Mainpaper
Mainpaper
Lihat diskusi, statistik, dan profil penulis untuk publikasi ini di: https://www.researchgate.net/publication/326581135
KUTIPAN BACA
17 3.238
Avinash Marwal
Universitas Mohan Lal Sukhadia
LIHAT PROFIL
Semua konten yang mengikuti halaman ini diunggah oleh Avinash Marwal pada 24 Juli 2018.
Tinjau Artikel
ABSTRAK
Ke ywo rds Erwinia carotovora, bakteri penting berbentuk batang gram negatif (Family
Enterobacteriaceae), menyebabkan penyakit busuk lunak pada berbagai jenis tanaman,
Erwinia terutama kentang yang ditandai dengan blackleg pada tanaman kentang dan busuk lunak
carotovora; umbinya selama kondisi penyimpanan, sehingga menyebabkan kehilangan hasil yang ekstrim di seluruh dunia.
Kentang; Tujuan dari tinjauan yang diusulkan adalah untuk menggambarkan status saat ini dan
penyakit
menganalisis keragaman molekul E. carotovora, yang diperoleh dari kentang dan menyoroti
pengelolaan. berbagai teknik atau metode yang digunakan untuk pengelolaan penyakit Erwinia .
Perkenalan
Pertanian secara demografis merupakan sektor spesifik dan dapat mempengaruhi populasi
ekonomi terluas, memainkan peran penting bakteri menguntungkan yang terkait dengan
dalam pembangunan sosial ekonomi India tanaman. Selain itu, beberapa senyawa
secara keseluruhan. Namun, produktivitas bakterisidal ini (misalnya, 1,4-naphthoquinones)
berbagai tanaman sangat dipengaruhi oleh terakumulasi dalam jaringan tanaman , yang
serangan penyakit yang disebabkan oleh mikroorganisme.
pada gilirannya menyebabkan beberapa
Lebih dari 100 spesies bakteri diketahui dapat masalah kesehatan (Banasiuk et al.,2012).
menyebabkan penyakit tanaman. Penyakit
bakteri jauh lebih umum di daerah tropis dan
subtropis di India (Jackson, 2009). Sejumlah Anggota keluarga Enterobacteriaceae
tindakan pencegahan termasuk perawatan menyebabkan penyakit busuk lunak pada
kimia digunakan untuk melawan penyakit berbagai spesies tanaman di seluruh dunia
berbahaya yang disebabkan oleh bakteri. termasuk sayuran, bunga dan buah-buahan.
Sebuah konsorsium enzim ekstraseluler
Senyawa kimia yang berbeda digunakan pendegradasi dinding sel tanaman yang terdiri
oleh petani India yang miskin untuk dari pektat liase (Pel), poligalakturonase (Peh),
mengatasi masalah infeksi bakteri. protease (Prt), dan selulase (Cel) berkontribusi
Namun, sebagian besar senyawa ini bukan target
terhadap virulensi tanamannya (Chatterjee
83
Machine Translated by Google
et al., 1995). Diantaranya, pektinase Gambar.1 [a] Gejala kaki hitam akibat infeksi
ekstraseluler, termasuk Pel dan Peh, Erwinia carotovora , [b] Erwinia carotovora
memainkan peran penting dalam maserasi subsp. atroseptica - Black Leg (Soft Rot) of
jaringan dan kematian sel (Favey et al., 1992). Potato, [c] Lesi yang berhubungan dengan
lentisel pada umbi kentang yang disebabkan
Erwinia carotovora: Penularan dan oleh Erwinia carotovora pv. atroseptica, atau
Kerugian hasil Erwinia carotovora pv.
kaisar.
Erwinia carotovora (Famili Enterobacteriaceae ),
merupakan bakteri fitopatogen gram negatif
berbentuk batang , dan patogen paling
mematikan yang mempengaruhi produktivitas
tanaman (Rogers, 1959). Bakteri tersebut
menyebabkan penyakit busuk lunak pada
berbagai jenis tanaman termasuk wortel,
kentang, mentimun, bawang merah, tomat,
selada, sawi dan tanaman hias seperti iris.
Penularan E. carotovora terjadi baik melalui
tanaman ke tanaman maupun serangga ke
tanaman. E. carotovora menyebabkan
kematian sel melalui penghancuran dinding
sel tumbuhan dengan menciptakan sel yang
rapuh secara osmotik. Kehilangan hasil
hingga 98,8% telah dialami di bawah epifit
buatan (Thinda dan Payakab, 1985). Erwinia
busuk lunak yang penting secara komersial
adalah Erwinia carotovora subsp. carotovora
(Ecc), Erwinia chrysanthemi, dan Erwinia
carotovora subsp. atroseptica (Eca), yang
menyebabkan penyakit pada kentang dan
tanaman komersial penting lainnya
(Czajkowski et al., 2009; Rahmanifar et
al.,2012).
84
Machine Translated by Google
Kelembaban dan suhu yang tinggi sekitar ekstraksi (Helias et al., 1998). Tujuh antibodi
30°C mendukung perkembangan infeksi E. monoklonal (MAbs) terhadap Eca telah
carotovora sehingga kondisi iklim cocok untuk diproduksi. ELISA-DAS menggunakan MAb
patogen ini (Colther et al.,1983). Gejala 4G4 dengan langkah pengayaan juga secara
penyakit diamati baik di luar maupun di dalam efisien mendeteksi Eca pada umbi dan
umbi. Kulit kentang terlihat seperti basah tanaman yang terinfeksi secara alami (Gorris
kuyup dan berbentuk lepuhan berwarna gelap. et al., 1994). Spesifisitas relatif, sensitivitas
Bakteri masuk melalui titik lemah di kulit dan metode mikrobiologi, imunologi dan molekuler
membusuk di bagian tengah kentang (Gbr. 1). yang baru dikembangkan untuk mendeteksi
Penapisan isolat untuk aktivitas antagonis dan mengukur kontaminasi umbi adalah
terhadap E. carotovora subsp. atroseptica dibahas dalam kaitannya dengan pengujian
mengungkapkan bahwa 38% endofit stok benih komersial. (Perombelon et al.,
melindungi tanaman kultur jaringan dari 1998). Gen PrtW menyediakan aktivitas
penyakit kaki hitam (Reiter et al., 2002). protease untuk perkembangan normal gejala
penyakit yang disebabkan oleh bakteri ini
(Marits et al., 2002). Gen pelB mengkode
pectate lyase B, salah satu dari tiga pectate
Gen yang memberikan ketahanan busuk lyases yang diidentifikasi di Erwinia carotovora
lunak pada kentang telah diidentifikasi (gen EC. PelB (Pel2) dan PelC (Pel3) dari Ecc
ubiquitin7, atau ubi7) pada umbi (Garbarino dianggap sebagai lyases pektat utama yang
dan Belknap, 2002), tanaman lain mungkin bertanggung jawab untuk maserasi jaringan
juga mendapat manfaat dari perlindungan tanaman (Perombelon, 2002). Gen hrp yang
yang diperoleh oleh gen ketahanan Erwinia mengkode sistem sekresi tipe III telah
yang terkait dengan promotor gen ubi7 (Wood, dianggap penting untuk virulensi (De Boer,
1998). Metode berbasis PCR dikembangkan 2003; Mee-Ngan et al., 2004).
untuk deteksi dan kuantifikasi simultan dari
patogen kentang E. carotovora subsp.
TM
atroseptica (Eca) pada umbi kentang. ,
Kit berbasis PCR, Probelia untuk deteksi Eca
Ini adalah metode deteksi berbasis PCR pada kentang telah dievaluasi. Kit ini
kuantitatif pertama yang dijelaskan untuk Eca didasarkan pada amplifikasi PCR spesifik
dan yang pertama untuk setiap patogen DNA diikuti dengan deteksi amplikon dengan
tanaman bakteri yang menggabungkan kontrol hibridisasi ke probe DNA berlabel peroksidase
ekstraksi DNA (Hyman et al., 2000). Primer dalam lempeng mikro (Frechon et al., 1998;
ECA1f dan ECA2r secara khusus memperkuat Darrasse et al., 1994). Sensitivitas PCR untuk
fragmen DNA 690-bp dari semua Eca (De deteksi langsung Eca dalam ekstrak kulit
Boer dan Ward, 1995). Pengukuran kasar hanya 107-108 sel/ml, karena
konduktansi otomatis dalam media polypectate penghambatan amplifikasi PCR oleh senyawa
digunakan untuk mendeteksi busuk lunak turunan umbi kentang (Fraaije et al., 2008).
patogen Erwinia spp. dalam ekstrak kulit Intergenic transcribed spacer (ITS) 16S-23S
kentang (Fraaije et al., 1997). rRNA digunakan untuk mengidentifikasi
Erwinias busuk lunak. ITS diamplifikasi dari
Analisis infeksi E. carotovora Erwinia dan genera lainnya menggunakan
primer PCR universal (Toth et al., 2001).
Tes PCR-RFLP berdasarkan gen penyandi Teknik serologis juga telah digunakan untuk
pektat-lyase memungkinkan deteksi E. mengidentifikasi
carotovora yang membutuhkan DNA lengkap
85
Machine Translated by Google
patogen E. carotovora (De Boer et al., 1987). Chakravarti, 2011). Ekstrak air dari dua puluh
Ditemukan bahwa patogen diabadikan dalam tanaman disaring dengan metode difusi agar
benih, baik secara eksternal maupun internal untuk aktivitas antibakterinya terhadap Eca,
(Prasad dan Sinha, 1978). organisme penyebab busuk lunak kentang. Efek
Patogen tersebut menyebabkan busuk lunak pada penghambatan yang kuat pada spesies Erwinia
kentang, wortel, bawang merah, dan juga diamati dengan penggunaan ekstrak daun
menginfeksi jowar (Sorghum), bajra [Pennisetum Camellia sinensis, dan ekstrak kulit kayu Acacia
typhoides], dan tembakau (Hingorani et al.,1960). arabicae dan Acacia catechu (Bhardwaj dan
Laura, 2008). L-Asparaginase, obat enzim yang
Penelitian E. carotovora pada Status Nasional digunakan untuk pengobatan leukemia limfoblastik
akut diisolasi dari E. carotovora (Jain et al., 2012).
86
Machine Translated by Google
sifat pengendalian biologis dan kimia dapat fitopatogen interik, Erwinia carotovora. Mol.
digunakan untuk pengelolaan penyakit tanaman Patol Tumbuhan. 7: 31 45.
melalui ekspresi seluler gen terkait biokontrol
dan sekresi metabolit bioaktif. Czajkowski, R., G. Grzegorz dan Van Der Wolf
JM 2009. Distribusi Dickeya spp. dan
Pectobacterium carotovorum subsp.
Referensi carotovorum pada benih kentang yang
terinfeksi secara alami. eur. J.
Banasiuk, R., A. Kawiak dan Królicka A. Tanaman. Patol. 125: 263-275.
2012. Kultur in vitro tanaman karnivora dari Darrasse, A., A. Kotoujansky dan Bertheau Y.
genus Drosera dan Dionaea untuk produksi 1994. Isolasi dengan pengurangan genom
metabolit sekunder yang aktif secara biologis. probe DNA spesifik untuk Erwinia carotovora
subsp. atroseptik. Aplikasi Mengepung.
J. Biotek, Mikrobiol. 60 :298-306.
Bio Komputasi. Bionanotech. 93(2): 87-96.
De Boer, SH 2003. Karakterisasi pektolitik
Bhardwaj, SK dan Laura J.S. 2008. erwinias patogen tanaman yang sangat
sebagai
Aplikasi Mengepung. Mikrobiol. 61: 1959- Fraaije, BA, M. Appels, SH De Boer, JWL Van
1967. Vuurde dan Van den Bulk RW 1997. Deteksi
Coulthurst, SJ, KS Lilley dan Salmond G. P. C. busuk lunak Erwinia spp. pada benih
2006. Analisis genetik dan proteomik peran kentang: konduktimetri dibandingkan dengan
luxS dalam
87
Machine Translated by Google
pelapisan pengenceran, PCR dan uji Hingorani, MK, UJ Grant dan Singh NH 1960.
serologis. Eropa J. Plant Pathol. 103:183-193. Erwinia carotovora .sp. zeae, patogen perusak
jagung di India. Fitopatologi India. 12: 151-157.
Fraaije, BA, Y. Birnbaum dan VanDen Bulk RW
2008. Perbandingan Metode Deteksi Erwinia
carotovora ssp. atroseptica pada Umbi Hyman, LJ, PR Birch, A. Dellagi, A.
Keturunan Berasal dari Umbi Solanum O. Avrova dan Toth I. K. 2000. Metode
tuberosum LJ yang Diinokulasi dari kompetitif berbasis PCR untuk deteksi dan
Phytopathol. 144: 551 557. kuantifikasi Erwinia carotovora subsp.
atroseptica pada umbi kentang. Lett Appl
Frechon , D. , P. Exbrayat , V. Helias , L.J. Mikrobiol. 4:330-5.
Hyman, B. Jouan, P. Llop, MM
Lopez, N. Payet M. C. M. Pérombelon, I. K. Jackson, R. W. 2009. Bakteri Patogen Tumbuhan :
Toth, et al, 1998. Evaluasi kit PCR untuk Genomik dan Biologi Molekuler . Pers
mendeteksi Erwinia carotovora subsp. umbi Akademik Caister .
kentang atroseptik . Kentang Res. 41:163-173. ISBN 978-1-904455-37-0.
Jain, R., KU Zaidi, Y. Verma dan Saxena P. 2012.
Garbarino, JE dan Belknap W.R. 2002. L-Asparaginase: Enzim yang menjanjikan
Konstruksi gen fusi peptida ubiquitin-litik , untuk pengobatan leukemia limfoblastik.
produk protein yang berasal darinya, dan akut
metode pembuatan dan penggunaannya. People s J. Res Ilmiah. 5(1): 29-35.
Paten promotor Ubi7: Paten AS 414102, S/N Kumar, A., VS Pundhir dan Gupta K.C.
091.482, 611. 1991. Peran fenol dalam ketahanan umbi
Gorris, MT, B. Alarcon, MM Lopez dan Cambra kentang terhadap busuk lunak oleh Erwinia
M. 1994. Karakterisasi Antibodi Monoklonal carotovora ssp. Carotovora.
Spesifik Erwinia carotovora subsp. atroseptica Kentang Res. 34: 9-16.
dan Perbandingan metode serologis untuk Maladkar, NK, VK Singh dan Naik S.
deteksi sensitifnya pada umbi. R. 1993. Produksi fermentasi dan isolasi L-
asparaginase dari EC-113.
Aplikasi Mengepung. Erwinia carotovora, Hindustan.
Mikrobiol kentang . 60: 2076-2085. Antibiotik. Banteng. 35:77-86.
Harris, SJ, YL Shih, SD Bentley dan Salmond Mee-Ngan, Y., DB Jeri dan Charkowski A.O. 2004.
G.P. 1998. Gen hexA dari Erwinia carotovora Keanekaragaman Genomik Erwinia carotovora
mengkode homolog LysR dan mengatur subsp. carotovora dan Korelasinya dengan
motilitas dan ekspresi penentu virulensi Virulensi.
ganda. Mikrobiol Mol. 28:705- 17. Aplikasi Mengepung. Mikrobiol. 70(5): 3013
3023.
Perombelon, M.C.M. 2002. Penyakit kentang
Helias , V. , A.C. Le Roux , Y. Bertheau , D.A. yang disebabkan oleh busuk lunak erwinias:
Andrivon, JP Gauthier dan Jouan B. gambaran patogenesis. Patol Tumbuhan .
1998. Karakterisasi subspesies Erwinia 51: 1-12.
carotovora dan deteksi Erwinia carotovora Perombelon, M.C.M. , Y. Bertheau, M.
subsp atroseptica pada ekstrak tanaman Cambra, D. Frechon, MM Lopez, et al,
kentang, tanah dan air dengan metode Mikrobiologi, 1998. metode imunologi dan
berbasis PCR. J Eropa molekuler cocok untuk deteksi komersial dan
Patol Tumbuhan. 104: 685-699.
88
Machine Translated by Google
89