Pendahuluan (overview)
Enzyme Specificity
Kofaktor Enzim
Enzyme Nomenclature
Lock and Key
Enzyme-Substrate Complex
Induced Fit Theory
Cara Kerja Enzim
Conditions Affecting the Actions of Enzymes
Inhibitor Enzim
Isozim/Isoenzim
Regulation of Enzymatic Activity
PENDAHULUAN
Kofaktor : Enzim :
Zn2+ Dehidrogenase alkohol
Anhidrase karbonat
Polimerase DNA
Mg2+ Heksokinase
6-fosfatase glukosa
Mn2+ Arginase
Fe2+/Fe3+ Sitokrom,
Peroksidase,Katalase
Cu2+ Oksidase sitokrom
K+ Kinase piruvat
Ni2+ Urease
Mo Reduktase nitrat
Se Peroksidase glutation
BEBERAPA CONTOH KOENZIM DAN
FUNGSI
Aktif
Interaksi spesifik dr enzim dg molekul tertentu (substrat )
menyebabkan pengaktifan molekul tsb dan mengakibatkan
perubahan struktur kimianya.
Katalis
Protein
substrates
Active Site: part of an enzyme to which the substrates
bind (most cases: a pocket of groove in the surface of the
protein)
ENZYME-SUBSTRATE COMPLEX
DRAWING
EXAMPLES OF ACTIVE SITES
INDUCED FIT THEORY
Active site on enzyme not as
rigid as “lock and key” model
As the substrate attaches to
the enzyme’s active site, the
site changes shape to fit the
substrate
improves the fit of the
active site to the substrate
brings catalytic groups into
the correct position for
action
MECHANISMS OF CATALYSIS
A large part of the catalytic power of an enzyme
depends on its ability to lower the activation energy
To do so, an enzyme may provide an environment
within the active site that favors the transitions
state...or it may provide catalytic groups that allow
the reaction to proceed via intermediates not part of
the uncatalyzed reaction
many enzymes act as general acid-base catalysts
MECHANISMS OF CATALYSIS
Temperature
pH
Kadar substrat
Kadar enzim
Koenzim
Ada tidaknya senyawa inhibitor (Heavy Metal Ions)
Oksidator
Radiasi
Bila T ↑ V ↑
Bila T naik 10oC kecepatan reaksi 2 X lipat
Bila T turun 10oC kecepatan turun ½ X lipat
EXTREMES OF TEMPERATURE
Changes enzyme structure
changes active site
prevents enzyme from
attaching to substrate
The thermal agitation of the
enzyme molecule disrupts the
hydrogen bonds, ionic bonds,
and other weak interactions
within the protein molecule
In humans, enzymes have an
optimum temperature of 37ºC
PH CHANGES ON ENZYME ACTIVITY
Extreme changes in pH values
denature such ionisable
enzymes rendering them
ineffective
within a narrow pH range,
enzyme structure changes
reversibility, and each such
enzyme was optimally at a
specific pH
Optimal pH values for most
enzymes
6-8 pH
exception: I.e. digestive
enzymes in stomachs
PH
100% SH+
pH rendah pH tinggi
pH maksimum
KADAR SUBSTRAT
Bila S (substrat) dinaikkan kadarnya, maka V
(kecepatan reaksi) juga akan naik sampai mencapai
V maximum
berarti kenaikan V sesuai dg kenaikan kadar substrat
sampai E (enzim) dijenuhi oleh substrat mk V tdk
dpt naik lagi(konstan)
KADAR ENZIM (E)
E
* Kecepatan awal reaksi (v) berbanding lurus dengan
kadar enzim
Ketika semua enzim telah jenuh V turun
KADAR KOENZIM
E + Ko-E E-Ko-E
Karena enzim tertentu hanya dapat bekerja kalau ada
Ko-E, maka pengaruh kadar Ko-E thd V sama dengan
kadar Enzim terhadap V.
ION-ION LOGAM BERAT
Competitive Inhibitors
Compete with substrate for the enzymes
Do not affect Vmax
Raise the apparent Km
NONCOMPETITIVE INHIBITORS
Donot affect Km
Lower Vmax
E + P
B. Hambatan non kompetitif irreversibel (I mengikat
enzim dan mengubah struktur E)
+I
E EIS X E + P
+S
MODEL-MODEL SISI
AKTIF/KATALITIK/SUBSTRAT
* Sisi aktif: tempat pada E yang mengadakan reaksi
dengan S atau yang ditempat koenzim
* Model: I. Emil Fischer (dahulu)
II. Koshland
I. Model Fischer mempunyai kelemahan karena sisi
aktif bersifat kaku seperti key and lock
II. Model (Induced Fit = mendorong kecocokan)
- sisi aktif lebih fleksibel
- substrat akan menginduksi perubahan konfor-
masi enzim
Koshlan membedakan 3 residu asam amino
1. Residu kontak : residu A.A. dalam ikatan dengan
jarak 0,2 mm dari S
2. residu spesifik : residu A.A. yang ikut serta
dalam pengikatan S yang selanjutnya juga ikut
serta dalam proses katalitik
3. Residu katalitik: residu A.A. yang ikut serta
dalam perubahab ikatan kovalen selama E bekerja
Modifiers (Modulator)
* Molekul yang dapat mengubah aktivitas E
* Di dalam tubuh secara fisiologis berguna untuk
mengatur kerja E dan metabolismenya
* Ada 2 macam modulator
1. Modulator positif: memacu aktivitas katalitik E
2. Modulator negatif: menurunkan aktivitas
katalitik E
Fungsi logam (M) hubungannya dengan E
1. sebagai peranan struktural, katalitik
2. sebagai pengubah Keq:
logam meningkat reaksi lebih cepat
3. pengubah konformasi E inaktif menjadi aktif atau
sebaliknya
Dasar pemikiran:
Perubahan kadar enzim dalam plasma atau substratnya merupakan
refleksi adan adanya proses patologis pada sel, jaringan atau organ
Macam enzim dalam plasma
1. Enzim plasma fungsional:
lipoprotein lipase: enzim yang diperlukan untuk
penjendalan darah, sedang yang untuk menghan-
curkan penjendalan darah: pseudokolin esterase.
Dalam keadaan normal kadarnya dalam darah >
di jaringan
2. Enzim plasma non fungsional
Amilase pankreas, lipase, alkalin fosfatase, dll.
yang dalam keadaan normal kadarnya rendah
Bagaimana cara untuk mengetahui bahwa sel, jaringan atau organ
dalam kondisi patologis?
Sangat ideal bila yang dianalisis adalah enzim-enzim yang hanya
diproduksi atau disekresi sel, jaringan atau organ tersebut.
Contoh jantung: kreatin fosfokinase, laktat
dehidrogenase
Defisiensi?
Akan terjadi penimbunan senyawa-antara tertentu dalam darah
dikeluarkan lewat urine
Maka dengan mengukur kadar senyawa-antara tertentu
dapat ditunjukkan reaksi enzimatis mana yang
mengalami kegagalan atau yang dihambat
Enzim-enzim dalam serum yang sering digunakan untuk
diagnosis klinis
Contoh lain :
Enz. Aspartat transkarbamoilase (ATC ase)
mengkatalisa biosintesis pirimidin
dihambat oleh sitidin trifosfat (CTP)
Sifat2 enz im alosterik berbeda dari enzim2 biasa yg
bukan enzim pengatur.
Bedanya :
Fosforilase
glikogen (otot,
hati)
(GLUKOSA)n-1
+ glukosa 1-fosfat
Rantai glikogen
diperpendek
Aktifasi sesekali
intermiten
BAKAL ENZIM Belum
ZIMOGEN/ PROENZIM
aktif Aktifasi cepat
Membuat
Proses proteolitis
Tempat
terbatas
katalitik
Katalitik aktif
Contoh : enz digestif (pepsin, tripsin), enz hemostasis dan fibrinolisis
Kimotripsinogen (245rantai) enzim yg aktf penuh jika ikatan
peptida antara arginin15 dipisah dg isoleusin16 oleh tripsin
KIMOTRIPSINOGEN INAKTF
1
TRIPSIN
Л
1-kimotripsin 15 16 245
aktivasi
kalmodulin kerja
inaktivasi
Tergantu
ng ion
ca++
4 tempat
Pengikatan
α-antitripsin ca++
Diagnosa
Contoh:
LDH 1 : H4 jantung
LDH 2 : H3M jantung
LDH 3 : H2M2
LDH 4 : H1M3 (hati)
LDH 5 : M4 (hati)
Biologi molekuler
STREPTOKINASE IN BREAKING DOWN
BLOOD CLOTS
STREPTOKINASE
can dissolve blood clots that form in the heart, blood vessels, or
lungs after a process, such as a heart attack
called a thrombolytic agent
can also dissolve blood clots that form in intravenous catheters
tubing that goes into a vein for fluid exchange
PERANAN ENZIM
1. Penyelidikan reaksi-reaksi metabolik dan
pengaturannya
2. Sebagai katalisator dalam industri yg
mensintesis hormon/antibiotik
3. Membantu dlm menegakkan diagnosa
krn kadar enzim pd keadaan patologik
tertentu dpt mengalami perub yg nyata
dlm darah ataupun jaringan, penyakit genetik
(endonuklease retriksi)
*. 4. Dalam pengolahan pangan, pertanian,
peternakan dan pd akv. Sehari-hari dirumah
PEMBAGIAN ENZIM BERDASARKAN LOKASINYA
Enzim plasma fungsional:
Enzim atau proenzim tertentu terdapat sepanjang waktu dlm
sirkulasi individu normal, substrat juga terdapat dlm sirkulasi dan
melakukan fungsi fisiologis dlm darah
Contoh: Lipoprotein lipase, pseudokolinesterse, proenzim bekuan
darah dan lisis bekuan darah
umumnya disintesis dlm hati, konsentrasi dlm darah sama atau lebih
tinggi dibandingkan dlm jaringan
Enzim plasma non fungsional:
Tidak melakukan fungsi fisiologis dlm darah
Substrat sering tdk ada dlm plasma
Konsentrasi dlm darah individu normal berjutakali lebih rendah
dibanding dlm jaringan
No Enzim plasma fungsional Enzim plasma non fungsional