Diversity and function of fungi in peatlands:

A carbon cycling perspective

Lahan gambut adalah bentang alam yang dominan di belahan bumi utara,
mengumpulkan karbon dalam bentuk gambut karena ketidakseimbangan
Antara dekomposisi dan tingkat produksi tanaman. Dekomposer (saprobes) dan
jamur mikoriza berpengaruh secara signifikan terhadap karbon
Komunitas Microfungal (mycota) telah diteliti dalam sejumlah lahan
gambut di Eropa dan Utara dan Selatan Amerika. Dari perspektif taksonomi, lebih
dari 860 individu Catatan dari Mikrofungi dari lahan gambut telah dilaporkan,
mewakili 648 spesies yang berbeda. Ini adalah 408 Spesies anamorphic dengan
afinitas ascomycete putatif (Bereproduksi secara aseksual saja), 22 teleomorphic
ascomycetes (mereproduksi seksual), 25 basidiomycetes, 67 zygomycetes, 28
chytridiomycetes, dan 106 taksa dengan diketahui taksonomi afinitas, ragi, dan
mycelia sterilia (steril isolat; Tabel 2).
Ascomycetes anamorphic sejauh ini merupakan kelompok terbesar Jamur
yang diisolasi dari lahan gambut (408 spesies, atau 63% dari semua spesies; Tabel
2). Spesies Penicillium dan Acremonium Mendominasi kelompok ini (masing-
masing 89 dan 27 spesies), Dengan P. frequentans Westl., P. purpurogenum Stoll,
P. spinulosum Thom, P. thomii Maire, dan A. kiliense Grtz Menjadi spesies yang
dominan Kedua genera ini dan berikutnya Enam genera yang paling dominan terdiri
dari 194 spesies yang berbeda, Yang mewakili hampir setengah dari seluruh
anamorphic Kekayaan spesies ascomycete di lahan gambut (Tabel 3). Zygomycetes
juga sangat sering diisolasi dari gambut (67 spesies berbeda, atau 10% dari semua
spesies; Tabel 2). Didalam Kelompok, spesies Mortierella (M. alpina Peyronel, M.
Isabellina Oudem & Koning, M. minutissima van Tieghem, M. ramanniana
(Mller) Linnem., M. vinacea Dixon- Stewart) dan Mucor (M. hiemalis Wehmer)
terdiri dari 80% Dari semua zygomycetes (Tabel 3). Beberapa survei spesifik untuk
Chytridiomycetes menghasilkan 28 spesies (4% dari semua spesies; Tabel 2),
dengan Rhizophydium, Phlyctochytrium, dan Septosperma menjadi genera
dominan (61% dari semua chytridiomycete jenis; Tabel 3). Ascomycetes
teleomorfik (22 Spesies, atau 3% dari semua spesies) dan basidiomisetes (25
Spesies, atau 4% dari semua spesies) jarang diisolasi dari gambut. Di antara
kelompok sebelumnya, spesies Chaetomium, Gelasinospora, Sordaria, dan
Thielavia didominasi (68% Dari semua spesies ascomycete), sementara ragi
basidiomycete didominasi Kelompok yang terakhir (Cryptococcus dan
Rhodotorula Spp., 36% dari semua spesies basidiomycete; Tabel 3). Akhirnya, 106
catatan jamur dari lahan gambut tetap tidak dikenal (Miselia sterilia dan tidak
teridentifikasi: 77 taksa; ragi: 12 taksa; Pycnidial: 7 taksa) atau milik taksa dengan
Tak dikenal taksonomi taksonomi (10 taksa; Tabel 2 dan 3).
 Jamur memainkan peran mendasar dalam proses dekomposisi Bahan
organik di semua ekosistem dan mungkin lebih Penting daripada bakteri di lahan
basah dari perspektif fungsional, Karena kebiasaan pertumbuhan hama yang luas,
Tingkat pertumbuhan yang lebih cepat, dan kemampuan untuk mentransmitasi
nutrisi Melalui jaringan hyphal mereka. Lima besar "perilaku Pengelompokan
"jamur dekomposer telah dikenali (Tabel 4). Kelompok 1 jamur, patogen dan
parasit lemah bisa Mentolerir mekanisme pertahanan rumah tapi umumnya miskin
Pesaing dalam bahan organik mati Akses jamur ini sederhana Gula dan senyawa
penyimpanan lainnya. Mengikuti Penuaan dan kematian tanaman, semua bahan
organik berurutan Dikoloni oleh pelopor saprobes (Grup 2), diikuti oleh jamur
pengurang polimer sederhana (Kelompok 3), dan akhirnya Degrader polimer
bandel (Kelompok 4). Sekunder, atau Oportunistik, saprobes (kelompok 5) umum
terjadi Seluruh proses dekomposisi (Tabel 4; Deacon 1997). Oleh karena itu, dari
sudut penuaan untuk menyelesaikan dekomposisi, Semua bahan organik dikoloni
oleh seperangkat saprobes Dengan profil enzimatik spesifik dan preferensi untuk
spesifik (Non) senyawa struktural C. Suksesi ini telah Sebelumnya ditampilkan
dalam berbagai tandu, termasuk daun, Akar, kerucut, biji, kotoran, dan kayu, dalam
berbagai ekosistem, Termasuk hutan, lahan basah, dan padang rumput (Wicklow
Dan Yokum 1981; Heilman-Clausen 2001; Lumley dkk. 2001).
Evaluation of biocontrol potential of some fungal decomposers of Sesbania
aculeata L. green manure against some soil-borne plant pathogens

PENDAHULUAN

Patogen yang ditularkan melalui tanah, yaitu Sclerotium rolfsii, Rhizoctonia

solani, Sclerotinia sclerotiorum, Pythium spp. Dan Fusarium spp. Adalah patogen
paling merusak dari berbagai tanaman komersial penting di seluruh dunia. Tingkat
kerusakan dapat dinilai dari kenyataan bahwa di bawah kondisi agro-iklim yang
menguntungkan, kerugian yang disebabkan oleh patogen ini dapat mencapai hingga
100% (Kapoor, 2008).Pengendalian patogen tanaman yang ditanami tanah yang
menyebabkan penyakit parah di berbagai tanaman bernilai ekonomis menghadirkan
tantangan besar bagi para peneliti dan petani. Pupuk hijau telah dipelajari sebagai
strategi pengendalian potensial untuk penyakit yang ditularkan melalui tanah
dengan meningkatkan persaingan mikroba dan antagonisme (Ochiai et al., 2007;
Kamil et al., 2009; Larkin, 2013)Pupuk hijau dapat mempengaruhi patogen secara
langsung melalui pemecahan glukosinolat atau dengan melepaskan senyawa
fungitoksik seperti avenacin, saponin atau allil isothiocyanate (Mayton et al., 1996)
dan juga mempengaruhi patogen yang ditularkan melalui tanah secara tidak
langsung dengan mempengaruhi populasi mikroba pribumi (Manici et al., 2004).

Penggunaan Sesbania spp. Secara khusus dan tanaman terkait lainnya pada
umumnya sebagai tanaman penutup, rotasi tanaman atau tanaman pupuk hijau
untuk mengurangi patogen dan penyakit yang ditanggung tanah telah mendapat
perhatian yang meningkat dalam beberapa tahun terakhir (Kumar dkk, 2014).
Berdasarkan penelitian ini, pengaruh 8 pengurai jamur dominan yaitu Aspergillus
niger, Aspergillus flavus, Aspergillus fumigatus, Trichoderma harzianum,
Penicillium citrinum, Penicillium rubrum, Cladososporium cladosporioides dan
Curvularia lunata pada pertumbuhan radial dan produksi sklerotia dari tiga patogen
tanah yang ditanggung. Sclerotium rolfsii, Rhizoctonia solani dan Sclerotinia
sclerotiorum dievaluasi.

METODE
 Isolasi pengurai jamur yang dominan: Komunitas jamur yang terkait dengan
dekomposisi pupuk hijau Sesbania aculeata L. diamati, diisolasi dan dipelihara
dengan mengikuti tiga metode yaitu metode pengamatan langsung (Garrett, 1981),
metode inkubasi majemuk lembab (Boedijn, 1956) Dan teknik lempeng dilusi
(Warcup, 1960). Biji pengurai pupuk hijau diidentifikasi dan terdaftar (Kumar et
al., 2011). Dari total 44 spesies jamur yang diamati selama periode dekomposisi,
delapan potensi jamur yang membusuk yaitu, Aspergillus niger, Aspergillus flavus,
Aspergillus fumigatus, Trichoderma harzianum, Penicillium citrinum, Penicillium
rubrum, Cladososporium cladosporioides dan Curvularia lunata dicatat sebagai
dekomposer jamur dominan (Kumar et al., 2011). Delapan dekomposisi jamur
dominan ini dikultur pada PDA pada 28 2 C untuk penelitian lebih lanjut.

Pengumpulan dan pemeliharaan patogen tanaman ditanggung tanah:

Tiga patogen tanaman tanaman tanah, Sclerotium rolfsii (ITCC 5518), Rhizoctonia
solani (ITCC 4110) dan Sclerotinia sclerotiorum (ITCC 6094) dipilih untuk
penelitian ini dan dikumpulkan dari Indian Type Culture Collection (ITCC), Indian
Agriculture Research Institute, New Delhi. Ketiga patogen uji ini dikultur pada
medium PDA pada suhu 25 2 C untuk aktivitas penelitian lebih lanjut.

Efek amandemen pupuk hijau pada viabilitas sklerotia Sclerotium rolfsii,

Rhizoctonia solani dan Sclerotinia sclerotiorum: Sejumlah besar sklerotia
Sclerotium rolfsii, Rhizoctonia solani dan Sclerotinia sclerotiorum diproduksi di
media PDA dan dikumpulkan. Seratus gram, 2,5-3,0 cm pupuk kandang hijau
(Sesbania aculeata L.) dicampur ke dalam pot yang mengandung 2,5 kg tanah
ladang yang disterilkan dan dua ratus sklerotia dari patogen uji dimasukkan ke
dalam tanah yang mengandung pupuk hijau. Demikian pula, set kontrol disiapkan
tanpa pupuk hijau. Tiga replikasi setiap perlakuan disiapkan. Semua pot ini dibasahi
dari waktu ke waktu dengan menambahkan beberapa air steril untuk memudahkan
penguraian kotoran hijau dan disimpan selama tiga puluh hari. Sklerotia
dikumpulkan dari pot ini setelah menyaring tanah melalui kain muslin. Jumlah
sclerotia dihitung dan viabilitasnya diuji dengan mentransfernya ke media PDA dan
diinkubasi pada suhu 25 + 2 C selama tujuh hari.
 Teknik Dual Culture: Dekomposer jamur dominan dievaluasi terhadap tiga
patogen uji di laboratorium dengan teknik kultur ganda seperti yang dijelaskan oleh
Morton dan Stroube (1955) untuk menyaring jamur yang paling manjur. Cawan
petri (90 mm) yang mengandung media PDA diinokulasi dengan cakram mycelial
berdiameter 5mm dari koloni jamur dominan dan patogen uji yang bertahan selama
7 hari pada jarak yang sama dari pinggiran. Pelat inokulasi diinkubasi pada 25 + 2
C pada inkubator BOD dan pertumbuhan radial patogen uji diukur pada 24, 48,
72 dan 96 jam.

Pengaruh metabolit volatile pengurai jamur dominan pada pertumbuhan

radial dan produksi sklerotia patogen uji: isolat pengurai jamur dominan dievaluasi
di laboratorium untuk menyaring jamur yang paling manjur, yang menghambat
pertumbuhan patogen yang ditularkan melalui tanah dengan menghasilkan zat
volatil setelah Teknik yang dideskripsikan oleh Dennis dan Webster (1971a). Jamur
yang dominan dipusatkan secara terpusat pada cawan Petri (90mm) dengan
menempatkan cakram 5 mm yang diambil dari budaya 5 hari di piring PDA dan
diinkubasi pada suhu 25 + 2 C selama seminggu. Setelah inkubasi, tutup masing-
masing cawan Petri digantikan oleh plat dasar yang sama dengan 25 ml media PDA
yang diinokulasi secara terpusat dengan selotip uji 5 mm. Cawan petri dengan
media PDA tanpa jamur dominan pada tutup bawah dan diinokulasi oleh patogen
uji dipertahankan sebagai kontrol. Tiga ulangan dipertahankan untuk setiap
perlakuan. Pasangan masing-masing cawan Petri dimeteraikan bersama dengan pita
parafin dan diinkubasi pada suhu 25 + 2 C. Diameter koloni patogen diukur pada
24, 48, 72 dan 96 jam setelah inkubasi dan penghambatan pertumbuhan miselia
dihitung dengan rumus

Efek metabolit non-volatile pengurai jamur dominan pada pertumbuhan

radial dan produksi sklerotia patogen uji: Efek zat non-volatil yang dihasilkan oleh
dekomposer jamur yang dominan ditentukan dengan mengikuti metode yang
dijelaskan oleh Dennis dan Webster (1971b). Jamur dominan diinokulasi dalam
kaldu dekstrosa kentang 100 ml steril dalam labu berbentuk kerucut 250ml. Termos
yang diinokulasi diinkubasi pada suhu 25 2 C selama 15 hari. Kultur disaring
melalui filter Millipore dan filtrasi kultur ditambahkan ke media PDA cair (40 C)
untuk mendapatkan konsentrasi akhir 50% (v / v). Media tersebut dituangkan ke
dalam cawan Petri di piring 25 ml-1 dalam tiga ulangan dan diinokulasi setelah
dipadatkan dengan cakram uji 5mm dari patogen. Piring kontrol dipertahankan
tanpa mengubah filtrat kultur. Cawan petri dimeteraikan dengan pita parafin dan
diinkubasi pada suhu 25 2 C. Setelah 24, 48, 72 dan 96 jam, pertumbuhan radial
patogen uji diukur dan persen penghambatan dihitung dengan rumus.

Analisis statistik: Semua data dianalisis secara statistik dalam rancangan

acak lengkap (complete) (CRD). Perbedaan signifikan yang paling sedikit adalah
(LSD pada 1%) yang digunakan untuk membandingkan mean pengobatan (Gomez
dan Gomez, 1984).

HASIL DAN PEMBAHASAN

Pengaruh amandemen pupuk hijau terhadap kelayakan sklerotial Sclerotium

rolfsii, Rhizoctonia solani dan Sclerotinia sclerotiorum: Amandemen pupuk hijau Sesbania
aculeata menyebabkan penurunan maksimum (40,0%) pada sklerotium rolfsii Sclerotium
terhadap 13,0% dan 8,17% pada kontrol yang masing-masing memiliki tanah yang tidak
diautoklaf dan diautoklaf. Demikian pula, pengurangan sklerotia Rhizoctonia solani adalah
36,0% pada pupuk kandang hijau yang diamandemen sebagai campuran terhadap 18,0%
dan 10,67% pada kontrol yang masing-masing memiliki tanah yang tidak diautoklaf dan
diautoklaf, sedangkan penurunan sclerotinia sclerotinia sclerotiorum adalah 36,50%
pupuk hijau diubah Pot sebagai melawan 20,33% dan 10,50% di kontrol set memiliki tanah
yang tidak autoclaved dan diautoklaf, masing-masing (Tabel 1).

Perubahan pupuk hijau dalam pot mungkin telah mendorong pertumbuhan dan
perkembangan mikrobiota tanah, yang menekan perkecambahan sclerotia atau
menentang miselium patogen sclerotial setelah perkecambahannya (Coventry et al.,
2006). Pengurangan dalam tubuh sklerotial dengan amandemen pupuk hijau mungkin
juga disebabkan oleh parasitisme sklerotia oleh pengurai jamur dominan selama
penguraian Sesbania Aculeata dalam pot Parasitisme diduga disertai dengan produksi
enzim litik daripada antibiosis. Peleburan dan penetrasi sklerotia S. rolfsii oleh
Trichoderma harzianum diamati oleh Benhamou dan Chet (1996). Pengurangan sklerotia
fitofatogen yang ditularkan melalui tanah adalah R. solani, S. rolfsii dan S. sclerotiorum,
dalam pupuk hijau yang diamandemen tanah, sesuai dengan studi Kamil et al. (2009),
yang melaporkan penurunan sclerotia yang signifikan dari dua patogen sclerotial yaitu R.
solani dan S. rolfsii karena efek pengawetan hijau.

Semua pengurai jamur menghambat pertumbuhan miselium patogen

tanaman yang ditumbuhi tanah secara signifikan dalam kontrol, dalam dual culture.
Di antara 8 pengurai jamur, Trichoderma harzianum menghambat pertumbuhan
Sclerotium rolfsii sampai 49,95%, yang secara signifikan lebih unggul daripada
semua pengurai jamur lainnya. Ini diikuti oleh Penicillium citrinum (46,20%) dan
Aspergillus niger (33,16%), sedangkan Curvularia lunata (20,35%) menunjukkan
penghambatan pertumbuhan terendah Sclerotium rolfsii. Pola hampir serupa
diamati pada test patogen; Rhizoctonia solani dan Sclerotinia sclerotiorum (Gambar
1). Penghambatan pertumbuhan maksimum Rhizoctonia solani disebabkan oleh
Trichoderma harzianum (47,62%) diikuti oleh Penicillium citrinum (45,13%) dan
Aspergillus niger (42,70%), sedangkan Aspergillus fumigatus (24,72%)
menyebabkan penghambatan pertumbuhan Rhizoctonia solani minimal.
Penghambatan pertumbuhan maksimum Sclerotinia sclerotiorum disebabkan oleh
Trichoderma harzianum (57,83%) diikuti Aspergillus niger (50,22%) dan
Penicillium citrinum (47,01%), sedangkan Aspergillus fumigatus menyebabkan
penghambatan minimal pertumbuhan sklerotiorum sklerotinia (28,14%).

Semua antagonis jamur dekomposer, Trichoderma harzianum, Penicillium

citrinum, Aspergillus niger, Aspergillus flavus, Aspergillus fumigatus, Penicillium
rubrum, Cladososporium cladosporioides dan Curvularia lunata menghambat
pertumbuhan miselium patogen tes. T. harzianum menghambat pertumbuhan
mycelial maksimum patogen pada 4 hari inkubasi. Mekanisme penghambatan
mungkin menjadi persaingan untuk makanan dan ruang. P. citrinum menempati
urutan kedua antagonis terbaik setelah T. harzianum pada umur 4 hari inkubasi.
Trichoderma viride, T. harzianum, Gliocladium roseum, Penicillium citrinum,
Aspergillus niger dan Curvularia lunata dilaporkan oleh beberapa pekerja sebagai
antagonis terbaik untuk penghambatan pertumbuhan beberapa patogen tanaman
bawaan, bawaan benih dan foliar (Dubey et al., 2007; Kamil Et al., 2009; Ahmed
dan Upadhyay, 2009; Prabhakaran et al., 2015).
 Penelitian ini menyoroti efektivitas dekomposer jamur dominan dari pupuk
hijau dalam mengendalikan patogen yang ditanggung tanah. Semua delapan
dekomposer jamur ditemukan berkontribusi dalam mengendalikan patogen yang
ditularkan melalui tanah. Secara keseluruhan T. harzianum, Aspergillus niger dan
Penicillium citrinum terbukti sebagai agen bio-kontrol potensial terhadap semua
patogen tanaman yang ditumbuhi tanah yaitu S. rolfsii, R. solani dan S.
sclerotiorum.