kecil yang
dikelilingi membran) membawa bahan dari RER ke aparatus
Golgi. Vesikel bergerak di antara tumpukan sementara protein "diproses"
menjadi bentuk matang. Vesikel kemudian membawa membran yang baru
terbentuk dan protein yang disekresikan ke tujuan akhir mereka termasuk
sekresi atau lokalisasi membran.

Lisosim
Sebuah organel terikat membran yang bertanggung jawab untuk
mendegradasi protein dan membran dalam sel, dan juga membantu
mendegradasi bahan yang dicerna oleh sel. 11
Machine Translated by Google

Vakuola
Selaput dikelilingi “kantong” yang berisi air dan bahan penyimpan
pada tumbuhan.

Peroksisom atau Badan Mikro

Menghasilkan dan mendegradasi hidrogen peroksida,
senyawa beracun yang dapat diproduksi selama metabolisme.

dinding sel
Tumbuhan memiliki dinding sel yang kaku selain membran selnya

sitoplasma
tertutup oleh membran plasma, bagian cair yang disebut sitosol dan
menampung organel membran.

Sitoskeleton
Susunan filamen protein di sitosol. Memberi sel bentuknya dan
menyediakan dasar untuk pergerakan.
Misalnya mikrotubulus dan mikrofilamen.

http://www.biology.arizona.edu hak cipta © 1997 - 2004.. 12

Machine Translated by Google
Machine Translated by Google

biologi. Struktur nano

Biokimia 14
Machine Translated by Google

Bagaimana molekul kompleks organik berevolusi dari

molekul yang lebih sederhana?

CH4 , H2O, NH3 , HCN

?
Evolusi Biokimia

15
Machine Translated by Google

Bagaimana molekul kompleks organik berevolusi

dari molekul yang lebih sederhana?

• Urea disintesis dengan memanaskan senyawa

anorganik amonium sianat (1828)
• Hal ini menunjukkan bahwa senyawa yang ditemukan secara
eksklusif dalam organisme hidup dapat disintesis dari zat
anorganik umum

16
Machine Translated by Google

Eksperimen Urey-Miller (1950)

Beberapa asam amino dapat diproduksi:

17
Machine Translated by Google

Banyak Biomolekul Penting

adalah Polimer

• Biopolimer - makromolekul yang dibuat dengan menggabungkan

banyak molekul organik yang lebih kecil (monomer)

• Reaksi kondensasi bergabung dengan monomer

(H2O dihilangkan dalam proses)

• Residu - setiap monomer dalam rantai

18
Machine Translated by Google
Machine Translated by Google

Organisasi Molekul sel

20
Machine Translated by Google

Bio-molekul
• Sama seperti sel yang membangun blok jaringan seperti molekul
blok bangunan sel.
• Sel hewan dan tumbuhan mengandung kurang lebih 10.000 jenis
molekul (bio-molekul)
• Air merupakan 50-95% dari isi sel menurut beratnya.

• Ion seperti Na+, K+ dan Ca+ dapat menyumbang 1% lainnya

• Hampir semua jenis biomolekul lainnya adalah organik (C, H, N, O, P, S)

• Variasi molekul yang tak terbatas mengandung C.

• Sebagian besar biomolekul dianggap berasal dari hidrokarbon.

• Sifat kimia biomolekul organik ditentukan oleh gugus fungsinya. Kebanyakan

bio-molekul memiliki lebih dari satu.

21
Machine Translated by Google

Biomolekul

• Karbohidrat •
Lipid • Protein

• Asam nukleat
Machine Translated by Google

Biomolekul – Struktur
anabolik

• Bahan penyusun • Makromolekul •

• Gula sederhana Polisakarida •
• Asam amino • Protein (peptida) •
Nukleotida • Asam RNA atau DNA • Lipid
lemak

Katabolik

23
Machine Translated by Google

Menghubungkan Monomer
Sel menghubungkan monomer dengan suatu proses
disebut sintesis dehidrasi
(menghilangkan molekul air)

Menghapus
H
H2
HAI

Untuk

MS
Hapus OH

Proses ini menggabungkan dua monomer

gula untuk membuat gula ganda
24
Machine Translated by Google

Menghancurkan Polimer
• Sel rusak
makromolekul
melalui proses yang
disebut hidrolisis
(menambahkan
molekul air)

Air ditambahkan untuk membagi gula ganda

25
Machine Translated by Google

Makromolekul

26
Machine Translated by Google

Makromolekul

27
Machine Translated by Google

Karbohidrat
• Tersusun atas karbon, hidrogen, dan oksigen.
• Gula •
Monosakarida
- Mantan. Glukosa
• Disakarida
- Mantan. Sukrosa

• Polisakarida
- Mantan. Glikogen, Peptidoglikan
Machine Translated by Google

Karbohidrat - Glukosa

www.palaeos.com
Machine Translated by Google

Karbohidrat - Sukrosa

www.chm.bris.ac.uk
Machine Translated by Google

Karbohidrat - Peptidoglikan

www.biologie.uni-hamburg.de
Machine Translated by Google

Karbohidrat - Glikogen

www.elmhurst.edu
Machine Translated by Google

Lemak
• Asam lemak
- Blok
pembangun
lipid.

biologi.clc.uc.edu
kursus.cm.utexas.edu
Machine Translated by Google

Lemak
• Contohnya adalah:
– Lilin
- Lemak dan minyak

– Fosfolipid
– Steroid

Membran Sel Fosfolipid.

www.williamsclass.com
Machine Translated by Google

Protein

• Tersusun dari
polimer asam amino.

• “manik-manik pada tali.”

• Ada 20 asam amino
primer.
• Polimer dari 3 atau
lebih asam amino
membentuk
polipeptida.
Machine Translated by Google

Protein

• Struktur Primer –
Urutan linier asam amino. •
Struktur Sekunder – Bentuk
heliks atau lembaran karena strukturnya.
• Struktur Tersier –
Sebuah protein
terlipat. • Struktur Kuarter
– 2 atau lebih rantai polipeptida
terikat bersama.
Machine Translated by Google

Struktur Protein

www.denizeuret.com
Machine Translated by Google

• Apakah protein.
Enzim
• Dianggap sebagai
katalis biologis.

– Mempercepat reaksi
kimia tanpa diubah.

• Nama sering diakhiri

dengan “-ase”.
- Mantan.
lipase, karbohidrat.
• Bekerja pada substrat.
• Protein, termasuk enzim,
dapat didenaturasi.
Machine Translated by Google

Asam nukleat

• DNA dan RNA.

– (DNA - asam deoksiribonukleat,
RNA - asam ribonukleat).
• Apakah "molekul turun-temurun."
• Berisi gen yang mengkode produk tertentu.

• DNA diterjemahkan menjadi RNA yang digunakan

untuk menghasilkan protein atau produk lain.
Machine Translated by Google

Struktur Asam Nukleat

• Nukleotida DNA
- Blok bangunan DNA. •
nukleotida RNA
– Blok penyusun RNA.
Machine Translated by Google

Struktur Asam Nukleat

• DNA
– Basa nitrogen www.microbelibrary.org

– Deoksiribosa
– Gugus fosfat •
RNA
– Basa nitrogen
– Ribosa
– Gugus fosfat
Machine Translated by Google

Basa Nitrogen

• Adenin (A)
• Guanin (G)
DNA dan RNA
• Sitosin (C) •
Timin (T) – hanya DNA •
Urasil (U) – hanya RNA
Machine Translated by Google

Basa Nitrogen

• A dan G
– Purin
(struktur
cincin ganda)
• C, T, dan U
– Pirimidin
(struktur
cincin tunggal)
hyperphysics.phy-astr.gsu.edu
Machine Translated by Google

Struktur DNA
• Ikatan nukleotida
antara gula dan gugus
fosfat untuk membentuk polimer
panjang.
• DNA untai ganda
• - Kedua polimer nukleotida

berikatan pada basa nitrogen.

www.genome.gov

– Gaya ikatan menyebabkan

polimer untai ganda
membentuk heliks ganda.
Machine Translated by Google

Struktur DNA
• James Watson (kiri) dan Francis Crick
(kanan) menemukan struktur heliks
ganda DNA dan proses replikasinya
pada 1950-an.

www.achievement.org
Machine Translated by Google

Konsep Kehidupan
Hidup dicirikan oleh
• Keanekaragaman hayati: lumut, mikroba, ubur-
ubur, sequoia, burung kolibri, pari manta, monster
gila, & Anda

• Kesatuan kimia: sistem kehidupan (di

bumi) mematuhi aturan kimia fisik dan organik –
tidak ada prinsip baru

46
Machine Translated by Google

Hidup butuh 3 hal :

(1) ENERGI, yang harus

diketahui caranya:

• Ekstrak •
Transform •
Manfaatkan

47
Machine Translated by Google

Energi Kehidupan

• Organisme
fotosintesis menangkap
energi sinar matahari dan
menggunakannya untuk
mensintesis senyawa organik

Senyawa organik menyediakan

energi untuk semua organisme

48
Machine Translated by Google

Menggunakan O2 beracun untuk menghasilkan energi

2 H2O O2 + 4e- + 4H+ (fotosintesis)

Glukosa + 6O2 6CO2 + 6H2O + Energi

49
Machine Translated by Google

Glikolisis: cara yang disukai untuk

pembentukan ATP

50
Machine Translated by Google

Kehidupan membutuhkan (2) MOLEKUL

SEDERHANA, yang harus diketahui caranya:

• Konversi •

Polimerisasi •
Degradasi

51
Machine Translated by Google

Kebutuhan hidup (3) KIMIA

MEKANISME, untuk:

• Memanfaatkan
energi • Mendorong reaksi kimia berurutan
• Mensintesis & mendegradasi makromolekul
• Mempertahankan keadaan tunak dinamis •
Merakit sendiri struktur kompleks • Mereplikasi
secara akurat & efisien • Mempertahankan
"keteraturan" biokimia vs luar

52
Machine Translated by Google

Trik #1: Kehidupan menggunakan kopling kimia

untuk mendorong reaksi yang tidak menguntungkan

53
Machine Translated by Google

Trik #2: Kehidupan menggunakan enzim untuk

mempercepat reaksi yang lambat

54
Machine Translated by Google

Bagaimana enzim melakukannya,

secara termodinamika?

55
Machine Translated by Google

Bagaimana enzim melakukannya,

secara mekanis?

56
Machine Translated by Google

Jenis reaksi kimia yang ditemui

dalam proses biokimia
1. Substitusi Nukleofilik • Satu
atom dari satu golongan menggantikan yang lain

2. Reaksi Eliminasi
• Ikatan rangkap terbentuk ketika atom dalam suatu molekul dilepaskan

3. Reaksi Penambahan:
• Dua molekul bergabung untuk membentuk produk
tunggal. • A. Reaksi Hidrasi
• Air ditambahkan ke alkena > alkohol (jalur adisi umum)

57
Machine Translated by Google

4. Reaksi Isomerisasi. •
Melibatkan pergeseran intramolekul dari atom atau gugus

5. Reaksi Oksidasi-Reduksi (redoks)

• Terjadi ketika ada transfer e- dari donor ke
penerima elektron

6. Reaksi hidrolisis
• Pemutusan ikatan rangkap oleh air.

58
Machine Translated by Google

Ringkasan Konsep Utama

Machine Translated by Google

Reaksi Biokimia
•
Metabolisme: jumlah total reaksi kimia yang terjadi dalam organisme
hidup (aktivitas yang sangat terkoordinasi dan terarah)
sebuah. Anabolisme- energi yang membutuhkan jalur biosintetik
b. Katabolisme- degradasi molekul bahan bakar dan produksi energi untuk
fungsi seluler

•
Semua reaksi dikatalisis oleh enzim

• Fungsi utama metabolisme adalah: a. perolehan

& pemanfaatan energi b. Sintesis molekul
yang dibutuhkan untuk struktur sel dan
berfungsi (yaitu protein, asam nukleat, lipid, & CHO
c. Pembuangan produk limbah

60
Machine Translated by Google

Meskipun ribuan jalur terdengar sangat besar

dan kompleks dalam sel kecil:

• Jenis jalurnya kecil •

Mekanisme jalur biokimianya sederhana
• Reaksi yang sangat penting (untuk energi
produksi & sintesis dan degradasi komponen sel
utama) jumlahnya relatif sedikit

61
Machine Translated by Google

Energi untuk Sel

• Sel hidup pada dasarnya tidak stabil. • Aliran

energi yang konstan mencegah mereka menjadi tidak

teratur.

• Sel memperoleh energi terutama melalui oksidasi

bio-molekul (ditransfer secara elektronik dari 1 molekul ke
molekul lain dan dengan demikian mereka kehilangan energi)

• Energi ini ditangkap oleh sel & digunakan untuk mempertahankan

struktur dan fungsi seluler yang sangat terorganisir

62
Machine Translated by Google