1.

Mikroorganisme Pendegradasi Lignin

1.1 Bakteri Pendegradasi Lignoselulosa

Bukti degradasi lignin oleh bakteri sangat

jarang

meskipun spesies

Streptomycete mampu menurunkan lignin dengan tingkat rendah. Oleh karena itu,
bakteri umumnya dianggap sebagai pendegradasi lignoselulosa sekunder, dan dapat
menurunkan selulosa dan hemiselulosa baik aerobik dan anaerobik. Contoh
pendegradasi aerobik (hemi) selulosa meliputi Thermobifida fusca dan Composti
Cellulomonas, serta beberapa bakteri lain. Dalam kasus ini, degradasi dimulai oleh
aktivitas bersama dari sel terkait dan ekstraseluler bebas selulase dan hemicellulases.
Sebaliknya, bakteri pendegradasi selulosa anaerobik biasanya mengikat hidrolase
yang sesuai dengan sel melalui kompleks cellulosome. Cellulosomes adalah
kompleks multienzim yang mengikat dinding sel bakteri dan mempromosikan
penyerapan gula terlarut oleh organisme hidrolitik. Clostridium thermocellum dan C.
cellulolyticum adalah bakteri pendegradasi anaerobik terbaik (Mahajan, 2011).
1.2 Jamur Pendegradasi Lignoselulosa
Jamur adalah pendegradasi utama lignoselulosa. Selain mengeluarkan enzim
yang sangat penting untuk dekomposisi lignoselulosa, pertumbuhan jamur pada
lignoselulosa ditingkatkan oleh pembentukan miselia yang memungkinkan
transportasi nutrisi oleh jamur berserabut termasuk nitrogen dan besi, dengan substrat
lignoselulosa yang kaya karbon. Banyak jamur juga lebih tahan terhadap turunan
biosida kayu yang membatasi pertumbuhan bakteri. Senyawa ini termasuk tanin dan
berbagai senyawa fenolik yang sangat melimpah dalam kayu lunak dari pohonpohon tumbang .
Sebagian besar jamur pelapuk kayu yang telah diketahui sampai saat ini
adalah anggota dari filum Basidiomycota baik jamur pelapuk coklat atau putih
(Mahajan, 2011).
1.2.1 Jamur Pelapuk Putih
Jamur pelapuk putih yang melapukkan kayu mensekresikan enzim untuk
mendegradasi lignin, hemiselulosa dan selulosa, meninggalkan

sisa serat kayu

dengan penampilan dikelantang. Dua pola utama jamur pelapuk putih, yaitu pelapuk

putih simultan ("busuk korosi") dicontohkan dengan degradasi gabungan karbohidrat

dan lignin pada tahap pembusukan awal dan akhir. Contoh jamur putih yang
menimbulkan pelapukan simultan adalah Fomes fomentarius, Phellinus robustus,
dan Trametes versicolor. Coriolus versicolor merupakan contoh jamur pelapuk putih
yang menyebabkan degradasi simultan dari semua komponen dinding sel
(Blanchette, dkk., 1988). Sedangkan, pelapuk putih selektif dicontohkan dengan
degradasi awal lignin dan hemiselulosa diikuti oleh degradasi selulosa. Ceriporiopsis
subvermispora dan Phlebia radiata mungkin adalah jamur terbaik yang dipelajari
untuk memperoleh pelapukan putih selektif (Mahajan, 2011).
Banyak pola morfologis berbeda dari pelapuk putih yang terjadi pada kayu
karena variasi degradasi lignin dan polisakarida. Beberapa jamur pelapuk putih
memiliki kemampuan untuk mendegradasi secara selektif jumlah kandungan lignin
dengan hanya sedikit kehilangan

selulosa dan toleransi untuk kehilangan

hemiselulosa yang rendah (Blanchette, dkk., 1988).

1.2.2 Jamur Pelapuk Coklat
Pelapukan oleh jamur pelapuk coklat ditandai dengan degradasi cepat dari
selulosa dan hemiselulosa, dan retensi residu lignin yang dimodifikasi. Sampai saat
ini, jamur pelapuk cokelat terutama diisolasi dari jenis pohon jarum (kayu lunak)
dan mewakili sekitar 7 % dari Basidiomycetes

pelapuk kayu terisolasi. Jamur

pelapuk coklat dapat menyebabkan hilangnya kekuatan struktural kayu dengan

konstruksi, dan pembusukan kayu yang biasanya ditandai dengan warna coklat
kemerahan dan kering dan konsistensi yang rapuh. Contoh jamur pelapuk coklat
termasuk Fomitopsis lilacino - gilva, Laetiporus portentosus, Postia plasenta,
Gloeophyllum trabeum dan Serpula lacrymans. Berbeda dengan berbagai enzim
yang disekresi oleh jamur pelapuk putih, jamur pelapuk cokelat dimulai dengan
degradasi polisakarida kayu menggunakan kimia Fenton, dimana radikal hidroksil
dapat berdifusi menembus permukaan kayu dan selulosa dan depolimerisasi
hemiselulosa ketika meninggalkan lignin utuh. Studi menunjukkan bahwa jamur
pelapuk coklat telah berevolusi beberapa kali dari jamur pelapuk putih (Mahajan,
2011).

2.

Pemilihan Jamur Pelapuk

Ada sekitar 10.000 spesies jamur putih pelapuk, dengan berbagai kemampuan

untuk mendegradasi lignin , selulosa, dan hemiselulosa . Untuk menemukan spesies

yang sesuai dan cocok untuk biopulping , program skrining dilakukan untuk
mengidentifikasi strain yang tumbuh cepat yang bisa dengan selektif menghilangkan
lignin dari kayu. Meskipun ada banyak metode yang berbeda untuk skrining jamur
pelapuk putih, salah satu prosedur yang paling tepat tampaknya adalah penilaian
kerusakan (analisis kimia dari lignin dan kadar gula kayu ) dari balok kayu
terinokulasi yang ditempatkan di ruang pembusukan yang dipercepat . Spesies yang
dipilih dengan metode ini juga telah terbukti menjadi kandidat sukses untuk
pretreatment biologi kayu untuk proses pembuatan pulp mekanik atau sebagai
alternatif untuk pretreatment kimia pulping kayu dengan yield tinggi.
Ergosterol merupakan indikator jamur dan terlibat dalam pertumbuhan sel jamur
sebagai komponen utama dalam membran sel jamur. Dengan demikian, bahan kimia
ini dapat digunakan untuk memperkirakan biomassa jamur hidup dalam berbagai
substrat padat (Kang, dkk., 2007).
3. Enzim dalam degradasi Lignin
Endo- 1 ,4 - - xylanase adalah enzim penting untuk depolimerisasi xilan, yang
menghidrolisis ikatan - 1 ,4 antara residu D xylose dalam rantai utama
penghasil non - substituen atau xylooligossacharida bercabang . Namun, - L arabinofuranosidase , a- glukuronidase , asetil ( xilan ) esterase , dan ferulic dan p
coumaric esterase asam memiliki fungsi bersama dalam degradasi sempurna xilan.
- mannanase telah diklasifikasikan dalam 5 keluarga dan 26

hidrolase

glikosida, yang merupakan enzim yang penting untuk degradasi enzimatik

hemiselulosa dari kayu lunak . Di alam , endo - 1 ,4 - mananase memotong rantai
utama galactomannan, menghasilkan terutama oligosakarida dan mannobiose.
Selanjutnya , 1,4- - mannosidase menghasilkan mannose. Enzim ini menunjukkan
aktivitas terhadap p - nitrofenil - -D - mannoside , karboksimetil selulosa , dan
xylans. kemampuan enzim ini untuk menurunkan beberapa substrat dapat dijelaskan
oleh kehadiran dari beberapa situs katalitik atau ikatan di mana setiap substrat
dihidrolisis di lokasi yang berbeda dalam enzim (Magalhaes, dkk., 2009).

Mangan Peroksidase, adalah enzim glikosilasi ekstra seluler, diproduksi oleh

Phanerochaete chrysosporium dan berbagai

jamur pelapuk putih pendegradasi

lignin. Mangan Peroksidase digunakan untuk degradasi lignin in situ dalam pulp dan
dekolorisasi larutan pemasak Kraft, yang berisi lignin dan turunannya. Banyak Mn
peroksidase telah dimurnikan dari media extra - seluler dari berbagai spesies jamur
termasuk Dichomitus squalens, Ceriporiopsis subvermispora, Lentinus edodes,
Trametes versicolor, Phlebia radiata, Pleurotus ostreatus, Panus tigrinus dan
Phanerochaete chrysosporium (Jha & Patil, 2011).
Laccase, ezim yang mengandung tembaga, jenis pengoksidasi

senyawa

aromatik. Laccase sangat ppenting untuk degradasi lignindapat digunakan untuk

menghilangkan lignin dalam industri pulp dan kertas (biopulping). Laccase juga
diguakan

sebagai agen dekolorisasi

(biobleaching), bersamaan dengan

penghilangan pencemar fenolik dan aromatik (Harit dan Mandakini, 2013).

Banyak mikroorganisme yang dikenal untuk menghasilkan lebih dari satu enzim
depolimerisasi xilan. C. subvermispora menghasilkan setidaknya tiga xilanase dan
dua mannanase (Magalhaes, dkk., 2009).
4.

Biopulping
Biopulping adalah proses pembuatan pulp (serat selulosa) secara biologis

menggunakan mikroorganisme ligninolytik (Wulandari, dkk., 2013). Beberapa

keuntungan biopulping antara lain menghemat penggunaan energi listrik,
meningkatkan kualitas kertas, mengurangi dampak pencemaran lingkungan, dan
meningkatkan daya saing ekonomi (Koshy,dkk, 2011; El-din, dkk., 2013)

Gambar 1. Diagram Alir Biopulping

Pada

metode perlakuan awal

jamur, serpihan kayu dikukus, didinginkan,

diinokulasi dengan jamur alam tertentu, dan diinkubasi selama dua minggu. Selama
periode inkubasi, jamur berkolonisasi pada permukaan dan bagian dalam serpihan
kayu dan mengeluarkan enzim yang

mendegradasi lignin dalam kayu dan

melembutkan chip.
Olahan serpihan kayu dengan proses ini membutuhkan sedikit energi listrik
dalam proses pembuatan pulp dan untuk memproduksi pulp yang lebih kuat. Hal-hal
inovatif dari proses biopulping ini adalah identifikasi jamur tertentu, pemilihan
nutrisi jamur murah, dan

pengembangan sistem yang dapat menghasilkan chip

olahan dalam sebuah operasi sinambung yang komersial (Department of Energy

United States, 2001).