IKATAN HIDROGEN

Ikatan hIdogen atau jembatan hidrogen terbentuk ketika sebuah atom hidrogen terkait dengan dua atau lebih atom lain. dalam banyak kasus salah satu dari dua atau lebih ikatan hidrogen yang terbentuk akan lebih kuat dari yang lain. Yang lebih lemah dari dua ikatan tersebut diberi nama ikatan hidrogen, dalam rangka membedakannya dari ikatan yang lebih kuat, yang dianggap kovalen. Situasi ini direpresentasikan sebagai X-H ---- Y. Namun, terkadang kedua ikatan hidrogen memiliki kekuatan yang sama dan panjang, dalam kasus ikatan diwakili dengan cara sebagai berikut: X-H-Y. ini adalah apa yang terjadi dalam ion difluorida (F-H-F) dan juga dalam garam asam dari berbagai asam monobasa (O-H-O). Sebuah ikatan hidrogen terbentuk setiap kali jika ada kehadiran bersamaan dengan asam hidrogen dan akseptor dasar, dengan pembagian sebagai berikut : A - H - B. Misalnya, atom hidrogen dari gugus imino (NH) yang memiliki gaya tarik menarik dengan atom oksigen ketonic, yang bermuatan negatif (C = O). Oleh karena ikatan hidrogen terdiri dari daya tarik antara dua atom elektronegatif terdekat dengan proton antar mereka. jika muatan positif parsial hidrogen tidak baik terlindung, dapat tertarik oleh sepasang elektron tak memiliki bagian yang dimiliki oleh atom elektronegatif lain tetangga, seperti ditunjukkan pada gambar 7.9 dalam pembentukan ikatan hidrogen molekul atau segmen molekul yang paling sering terlibat dalam donor proton adalah F-H, O-H. dan N-H, Cl-H, S-H, dan kelompok P-H berikutnya, tapi ikatan yang dibentuk dalam hal ini jauh lebih lemah, ada bukti bahwa kelompok C-H dapat menjadi donor. kapasitas kelompok C-H untuk menyumbangkan proton berkurang dengan perubahan hibridisasi karbon dan meningkat dengan jumlah kelompok yang berdekatan yang menarik elektron. Atom dalam molekul mampu menjadi akseptor proton harus memiliki minimal satu pasangan elektron tunggal dalam oktet lengkap. Kelompok ini adalah fluorin, oksigen, nitrogen, dan untuk tingkat yang lebih rendah, klorin, sulfur dan fosfor. Atom halogen lainnya juga dapat berfungsi sebagai akseptor, namun F-, Cl-, Br-, I-ion adalah akseptor yang lebih baik Menjadi lemah daripada ikatan kovalen, namun lebih kuat dari van der Waals.

sebuah link ikatan hidrogen dua atom lebih dekat bersama-sama daripada jumlah jari-jari van der Waals, tapi tidak ada sedekat ikatan kovalen. Kekuatan ikatan hidrogen ini berbanding terbalik dengan jarak antar atom, seperti dalam ikatan kimia umum. Seperti yang berbeda dari apa yang terjadi dengan yg terjadi pada van der Waals, ikatan hidrogen sangat terarah, yaitu, semakin berada pada bagian ujung terhadap akseptor, semakin kuat. Meskipun dari sudut pandang ikatan hidrogen muatan linier disukai, linearitas tidak merupakan aturan melainkan pengecualian. tidak ada banyak korelasi antara panjang ikatan hidrogen dan deviasi dari linearitas yang ketat. pada kenyataannya, ikatan hidrogen memiliki fleksibilitas yang besar. Dari contoh, ada banyak ikatan hidrogen bercabang, dimana hidrogen kovalen terikat berpartisipasi dalam dua ikatan hidrogen lemah.

Fleksibilitas dari ikatan hidrogen juga dapat ditunjukkan dengan membandingkan H-O-H sudut dari molekul air dengan 0 - O-- O sudut dalam sistem dapat direpresentasikan sebagai berikut:

Ditemukan bahwa variasi O-- O-- O memiliki sudut (81-147o) jauh lebih besar daripada variasi sudut H-OH (106-114o), yang relatif konstan (sekitar 110o). Variasi ini disebut sudut akseptor ini menunjukkan bahwa A-H ---B tidak linear (49).

Lebih banyak bukti yang mendukung fleksibilitas ikatan hidrogen adalah penyimpangan dari linearitas dari O-H-- O ikatan dalam semua senyawa dipelajari dengan metode neutron-difraksi, bukan O-H --- O sudut sistematis menjadi 1800, penyimpangan besar telah diamati dan nilai rata-rata 165o telah ditemukan (49). Penyimpangan 100 sampai 20 0yang umum terjadi (50). ikatan hidrogen yang paling umum dan jarak masing-masing tercantum dalam Tabel 7.3, di mana A --- B (calc) dan H --- B (calc) mengacu pada perhitungan

Jumlah jari-jari van der Waals (5), sedangkan A --- B (obs) dan H --- B (obs) adalah nilai-nilai yang ditentukan dengan metode difraksi. diterima bahwa ikatan hidrogen terbentuk ketika jarak antara berat dua atom dan atom hidrogen kurang dari jumlah jari-jari van der Waals Dalam sistem biologis ikatan hidrogen yang paling penting adalah mereka terbentuk antara atom hidrogen kovalen yang terikat pada oksigen (O-H) atau nitrogen (N-H) dan nitrogen atau atom oksigen. Ikatan hidrogen menstabilkan protein dalam susunan heliks dan membantu dalam menstabilkan struktur heliks ganda asam deoksiribonukleat (gambar 7.11). Geometri ikatan hidrogen antara unit peptida dapat direpresentasikan seperti pada gambar 7.12 Beberapa contoh ikatan hidrogen yang dihadapi dalam sistem biologi dan dalam interaksi obat-reseptor diperlihatkan pada gambar 7.13

Banyak obat mengandung grup - seperti hidroksil, karbonil, amino, dan imino-yang dapat membentuk ikatan hidrogen baik sebagai donor atau sebagai akseptor proton. Di sisi lain, makromolekul biologis di mana reseptor obat terletak juga mengandung kelompok tersebut. Antara lain aminoacids berikut dapat bertindak sebagai donor proton: arginin, lisin dan sistein, sebagai akseptor proton berikut; asam aspartat, asam glutamat, metionin, dan sistin. Asam amino lainnya dapat bertindak pada satu waktu sebagai donor dan di lain waktu sebagai akseptor atau sebagai donor dan akseptor secara bersamaan; untuk kelompok pertama milik histidine yang ketika terprotonasi, adalah sebagai donor dan ketika non terprotonasi, adalah sebagai akseptor. Asparagin, glutamin, serin, treonin, prolin hidroksi, tirosin, dan lainnya termasuk dalam kelompok kedua (32). Dari sini dapat ditarik kesimpulan bahwa ikatan hidrogen memiliki campur tangan dalam pembentukan hubungan obat-reseptor, memberikan kontribusi bagi stabilitas kompleks reseptor obat, yang meningkat dengan jumlah ikatan yang terbentuk.

Dengan mempertimbangkan bahwa dalam media internal obat serta reseptor yang sudah terhubung ke air dengan ikatan hidrogen, ini harus patah sebelum obligasi baru dapat dibentuk, kali ini antara obat dan reseptor. Menunjuk sebagai D kelompok donor elektron reseptor (R) dan sebagai A kelompok akseptor obat (F), interaksi mengambil tempat di internal medium

Namun pertukaran ini menguntungkan (20) dan terjadi dengan sangat sedikit perubahan energi bebas.

Ikatan hidrogen bisa intramoleculer atau intermoleculer. Bentuknya lebih kuat daripada yang sebelumnya . Beberapa molekul, seperti asam salisilat, mempunyai 2 ikatan hidrogen.

Ada atau tidak adanya aksi biologis dalam beberapa senyawa tersebut berasal , dalam beberapa kasus, dengan kapasitas mereka untuk membentuk atau tidak membentuk ikatan hidrogen. Fakta ini memiliki pengaruh besar pada sifat fisikokimia dan karenanya pada aktivitas farmakodinamik mereka. Dengan demikian, pada I-fenil-2,3-dimetil-5-pirazolon (antipyrine), yang larut dalam air dan larut dalam eter , memiliki sifat analgetik, analog demethylated nya, I-fenil-2,3-dimetil-5-pirazolon, yang tidak larut dalam air hanya sedikit larut dalam eter, tidak memiliki aktivitas analgetik. Perbedaan ini tampaknya berasal dari fakta bahwa bentuk senyawa tidak membentuk ikatan hidrogen intermoleculer, sedangkan yang sebelumnya terbentuk ikatan itu

Contoh lain adalah asam salisilat (o-hidroksi asam benzoat), yang memiliki aktivitas antibakteri, sedangkan asam isomer p-hidroksibenzoat dan m- hidroksibenzoat yang tidak memilikinya. Perbedaan ini dalam aksi biologis dianggap berasal dari fakta bahwa hanya asam salisilat mampu membangun ikatan hydroen intramolekul, meskipun hanya menjadi masking (pita penutup ) gugus hidroksi fenolik, meninggalkan grup karboksi bebas, sebagai akibat dari fenomena ini, asam salisilat dapat berfungsi sebagai agen antibakteri. Dua isomer lain tidak dapat membentuk intramolekul tapi hanya ikatan

hidrogen intermoecular. Hasil ini dalam asosiasi derajat tinggi suatu senyawa dapat menjelaskan pengurangan diucapkan aktivitas biologis mereka .

Hal sebaliknya terjadi dengan ester, metil salisilat memiliki aktivitas antibakteri sangat lemah, sedangkan metil p-hydroxybenzoate (nipagin) memanifestasikan kegiatan ini ke degre cukup. Fakta ini disebabkan kemungkinan fungsi senyawa yang terakhir sebagai fenol: ketika dimer terbentuk, melalui ikatan hidrogen intermoleculer, gugus hidroksi fenolik dibebaskan. Metil salisilat tidak dapat berfungsi sebagai fenol karena dalam pembentukan ikatan hidrogen intramolekul gugus hidroksi fenolik disembuyikan.

Turunan dari isatin--thiosemicarbazone dan benzimidazol memiliki aktivitas antivirus yang tinggi ,sebagai karakteristik umum, sebuah ikatan hidrogen intramolekul

Demikian juga, ini mendalilkan bahwa diuretik sulfamido serta benzothiadiazino, yang berfungsi sebagai inhibitor anhydrase karbonat dengan mekanisme kompetitif dengan asam karbonat, menempel pada sisi aktif enzim melalui ikatan hidrogen, seperti yang ditunjukkan pada gambar 7.14. jika obligasi ini melemah melalui subsititusi hidrogen dari gugus amino,maka akan kehilangan aktivitas senyawa mereka.

Tetrasiklin membentuk ikatan hidrogen intramolekul dan dapat sebagai penghelat dengan ion logam. Namun, tindakan antibiotik mereka tidak menghasilkan semata-mata dari sifat tersebut.

Seperti yang telah ditunjukkan di atas, ada banyak molekul dalam sistem biologis yang terhubung di antara mereka sendiri oleh ikatan hidrogen. Contohnya adalah empat basa nitrogen - sitosin (C), timin (T), adenin (A), dan guanin (G) - konstituen DNA. pada RNA urasil mengambil tempat timin. Interaksi energi dasar tersebut ditunjukkan dalam tabel 7.4. Ikatan hidrogen memainkan peran penting dalam proses replikasi. Mereka mempertahankan integritas struktural dari pasangan basa DNA konstituen dan bertanggung jawab untuk interaksi antara asam amino, mesengger RNA, dan transfer RNA yang akhirnya mengakibatkan sintetis rantai polipeptida tertentu. Ini menyoroti mekanisme kerja agen mutagenik dan kelat, serta beberapa antimetabolites. Melalui ikatan hidrogen senyawa ini awalnya membangun sebuah hubungan dengan lokasi aksi. Kemudian mereka mengambil tempat dasar konstituen asam nukleat. Dengan mengganggu, melepaskan atau mengubah beberapa proses vital. Dalam kasus agen chelating tindakan ini tidak dapat diubah, karena kemampuan mereka untuk membangun ikatan kovalen yang kuat dengan reseptor.

Sax dan Pletcher (55) menyarankan bahwa fitur umum dalam tindakan anestesi lokal adalah pembentukan hidrogen terikat kompleks antara obat dan akseptor pada membran saraf. Cammarata dan Stein (56) menunjukkan metode untuk menyelidiki interaksi obat-reseptor melalui ikatan hidrogen. Ini terdiri dalam penentuan -dan - tom tertentu dalam obat melalui sederhana perhitungan molekul-orbital dan pengaruh biaya ini pada interaksi dengan reseptor. Dengan menggunakan metode ini untuk mempelajari interaksi turunan 3-hidroksifenil-trimethylammonium bersama acetylcholinesterase. Mereka menyimpulkan bahwa melalui ikatan hidrogen terbentuk dengan gugus hidroksi terikat pada atom karbon 3 dari cincin aromatik yang terjadi interaksi ini. Pada dasar data eksperimen Jarboe, dan rekan kerja (57) mendalilkan bahwa dalam atraction dari compouds analog dengan pierotoxinin dengan ikatan hidrogen adalah reseptor yang terlibat antara gugus hidroksi di jembatan itu, dan -elektron dari kelompok isopropenil