CHEMISTRY THESIS

Here is where your presentation

begins
Anggota
Kelompo Ni luh putri aristha dewi
k 1908551084

Ni Made Frida Yanti

1908551085

Diah Mawarni Fitriari

1908551086

Dinda Dwi
Prameswari
1908551087
 Kanker
Penyakit kanker yang jumlahnya semakin meningkat telah
mendorong dilakukannya pengembangan obat antikanker.
Penyakit Jumlah penderita kanker di dunia mencapai 14,068 juta jiwa.
Sebanyak 8,202 juta kematian akibat kanker dan 32,455 juta
orang terdiagnosa kanker dalam 5 tahun terakhir. Diperkirakan
kanker akan meningkat 14 juta kasus baru dari tahun 2012
sampai 2022 (World Health Organization, 2012).
• Reseptor: VEGFR2 (Vascular Endothelial Growth Factor
Identifikasi Receptor) dianggap sebagai jalur proangiogenik paling
penting untuk meningkatkan semua tahap angiogenesis
target obat termasuk permeabilitas vaskular, kelangsungan hidup sel
endotelial, proliferasi, migrasi atau invasi ke jaringan
sekitar, dan pembentukan tabung kapiler
• Enzim: VEGFR2 Tirosin kinase
• Kanal ion: ida capek belajar & ida stress belajar tiap hari
Uji in silico Aktivitas Sitotoksik dan
Toksisitas Senyawa Turunan N-(Benzoil)-
N’- feniltiourea Sebagai Calon Obat
Antikanker
 Design Obat Optimasi Target
Interaksi (Docking)

Senyawa N-(benzoil)-N’-feniltiourea dan 23 senyawa turunannya serta

senyawa pembanding hidroksiurea dan sorafenib yang akan di-docking
digambar struktur molekul 2-D dengan program Chem Bio Draw Ultra versi
12, kemudian dikopi pada program Chem Bio 3D Ultra versi 12 untuk
membuat struktur 3-D. Setelah diukur energi minimalnya kemudian
disimpan dalam bentuk mol2 {SYBYL2(*.mol2)}. Setelah disimpan
kemudian dilakukan proses docking terhadap target reseptor VEGFR2,
dengan kode PDB: 3WZE menggunakan program komputer Molegro
Virtual Docker versi 5.5. Hasil yang didapat berupa nilai Rerank Score (RS)
 RS menggambarkan energi yang diperlukan dalam
proses interaksi ligan-reseptor, dan dari nilai tersebut
HASIL VALIDASI dapat diprediksi aktivitas antikanker senyawa melalui
METODE hambatan enzim tirosin kinase yang digambarkan
dengan target reseptor VEGFR2 (Okamoto et
PENAMBATAN al.,2015; Siswandono, 2016).
(DOCKING)
NILAI RS
NILAI RS NILAI RS PEMBANDING Semua senyawa yang diteliti mempunyai nilai RS
SENYAWA lebih kecil dibanding senyawa induk N-(benzoil)-N’-
N-(4- Sorafenib RS = ( -147,826
propoksibenzoil)- kkal/mol) feniltiourea, kecuali senyawa 6, 7 dan 11. mempunyai
N’-feniltiourea nilai RS yang paling kecil, Akan tetapi kedua
(nilai RS =
-106,332) senyawa menimbulkan efek hepatotoksik, sehingga
N-(3,5- Hidroksiurea RS = (- sebagai senyawa terpilih adalah senyawa nomor 5
ditrifluorometilben 39,647 kkal/mol).
zoil)-N’-feniltiourea yaitu N-(3,4-dimetilbenzoil)-N’-feniltiourea (nilai RS
(RS = -106,231). = -105,792) yang tidak menimbulkan efek
hepatotoksik.
Gambaran 3-D target reseptor VEGFR2 kode PDB: 3WZE dalam
bentuk back bone dengan turunan N-(benzoil)-N’-feniltiourea
dan senyawa pembanding sorafenib
HASIL
PENAMBAT
AN
DOCKING
Hasil docking berupa energi ikatan digambarkan dengan nilai
Rerank Score (RS). Senyawa dengan nilai RS kecil berarti
mempunyai ikatan ligan-reseptor yang stabil dan diprediksi
mempunyai aktivitas yang besar. Dari hasil uji in silico disimpulkan
bahwa semua turunan N-(benzoil)-N’-feniltiourea diprediksi
menimbulkan toksisitas relatif rendah, dan mempunyai aktivitas
sitotoksik lebih besar dibanding hidroksiurea, tetapi masih lebih
rendah dibanding sorafenib. N-(4- propoksibenzoil)-N’-feniltiourea
dan N-(3,5-di-trifluorometilbenzoil)-N’-feniltiourea diprediksi
mempunyai aktivitas sitotoksik paling besar tetapi menimbulkan
hepatotoksik, sehingga sebagai senyawa terpilih untuk disintesis dan
dikembangkan lebih lanjut adalah N- (3,4-dimetilbenzoil)-N’-
feniltiourea.
DATA Prediksi in silico aktivitas dan
toksisitas antikanker terhadap reseptor
VEGF turunanN-benzoil-N’-feniltiourea
dan senyawa pembanding menggunakan
Molegro Virtual Docker (*) serta pkCSM
TABLE
(**) dan Protox(***) online tool
Design obat-Optimasi
yang berhubungan
dengan
farmakokinetika Hasil analisis menyimpulkan bahwa senyawa akan sulit
diabsorpsi dan permeabilitasnya rendah apabila mempunyai:
berat molekulnya lebih besar 500, nilai log koefisien partisi
oktanol/air (log P) lebih besar +5; ikatan-H donor (HBD), yang
dinyatakan dengan jumlah gugus O-H dan N-H, lebih besar 5;
dan ikatan-H aseptor (HBA), yang dinyatakan dengan jumlah
atom O dan N, lebih besar 10. Analisis tersebut dikenal sebagai
hukum lima Lipinski karena semua nilai merupakan kelipatan
dari angka lima.
HASIL
PENAPISAN

Hasil penapisan
menunjukkan bahwa 24 senyawa
memenuhi aturan Lipinski.
Sehingga senyawa tidak memiliki
profil seperti drug likeness yang
diharapkan berarti adanya
modifikasi struktur tidak mengubah
profil dari senyawa tersebut.
Uji toksisitas
Untuk menentukan toksisitas
senyawa dapat dilakukan dengan uji
Ames Toxicity, metode yang
digunakan secara luas untuk menilai
potensi mutagenik senyawa dengan
menggunakan bakteri. Hasil uji
positif menunjukkan bahwa
senyawa tersebut bersifat mutagenik
dan oleh karena itu dapat bertindak
sebagai karsinogen.
 Daftar
pustaka
Dini, dkk. 2018. Uji in silico Aktivitas Sitotoksik dan Toksisitas
Senyawa Turunan N-(Benzoil)-N’- feniltiourea Sebagai
Calon Obat Antikanker
CREDITS

This is where you give credit to the ones who are part of this project.

● Presentation template by Slidesgo

● Icons by Flaticon
● Infographics by Freepik
● Images created by Freepik
● Author introduction slide photo created by Freepik
● Text & Image slide photo created by Freepik.com
RESOUR
CES
Did you like the resources on this template? Get them for free at our other websites.

VECTORS
● Chemistry
● Flat chemistry background Free Vector
● Flat chemistry background Free Vector
 Instructions for use (free users)
In order to use this template, you must credit Slidesgo by keeping the Thanks slide.

You are allowed to:

● Modify this template.
● Use it for both personal and commercial purposes.

You are not allowed to:

● Sublicense, sell or rent any of Slidesgo Content (or a modified version of Slidesgo Content).
● Distribute this Slidesgo Template (or a modified version of this Slidesgo Template) or include it in a database or in
any other product or service that offers downloadable images, icons or presentations that may be subject to
distribution or resale.
● Use any of the elements that are part of this Slidesgo Template in an isolated and separated way from this
Template.
● Delete the “Thanks” or “Credits” slide.
● Register any of the elements that are part of this template as a trademark or logo, or register it as a work in an
intellectual property registry or similar.

For more information about editing slides, please read our FAQs or visit Slidesgo School:
https://slidesgo.com/faqs and https://slidesgo.com/slidesgo-school
 Instructions for use (premium users)
In order to use this template, you must be a Premium user on Slidesgo.

You are allowed to:

● Modify this template.
● Use it for both personal and commercial purposes.
● Hide or delete the “Thanks” slide and the mention to Slidesgo in the credits.
● Share this template in an editable format with people who are not part of your team.

You are not allowed to:

● Sublicense, sell or rent this Slidesgo Template (or a modified version of this Slidesgo Template).
● Distribute this Slidesgo Template (or a modified version of this Slidesgo Template) or include it in a database or in
any other product or service that offers downloadable images, icons or presentations that may be subject to
distribution or resale.
● Use any of the elements that are part of this Slidesgo Template in an isolated and separated way from this
Template.
● Register any of the elements that are part of this template as a trademark or logo, or register it as a work in an
intellectual property registry or similar.

For more information about editing slides, please read our FAQs or visit Slidesgo School:
https://slidesgo.com/faqs and https://slidesgo.com/slidesgo-school
 Fonts & colors used
This presentation has been made using the following fonts:

Anton
(https://fonts.google.com/specimen/Anton)

Advent Pro
(https://fonts.google.com/specimen/Advent+Pro)

#ffc9c3 #674ea7 #6d9eeb #f3f3f3

 Use our editable graphic resources...
You can easily resize these resources keeping the quality. To change the color just ungroup the resource and
click on the object you want to change. Then click on the paint bucket and select the color you want. Don’t
forget to group the resource again when you’re done.
 ...and our set of editable icons
You can resize these icons keeping the quality.
You can change the stroke and fill color; just select the icon and click on the paint bucket/pen.
Business Icons
Avatar Icons
Creative Process Icons
Educational Process Icons
Help & Support Icons
Medical Icons
Nature Icons
Performing Arts Icons
SEO & Marketing Icons
Teamwork Icons