ACONITASE

1. Penomeran :
EC number

4.2.1.3

CAS number

9024-25-3

2. Bakteri :
mitochondrial aconitase group.
-proteobacteriaciae

3. Cara isolasi :
Aconitase, memiliki dua struktur yang sedikit berbeda, tergantung pada apakah itu
diaktifkan atau dinonaktifkan. Dalam bentuk tidak aktif, struktur dibagi menjadi
empat domain. Menghitung dari N-terminus, hanya tiga yang pertama dari domain ini
terlibat dalam interaksi yang erat dengan cluster [3Fe-4S], tetapi situs aktif terdiri dari
residu dari empat domain, termasuk domain C-terminal yang lebih besar. Fe-S klaster
dan anion SO42- juga berada di sisi aktif. Bila enzim ini diaktifkan, dapat
mengakibatkan bertambahnya kandungan besi, menciptakan [4Fe-4S] cluster. Namun,
struktur sisa enzim hampir tidak berubah; atom dilindungi antara dua bentuk yang di
dasarnya posisi yang sama, hingga perbedaan 0,1 angstrom.
4. Manfaat/Fungsi
Enzim aconitase adalah pemain kunci dalam proses produksi energi. Sebagai bagian
dari siklus asam trikarboksilat, itu mengkonversi sitrat menjadi isositrat. Ada satu
bentuk aconitase di mitokondria, yang melakukan sebagian besar konversi untuk
siklus asam sitrat, dan bentuk yang sama dalam sitoplasma yang menciptakan
isocitrate untuk tugas-tugas sintetis lainnya. Aconitase terdiri dari rantai protein
tunggal yang lipatan ke beberapa domain (domain berwarna nuansa yang sedikit
berbeda dari biru di sini). Domain menutup seperti pemecah kacang di sekitar lokasi
aktif, yang berisi sebuah cluster besi-sulfur yang membantu dengan reaksi.
Iron Regulatory Protein 1
Bentuk sitosol dari aconitase juga bertindak sebagai zat besi protein regulator 1.
Struktur yang lebih rendah, dari PDB entri 2ipy, menunjukkan bagaimana Aconitase
melakukan fungsi yang sama sekali berbeda ini. Cluster besi-sulfur di aconitase tidak
stabil dan harus diganti sesekali ketika jatuh keluar. Ketika kadar zat besi dalam sel
mendapatkan kadar rendah, tidak ada cukup zat besi untuk menumbuhkan cluster, dan
pergeseran protein dengan fungsi kedua. protein membuka grip hairpin loop dalam
molekul beberapa dan messenger RNA tertentu. Ini seperti sebuah jepitan di awal
messenger RNA untuk feritin, dan lima jepitanr yang sama pada akhir messenger
RNA untuk reseptor transferin. Ketika besi protein regulator 1 mengikat, menghambat
pembentukan feritin, sehingga kadar besi terkunci dalam penyimpanan,

dan meningkatkan pembangunan reseptor transferin, sehingga sel dapat mengambil

lebih transferin keluar dari darah, dan dengan itu , lebih banyak zat besi.
5. Struktur Enzim

Sitrat dan cluster Fe-S di situs aktif dari aconitase: garis putus-putus kuning
menunjukkan interaksi antara substrat dan residu terdekat
6. Metabolisme kerja enzim
mAcn memainkan peran kunci dalam metabolisme karbohidrat, mengkatalis pada
langkah kedua dari siklus TCA untuk menghasilkan isositrat dari sitrat. Selain
produksi energi dari pemecahan karbohidrat, beberapa intermediet dari siklus TCA
juga prekursor biosintesis heme dan asam amino.
mAcn juga moonlights: memiliki peran penting kedua - dalam DNA mitokondria
(mtDNA) pemeliharaan. mAcn bertindak untuk menstabilkan mtDNA, membentuk
bagian dari mtDNA kompleks protein-DNA dikenal sebagai nukleolus. Hal ini diduga
reversibel memodelkan nucleolus untuk secara langsung mempengaruhi ekspresi gen
mitokondria dalam menanggapi perubahan dalam lingkungan seluler.
Kedua fungsi terkait. Fungsi dari siklus TCA adalah untuk menyediakan elektron
energi tinggi dalam bentuk NADH dan FADH2 ke mitokondria fosforilasi jalur
oksidatif, sementara mtDNA mengkodekan komponen dari jalur oksidatif fosforilasi.
Dengan demikian, Macn bisa bertindak sebagai regulator metabolisme untuk
metabolisme energi pasangan dengan ekspresi gen mitokondria.
7. Inhibitor
Besi
Referensi
https://www.ebi.ac.uk/interpro/potm/2007_5/Page2.htm

http://pdb101.rcsb.org/motm/89
http://www.publish.csiro.au/nid/102.htm
http://www.biochemj.org/keyword/aconitase
https://en.wikipedia.org/wiki/Aconitase

HELMI FAJRIN UBAIDILLAH

20115061
1B TLB