Struktur dan

Fungsi Molekul
Biologis
Berukuran Besar
amelianda evelyn
 Molekul Kehidupan
✘ Semua organisme hidup terbentuk dari empat kelas molekul biologis
besar: karbohidrat, lipid, protein, dan asam nukleat
✘ Dalam sel, molekul organik kecil bergabung membentuk molekul
yang lebih besar 
✘ Makromolekul adalah molekul besar yang terdiri atas ribuan atom
yang tertaut oleh ikatan kovalen
✘ Struktur dan fungsi molekul tidak dapat dipisahkan

2
Makromolekul memiliki berbagai macam ukuran dan kompleksitas,
sehingga sungguh mengagumkan bila ahli biokimia berhasil
menentukan struktur terperinci dari sedemikian banyak
makromolekul.

3
makromolekul
merupakan
polimer, yang
tersusun dari
monomer-
monomer
 ✘Polimer adalah molekul panjang
yang terdiri atas banyak blok
pembangun yang mirip
✘molekul blok pembangun yang kecil
ini disebut monomer
✘tiga dari empat kelas makromolekul
yang ada pada senyawa organik
kehidupan, seperti karbohidrat,
protein, dan asam nukleat adalah
polimer
5
 SISTENSIS DAN PENGURAIAN
POLIMER
✘ Reaksi kondensasi atau secara lebih spesifik reaksi dehidrasi
terjadi ketika dua monomer bergabung diiringi hilangnya satu
molekul air
✘ Enzim adalah makromolekul yang mempercepat proses
dehidrasi
✘ Polimer dipecah menjadi monomer-monomer melalui
hidrolisis, suatu reaksi yang merupakan kebalikan dari reaksi
dehidrasi
6
7
 Keanekaragaman polimer
✘ Setiap sel memiliki ribuan jenis makromolekul yang berbeda
✘ Makromolekul bervariasi diantara sel-sel suatu organisme, lebih
bervariasi di dalam satu spesies, dan lebih bervariasi lagi
diantara spesies-spesies
✘ Variasi polimer yang sangat banyak dapat dibangun dari satu set
kecil monomer

8
 2.
karbohidrat
berperan sebagai
bahan bakar dan
materi
pembangun
 ✘ Karbohidrat mencakup gula dan
polimer-polimer gula
✘ Karbohidrat paling sederhana
adalah monosakarida, dikenal
juga sebagai gula sederhana
✘ Makromolekul karbohidrat adalah
polisakarida, polimer yang
tersusun dari banyak blok
pembangun gula
10
 Gula
✘ Monosakarida umumnya memiliki rumus molekul yang
merupakan kelipatan unit CH2O
✘ Glukosa (C6H12O6) adalah monosakarida yang paling umum
✘ Monosakarida diklasifikasi berdasarkan:
 Lokasi gugus karbonil (sebagai aldosa atau ketosa)
 Jumlah karbon dalam rangka karbon

11
12
 ✘ Meskipun sering digambarkan sebagai rangka lurus,
namun dalam larutan berpelarut air, sebagian besar gula
membentuk cincin
✘ Monosakarida bertindak sebagai bahan bakar utama bagi
kerja selular dan sebagai bahan mentah untuk
pembentukan molekul-molekul
✘ Disakarida terbentuk ketika suatu reaksi dehidrasi
menggabungkan dua monosakarida
✘ Ikatan kovalen ini disebut tautan glikosidik (glycosidic
linkage)

13
14
 POLISAKARIDA
✘ Polisakarida, polimer dari gula, berperan sebagai materi
simpanan dan materi pembangun
✘ Struktur dan fungsi polisakarida ditentukan olen monomer-
monomer gulanya dan oleh posisi tautan glokosidiknya

15
 Polisakarida simpanan
✘ Pati (starch), suatu polisakarida simpanan tumbuhan,
terdiri atas monomer-monomer glukosa
✘ Tumbuhan menyimpan kelebihan pati sebagai granula di
dalam kloroplas dan plastida lain
✘ Glikogen adalah polisakarida simpanan pada hewan
✘ Manusia dan vertebrata lain menyimpan glikogen terutama
di sel hati dan sel otot

16
17
 Polisakarida struktural
✘ Polisakarida selulosa adalah komponen utama dinding kokoh dari sel
tumbuhan
✘ Seperti pati, selulosa merupakan polimer glukosa, namun tautan
glikosidiknya berbeda
✘ Perbedaannya terletak pada struktur dua cincin glukosa : alfa (ᵅ) dan
beta (ᵝ)

18
(a) Struktur cincin glukosa dan

19
(b) Pati : tautan 1-4 pada monomer glukosa

(c) Selulosa : tautan 1-4 pada monomer glukosa

20
 ✘ Polimer dengan glukosa ᵅ berbentuk heliks
✘ Polimer dengan glukosa ᵝ berbentuk heliks
✘ Pada struktur paralel, atom-atom H pada satu untaian dapat
berikatan dengan gugus OH pada untaian lain
✘ Molekul selulosa paralel yang bergabung dengan cara ini
dikelompokkan ke dalam mikrofibril, yang membentuk materi
pembangun yang kuat bagi tumbuhan

21
22
 ✘ Enzim yang mencerna pati dengan cara menghidrolisis tautan ᵅ tidak mampu
menghidrolisis tautan ᵝ selulosa
✘ Selulosa dalam makanan manusia melewati saluran pencernaan sebagai serat
taklarut
✘ Beberapa mikroba menggunakan enzim untuk mencerna selulosa
✘ Banyak herbivora, mulai dari sapi hingga rayap, memiliki hubungan simbiosis
dengan mikroba-mikroba ini
✘ Kitin, polisakarida struktural lain, ditemukan dalam eksoskeleton artropoda
✘ Kitin juga memberikan peyangga struktural untuk dinding sel pada banyak fungi

23
(a) Struktur monomer (b) Kitin membentuk (c) Kitin digunakan untuk
kitin eksoskeleton artropoda membuat benang operasi
yang kuat dan fleksibel

24
KELOMPOK
MOLEKUL
HIDROFOBIK
YANG
BERANEKA
RAGAM
✘ LIPID ADALAH SALAH SATU KELAS
MOLEKUL BIOLOGIS BERUKURAN
BESAR YANG TIDAK MEMBENTUK
POLIMER
✘ CIRI PENTING LIPID ADALAH
SEDIKIT ATAU TIDAK MEMILIKI
AFINITAS TERHADAP AIR
✘ LIPID BERSIFAT HIDROFOBIK
KARENA SEBAGIAN BESAR
TERSUSUN ATAS HIDROKARBON,
YANG MEMBENTUK IKATAN
KOVALEN 26
NONPOLAR
 Lemak
✘ Lemak (fat) terbentuk dari dua jenis molekul yang lebih
kecil : gliserol dan asam lemak
✘ Gliserol merupakan alkohol dengan tiga karbon, yang
masing-masing berikatan dengan satu gugus hidroksil
✘ Asam lemak (fatty acid) terdiri atas satu gugus karboksil
melekat pada rangka karbon yang panjang

27
 Asam lunak
(asam palmitat)
Tautan ester

Gilserol
(a) Reaksi dendrasi
dalam sintesis lemak

28
(b) Molekul lemak (trasilgliserol)
✘ Panjang asam lemak bervariasi (jumlah karbonnya), begitu
pula jumlah dan lokasi ikatan rangkapnya
✘ Asam lemak jenuh memiliki sebanyaknya mungkin
jumlah atom hidrogen dan tidak memiliki ikatan rangkap
✘ Asam lemak takjenuh memiliki satu atau lebih ikatan
rangkap

29
Rumus struktur
molekul lemak
jenuh

Rumus struktur
Asam stearat, suatu molekul
sejenis asam takjenuh
lemak jenuh
(a) Lemak jenuh Asam oleat, sejenis
asam lemak
takjenuh

Ikatan rangkap cis

(b) Lemak menyebabkan
30
takjenuh penekukan
 ✘ Fungsi utama lemak adalah simpanan energi
✘ Manusia dan mamalia lain menyimpan lemak dalam sel-
sel adiposa
✘ Jaringan adiposa juga berperan seperti bantal bagi organ-
organ vital dan menginsulasi tubuh

31
 fosfolipid
✘ Dalam fosfolipid, dua asam lemak dan gugus fosfat
melekat pada gliserol
✘ Kedua ekor lemak bersifat hidrofobik, tetapi gugus fosfat
dan molekul yang melekat pada gugus ini membentuk
kepala hidrofilik

32
 Kepala
hidrofilik Kolin

Fosfat

Gliserol

Asam
lemak
Ekor hidrofilik

Kepala
hidrofilik

Ekor
hidrofobik
(a) Rumus struktur (b) Model pengisisan ruang (c)Simbol fosfolipid

33
 steroid
✘ Steroid adalah lipid yang dicirikan oleh rangka karbon
yang tersusun atas empat cincin yang menyatu
✘ Kolesterol, suatu steroid penting, adalah komponen untuk
membran sel hewan
✘ Meskipun kolesterol penting bagi hewan, namun kadar
kolesterol yang tinggi dalam darah dapat berkontribusi
bagi munculnya penyakit kardiovaskular

34
 4.
protein memiliki
banyak struktur
yang
menimbulkan
banyak ragam
fungsi
✘ Protein menyusun lebh dari 50%
massa kering sebagian besar sel
✘ Fungsi protein meliputi
penyokongan struktural,
penyimpangan, transpor,
komunikasi selular, pergerakan,
serta pertahanan melawan zat
asing

36
37
✘ Enzim adalah sejenis protein
yang bertindak sebagai katalis Substrat
(sukrosa)
untuk mempercepat reaksi
kimia
✘ Enzim dapat melakukan Glukosa
fungsinya berulang-ulang,
OH Enzim
dapat dianggap seperti kuda (sukrase) H2O
hela yang melaksanakan Fruktosa
proses-proses kehidupan HO

38
 POLIPEPTIDA
✘ Polipeptida adalah polimer yang tersusun dari suatu sel
yang sama, yang terdiri atas 20 asam amino
✘ Protein terdiri atas satu atau lebih polpeptida

39
 Monomer asam amino
✘ Asam amino adalah molekul organik yang memiliki gugus
kerboksil dan amino
✘ Sifat asam amino berbeda disebabkan oleh rantai sampingnya
yang berbeda, yang disebut gugus R

Karbon

Gugus amino Gugus karboksil

40
 Polimer asam amino
✘ Asam amino ditautkan oleh ikatan peptida
✘ Polipeptida adalah suatu polimer asam amino
✘ Panjang polopeptida berkisaran dari beberapa monomer
hingga lebih dari ribuan monomer
✘ Setiap polipeptida memiliki sekuens lurus asam-asam
amino yang unik

41
 Struktur dan fungsi protein
✘ Protein fungsional terdiri atas satu atau lebih polipeptida yang terpuntir,
terlipat, dan terkumpar menjadi molekul berbentuk unik

Lekukan
(a) Model
pita dari
lisozim (b) Model
pengisian ruang
dari lisozim

✘ Sekuens asam amino menentukan struktur tiga dimensi protein

✘ Struktur protein menentukan fungsinya

42
 Empat tingkat struktur protein
✘ Struktur protein, sekuens amino dalam suatu protein, bagaikan urutan huruf
dalam suatu kata yang panjang
✘ Kumparan dan lipatan struktur sekunder dihasilkan dari ikatan hidrogen diantara
komponen-komponen berulang pada tulang punggung polipeptida
✘ Struktur tersier ditentukan oleh interaksi antara gugus-gugus R, bukan oleh
interaksi antara komponen-komponen tulang punggung polipeptida
✘ Struktur kuaterner dihasilkan ketika dua atau lebih rantai polipeptida
membentuk satu makromolekul

43
 Struktur Struktur Struktur Struktur
primer sekunder tersier kuaterner

Lembar-berlipat ᵝ

+H2N Contoh
Ujung suunit
amino asam amino

Heliks ᵅ

44
 Penyakit sel sabit : perubahan
struktur primer
✘ Perubahan sekecil apapun pada struktur primer dapat
memengaruhi bentuk protein dan kemampuannya untuk
menjalankan fungsinya
✘ Penyakit sel sabit (sickle-cell disease), gangguan darah
keturunan, disebabkan oleh penggantian (substitusi) satu
asam amino dengan asam amino lain dalam struktur primer
hemoglobin

45
 Apa yang menentukan struktur
protein
✘ Selain struktur protein, kondisi fisik dan kimia dapat
memengaruhi struktur protein
✘ Perubahan pH, konsentrasi garam, suhu, atau faktor
lingkungan lain dapat menyebabkan suatu protein terurai
✘ Perubahan bentuk alami protein ini disebut denaturasi
✘ Protein terdenaturasi secara biologis bersifat inaktif (tidak
aktif)

46
 Pelipatan protein dalam sel
✘ Caperonin adalah molekul protein yang membantu
pelipatan yang tepat untuk protein-protein lain
✘ Para ilmuwan menggunakan kristalografi sinar-X untuk
menentukan struktur protein

RNA
polimerase

DNA

RNA

47
 5.
asam nukleat
menyimpan dan
meneruskan
informasi yang
diwariskan
 ✘ Sekuens asam amino suatu
polipeptida diprogram oleh unit
pewarisan sifat yang disebuut gen
✘ Gen terdiri dari dna, suatu asam
nukleat

49
 Peran asam nukleat
✘ Ada dua tipe asam nukleat :
 Asam deoksiribonukleat (deoxyribonucleic acid, DNA)
 Asam ribonukleat (ribonucleic acid, RNA)
✘ DNA menyediakan arahan untuk replikasi dirinya sendiri
✘ DNA mengarahkan sintesis RNA duta atau messenger RNA (mRNA) dan
melalui RNA, mengontrol sintesis protein
✘ Sintesis protein terjadi di riboosom

50