UPN "VETERAN" YOGYAKARTA

FAKULTAS TEKNOLOGI MINERAL

RENCANA PEMBELAJARAN SEMESTER (RPS)

Program Studi/Jurusan
Mata Kuliah / Kode
SKS/ Semester
Mata Kuliah Prasyarat (Kode)
Dosen (Tim Teaching)

: Teknik Geologi
: Geokimia Biomarker / 1111----: 2 SKS / Semester Genap (2x 50 menit)
: Geokimia Umum / 1111----: 1. Ir. S. Kis Daryono, MT
2. Ir. Mahap Maha, MT

I. Deskripsi Mata Kuliah

Mata kuliah ini membahas tentang prazat molekul, terutama struktur molekul biota
masa lalu dalam suatu batuan, batubara dan crude oils dengan ciri-cirinya agar supaya
mahasiswa dapat mendiskripsi dan mengenali gambaran kromatogram dari struktur molekul
purba dan masa kini yang bisa digunakan untuk menentukan umur, lingkungan pengendapan,
sumber material, kematangan, proses sedimentasi dan korelasinya.
Kuliah ini lebih baik dan bila memungkinkan dapat dilengkapi dengan studio/praktikum di
lapangan dan analisis di laboratorium/studio dengan hasil akhir berupa gambar kromatogram,
plotting gambar, tabel dan kolom.
II. Kompetensi Umum
Mahasiswa dapat menentukan KAPAN, DIMANA dan BAGAIMANA batuan
sedimen dan batubara diendapkan dan crude oils terbentuk serta dapat dikorelasikan ditinjau
berdasarkan kandungan fosil molekulnya.
III.Analisis Instruksional
(Gambar Flowchart)
IV. Strategi Pembelajaran
Tatap muka
: kuliah (2 sks), diskusi, praktikum (1 sks)/bila ada
Non Tatap Muka : tugas mandiri dan kelompok
a. Dilakukan dengan temu kelas/kuliah di dalam ruangan (14xpertemuan kuliah)
b. Diselingi dengan diskusi agar mahasiswa aktif, dan bagi mahasiswa yang aktif
diberikan point nilai sebagai nilai (keaktifan di kelas). Diskusi dilakukan di :
Awal kuliah
: untuk mengingat kembali materi minggu sebelumnya
Di Tengah
: untuk sharing kuliah hari tersebut
Di Akhir
: untuk mengevaluasi sejauh mana mahasiswa dapat menyerap
materi yang diajarkan pada saat kuliah hari tersebut.
c. Tugas mandiri untuk mengerjakan latihan-latihan soal, mencari paper2 dengan judul
tertentu baik di textbook, jurnal, referensi2, Internet dll.
Tugas kelompok (membuat simulasi kromatogram, dan mengaplikasikan hasil analisis
laboratorium/studio) untuk dipresentasikan bersama (dalam studio)
d. Kegiatan di studio/lapangan/laboratorium, bila mungkin, (14 x pertemuan), untuk
mendukung perkuliahan, agar mahasiswa dapat melakukan sampling di lapangan,
RPS_Geokimia Biomarker_Sem Genap 2011/2012

Page

melakukan preparasi sampel dan determinasi / analisis kromatogram dari pra zat
struktur molekul biotanya.

RPS_Geokimia Biomarker_Sem Genap 2011/2012

Page

KAPAN, DIMANA, BAGAIMANA

Aplikasi
Aplikasi ::
Lingkungan
Lingkungan Pengendapan,
Pengendapan,
Umur,
Umur, Sumber
Sumber Material,
Material,
Kematangan,
Kematangan, Korelasi,
Korelasi,

Zonasi, Tabel,
Plotting
Gambar

Diskripsi Lingkungan
Pengendapan dan
Sumber Material

Diskripsi Umur

Diskripsi
Kematangan dan
Biodegradasi

Ciri-Ciri Kromatogram
GC/GC-MS

Arti, Tujuan,
Materi dan
Manfaat

Sampling, Preparasi,
Observasi dan
Determinasi

Klasifikasi,
Kromatografi GC/GCMS

Geokimia Biomarker

RPS_Geokimia Biomarker_Sem Genap 2011/2012

Page

V. Sumber Referensi
A. Textbook :
1. Peters, K.E, Walters, C.C, & Moldowan, J.M., 2005. The Biomarker Guide, Vol 1 and 2.
Cambridge University Press, 1155 p.
B. Acuan / Referensi :
1. Peters, K.E., & Moldowan. J.M., 1993. The Biomarker Guide: Interpreting Molecular
Fossils in Petroleum and Ancient Sediments. Prentice Hall, Englewood Cliff, New Jersey,
07632, 363 p..
2. Peters, K.E., 1986. Guidelines for evaluating petroleum source rock using programmed
pyrolysis. AAPG Bulletin 70 (3), 318-329.
3. Philp, R.P., 1985. Fossil fuel biomarkers, Applications and spectra. Elsevier, AmsterdamNew York, 294 pp.
4. Waples, D.W., Machihara, T., 1990. Application of sterane and triterpane biomarkers in
petroleum exploration. Bulletin of Canadian Petroleum Geology 38 (3), 357-380.
5. van Aarssen, B.G.K., de Leeuw, J.W., Collinson, M., Boon, J.J, Goth, K., 1994.
Occurenceof polycadinene in fossil and recent resins. Geochimica et Cosmochimica Acta
58 (1), 223-229.
6. Alexander, R., Kagi, R.I., Noble, R., Volkman, J.K., 1984. Identification of some byciclic
alkanes in petroleum. Organic Geochemistry 6, 63-70.
7. Alexandre, R., Kagi, R.I., Rowland, S.J., Sheppard, P.N., Chirila, T.V., 1985. The effects
of thermal maturity on distributions of dimetylnaphthalenes and trimethylnaphthalenes in
some ancientsediments and petroleums. Geochimica et Cosmochimica Acta 49, 385-395.
8. Alexandre, R., Larcher. A.V., Kagi, R.I., Price, P.L., 1992. An oil-source correlation study
using age specific plant-derived aromatic biomarkers. In: Moldowan, J.M., Albrecht, P.,
Philp, R.P. (Eds). Biological markers in sediments and petroleum. Prentice Hall, New
Jersey, pp. 201-220.
9. Chaffee. A.L., Hoover, D.S., Johns, R.B., Schweighardt, F.K., 1986. Biological markers
extracable from coal. In: John, R.B. (Ed), Biological markers in the sedimentary record.
Elsevier, Amsterdam, pp. 311-345.
10. Moldowan, J.M., Seifert, W.K., Gallegos, E.J., 1985 Relationship between petroleum
composition and depositional environment of petroleum source rocks. AAPG Bulletin 69,
1255-1268.
11. Moldowan, J.M., Sundararaman, P., Shoell, M., 1986. Sensitivity of biomarker properties
to depositional environment an/or source input in the Lower Toarcian of S.W. Germany.
Organic Geochemistry 10, 915-926.

RPS_Geokimia Biomarker_Sem Genap 2011/2012

Page 3

VI. Penilaian
No
1
2
3
4

JENIS TAGIHAN

BOBOT (%)

Presensi kuliah (min 12 x tatap muka dari 14 x tatap

muka dosen
Tugas / Keaktifan / diskusi
Ujian Tengah Semester /UTS
Ujian Akhir Semester / UAS
Jumlah

10
10
30
50
100 %

Pedoman Penilaian yang digunakan berdasarkan :

Pedoman penilaian mengacu dari Skep Rektor Nomor 87a/VII Tentang Pokok-pokok
Peraturan Akademik Program D3, S1 dan S2 UPN VY halaman 20 Bab V Pasal 17 ayat
9.Skep ini mulai berlaku 20 Agustus (Semester Ganjil 2010, TA.2010/2011)
Nilai angka
81-100
76-80
66-75
61-65
51-60
31-50
30

Nilai huruf
A
B+
B
C+
C
D
E

Harkat
4
3,5
3
2,5
2
1
0

RPS_Geokimia Biomarker_Sem Genap 2011/2012

Sebutan
Istimewa
Baik sekali
Baik
Cukup baik
Cukup
Kurang
Gagal

Page 3

VII.
Pertem
uan ke
1

Rencana Pembelajaran Mingguan

Kompetensi
2

Dapat menjelaskan kompetensi mata

kuliah, tujuan, materi, manfaat dan
referensi.

Dapat mengetahui dan memahami asal

biokimia dari kebanyakan biomarker
dan asal petroleum.

Mengetahui dan memahami proses

pembentukan biomarker dan faktorfaktor yang berpengaruh terhadap
kuantitas dan kualitas material organik
serta kimia organik dan struktur
molekulnya

Mengetahui dan memahami kimia

organik dan struktur molekulnya serta
contoh biomarker, kemelimpahan dan
mulajadi

Pokok bahasan atau

subpokok bahasan
3
Bab 1. PENDAHULUAN
Maksud dan tujuan
Biomarker dan produktifitas
primer
Konsep biomarker dan
distribusi, preservasi,
alterasi biomarker
Aplikasi biomarker
BAB 2. BIOKIMIA DARI
BIOMARKER
Asal biokimia dan Lipid
membran
Biosintesa isoprenoid dan
sikliksasi squalena
Biosintesa hopanoid, sterol
dan porfirin di biosfer dan
geosfer
Asal petroleum, the deep
earth gas, abiogenic origin,
thermogenic origin
Bab 3. PROSES
BIOMARKER DAN KIMIA
ORGANIK I
Diagenesis dan katagenesis
Metagenesis, biodegradasi
dan water washing
Kimia alkana, alkena,
aromatik benzene dan notasi
struktur
BAB 4. KIMIA ORGANIK II
DAN CONTOH
BIOMARKER
Kimia alkana asiklik, alkana
siklik dan hokum isoprene
Stereokimia dan
nomenklatur

Metode
Pembelajaran
4

Ceramah
Diskusi kelas

Ceramah
Diskusi kelas
Studi lapangan, preparasi
Bahan preparasi

Media
Pembelajaran
5

LCD
OHP
Papan tulis

Pertanyaan
lisan seputar
Pendahuluan

LCD/OHP

Ceramah
Diskusi kelas

LCD
OHP
Papan tulis

Ceramah
Diskusi kelas

LCD/OHP
Papan tulis

Metode
evaluasi
6

Referensi
7

A (1)
B (1,3,5,7)

A.(1)
B (3)

A (1)
B (1,5)

Table dan
Gambar dari
struktur
molekul

A (1)
B (1,2,3,5, 9)

Mengetahui dan memahami organisasi

laboratorium, instrumentasi peralatan,
ketersediaan sampel, perlakuan sampel,
pencucian dan pemisahan sampel.

Mengetahui dan memahami apa itu GC,

MS dan tandem GC-MS
Memahami cirri-ciri dan identifikasi
senyawa dan kuantifikasinya
Memahami keterbatasan dan
problem/kesalahan GC-MS

Stereo isomerisasi dan

stereokimia biomarker
terseleksi
Bakteri hopana, kolestana,
porpirin, diterpana asiklik
BAB 5. DASAR-DASAR
BIOMARKER
Geokimia dasar/supporting
Organisasi laboratorium
biomarker dan instrumentasi
Ketersediaan sampel,
kualitas dan seleksi
Pencucian sampel dan
pemisahan
BAB 6. GAS
CHROMATOGRAPHY DAN
GC-MASS SPECTROMASS
GC dalam GC-MS
MS dalam GC-MS
Model-model operasi GC
MS
Spektrum massa,
identifikasi senyawa dan
kuantifikasi
Contoh problem data GC
MS
Analisis kesalahan

LCD / OHP
Papan tulis
TUGAS
Menggambar
flowcart
organisasi dan
instrumentasi

Ceramah
Diskusi kelas

A (1)
B (2, 3, 9)

LCD / OHP
Papan tulis

Ceramah
Diskusi kelas

A (1)
B (2,6, 9, 11)

Memahami konsep korelasi geokimia

biomarker dan prinsip-prinsip korelasi
batuan induk-batuan induk, batuan
induk-oil, oil-oil.
Memahami parameter biomarker untuk
mengetahui sumber dan umur material
organik dan memprediksi karakter
batuan induk dari interpretasi data oil.

BAB 7. PETUNJUK
INTERPRETASI
A. Konsep korelasi
geokimia
biomarker/nonbiomaker dan
chemometric
a. Korelasi batuan indukbatuan induk
b. Korelasi batuan induk-oil
c. Korelasi oil-oil
d. Analisis chemometric dari
kumpulan data
B. Parameter biomarker
untuk source material dan
umur
a. Parameter source
b. Prediksi karakter batuan
induk dari komposisi oil

UJIAN TENGAH SEMESTER

Ceramah
Diskusi kelas

LCD / OHP
Papan tulis

Soal Ujian

A (1)
B (2,6, 9, 11)

Soal Pilihan

Memahami parameter biomarker untuk

mengetahui sumber dan umur material
organik dan memprediksi karakter
batuan induk dari interpretasi data oil.

10

11

Memahami parameter non-biomarker

untuk sumber dan umur material
organik.
Mengenali karakteristik batuan induk
karbonatan dan serpih

12

Mengetahui dan memahami

kematangan batuan induk dan oil dari
sifat-sifat biomarker dan nonbiomarker

13

14

Mengetahui dan memahami

kematangan batuan induk dan oil dari
sifat-sifat biomarker dan nonbiomarker

BAB 8. PETUNJUK
INTERPRETASI
Parameter yang
berhubungan dengan umur
Isoprenoid asiklik dan
alkana
Sterana dan diasterana
Terpana dan senyawa
sejenis
Biomarker aromatik
Porpirin
Latihan
BAB 9. PETUNJUK
INTERPRETASI
C. Parameter non-biomarker
untuk source dan umur
D. Karakteristik geokimia
petroleum dari: a. Batuan
induk karbonatan, b. Batuan
induk serpih
BAB 10. PARAMETER
BIOMARKER
KEMATANGAN

Kriteria parameter
kematangan biomarker

Assessment
kematangan

Terpana, sterana

Polycadinane dan
pruduk yang berhubungan
Steroid dan hopanoid
aromatik

Porpirin dan latihan,

Parameter kematangan
non-biomarker: a. Alkana dan
isoprenoids, b. Hidrokarbon
aromatik
BAB 11. BIODEGRADASI

Ceramah
Diskusi kelas

Ceramah
Diskusi kelas

Ceramah
Diskusi kelas

Ceramah
Diskusi kelas

LCD / OHP
Papan tulis

PR
Identifikasi
masing-masing
biomarker

LCD / OHP
Papan tulis

A (1)
B (1)

A (1)
B (1)

LCD / OHP
Papan tulis

A (1)
B (2, 6, 9)

LCD / OHP
Papan tulis

A (1)
B ( 1,2,3,8,
9,10,11)

Ceramah
Diskusi kelas

Ceramah
Diskusi kasus

LCD / OHP
Papan tulis

LCD / OHP
Papan tulis
Tabel latihan

Latihan
menerapkan
hasil analisis.
Latihan
sintesis.

A (1)
B ( 1,2,3,8,
9,10,11)

A (1)
B ( 1,2,3,8,
9,10,11)

15

Memahami pengertian biodegradasi

dan mengetahui efek biodegradasi pada
pembacaan kromatogram dan
komposisi petroleum

16

Kontrol biodegradasi
dari petroleum
Kecepatan biodegradasi
aerobik dan anaerobik
Prediksi terjadinya dan
meluasnya biodegradasi
Cara degradasi
hidrokarbon aerobik dan
anaerobik
Efek biodegradasi pada
komposisi petroleum
Biodegradasi dari
kerogen dan batubara
Biodegradasi dari oil
seeps

Diskusi kelompok dari

tugas studi kasus

LCD / OHP
Papan tulis
Tabel latihan

Soal Ujian

UJIAN AKHIR SEMESTER

Yogyakarta,
Menyetujui,
Ketua Program Studi Teknik Geologi

Ir. H. Sugeng Raharjo, MT

NIP. 19581208 199203 1 001

Januari 2015

Dosen Pengampu

Ir. S. Kis Daryono, MT

NIP. 19630624 199003 1 001

Koreksi Tugas
studi kasus

Soal Obyektif,
Uraian

A (1)
B ( 2,4,11)