Proses ini mirip dengan proses pembentukan HMG KoA dalam mekanisme ketogenesis.
Hanya berbeda lokasi saja. Ketogenesis terjadi di mitokondria sedangkan sintesis
kolesterol terjadi di sitoplasma. Kesimpulannya ada dua lokasi sintesis HMG KoA di
dalam sel. Yang satu terjadi di dalam mitokondria (ketogenesis) dan yang satunya lagi
terjadi di sitoplasma (sintesis kolesterol).
Dua molekul asetil KoA awalnya berkondensasi membentuk asetoasetil KoA. Dan
molekul asetil KoA lainnya ditambahkan sehingga menghasilkan HMG KoA.
1. 2. Pembentukan mevalonat
Enzim HMG KoA akan mereduksi HMG KoA menjadi mevalonat. Enzim ini berada di
retikulum endoplasma. Pada proses reduksi ini dibutuhkan ekivalen pereduksi yang
disuplai oleh NADPH.
HMG KoA juga sangat dipengaruhi oleh hormon misalnya seperti hormon insulin dan
glukagon. Jika kadar glukagon meningkat, HMG KoA reduktase mengalami fosforilasi
dan menjadi tidak aktif sedangkan jika kadar insulin yang meningkat, enzim tersebut
akan mengalami defosforilasi dan menjadi aktif. Begitu juga dengan hormon tiroid dan
glukokortikoid. Hormon tiroid meningkatkan aktivitas reduktase ini sedangkan
glukokortikoid menurunkannya.
Kesimpulannya, reaksi pertama dari tahap ini adalah mevalonat diubah menjadi 3-fosfo
5-pirofosfomevalonat yang kemudian didekarboksilasi menjadi isopentenil pirofosfat.
Isopentenil pirofosfat inilah salah satu unit isoprenoid yang dimaksud. Sedangkan unit
isoprenoid lainnya adalah 3,3-dimetilali pirofosfat. 3,3-dimetilali pirofosfat diperoleh dari
reaksi isomerase yang dikatalisis oleh enzim isomerase isopentenil pirofosfat.
1. 4. Sintesis skualen
Isopentenil pirofosfat (Isopentenyl pyrophosphate, IPP) dan 3,3-dimetilalil pirofosfat
(dimethylallyl pyrophosphate, DPP) berkondensasi membentuk geranil pirofosfat (10C).
Dalam tahap ini terjadi penambahan satu unit isoprenoid lagi untuk menghasilkan farnesil
pirofosfat. Unit isoprenoid ditambahkan disini adalah satu molekul IPP. Molekul IPP
tersebut akan berkondensasi dengan GPP untuk membentuk farnesil pirofosfat (15C).
Dua unit farnesil pirofosfat bergabung dan direduksi sehingga menghasilkan skualen
(30C).