BIOKIMIA

KHAIRUN NIDA
2021
POKOK BAHASAN BIOKIMIA
 Terdiri dari 14 item, terbagi menjadi bahan UTS
& UAS.
 Bahan UTS membicarakan tentang molekul2
kecil (mikro molekul) & molekul besar
(makromolekul) yg ada dalam makhluk hidup
secara umum dengan sudut pandang molekuler
maupun seluler
 Bahan UAS membicarakan tentang metabolisme
molekul-molekul tsb., baik anabolismenya
maupun katabolismenya.
PUSTAKA

1. Campbell,Reece, Mitchel. Biologi.

Erlangga. Edisi ke8. 2010
2. Campbell,Reece, Mitchel. Biology.
11th ed.. 2014
3. Harper. Biokimia. EGC. Ed.29.
2014
4. Harper. Biokimia. 30th ed.. 2014
KONTRAK KULIAH

 TATA TERTIB:
BIOKIMIA

 Apakah biokimia?
 Bio
 Kimia
 Kimia kehidupan
Hubungan kimia & biologi

 .

 .GAMBAR 1. KISAH SEMUT KEBUN SETAN

Materi, senyawa dan unsur2
esensial kehidupan

 Gambar 2. sifat emergen suatu senyawa

Kimia kehidupan: AIR

Molekul air Interaksi molekul air

Bab 1. Molekul-
molekul
sistem hidup
Tabel 1. unsur dalam tubuh manusia

 Tabel 1
Bentuk dan fungsi molekul

 Bentuk dan fungsi molekul

tergantung dari ikatan kimia
antar atom
 Bentuk/struktur
molekul dapat
menentukan fungsinya
 Fungsi
suatu molekul/materi
dapat menentukan strukturnya
Jenis ikatan kimia kehidupan

 Ikatan kovalen
 Ikatan ionik
 Ikatan kimia lemah:
1.Ikatan hidrogen
2. Ikatan Van Der Waals
Sifat unsur & senyawa pada
atom: ikatan kovalen
H2 dan O2 H2O dan CH4
Ikatan Vander Waals

Molekul ratusan ribu rambut

halus di kaki cicak dengan
molekul permukaan dinding
Molekul2 kehidupan

 Berdasarkan ukurannya terdiri dari:

1. Molekul-molekul kecil
contoh: O2, H2O dan CO2

2. Molekul-molekul besar
contoh: as.amino, as. Nukleat, KH,
lipid, protein
7 ciri materi hidup

1. Keteraturan
2. Reproduksi
3. Pertumbuhan dan perkembangan
4. Pemanfaatan/Ekstraksi energi
5. Respon thd lingkungan
6. Regulasi/Homeostasis
7. Adaptasi
Ciri-ciri materi hidup
3 fungsi dasar hidup :
# gerak (lokomosi)
# gradien dengan extrasel ([ ], to, pH,
bioelektrik)
# replikasi/reproduksi
 Gerak (lokomosi) :
- perubahan orientasi / posisi
- aktif :sumber energi dlm
selmetabolisme
- bertujuan (bukan gerak acak) :
 Gradien dengan ekstrasel :
Pd makhluk hidup, kondisi intra¢ # ekstra¢, dlm
hal to, pH, [bbg senyawa], muatan listrik.
 ada gradien selama ¢ hidup (bbp menit pd 1
sel bakteri – 200 – 300 tahun pd kura-kura
Galapagos)
# Hukum termodinamika II :
Dalam 2 sistem berbeda,  energi bebas (yg dpt
digunakan u/ suatu kerja) selalu  dalam
perjalanan waktu, sampai tercapai
keseimbangan homogen antara kedua sistem
Hirarki organisasi biologis
Hirarki organisasi biologis1
1. Elektron, proton & Organisme (MH)
netron 9. Populasi
2. Atom 10. Komunitas
3. Molekul 11. Ekosistem
4. organel 12. Biosfer
5. sel
6. jaringan
7. organ
8. Organisme (MH)
Pengelompokan sel
Pengelompokan sel
 Pengelompokan sel

1. Prokariot
2. Eukariot:- plant cell
- animal cell
Persamaan?
Perbedaan?
 Tabel. Perbandingan antara sel prokariot dan eukariot

Karakteristik Prokariot Eukariot

Ukuran sel umumnya 0,5-5 μm 10-100 μm

Inti sel Tidak terbungkus membran inti sehingga tidak disebut nukleus Inti sejati yang terbungkus membran inti dan memiliki
tetapi nukleiod nukleolus

Organel yang terbungkus membran Tidak ada Ada, seperti lisosom, kompleks golgi, mitokondria, retikulum
endoplasma, dan kloroplas

Dinding sel Biasanya ada, tersusun atas peptidoglikan Jika ada, struktur kimia sederhana

Vesikel gas Ada Tidak

Membran sel Tanpa karbohidrat dan biasanya tanpa sterol Sterol dan karbohidrat ada sebagai reseptor

Sitoplasma Tanpa sistoskeleton atau aliran sitoplasmik Ada sistoskeleton dan terjadi aliran sitoplasmik

Ribosom Ukuran kecil (70s) Ukuran besar (80s)

Kromosom (DNA) Kromosom tunggal melingkar tanpa protein histon Kromosom linear melipat dengan terikat protein histon

Pembelahan sel Pembelahan biner Mitosis

Rekombinasi seksual Tanpa meiosis, hanya transfer fragmen DNA Meiosis

Sensitivitas terhadap antibiotik Sensitif Tidak sensitif

Kesamaan prokariot &
eukariot

Merupakan struktur yang

amat teratur yang
bertugas menjalankan
proses-proses rumit demi
kelangsungan hidup sel
Struktur dasar dan fungsi sel
Struktur dasar dan fungsi sel
 Dgnmenganalisis struktur biologis, dapat
diketahui bagaimana cara kerjanya
 Dgndiketahuinya fungsi suatu struktur, dapat
dianalisa konstruksi struktur tersebut
 Contohbentuk sayap burung berbentuk
aerodinamis
 Rangkainternal sayap burung ringan tapi kuat
dengan bentuk sarang lebah
Contoh lain
Reaksi kimia di dalam dan di
luar sel
2 sistem :
A. tabung reaksi berisi :
- air (H2O)
- dialiri dengan CO2 murni
- sumber sinar uv dengan rentangan 
tertentu
- sumber energi panas, bila perlu
B. cawan Petri, berisi :
- air (H2O)
- CO2 , cukup dari udara saja ( [ ] <<)
- disinari dengan cahaya matahari saja.
- sehelai daun segar
 Diharapkan :
terjadi pembentukan glukosa dari molekul air
dan CO2 (fotosintesis) baik di A mau pun di B,
menurut reaksi
6 CO2 + 6 H2O  C6H12O6 + 6O2
Kenyataan :
- di A tidak terjadi reaksi kimia apa pun,
termasuk reaksi kimia yang diharapkan
- di B terjadi reaksi kimia yang diharapkan,
yaitu pembentukan glukosa
Catatan :
- bahan baku yang diperlukan terdapat, baik
di A mau pun di B
- kondisi di A lebih terstandarisasi dari pada di
B
- hk2 fisikokimia yang berlaku di A = di B
- satu-satunya beda : makhluk hidup di B
B, yang mempunyai daun segar, suatu
makhluk hidup (=sistem organisasi
molekul) yang mampu menata benda-
benda “mati” (anorganik) berupa CO2 dan
H2O, menjadi molekul bagian tak
terpisahkan dari makhluk hidup (organik),
yaitu C6H12O6.
Dapat dinyatakan dalam reaksi kimia
kondisi fisikokimia

sel memungkinkan kondisi & hk

fisikokimia biasa bekerja secara
terarah & produktif
 Selharuslah suatu struktur dengan
suatu sistem, organisasi &
keteraturan yang tinggi, bukan
sesuatu yang acak / baur / difus
AIR
 QS 21:30 ……..Kami jadikan segala sesuatu yang
hidup dari air……(Islam 130 ayat)
 Sirakh 29:21 Kebutuhan pokok untuk hidup
ialah air dan makanan serta…. (katolik 9 ayat)
 Air adalah……..
 Pentingnya air: -pengaruh polaritas air
- polaritas air menghasilkan ikatan
hidrogen
Air
 Kejadian 1:20 Berfirmanlah Allah: "Hendaklah dalam
air berkeriapan makhluk yang hidup, dan hendaklah
burung beterbangan di atas bumi melintasi cakrawala."
 Yehezkiel 47:8-9 Ia berkata kepadaku: "Sungai ini
mengalir menuju wilayah timur, dan menurun ke Araba-
Yordan, dan bermuara di Laut Asin, air yang
mengandung banyak garam dan air itu menjadi tawar,
sehingga ke mana saja sungai itu mengalir, segala
makhluk hidup yang berkeriapan di sana akan hidup.
Ikan-ikan akan menjadi sangat banyak, sebab ke mana
saja air itu sampai, air laut di situ menjadi tawar dan ke
mana saja sungai itu mengalir, semuanya di sana hidup.
 Sirakh 29:21 Kebutuhan pokok untuk hidup ialah air
dan makanan serta pakaian dan perumahan untuk
menudungi ketelanjangan
Pengaruh polaritas air
Keistimewaan air
Kebutuhan energi
bagi sistem hidup
Keistimewaan air

1. Perilaku kohesi air

2. Kemampuan menstabilkan suhu
3. Pemuaiannya pada saat
membeku
4. Pelarut serbaguna
PENGELOMPOKAN MAKHLUK HIDUP
Berdasarkan Kebutuhan Energinya

1. Autotrof
- Fototrof
- Kemotrof

2. Heterotrof
- Herbivora
- Carnivora
- Omnivora
Soal belajar
1. Apa yang dimaksud dengan biokimia?
2. Hal-hal apa saja yang dibicarakan dalam biokimia?
3. Sebutkan 3 mikromolekul & 7 makromolekul yg ada dalam
makhluk hidup!
4. Sebutkan 7 ciri-ciri materi hidup
5. Sebutkan 3 fungsi dasar hidup
6. Bagaimana pengelompokan sel secara umum
7. Apa beda prokariot & eukariot? Sebutkan contohnya masing-
masing 3!
8. Apa hubungan antara struktur dasar dan fungsi sel pada makhluk
hidup?
9. Sebutkan keistimewaan air sebagai penunjang kehidupan
10. Jelaskan posisi atom dan molekul dalam hirarki sistem biologis
11. Sebutkan penggolongan organisme menurut kebutuhan energinya
12. Apa yang membedakan reaksi kimia di dalam dan di luar sel
hidup?
Pre tes
1. Apa yang dimaksud dengan biokimia?
2. Hal-hal apa saja yang dibicarakan dalam biokimia?
3. Sebutkan jenis2 sel atau pembagian sel!
4. Apa beda prokariot & eukariot? Apa
persamaannya?
5. Sebutkan ciri-ciri makhluk hidup!
6. Jelaskan posisi atom dan molekul dalam hirarki
sistem biologis
7. Sebutkan penggolongan organisme menurut
kebutuhan energinya
8. Apa yang membedakan reaksi kimia di dalam dan
di luar sel hidup?
Pre tes
1. Apa yang dimaksud bioinformatika?
2. Apa yang dimaksud dengan sel, komunitas, biosfer?
3. Apa yang dimaksud dengan Autotrof & heterotroph?
Jelaskan dengan lebih detil!
4. Apa yang dimaksud dengan polaritas? Apa
hubungannya dengan struktur/bentuk suatu benda?
5. Apa yang dimaksuddengan genom? Apa bedanya
dengan gen?
Autotrof
- Fototrof
- Kemotrof

2. Heterotrof
- Herbivora
- Carnivora
- Omnivora