Halaman
Topik 1.
Pengantar Virologi ............................................................................................... 2
Latihan …....…………………………………………….................................................................. 12
Ringkasan ….…………………………………………................................................................... 13
Tes 1 ….……………………………..……................................................................................. 13
Topik 2.
Dasar-Dasar Virologi ............................................................................................ 17
Latihan …....…………………………………………….................................................................. 33
Ringkasan ....…………………………………………................................................................... 33
Tes 2 ....……………………………..……................................................................................. 34
KUNCI JAWABAN TES FORMATIF ......................................................................... 38
GLOSARIUM …...................................................................................................... 39
DAFTAR PUSTAKA …............................................................................................. 45
Topik 1.
Virus DNA ............................................................................................................ 45
Latihan …....…………………………………………….................................................................. 63
Ringkasan ….…………………………………………................................................................... 63
Tes 1 ….……………………………..……................................................................................. 64
Topik 2.
Virus RNA ............................................................................................................ 68
Latihan …....…………………………………………….................................................................. 84
Ringkasan ....…………………………………………................................................................... 85
Tes 2 ....……………………………..……................................................................................. 85
KUNCI JAWABAN TES FORMATIF ......................................................................... 89
GLOSARIUM …...................................................................................................... 90
Virologi iii
Topik 1.
Reproduksi Virus ................................................................................................. 95
Latihan …....…………………………………………….................................................................. 110
Ringkasan ….…………………………………………................................................................... 110
Tes 1 ….……………………………..……................................................................................. 110
Topik 2.
Bakteriofaga ........................................................................................................ 114
Latihan …....…………………………………………….................................................................. 138
Ringkasan ....…………………………………………................................................................... 138
Tes 2 ....……………………………..……................................................................................. 139
KUNCI JAWABAN TES FORMATIF ......................................................................... 143
GLOSARIUM …...................................................................................................... 144
DAFTAR PUSTAKA …............................................................................................. 148
Topik 1.
Reaksi Imunologi ................................................................................................. 152
Latihan …....…………………………………………….................................................................. 164
Ringkasan ….…………………………………………................................................................... 164
Tes 1 ….……………………………..……................................................................................. 166
Topik 2.
Vaksin Virus ......................................................................................................... 169
Latihan …....…………………………………………….................................................................. 177
Ringkasan ....…………………………………………................................................................... 178
Tes 2 ....……………………………..……................................................................................. 179
KUNCI JAWABAN TES FORMATIF ......................................................................... 182
GLOSARIUM …...................................................................................................... 183
DAFTAR PUSTAKA …............................................................................................. 186
Virologi
Topik 1.
Penyebaran Virus ................................................................................................ 188
Latihan …....…………………………………………….................................................................. 204
Ringkasan ….…………………………………………................................................................... 205
Tes 1 ….……………………………..……................................................................................. 205
Topik 2.
Infeksi Virus ........................................................................................................ 210
Latihan …....…………………………………………….................................................................. 237
Ringkasan ....…………………………………………................................................................... 238
Tes 2 ....……………………………..……................................................................................. 240
Topik 1.
Diagnosis Pemeriksaan Laboratorium Virus ......................................................... 252
Latihan …....…………………………………………….................................................................. 277
Ringkasan ….…………………………………………................................................................... 277
Tes 1 ….……………………………..……................................................................................. 277
Topik 2.
Penjaminan Mutu ............................................................................................... 282
Latihan …....…………………………………………….................................................................. 296
Ringkasan ....…………………………………………................................................................... 297
Tes 2 ....……………………………..……................................................................................. 297
KUNCI JAWABAN TES FORMATIF ......................................................................... 303
GLOSARIUM …...................................................................................................... 304
DAFTAR PUSTAKA …............................................................................................. 305
Virologi v
Bab 1
DASAR-DASAR VIROLOGI
Drh.Ocky Dwi uprobowati,M.Kes.
Pendahuluan
membahas topik tentang Dasar-Dasar Virologi.Virologi berasal dari kata virus dan
S elamat berjumpa dengan kami tim Virologi. Pada pertemuan kali ini kita akan
logos (ilmu). Virologi adalah suatu ilmu yang mempelajari tentang virus dan penyakit-
penyakit yang disebabkannya. Virus adalah parasit atau makhluk hidup yang
kehidupannya bergantung pada makhluk hidup lain, berukuran mikroskopik (tidak dapat
dilihat oleh mata) yang menginfeksi sel organisme biologis. Status virus sering menjadi
kontroversi apakah ia termasuk makhluk hidup atau bukan. Virus memiliki ciri makhluk hidup
karena memiliki DNA dan dapat berkembang biak, sedangkan disebut benda mati karena tidak
memiliki sel dan dapat dikristalkan. Mungkin solusi terbaik untuk masalah ini adalah dengan
menyebut virus sebagai makhluk perantara yang tidak termasuk ke dalam kelompok makhluk
hidup juga tidak sepenuhnya dapat dikatakan sebagai benda mati. Virus bersifat obligat,
artinya virus hanya dapat hidup dalam sel inang dan tidak dapat bertahan di luar sel.
Dalam kehidupan sehari-hari virustidak lagi terdengar asing bagi kita. Bermacammacam
virus dapat menimbulkan berbagai penyakit pada tubuh manusia yang tidak diinginkan. Jika
tubuh kita dalam kondisi menurun (lemah) maka kita dapat dengan mudah terserang penyakit
atau virus. Oleh sebab itu kita perlu mempelajari virus tentang sifat-sifat virus, peranan virus
dalam kehidupan, susunan kimia, pengaruh fisika dan kimia, pembiakan virus, klasifkasi virus,
reproduksi virus, reaksi imun virus, vaksin virus, penyebaran dan infeksi virus, dan diagnosa
virus. Setelah mempelajari mata kuliah ini anda diharapkan mampu untuk :
1. Menjelaskan tentang pengantar virologi dan dasar-dasar virologi
2. Menjelaskan tentang Virus DNA dan RNA
3. Menjelaskan tentang reproduksi virus
4. Menjelaskan tentang reaksi imunologi dan vaksin virus
5. Menjelaskan tentang penyebaran dan infeksi virus
V adalah suatu jasad renik yang berukuran sangat kecil dan hanya dapat dilihat
dapat bereproduksi (hidup) didalam sel yang hidup dengan menginvasi dan
memanfaatkan sel tersebut karena virus tidak memiliki perlengkapan seluler untuk
bereproduksi sendiri. Virus merupakan parasit obligat intraseluler. Virus mengandung asam
nukleat DNA atau RNA sajatetapi tidak kombinasi keduanya, dan yang diselubungi oleh bahan
pelindung terdiri atas protein, lipid, glikoprotein, atau kombinasi ketiganya.
Istilah virus biasanya merujuk pada partikel-partikel yang menginfeksi sel-sel eukariota
(organisme multisel dan banyak jenis organisme sel tunggal) dan istilah bakteriofaga atau faga
dipakai untuk virus yang menyerang jenis-jenis sel prokariota (bakteri dan organisme lain yang
tidak berinti sel). Selama siklus replikasi dihasilkan banyak sekali salinan asam nukleat dan
protein selubung virus. Protein-protein selubung tadi dirakit untuk membentuk kapsid yang
membungkus dan menstabilkan asam nukleat virus terhadap lingkungan ekstra sel serta
memfalitasi perlekatan penetrasi virus saat berkontak dengan sel-sel baru yang rentan. Infeksi
virus dapat memiliki efek yang kecil atau bahkan tidak memiliki efek sama sekali pada sel
penjamu tetapi dapat pula menyebabkan kerusakan atau kematian sel.
Virus sering diperdebatkan statusnya sebagai mahluk hidup karena dia tidak dapat
menjalankan fungsi biologisnya secara bebas.Oleh karna karakteristiknya yang khas ini, virus
selalu teasosiasi dengan penyakit tertentu, baik pada manusia (mis : virus HIV, DHF ), pada
hewan (mis : virus flu burung), atau pada tanaman (mis : virus mozaik tembakau/TMV ).
Penelitian virus dimulai dengan penelitian mengenai penyakit mozaik yang menghambat
pertumbuhan tanaman tembakau dan menjadikan tanaman tersebut memiliki bercak-bercak.
Seorang ilmuwan Jerman pada tahun 1883, Adolf Meyer, menemukan bahwa penyakit
tersebut dapat menular ketika tanaman yang ditelitinya menjadi sakit setelah disemprot
dengan getah dari tanaman yang sakit. Dari hasil penelitiannya, Meyer menyimpulkan bahwa
penyakit tersebut disebabkan oleh bakteri yang lebih kecil dari biasanya dan tidak dapat dilihat
dengan mikroskop.
Dimitri Ivanowsky pada tahun 1892 yang berasal dari Rusia menemukan bahwa getah
daun tembakau yang sudah disaring dengan penyaring bakteri masih dapat menimbulkan
penyakit bakteri, lalu ia menyimpulkan bahwa bakteri tersebut berbentuk lebih kecil, sehingga
masih dapat melewati penyaring yang dipakainya, atau bakteri tersebut mengeluarkan toksin
yang masih dapat menembus saringannya. Pada tahun 1897 penelitian ini dilanjutkan oleh
peneliti Belanda yang bernama Martinus Beijerinck, ia menyatakan bahwa agens infeksi yang
ada dalam getah yang sudah disaring tersebut dapat bereproduksi karena kemampuannya
menimbulkan penyakit tidak berkurang meskipun telah ditransfer beberapa kali antar
tanaman. Akhirnya disimpulkan bahwa patogen mosaik tembakau bukan merupakan bakteri
tetapi merupakan sejenis cairan hidup pembawa penyakit.
Pada tahun 1935 Wendell Meredith Stanley dari Amerika Serikat berhasil mengkristalkan
partikel penyebab penyakit mozaik yang kini dikenal sebagai virus mozaik tembakau. Virus ini
juga merupakan virus yang pertama kali divisualisasikan denganmikroskopelektron pada
tahun 1939 oleh ilmuwan Jerman G.A. Kausche dan H.Ruska(Kuswiyanto, 2016).
Virologi 2
Virus merupakan agen infeksius terkecil (diameter sekitar 20 nm hingga300 nm) dan
hanya mengandung satu jenis asam nukleat (RNA atau DNA) sebagai genom mereka. Asam
nukleat tersebut terbungkus dalam suatu selubung protein yangdikelilingi sebuah membran
yang mengandung lipid dan keseluruhan unit infeksius tersebut dinamakan virion. Cara
berkembang virus berbeda dengan cara berkembang biak bakteri. Bakteri berkembang biak
dengan cara membelah diri dari satu sel menjadi dua sel (binary fission), sedangkan pada virus
perkembangbiakannya terjadi dengan cara perbanyakan diri dari partikel asam nukleat virus
sesudah virus menginfeksi suatu sel. Virus tidak mempunyai ribosom dan partikel
ribonukleoprotein yang mempunyai peran dalam proses sintesis protein. Selain itu virus pada
umumnya kebal atau resisten terhadap antibiotik, akan tetapi peka atau sensitif terhadap
interveron. Agar dapat hidup virus harus selalu berada didalam sel organisme hidup lainnya
(obligate intraseluler), sehingga virus tidak dapat dibiakkan di dalam medium buatan. Seperti
halnya riketsia dan klamidia, virus hanya dapat dibiakkan pada kultur jaringan atau kultur sel
(tissue culture atau sellular culture).
A. PENGERTIAN VIRUS
Virus adalah parasit intraseluler obligat yang berukuran antara 20-300 nm, bentuk dan
komposisi kimianya bervariasi, tetapi hanya mengandung RNA atau DNA saja. Partikelnya
secara utuh disebut virion yang terdiri dari capsid yang dapat terbungkus oleh sebuah
glikoprotein atau membran lipid, dan virus resisten terhadap antibiotik. Bentuk virus
berbeda-beda ada yang : bulat, batang polihidris, dan seperti huruf T.
Virologi
3
1. Kepala
Virus memiliki kepala berisi DNA atau RNA yang menjadi bahan genetik kehidupannya.
Isi kepala ini dilindungi oleh kapsid, yaitu selubung protein yang tersusun oleh protein.
Bentuk kapsid sangat bergantung pada jenis virusnya. Kapsid virus bisa berbentuk bulat,
polihedral, heliks, atau bentuk lain yang lebih kompleks. Kapsid tersusun atas banyak
kapsomer atau sub-unit protein.
2. Isi Tubuh
Isi tubuh virus atau biasa disebut virionadalah bahan genetik yang berupa salah satu tipe
asam nukleat (DNA atau RNA). Tipe asam nukleat yang dimiliki virus akan mempengaruhi
bentuk tubuh virus. Virus dengan isi tubuh berupa RNA biasanya berbentuk menyerupai
kubus, bulat, atau polihedral, contohnya pada virus-virus penyebab penyakit
polyomyelitis, virus influenza, dan virus radang mulut dan kuku.
3. Ekor
Ekor merupakan bagian dalam struktur tubuh virus yang berfungsi sebagai alat untuk
menempelkan diri pada sel inang. Ekor yang melekat di kepala ini umumnya terdiri atas
beberapa tabung tersumbat yang berisi benang dan serat halus. Adapun pada virus yang
hanya menginveksi sel eukariotik, bagian tubuh ini umumnya tidak dijumpai.
4. Kapsid
Kapsid adalah lapisan berupa rangkaian kapsomer pada tubuh virus yang berfungsi
sebagai pembungkus DNA atau RNA. Fungsi kapsid ini adalah sebagai pembentuk tubuh
dan pelindung bagi virus dari kondisi lingkungan luar.
Virologi 4
Gambar 1.2 Bentuk Virus
Sumber :http://www.ebiologi.net/2016/03/struktur-tubuh-macam-macam-
bentukvirus.html
1. Bentuk tubuh bulat dimiliki oleh virus-virus penyebab penyakit AIDS, ebola, dan
influenza.
2. Bentuk tubuh oval dimiliki oleh virus penyebab penyakit rabies.
3. Bentuk tubuh batang dimiliki oleh virus TMV (Tobaccao Mosaic Virus).
4. Bentuk tubuh polihidris dimiliki oleh virus Adenovirus penyebab demam.
5. Bentuk tubuh huruf T pada bacteriophage, virus menyerang bakteri E. coli.
Ciri-ciri Virus memiliki RNA atau DNA saja, dapat dikristalkan, memerlukan asam nukleat
untuk bereproduksi, tidak melakukan aktivitas metabolisme karena tidak memiliki
sitoplasma, bersifat aseluler (tidak mempunyai sel), berukuran lebih kecil dari bakteri,
bentuknya bervariasi, hanya dapat dilihat dengan mikroskop elektron.
Sampai saat ini virus diketahui merupakan organisme terkecil dan berdasarkan
tropismenya dapat dibagi dalam tiga golongan besar yaitu virus binatang (virus yang paling
banyak dipelajari), virus tanaman tinggi, dan virus bakteri dan jamur
Virologi
5
dibungkus dengan suatu selubung protein (kapsul). Berdasarkan atas hospes atau tuan
rumah tempat yang ditumpanginya virus dibedakan atas virus hewani (virus pada hewan
dan manusia), virus tanaman dan virus bakteri.
Asam nukleat genom virus dapat berupa DNA ataupun RNA, genom virus dapat terdiri
dari DNA untai ganda, DNA untai tunggal, RNA untai tunggal, RNA untai ganda. Selain itu
asam nukleat genom virus dapat berbentuk linear tunggal atau sirkuler. Jumlah gen virus
bervariasi dari empat untuk yang terkecil hingga beberapa ratus untuk yang terbesar.
Bahan genetik kebanyakan virus hewan dan manusia berupa DNA, dan pada virus
tumbuhan kebanyakan adalah RNA yang beruntai tunggal.
Bahan genetik virus diselubungi oleh suatu lapisan pelindung. Protein yng menjadi
lapisan pelindung disebut kapsid. Bergantung pada tipe virusnya, kapsid dapat berbentuk
bulat, heliks, polihedral, atau bentuk yang lebih kompleks, dan terdiri atas protein yang
disandikan oleh genom virus. Kapsid terbentuk dari banyak sub unit protein yang disebut
kapsomer.
Untuk virus berbentuk heliks, protein kapsid(biasanya disebut dengan protein
nukleokapsid) terikat langsung dengan genom virus. Misalnya pada virus campak, setiap
protein nukleokapsid terhubung dengan enam basa RNA membentuk heliks sepanjang
sekitar 1,3 mikrometer. Komposisi kompleks protein dan asam nukleat ini disebut
nukleokapsid. Pada virus campak, nukleokapsid ini diselubungi oleh lapisan lipid yang
didapatkan dari sel inang, dan glikoproten yang disandikan oleh virus melekat pada
selubung lipid tersebut. Bagian-bagian ini berfungsi dalam pengikatan dan pemasukan ke
sel inang pada awal infeksi.
Kapsid virus sferik menyelubungi genom virus secara keseluruhan dan tidak terlalu
berikatan dengan asam nukeat seperti virus heliks. Struktur ini bervariasi dari ukuran 20
Virologi 6
nanometer hingga 400 nanometer dan terdiri atas protein virus yang tersusun dalam
bentuk simetri ikosahedral. Jumlah protein yang dibutuhkan untuk membentuk kapsid
virus sferik ditentukan dengan koefisien T (yaitu sekitar 60 T protein). Sebagai contoh, virus
hepatitis B memiliki angka T = 4, membutuhkan 240 proteinuntuk membentuk kapsid.
Seperti virus berbentuk heliks, kapsid sebagian jenis virus sferikdapat diselubungi lapisan
lipid, tetapi biasanya protein kapsid sendiri langsung terlibat dalam menginfeksi
sel.
Seperti yang telah dijelaskan pada virus campak, beberapa jenis virus memiliki unsur
tambahan yang membantunya menginfeksi inang. Virus pada hewan memiliki selubung
virus, yaitu membran yang menyelubungi kapsid. Selubung ini mengandung fosfolipid dan
protein dari sel inang, tetapi juga mengandung protein dan glikoprotein yang berasal dari
virus. Selain protein selubung dan protein kapsid, virus juga membawa beberapa molekul
enzim didalam kapsidnya. Ada pula beberapa jenis bakteriofaga yang memiliki ekor protein
yang melekat pada “kepala” kapsid. Serabut-serabut ekor tersebut digunakan oleh faga
untuk menempel pada suatu bakteri.
Partikel lengkap virus disebut virion. Virion berfungsi sebagai alat tranportasi gen,
sedangkan komponen selubung dan kapsid bertanggung jawab dalam mekanisme
penginfeksian sel inang (Kuswiyanto, 2016).
1. Partikel Virus
Kemajuan dalam teknik difraksi sinar X dan mikroskop elektron memungkinkan untuk
melihat perbedaan-perbedaan kecil dalam morfologi dasar virus. Dalam hal ini
dibutuhkan zat warna logam berat sepertiKalium Fosfotungstat untuk mempertegas
struktur permukaan. Logam berat tersebut memasuki partikel virus bagaikan awan dan
menonjolkan struktur permukaan virus melalui pewarnaan negatif.
Dengan cara ini virus dapat dikelompokkan menjadi 3 (tiga) tipe berdasarkan penataan
sub satuan morfologinya Yaitu :
a. Yang mempunyai simetri helix, misalnya Paramixovirus dan Orthomyxovirus.
b. Yang mempunyai simetri kubus, misalnya Adenovirus.
c. Yang mempunyai struktur kompleks, misalnya Poxvirus.
2. Ukuran virus
Ukuran yang sangat kecil serta kemampuan untuk melewati saringan kuman adalah ciri
klasik untuk virus, karena beberapa kuman lebih kecil dari virus yang tersebar maka ciri
khas ini sudah tidak berlaku lagi.
Ada beberapa cara yang digunakan untuk menentukan ukuran virus yaitu : a.
Mengunakan Mikroskop Elektron
Pada mikroskop elektron digunakan elektron sebagai pengganti gelombang cahaya
dan lensa elektromagnetiksebagai pengganti lensa-lensa kaca. Berkas elektron yang
Virologi
7
diperoleh memiliki gelombang cahaya sehingga benda-benda yang lebih kecil dari
pada gelombang cahaya dapat dilihat. Virus dapat dilihat dalam sediaan dari ekstrak
jaringan dan dalam seksi-seksi sangat tipis sel-sel terinfeksi. Cara ini banyak
digunakan untuk menentukan ukuran partikel.
b. Ultrasedimentasi (Ultrasentrifugasi)
Bila partikel-partikel disuspensi dalam cairan, partikel tersebut akan mengendap
pada dasar dengan kecepatan sebanding dengan ukurannya. Dengan
ultrasentifugasi dapat digunakan daya 100.000 kali lebih besar dari gaya berat untuk
menyebabkan partikel-partikel mengendap di dasar tabung (sekitar 80.000100.000
putaran/menit). Hubungan antara ukuran dan bentuk partikel dengan kecepatan
mengendapnya memungkinkan penentuan ukuran partikel. Dalam hal ini struktur
fisik sangat mempengaruhi perkiraan ukuran yang diperoleh.
c. Ultrafiltrasi dengan membran kolodion yang diameter pori-porinya bermacam-
macam.
Membran kolodion ini dapat diperoleh dengan pori-pori dalam berbagai ukuran. Bila
bahan virus ini dilewatkan melalui sederet membran dengan ukuran pori yang
diketahui maka ukuran suatu virus dapat diperkirakan dengan menentukan
membran mana yang meloloskan virus dan selaput mana yang menahannya. Ukuran
diameter pori rata-rata yang menahan virus (APD = Average Pore Diameter) dikalikan
dengan 0,64 menghasilkan diameter partikel virus. Lolosnya virus melalui suatu
saringan tergantung pada struktur fisik virus tersebut, dengan demikian hasil yang
diperoleh merupakan perkiraan yang sangat mendekatiDepkes, 1996 )
Sifat-sifat Virus
Adapun sifat-sifat khusus virus menurut Lwoff, Home dan Tournier(1966) adalah :
1. Bahan genetik virus terdiri dari asam ribonukleat (RNA) atau asam
deoksiribonukleat (DNA), akan tetapi bukan gabungan dari kedua jenis asam nukleat
tersebut.
2. Struktur virus secara relatif sangat sederhana, yaitu dari pembungkus yang
mengelilingi atau melindungi asam nukleat.
3. Virus mengadakan reproduksi hanya dalam sel hidup yaitu dalam nukleus,
sitoplasma atau di dalam keduanya dan tidak mengadakan kegiatan metabolisme
jika berada di luar sel hidup.
4. Virus tidak membelah diri dengan cara pembelahan biner. Partikel virusbaru
dibentuk dengan suatu proses biosintesis majemuk yang dimulai dengan
pemecahan suatu partikelvirusinfektif menjadi lapisan protein pelindung dan
komponen asam nukleat infektif.
5. Asam nukleat partikel virus yang menginfeksi sel mengambil alih kekuasaan dan
pengawasan sistem enzim hospesnya, sehingga selaras dengan proses sintesis asam
nukleat dan protein virus.
Virologi 8
6. Virus yang menginfeksi sel mempergunakan ribosom sel hospes untuk keperluan
metabolismenya.
7. Komponen-komponen virus dibentuk secara terpisah dan baru digabung di dalam
sel hospes tidak lama setelah dibebaskan.
8. Selama proses pembebasan, beberapa partikel virus mendapat selubung luar yang
mengandung lipid, protein, dan bahan-bahan lain yang sebagian berasal dari sel
hospes.
9. Partikel virus lengkap disebut Virion dan terdiri dari inti asam nukleat yang dikelilingi
lapisan protein yang bersifat antigenik yang disebut kapsid dengan atau tanpa
selubung di luar kapsid.
Virologi
9
a. Secara spontan yaitu terjadi dengan sendirinya
b. Jika virus diolah dengan bahan kimia tertentu
c. Jika virus diradiasi, misalnya dengan sinar ultra violet.
6. Cara berkembang biak
Bakteri berkembang biak dengan cara belah pasang (binary fission) sedangkan virus
berkembang biak dengan cara berikut Virus masuk sel (infeksi), virus melekat pada sel
(viropeksis) kemudian menembus sel (pinositosis). Di dalam sel asam nukleat
dilepaskan, merangsang isi sel untuk membentuk asam nukleat dan protein yang
dimiliki oleh virus yang masuk, kemudian terjadi proses pemantangan
komponankomponen yang baru terbentuk. Mulai masuknya virus sampai
pematangan komponen-komponen baru disebut stadium eclypse. Bila sel itu mati,
maka virusnya pun mati (berbeda dengan bakteri yang tetap hidup sebagai saprofit)
(Depkes,
1996).
Tabel1.1.
Perbedaan Virus dan bakteri
Perbedaan Bakteri Virus
Ukuran Ukuran bakteri umumnya lebih Sementara virus ukurannya lebih
besar dari 1000 nm kecil, yaitu antara 20-400 nm
Dinding Sel Dinding sel bakteri mengandung Sementara virus tidak memiliki
peptidoglikan atau lipopolisakarida dinding sel. Fungsi dinding sel
digantikan dengan selubung
protein
Jumlah sel Satu sel (uniseluler) Bukan sel karena tidak memiliki
kelengkapan organel sel
DNA dan RNA Mengambang bebas di sitoplasma Tertutup di dalam selubung protein
Virologi 10
Durasi penyakit Umum akan berlangsung lebih Berlangsung 2 sampai 10 hari
lama dari 10 hari
Terdapat contoh gambar antara virus dan bakteri yang dapat anda pakai sebagai referensi
untuk mempelajari perbedaan mofologi virus dan bakteri:
Virologi
11
Latihan
Untuk dapat memperdalam pemahaman Anda mengenai materi di atas, kerjakanlah
Latihan berikut
Agar Anda dapat mengerjakan soal di atas dengan baik, cermati kembali Modul 1 Topik 1. Lalu
diskusikan jawaban Anda dengan teman-teman sejawat. Setelah itu, rumuskan jawaban yang
paling tepat.
Ringkasan
Virus adalah suatu jasad renik yang berukuran sangat kecil dan hanya dapat dilihat
dengan mikroskop elektron yang menginfeksi sel organisme biologis. Virus hanya dapat
bereproduksi (hidup) didalam sel yang hidup dengan menginvasi dan memanfaatkan sel
tersebut, karena virus tidak memiliki perlengkapan seluler untuk bereproduksi sendiri. Virus
merupakan parasit obligat intraseluler. Virus mengandung asam nukleat DNA atau RNA saja,
tetapi tidak kombinasi keduanya, yang diselubungi oleh bahan pelindung terdiri atas protein,
lipid, glikoprotein, atau kombinasi ketiganya. Struktur virus terdiri dari kepala, Isi tubuh, ekor,
kapsid
Ciri-ciri Virusmemiliki RNA atau DNA saja, dapat dikristalkan, memerlukan asam nukleat untuk
bereproduksi, tidak melakukan aktivitas metabolisme karena tidak memiliki sitoplasma,
bersifat aseluler (tidak mempunyai sel), berukuran lebih kecil dari bakteri, bentuknya
bervariasi, hanya dapat dilihat dengan mikroskop elektron. Perbedaan Virus dengan bakteri
terletak pada ukuran,Susunan kimiawi, tempat hidup, kandungan enzim, daya mutasi yang
mengubah sifat antigennya
Bakteri berkembang biak dengan cara belah pasang (binary fission) sedangkan virus
berkembang biak dengan cara berikut Virus masuk sel (infeksi), virus melekat pada sel
(viropeksis) kemudian menembus sel (pinositosis). Di dalam sel asam nukleat dilepaskan,
merangsang isi sel untuk membentuk asam nukleat dan protein yang dimiliki oleh virus yang
masuk, kemudian terjadi proses pemantangan komponan-komponen yang baru terbentuk.
Virologi 12
Mulai masuknya virus sampai pematangan komponen-komponen baru disebut stadium
eclypse. Bila sel itu mati, maka virusnya pun mati (berbeda dengan bakteri yang tetap hidup
sebagai saprofit)
Tes 1
Jawablahpertanyaan di bawah ini dengan benar!
2. Kapsid tersusun atas sub unit-sub unit protein yang disebut dengan
A. Selubung protein
B. Kapsul
C. Kapsomer
D. Nucleoprotein
E. Nukleokapsid
Virologi
13
E. Nukleokapsid
Virologi 14
E. Leher
10. Di bawah ini yang tidak termasuk contoh dari nukleokapsid yang telanjang yaitu
A. Wart virus
B. TMV
C. Virus kutil
D. Adenovirus
E. Virus influenza
14. Di bawah ini merupakan pernyataan yang benar mengenai susunan tubuh virus yaitu A.
Virus adalah organisme nonseluler dan mempunyai kristal yang mengandung plasmid
Virologi
15
B. Virus mempunyai selubung dari protein dan materi genetik berupa DNA/RNA
C. Kapsid virus tersusun dari lipoprotein dan materi genetik berupa RNA/DNA
D. Virus mempunyai selubung dari lemak dan materi genetik berupa DNA/RNA
E. Kapsid virus tersusun dari karbohidrat polisakarida dan materi genetik berupa plasmid
diagnosis. Virus mengandung DNA atau RNA, asam nukleat ini merupakan komponen utama
inti virus dan berikatan dengan protein inti. Genom dan protein inti dibungkus oleh sebuah
selubung protein yang terdiri dari kapsomer (sub unit kapsid). Selubung (amplop) merupakan
membran lipid lapis ganda yang mengelilingi nukleokapsid beberapa virus (virus berselubung),
selubung ini mengandung glikoprotein. Virion merupakan partikel virus lengkap yang infeksius
(Prasetyo A, 2005).
Virologi 16
A. PERANAN VIRUS DALAM KEHIDUPAN
Beberapa virus ada yang dapat dimanfaatkan dalam rekomendasi genetika. Melalui
terapi gen, gen jahat (penyebab infeksi) yang terdapat dalam virus diubah menjadi gen
baik (penyembuh). David Sanders, seorang profesor biologi pada Purdue’s School of
Science telah menemukan pemanfaatan virus dalam dunia kesehatan. Sanders berhasil
menjinakkan cangkang luar virus Ebola sehingga dapat dimanfaatkan sebagai pembawa
gen kepada sel yang sakit (paru). Meskipun demikian, kebanyakan virus bersifat
merugikan terhadap kehidupan manusia, hewan, dan tumbuhan.
Virus sangat dikenal sebagaipenyebab penyakit infeksi pada manusia dan tumbuhan.
Sejauh ini tidak ada mahluk hidup yang tahan terhadap virus. Tiap virus secara khusus
menyerang sel-sel tertentu pada inangnya. Virus yang menyebabkan selesma menyerang
saluran pernapasan, virus campak menginfeksi kulit, virus hepatitis menginfeksi hati, virus
rabies menyerang sel-sel syaraf. Begitu juga yang terjadi pada sel AIDS, yaitu suatu
penyakit yang mengakibatkan menurunnya daya tahan tubuh penderita. Penyakit
tersebut disebabkan oleh virus HIV yang secara khusus menyerang sel darah putih. Selain
manusia, virus juga menyebabkan kerugian bagi hewan dan tumbuhan. Tidak sedikit pula
kerugian yang diderita peternak atau petani akibat penyakit virus yang menyerang,
sehingga mempengaruhi hasil ternak dan hasil panen. (Kuswiyanto,2016)
Virologi
17
Virus yang non-persisten dapat segera ditularkan dengan gigitan(sengatan) serangga
(hewan).
Kapsid virus terdiri dari unit struktural yang disebut kapsomer, merupakan kumpulan
polipeptida khas virus.Mempunyai simetri yang disebut heliks, ikosahedron (bentuk
bersudut banyak dengan 20 sisi) atau gabungan. Dipergunakan sebagai salah satu kriteria
klasifikasi virus.
1. Protein Virus
Protein struktural virus memiliki beberapa fungsi penting yaitu : melindungi
genom virus, tempat reseptor-reseptor yang perlu bagi virus telanjang untuk mulai
menginfeksi, perangsang pembentukan antibodi dan tempat determinan antigen
yang penting untuk beberapa uji serologis. Manfaat utama protein tersebut adalah
untuk memfasilitasi transfer asam nukleat virus dari satu sel pejamu ke sel pejamu
Virologi 18
yang lain. Protein tersebut berfungsi untuk melindungi genom virus dari inaktifasi
oleh nuklease, berpartisipasi dalam perlekatan partikel virus ke sel yang rentan, dan
memberikan simetri struktural bagi partikel virus.
Protein menentukan karakteristik antigenik suatu virus. Respon imun pejamu
memiliki target berupa determinan antigenik protein atau glikoprotein yang
terekspos pada permukaan partikel virus. Beberapa partikel permukaan dapat pula
memiliki aktitas spesifik, misalnya hemaglutinin virus influenza mengaglutinasi sel
darah merah.
Beberapa virus memiliki enzim (yang merupakan protein) di dalam virion. Enzim-
enzim tersebut terdapat dalam jumlah yang sangat sedikit mungkin tidak penting
dalam struktur partikel virus, tetapi mereka penting untuk inisiasi siklus replikasi virus
saat virion memasuki sel penjamu. Contoh-contohnya meliputi polimerase RNA yang
dibawa oleh virus dengan genom RNA sense negatif (misalnya orthomyxovirus dan
rhabdovirus) yang diperlukan untuk menjalin mRNA pertama, dan reserve
transcriptase, suatu enzim dalam retrovirus yang membuat salinan DNA dari RNA
virus, suatu langkah penting dalam replikasi dan trasformasi. Contoh yang ekstrim
adalah poxvirus yang bagian intinya mengandung suatu sistem transkripsi, banyak
enzim yang berbeda terdapat dalam patikel poxvirus(Jawet, 2014).
Protein struktural virus mungkin merupakan molekul-molekul yang sangat
khusus dan dibuat untuk melaksanakan tugas khusus, misalnya:
1. Virus Vaccinia mengandung banyak enzim dalam partikelnya untuk melaksanakan
fungsi tertentu pada awal siklus infeksi.
2. Beberapa virus memiliki protein khusus untuk perlekatan pada sel-sel, misalnya
hemaglutinin virus influenza.
3. Virus tumor RNA mengandung suatu enzim reverse transcripetase yang membuat
suatu salinan DNA dari RNA virus yang merupakan suatu langkah penting dalam
transformasi virus-virus ini (Depkes,1996).
Virologi
19
infeksius dan molekulnya berfungsi sebagai mRNA didalam sel yang terinfeksi. RNA
dari virus RNA sense-negatif (rhapdovirus dan orthomyxovirus) bersifat tidak
infeksius.
Pada famili-famili virus tadi, virion memiliki polimerase RNA yang didalam sel
akan menstranskripsi molekul RNA, genom menjadi beberapa molekul RNA
komplementer, dan masing-masing dapat berperan sebagai mRNA. Sekuens dan
komposisi nukleotida tiap asam nukleat virus bersifat khas. Banyak genom virus yang
telah berhasil disekuens. Sekuens dapat memperlihatkan hubungan genetik antar
isolat termasuk hubungan yang tak terduga antara virus-virus yang sebelumya tidak
diperkirakan berkerabat erat. Jumlah gen dalam satu virus dapat diperkirakan dari
bingkai pembacaan terbuka yang diperoleh dari sekuens asam nukleat.
Asam nukleat virus dapat dikakterisasi berdasarkan kandungan G + C-nya.
Genom virus DNA dapat dianalisis dan dibandingkan dengan menggunakan
endonuklease retriks( enzim yang memutus DNA pada sekuens nukleotida spesifik).
Tiap genom akan menghasilkan pola fragmen DNA yang khas setelah dipecah oleh
enzim tersebut. Dengan menggunakan salinan DNA yang digandakan secara
molekulaer dari RNA, peta retriksi dapat pula diperoleh dari genom virus RNA.
Pemeriksaan PCR dan teknik hibridisasi molekular (DNA ke DNA , DNA ke RNA, atau
RNA ke RNA) memungkinkan dipelajarinya transkripsi genom virus dalam sel yang
terinfeksi serta perbandingan kekerabatan berbagai virus.
Jenis asam nukleat dapat ditentukan dengan beberapa metode baik dengan
menggunakan partikel virus yang utuh atau dengan asam nukleat bebas. Jenis asam
nukleat dan untaiannya dapat ditentukan di bawah mikroskop Fluoresensi dengan
pewarnaan Acridine Orange (AO). Asam nukleat di indentifikasi dengan reaksi warna
dan tes pencernaan enzim. Hasilnya dapat dilihat pada tabel 1 sebagai berikut:
Tabel 1.2
Identifikasi asam nukleat virus dengan jingga akridin (Acridine Orange = AO)
Sediaan Virus Kepekaan enzim
Perekat – Carmoy Reaksi warna
dengan 0,01 %
AO pada pH 4 D. Nasa R. Nasa
Uranil asetat adalah zat warna khusus untuk DNA, tidak memiliki afinitas
terhadap RNA dan dapat dilihat melalui mikroskop elektron. Untuk menentukan sifat-
sifat fisiko kimiawi perlu dipisahkan asam nukleat dari virion.
Setelah pemurnian, asam nukleat dapat ditentukan sifat-sifatnya misalnya
kandungan gula (ribosa atau dioksiribosa), untaian, ukuran dan susunannya dengan
Virologi 20
teknik yang meliputi pemberian nuklease, khromatografi kolom, mikroskopik
elektron dan sebagainya. Urutan dan komposisi nukleotida setiap asam nukleat virus
adalah khas. Salah satu sifat yang berguna untuk penentuan asam nukleat virus
adalah kandungan guanin dan sitosin .
Semua familia DNA virus memiliki genom yang merupakan molekul tunggal
DNA yang berbentuk linier atau melingkar. Lingkaran-lingkaran ini sering bergulung
berlebihan dalam virion. Kebanyakan urutan basa dalam genom adalah khas, tetapi
pengulangan urutan-urutan ditemukan pada familia DNA virus tertentu. Penelitian
terhadap molekul DNA dengan menggunakan endonuklease dengan tuan rumah
yang dibatasi dari sejenis kuman, enzim akan mengenal urutan basa tertentu
sehingga menghasilkan fragmen-fragmen yang lebih kecil sehingga mudah
dipisahkan dengan menggunakan elektroforesis gel agar rosa. Fragmen-fragmen ini
memungkinkan pemetaan gen yang lebih besar.
Virus RNA ditemukan dalam beberapa bentuk, dapat berupa molekul linier
tunggal, misalnya Picornavirus. Untuk virus lain, misalnya Orthomyxovirus, genom
terdiri dari beberapa segmen RNA yang mungkin berhubungan satu sama lain dalam
virion. Virus-virus RNA lainnya dapat menyebabkan infeksi dan seluruh molekul
berfungsi sebagai suatu messenger RNA dalam sel yang terinfeksi, sedangkan RNA
lainnya tidak dapat menyebabkan infeksi (Jawet, 2014).
3. Lipid Virus
Virus memiliki kadungan lipid yang berbeda sebagai bagian dari strukturnya.
Penelitian mikroskopik elektron dari virus Sindbis (virus yang memiliki pembungkus)
telah memperlihatkan suatu struktur usulan dari virion. Virus yang mengandung lipid
demikian bersifat peka terhadap eterdan pelarut organik lainnya ,gangguan atau
kehilangan lipid akan berakibat kehilangan infektivitasnya. Umumnya virus yang
tidak mengandung lipid bersifat resisten terhadap daya kerja eter.
Pada beberapa virus murni, komposisi asam lemak dan fosfolipid berlainan dari
komposisi selaput plasma sel-sel tuan rumah. Namun pada virus-virus yang lain dapat
memiliki komposisi yang sama. Untukkomposisi fosofolipid khusus dari pembungkus
virion ditentukan dengan cara penonjolan virus dalam masa
pematangan. Pada virus Herpes, virus menonjol melalui selaput inti sel tuan rumah
dan komposisi fosfolipid virion murni merupakan lipid selaput inti bagian dalam.
Virologi
21
Gambar 1.5 Struktur virus
Sumber : http://www.edubio.info/2015/01/penemuan-struktur-replikasi-dan-bentuk.html
Beberapa virus yang berbeda memiliki selubung lipid sebagai bagian struktur
mereka. Lipid diperoleh saat nukleokapsid virus “menonjol” keluar membran sel
selama terjadinya pematangan. Pertunasan tersebut hanya terjadi ditempat-tempat
yang membran sel pejamunya telah disisipi protein spesifik virus dan struktur
nukleokapsid.
Komposisi fosfolipid spesifik suatu selubung virion ditentukan oleh jenis spesifik
membran sel yang terlibat dalam proses pertunasan. Sebagai contoh, herpes virus
bertunas menembus membran inti sel pejamu, dan komposisi fosfolipid virus yang
telah dimurnikan setara dengan lipid pada membran inti.
Akuisisi membran yang mengandung lipid merupakan tahap integraldalam
morfogenesis virus pada beberapa kelompok virus.
Virus yang mengandung lipid sensitif terhadap pemberian eter dan pelarut organik
lainnyayang menandakan bahwa kerusakan atau lenyapnya lipid menyebabkan
hilangnya infektifitas virus. Virus yang tidak mengandung lipid umumnya resisten
terhadap eter lawanan dengan lipid dalam membran (Jawet, 2014).
4. Karbohidrat Virus
Pembungkus virus mengandung sejumlah karbohidrat yang berarti, biasanya
dalam glikoprotein. Gula-gula yang ditambahkan pada glikoprotein virus sering
menyerupai sel tuan rumah di mana virus tersebut tumbuh. Dengan demikian proses
ini mungkin ditentukan oleh sel tuan rumah.
Virologi 22
Glikoprotein merupakan antigen virus yang penting. Karena posisinya terdapat
pada permukaan luar dari virion maka glikoprotein sering merupakan protein yang
terlibat dalam interaksi virus dengan antibodi yang menetralkannya.
Berlawanan dengan lipid dalam membran virus yang berasal dari sel pejamu,
glikoprotein virus disandi oleh virus itu sendiri. Namun gula yang ditambahkan pada
glikoprotein sering kali mencerminkan sel pejamu tempat pertumbuhan virus.
Glikoperotein permukaan virus yang berselubung yang melekatkan partikel
virus ke sel target melalui interaksi dengan reseptor sel. Mereka juga sering kali
terlibat dalam langkah fusi membran pada infeksi. Glikoprotein juga merupakan
antigen virus yang penting. Akibat posisinya yang berada dipermukaan luar virion,
glikoprotein sering kali terlibat dalam interaksi partikel virus dengan antibodi
penetral( Depkes, 1996)
Virologi
23
cara menanam virus dalam biakan jaringan ginjal kera. Kera ini mungkin saja
mengandung virus SV 40 tanpa menunjukkan gejala sakit, sedangkan menurut
penelitian virus SV 40 ini bisa menyebabkan sarkoma pada hamster. Dan sudah
dibuktikan pula bahwa virus SV 40 berhasil ditemukan kembali dari tinja orang yang
sudah divaksinasi. Untuk mencegahnya maka virus Polio yang sudah dipanen dari
biakan jaringan ginjal kera tadi diberi MgCl2 1 mol, panaskan 60oC 1 jam, virus Polio
tidak diinaktivasi tetapi virus SV 40 mati.
4. Radiasi
Pada umumnya sinar X (sinar Rontgen), Ultraviolet (UV) dan partikel berenergi
tinggi dapat menghilangkan aktivitas virus atau membunuh virus. Dosisnya bervariasi
untuk setiap jenis virus. Infektivitas merupakan sifat yang paling radiosensitif karena
replikasi memerlukan ekspresi seluruh komponen genetik virus. Partikel teradiasi
yang tidak mampu bereplikasi mungkin masih dapat menekspresikan beberapa fungsi
spesifik dalam sel pejamu.
5. Pengecatan Vital
Virus dapat ditembus sampai tingkat tertentu oleh zat warna vital, seperti
toluidin blue, netral red, proflavin atau acridin orange. Zat warna ini akan diserap dan
mengikat asam nukleat virus sehingga virus akan menjadi peka terhadap cahaya biasa
dan virus akan diinaktivasi. Cara inaktivitasi seperti ini disebut inaktivasi fotodinamik.
Virologi 24
b. Golongan yang tahan(resisten) terhadap eter yaitu : Golongan Picornavirus,
Papovavirus, Poxvirus, Adenovirus, Parvovirus.
Virologi
25
E. METODE-METODE LAZIMPENONAKTIFAN VIRUS UNTUK
BERBAGAI TUJUAN
Virus dapat dinonaktifkan dalam berbagai alasan, misalnya : untuk mensterilkan
peralatan dan perlengkapan laboratorium, untuk mendesinfeksi permukaan atau kulit,
untuk mengamankan air minum, dan untuk membuat vaksin virus jenis nonaktif. Berbagai
metode dan zat kimia digunakan untuk tujuan-tujuan tersebut.
Sterilisasi dapat dicapai dengan menggunakan uap dalam tekanan tertentu,
pemanasan kering, etilen oksida, dan radiasi gamma. Desinfektan permukaan meliputi
natrium hipoklorit, glutaraldehida, formaldehida dan asam perasetat.Desinfektan kulit
mencakup klorheksidin,etanol 70%, dan yodofor. Pembuatan vaksin dengan menyertakan
penggunaan formal dehida, propiolakton-beta, sporalenditambah denganradiasi
ultraviolet, atau deterjen (vaksin subunit) untuk menonaktifkan virus vaksin (Jawet,
2014).
F. PEMBIAKAN VIRUS
Virus adalah mikroorganisme yang hidup secara obligat intra seluler, oleh karena itu
cara pembiakannya lebih sulit daripada pembiakan bakteri.Ada tiga cara yang umum
digunakanuntuk membiakkan virus yang dengan inokulasi pada hewan percobaan,
inokulasi pada telur berembrio, Inokulasi pada biakan jaringan
1. Inokulasi Pada Hewan Percobaan
Pada mulanya binatang percobaan merupakan satu-satunya cara untuk
membiakkan virus. Tetapi karena sangat banyaknya perbedaan kepekaan hewan
percobaan terhadap infeksi virus yang dapat menimbulkan reaksi yang berbedabeda
baik pada hewan yang sama spesiesnya apalagi yang berbeda spesies, maka untuk
pembiakan virus kini lebih banyak digunakan metode pembiakan dengan cara invitro
dengan mengunakan kultur sel. Meskipun demikian hewan percobaan masih
digunakan untuk mempelajari sifat-sifat onkogenik virus, patogenesis penyakit virus,
reaksi imun terhadap virus, pengaruh lingkungan terhadap infeksi dan isolasi primer
terhadap beberapa jenis virus misalnya virus coxsackie A.
Metode yang digunakan untuk mengadakan inokulasi virus tergantung pada
jenis virus yang akan dicoba dan lokasi anatomi dari sel yang dituju dalam percobaan.
Contoh, virus berselubung segera menjadi tidak aktif jika berada pada pH asam
sehingga tidak mungkin dibiakkan dengan cara inokulasi melalui alat pencernaan.
Cara yang sering digunakan untuk melakukan inokulasi adalah melalui intravena,
intraserebral, intraperintonial, intranasal, intratrakeal, intradermal dan melalui
subkutan. Dengan demikian jenis hewan percobaan, umurnya, jenis kelamin serta
cara penyuntikan untuk inokulasi pada hewan percobaan sangat tergantung dari jenis
virus yang akan ditanam atau diisolasi.
Contoh :
- Virus Herpes simplex :
Pada Kelinci, dengan bahan digoreskan/skarifikasi pada kornea, setelah beberapa
hari kornea keruh karena ada vesikel-vesikel berisi virusnya.
Virologi 26
- Virus Rabies :
Pada Tikus putih (albino) bayi atau dewasa, disuntikan intraserebral, setelah
1minggu akan terlihat gejala ensefalitis (rabies) dan tikus akan mati.
- Dengue :
Pada Tikus putih berumur 1-3 hari, dsuntikan intraserebral dan subkutan, 3-7 hari
kemudian terlihat tremor kemudian paralisis dan mati.
- Penyebab Q-fever :
Pada Cavia jantan, disuntikan intraperitonial, setelah 7-10 hari tampak orkhitis,
dalam cairan skrotum dapat ditemukan penyebab Q-fever.
- Polio
Dari tinja, liqour, apus tenggorokan penderita disuntikkan pada kera secara
intrakutan/intramuskular/intraneural/intraspinal, kemudian akan tampak
paralisis.
Virologi
27
- Intra embrional :
Untuk Japanese B Encephalitis, dipakai telur berembrio umur 8-10 haridan
dieramkan pada suhu 37oC.
Virologi 28
Contoh :
Virus influenza sesudah dipasase 5 kali berturut-turut secara intra amnion, avirulen
bagi manusia tapi virulen bagi tikus, kemudian diteruskan 5 kali berturut-turut secara
intra alantois, ternyata tidak virulen lagi bagi manusia, tetapi tetap virulen bagi tikus.
Virologi
29
Gambar 1.8 Perkembangan Telur Berembrio
Sumber: http://www.alattetas.com/alat-teropong-telur/
Virologi 30
terbentuk dari kultur primer dari jaringan maligna secara langsung atau tumbuh dari
kultur primer yang diinfeksi dengan virus onkogenik.
Di dalam penggunaannya biakan jaringan yang berasal dari manusia maupun
hewan dibagi menjadi dua yaitu biakan jaringan primer (Primary tissue culture =
primary cell line), stable cell line
Virologi
31
2. Adanya perubahan metabolisme sel biakan jaringan dan kegagalan pembentukan
asam dari biakan jaringan.
3. Adanya pembentukan antigen dalam biakan jaringan tergantung dari jenis virusnya,
bisa antigen netralisasi, antigen ikatan komplemen dan antigen hemaglutinin.
4. Terjadinya hemabsorpsi yaitu pengikatan eritrosit hewan tertentu dalam konsentrasi
tertentu oleh sel biakan jaringan yang ditandai dengan tersusunnya eritrosit , seperti
kalung mutiara disekitar sel yang mengandung virus tersebut. Tanda ini bisa terjadi
sebelum terjadinya CPE atau tanpa CPE sama sekali.
Contoh :
Biakan jaringan kera Macaca di tanam dengan virus JBE, sesudah dieramkan tidak
timbul CPE. Apabila medium dibuang kemudian ditambahkan eritrosit angsa 0,5% dan
dieramkan 37oC selama 1-5 jam, ternyata dibawah mikroskop tampak eritrosit angsa
tersusun disekeliling sel yang mengandung virusnya. Hal ini membuktikan bahwa virus
JBE tumbuh dan hidup di dalam sel ginjal kera Macaca walaupun tidak ada CPE.
5. Adanya interferensi, bila suatu biakan jaringan Hela cell yang ditanami virus Coxackie
A tipe 7, sesudah dieramkan 37oC 1 minggu, ternyata tidak ada CPE, tetapi apabila
biakan jaringan tersebut ditanami suatu virus (misalnya Virus Polio 1) yang diketahui
dapat menyebabkan CPE, ternyata pada biakan jaringan tidak terjadi CPE. Hal ini
berarti ada interferensi, jadi virus Coxsackie tumbuh sehingga sel biakan jaringan Hela
cell membentuk interferon yang menghalangi pertumbuhan Virus Polio.
6. Adanya perubahan morfologis karena virus onkogenik (virus yang mempunyai daya
membentuk tumor) akan tampak perubahan morfologis dan susunan sel biakan
jaringan berupa beberapa mikrotumor. Sel-sel biakan jaringan bertumpuk-tumpuk
tidak merupakan suatu monolayer lagi dan tampak adanya sel-sel datia dengan banyak
inti di dalamnya.Contohnya adalah Adenovirus, virus SV 40
1. Suhu
Biakan Jaringan bisa hidup terus pada suhu 40-41oC, tetapi bila biakan jaringan sudah
ditanami virus maka virus hanya bisa hidup pada suhu 36-37oC. Apabila suhu kurang dari
36oC maka pertumbuhannya akan sangat lambat atau tidak tumbuh sama sekali.
2. PH
Virus paling baik tumbuh pada pH 7-7,5, bila kurang dari 7 biasanya virus akan mati.
Untuk menghindarkan timbulnya keasaman pada waktu pertumbuhan virus, maka
mediumnya jangan diberi glukosa danditambahkan Na2CO3 (Natrium bikarbonat).
Virologi 32
yang pertumbuhannya subur dalam keadaan memutar dengan alat tertentu (dalam
keadaan rotasi dengan alat roller drum).
Contohnya adalah virus Polio tumbuh lebih baik pada keadaan rotasi daripada keadaan
stasioner.
4. Jenis Virus, jenis biakan jaringan, jenis dan konsentrasi sumber protein serta komposisi
medium.
Contoh :
- Virus Polio akan tumbuh subur dengan cpe yang cepat bila ditanam pada biakan
jaringan ginjal kera Macaca yang ditambah Earle’smedium dengan sumber protein
serum kuda 10%, cpe tampak setelah pengeraman 37oC 3-4 hari.
- Virus Dengue, dipakai biakan jaringan LLCMK2 ditambah Earle’s medium dan serum
anak sapi 5-10%, akan memperlihatkan cpe yang sangat jelas. (Kuswiyanto, 214 )
Latihan
Untuk dapat memperdalam pemahaman Anda mengenai materi di atas, kerjakanlah
Latihan berikut!
Agar Anda dapat mengerjakan soal di atas dengan baik, cermati kembali Modul 1 Topik 1. Lalu
diskusikan jawaban Anda dengan teman-teman sejawat. Setelah itu, rumuskan jawaban yang
paling tepat.
Ringkasan
Peran virus dalam kehidupan sangat penting , karena Virus dikenal sebagai penyebab
penyakit infeksi pada manusia dan tumbuhan. Sejauh ini tidak ada mahluk hidup yang tahan
terhadap virus. Tiap virus secara khusus menyerang sel-sel tertentu pada inangnya.Virus dapat
menyababkan beberapa penyakit pada manusia, hewan maupun tumbuhan diantaranya pada
manusia influenza, AIDS ; pada hewan dapat menyebabkan Rabies, New Castle Disease, pada
tumbuhan dapat menyebabkan TMV, Tungro (sejenis penyakit yng menyerang padi)
Susunan kimia virus terdiri dari Protein virus, Asam nukleat virus, Lipid virus,
Karbohidrat virus.Berepapa unsur-unsur kimia dan fisika yang dapat mempengaruhi virus
Virologi
33
diantaranya adalah suhu, Stabilisasi Virus Dengan Garam-Garam , Derajat keasaman (pH),
radiasi,pengecatan vital, kepekaan terhadap eter, Pengaruh Obat-Obat Khemoterapeutika
(Obat-Obat Sulfa dan Antibiotika) dan Kemoprofilaksia.
Virus adalah mikroorganisme yang hidup secara obligat intra seluler, oleh karena itu
cara pembiakannya lebih sulit daripada pembiakan bakteri. Ada tiga cara yang
umumdigunakan untuk membiakkan virus yaitu: inokulasi pada hewan percobaan, inokulasi
pada telur berembrio, inokulasi pada biakan jaringan
Tes 2
Pilihlah jawaban yang paling tepat di bawah ini
3. Di bawah ini yang merupakn pernyataan yang benar tentang virus yaitu …..
A. Klasifikasi virus yaitu dibawah tingkat seluler organisasi biologi
B. Partikel virus memiliki DNA dan RNA
C. Partikel virus bisa dilihat dengan menggunakan mikroskop cahaya
D. Perakitan kapsid virus dari protein memerlukan sel inang
Virologi 34
E. Pertumbuhan partikel virus setelah perakitan kapsid, berlanjut sampai pada pelepasan
partikel-partikel virus baru
6. Beberapa jenis virus dapat dibiakkan pada telur berembrio dengan usia tertentu untuk
jenis virus yang akan diinokulasikan,berbagai jenis telur dapat digunakan untuk
membiakkan virus, antara lain telur bebek dan telur ayam , pada virus Herpes simplex usia
telur berembrio yang digunakan :
A. 8-10 hari B. 8-13 hari C. 9-12 hari D. 9-10 hari
E. 9-14 hari
D. 2-3 x 24 jam
E. 5-7 x 24 jam
8. Pada inokulasi telur ayam berembrio yang dilakukan secara intra amnion/intra alantois
akan membentuk:
Virologi
35
A. Antigen hemaglutinin dan ikantan komplemen
B. Membentuk antigen ikatan komplemen
C. Vesikular berisi virus
D. Terjadi paralisis
E. Terjadi kemetian
9. Terdapat beberapa pengaruh fisika dan kimia pada daya infektivitas virus, untuk virus
yang diliofilisasi agar dapat bertahan hingga bertahun-tahun virus dapat disimpan pada
suhu:
A. 5-10 derajat Celsius
B. -90 derajat Celsius C. 4-8 derajat Celsius D. -80 derajat Celsius
E. -70 derajat Celsius
10. Ilmuwan yang pertama kali mengadakan eksperimen tentang virus adalah …. A. Einstein
B. Iwanovski
C. Wendell
D. M. Beijerinck
E. Louis P.
12. Pada bagian tubuh virus yang mengandung RNA atau DNA adalah
A. serat ekor
B. kepala
C. ekornya
D. kapsid
E. Kapsidekor
13. Pertumbuhan virus didalam jaringan dipengaruhi oleh beberapa faktor, kecuali
A. Suhu
B. pH
C. Keadaan biakan jaringan
D. Jenis virus
E. Sumber eritrosit
Virologi 36
14. Semula sel-selnya terbentuk kumparan dan tersusun teratur kemudian berubah selselnya
menjadi bundar-bundar, berkelompok, sebagian terlepas dari dinding botol, inti
membesar, struktur inti menjadi kasar dan tampak lebih gelap (piknotis), hal ini terjadi
pada keadaan
A. Adanya CPE
B. Adanya perubahan metabolisme sel
C. Adanya pembentukan antigen
D. Terjadinya haemaglutinasi
E. Adanya perubahan morfologi sel
15. Pocks adalah bintik-bintik putih berbentuk bundar dan menonjol pada permukaan CAM,
tampak bundar, diameter kira-kira 1mm, berwarna putih keruh, menonjol pada
permukaan CAM, ini merupakan sifat pocks dari virus:
A. Rabies
B. Variola
C. Vaccinia
D. Herpes simplex
E. Cowpox
Virologi
37
3. E 8. C 13. B
4. C 9. D 14. B
5. B 10. E 15.C
Test Formatif 2
1.A 6. E 11. C
2. D 7. D 12. B
3. B 8. A 13. E
4. D 9. E 14. A
5. C 10. B 15. B
Glosarium
Amplop : merupakan membran yang tersusun oleh fosfolipid dan
glikoprotein dalam bentuk peplomers yang melindungi atau
membungkus unit struktural kapsid beserta isinya.
Virologi 38
Antigen : adalah berbagai macam bahan yang dapat memicu tubuh
memproduksi zat anti terhadapnya. Zat anti ini disebut sebagai
antibodi.
Enzim nuklease retriksi : enzim dari mikroba yang dapat memotong DNA utas ganda,
enzim tersebut sekarang dikenal dengan nama enzim retriksi
atau endonuklease retriksi
Limfogranuloma venerium: adalah suatu penyakit menular seksual yang disebabkan oleh
Chlamydia trachomatis. Penyakit ini terutama ditemukan di
daerah tropis dan subtropis.
Virologi
39
Nukleokapsid : merupakan unit struktural berupa protein yang membungkus genom virus
bedanya dengan kapsid adalah kalau kapsid terletak di luar
namun jika nukleokapsid itu terletak di dalam atau
menyelubungi genom virus secara langsung.
Psitakosis : infeksi yang disebabkan oleh Chlamydia psittaci, jenis bakteri yang ditemukan
dalam kotoran burung yang menyebar ke manusia. Infeksi pada
burung seringkali tidak menunjukkan gejala. Pada manusia,
gejala infeksi psittacosis termasuk batuk disertai dahak yang
berdarah, batuk kering, kelelahan, demam dan menggigil, sakit
kepala, nyeri sendi, nyeri otot, dan sesak napas.
Pejamu : semua faktor yang terdapat pada diri manusia yang dapat mempengaruhi timbulnya
serta perjalanan penyakit. Faktorfaktor tersebut banyak
macamnya, antara lain : umur, seks, ras, genetik.pekerjaan,
nutrisi, status kekebalan, adat istiadat, gaya hidup dan psikis.
Resistensi : daya tahan alami tubuh terhadap pengaruh buruk seperti racun dan kuman.
Radiosensitif : perubahan sel endotel sesaat setelah pemaparan merupakan tanda paling awal
toksisitas radiasi terhadap jaringan.
Sub unit : sebuah rantai polipeptida virus yang berkumpul menjadi satu
Teknik hibridisasi : dilakukan pada DNA virus yang terdapat pada sampel dengan
RNA spesifik yang berfungsi sebagai pelacak sehingga
keberadaan virus dapat dideteksi.
Virologi 40
Terglikasi = glikohemoglobin = hemoglobin glikosilasi : proses pengikatan antara glukosa dan
hemoglobin
Daftar Pustaka
Dekes RI. 1996.Virologi umum. Jakarta : PPSDM Departemen Kesehatan
Jawet, Melnick, and Adelberg. 2014. Mikrobiologi Kedokteran Edisi 25. Jakarta : Buku
Kedokteran EGC
Virologi
41
Kuswiyanto. 2016. Buku Ajar Virologi Untuk Analis Kesehatan. Jakarta : Buku kedokteran EGC
Kate Rittenhouse, Olson and Ernesto De Nardin. 2017. Immunologi dan Serologi Klinis Modern.
Jakarta : Buku Kedokteran EGC
Tom Elliott,dkk, (2013). Mikrobiologi kedokteran dan Infeksi Edisi 4. Jakarta : Penerbit Buku
kedokteran EGC
Pendahuluan
Virologi 42
D alam modul ini kita akan membahas topik tentang klasifikasi virus, yang
mana kita telah mempelajari dasar-dasar virologi pada modul 1. Berbagai jenis virus
dikelompokkan dan diklasifikasi berdasarkan sifat-sifat dan ciri khas virus. Misalnya morfologi,
sifat-sifat fisika dan biokimia virus, jenis hospes atau tuan rumah / inang tempat menumpang
hidup, tempat hidup (habitat) virus di dalam organ tubuh hospes, berdasar atas jaringan tubuh
yang diinfeksi oleh virus atau berdasar pada jenis kerusakan yang ditimbulkan oleh virus. Kali
ini kita bertemu kembali dalam pembahasan tentang klasifikasi virus untuk virus DNA dan virus
RNA. Oleh sebab itu kita perlu mempelajari tentang klasifikasi virus, virus DNA, tingkat
klasifikasi virus, dasar klasifikasi secara taksonomi, struktur virus, virus RNA, tingkat klasifikasi
virus, dasar klasifikasi secara taksonomi, dan struktur virus. Setelah mempelajari mata kuliah
ini anda diharapkan mampu
untuk :
1. Menjelaskan tentang klasifikasi virus
2. Menjelaskan tentang virus DNA dan RNA
3. Menjelaskan tentang tingkat klasifikasi virus DNA dan RNA
4. Menjelaskan tentang dasar klasifikasi secara taksonomi
5. Menjelaskan tentang struktur virus
Pada modul 2 ini kita akan mempelajari tentang klasifikasi virus yang akan kita sajikan dalam
2 topik, yaitu virus DNA (tingkat klasifikasi virus, dasar klasifikasi secara taksonomi, dan
struktur virus) dan virus RNA (tingkat klasifikasi virus, dasar klasifikasi secara taksonomi,
struktur virus).
Kita masih ingat bahwa pada topik yang lalu sebagai patokan dasar penting yang
digunakan untuk melakukan klasifikasi virus adalah ciri morfologi dan sifat-sifat biokimiawi.
Sedangkan ciri-ciri khusus, yaitu jenis asam nukleatnya, RNA atau DNA, ukuran dan bentuk
virus, berat molekul asam nukleat, susunan simetri nukleokapsid, ada tidaknya selubung
(amplop) pembungkus nukleo kapsid, jumlah kapsomer kapsid, ukuran virion, adanya enzim
spesifik, lokasi tempat terbentuknya virus dalam sel, daya tahan virus terhadap bahan kimia,
misalnya eter, pengaruh perubahan fisika terhadap virus, sifat imunologik, cara penularan
secara alami, hospes atau inang, jaringan, dan sel yang sering diserang virus, sifat patologik
virusterhadap sel atau jaringan hospes, gejala klinis yang ditimbulkan virus terhadap hospes.
(Soedarto,2010).
Jumlah informasi yang tersedia untuk masing-masing kategori tidak sama untuk semua
virus. Cara mengkarakterisasi virus senantiasa berubah dengan cepat. Penentuan sekuens
genom saat ini sering dilakukan secara dini untuk mengidentifikasi virus (Jawet, 2014). Untuk
saat ini, klasifikasi virus yang penting hanya dari tingkat famili ke bawah. Semua famili virus
memiliki akhiran viridae, misal : Poxviridae, Herpesviridae, Parvoviridae, dan Retroviridae.
Virologi
43
Anggota-anggota famili Picornaviridae umumnya ditularkan melalui jalur fekal/oral dan
melalui udara. Genus memiliki nama dengan akhiran virus. Misalnya : famili Picornaviridae
terdiri dari 5 genus.
Definisi “spesies” merupakan hal yang paling penting, tetapi sulit dilakukan untuk virus.
Penentuan spesies virus mengandung unsur subyektif. Misalnya genus Lentivirus terdiri dari
banyak spesies yang berbeda (Kuswiyanto,2016).
V irus DNA adalah virus yang memiliki DNA sebagai materi genetic dan bergantung
Virologi 44
pada DNA untuk mereplika diri, menggunakan DNA polymerase sebagai DNA-
dependent. Asamnukleat yang dimiliki biasanya DNA beruntai ganda (dsDNA
atau double stranted-DNA) tetapi bisa juga DNA beruntai tunggal (ssDNA atau single stranted-
DNA).
Virus DNA memiliki Kelompok I atau Kelompok II dari system klasifikasi Baltimore untuk
virus. Virus DNA beruntai tunggal bias anya berkembang menjadi rantai ganda saat terdampar
di sel yang terinfeksi. Meskipun virus Grup VII seperti hepatitis B mengandung genom DNA,
mereka tidak dianggap virus DNA sesuai dengan klasifikasi Baltimore, melainkan sebaliknya
virus mereplika diri karena mereka meniru melalui perantara RNA.
Kelompok I : virus dsDNA (virus DNA beruntai ganda)
1. Ordo Caudovirales
Famili Myoviridae (termasuk fag T4 Enterobacteria),Famili Podoviridae, Famili
Siphoviridae(termasuk fag λ Enterobacteria)
2. Ordo Herpesvirales
Famili Alloherpesviridae, Famili Herpesviridae (termasuk virus herpes manusia), virus
Varicella Zoster, Famili Malacoherpesviridae
3. Famili yang belum ditandai
Famili Ascoviridae, Famili Adenoviridae (termasuk virus yang menyebabkan infeksi
adenovirus manusia), Famili Asfarviridae (termasuk virus demam babi Afrika),Famili
Baculoviridae, Famili Coccolithoviridae, Famili Corticoviridae, Famili Fuselloviridae, Famili
Guttaviridae, Famili Iridoviridae, Famili Lipothrixviridae, Famili Mimiviridae, Famili
Nimaviridae, Famili Papillomaviridae, Famili Phycodnaviridae, Famili Plasmaviridae, Famili
Polyomaviridae (termasuk Simian virus 40, virus JC), Famili Poxviridae (termasuk cacar
sapi virus, cacar),Famili Rudiviridae, Famili Tectiviridae
4. Genera yang belum bertanda
Ampullavirus, Nudivirus, Salterprovirus, Sputnik virophage, Rhizidiovirus
Virologi
45
a. Subfamili : Chordopoxvirinae(virus cacar vertebrata) Genus :
• Orthopoxvirus (subkelompok virusvaccinia) :Virus cacar yang menyerang
padasapi, unta, mencit, kelinci, dan kera.
• Parapoxvirus (subkelompok virus orf) : Virus dermatitis, cacar semu, dan
stomatitis papula sapi.
• Avipoxvirus (subkelompok virus cacar unggas): Virus cacar yang khusus pada
unggas.
• Capripoxvirus (subkelompok virus cacar domba) : Virus penyebab cacar pada
domba, kambing, dan penyakit kulit bebenjol pada sapi.
• Leporipoxvirus (subkelompok virus myxoma) : Virus myxoma dan fibroma pada
kelinci.
• Suipoxvirus (subkelompok virus cacar babi).
• Moluscipoxvirus (subkelompok virus molusca).
• Yabapoxvirus (subkelompok virus cacar yaba/ tana dan monyet).
b. Subfamili : Entomopoxvirinae (virus cacar serangga).
2. Famili : Iridoviridae(Icosahedral Cytoplasmic Deoxyvirus)
Genus :
• Ranavirus (virus kodok)
• Lymphocystivirus (virus limfosistis ikan)
• Virus African Swine Fever (belum jelas masuk famili mana)
3. Famili : Herpesviridae (Herpesviruses)
a. Subfamili : Alphaherpevirinae (virus serupa-herpes simplex) Genus
:
• Simplexvirus(virus serupa-herpes simplex)
• Varicellovirus (virus serupa-varicella)
b. Subfamili : Bethaherpesvirinae (cytomegaloviruses) Genus :
• Cytomegalovirus (cytomegalovirus manusia)
• Roseolovirus (virus herpes manusia)
c. Subfamili : Gammaherpevirinae (virus lymphoproliferative) Genus
:
• Lymphocryptovirus (virus Epstein-barr)
• Rhadinovirus (herpesvirus ateline)
4. Famili : Hepadnaviridae (Hepatitis B-like viruses) Genus :
• Orthohepadnavirus (virus serupa-hepatitis B mamalia)
• Avihepadnavirus (virus serupa-hepatitis B unggas)
5. Famili : Parvoviridae (Parvoviruses)
Genus :
• Parvovirus (parvovirus dari mamalia dan unggas)
• Dependovirus (virus terkait adeno)
6. Famili : Circoviridae (Ciroviruses)
Virologi 46
B. DASAR KLASIFIKASI SECARA TAKSONOMI
Sifat-sifat berikut yang disusun berdasarkan kepentingan telah digunakan sebagai dasar
untuk klasifikasi virus menurut (Soedarto, 2010) yaitu :
1. Jenis asam nukleat DNA, beruntai tunggal atau berutai ganda.
2. Ukuran dan morfologi, termasuk jenis simetri, jumlah kapsomer dan ada atau
tidaknya selaput.
3. Kerentanan terhadap pengaruh fisik dan kimia, terutama eter.
4. Adanya enzim khusus, terutama polimerase DNA yang berhubungan dengan
replikasi genom dan neuraminidase yang diperlukan untuk pelepasan
patikelpartikel virus tertentu (influenza) dari sel tempat virus dibentuk.
5. Sifat-sifat imunologik.
6. Metode penularan alami.
7. Inang, jaringan dan tropisme sel.
8. Sifat patologik virus terhadap sel atau jaringan hospes
9. Gejala klinik yang ditimbulkan virus terhadap hospes
1. Parvoviridae
Parvovirus, anggota famili ini adalah virus yang berukuran sangat kecil dengan virion
yang berdiameter antara 18 nm dan 25 nm, mengandung single stranded DNA yang
memiliki kapsid ikosahedral simetri kubikal dengan 32 kapsomer dan tidak memiliki
selubung. Di dalam famili Parvoviridae terdapat dua subgrup, yaitu subgrup A dan sub
grup B. Infeksi pada manusia yang disebabkan Parvovirus B-19 menimbulkan erythema
infectiosum yang menghambat produksi eritrosit di dalam sumsum tulang (Soedarto,
2010).
Virologi
47
Contoh Penyakit Krisis Aplastik Transien
Parvovirus B19 adalah penyebab krisis aplastik transien yang dapat memperburuk
anemia hemolitik kronis, misalnya pada pasien dengan penyakit sel sabit, talasemia, dan
anemia hemolotik didapat pada orang dewasa. Krisis aplastik transien dapat juga terjadi
setelah transplantasi sumsum tulang. Sindrom tersebut merupakan penghentian tibatiba
sintesa sel darah merah pada sumsum tulang dan ditunjukkan dengan tidak adanya
prekursor erritroid pada sumsum tulangkemudian diikuti oleh pemburukan anemia yang
cepat. Infeksi ini menurunkan produksi eritrosit sehingga penurunan kadar hemoglobin
darah tepi. Terhentinya produksi sel darah merah yang sementara menjadi jelas tampak
hanya pada pasien dengan anemi hemolitik kronis karena umur eritrositnya yang pendek.
Epidemiologi
Virus B19 ini tersebar luas dan infeksinya dapat terjadi sepanjang tahun pada semua
kelompok usia.Infeksi paling sering terlihat sebagai wabah di sekolah yang nampaknya
ditularkan melalui saluran nafas. Parvovirus yang menginfeksi banyak terjadi pada masa
anak-anak karena antibodi masih berkembang antara usia 5 sampai 19 tahun.
Diagnosis Laboratorium
Pemeriksaan laboratorium merupakan sarana yang paling sensitif untuk mendeteksi
DNA virus. Pemeriksaan yang dapat dilakukan dan merupakan pemeriksaan paling sensitif
adalah PCR (Polymerase chainreaction). DNA B19 telah terdeteksi pada serum, sel-sel
darah, sampel jaringan, dan sekret pernapasan. Selama infeksi akut, muatan virus di darah
dapat mencapai sekitar 10 pangkat 11 salinan genom/ml.
Pemeriksaan deteksi antigen dapat mengidentifikasi virus B19 dengan titer tinggi
pada sampel klinis. Immunohistokimiawi telah digunakan untuk mendeteksi antigen B19
di jaringan janin dan sumsum tulang. B19 manusia sulit ditumbuhkan dan isolasi virus
tidak digunakan untuk mendeteksi infeksi.
Pencegahan
Pencegahan dapat dilakukan dengan penerapan hiegiene yang baik, seperti mencuci
tangan dan tidak berbagi minum. Karena ini dapat membantu mencegah penyebaran B19
melalui sekret saluran pernapasan, aerosol dan materi pembawa infeksi. Tindakan
pengendalian infeksi standar harus diikuti untuk mencegah penularan B19 pada pekerja
kesehatan dan pasien penderita krisis aplastik dan dari pasien imunodefisiensi penderita
infeksi B19. Sampai saat ini masih belum ada vaksin untuk Parvovirus pada
manusia(Jawet,2014).
2. Papovaviridae
Papovavirus yang termasuk dalam famili Papovaviridae ini mempunyai kapsid
ikosahedral yang tidak berselubung, berukuran kecil dengan garis tengah antara 40 nm
dan 60 nm, tahan panas, dan resisten terhadap eter.Virus ini mengandung double
stranded DNA yang menunjukkan simetri kubikal dan memiliki 72 kapsomer. Salah satu
penyakit yang ditimbulkan oleh virus ini pada manusia adalah papiloma, sedangkan virus
yang dapat menginfeksi hewan adalah papilomavirus, polyomavirus, dan vacuolating
virus. Penyakit yang ditimbulkan diantaranya adalah onkogenik pada tikus, onkogenik
pada sel manusia, dan rodent (Soedarto, 2010).
Contoh Penyakit yang ditimbulkan diantaranya adalah:
Virologi 48
Human Papiloma Virus
Human papillomavirus atau HPV adalah virus yang dapat menyebabkan tumbuhnya
kutildi berbagai bagian tubuh. Virus ini hidup pada sel-sel kulit dan memiliki lebih dari 100
jenis. Ada sekitar 60 jenis HPV penyebab kutil yang biasanya menginfeksi bagian-bagian
tubuh seperti kaki dan tangan, sementara 40 lainnnya memicu munculnya kutil
kelamin.Tidak semua HPV dapat menyebabkan kanker namun ada beberapa jenis yang
berbahaya, seperti HPV 16 dan HPV 18, berpotensi besar memicu terjadinya kanker
serviks.WHO (World Health Organisation) memperkirakan sekitar 70% kanker serviks
disebabkan oleh kedua jenis HPV tersebut.
Saat ini, terdapat dua jenis vaksin HPV yang telah terdistribusi di seluruh penjuru
dunia, termasuk Indonesia. Vaksin jenis bivalen dan kuadrivalen ini terbukti efektif untuk
mencegah infeksi HPV, termasuk mencegah kejadian kanker serviks. Maka dari itu,
vaksinasi HPV ini sangat disarankan untuk kelompok wanita usia remaja, terutama usia 9-
14 tahun.
Virologi
49
Jika infeksi HPV sampai pada tahap menimbulkan gejala, indikasi utama adalah
tumbuhnya kutil. Jenis kutil terbagi ke dalam 5 kategori, yaitu:
a. Kutil biasa yang umumnya berupa benjolan bulat yang kasar.
b. Kutil plantar atau mata ikan. Kutil ini berbentuk rata dengan lubang di tengahnya yang
terkadang disertai titik-titik hitam.
c. Kutil datar (flat wart)dengan bentuk seperti bekas cakar di kulit. Warnanya juga
beragam, bisa cokelat, kekuning-kuningan, atau merah muda.
d. Kutil filiform yang biasanya berupa bintil daging tumbuh dengan warna yang sama
seperti kulit.
e. Kutil periungual jenis kutil yang biasa tumbuh di kaki dan tangan ini
berbentukpecahpecah seperti kembang kol serta menebal di lempeng kuku.
Sementara kutil kelamin umumnya dapat berupa lesi datar serta bentol dengan
permukaan pecah-pecah yang mirip kembang kol. Kutil ini akan menyebabkan rasa gatal,
tapi jarang terasa sakit.
Virologi 50
Sumber : https://www.sintesahealth.co.id/info/kalangan_umum/
penyakit_kulit_dan_kelamin/infeksi_hpv
3. Adenoviridae
Virion Adenovirus terdiri dari sebuah inti dan satu lapis kapsid. Kapsid virus tidak
berselubung, bulat dan simetri ikosahedral. Kapsid isometrik mempunyai diameter antara 70
nm dan 90 nm, mengandung double stranded DNA yang menunjukkan simetri kubikal dan
mempunyai 252 kapsomer. Terdapat 47 serotipe Adenovirus yang dapat menyebabkan
penyakit pada manusia, terutama menyerang membran mukosa dan sebagian kecil menetap
Virologi
51
di dalam jaringan limfoid, menimbulkan gangguan saluran pernapasan, faringitis dan
konjungtifitis. Adenovirus tipe 40 dan 41 bersifat enteropatogen dapat menyebabkan
gastroenteritis pada anak berumur dibawah 4 tahun. Beberapa jenis Adenovirus yang
menginfeksi manusia dapat merangsang terbentuknya tumor pada anak hamster yang baru
dilahirkan. Banyak serotipe virus ini ternyata juga dapat menimbulkan penyakit pada hewan
(zoonotik).
Penyakit yang ditimbulkan diantaranya adalah Infeksi mata dan saluran pernafasan,
gastrointestinal(Soedarto,2010).
Virologi 52
fiksasi komplemen meningkat empat kali lipat atau lebih pada serum antara fase konvalesens
hal tersebut mengidentifikasikan adanya infeksi yang sedang terjadi oleh suatu adenovirus,
tetapi tidak memberikan petunjuk tipe spesifiknya.
Pada sebagian besar kasus, titer antibodi netralisasi pasien yang terinfeksi menunjukkan
peningkatan empat kali lipat atau lebih terhadap titer adenovirus yang diambil dari pasien.
Epidemiologi
Adenovirus terdapat disemua belahan dunia dan terdapat sepanjang tahun, biasanya
tidak menyebabkan wabah penyakit. Serotipe yang paling sering ditemukan pada sampel klinis
adalah tipe pernapasan yang bernomor rendah (1,2,3,5,7) dan tipe gastroenteritis (40,41).
Adenovirus tersebar melalui kontak langsung,rute fecal-oral, droplet pernapasan, atau
peralatan yang terkontaminasi. Sebagian besar penyakit yang terkait Adenovirus tidak
patognomonis secara klinis dan banyak infeksi bersifat subklinis.
Pencegahan dan Pengendalian
Mencuci tangan dengan benar adalah cara termudah untuk mencegah infeksi,
sedangkan untuk permukaan area sekitar dapat didesinfeksi dengan natrium hipoklorit.
Di tempat umum tissu kertas lebih disarankan karena handuk yang kotor dapat menjadi
sumber infeksi ketika wabah. Resiko wabah konjungtifitis yang ditularkan melalui air dapat
diminimalkan dengan melakukan klorinasi kolam renang dan mengurasnya(Jawet, 2014).
Herpetoviridae
Virus berukuran sedang yang mengandung untai ganda,nukleokapsidnya berdiameter
100 nm, mempunyai simetri kubik dengan 162 kapsomer. Nukleokapsid dikelilingi oleh
selubung yang mengandung lemak (berdiameter 150-200 nm). Infeksi laten dapat berlangsung
selama masa hidup inang, biasanya dalam sel hidup ganglia atau limfoblastoid. Herpes
manusia antara lain herpes simplek jenis 1 dan 2 (lesi oral dan genital), virus Varicella zoster
(herpes zoster dan cacar air), sitomegalovirus, dan virus Epstein-Barr(mononukleosis
infeksiosa) dan berkaitan dengan neoplasma pada manusia(Kuswiyanto,2014). Penyakit yang
ditimbulkan antara lain adalah :
Herpes Simplex
Herpes genital adalah infeksi pada alat kelamin yang bisa terjadi pada pria dan wanita.
Penyakit ini termasuk salah satu infeksi menular seksual (IMS) karena umumnya ditularkan
melalui hubungan seksual (vagina, anal, dan oral). Herpes genital bisa dikenali dengan
kemunculan luka melepuh berwarna kemerahan dan terasa sakit di sekitar area kelamin. Luka
ini bisa pecah dan menjadi luka terbuka.
Infeksi yang terjadi pada kasus herpes genital disebabkan oleh virus herpes simpleks
atau sering disebut sebagai HSV. HSV dapat menular dan masuk ke dalam tubuh melalui
berbagai membran mukosa dalam tubuh, seperti mulut, kulit, dan kelamin. Virus ini seringkali
menetap di tubuh manusia dan suatu saat bisa aktif lagi. Saat virus ini aktif, gejalagejala herpes
genital akan kembali muncul. Virus ini bisa kambuh antara empat sampai lima kali pada dua
tahun pertama sejak terinfeksi.
Virologi
53
Gambar 2.4 Struktur HSV
Sumber : http://www.materisma.com/2014/10/virus-yang-menguntungkan-
danmerugikan.html
Virologi 54
Infeksi HSV primer biasanya ringan; kebanyakan asimptomatis. Jarang yang menjadi
penyakit sistemik. Terjangkitnya organ secara luas dapat terjadi ketika inang yang bersifat
immunokompromis tidak mampu membatasi replikasi virus dan terjadi viremia. b. Infeksi
laten
Virus berdiam dalam ganglion yang mengalami infeksi laten dalam keadaan tidak
bereplikasi dan sangat sedikit gen-gen yang diekspresi. Persistensi virus dalam ganglion yang
mengalami infeksi laten bertahan seumur hidup inang.
Reaktivasi spontan terjadi sekalipun ada imunitas seluler dan imunitas humoral spesifik
HSV tetapi imunitas ini membatasi replikasi virus lokal, sehingga infeksi rekuren tidak begitu
meluas dan tidak begitu parah. Banyak kejadian rekurensi bersifat asimtomatis dan hanya
tercermin dari adanya virus dalam sekresi. c. Infeksi rekuren
Virus yang beristirahat pada fase laten tersebut suatu saat dapat aktif kembali.
Faktorfaktor atau kondisi-kondisi yang dapat mengaktifkan infeksi tersebut antara lain :
1. Trauma fisik, seperti demam, infeksi oleh penyakit lain, penyakit HIV/AIDS, hubungan
seksual, kurang istirahat, menstruasi, dan sebagainya
2. Trauma psikis, seperti gangguan emosional dan depresi.
3. Penggunaan obat-obatan, seperi kortikosteroid, immunosupresif, obat-obatan terapi
kanker.
Gejala Klinis
Terkadang virus HSV tidak menyebabkan gejala. Bagi yang baru pertama kali terinfeksi
herpesmungkin tidak akan menyadari adanya gejala-gejala tertentu. Akibatnya, mereka tidak
tahu bahwa dirinya telah terinfeksi virus herpes. Gejala-gejala herpes genital bisa berupa:
Luka yang terbuka dan terlihat merah tanpa disertai rasa sakit, gatal, atau geli.
Sensasi rasa sakit, gatal, atau geli di sekitar daerah genital atau daerah anal.
Luka melepuh yang kemudian pecah dan terbuka di sekitar genital, rektum, paha, dan
bokong.
Merasakan sakit saat membuang air kecil.
Sakit punggung bawah.
Mengalami gejala-gejala flu seperti demam, kehilangan nafsu makan, dan kelelahan.
Luka terbuka atau melepuh pada leher rahim.
Adanya cairan yang keluar dari vagina.
Virus HSV bisa menjadi laten atau tidak aktif di dalam tubuh selama beberapa waktu
namun virus ini bisa kembali aktif dan memicu timbulnya gejala herpes genital. Dengan kata
lain, setelah gejala dari infeksi pertama menghilang bukan berarti virus juga menghilang dari
tubuh kita. Virus itu kemungkinan masih mengendap di dalam tubuh.
Ketika pertama kali terinfeksi, tubuh akan menghasilkan antibodi untuk melawan infeksi.
Hal itu membuat tubuh bisa mengenali virus dan menyusun kekuatan yang dibutuhkan untuk
melawan HSV secara lebih efektif. Maka dari itu, infeksi atau gejala kambuhan yang terjadi
tidak akan separah infeksi pertama. Frekuensinya akan berkurang dan gejalanya akan lebih
cepat hilang (Handoko,2010).
Diagnostik Laboratorium Pemeriksaan Penunjang
Diagnosis laboratorium untuk penyakit herpes terdiri dari empat macam pemeriksaan yaitu:
Virologi
55
1. Pemeriksaan langsung secara mikroskopis
Herpes simplex virus (HSV) dapat ditemukan pada vesikel dan dapat dibiakkan.Pada
keadaan tidak ada lesi dapat diperiksa antibodi HSV.Dengan pewarnaangiemsa dapat
ditemukan sel datia berinti banyak dan badan inklusi intranuklear (Handoko, 2010).
Tes ini dapat diselesaikan dalam waktu 30 menit atau kurang.Caranya dengan membuka
vesikel dan korek dengan lembut pada dasar vesikel tersebut lalu letakkan pada gelas obyek
kemudian biarkan mengering sambil difiksasi dengan alkohol atau dipanaskan.Selanjutnya beri
pewarnaan (5% methylene blue, Wright, Giemsa) selama beberapa detik, cuci dan keringkan,
beri minyak emersi dan tutupi dengan gelas penutup.Jika positif terinfeksi hasilnya berupa
keratinosit yang multinuklear dan berukuran besar berwarna biru (Frankel, 2006).
2. Pemeriksaan serologik
Antibodi timbul dalam waktu 4-7 hari setelah infeksi mencapai puncaknya dalam 2-4
minggu. Mereka bertahan dengan fluktuasi kecil untuk kehidupan inang.
Nilai diagnostik pengujian serologi terbatas oleh banyaknya antigen yang sama pada
HSV-1 dan HSV-2. Bisa juga terdapat responheterotipikanamnestik dengan virus varicella
zoster pada orang yang terkena infeksi HSV dan begitu pula sebaliknya.
3. Isolasi dan identifikasi virus
Isolasi virusdapat dilaksanakan dengan tiga cara, yaitu dengan telur berembrio, teknik invitro
(biakan sel jaringan), dan teknik in vivo (binatang laboratorium).
Identifikasi virusdengan PCR, mikroskop elektron, atau kultur (Sterry, 2006). Tes serologi
menggunakan enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA) spesifik HSV tipe II dapat
membedakan siapa yang telah terinfeksi dan siapa yang berpotensi besar menularkan infeksi
.
Pengujian PCR dapat digunakan untuk mendeteksi virus tetapi isolasi virus tetap sebagai
pendekatan diagnosis pasti. Virus dapat diisolasi dari lesi herpetik dan mungkin juga didapat
pada basuhan tenggorokan, cairan cerebrospinal dan feses baik selama infeksi primer maupun
selama periode asimtomatik. Karena itu, isolasi HSV saja bukan bukti yang cukup sebagai
indikator bahwa virus sebagai agen penyebab penyakit yang sedang diselidiki. Inoklusi kultur
jaringan dipakai untuk isolasi virus. Agen kemudian diidentifikasi melaluipengecatan
imunofluorensendengan antibodi spesifik. Penentuan tipe isolate HSV bisa dilakukan dengan
menggunakan antibodi monoclonal.
Pencegahan
Untuk menghindari Penyakit Menular Seksual yang disebabkan oleh virus herpes
simpleks, yang paling mudah adalah tidak melakukan hubungan seksual dengan pasangan
yang telah terinfeksi PMS. Namun hal ini tentunya tidak mudah dilakukan. Upaya pencegahan
antara lain sebagai berikut :
a. Selalu menjaga higienitas (kebersihan/kesehatan) organ genetalia (atau alat kelamin
pria dan wanita secara teratur).
b. Setia kepada pasangannya, dengan tidak berganti-ganti pasangan.
c. Jangan lupa menggunakan kondom, bila pasangan kita sudah terinfeksi PMS
d. Mintalah jarum suntik baru setiap kali menerima pelayanan medis yang menggunakan
jarum suntik.
Virologi 56
4. Iridoviridae
Dalam famili ini virus-virus anggotanya mempunyai DNA yang tidak beraturan bentuknya
dengan partikelberukuran antara 180 nm dan 200 nm. Virion tidak berselubung dan
mempunyai garis tengah dengan ukuran sekitar 130 nm.Swine-fever virus penting dalam
bidang kesehatan veteriner karena dapat menimbulkan penyakit pada babi yang
menyebabkan gejala demam dan diare berat.Penyakit yang ditimbulkan diantaranya adalah
African swine fever (Soedarto, 2010).
5. Poxviridae
Famili virus Poxviridae yang mempunyai struktur rumit ini memiliki anggota kelompok
yangbesar jumlahnya. Sesuai dengan jenis-jenis hewan yang menjadi hospesnya, famili
Poxviridae dikelompokkanmenjadi grup A, B, C, D, E. Variola virus yang menjadi penyebab
penyakit cacar yang menyerang manusia termasuk salah satu anggota Poxviridae grup A
(Soedarto, 2010).Contoh penyakit yang dapat ditimbulkan pada manusia antara lain adalah
Vaccinia dan Variola
Infeksi Poxvirus pada manusia :
Vaccinia dan Variola
Virus vaccinia adalah virus vaksin yang digunakan untuk memberantas variola (cacar)
merupakan hasil rekayasa genetika menjadi vaksin rekombinan (beberapa masih dalam
tarafuji klinik) dengan risiko terendah terjadi penularan terhadap kontak non imun.
“Immunization Practices Advisory Committee” (ACIP) merekomendasikan vaksinasi cacar
untuk semuapetugas laboratorium yang mempunyai risiko tinggi terkena infeksi yaitu mereka
yang secara langsung menangani bahan atau binatang yangdiinfeksi dengan virus vaccinia atau
orthopoxvirus lainnya yang dapat menginfeksi manusia. Vaksinasi juga perlu dipertimbangkan
terhadap petugaskesehatan lain walaupun berisiko rendah terinfeksi virus seperti dokter dan
perawat.Vaksinasi merupakan kontra indikasi bagi seseorang yang menderita defisiensi sistem
imun; contoh: penderita AIDS dankanker, mereka yang menerima transplantasi, dan wanita
hamil. Di ASVaccine immune globulin dapat diperoleh untuk petugas laboratorium
denganmenghubungi CDC Drug Service, 1600 Clifton Road (Mailstop D09), Atlanta GA 30333,
Vaksin yang diberikan sudah dilengkapi dengan instruksi yang jelas (cara vaksinasi,
kontraindikasi, reaksi, komplikasi) yang harus diikuti dengan tepat.
Vaksin harus diulang kecuali muncul reaksi (salah satu reaksi adalah muncul indurasi
eritematosa 7 hari setelah vaksinasi). Booster diberikan dalam waktu 10 tahun kepada mereka
yang masukkategoriharusdivaksinasi. WHO selalu menyimpan dan menyediakan vaccine
seedlot (virusvaccine strain ListerElstree) dipakai untuk keadaan darurat. Vaksin tersebut ada
di Pusat kerjasamaWHO (WHOCollaborating Center) untuk vaksin cacar di National Institute
of Public and Environment Protection di Bilthoven, The Netherlands (Jawet,
2014).
6. Hepadnaviridae
Anggota famili Hepadnaviridae ini berukuran kecil sekitar 42 nm, mengandung molekul
DNA sirkuler yang doeble-stranded partial, dengan virion yang juga mengandung polimerase
Virologi
57
DNA. Virus mempunyai core nukleokapsid dengan selubung yang mengandung lipid.
Hepadnavirus merupakan penyebab penyakit hepatitis yang akut maupun kronis dan apabila
infeksinya menetap dapat mengakibatkan terjadinya resiko kanker hati. Contoh penyakit yang
dapat ditimbulkan pada manusia :
Hepatitis
Hepatitis adalah istilah umum penyakit yang merujuk pada peradangan yang terjadi
dihati. Hepatitis umumnya disebabkan oleh infeksi virus, meskipun juga dapat disebabkan oleh
kondisi lain. Beberapa penyebab selain infeksi virus adalah kebiasaan minum alkohol, penyakit
autoimun, serta zat racun atau obat-obatan tertentu.
Hepatitis dapat mengganggu berbagai fungsi tubuh terutama yang berkaitan dengan
metabolisme karena hati memiliki banyak sekali peranan dalam metabolisme tubuh.
Hepatitis yang terjadi dapat bersifat akut maupun kronis. Seseorang yang mengalami hepatitis
akut dapat memberikan beragam manifestasi dan perjalanan penyakit mulai dari tidak
bergejala, bergejala dan sembuh sendiri, menjadi kronis, dan yang paling berbahaya adalah
berkembang menjadi gagal hati. Bila berkembang menjadi hepatitis kronis, dapat
menyebabkan sirosis dan kanker hati (hepatocellular carcinoma) dalam kurun waktu tahunan.
Pengobatan hepatitis sendiri bermacam-macam sesuai dengan jenis hepatitis yang diderita
dan gejala yang muncul.
Virologi 58
Gambar 2.7 . Tahapan kerusakan hati
Sumber : http://www.gunardi.info/2015/07/tahapan-kerusakan-hati-akibat-tidur.html
Gambaran klinis secara umum
Gambaran klinis hepatitis virus dapat berkisar dari asimtomatik sampai penyakit yang
mencolok, kegagalan hati, dan kematian. Terdapat tiga stadium pada semua jenis hepatitis
yaitu:
a. Stadium prodormal
Disebut juga periode pra-ikteruskarena ikterus belum muncul. Dimulai setelah periode
masa tunas virus selesai dan pasien mulai memperlihatkan tanda-tanda penyakit.Antibodi
terhadap virus biasanya belum dijumpai, stadium ini berlangsung 1-2 minggu dan ditandai oleh
malese umum, anoreksia, sakit kepala, malas, ISPA, dan nyeri otot. b. Stadium ikterus.
Dapat berlangsung 2-3 minggu atau lebih, pada sebagian besar orang stadium ini
ditandai oleh timbulnya ikterus, manifestasi lainnya adalah memburuknya semua gejala yang
ada pada stadium prodromal, pembesaran dan nyeri hati, splenomegali, pruritus. c. Stadium
pemulihan.
Biasanya timbul dalam 2-4 bulan, selama periode inigejala-gejala mereda termasuk
ikterus, nafsu makan pulih, apabila terdapatsplenomegaliakan segera mengecil.
Penyebab Hepatitis
Hepatitis A.Penyakit ini disebabkan oleh virus hepatitis A (HAV). Hepatitis A biasanya
ditularkan melalui makanan atau air minum yang terkontaminasi feses dari penderita yang
mengandung virus hepatitis A.
Hepatitis B. Penyakit ini disebabkan oleh virus hepatitis B (HBV). Hepatitis Bdapat ditularkan
melalui cairan tubuh yang terinfeksi. Cairan tubuh yang dapat menjadi sarana penularan
hepatitis B adalah darah, cairan vagina, dan air mani. Karena itu, memakai jarum suntik
bergantian dan berhubungan seksual tanpa kondom dengan penderita hepatitis B dapat
menyebabkan seseorang tertular penyakit ini.
Hepatitis C. Penyakit ini disebabkan oleh virus hepatitis C (HCV). Hepatitis C dapat ditularkan
melalui cairan tubuh, terutama melalui berbagi jarum suntik dan hubungan seksual tanpa
kondom.
Virologi
59
Hepatitis D. Penyakit ini disebabkan oleh virus hepatitis D (HDV). Hepatitis D merupakan
penyakit yang jarang terjadi namun bersifat serius. Virus ini tidak bisa berkembang biak di
dalam tubuh manusia tanpa adanya hepatitis B. Hepatitis Dditularkan melalui darah dan cairan
tubuh lainnya.
Hepatitis E. Penyakit ini disebabkan oleh virus hepatitis E (HEV). Hepatitis E mudah terjadi
pada lingkungan yang tidak memiliki sanitasi yang baik akibat kontaminasi virus ini pada
sumber air.
Selain disebabkan oleh virus, hepatitis juga dapat terjadi akibat kerusakan pada hati oleh
senyawa kimia terutama alkohol. Konsumsi alkohol berlebihan akan merusak sel-sel hati
secara permanen dan dapat berkembang menjadi gagal hati atau sirosis. Penggunaan obat-
obatan melebihi dosis atau paparan racun juga dapat menyebabkan hepatitis.
Pada beberapa kasus, hepatitis terjadi karena kondisi autoimun pada tubuh. Pada
hepatitis yang disebabkan oleh autoimun, sistem imun tubuh justru menyerang dan merusak
sel dan jaringan tubuh sendiri. Dalam hal ini adalah sel-sel hati sehingga menyebabkan
peradangan. Peradangan yang terjadi dapat bervariasi mulai dari yang ringan hingga berat.
Hepatitis autoimun lebih sering terjadi pada wanita dibanding pria.
Gejala Umum Hepatitis
Sebelum menimbulkan gejala pada penderita, terlebih dahulu virus ini akan melewati
masa inkubasi. Waktu inkubasi tiap jenis virus hepatitis berbeda-beda. HAV membutuhkan
waktu inkubasi sekitar 15-45 hari, HBV sekitar 45-160 hari, dan HCV sekitar 2 minggu hingga 6
bulan.
Beberapa gejala yang umumnya muncul pada penderita hepatitis antara lain
adalahmengalami gejala seperti flu, misalnya mual, muntah, demam, dan lemas, feses
berwarna pucat, mata dan kulit berubah menjadi kekuningan (jaundice), nyeri perut, berat
badan turun, urin menjadi gelap seperti teh, kehilangan nafsu makan.
Bila Anda mengalami hepatitis virus yang dapat berubah menjadi kronik seperti hepatitis
B dan C mungkin Anda tidak mengalami gejala tersebut pada awalnya, sampai kerusakan yang
dihasilkan oleh virus berefek terhadap fungsi hati, sehingga diagnosisnya menjadi terlambat.
Faktor Risiko Hepatitis
Faktor risiko yang dapat meningkatkan seseorang untuk lebih mudah terkena hepatitis
tergantung dari penyebab hepatitis itu sendiri. Hepatitis yang dapat menular lewat makanan
atau minuman seperti hepatitis A dan hepatitis E lebih berisiko pada pekerja pengolahan air
atau pengolahan limbah. Sementara hepatitis non infeksi lebih berisiko pada seseorang yang
kecanduan alkohol.
Untuk hepatitis yang penularannya melalui cairan tubuh seperti hepatitis B,C, dan D
lebih berisiko pada petugas medis, pengguna NAPZA dengan jarum suntik, berganti-ganti
pasangan seksual, orang yang sering menerima transfusi darah.Namun saat ini sudah jarang
orang yang tertular hepatitis melalui transfusi darah, karena setiap darah yang didonorkan
terlebih dulu melewati pemeriksaan untuk penyakit-penyakit yang dapat ditularkan melalui
darah.
Virologi 60
Diagnosis Hepatitis
Langkah diagnosis hepatitis pertama adalah dengan menanyakan riwayat timbulnya
gejala dan mencari faktor risiko dari penderita. Lalu dilakukan pemeriksaan fisik untuk
menemukan tanda atau kelainan fisik yang muncul pada pasien seperti dengan menekan perut
untuk mencari pembesaran hati sebagai tanda hepatitis dan memeriksa kulit serta mata untuk
melihat perubahan warna menjadi kuning.
Setelah itu, pasien akan disarankan untuk menjalani beberapa pemeriksaan tambahan,
seperti:
Tes fungsi hati. Dilakukan dengan mengambil sampel darah dari pasien untuk mengecek
kinerja hati. Pada tes fungsi hati enzim aspartat aminotransferase dan alanin aminotransferase
(AST/SGOT dan ALT/SGPT) akan diukur. Dalam kondisi normal, kedua enzim tersebut terdapat
di dalam hati. Jika hati mengalami kerusakan akibat peradangan, kedua enzim tersebut akan
tersebar dalam darah sehingga kadarnya naik. Meski demikian perlu diingat bahwa tes fungsi
hati tidak spesifik untuk menentukan penyebab hepatitis. Tes antibodi virus hepatitis.
Berfungsi untuk menentukan keberadaan antibodi yang spesifik untuk virus HAV, HBV, dan
HCV. Pada saat seseorang terkena hepatitis akut, tubuh akan membentuk antibodi spesifik
guna memusnahkan virus yang menyerang tubuh. Antibodi dapat terbentuk beberapa minggu
setelah seseorang terkena infeksi virus hepatitis. Antibodi yang dapat terdeteksi pada
penderita hepatitis akut antara lain adalahantibodi terhadap hepatitis A (anti HAV), antibodi
terhadap material inti dari virus hepatitis B (anti HBc), antibodi terhadap material permukaan
dari virus hepatitis B (anti HBs), antibodi terhadap material genetik virus hepatitis B (anti HBe),
dan antibodi terhadap virus hepatitis C (anti HCV).
Tes protein dan materi genetik virus. Pada penderita hepatitis kronis antibodi dan sistem
imun tubuh tidak dapat memusnahkan virus sehingga virus terus berkembang dan lepas dari
sel hati ke dalam darah. Keberadaan virus dalam darah dapat terdeteksi dengan tes antigen
spesifik dan material genetik virus, antara lainantigen material permukaan virus hepatitis B
(HBsAg), antigen material genetik virus hepatitis B (HBeAg), DNA virus hepatitis B (HBV DNA),
RNA virus hepatitis C (HCV RNA).
USG perut.Dengan bantuan gelombang suara, USG perut dapat mendeteksi kelainan pada
organ hati dan sekitarnya seperti adanya kerusakan hati, pembesaran hati, maupun tumor
hati. Selain itu, melalui USG perut dapat juga terdeteksi adanya cairan dalam rongga perut
serta kelainan pada kandung empedu.
Biopsi hati. Dalam metode ini, sampel jaringan hati akan diambil untuk kemudian diamati
menggunakan mikroskop. Melalui biopsi hati dokter dapat menentukan penyebab kerusakan
yang terjadi di dalam hati.
Pencegahan Hepatitis
Agar terhindar dari hepatitis, seseorang perlu menerapkan pola hidup bersih dan sehat.
Misalnya denganmenjaga kebersihan sumber air agar tidak terkontaminasi virus
hepatitis,mencuci bahan makanan yang akan dikonsumsi, terutama kerang dan tiram,
sayuran, serta buah-buahan, tidak berbagi pakai sikat gigi, pisau cukur, atau jarum suntik
dengan orang lain, tidak menyentuh tumpahan darah tanpa sarung tangan pelindung,
Virologi
61
melakukan hubungan seksual yang aman, misalnya dengan menggunakan kondom, atau tidak
berganti-ganti pasangan, dan kurangi konsumsi alkohol.
Selain melalui pola hidup bersih dan sehat, hepatitis (terutama A dan B) bisa dicegah
secara efektif melalui vaksinasi. Untuk vaksin hepatitis C, D, dan E hingga saat ini masih dalam
tahap pengembangan. Namun di beberapa negara vaksin hepatitis C sudah tersedia dan bisa
digunakan.
Agar saudara dapat mengerjakan soal di atas dengan baik, cermati kembali bab 2 topik 1dan
diskusikan jawaban saudara dengan teman-teman sejawat. Setelah itu, rumuskan jawaban
yang paling tepat.
Ringkasan
Virus DNA adalah virus yang materi genetiknya berupa asam nukleat yang berbentuk rantai
ganda berpilin. Di dalam sel inangnya, DNA pada virus akan mengalami replikasi menjadi
beberapa DNA dan juga akan mengalami transkripsi menjadi mRNA.mRNA akan mengalami
translasi untuk menghasilkan protein selubung virus. Masih didalam sel inang, DNA dan
protein virus mengkonstruksikan diri menjadi virus-virus baru. mRNA juga akan membentuk
enzim penghancur (Lisozim) sehingga sel inang lisis (hancur) dan virus-virus keluar untuk
menginfeksi sel inang lainnya.
Famili-famili yang termasuk virus-virus DNA adalah Parvoviridae, Papovaviridae, Adenoviridae,
Herpetoviridae, Iridoviridae, Poxviridae, Hepadnaviridae. Banyak penyakit penting yang
ditimbulkan oleh virus DNA, seperti :
a. Papovaviridae : Papillomavirus adalah penyebab dari Warts, sedangkan SV40 virus
mempunyai sifat onkogenikpada sel manusia dan rodent.
Virologi 62
b. Adenoviridae : Adenovirus penyebab inveksi mata dan saluran pernafasan.
c. Herpetoviridae : dengan virus-virus Herpes simplex virus dan Varicella zoster virus selain
menjadi penyebab herpes simplex dan varicella, juga berperan pada kelainan cervical
cancer.
d. Poxviridae : penyebab penyakit variola, komplikasi pasca vaksinasi dan penyebab
terjadinya benign skin nodule dan contagious pustular dermatitis.
e. Hepadnaviridae : penyebab penting terjadinya hepatitis akut maupun hepatitis kronis.
Famili dan virus DNA
Famili: Papovaviridae, Virus :Papillomavirus, Polyomavirus, SV40 virus
Famili : Parvoviridae, Virus : Adeno-associated virus, Virus H1 dan H3
Famili : Adenoviridae, Virus : Adenovirus
Famili : Hepetoviridae, Virus : Herpes-simplex virus, Varicella-zooster virus
Famili : Iridoviridae, Virus : African swine fever virus
Famili : Poxviridae, Virus : Variola virus, Vaccinia virus, Molloscum contagiosum virus, Orf virus
Famili : Hepadnaviridae, Virus : Hepadnavirus
Tes 1
Pilihlah salah satu jawaban yang paling benar!
1. Manakah berikut ini yang paling baik menggambarkan sifat-sifat fisikokimiawi parvovirus
...
A. Partikel virus berselubung
B. Genom DNA untai tunggal
C. Infeksifitas diinaktifasi oleh terapi eter
D. Virion menunjukkan simetri helix
E. Ukuran virionnya kira-kira samadengan herpes virus
2. Seorang bayi erusia 6 bulan mengalami diare cairdan demam selama 10 hari, adenovirus
tipe 40 dan 41 dicurigai sebagai penyebabnya. Spesimen apa yang paling tepat untuk
mendeteksi infeksi adenovirus pada pasien ini adalah ...
A. Darah
B. Urin
C. Apusan konjungtiva
D. Feses
E. Apusan tenggorokan
Virologi
63
3. Mana dari penyakit pada manusia berikut ini yang tidak berhubungan dengan adenovirus
... A. Kanker
B. Selesma
C. Penyakit pernapasan akut
D. Keratokonjungtivitis
E. Gastroenteritis
7. Manakah dari pejanan berikut ini yang mengandung resiko infeksi hepatitis ...
A. Perawat yang mengalami luka tusuk jarum bekas pakai ketika mengambil bat untuk
pasien HIV.
B. Ketika membersihkan kamar mandi, kulit yang utuh seorang pramuwisma berkontak
dengan feses.
C. Seorang teknisi kamar operasi dengan tangan yang terkelupas melihat ada darah
dibalik sarung tangannya setelah membantu operasi oasien HCV.
D. Seorang anak minum dari gelas yang sama dengan ibunya yang menderita HAV.
E. Seorang pembeli makan roti isi yang dibuat oleh pekerja yang menderita HAV.
Virologi 64
8. Manakah orang-orang berikut ini yang tidak dianjurkan untuk menerima vaksin hepatitis
B karena mereka memiliki faktor resiko infeksi HBV ...
A. Orang yang aktif secara seksual dan tidak berada dalam hubungan monogami jangka
panjang yang saling menguntungkan. B. Pengguna obat suntik
C. Wanita hamil.
D. Orang yang tinggal serumah dengan orang yang positif HbsAg.
E. Orang yang mencari terapi untuk penyakit seksual menular.
9. Kelompok individu manakah berikut ini yang beresiko paling rendah terkena penyakit
Adenovirus
A. Dewasa sehat
B. Anak-anak kecil
C. Resipien transplan sumsum tulang
D. Calon anggota militer
E. Pasien AIDS
10. Menyebabkan minimal 80% kasus hepatitis akibat transfusi darah. Virus ini paling sering
ditularkan melalui pemakai obat yang menggunakan jarum bersama-sama dan alkoholik.
Jarang terjadi penularan melalui hubungan seksual.hal tersebut Merupakan jenis virus
hepatitis apa?
A. VHD
B. VHC
C. VHE
D. VHG
E. Semua benar
11. Protein Adenovirus yang terdiri sebagian besar kapsomer penyusun kapsid virus adalah
...
A. Serat
B. Hekson
C. Penton
D. Protein terminal
E. Protein regio E1
12. Panas, muncul gejala mirip flu sindrom, ikterik, sakit kepala, warna urin merah gelap,
warna feses pucat, hal tersebut merupakan tanda dan gejala penyakit ....
A. Hepatitis
B. HIV/AIDS
C. Infeksi traktus urinarius
Virologi
65
D. CMV (citomegalo virus)
E. Toxoplasmosis
13. Virus hepatitis yang termasuk dalam kelompok penyakit hepatitis akut, yaitu…
A. Virus hepatitis A
B. Virus hepatitis B dan C
C. Virus hepatitis E
D. Virus hepatitis A dan E
E. Semuanya salah
14. Seorang anak berusia 3 tahun mengalami penyakit virus klasik pada anak, manakah
infeksi virus primer pada anak berikut ini yang biasanya simtomatik ...
A. Sitomegalovirus
B. Toxoplasmosis
C. Virus hepatitis B
D. Virus varicella-zooster
E. Parvovirus B-19
15. Siapakah kelompok berikut ini yang beresiko tinggi menderita herpes-zooster...
A. Orang lanjut usia
B. Pasien autoimun
C. Wanita hamil
D. Orang yang telah divaksin dengan vaksin varicella
E. Bayi dengan infeksi congenital
Virologi 66
Topik 2 Virus
RNA
R
unit-unit mononukleotida). Hanya saja berbeda dengan DNA yang unit-unit NA (asam
ribonukleat) juga merupakan asam nukleat (polinukleotida yang terdiri dari
pembangunnya dioksinukleotida sehingga disebut untai ganda, RNA merupakan asam
nukleat untai tunggal yang terdiri dari unit-unit pembangun berupa mononukleotida.
Setiap nukleotida terdiri atas satu gugus fosfat, satu gugus pentosa, dan satu gugus basa
Nitrogen (N).
RNA merupakan hasil transkripsi dari suatu fragmen DNA, sehingga kedudukan RNA
ialah sebagai polimer dan jauh lebih pendek dibanding DNA. Tidak seperti DNA yang biasanya
dijumpai di dalam inti sel, RNA kebanyakan berada di dalam sitoplasma, khusunya di ribosom.
Golongan virus RNA hanya memiliki asam ribonukleat (ribonukleat acid). Dalam
kelompok virus RNA banyak dijumpai virus-virus yang dapat menimbulkan penyakit pada
manusia. Famili-famili yang termasuk virus-virus RNA adalah : Picornaviridae, Reoviridae,
Togaviridae, Arenaviridae, Coronaviridae, Retroviridae, Bunyaviridae, Orthomyxoviridae,
Paramyxoviridae, Rhabdoviridae.
1. Picornaviridae
Picornavirusadalah virus dari famili Picornaviridaeyang berukuran kecil antara 20-40 nm,
yang tahan terhadap eter, mengandung single stranded RNA dan menunjukkan struktur
Virologi
67
simetri kubikal. Virus ini nukleokapsidnya tidak berselubung, ikosahedral dengan asam nukleat
RNA positif dengan berat molekul antara 2-3 juta dalton. Lima genus Picornaviridae yang
menginfeksi manusia adalahRhinovirus (penyebab demam, bersifat labil dalam suasana asam),
Enterovirus (meliputi Poliovirus, Coxsackie virus, Echovirus) Hepatovirus, Parechovirus
(penyebab infeksi gastrointestinal dan infeksi jalan napas), Kobuvirus (penyebab
gastroenteritis) (Sudarto,2014).
Contoh penyakit yang ditimbulkan diantaranya adalah :
a. Poliomielitis
Poliomyelitis adalah suatu penyakit virus yang dalam stadium beratnya menyebabkan
kelumpuhan karena kerusakan sel-sel syaraf baik dalam sumsum tulang, tulang punggung
maupun otak.Penyakit ini disebabkan oleh enterovirus, poliovirus (PV) yang sangat infeksius,
yang terutama mempengaruhi anak-anak muda dan disebarkan melalui kontak langsung orang
ke orang, dengan lendir, dahak, feces, yang terinfeksi atau oleh kontak dengan makanan dan
air ang terkontaminasi oleh feces dari individu lain yang terinfeksi. Virus berlipatganda dalam
sistim pencernaan dimana ia dapat juga menyerang sistim syaraf, menyebabkan kerusakan
syaraf yang permanen pada beberapa individu-individu.
Penyakit ini disebut juga Hiene-Meidin berdasarkan 2 orang ahli yang menemukan
penyakit ini dengan menyuntikkan tinja dari seorang penderita lumpuh secara intra cerebral
dan intra nasal pada kera,2 minggu kemudian kera menjadi lumpuh.
Tanda Dan Gejala
Tanda-tanda dan gejala-gejala dari polio berbeda tergantung pada luas infeksi. Tanda-tanda
dan gejala-gejala dapat dibagi kedalam polio yang melumpuhkan (paralytic) dan polio yang
tidak melumpuhkan (non-paralytic).
Pada polio non-paralytic : asymptomatic atau mengembangkan hanyagejala-gejala seperti flu
yang ringan, termasuk kelelahan, malaise, demam, sakit kepala,sakit tenggorokan, dan
muntah,nyeri ekstremitas bawah.
Polio Paralytic : terjadi pada kira-kira 2% dari orang-orang yang terinfeksi dengan virus polio
dan merupakan penyakit yang jauh lebih serius. Gejala-gejala terjadi sebagai akibat dari sistim
syaraf dan infeksi peradangan sumsum tulang belakang (spinal cord).
Pasien yang telah sembuh dari polio kadang-kadang mengembangkan sindrom
postpoliomyelitis, kelelahan yang diamati dan yang biasanya melibatkan kelompok otot yang
awalnya terpengaruh. Sindrom ini dapat berkembang postpolio 20-40 tahun setelah terinfeksi
virus polio.
Penyebab
Penyakit polio disebabkan oleh polio virus yang umumnya masuk melalui makanan atau
minuman yang terkontaminasi dengan tinja yang mengandung virus tersebut. Sama halnya
seperti cacar, polio hanya menjangkiti manusia. Dalam tubuh manusia, virus polio menjangkiti
tenggorokan dan usus. Selain melalui kotoran, virus polio juga bisa menyebar melalui tetesan
cairan yang keluar saat penderitanya batuk atau bersin. Dalam beberapa kondisi, infeksi virus
ini dapat menyebar ke aliran darah dan menyerang sistem saraf.
Imunisasi atau pemberian vaksin polio dapat meminimalisasi terjangkitnya virus polio.
Anak-anak, wanita hamil dan orang yang sistem kekebalan tubuhnya lemah sangat rentan
Virologi 68
terkena virus polio jika di daerah mereka tidak mengikuti program imunisasi atau tidak
memiliki sistem sanitasi yang bersih dan baik.
Orang-orang yang belum divaksinasi akan memiliki tingkat risiko terjangkit polio yang
tinggi jika melakukan atau mengalami hal-hal seperti berikut ini:
Tinggal serumah dengan penderita polio, sistem kekebalan tubuh yang menurun,
bepergian ke daerah di mana polio masih kerap terjadi, dan atau telah melakukan operasi
pengangkatan amandel.
Kira-kira 5-10% dari pasien yang mengalami polio dengan kelumpuhan seringkali
meninggal karenakegagalan pernapasan karena mereka tidak mampu untuk bernapas sendiri.
Itulah sebabya mengapa sangat mendesak bahwa pasien-pasien menerima evaluasi dan
perawatan medis yang tepat. Sebelum era vaksinasi dan penggunaan dari ventilator modern
pasien akan ditempatkan dalam “iron lung” (ventilator bertekanan negatif yang digunakan
untuk mendukung pernapasan pada pasien-pasien yang menderita polio yang melumpuhkan)
(World Health Organization, 2017).
Diagnosis
Prognosis tergantung kepada jenis polio (subklinis, non-paralitik atau paralitik) dan
bagian tubuh yang terkena. Jika tidak menyerang otak dan korda spinalis kemungkinan akan
terjadi pemulihan total.Jika menyerang otak atau korda spinalis, merupakan suatu keadaan
gawat darurat yang mungkin akan menyebabkan kelumpuhan atau kematian (biasanya akbiat
gangguan pernafasan).
Diagnosis dari polio adalah secara klinik. Riwayatdari paparan dengan tidak ada sejarah
vaksinasi sebelumnya adalah petunjuk awal. Sering, penyadapan tulang belakang untuk cairan
CSF dilakukan untuk membantu membedakan polio dari penyakit-penyakit lain yang awalnya
Virologi
69
mempunyai gejala-gejala yang serupa (contohnya, meningitis). Setelah itu pembiakan virus
(diambil dari tenggorokan, feces, atau cairan CSF) dan pengukuran dari antibodi-antibodi polio
untuk mendukung diagnosis.
Pencegahan
Vaksin polio merupakan bagian dari imunisasi rutin pada masa kanak-kanak.
Terdapat 2 jenis vaksin polio:
Vaksin Salk, merupakan vaksin virus polio yang tidak aktif dan Vaksin Sabin, merupakan vaksin
virus polio hidup. Yang memberikan kekebalan lebih baik (sampai lebih dari 90%) dan yang
lebih disukai adalah vaksin Sabin per-oral (melalui mulut). Tetapi pada penderita gangguan
sistem kekebalan, vaksin polio hidup bisa menyebabkan polio.Karena itu vaksin ini tidak
diberikan kepada penderita gangguan sistem kekebalan atau orang yang berhubungan dekat
dengan penderita gangguan sistem kekebalan karena virus yang hidup dikeluarkan melalui
tinja. Orang dewasa yang belum pernah mendapatkan imunisasi polio dan hendak
mengadakan perjalanan ke daerah yang masih sering terjadi polio sebaiknya menjalani
vaksinasi terlebih dahulu. Dewasa yang belum pernah mendapatkan imunisasi polio dan
hendak mengadakan perjalanan ke daerah yang masih sering terjadi polio, sebaiknya
menjalani vaksinasi terlebih dahulu.
2. Reoviridae
Reovirus merupakan virus yang berukuran antara 60-80 nm, mengandung
doublestranded RNA dengan struktur simetri kubikal, terdiri dari 10-12 segmen. Virus yang
ikosahedral ini mempunyai kapsid dengan banyak lapisan serta tahan terhadap eter. Rotavirus
yang mempunyai bentuk seperti roda dapat menimbulkan penyakit gastroenteritis pada
manusia, sedangkan Orbivirus yang merupakan subgrup kelompok virus ini dapat
menyebabkan penyakit Colorado Tick Fever pada manusia dan penyakit lidah biru pada sapi
dan biri-biri.
3. Togaviridae
Togavirus merupakan suatu kelompok virus dengan genom yang single stranded
mempunyai selubung dari lipid yang sensitif terhadap eter. Virion virus mempunyai selubung
dan berukuran garis tengah antara 50-70 nm. Partikel Togavirus mengadakan pematangan
dengan cara membentuk tunas dan membran sel plasma hospes. Secara serologik Togavirus.
Dikelompokkan menjadi 3 genus yaitu Alphavirus, Flavivirus, Rubivirus.
4. Arenaviridae
Arenavirus adalah virus RNA dengan genom negative-sense, single stranded,
berselubung dan mempunyai virionberbentuk bulat, lonjong atau pleomorfik (mempunyai
banyak bentuk). Nukleokapsid berfilamen, simetri helikal. Virus ini mempunyai ukuran garis
tengah antara 50-350 nm. Semua Arenavirus yang patogen bagi manusia merupakan virus
zoonosis yang dapat ditularkan dari hewan ke manusia. Sebagai contoh adalah penyakit Lassa
fever virus yang merupakan penyebab infeksi kronis pada roden dapat menimbulkan Lassa
Fever suatu penyakit demam berdarahdisertai gangguan fungsi hati dan ginjal pada manusia
di Afrika Barat.
Virologi 70
5. Coronaviridae
Coronavirus adalah virus dengan virion berselubung yang berbentuk pleomorfik atau
sferis dengan diameter 70-160 nm mengandung genom single stranded RNA yang positif dan
tidak bersegmen. Nukleokapsid virus ini berbentuk helikal, mempunyai ukuran garis tengah
antara 11-13 nm.Terdapat 4 struktur protein utama pada Coronavirus yaitu : protein N
(nukleokapsid), glikoprotein M (membran), glikoprotein spike S (spike), protein E (selubung).
Morfologi virusnya mirip Orthomyxovirus. Infeksi pada manusia disebabkan oleh Human
Coronavirus (HcoV) dan Human Enteric Corona Virus (HECV). Virus ini dapat diisolasi dari
saluran napas bagian atas dari penderita yang mengalami demam. Coronavirus diduga sebagai
penyebab penyakit SARS (Severe Acute Respiratory Syndrome), selain itu pada manusia dapat
pula menyebabkan gangguan pada sistem pencernaan dan sistem saraf pusat. Contoh
penyakitnya adalah:
Virologi
71
Penyebab
SARS tampaknya disebabkan oleh jenis baru dari coronavirus sedangkan coronavirus
lainnya menyebabkan flu biasa atau menulari berbagai binatang. SARS menyebar dari
hubungan tatap muka, kemungkinan dengan menghirup tetesan bersin atau batuk orang yang
tertular. Hal tersebut bisa juga menyebar dengan terkena ludah orang yang tertular dan
kemudian memegang hidung, mulut, atau mata. Kebanyakan yang tertular adalah orang yang
berhubungan dekat dengan orang yang tertular seperti perawat kesehatan, anggota keluarga,
atau orang yang berada di sekitar penderita ketika duduk di pesawat atau tempat tidur di
rumah sakit. Meskipun begitu beberapa orang yang menderita SARS bisa belum pernah
berhubungan dekat dengan orang yang tertular, dan banyak orang yang berhubungan dekat
dengan orang yang tertular tidak terkena. Virus juga terdapat di tinja, dan beberapa orang
tampak telah tertular setelah terkena langsung dengan persediaan air yang tercemari oleh
kotoran.
Gejala
Gejala-gejala dimulai sekitar 2 sampai 10 hari setelah terkena virus. Gejala awal
menyerupai lebih dari infeksi umum dan termasuk demam, sakit kepala, menggigil, dan sakit
otot, hidung basah, dan luka kerongkongan tidak biasa. Sekitar 3 sampai 7 hari kemudian,
batuk kering dan kesulitan bernafas bisa muncul. Kebanyakan orang sembuh dalam 1 sampai
2 minggu. Meskipun begitu, sekitar 10 sampai 20% muncul kesulitan bernafas akut,
mengakibatkan tidak tercukupinya oksigen di dalam darah. Sekitar 10% orang yang tertular
meninggal. Kematian disebabkan kesulitan bernafas.
Diagnosa
SARS dicurigai hanya jika orang yang sudah terpapar dengan orang yang tertular
mengalami demam disertai batuk atau kesulitan bernafas. Orang bisa terkena jika dalam 10
hari ke belakangmereka melakukan perjalanan ke daerah dimana SARS akhir-akhir ini
dilaporkan atau telah berhubungan tatap muka dengan orang yang menderita SARS.
Jika seorang dokter mencurigai SARS, sinar X pada dada biasanya dilakukan. Dokter
mengambil ludah dari hidung dan tenggorokan orang tersebut untuk berusaha mengenali
virus tersebut. Contoh dahak bisa jadi diteliti. Darah dites untuk infeksi SARS ketika infeksi
pertama kali dikenali dan dilakukan lagi setelah 3 minggu kemudian. Jika orang tersebut
mengalami kesulitan bernafas, tes darah lainnya kemungkinan diperlukan. Karena SARS adalah
penyakit menular yang baru dikenali.
Pencegahan
Pencegahan paling utama adalah dengan tidak mengunjungi ke wilayah yang sudah
terjangkit SARS, karena sebagian besar infeksi terjadi di sini. Apabila tidak memungkinkan,
sebisa mungkin hindari berdekatan dengan penderita atau penderita bergejala sama, dan
gunakan selalu masker penutup hidung dan mulut serta sarung tangan. Pemakaian masker
dan sarung tangan ditujukan untuk menghindari penularan melalui cairan dan udara (debu).
Jika Anda baru pulang dari luar negara yang terkena wabah SARS, setidaknya dalam 10
hari pertama harus waspada terhadap gejala SARS dan segera berobat jika gejala-gejalanya
muncul. Selain itu perkuat daya tahan tubuh dengan makan makanan bergizi, istirahat cukup,
dan berolahraga teratur. Dan tentu saja, jaga kebersihan tubuh, misalnya segera mencuci
tangan setelah berada ditempat umum.
Virologi 72
Jika dokter menduga seseorang menderita SARS, orang tersebut diisolasi di sebuah
ruangan dengan sistem ventilasi yang membatasi penyebaran mikroorganisme di udara. Jika
setelah 72 jam isolasi gejala tidak meningkat menunjukkan SARS, orang tersebut biasanya
bebas melanjutkan aktifitas biasa. Ketika pekerja pemerhati kesehatan memperhatikan
seseorang yang menderita SARS mereka menggunakan masker, kacamata, jubah, dan sarung
tangan (WHO,2004).
6. Retroviridae
Retrovirus adalah virus berselubung yang mempunyai garis tengah antara 90-120 nm,
mempunyai genom single-stranded RNA dengan virion yang mengandung reverse
transcriptase.Didalam kelompok Retrovirus termasuk virus-virus penyebab leukemia dan
sarkoma yang menyerang manusiamaupun hewan.
7. Bunyaviridae
Famili Bunyaviridae mempunyai anggota lebih dari 350 jenis virus Arbovirusyang
ditularkan oleh serangga. Sifat famili virus ini meliputi jenis virus yang berselubung,
mempunyai bentuk pleiomorfik, dengan nukleokapsid helikal, memiliki partikel virion
berbentuk sferis/pleomorfik denganukuran garis tengah antara 80-120 nm. Virus-virus famili
ini memperbanyak diri di dalam sitoplasma dan membentuk selubung dengan cara
membentuk tunas kearah bagian dalam golgi aparatus. Genom terbentuk dari negative single
stranded RNA yang bersegmen tiga.
Terdapat 5 genus virus dalam famili ini, yaitu Bunyavirus, Phlebovirus, Nairovirus,
Hantavirus, Topsovirus. Bunyavirus termasuk dalam kelompok Arbovirus yang hampir
semuanya ditularkan oleh nyamuk sedangkan berbagai jenis vertebrata dapat bertindak
sebagai hospes.
8. Orthomyxoviridae
Orthomyxovirus mempunyai selubung dengan partikel berbentuk bulat atau berfilamen,
berukuran 80-120 nm, mengandung genom single stranded RNAdan menunjukkan gambaran
simetri helikal. Pada permukaan virus terdapat tonjolan yang mempunyai hemaglutinin (HA)
dan neuraminidase (NA). Nukleokapsid helikal berukuran antara 9-15nm dengan RNA plus
protein N, sebanyak 8 segmen dengan polimerase terdiri dari 3 jenis protein. Membran lipid
terdiri dari 2 lapis. Pematangan virus terjadi pada membran sel dengan cara budding. Semua
jenis Orthomyxovirus merupakan virus penyebab
influenza yang dapat menyerang hewan maupun manusia. (Soedarto, 2010) Contoh
penyakit yang ditimbulkan adalah :
Influenza
Penyakit flu atau yang terkadang disebut sebagai penyakit influenza pasti sudah tidak
asing bagi kita semua. Penyakit flu ini termasuk jenis penyakit yang sering menyerang
masyarakat terlebih pada saat musim hujan dan musim pancaroba(pergantian musim),
penyakit flu merupakan penyakit musiman di Indonesia. Flu merupakan penyakit infeksi
salurannafas yang menyerang manusia tanpa mengenal umur, jenis kelamin, dll. Umumnya
penyakit flu bisa sembuh dengan sendirinya dengan masa inkubasi rata- rata selama 2-4 hari.
Definisi
Virologi
73
Influenza yang dikenal sebagai flu adalah penyakit pernapasan yang sangat menular dan
disebabkan oleh virus influenza tipe A, B dan bisa juga C.
Influenza merupakan suatu penyakit infeksi akut saluran pernapasan terutama ditandai
oleh demam, menggigil, sakit otot, sakit kepala dan sering disertai pilek, sakit tenggorok dan
batuk non produktif.
Influenza adalah penyakit infeksi yang dapat menyerang burung dan mamalia yang
disebabkan oleh virus RNA famili orthomyxoviridae.
Epidemiologi
Influenza merupakan penyakit yang dapat menjalar dengan cepat di lingkungan
masyarakat. Walaupun ringan, penyakit ini tetap berbahaya untuk mereka yang berusia sangat
muda dan orang dewasa dengan fungsi kardiopulmoner yang terbatas. Juga pasien yang
berusia lanjut dengan penyakit ginjal kronik atau ganggugan metabolik endokrin dapat
meninggal akibat penyakit yang dikenal tidak berbahaya ini.
Resiko komplikasi, kesakitan, dan kematian influenza lebih tinggi pada individu di atas
65 tahun, anak-anak usia muda, dan individu dengan penyakit-penyakit tertentu.Di Indonesia
telah ditemukan kasus flu burung pada manusia, dengan demikian Indonesia merupakan
negara ke-lima di Asia setelah Hongkong, Thailand, Vietnam dan Kamboja yang terkena flu
burung pada manusia.
Etiologi
Pada saat ini dikenal 3 tipe virus influenza yakni A, B dan C. Ketiga tipe ini dapat
dibedakan dengan complement fixasion test.
- Tipe A merupakan virus penyebab influenza yang bersifat epidemik.
- Tipe B biasanya hanya menyebabkan penyakit yang lebih ringan dari tipe A dan
kadangkadang saja sampai mengakibatkan epidemi.
- Tipe C adalah tipe yang diragukan patogenitasnya untuk manusia, mungkin hanya
menyebabkan gangguan ringan saja. Virus penyebab influenza merupakan suatu
orthomixovirus golongan RNA dan berdasarkan namanya sudah jelas bahwa virus ini
mempunyai afinitas untuk myxovirus.
Virus influenza A dibedakan menjadi banyak subtipe berdasarkan tanda berupa tonjolan
protein pada permukaan sel virus. Ada 2 protein petanda virus influenza A yaitu protein
hemaglutinin dilambangkan dengan H dan protein neuraminidase dilambangkan dengan N.
Ada 15 macam protein H, H1 hingga H15, sedangkan N terdiri dari sembilan macam, N1 hingga
N9. Kombinasi dari kedua protein ini bisa menghasilkan banyak sekali varian subtipe dari virus
influenza tipe A.
Semua subtipe dari virus influenza A ini dapat menginfeksi unggas yang merupakan
pejamu alaminya, sehingga virus influenza tipe A disebut juga sebagai avian influenza atau flu
burung. Sebagian virus influenza A juga menyerang manusia, anjing, kuda dan babi. Variasi
virus ini sering dinamai dengan hewan yang terserang, seperti flu burung, flu manusia, flu babi,
flu kuda dan flu anjing. Subtipe yang lazim dijumpai pada manusia adalah dari kelompok H1,
H2, H3 serta N1, N2 dan disebut human influenza.
Virologi 74
Sekarang ini dihebohkan dengan penyakit flu burung atau avian influenza dimana
penyebabnya adalah virun influenza tipe A subtipe H5N1. Virus avian influenza ini digolongkan
dalam Highly Pathogenic Avian Influenza (HPAI).
Patogenesis
Transmisi virus influenza lewat partikel udara dan lokalisasinya pada traktus
respiratorius.Penularan bergantung pada ukuran partikel (droplet) yang membawa virus
tersebut masuk ke dalam saluran napas. Pada dosis infeksius, 10 virus/droplet, maka 50%
orang-orang yang terserang dosis ini akan menderita influenza. Virus akan melekat pada epitel
sel di hidung dan bronkus. Setelah virus berhasil menerobos masuk kedalam sel, dalam
beberapa jam sudah mengalami replikasi. Partikel-partikel virus baru ini kemudian akan
menggabungkan diri dekat permukaan sel, dan langsung dapat meninggalkan sel untuk pindah
ke sel lain. Virus influenza dapat mengakibatkan demam tetapi tidak sehebat efek pirogen
lipopoli-sakarida kuman gram-negatif. Masa inkubasi dari penyakit ini yakni satu hingga empat
hari (rata-rata dua hari). Pada orang dewasa, sudah mulai terinfeksi sejak satu hari sebelum
timbulnya gejala influenza hingga lima hari setelah mulainya penyakit ini. Anak-anak dapat
menyebarkan virus ini sampai lebih dari sepuluh hari dan anak-anak yang lebih kecil dapat
menyebarkan virus influenza kira-kira enam hari sebelum tampak gejala pertama penyakit ini.
Para penderita imunocompromise dapat menebarkan virus ini hingga berminggu-minggu dan
bahkan berbulan-bulan.
Pada avian influenza (AI) juga terjadi penularan melalui droplet, dimana virus dapat
tertanam pada membran mukosa yang melapisi saluran napas atau langsung memasuki alveoli
(tergantung dari ukuran droplet). Virus selanjutnya akan melekat pada epitel permukaan
saluran napas untuk kemudian bereplikasi di dalam sel tersebut. Replikasi virus terjadi selama
4-6 jam sehingga dalam waktu 10 singkat virus dapat menyebar ke sel-sel di dekatnya. Masa
inkubasi virus 18 jam sampai 4 hari, lokasi utama dari infeksi yaitu pada selsel kolumnar yang
bersilia. Sel-sel yang terinfeksi akan membengkak dan intinya mengkerut dan kemudian
mengalami piknosis. Bersamaan dengan terjadinya disintegrasi dan hilangnya silia selanjutnya
akan terbentuk badan inklusi. Adanya perbedaan pada reseptor yang terdapat pada membran
mukosa diduga sebagai penyebab mengapa virus AI tidak dapat mengadakan replikasi secara
efisien pada manusia.
Pencegahan
Yang paling pokok dalam menghadapi influenza adalah pencegahan. Infeksi dengan
virusinfluenza akan memberikan kekebalan terhadap infeksi virus yang homolog. Karena
sering terjadi perubahan akibat mutasi gen, antigen pada virus influenza akan berubah,
sehingga seseorang masih mungkin diserang berulang kali dengan jalur (strain) virus influenza
yang telah mengalami perubahan ini. Vaksin influenza mengandung virus subtipe A dan B saja
karena subtipe C tidak berbahaya dan diberikan dengan cara 0,5 ml subkutan atau
intramuskuler. Vaksin ini dapat mencegah tejadinya mixing dengan virus yang sangat
pathogen seperti H5N1 yang dikenal sebagai penyakit avian influenza atau flu burung. Nasal
spray flu vaccine (live attenuated influenza vaccine) dapat juga digunakan untuk pencegahan
flu pada usia 5-50 tahun dan tidak sedang hamil. Vaksinasi perlu diberikan 3-4 minggu sebelum
terserang influenza namun kekebalan yang diperoleh melalui vaksinasi sekitar 70%. Ada
beberapa kebiasaan yang di sarankan untuk dilakukan sebagai upaya pencegahan lebih dini
Virologi
75
adalah mencuci tangan sesering mungkin, jangan menutup mulut dengan tangan jika bersin,
jangan menyentuh muka, minum banyak air, menghirup udara segar, olah raga secara teratur,
konsumsimakanan bergizi tinggi, dan relaksasi.
1. Paramyxoviridae
Paramyxovirus anggota famili ini morfologinya mirip Orthomyxovirus, mempunyai virion
dengan ukuran diameter antara 150-300 nm dan panjang antara 1000-10.000 nm.
Nukleokapsid helikal berukuran 18 nm, dan single- stranded RNA dengan Nukleokapsid
protein (NP) yang tidak bersegmen. Terdapat 2 tonjolan duri yaitu yang terbentuk
dariglikoprotein HN (hemagglutinin-neuraminidase) / H (hemaglutinin)/ Glycoprotein (GP) dan
gliikoprotein F (Fusion glycoprotein). Nukleokapsid dan hemaglutinin virus ini terbentuk di
dalam sitoplasma. Virus-virus anggota Paramyxoviridae yang dapat menimbulkan penyakit
pada manusia adalah virus penyebab parotitis epidemica (mumpsvirus), parainfluenza dan
virus respiratory syncytial. Berbeda dengan virus influenza, Paramyxovirus secara genetik
umumnya lebih stabil.
Virologi 76
nyeri rahang bagian belakang saat mengunyah dan adakalanya disertai kaku rahang (sulit
membuka mulut).Selanjutnya terjadi pembengkakan kelenjar di bawah telinga (parotis)
yang diawali dengan pembengkakan salah satu sisi kelenjar kemudian kedua kelenjar
mengalami pembengkakan.Pembengkakan biasanya berlangsung sekitar 3 hari kemudian
berangsur mengempis.Kadang terjadi pembengkakan pada kelenjar di bawah rahang
(submandibula) dan kelenjar di bawah lidah (sublingual). Pada pria akil balik adakalanya
terjadi pembengkakan buah zakar (testis) karena penyebaran melalui aliran darah.
Diagnosis
Diagnosis ditegakkan bila jelas ada gejala infeksi parotitis epidemika pada pemeriksaan
fisis, termasuk keterangan adanya kontak dengan penderita penyakit gondong (Mumps atau
Parotitis) 2-3 minggu sebelumnya. Selain itu adalah dengan tindakan pemeriksaan hasil
laboratorium air kencing (urin) dan darah.
PemeriksaanLaboratorium
Disamping leucopenia dengan limfosiotsis relatif, didapatkan pula kenaikan kadar
amylase dengan serum yang mencapai puncaknya setelah satu minggu dan kemudian menjadi
normal kembali dalam dua minggu.
Jika penderita tidak menampakkan pembengkakan kelenjar dibawah telinga, namun
tanda dan gejala lainnya mengarah ke penyakit gondongan sehingga meragukan diagnose,
maka dokter akan menganjurkan untuk dilakukan pemeriksaan lebih lanjut seperti serum
darah. Sekurang-kurangnya ada 3 uji serum (serologis) untuk membuktikan spesifik mumps
antibodies: Complement fixation antibodies (CF), Hemagglutination inhibitor antibodies (HI),
Virus neutralizing antibodies (NT).
Pencegahan
Pemberian vaksinasi gondongan merupakan bagian dari imunisasi rutin pada masa
kanak-kanak, yaitu imunisasi MMR (mumps, morbili, rubela) yang diberikan melalui injeksi
pada usia 15 bulan.
Virologi
77
Imunisasi MMR dapat juga diberikan kepada remaja dan orang dewasa yang belum
menderita Gondong. Cukup mengkonsumsi makanan yang mengandung kadar Iodium,
dapatmengurangi resiko terkena serangan penyakit gondongan( Jawet, 2010).
2. Rhabdoviridae
Rhabdovirus yang menjadi anggota famili ini memiliki virion yang berbentuk seperti
peluru dengan ukuran sekitar 75x150 nm. Selubung virus mempunyai tonjolan-tonjolan
berukuran panjang 10 nm. Genom yang single-stranded RNA negative-sense tidak mempunyai
segmen. Partikel virus terbentuk secara budding yang menonjol dari membran sel. Rabies
virus termasuk anggota dari Rhabdovirus ( Soedarto,2014). Contoh penyakit yang dapat
ditimbulkan:
Rabies
Rabies atau umumnya dikenal sebagai penyakit anjing gila adalah penyakit serius yang
menyerang otak dan sistem saraf. Penyakit ini digolongkan sebagai penyakit mematikan yang
harus ditangani dengan cepat. Virus yang mematikan ini menyebar ke manusia dari air liur
hewan yang terinfeksi dan biasanya ditularkan melalui gigitan.
Gejala
Waktu yang dibutuhkan virus rabies untuk inkubasi sangat bervariasi, namun biasanya
antara dua minggu sampai tiga bulan. Pada kasus yang jarang terjadiinkubasi virus terjadi
hanya dalam waktu empat hari. Masa inkubasi adalah jarak waktu ketika virus pertama kali
masuk ke tubuh sampai gejala muncul.
Setelah tergigit hewan berpenyakit rabies, virus akan berkembang biak di dalam tubuh
inang. Selanjutnya virus-virus tersebut akan menuju ujung saraf dan berlanjut menuju saraf
tulang belakang serta otak yang mana perkembangbiakan terjadi dengan sangat cepat. Setelah
itu virus rabies menyebar ke paru-paru, kelenjar air liur, hati, ginjal, dan organ-organ lainnya.
Gejala-gejala penyakit rabies pada manusia antara lain demamtinggi, rasa gatal di bagian
yang terinfeksi, perubahan perilaku menjadi agresif, dan takut terhadap air atau hidrofobia.
Sedangkan pada hewan, gejala hampir serupa dengan manusia, namun tanpa hidrofobia.
Ketika gejalapenyakit rabies memasuki fase akhir, baik manusia atau hewan yang
mengalaminya bisa mengalami kematian.
Penyebab
Virus rabies berasal dari kelompok lyssaviruses dan menyerang mamalia. Semua hewan
mamalia sebenarnya bisa membawa atau menularkan virus ini (termasuk mamalia ternak
seperti kambing, sapi, dan kuda). Namun yang paling umum adalahanjing, kucing, monyet,
kelelawar, luwak, dan rubah. Di negara-negara berkembang terutama di Afrika dan Asia
(termasuk Indonesia), sebagian besar kasus rabies disebabkan oleh gigitan anjing.
Virus rabies yang menginfeksi hewan-hewan tersebut dapat menular pada manusia
melalui gigitan, cakaran, jilatan, atau bahkan semburan air liur yang mengenai mata dan bekas
luka pada kulit manusia. Terkait kasus penularan rabies dari manusia ke manusia, sejauh ini
biasanya disebabkan oleh transplantasi atau pencangkokan organ. Namun kasuskasus seperti
itu jarang terjadi di Indonesia.
Virologi 78
Setelah masuk ke tubuh, virus rabies akan memperbanyak diri sebelum menyebar ke
ujung saraf. Selanjutnya virus akan menuju saraf tulang belakang dan otak. Dari sistem saraf
pusat inilah virus rabies kemudian menyebar ke paru-paru, ginjal, kelenjar ludah, serta organ
lainnya.
Seseorang yang tinggal di wilayah rawan rabies atau bepergian ke wilayah tersebut
berisiko tinggi terjangkit rabies. Selain itu, orang yang sering berinteraksi dengan mamalia,
seperti pengurus kebun binatang atau dokter hewan, orang yang suka mengeksplorasi alam
liar (salah satunya adalah gua), dan ilmuwan yang meneliti virus rabies di laboratorium juga
berpotensi tinggi terjangkit penyakit ini.
Virologi
79
Pemeriksaan Penunjang Rabies
a. Kultur virus dan Polymerase Chain Reaction (PCR) Assay
b. Saliva: hasil kultur saliva untuk virus rabies positif dengan kadar yang rendah dalam waktu
2 minggu dari onset penyakit, Cairan serebrospinal, hematologi
c. Jaringan otak, Analisis Gas Darah, Cairan serebrospinal
d. Urinalisis, radiologi, elektroensefalografi, monitoring jantung
e. Nucleic Acid Sequence-Based Amplification (NASBA)
f. Serologi, biopsi kulit, temuan histopatologis
Pencegahan
Melakukan vaksinasi pada hewan peliharaan, mengawasi hewan peliharaan saat berada di
luar ruangan, mengurangi populasi hewan liar yang ada di lingkungan, tidak memegang
hewan liar, dan berhati-hatilah saat bepergian ke luar negeri.
Virologi 80
Spesies : Poliovirus (penyebab polio)
b. Klasifikasi Virus Berdasarkan Asam Nukleatnya
Virus RNA
Contoh:Orthomyxoviruses, Paramyxoviruses, Rhabdoviruses, Picornaviruses, Togaviruses,
Reoviruses, Retroviruses.
c. Klasifikasi Virus Berdasarkan Bentuk Dasar
Virus bentuk Ikosahedral, bentuk tata ruang yang dibatasi oleh 20 segitiga sama sisi, dengan
sumbu rotasi ganda (Contoh : virus polio dan adenovirus).
Virus bentuk Heliks, menyerupai batang panjang, nukleokapsid merupakan suatu
struktur yang tidak kaku dalam selaput pembungkus lipoprotein yang berumbai dan berbentuk
heliks, memiliki satu sumbu rotasi. Pada bagian atas terlihat RNA virus dengan kapsomer
(Contoh : virus influenza dan TMV).
d. Klasifikasi Virus Berdasarkan Ada Tidaknya Selubung Yang Melapisi
Nukleokapsid Virus berselubung, mempunyai selubung yang tersusun atas
lipoprotein atau glikoprotein. Contoh: Poxvirus, Herpesviruses,
Orthomyxoviruses, Paramyxoviruses, Rhabdoviruses, Togaviruses,
Retroviruses.
e. Klasifikasi Virus Berdasarkan Jumlah Kapsomer Virus dengan 60
kapsomer. Contohnya picornavirus.
f. Klasifikasi Virus Berdasarkan Sel Inangnya
Virus yang menyerang manusia (contohnya HIV) dan virus yang menyerang hewan
(Contohnya rabies).
g. Klasifikasi Virus Berdasarkan Tempat Hidupnya
Virus hewan, Virus yang parasit pada sel hewan.Contoh : virus Poliomylitis, virus
Vaccina, dan virus Influenza.
Virus diklasifikan menjadi 7 kelompok berdasarkan alur fungsi genomnya. Klasifikasi ini disebut
juga klasifikasi Baltimore yaitu: Virus Tipe III = RNA Utas Ganda
• Virus Tipe IV = RNA Utas Tunggal (+)
• Virus Tipe V = RNA Utas Tunggal (-)
• Virus Tipe VI = RNA Utas Tunggal (+) dengan DNA perantara Virus Tipe VII = DNA Utas
Ganda dengan RNA perantara
Virologi
81
1. Transkripsi : menggunakan DNA sebagai cetakan disistesis RNA messenger. Proses ini
terdiri atas 3 tahap, yaitu:
a. Inisiasi : enzim RNA polymerase menyalin gen, sehingga terjadi pengikatan RNAp dengan
promoter (tempat pertemuan antara gen/DNA dengan RNAp) yang akan memberikan
inisiasi transkripsi. Selanjutnya, RNAp akan membuka double heliks DNA (untai ganda)
yang berfungsi sebagai cetakan yakni rantai sense.
b. Elongasi : RNAp akan bergerak sepanjang untai ganda DNA, membuka double heliksdan
merangkai ribonukleotida ke ujung 3’ ribonukleotida yang sedang tumbuh, sehingga
dihasilkan rantai RNA yang di dalamnya mengandung urutan basa nitrogen pertama
sebagai hasil perekaman. Jika hasil perekaman sudah mencapai 30 buah, suatu senyawa
kimia yang berperan sebagai penutup untuk memberikan sinyal inisiasi tahap translasi,
dan mencegah terjadinya degradasi RNA akan berikatan dengan ujung 5’ RNA.
c. Terminasi : Proses terminasi ialah terhentinya proses perekaman dan molekul DNA baru
terpisah dari DNA template. Tahap ini ditandai dengan terdiasosiasinya enzim RNAp dari
DNA dan RNA dilepaskan sehingga dihasilkan produk transkripsi yang lengkap disebut
messenger RNA (mRNA).
2. Translasi : merupakan tahap penerjemahan beberapa triplet/kodon dari mRNA menjadi
asam amino yang akhirnya membentuk protein. Setiap triplet terdiri dari urutan basa
nitrogen yang berbeda sehingga akan diterjemahkan menjadi asam amino yang berbeda
pula. Asam amino tersebut akan menghasilkan rantai polipeptida spesifik hingga
terbentuk protein spesifik pula. Proses translasi dapat berupa:
a. Inisiasi : Tahap ini diawali dengan pengenalan kodon AUG yang terdapat pada bagian akhir
mRNA yang disebut juga kodon Start. Kodon AUG akan mengkode pembentukan
metionin. Selanjutnya, metionin dibawa oleh tRNA untuk bergabung melalui
pembentukan ikatan pada subunit besar ribosom sehingga terbentuklah ribosom yang
lengkap. Molekul tRNA pertama yang terikat pada ribosom akan menempati tempat
khusus, yaitu sisi P (Polipeptida) yang akan terbentuk rantai yang dikenal dengan istilah
polipeptida. Sedangkan tRNA berikutnya akan berikatan dengan kodon kedua dan akan
menempati ribosom pada sisi A (asam amino)
b. Elongasi : Tahap ini ditandai dengan pengaktifan asam amino oleh tRNA pada tiap kodon
ke kodon sehingga akan dihasilkan asam amino baru satu per satu.Proses engolasi ini
membuat rantai polipeptida tumbuh semakin panjang akibat asam amino yang terus
bertambah.
c. Terminasi : Proses ini ditandai dengan pertemuan antara antikodon yang dibawa oleh
tRNA dengan UAA, UAG, atau UGA sehingga menyebabkan berhentinya proses translasi.
Akibanya, terlepaslah rantai polipeptida yang dibentuk dari ribosom dan diolah
membentuk protein fungsional.
Latihan
Untuk dapat memperdalam pemahaman Anda mengenai materi di atas, kerjakanlah Latihan
berikut!
Virologi 82
Jelaskan tentang :
1. Famili-Famili yang termasuk dalam golongan virus RNA
2. Berikan beberapa contoh penyakit yang dapat ditimbulkan dari virus RNA
3. Pelajari pula tentang tingkat klsifikasi virus RNA
4. Penyakit dari golongan virus famili Orthomyxoviridae, serta berikan contohnya 5. Jelaskan
virus RNA yang bersifat zoonosis
Virus RNA (asam ribonukleat) juga merupakan asam nukleat (polinukleotida yang terdiri
dari unit-unit mononukleotida). RNA merupakan asam nukleat untai tunggal yang terdiri dari
unit-unit pembangun berupa mononukleotida. Setiap nukleotida terdiri atas satu gugus fosfat,
satu gugus pentosa, dan satu gugus basa Nitrogen (N). RNA merupakan hasil transkripsi dari
suatu fragmen DNA, sehingga kedudukan RNA ialah sebagai polimer dan jauh lebih pendek
dibanding DNA.
Famili yang termasuk virus-virus RNA adalah Picornaviridae, Reoviridae, Togaviridae,
Arenaviridae, Coronaviridae, Retroviridae, Bunyaviridae, Orthomyxoviridae, Paramyxoviridae,
Rhabdovirus. Berbagai famili virus RNA dapat menimbulkan penyakitpenyakit zoonosis yang
dapat ditularkan dari hewan ke manusia atau sebaliknya dari manusia ke hewan. Poliovirus
yang termasuk Enterovirus dari famili Picornaviridae. Coxsackie virus yang juga termasuk
Enterovirus dapat menimbulkan berbagai penyakit dan gangguan kesehatan pada manusia,
antara lain : aseptic meningitis, hepatitis A virus. Enterovirus yang juga anggota Enterovirus
pada manusia dapat menimbulkan aseptic meningitis.Famili Reoviridae yang dapat juga
menyebabkan penyakit pada manusia antara lain Reovirus menimbulkan diare. Paramyxovirus
dari famili Paramyxoviridae adalah penyebab penyakit rabies. Coronaviridae diduga
merupakan penyebab infeksi saluran pernapasan pada manusia, misalnya SARS (Severe Acute
Respiratory Syndrom). Famili Retroviridae, pengaruhya pada manusia masih belum jelas,
tetapi pada hewan dapat menyebabkan leukemia.
Virologi
83
1. Termasuk Enterovirus dari famili Picornaviridae dimasa lalu sering menjadi epidemi
diberbagai daerah di seluruh dunia.Penyakit yang dapat ditimbulkan adalah
A. Rabies
B. Sars
C. Influenza
D. Mumps
E. Poliomielitis
3. Penggunaan vaksin polio oral hidup telah diganti dengan vaksin polio tidak aktif di
berbagai negara. Alasan terjadinya hal ini karena
A. Lebihefektif dari segi biaya untuk menggunakan vaksin tidak aktif
B. Di daerah yang sudah mengalami erdikasi poliovirus, resiko penyakit akibat vaksin jauh
lebih besar darpada penyakit akibat virus liar
C. Hanya diperlukan satu dosis vaksin tidak aktif dibandingkan dengan vaksin oral yang
perlu diberikan berkali-kali
D. Galur poliovirus dalam sirkulasi telah berubah sehingga vaksin hidup tidak lagi efektif
E. Pemberian vaksin ini hanya diperlukan sekali dalam seumur hidup
5. Adanya badan inklusi sitoplasma eosinofilik dalam neuron disebut badan negri,
merupakan ciri khas infeksi sistem saraf pusat. Berikut yang benar
A. Penyakit Borna
B. Rabies
Virologi 84
C. Hepatitis
D. Mumps
E. Ensefalitis pasca vaksinasi
6. Seorang anak laki-laki menderita penyakit demam akut. Diagnosa dokter adalah
gondongan, organ yang paling sering menunjukkan tanda dari gondongan adalah A. Paru
B. Ovarium
C. Kelenjar parotis
D. Kulit
E. Testis
7. Mana dari paramyxovirus berikut yang memiliki glikoprotein permukaan HN yang tidak
mempunyai aktifitas hemaglutinin
A. Virus campak
B. Virus gondongan
C. Virus parainfluenza tipe 1
D. Respiratory syncytial virus
E. Virus rubella
9. Epidemi SARS coronavirus pada tahun 2002-2003 menyebabkan banyak kasus dan
kematian. Apa jalur utama transmisi coronavirus manusia
A. Fekal-oral
B. Respirasi
C. Darah
D. Perinatal dari ibu ke bayi
E. Aktifitas seksual
10. Wabah SARS ditandai dengan pneumonia dan gagal napas progresif, pencegahan atau
terapi penyakit ini dapat dilakukan dengan
A. Vaksin subunit
B. Vaksin hidup yang dilemahkan dan diadaptasikan dengan dingin
Virologi
85
C. Obat antivirus amantadine
D. Standart pengendaliann infeksi ,termasuk isolasi dan pemakaian alat pelindung diri E.
Obat antivirus asiklovir
12. Virus flu burung banyak sekali tipenya, tetapi yang paling berbahaya adalah tipe
A. H1N5 B. H5N1 C. H5N5 D. H1N1
E. H4N5
Virologi 86
Kunci Jawaban Tes
Test Formatif 1
1. B 6. C 11. B
2. D 7. A 12. A
3. A 8. C 13. D
4. D 9. A 14. D
5. A 10. C 15. A
Test Formatif 2
1. E 6. C 11. A
2. A 7. D 12. B
3. B 8. A 13. A
4. E 9. B 14. C
5. B 10. D 15. E
Virologi
87
Glosarium
Aerofobia : kegelisahan yang hebat bergantian dengan sikap tenang dan
berdiam diri, puncak dari kkegelisahan akan meningkat
menjadi ketakutan yang mencekam dan halusinasi pada
penderita rabies.
Akson : jalur transmisi utama sistem saraf dan mereka membantu
membuat saraf. Aksonmerupakan individual berukuran
sekitar satu mikro
Anemia hemolotik : kondisi di mana hancurnya sel darah merah (eritrosit) lebih
cepat dibandingkan pembentukannya. Kondisi tersebut
menyebabkan sel darah merah tidakmemiliki masa hidup
seperti sel normal
Asimtomatik : tanpa gejala
Badan inklusi : merupakan protein-protein yang dihasilkan dari virus
Budding : keluarnya virus complete dari sel inang
Endemik : suatu keadaan dimana penyakit secara menetap berada
dalam masyarakat pada suatu tempat atau populasi tertentu
Virologi 88
Sindrom Guillain- : sebuah gangguan sistem kekebalan tubuh yang menyerang
Barré saraf. Lemah dan kesemutan pada kaki, biasanya menjadi
gejala yang paling awal. Sensasi ini dapat dengan cepat
menyebar, yang akhirnya dapat melumpuhkan seluruh tubuh
orang tersebut
Splenomegali : pembesaran limpa, keadaaan ini biasanya terjadi akibat
proliferasi limfosit dalam limpa karena infeksi di tempat lain
tubuh
Talasemia : sebuah penyakit kelainan yang terjadi pada sel darah
manusia
Vaksin kwadrivalen : merupakan salah satu jenis vaksin HPV
Virion : partikel virus yang utuhsecara struktural dan menular
Virus Onkogenik : virus yang dapat menyebabkan perubahan-perubahan yang
mempengaruhi proses onkogenesis. Onkogenesis adalah
hasil akumulasi berbagai perubahan genetik yang mengubah
ekspresi atau fungsi protein yang penting dalam
pengendalian pertumbuhan dan pembelahan sel.
Virologi
89
Daftar Pustaka
Centers for Disease Control and Prevention CDC. 2017. Human Papillomavirus (HPV). Genital
HPV Infection - Fact Sheet.Atlanta : Departementof Healt & Human Services
Davis, CP. Medicine Net. 2016. Hepatitis (Viral Hepatitis A,B,C,E,G),America : American Board
of Internal Medicine
Jawet, Melnick, and Adelberg. 2014. Mikrobiologi Kedokteran Edisi 25. Jakarta : Buku
Kedokteran EGC
Kuswiyanto. 2016. Buku Ajar Virologi Untuk Analis Kesehatan. Jakarta : Buku kedokteran EGC
Kate Rittenhouse, Olson and Ernesto De Nardin. 2017. Immunologi dan Serologi Klinis Modern.
Jakarta : Buku Kedokteran EGC
WHO. 2017. Immunization and Biological Human papillomavirus (HPV). Geneva : World Health
Organization
Virologi 90
Bab 3 REPRODUKSI VIRUS
Iis Kurniati S.Pd., M.Kes.
Pendahuluan
hanya terjadi jika berada dalam sel organisme lain. Dengan demikian, virus hanya
V irus menunjukan satu ciri kehidupan, yaitu reproduksi. Namun, reproduksi virus
dapat hidup secara parasit. Virus memperbanyak diri hanya di dalam sel-sel hidup.
Sel penjamu harus menyediakan energi dan peralatan sintetis serta perkusor
berberat-molekul-rendah untuk sintetis protein dan asam nukleat virus. Asam nukleat virus
mengandung spesifisitas genetik untuk menjadi semua makromolekul spesifik-virus dalam
cara yang sangat terorganisasi.
Virus memperbanyak diri dengan cara menyuntikkan materi genetik (DNA atau RNA) ke
dalam sel target, materi genatik virus itu akan diterjemahkan oleh sel target untuk
menghasilkan bagian-bagian tubuh virus baru. Proses penerjemahan materi genetik hanya
dapat dilakukan oleh sel-sel yang masih hidup, sedangkan sel mati tidak mampu melakukan
proses tersebut. Virus-virus yang bereproduksi dalam sel akan menyebabkan sel tersebut lisis
(pecah) karena aktivitas virus baru yang telah terbentuk. Virus-virus yang memperbanyak diri
juga menyebabkan timbulnya beragam penyakit dalam tubuh tumbuhan, hewan, dan
manusia.
Virus dapat berkembang biak dalam sel bakteri, sel hewan dan tumbuhan. Untuk
menjelaskan perkembangbiakan virus biasanya digunakan contoh virus yang menyerang
bakteri (bakteriofaga). Misalnya virus yang berkembang biak pada bakteri Escherichia coli.
Perkembangbiakan bakteriofaga membentuk suatu daur. Daur bakteriofaga dibagi menajadi
dua, yaitu daur litik dan daur lisogenik.
Pada Bab 3 ini kita akan mempelajari mengenai ruang lingkup reproduksi virus dan
replikasi virus serta konsep bakteriofaga. Setelah mempelajari bab ini, mahasiswa akan
mampu :
1. Menjelaskan tentang konsep reproduksi virus.
2. Menjelaskan tentang replikasi virus secara litik.
3. Menjelaskan tentang replikasi virus secara lisogenik
4. Menjelaskan tentang konsep bakteriofaga.
5. Menjelaskan tentang konsep jenis-jenis bakteriofaga.
Manfaat mempelajari bab ini adalah membantu Saudara untuk dapat memahami lebih
dalam tentang bagaimana virus bereproduksi sebagai dasar dalam upaya melaksanakan
Virologi
91
penanganan sampel, serta identifikasi penyakit yang disebabkan oleh virus.Agar memudahkan
Anda mempelajari bab ini, maka materi yang akan dibahas terbagi menjadi 5topik, yaitu:
1. Reproduksi virus, yang membahas secara umum tentang kebutuhan dasar virus untuk
berkembang biak.
2. Konsep bakteriofaga, membahas tentang aspek umum bakteriofaga baik struktur dan
morfologi.
3. Jenis-jenis bakteriofaga, yang membahas tentang jenis dan perkembangan berbagai
macam bakteriofaga beserta perkembangbiakannya.
Selanjutnya agar Saudara berhasil dalam mempelajari materi yang tersaji dalam Bab 3
ini, perhatikan beberapa saran sebagai berikut :
a. Pelajari setiap topik materi secara bertahap
b. Usahakan mengerjakan setiap latihan dengan tertib dan sungguh-sungguh.
Kerjakan tes yang disediakan dan diskusikan bagian-bagian yang sulit Anda pahami
dengan teman sejawat atau tutor, atau melalui pencarian di buku dan internet.
Virologi 92
mengendalikan sel makhluk hidup karena virus tidakmemiliki perlengkapan selular
untuk bereproduksi sendiri.
Istilah virus biasanya merujuk pada partikel-partikel yang menginfeksi sel-sel eukariota
(organisme multisel dan banyak jenis organisme sel tunggal), sementara istilah bakteriofaga
digunakan untuk jenis yang menyerang jenis-jenis sel prokariota (bakteri dan organisme lain
yang tidak berinti sel).
Biasanya virusmengandung sejumlah kecil asam nukleat (DNA atau RNA, tetapi
tidakkombinasi keduanya) yang diselubungi semacam bahan pelindung yang terdiriatas
protein, lipid, glikoprotein, atau kombinasi ketiganya. Genom virus baik protein yang
digunakan untuk memuat bahan genetik, maupun protein yang dibutuhkan dalam daur
hidupnya (Jawetz , 2013).
Virus adalah peralihan antara mahluk hidup dan mahluk tak hidup. Sampai sekarang
masih belum bisa ditentukan apakah virus termasuk kedalam mahluk hidup atau
virustermasuk kedalam benda mati, ada juga yang berpendapat bahwa virus adalah peralihan
antar mahluk hidup dan benda mati (Jawetz, 2013).
Salah satu sifat virus yang hampir-hampir membuatnya dianggap sebagai makhluk hidup
adalah kemampuannya dalam memperbanyak diri (reproduksi). Virus akan memperbanyak
diri dalam sel atau jaringan yang masih hidup. Virus tidak dapat memperbanyak diri dalam sel
yang sudah mati, mengapa demikian?Virus memperbanyak diri dengan cara menyuntikkan
materi genetik (DNA atau RNA) ke dalam sel target, materi genatik virus itu akan
diterjemahkan oleh sel target untuk menghasilkan bagian-bagian tubuh virus baru. Proses
penerjemahan materi genetik hanya dapat dilakukan oleh sel-sel yang masih hidup, sedangkan
sel mati tidak mampu melakukan proses tersebut.
Virus-virus yang bereproduksi dalam sel akan menyebabkan sel tersebut lisis (pecah)
karena aktivitas virus baru yang telah terbentuk. Virus-virus yang memperbanyak diri juga
menyebabkan timbulnya beragam penyakit dalam tubuh tumbuhan, hewan, dan manusia.
Agar suatu virus dapat bereplikasi, protein virus harus disintesis oleh peralatan
penyintesis protein milik sel penjamu. Oleh sebab itu genom virus harus mampu menghasilkan
mRNA yang dapat berfungsi. Telah diindentifikasi berbagai mekanisme yang memungkinkan
mRNA virus berkompetisi dengan mRNA sel untuk menghasilkan protein virus dalam jumlah
yang cukup.
Sifat unik multiplikasi virus adalah segera setelah berinteraksi dengan sel penjamu,
virion penginfeksi menjadi rusak dan infektivitas-nya hilang. Fase dalam siklus pertumbuhan
ini dinamakan periode gerhana (eclipse periode), durasinya beragam bergantung pada virus
maupun sel penjamu, dan diikuti oleh suatu interval terjadinya akumulasi cepat partikel virus
progeni yang infeksius. Periode gerhana sebenarnya merupakan salah satu aktivitas sintetis
yang kuat karena sel diarahkan untuk memenuhi kebutuhan “pembajak virus. Pada sebagian
kasus, segera setelah asam nukleat virus memasuki sel penjamu, metabolisme sel diarahkan
secara ekslusif untuk mensintesis partikel virus baru, dan selanjutnya sel tersebut akan
dihancurkan. Pada kasus lain, proses metabolik sel penjamu tidak berubah secara signifikan,
meskipun sel tadi mensintesis protein dan asam nukleat virus, sel tidak dimatikan.
Setelah disintesisnya asam nukleat dan protein virus komponen-komponen tersebut
dirangkai untuk membentuk virion infeksius baru. Kisaran virus infeksius yang dihasilkan per
Virologi
93
sel-nya sangat bervariasi, darijumlah yang sedikit hingga lebih dari 100.000 partikel. Durasi
siklus replikasi virus juga sangat beragam, mulai dari 6-8 jam (picornavirus) hingga lebih dari
40 jam (beberapa hervesvirus).
Tidak semua infeksi akan menghasilkan keturunan virus baru. Infeksi produktif terjadi
pada sel permisif dan menghasilkan virus infeksius baru. Infeksi abortif gagal menghasilkan
progeni infeksius, baik karena sel penjamu bersifat nonpermisif dan tidak mampu menunjang
ekspresi semua gen virus maupun karena virus penginfeksi bersifat defektif, tidak memiliki
beberapa gen fungsional virus. Infeksi laten dapat terjadi, dengan menetapnya genom virus,
tidak diekspresikannya atau hanya diekspresikannya sedikit gen virus, dan bertahan hidupnya
sel yang terinfeksi. Pola replikasi dapat bervariasi untuk satu jenis virus, bergantung pada jenis
sel penjamu yang diinfeksi.
1. Perlekatan
Langkah pertama dalam infeksi virus adalah perlekatan (interaksi virion dengan situs
reseptor spesifik pada permukaan suatu sel). Molekul reseptor berbeda-beda untuk tiap virus,
tetapi umumnya merupakan kumpulan glikoprotein. Pada sebagian kasus, virus pengikat
sekuens protein (mis, picornavirus) dan pada kasus lain, oligosakarida (mis, orthomyxovirus
dan paramyxovirus. Pengikatan reseptor dipercaya dapat terjadi karena adanya konfigurasi
struktur permukaan virion yang kebetulan homolog dengan komponen permukaan sel.
Sebagai contoh, human immune deficiency virus berikatan dengan reseptor CD4 pada sel-sel
system imun, rhinovirus berikatan dengan reseptor CD4 pada sel-sel system imun, rhinovirus
berikatan dengan ICAM-1, dan virus Eipstein-Barr mengenali reseptor CD21 pada sel B. ada
atau tidak adanya reseptor memainkan peranan penting untuk menentukan tropsime sel dan
pathogenesis virus. tidak semua sel dalam pejamu yang rentan akan mengekspresikan
reseptor yang dibutuhkan; misalnya, poliovirus hanya mampu melekat ke sel-sel pada system
saraf pusat dan saluran cerna primata. Tiap sel yang sensitif dapat mengandung hingga
100.000 situs reseptor untuk satu virus. tahap perlekatan tadi dapat menginisiasi perubahan
struktural yang ireversibel dalam virion.
2. Penetrasi
Setelah peristiwa pengikatan, partikel virus akan dibawa ke dalam sel. Langkah tersebut
dinamakan sebagai penetrasiatau penelanan. Pada sebagian sistem,penetrasi dicapai melalui
endositosis yang dimediasi reseptor, dengan diambilnya partikel virus yang diingesti ke dalam
Virologi 94
endosome. Terdapat pula contoh-contoh penetrasi langsung partikel virus menembus
membrane plasma. Pada kasus lain, tejadi fusi selubung virion dengan membrane plasma sel.
Sistem-sistem tersebut melibatkan interaksi protein fusi virus dengan reseptor seluler kedua
atau “koreseptor” (misal reseptor kemokin untuk human immunodeficiency virus).
Gambar 3.1 Contoh siklus pertumbuhan virus. A: Siklus pertumbuhan virus DNA untai ganda
tak-berselubung. B: Siklus pertumbuhan virus RNA untai-tunggal, sense-positif. Sumber
Microbiology : Basic Principles, edisi keenam. Mc Graw-Hill, 2008)
Virologi
95
Dalam perjalanan replikasi virus, semua makromolekul spesifik virus disintesis dalam
urutan yang sangat terorganisasi. Pada beberapa infeksi virus, khususnya yang melibatkan
virus yang mengandung DNA untai ganda, protein virus dini disintesis segera setelah terjadinya
infeksi dan protein lanjut baru dibuat pada infeksi lanjut, setelah berlangsungnya sintesis DNA
virus. Gen-gen awal mungkin tidak saat produk lanjut tersebut dibuat. Sebaliknya, sebagian
besar bahkan mungkin semua, informasi genetik milik virus yang mengandung RNA
diekspresikan sekaligus. Selain kendali temporal, ada pula kendali kuantitatif karena tidak
semua protein virus diproduksi dalam jumlah yang sama. Protein spesifik virus mungkin
mengatur sejumlah transkripsi genom atau translasi mRNA virus.
Virus-virus kecil hewan dan bakteriofagamerupakan model yang baik untuk mempelajari
ekspresi gen. Sekuens nukleotida total milik banyak virus telah berhasil diindentifikasi. Dari
temuan tersebut, ditemukan ada gen-gen yang bertumpang tindih, yaitu pada sebagian
sequens DNA yang digunakan untuk sintetis dua polipeptida yang berbeda, baik dengan
menggunakan dua kerangka pembacaan yang berbeda, ataupun dengan dua mRNA yang
berbeda dan menggunakan kerangka pembacaan yang sama, tetapi dimulai dari titik yang
berbeda. Sebuah sistem virus (dari adenovirus) pertamakali menunjukan fenomena
pengolahan mRNA yang menyandi protein tertentu diperoleh dari sekuens sekuens yang
terpisah dari cetakan, dengan sekuens sisipan noncoding ‘’dipotong keluar’ dari transkip. Baru-
baru ini, beberapa virus DNA (herpes virus, adenovirus polyomavirus) ditemukan menyandi
microRNA; RNA-RNA kecil (~22 nukleotida) tersebut berfungsi pada tingkat baru dalam
regulasi gen pasca transkipsi, dengan mengantarai degradasi mRNA target atau dengan
menginduksi inhibisi translasi mRNA-mRNA tadi.
Variasi terluas dalam strategi ekspresi gen ditemukan pada virus-virus yang mengandung
RNA (tabel 3.2). Beberapa virion memiliki polimerase (orthomyxovirus, reovirus) dan beberapa
sistem yang lain dengan menggunakan pesan subgenomik, kadangkadang dibentuk melalui
splicing (orthomyxovirus, retrivirus) dan beberapa virus pensintetis prekursor poliprotein
besar yang selanjutnya diolah dan dipecah untuk menghasilkan produk gen akhir
(picornavirus, retrovirus). Protease viral milik human Immunodeficiency virus merupakan
suatu enzim yang dihambat oleh kelas obat antivirus yang dinamakan inhibitor protease
(Jawetz, 2013).
Virologi 96
Tabel 3.1 Jalur Transkripsi Asam Nukleat Pada Berbagai Kelas Virus
Sejauh apa enzim spesifik virus terlibat dalam proses-proses tadi, bervariasi dari grup
yang satu ke grup yang lain. Virus DNA yang bereplikasi di dalam nukleus biasanya
menggunakan polimerase DNA dan polimerase RNA serta enzim pemroses milik sel penjamu.
Virus yang lebih besar (herpesvirus, Foxvirus) lebih independen dalam hal fungsi seluler
mereka dibandingkan dengan virus yang lebih kecil. Inilah salah satu alasan mengapa virus
yang lebih besar lebih sensitif terhadap kemoterapi antivirus, karena lebih banyak proses
spesifik virus yang tersedia sebagai target untuk kerja obat (Jawetz, 2008)
Situs intrasel tempat berlangsungnya sebagai peristiwa dalam replikasi virus bervariasi
antar kelompok virus yang berbeda (tabel 3.2) dapat dibuat beberapa generalisasi. Protein
virus disintesis dalam sitoplasma pada poliribososm yang tersusun atas mRNA spesifik-virus
dan ribosom sel penjamu. Banyak protein virus menjalani modifikasi (glikosilasi, asilasi,
pemecahan dll). DNA virus biasanya mengalami replikasi dalam nukleus. RNA genomik virus
umumnya mengalami duplikasi dalam sitoplasma sel, meskipun terdapat beberapa
pengecualian.
Virologi
97
Tabel 3.2 grouping virus berdasarkan genomik RNA
Virologi 98
efek sitopatik seluler akhirnya timbul dan sel tersebut akan mati. Namun, terdapat beberapa
pengecualian, yaitu sel tidak dirusak oleh virus sehingga terjadi infeksi persisten jangka-
panjang. Mekanisme yang diinduksi-virus mungkin mengatur apoptosis, suatu peristiwa yang
diprogram secara genetik yang mengakibatkan sel mematikan dirinya sendiri. Beberapa infeksi
virus menunda apoptosis dini sehingga mereka dapat menghasilkan virus progeni dalam
jumlah besar. Sementara itu, beberapa virus secara aktif menginduksi apoptosis pada tahap
lanjut untuk memfasilitasi penyebaran virus progeni ke sel-sel baru.
Virologi
99
melalui vaksinasi. Viruslain yang memililkibanyak tipe antigenik (rhinovirus) atau memiliki
antigenyang sering berubah-ubah (virus influenza A) sulit dikontrolmelalui vaksinasi; genetik
virus mungkin dapat membantu mengembangkan vaksin yang lebih efektif. Beberapa
jenisinfeksi virus terus berulang secara repetitif (virus parainfluenza) atau menetap
(retrovirus) meskipun terdapat antibodi; jenis-jenis virus tadi mungkin lebih baik
ditanganidengan obat antivirus. Analisis genetik akan membantumengidentifikasi proses
spesifik-virus yang layak menjaditarget untuk pengembangan terapi antivirus.(Yuwono, 2012).
Istilah-istilah berikut merupakan dasar untuk memahami penjelasan mengenai genetik:
Genotip adalah susunan genetik suatu organisme. Fenotip merupakan sifat organisme
yangdapat diamati yang dihasilkan oleh kombinasi genotip dan lingkungan. Mutasi adalah
perubahan dalam genotip yangdapat diwariskan. Genom adalah keseluruhan gen yangdimiliki
suatu organisme. Virus tipeliar (wildtype virus) adalah virus asli yang merupakan bentuk asal
mutan (sebelummengalami mutasi) dan merupakan bagi mutan: istilah tersebut mungkin
tidak memperlihatkanciri virus secara akurat karena virus tipe-liar diisolasi
darialam/lingkungan. Isolat virus baru dari pejamu alaminya disebut sebagai isolat lapangan
atau isolat primer.
Virologi 100
b. Turunkan siklus vertebrata-arthropoda dengan tangensial infeksi manusia:
ContohDemam kuning hutan, St. Louis ensefalitis. Manusia yang terinfeksi adalah
"jalan buntu" tuan rumah. Ini adalah mekanisme transmisi yang lebih umum.
Dalam siklus ini, virus dapat ditularkan dari orang dewasa arthropoda ke keturunannya
melalui telur (bagian transovarian); Dengan demikian, siklus bisa berlanjut dengan atau tanpa
intervensi dari host vertebrata viremic (Yuwono, 2012).
Pada vertebrata, invasi sebagian besar virus menimbulkan kekerasan Reaksi, biasanya
berdurasi pendek. Hasilnya sangat menentukan. Entah tuan rumah mengalah atau hidup
melalui produksi antibodi yang menetralkan virus. Terlepas dari hasilnya, Tinggalnya virus aktif
biasanya singkat infeksi terus-menerus atau laten yang berlangsung selama berbulanbulan
sampai bertahun-tahun Bisa terjadi (hepatitis B, herpes simpleks, cytomegalovirus, retrovirus).
Pada vektor arthropoda virus, hubungannya biasanya sangat berbeda. Virus menghasilkan
sedikit atau tidak sakit efek dan tetap aktif di arthropoda sepanjang yang terakhir kehidupan
alam Jadi, arthropoda, berbeda dengan vertebrata, bertindak sebagai tuan rumah dan waduk
permanen.
Virologi
101
Agen Bioterorisme
Agen bioterorisme adalah mikroorganisme (atau toksin) yang bisa digunakan untuk
menghasilkan kematian dan penyakit pada manusia, hewan, atau tanaman untuk tujuan
teroris. Mikroorganisme semacam itu bisa jadi dimodifikasi secara genetik untuk
meningkatkan virulensi mereka, membuat mereka tahan terhadap obat-obatan atau vaksin,
atau meningkatkan kemampuan mereka untuk menjadi disebarluaskan di lingkungan.
Agen bioterorisme potensial diklasifikasikan ke dalam kategori risiko berdasarkan
kemudahan diseminasi atau transmisi dari orang ke orang, tingkat kematian, kemampuan
untuk menyebabkan publik panik, dan kebutuhan kesiapan kesehatan masyarakat. Virus agen
dalam kategori risiko tertinggi adalah cacar dan virus demam berdarah; Bakteri berisiko
tertinggi termasuk agen dari antraks, botulisme, wabah, dan tularemia.
Virus-virus kecil hewan dan bakteriofaga merupakan model yang baik untuk
mempelajari ekspresi gen. sekuens nukleotida total milik banyak virus telah berhasil
diidentifikasi. Dari temuan tersebut ditemukan adanya gen-gen yang bertumpang tindih, yaitu
pada sebagian sekuens DNA yang digunakan untuk sintesis dua polipeptida yang berbeda, baik
dengan menggunakan 2 kerangka pembacaan yang berbeda, ataupun dengan 2 mRNA yang
berbeda dan menggunakan kerangka pembacaan yang sama, tetapi dimulai dari titik yang
berbeda. Sebuah sistem virus (dai adenovirus) pertama kali menunjukkan fenomena
pengolahan mRNA yang dinamakan “spilicing”, yaitu sekuens mRNA yang menyandi protein
tertentu diperoleh dari sekuens-sekuens yang trpisah dari cetakan, dengan sekuens sisipan
noncoding “dipotong keluar” dari transkrip. Baru-baru ini, beberapa virus DNA (herpesvirus,
adenovirus, polyomavirus) ditemukan menyandi microRNA’ RNARNA kecil (-22 nukleotida)
tersebut berfungsi pada tingkat yang baru dalam regulasi gen pasca trasnkripsi, dengan
mengantarai degradasi mRNA target atau dengan menginduksi inhibisi translasi mRNA-mRNA
tadi.Variasi terluas dalam strategi ekspresi gen ditemukan pada virus-virus yang mengandung
RNA. (Jawetz, 2008)
Beberapa virion memiliki polimerase (orthomyxovirus, reovirus); dan beberapa sistem
yang lain dengan menggunakan pesan subgenomik, kadang-kadang dibentuk melalui splicing
(orthomyxovirus, retrovirus); dan beberapa virus mensintesis prekursor poliprotein besar yang
selanjutnya diolah dan dipecah untuk menghasilkan produk gen akhir (picornavirus,
retrovirus). Protease viral milik human immunodeficiency virus merupakan suatu enzim yang
dihambat oleh kelas obat antivirus yang dinamakan inhibitor protease. Sejauh apa enzim
spesifik-virus terlibat dalam proses-proses tadi, bervariasi dari grup yang satu ke grup yang
lain. Virus DNA yang bereplikasi didalam nukleus biasanya menggunakan polimerase RNA dan
polymerase DNA serta enzim pemroses milik sel pejamu. Virus yang lebih besar (herpesvirus,
poxvirus) lebih independen dalam hal fungsi seluler mereka dibandingkan dengan virus yang
lebih kecil. Inilah salah satu alasan mengapa virus yang lebih besar lebih sensitif terhadap
kemoterapi antivirus karena lebih banyak proses spesifik-virus yang tesedia sebagai target
untuk kerja obat.
Situs intrasel tempat berlangsungnya berbagai peristiwa dalam replikasi virus bervariasi
antar kelompok virus yang berbeda. Dapat dibuat beberapa generalisasi. Protein virus
disintesis dalam sitoplasma pada poliribosomyang tersusun atas mRNA spesifik-virus dan
ribosom sel pejamu. Banyak protein virus menjalani modifikasi (glikosilasi, asilasi, pemecahan,
Virologi 102
dll). DNA virus biasanya mengalami replikasi dalam nukleus. RNA genomik virus umumnya
mengalami duplikasi dalam sitoplasma sel, meskipun terdapat beberapa pengecualian.
Proses multiplikasi mencakup beberapa tahapan. Pertama-tama, virusharus mampu
mengenal dan menempel pada suatu sel. Umumnya virus memilikikecenderungan untuk
mengenal sel tertentu sehingga proses ini sangat spesifik(trofisme). Selanjutnya virus
teradsorbsi ke dalam sel melalui specificantireceptor molecules, biasanya suatu glikoprotein.
Adsorsi ini bersifattemperatur and energi independent yaitu dipengaruhi oleh temperatur
danenergi. Proses penetrasi virus ke dalam sel inang ini dapat berlangsung melaluisalah satu
dari tiga cara berikut yaitu: 1) translokasi ke dalam membran plasma, 2) pinositosis ke dalam
cytoplasmic vacuoles, 3) fusi membran plasma dengan envelope virus. Umumnya
nonenveloped virusesmasuk ke dalam sel melalui translokasi dan pinositosis sedangkan
enveloped viruses melalui cara fusi. Setelah masuk ke dalam sel, virus akan melepaskan
genomnya untuk kemudian bereplikasi. Secara garis besar proses multiplikasi (replikasi) virus
adalah sebagai berikut:
Adsorption yaitu virus memiliki reactive sitespada permukaannya yang dapat
berinteraksi dengan reseptor tertentu pada inang yang sesuai. Reaksi ini biasanya bersifat
pasif (tidak memerlukan energi) dan dapat dirusak oleh disinfektan atau pemanasan, serta
dihambat (blocking) dengan antibodi spesifik (neutralizing antibodies).
Uptake yaitu setelah adsorpsi, selubung virus akan berfusi dengan membran inang dan
virus melepas nucleocapsid-nya ke dalam sitoplasma. Sebagian virus ada yang masuk ke dalam
sitoplasma dengan cara endositosis yaitu invaginasi membran sel membentuk vesikel dalam
sitoplasma.
Uncoating yaitu penglepasan genom virus dari protective capsid sehingga asam
nukleatnya dapat ditranspor dalam sitoplasma dan memungkinkan dimulainya replikasi atau
transkripsi untuk membentuk new progeny virions.
Genomic activationyaitu messenger RNA (mRNA) ditranskripsi dari DNA virus atau
terbentuk langsung pada virus (+) strand RNA kemudian ditranslasi menjadi protein. Protein
yang terbentuk awal-awal umumnya protein nonstruktural misalnya DNA atau RNA
polimerase. Protein yang terbentuk kemudian adalah protein struktural seperti kapsid
(building blocks of the virion). Replikasi akan membuat genom baru yang akan
diinkorporasikan dengan protein yang telah disintesa menjadi progeny virions. Secara umum
replikasi virus DNA terjadi di dalam inti sel sedangkan replikasi virus RNA di dalam sitoplasma,
ada pengecualian misalnya pox virus (virus DNA) bereplikasi di dalam sitoplasma.
Assembly yaitu perakitan nukleokapsid dapat terjadi di nukleus (herpes virus,
adenovirus), sitoplasma (polio virus), atau pada permukaan sel misalnya "budding" virus
influenza. Akumulasi virion pada tempat perakitan tersebut dapat terlihat dengan mikroskop
cahaya sebagai benda inklusi (inclusion bodies).
Release yaitu penglepasan new infectious virionsadalah proses akhir replikasi. Proses ini
dapat terjadi dengan cara budding pada virus ber-envelope yaitu kapsid dan asam nukleat
secara langsung berkondensasi di tepi membran sel dimana disana telah terdapat viralcoded
envelope proteins, maka terlepaslahvirion ber-enveloped dari sel terinfeksi tersebut.
Beberapa virus memanfaatkan cellular secretory pathway untuk keluar dari sel. Partikel virus
Virologi
103
masuk ke dalam Golgi-derived vesicles dan kemudian disekresikan ke luar sel. Disintegrasi atau
lisis infected cell juga merupakan salah satu cara pelepasan intact infectiousvirions.
Sebagian besar virus DNA bereplikasi secara semi-conservative.Umumnya DNA virus
segera ditranskripsi dengan bantuan protein inang untukmemproduksi mRNA yang menyandi
protein replikatif dan struktural. Selanjutnya hasil enzim replikasi mengkatalisa pembentukan
dsDNA. Tahap akhir adalah mengemas protein struktural bersama newlysynthesized DNA
(dsDNA) menjadivirion. (Yuwono, 2012).
Genom positive-stranded RNA virus pada dasarnya merupakan/sama dengan mRNA dan
secara langsung dapat menjadi kodon bagi proses translasi protein. Pada tahap awal sintesa
protein ini, yang dibuat adalah enzim replikasi yang diperlukan untuk mengkatalisis sintesa
negative-strand RNA. Selanjutnya (−)RNA ini disalin ulang menjadi (+) RNA. Pada sintesa
protein tahap kedua akan diproduksi protein struktural. Protein struktural ini akan dikemas
bersama progeny(+) RNA menjadi virion baru yang siap menginfeksi (Yuwono, 2018).
Negative-strandedRNA pertama-tama harus dikonversi terlebih dahulumenjadi (+) RNA
(mRNA) dengan bantuan enzim RNA-dependent RNApolymerase (RDRP) yang dimiliki virion.
Selanjutnya mRNA ditranslasi menjadi protein (replikatif dan struktural). Enzim replikasi
mengkatalisia sintesa negative strandRNA. Protein struktural dikemas bersama progeny (−)
RNA dan RDRPmenjadi virion.
Retrovirus memiliki cara replikasi yang unik. Pertama virus RNA akan
direversetranscribed oleh enzim reverse transcriptase(RT) menjadi RNA/DNAhybrid duplex.
Kemudian RT menghilangkan RNA strand sedangkan new DNAstrand mensintesa satu untai
DNA lagi menjadi dsDNA. Double stranded DNA iniakan berintegrasi ke dalam genom inang
(kromosom). Kemudian disintesaprogeny RNA molecules dan protein struktural untuk dirakit
menjadi new viral particles (Yuwono, 2012).
Virologi 104
menyebabkan fosforilasi eIF2 yang berperan penting dalam menghentikan sintesa protein
pada sel. Specific host defenses: meliputi antiviral antibodiyang berperanmencegah adsorpsi
ke sel target dan cytotoxic T-lymphocyte yang mampu mengenali sel terinfeksi (virallyinfected
cells) dan menghancurkannya sehingga mengurangi atau mengeliminasi produksi virus.
Mengapa virus tidak bisa memperbanyak diri pada sel yang sudah mati? Virus
memperbanyak diri dengan cara menyuntikkan materi genetik yaitu DNA atau RNA ke sel
target, materi genetik virus tersebut akan diterjemahkan oleh sel target untuk menghasilkan
bagian-bagian tubuh virus baru. Proses penerjemahan inilah yang dapat dilakukan oleh sel
yang masih hidup saja. Virus yang bereproduksi dalam sel akan menyebabkan sel tersebut lisis
atau pecah karena terbentuknya virus baru. Virus yang memperbanyak diri juga menyebabkan
timbulnya beberapa penyakit dalam tubuh hewan, tumbuhan, dan manusia.
Terdapat dua cara virus bereproduksi virus pada sel inang, yaitu melalu siklus litik dan
lisogenik. Apakah Prelovers sudah mengetahui bagaiamana siklus ini terjadi? Jika jawabannya
belum, kamu perlu membaca artikel ini hingga akhir karena Prelo kali ini akan membahas cara
reproduksi virus (aditya, 2014).
Virologi
105
Proses injeksi DNA ke dalam sel inang ini terdiri atas penambatan lempeng ujung,
kontraksi sarung, dan penusukan pasak berongga kedalam sel bakteri. Pada peristiwa
ini, asam nukleat masuk ke dalam sel, sedangkan selubung proteinnya tetap berada di
luar sel bakteri. Jika sudah kosong, selubung protein ini akan terlepas dan tidak
berguna lagi.
c. Sintesis (fase pembentukan), Eklifase, Replikasi.
Enzim penghancur yang dihasilkan oleh virus akan menghancurkan DNA bakteri yang
menyebabkan sintesis DNA bakteri terhenti. Posisi ini digantikan oleh DNA virus yang
kemudian mengendalikan kehidupannya. Dengan fasilitas dari DNA bakteri yang sudah
tidak berdaya, DNA virus akan mereplikasi diri berulang kali. DNA virus ini kemudian
akan mengendalikan sintesis DNA dan protein yang akan dijadikan kapsid virus.
d. Perakitan.
Pada tahap ini, kapsid virus yang masih terpisah-pisah antara kepala, ekor, dan serabut
ekor akan mengalami proses perakitan menjadi kapsid yang utuh. Kemudian, kepala
yang sudah selesai terbentuk diisi dengan DNA virus. Proses ini dapat menghasilkan
virus sejumlah 100-200 buah.
e. Lisis (fase pemecahan sel inang ataupembebasan).
Dinding sel bakteri yang sudah dilunakkan olen enzim lisozim akan pecah dan diikuti
oleh pembebasan virus-virus baru yang siap untuk mencari sel-sel inang yang baru.
Pemecahan sel-sel bakteri secara eksplosif dapat diamati dengan mikroskop lapangan
gelap. Jangka waktu yang dilewati lima tahap ini dan jumlah virus yang dibebaskan
sangat bervariasi, tergantung dari jenis virus, bakteri, dan kondisi lingkungan.
Virologi 106
2. Siklus Lisogenik
Virologi
107
enzim transkriptase balik dari virus. Dengan dibentuknya ADA, leukosit pun dapat diproduksi.
Penyakit yang disebabkan oleh virus dapat dicegah dengan cara vaksinasi. Vaksinasi adalah
proses pemberian vaksin (bibit penyakit yang telah dilemahkan) ke dalam tubuh. Dengan
memasukan vaksin, tubuh akan bereaksi dengan membentuk antibodi, sehingga diharapkan
pada saat tubuh terkena penyakit di masa yang akan datang, antibodi dapat menghancurkan
penyebab penyakit tersebut atau menjadi kebal. Kekebalan seperti ini disebut kekebalan aktif.
Bagi orang atau hewan yang menderita penyakit akibat virus dapat dilakukan pengobatan
dengan pemberian serum. Serum adalah plasma darah yang mengandung antibodi suatu
penyakit. Dengan pemberian serum ini tubuh tidak perlu membentuk sendiri antibodinya.
Kekebalan dengan cara ini disebut kekebalan pasif (SAASTA,2010)
Latihan
Untuk dapat memperdalam pemahaman Saudara mengenai materi di atas, kerjakanlah
Latihan berikut!
1) Jelaskan dengan istilah multiplikasi oleh virus?
2) Apa yang anda ketahui dengan istilah sel penjamu?
3) Sebutkan tahapan-tahapan reproduksi virus?
4) Sebutkan cara-cara penularan virus?
5) Apa yang dimaksud dengan agen Bioterism?
Ringkasan
Virus adalah agen infeksi terkecil dan mengandung hanya satu jenis asam nukleat (DNA
atau RNA).Virus yang dikenal sangat beragam, bervariasi dalam ukuran, bentuk, dan
kandungan genetik; hanya beberapa jenis yang memiliki lipida amplop.Virus diklasifikasikan
ke dalam kelompok, keluarga virus yang ditunjuk, berdasarkan sifat umum, seperti morfologi
virion, struktur genom, sifat protein virus, dan strategi replikasi. Virus adalah parasit
intraseluler obligat dan berkembang biak hanya di sel hidup. Asam nukleat virus encode
virusspecific produk, dan sel inang menyediakan energi, biokimia prekursor, dan mesin
biosintesis.
Langkah-langkah dalam replikasi virus termasuk keterikatan pada sel via mengikat
reseptor spesifik pada permukaan sel, masuk ke dalam sel, uncoating dari genom virus, diatur
ekspresi transkrip virus, sintesis protein virus, replikasi asam nukleat genomik virus, perakitan
virus progeni baru, dan pelepasan virion baru dari sel. Durasi siklus replikasi sangat bervariasi
di antara jenis virus yang berbeda. Sel yang terinfeksi mungkin terbunuh atau mungkin
Virologi 108
bertahan dengan sedikit kerusakan. Tidak semua infeksi menyebabkan virus progeni
baru.Penyakit virus baru muncul, disebut "muncul penyakit menular, "karena agen baru
dikenali, Agen yang dikenal berevolusi dan menyebar, dan populasi induk baru menjadi
terinfeksi. Beberapa virus merupakan agen bioterorisme potensial berdasarkan kemudahan
transmisi host-to-host dan tingkat kematian.
Tes 1
Pilihlah salah satu jawaban yang paling benar!
1. Beberapa virus ditandai dengan simetri heliks virus nukleokapsid. Manakah dari
pernyataan berikut tentang virus dengan simetri heliks yang paling akurat?
A. Kelebihan partikel heliks kosong yang tidak mengandung asam nukleat umumnya
diproduksi di sel yang terinfeksi
B. Semua virus yang terselubung dengan simetri heliks diklasifikasikan ke keluarga virus
yang sama
C. Semua virus yang terselubung dengan simetri heliks diklasifikasikan ke dalam keluarga
virus yang berbeda
D. Semua virus manusia dengan nukleokapsid heliks memiliki amplop.
E. Helical nucleocapsids ditemukan terutama pada DNA containing virus
2. Sel yang terinfeksi virus sering mengalami perubahan morfologis yang disebut sebagai
efek cytopathic. Manakah dari pernyataan berikut tentang perubahan sitopati yang
disebabkan virus paling akurat?
A. Mereka patognomonik untuk virus yang menginfeksi.
B. Mereka mungkin termasuk pembentukan sel raksasa.
C. Mereka hanya bisa dilihat dengan mikroskop elektron.
D. Mereka jarang dikaitkan dengan kematian sel
E. Mereka hanya bisa dilihat dengan mikroskop medan terang
3. Virus biasanya menginisiasi infeksi dengan terlebih dahulu berinteraksi dengan reseptor
di permukaan sel. Manakah dari pernyataan berikut ini paling akurat tentang reseptor
seluler untuk virus?
A. Infeksi sel yang berhasil oleh virus mungkin melibatkan interaksi dengan lebih dari satu
jenis reseptor.
B. Semua virus dalam keluarga tertentu menggunakan seluler yang sama reseptor
C. Reseptor seluler untuk virus tidak memiliki fungsi seluler yang diketahui.
D. Semua virus dalam keluarga tertentu menggunakan seluler yang berbeda E. Semua sel
di host yang rentan mengekspresikan reseptor virus
Virologi
109
4. Manakah dari berikut ini yang bisa digunakan untuk menghitung infeksi titer virus?
A. Reaksi berantai polimer
B. Mikroskop elektron
C. Hemaglutinasi
D. Uji plak
E. Uji Serologi
5. Manakah dari berikut yang menyatakan sebuah prinsip mengenai virus asam nukleat? A.
Asam nukleat virus yang dimurnikan dari virus apapun biasanya menular
B. Beberapa virus mengandung genom tersegmentasi.
C. Virus mengandung RNA dan DNA.
D. Ukuran genom virus tidak serupa diantara virus manusia yang dikenal
E. Ukuran genom virus serupa di antara virus manusia yang dikenal.
6. Dua mutan poliovirus telah diisolasi, satu (MutX) dengan mutasi pada gen X dan yang
kedua (muty) dengan mutasi pada gen Y. Jika sel terinfeksi setiap mutan saja, tidak ada
virus diproduksi. Jika sel koinfeksi dengan MutX dan MutY, salah satu dari berikut ini yang
paling mungkin terjadi?
A. Pembentukan ulang segmen genom dapat terjadi dan menimbulkan untuk virus
wild type yang layak.
B. Sel akan berubah pada frekuensi tinggi karena mereka tidak akan dibunuh oleh
mutan poliovirus.
C. Genom dapat ditranskripsi ulang menjadi DNA dan keduanya Virus MutX dan MutY
diproduksi.
D. Komplementasi antara produk gen mutan mungkin terjadi dan virus MutX dan MutY
diproduksi.
E. Genom dapat ditranskripsi ulang menjadi RNA
7. Manakah dari virus berikut yang memiliki genom RNA itu menular saat dimurnikan?
A. Virus influenza
B. Poliovirus
C. Papillomavirus
D. Campak virus
E. Mumps
Virologi 110
E. Mumps
9. Beberapa virus mengkodekan RNA polimerase bergantung RNA virus. Manakah dari
kingdom berikut ini yang menjadi contoh RNA virus polimerase?
A. Semua virus RNA membawa molekul RNA polimerase di dalamnya partikel virus
karena mereka perlu untuk memulai berikutnya siklus menular
B. Antibodi terhadap RNA polimerase yang menetralkan Infektivitas virus.
C. Antigen virus RNA polimerase yang menggumpalkan infektivitas virus
D. Protein RNA polimerase viral juga berfungsi sebagai mayor inti protein struktural
dalam partikel virus.
E. Virus RNA untai negatif memasok RNA mereka sendiri yang mandiri RNA polimerase
karena sel eukariotik kurang enzim semacam itu
10. Manakah dari pernyataan berikut mengenai morfologi virus adalah benar? A.
Beberapa virus dengan genom DNA mengandung nukleus primitif.
B. Protein permukaan virus melindungi genom virus dari nukleases.
C. Helical nucleocapsids ditemukan dengan DNA untai tunggal virus.
D. Semua virus RNA berbentuk bulat.
E. Beberapa virus dengan genom RNA mengandung nukleus primitif
11. Banyak virus bisa tumbuh di laboratorium. Manakah dari berikut ini pernyataan tentang
propagasi virus tidak benar?
A. Beberapa virus dengan rentang host yang luas dapat berkembang biak dalam banyak
hal jenis sel.
B. Sebagian besar persiapan virus memiliki unit partikel ke infeksi rasio lebih besar dari 1
C. Beberapa virus dapat disebarkan di media bebas sel.
D. Beberapa virus mamalia dapat diolah pada telur ayam.
E. Sebagian kecil virus mempunyai efek sitopatik pada sel hidup
12. Infeksi laboratorium dapat diperoleh saat bekerja dengan virus kecuali praktik
keselamatan laboratorium yang baik diikuti. Manakah dari praktik-praktik keamanan
kerja berikut ini yang tidak diperbolehkan ?
A. Pembuangan limbah percobaan ke wastafel laboratorium
B. Penggunaan jas laboratorium dan sarung tangan laboratorium
C. Menghindari pipetting melalui mulut
D. Penggunaan masker keselamatan
E. Penggunaan sepatu yang tertutup
13. Virus kecil berada dalam kisaran ukuran yang sama dengan yang berikut?
A. Spesies Staphylococcus
B. Ribosom eukariotik
Virologi
111
C. Sel darah merah
D. Sel darah putih
E. Serum globulin
14. Manakah dari faktor berikut yang tidak menjadi faktor penting yang berkontribusi dengan
fenomena penyakit virus yang muncul?
A. Transplantasi organ dan jaringan
B. Melalui udara
C. Resistensi antibiotik
D. Antiseptik
E. Disinfektan
15. Arbovirus diklasifikasikan ke dalam beberapa keluarga virus yang berbeda namun
dikelompokkan bersama berdasarkan kesamaan karakteristik berikut?
A. Menyebabkan demam hemoragik
B. Replikasi hanya pada manusia
C. Mengandung RNA dan DNA
D. Ditransmisikan oleh vektor
E. Replikasi hanya pada vektor
Topik 2 Bakteriofaga
B bakteri. Virus ini sering digunakan oleh para ilmuwan untuk penelaahan lebih
akteriofaga (sederhananya faga) merupakan virus yang menginfeksi/ menyerang
mendalam tentang virus. Virus fage mudah ditumbuhkan pada bakteri (inang). Virus
yang hidup pada bakteri tersebut mudah dipelihara dengan kondisi yang dapat dikendalikan
seperti waktu, kerja, dan ruangan yang relatif sedikit dibandingkan dengan pemeliharaan
inang berupa tumbuhan dan hewan. Oleh karena itulah, bakteriofaga menjadi perhatian yang
besar untuk penelitian virus. (Jawetz, 2013)
Literatur faga sangat banyak dan terdiri dari lebih dari 11 400 publikasi untuk tahun
1915-1965 dan, untuk penulis perhitungan, sekitar 45.000 untuk 1965 sampai hari ini. Volume
Penelitian faga terbukti pada kenyataan bahwa ada dua buku masing-masing untuk virus
tunggal, l dan T4, dan itu, oleh pertengahan 2006, jurnal Virologi telah menerbitkan lebih dari
2000 artikel faga sejak dimulainya tahun 1955. Sejarah faga dapat dibagi menjadi tiga,
sebagian tumpang tindih periode. Karena volume penelitian faga dan banyak Bacteriofaga
atau Faga (bacteria=bakteri, faga=makan) adalah sekelompok virus yang hidup dalam sel
bakteri. Dalam bahasa Indonesia kita menyebutnya bakteriofaga atau faga saja. Salah satu
studi tentang “pemakan bakteri” ini adalah eksperimen Hershey-Chase. Pada eksperimen ini
dua faga dilabel dengan fosfor pada tempat yang berbeda yaitu satu faga dilabel pada kapsid
dan faga lainnya dilabel pada genomnya. Keduanya kemudian diinfeksikan ke dalam dua
Virologi 112
media mengandung bakteri dan kemudian media tersebut disentrifugasi. Media yang pertama
mengandung fosfor pada supernatan-nya tetapi tidak pada pellet (sel) nya, sedangkan media
kedua yang berasal dari faga yang dilabel pada genomnya mengandung fosfor pada selnya dan
tidak pada supernatan-nya. Kesimpulan dari eksperimen ini bahwa yang berperan dalam
multiplikasi faga adalah genomnya, bukan protein kapsidnya (anonim, 2017).
Genom faga merupakan rangkaian asam nukleat yang sangat efisien. Jika pada genom
sel manusia lebih dari 90% adalah bagian yang tidak menyendi protein (untranslated regions)
sebaliknya pada virus seluruh genomnya adalah penyandi protein bahkan sering berupa
susunan yang overlapping seperti yang terdapat pada gambar 3.8 di bawah ini.
Sebagaimana virus lainnya tetapi lebih sederhana, faga hanya mengandung kapsid dan
genom (asam nukleat) dan tidak ada faga ber-enveloped sebagaimana sebagian virus. Ukuran
faga menempati urutan terkecil dari virus. Terdapat tiga macam bentuk faga yaitu ikosahedral,
ikosahedral dengan ekor dan filamen (aditya, 2014).
Faga bereplikasi dalam dua kemungkinan yaitu profaga pathway dan lytic pathway.Pada
profaga pathway, genom faga kan berintegrasi pada kromosom bakteri dan akan terus disana
dan membelah sejalan dengan pembelahan kromosom bakteri. Sedangkan pada lytic pathway,
genom faga tidak berintegrasi pada kromosom bakteri tetapi membelah dalam sitoplasma,
bertranskripsi dan bertranslasi dan membentuk virion baru yang mengakibatkan sel bakteri
menjadi lisis (anonim, 2017).
Bakteri yang mengandung profaga (temperate faga) disebut lysogen, pertumbuhan faga
pada lysogenini disebut lysogenic growth. Sekitar 90% dari faga adalah profaga. Diduga
inaktifasi genom faga (switches off faga genes) ini karena adanya mekanisme represor pada
bakteri lisogen tsb. Jika karena suatu sebab profaga ini terinduksi maka faga akan
bermultiplikasi dan sel iang menjadi lisis. Suatu lysogen akan kebal terhadap superinfeksi oleh
tipe faga yang sejenis. Pada lytic pathwayhanya dikenal siklus lisis dan faga yang bersangkutan
disebut virulent faga, pertumbuhannya disebut lytic growth. Berdasarkan uraian diatas
jelaslah bahwa temperate faga dapat bereplikasi dengan cara lytic growthmaupun lysogenic
growth sedangkan virulent faga hanya dapat menyebabkan lytic growth.
Agar dapat menahan/resisten terhadap infeksi faga, maka bakteri mengembangkan
beberapa bentuk pertahanan:
1. Memproduksi enzim restriksi (restriction endonuclease enzymes). Enzim ini mampu
memotong bagian tertentu basa asam nukleat sehingga susunan asam nukleat tersebut
akan terdegradasi. Misalnya enzim EcoR1 yang diproduksi oleh E. coli mampu memotong
untaian asam nukleat sbb:
----GAATTC----
----CTTAAG---- , dipotong menjadi
----G AATTC----
----CTTAA G----
2. Menambahkan gugus metil (CH3) pada genom faga sehingga genom faga tersebut tidak
berfungsi dengan normal. Misalnya metilasi pada gugus adenin.
------GAATTC------
------CTTAAG------
Virologi
113
Faga penting dipelajari dalam dunia kedokteran setidaknya karena dua alasan yaitu:
pertama, secara alami banyak perpindahan gen antar kuman (termasuk gen virulen) yang
diperantarai oleh faga. Proses perpindahan gen yang diperantarai oleh faga ini disebut
transduksi. Bakteri yang mengandung gen baru yang dibawa oleh faga akan mengalami
konversi, beberapa diantaranya menjadi virulen misalnya Diphtheria toxin pada
Corynebacterium diphtheriae, toksin kolera pada Vibrio cholerae, toksin eritrogenik pada
Streptococcus pyogenes, sitotoksin vero pada Escherichia coli O157 dan botulin (neurotoxin)
pada Clostridium botulinum. Alasan kedua, faga sangat mungkin menjadi vektor (vehicle) yang
akan memuat sejumlah gen yang penting pada proses terapi gen. (Yuwono, 2012)
Faga dapat dideteksi dengan cara plaque assay yaitu dengan cara mencampur faga dan
bakteri dalam suatu suspensi, kemudian menanam diatas media padat. Faga yang bereplikasi
akan tampak sebagai plaque (bagian jernih) pada media tersebut.
Bakteriofaga adalah kesatuan biologis paling sederhana yang diketahui mampu
mereplikasi dirinya (mampu menggandakan dirinya sendiri menjadi lebih banyak). Dengan
demikian, jasad renik ini dijadikan penelitian dalam genetika, yaitu dijadikan sistem model
untuk mempelajari patogenesitas yang disebabkan virus. Bagaimana struktur dari
Bakteriofaga? Yuk simak bersama:
1. Ciri-Ciri Umum Bakteriofaga
Di manakah virus bisa hidup? Kenyataannya virus ada di mana-mana, terbukti sering
terjadi mewabahnya suatu penyakit yang tidak mengenal daerah tertentu. Dengan
demikian, virus ini sama seperti virus pada umumnya yang dapat hidup luas di alam.
Bentuknya juga hampir sama seperti virus, yaitu terdiri atas sebuah inti asam nukleat yang
dikelilingi oleh selubung protein. Virus ini mempunyai ekor yang digunakan untuk
melewatkan asam nukleatnya ketika menginokulasi sel inang.
2. Morfologi dan Struktur Bakteriofaga
Bagaimana dengan bentuk morfologi dan struktur dari Bakteriofaga?Coba amati dan
perhatikan gambar berikut:
Gambar 3.4 Struktur Bakteriofaga yang terdiri atas kepala, ekor dan serabut ekor Sumber
: htttp://http://www.microinmuno.qb.fcen.uba.ar/03-Bacteriophage.pdf
Virologi 114
Jika kita amati, tubuh Bakteriofaga tersusun atas kepala, ekor, dan serabut ekor. Kepala
berbentuk polyhedral (segi banyak) yang di dalamnya mengandung DNA atau RNA
saja.Dari kepala muncul tubus atau selubung memanjang yang dinamakan sebagai ekor
virus.Ekor ini bertugas sebagai alat penginfeksi. Bagian antara kepala dan ekor memiliki
selubung yang disebut kapsid. Kapsid tersusun atas molekul-molekul protein, oleh sebab
itu disebut sebagai selubung protein atau pembungkus protein, fungsinya sebagai
pelindung asam nukleat (DNA dan RNA), dapat membantu menginfeksi virus ke sel
inangnya dan menentukan macam sel yang akan dilekati (Aditya, 2014)
Coba perhatikan, pada bagian ujungnya ditumbuhi serabut-serabut ekor yang dapat
berfungsi sebagai penerima rangsang atau reseptor. Sejumlah subunit molekul protein
yang menyusun kapsid dan identik satu dengan yang lain disebut kapsomer.
Telah kita ketahui bahwa ekor Bakteriofaga bertugas untuk menginfeksi. Tahukah
Anda bahwa Bakteriofaga sebenarnya mempunyai dua tipe cara menginfeksi, itu litik atau
virulen dan tenang atau lisogenik. Cara-cara menginfeksi Bakteriofaga tersebut juga
sekaligus digunakan sebagai cara bereproduksi (memperbanyak diri).
3. Reproduksi Bakteriofaga
Perhatikan cara Bakteriofaga bereproduksi pada gambar berikut:
Litik atau virulen, bila fage litik menginfeksi sel dan sel tersebut memberikan tanggapan
dengan cara menghasilkan virus-virus baru dalam jumlah yang besar, yaitu pada masa akhir
inkubasi. Sel ini akan pecah atau mengalami lisis yang akan melepaskan fage-fage baru untuk
menginfeksi sel-sel inangnya.
Daur Litik
a. Fase adsorbsi (penempelan), pada fase ini, awalnya ditandai dengan adanya ujung ekor
menempel atau melekat pada dinding sel bekteri. Penempelan tersebut dapat terjadi
apabila serabut dan ekor virus melekat pada dinding sel bakteri.
Virologi
115
Virus menempel hanya pada tempattempat khusus, yakni pada permukaan dinding sel
bakteri yang memiliki protein khusus yang dapat ditempeli protein virus.Menempelnya
protein virus pada protein dinding sel bakteri itu sangat khas, mirip kunci dan gembok.Virus
dapat menempel pada sel-sel tertentu yang diinginkan karena memiliki reseptor pada
ujung-ujung serabut ekor.Setelah menempel, virus mengeluarkan enzim lisozim (enzim
penghancur) sehingga terbentuk lubang pada dinding bakteri atau inang.
b. Fase injeksi (penetrasi), selubung (seludang) sel berkontraksi yang mendorong inti ekor ke
dalam sel melalui dinding dan membran sel, kemudian virus tersebut menginjeksikan DNA
ke dalam sel bakteri. Namun demikian, seludang protein yang membentuk kepala dan ekor
fage tetap tertinggal di luar sel. Setelah menginjeksi kemudian akan terlepas dan tidak
berfungsi lagi.
Seperti pada gambar berikut ini:
Fase injeksi
1) Penetrasi sel inang oleh bakteriofaga
2) Seludang ekor memendek intinya menembus ke dalam sel, dalam DNA virus disuntikkan
ke dalam sel
3) Fase sintesis, DNA virus yang telah diinjeksikan yang mengandung enzim lisozim ke dalam
akan menghancurkan DNA bakteri, sehingga DNA virus yang berperan mengambil alih
kehidupan.Kemudian DNA virus mereplikasi diri berulang-ulang dengan cara
menggandakan diri dalam jumlah yang banyak, selanjutnya melakukan sintesis protein
dari ribosom bakteri yang akan diubah manjadi bagian-bagian kapsid seperti kepala, ekor,
dan serabut ekor.
4) Fase perakitan, bagian-bagian kapsid kepala, ekor, dan rambut ekor yang mula-mula
terpisah selanjutnya dirakit menjadi kapsid virus kemudian DNA virus masuk ke dalamnya,
maka terbentuklah tubuh virus yang utuh.
5) Fase litik, ketika perakitan telah selesai yang ditandai dengan terbentuknya tubuh virus
baru yang utuh. Virus ini telah mengambil alih perlengkapan metabolik sel inang bakteri
yang menyebabkan memuat asam nukleat virus dari pada asam nukleat bakteri. Setelah
Virologi 116
sekitar 20 menit dari infeksi awal sudah terbentuk 200 Bakteriofaga yang telah terakit
dan sel bakteri itu pun meledak pecah (lisis) dan melepaskan fage-fage baru/virus akan
keluar untuk mencari atau menginfeksi bateri-bakteri lain sebagai inangnya, begitu
seterusnya dan memulai lagi daur hidup tersebut.
Tenang atau lisogenik, tipe ini tidak mengalami lisis (selnya pecah), jadi asam nukleatnya
dibawa dan direplikasikan di dalam sel-sel bakteri dari satu generasi ke generasi yang lain,
namun bisa secara mendadak menjadi virulen pada suatu generasi berikutnya dan
menyebabkan lisis pada sel inangnya.
Daur Lisogenik
Pada daur ini juga mengalami fase yang sama dengan daur litik, yaitu melalui fase
adsorbsi dan fase injeksi. Selanjutnya, akan mengalami fase-fase berikut.
a. Fase penggabungan, karena DNA bakteri terinfeksi DNA virus, hal tersebut akan
mengakibatkan benang ganda berpilin DNA bakteri menjadi putus, selanjutnya DNA virus
menyisip di antara putusan dan menggabung dengan benang bakteri.
Dengan demikian, bakteri yang terinfeksi akan memiliki DNA virus.
b. Fase pembelahan, karena terjadi penggabungan, maka DNA virus menjadi satu dengan
DNA bakteri dan DNA virus menjadi tidak aktif disebut profage. Dengan demikian, jika DNA
bakteri melakukan replikasi, maka DNA virus yang tidak aktif (profage) juga ikut melakukan
replikasi. Misalnya, apabila DNA bakteri membelah diri terbentuk dua sel bakteri, maka DNA
virus juga identik membelah diri menjadi dua seperti DNA bakteri, begitu seterusnya.Dengan
demikian jumlah profage DNA virus akan mengikuti jumlah sel bakteri inangnya.
c. Fase sintesis, dalam keadaan tertentu jika DNA virus yang tidak aktif (profage) terkena
zat kimiatertentu atau terkena radiasi tinggi, maka DNA virus akan menjadi aktif kemudian
menghancurkanDNA bakteri dan memisahkan diri. Selanjutnya, DNA virus tersebut
mensintesis protein sel bakteri(inangnya) untuk digunakan sebagai kapsid bagi virus-virus baru
dan sekaligus melakukan replikasi diri menjadi banyak.
d. Fase perakitan: kapsid-kapsid dirakit menjadi kapsid virus yang utuh, yang berfungsi
sebagai selubung virus. Kapsid baru virus terbentuk. Selanjutnya, DNA hasil replikasi masuk ke
dalamnya guna membentuk virus-virus baru. e. Fase litik, fase ini sama dengan daur litik.
Virologi
117
Setelah terbentuk bakteri virus baru terjadilah lisis sel. Virus-virus yang, terbentuk
berhamburankeluar sel bakteri guna menyerang bakteri baru. Dalam daur selanjutnya virus
dapat mengalami daur litik atau lisogenik, demikian seterusnya.
Bagaimana hubungan antara fase litik dan lisogenik? Perhatikan gambar berikut ini:
Gambar diatas memperlihatkan bahwa virus dalam keadaan lingkungan tertentu pada
saat mengalami fase lisogenik dapat berpindah ke fase litik. Hal itu terjadi apabila virus fage
menginfeksi bakteri, tetapi sel bakteri tersebut mempunyai daya tahan atau daya imun yang
kuat, maka virus tersebut tidak dapat bersifat virulen (virus menyebabkan lisis atau pecah).
Pada saat lingkungannya berubah dan menyebabkan daya tahan sel bakteri berkurang, maka
keadaan lisogenik akan dapat berubah menjadi litik atau lisis, sehingga profage akan berubah
menjadi virulen. Dengan demikian, bakteri akan pecah (lisis) karena terbentuknya virus-virus
baru.
Semua fagamemiliki kromosom yang terbungkus kapsid yang tersusun dari fagencoded
protein. Untuk banyak jenis fag, kapsid dilekatkan pada struktur ekor yang juga terbuat dari
protein yang disandikan dengan fag. T4 dan P1 mengandung DNA beruntai ganda linier genom
tertutup dalam kapsid dan menempel pada ekor. Genom T4 adalah 172 kb, sedangkan P1
adalah fagayang lebih kecil dengan genom 90 kb. T4 kapsid adalah memanjang icosahedron
T4 memiliki struktur ekor yang sangat rumit termasuk kerah di bagian bawah kepala dan inti
ekor yang kaku dikelilingi selubung kontraktil. Inti dan sarungnya menempel pada pelat dasar
heksagonal. Dilekatkan juga pada tail tail dan pin enam serat ekor yang berkerut. P1 juga
memiliki kapsul icosahedral, ekor dengan selubung kontraktil, a pelat dasar, dan serat ekor.
Saya berisi genom DNA beruntai ganda linier 48,5 kb, kapsid, dan ekor. Kapsid selesai lagi
berbentuk seperti icosahedron sedangkan ekornya adalah tabung fleksibel tipis yang ujungnya
Virologi 118
di bagian kerucut kecil dan satu ekor serat. M13 berisi genom DNA beruntai tunggal melingkar
dari 6407 nukleotida yang dikelilingi oleh lima protein yang disandikan dengan faga.
Kromosom M13 dilapisi.
Penemuan faga
Faga pertama kali dijelaskan di 1915 oleh Frederick Twort dan 1917 oleh Felix d'Herelle
Kedua pria menemukan fagot saat bakteri mereka bekerja dengan lysed Agen bertanggung
jawab atas lisis itu dipindahtangankan dari budaya ke budaya, tak terlihat oleh cahaya
mikroskop, dan akan pergi melalui saringan terkecil mereka telah. d'Herelle menciptakan
istilah itu "Bakteriofag", menandakan sebuah entitas yang memakan bakteri.
oleh satu lapisan ~ 2700 subunit protein dikodekan gen VIII (gpVIII) yang memberikannya
filamen Penampilan, alasan M13 juga dikenal sebagai fagafilamen. DiSalah satu ujung filamen
terikat pada protein M13 yang dikodekan oleh gen VII dan IX (gpVII dan gpIX) dan di ujung lain
terikat protein gen III dan gen M13-encoded (gpIII dan gpVI).
Virologi
119
Hanya menginfeksi Bacillus subtilis. Beberapa jenis fagadapat menginfeksi satu spesies bakteri
tunggal. E. coli dapat terinfeksi oleh fusi l, M13, P1, T4, dan Mu, untuk beberapa nama. Jumlah
fagayang bisa dilepaskan dari satu bakteri setelah infeksi dan Pertumbuhan satu fagadikenal
dengan ukuran burst. Setiap fagamemiliki ciri khas ukuran Phag yang berbeda juga
membutuhkan jumlah waktu yang berbeda untuk melewatinya siklus pertumbuhan Kita tahu
kapan fagatelah berhasil direproduksi saat kita mampu untuk mendeteksi plak atau daerah
melingkar dengan sedikit atau tidak ada pertumbuhan bakteri pada piring agar-agar ditutupi
dengan lapisan tipis bakteri.
Setelah terikat ke sel, fagaharus mendapatkan genomnya ke dalam sitoplasma. Tarifnya
Dari Transportasi fagaDNA bisa sangat cepat. Hal ini berbeda untuk faga yang berbeda namun
nilai forreach setinggi 3000 pasangan basa per detik. Sebaliknya, dua metode lain yang
melupakan DNA dari luar sel ke sitoplasma (konjugasi, Bab 10 dan transformasi) mentransfer
DNA pada kecepatan kira-kira 100 basis detik per detik. Dalam banyak kasus, rincian
bagaimana genom fagamasuk ke sitoplasma yang tidak diketahui. Dari informasi yang kami
miliki, jelas bahwa tidak hanya mekanisme mekanis yang digunakan.
Pilihan Lisogenik.
Proses fagayang menginfeksi bakteri dan menghasilkan keturunan disebut sebagai
infeksi litik. Beberapa fag, seperti T4, hanya mampu pertumbuhan litik. Beberapa faga juga
mampu mempertahankan kromosom mereka dalam keadaan diam yang stabil di dalam
bakteri. Ini disebut lysogeny. Faga yang mampu baik litik dan lysogenicpathway disebut frat
beriklim sedang. P1 dan l adalah fagaberiklim sedang. M13 tidak biasa karena fagaterus keluar
dari bakteri tanpa membunuhnya. Untuk alasan ini, M13 tidak dianggap memiliki keadaan
lysogenic yang benar dan bukan fagayang berawan. Bila bakteri mengandung kromosom
samar diam, ini disebut sebagai lisogen. Genom fagayang dimasukkan disebut sebagai profaga.
Virologi 120
diketahui akhir kiri dimasukkan terlebih dahulu. Ketika DNA saya keluar dari kepala fag, hak
kanan keluar lebih dulu. Tidak seperti faga T4 (lihat di bawah), tidak ada perubahan dalam
struktur ekor l terlihat
Gambar 3.9 Struktur lDNA dalam kapsid faga(a) dan setelah sirkularisasi pada
thecytoplasm (b). DNAcircularizes melalui situs cos.
Sumber:Sumber :htttp://http://www.microinmuno.qb.fcen.uba.ar/03-Bacteriophage.pdf
Ketika DNA dikeluarkan. Selain LamB, saya juga menggunakan membran dalam
proteincalled PstM untuk masuk ke sitoplasma. Bagaimana DNA saya secara fisik melintasi
peptidoglikan dan periplasma dan melewati PtsM tidak diketahui.
Melindungi genom di sitoplasma bakteri.
Proteksi apa yang dibutuhkan oleh genom fagadi sitoplasma tergantung pada keadaan
fisik asam nukleat yang disuntikkan. Faga mengandung molekul DNA beruntai ganda linear
pada kapsidnya. Dalam sitoplasma bakteri, molekul dsDNA mengalami degradasi pada
eksonuklease yang membutuhkan satu ujung bebas untuk mencerna DNA. Kejadian pertama
yang terjadi pada DNA yang baru disuntikkan adalah bahwa DNA disirkulasikan untuk
mencegahnya terdegradasi.
Faga memiliki tempat spesifik pada DNA-nya, yang disebut situs cos, yang digunakannya
untuk circularize theDNA (Gambar 3.9). Situs cos adalah urutan 22 bp yang dipotong asimetris
saat lDNA dikemas (lihat di bawah). Situs cos dipotong memiliki 12 bp overhang. Ada satu
cosebook potong di ujung kiri genom l dan situs cos yang lain di ujung kanan lgenome (Gambar
3.9a). Ketika DNA l disuntikkan ke dalam sitoplasma, situs yang dipotong bukan dari anomali
genital l linier (Gambar 3.9b). Enzim tuan rumah, ligase DNA, segel kemudian menusuk di
kedua ujung situs cos menghasilkan genom l yang tertutup tertutup kovalen. Enzim host yang
dikodekan, gyrase DNA, superkoil molekul.
Virologi
121
Apa yang terjadi pada genom setelah stabil?
Genom mengandung enam promotor utama yang dikenal sebagai promotor PLfor ke kiri,
PR untuk promotor kanan, PRE forpromoter untuk pembentukan represor, PRM untuk
promoter untuk perawatan represor, PI untuk promoter untuk integrasi, dan PR ¢ untuk
promotor kanan sekunder (Gambar 3.10). Setelah genom disirkulasikan dan supercoiled,
transcriptionbegins dari PL dan PR. Serangkaian gen yang dikenal sebagai gen genetika
ditranskrip dan diterjemahkan. Geneproduk ini adalah protein awal yang dibutuhkan untuk
pengembangan lebih lanjut. E. coli RNA polimerase berinteraksi dengan PL togive naik ke
transkrip mRNA pendek yang diterjemahkan ke dalam protein N (Gambar 3.11a). E. coli RNA
polimerase berinteraksi dengan PR untuk menghasilkan transkrip mRNA pendek yang
diterjemahkan ke dalam protein Cro (Gambar 3.11a).
Protein N mampu memperpanjang transkripsi saat RNApolymerase menemukan urutan
dalam DNA yang memberitahukannya untuk berhenti. Untuk alasan ini, N disebut anti-
terminationprotein. N memungkinkan RNA polimerase untuk menuliskan melalui sinyal
pemutusan tL dan tR1 yang menghasilkan sintesis transkrip mRNA yang lebih panjang (Gambar
3.11b). The longertranscript dari PR mengkodekan protein O, P, dan CII, dan sejumlah kecil
anti-terminator lain, protein Q. Dari PL, CIII, protein rekombinasi Gam dan Red dan sejumlah
kecil Xisand Int dibuat.
Protein anti-penghentian dengan mengikat RNA polimerase setelah urutan basepair
spesifik, yang terletak di hulu dari situs penghentian transkripsi, telah ditranskripsi menjadi
mRNA (Gambar 3.11c). Urutan ini disebut kacang untuk pemanfaatan N. LainnyaE. Protein coli
berkontribusi terhadap anti penghentian. Protein ini telah diberi nama Nus, untuk zat
pemanfaatan N.
Pada titik ini, semua pemain perlu membuat keputusan litikogenik yang telah dibuat. CII
dan CIII dibutuhkan untuk pertumbuhan lisogenik. Cro dan Q dibutuhkan pertumbuhan
forlytic. Protein O dan P digunakan untuk mereplikasi l DNA.
Virologi 122
Gambar 3.10 Lokasi promoter enammajor pada lgenome dan arah yang mereka
tentukan mRNAproduksi.
Sumber : http://www.microinmuno.qb.fcen.uba.ar/03-Bacteriophage.pdf
Gambar 3.11 Kejadian transkripsi dan terjemahan pertama yang terjadi pada genom l
setelah infeksi. (a) Transkripsi dari PL mengarah pada produksi protein N. Transkripsi dari PR
mengarah ke protein Cro. (B) N adalah anti-terminator yang memungkinkan RNA polimerase
untuk membaca terminator tL dan tR1. Dari protein PL, N dan CIII akan diproduksi. Dari
protein PR, Cro, CII, O, P, dan Q akan diproduksi. (C) N berikatan dengan situs kacang pada
DNA. Sehubungan dengan protein fourbacterial, NusA, NusB, NusD, dan NusE, N
memungkinkan RNApolymerase untuk membaca.
Virologi
123
Sumber :htttp://http://www.microinmuno.qb.fcen.uba.ar/03-Bacteriophage.pdf
λ keputusan lytic-lysogenic
Keputusan antara pertumbuhan litik atau lysogenic untuk adalah perkembangan
pertama saklar dipahami pada tingkat molekuler. Pada tingkat yang paling dasar,
keputusannya tergantung pada jumlah dua protein yang disandi fag yang disebut CI dan Cro,
dan pengikatannya pada daerah kontrol promoter mereka . Saat CI terikat, ekspresi gen litik
ditekan dan fag mengikuti jalur lysogenic . Untuk alasan ini, CI juga dikenal sebagai represor CI
atau represor ekspresi dan pengikatan Cro mengarah pada perkembangan litik.
Cro yang terbuat dari PR dan CI terbuat dari PRE atau PRM. Baik Cro dan CI berikatan
dengan urutan DNA yang sama disebut operator, berisi dua operator itu mengikat Cro dan CI
Satu, disebut OR, tumpang tindih PRM dan promotor PR. Yang lainnya dipanggil OL, berada di
belakang promotor PL. ATAU pemain utama dalam keputusan litikogenik, sedangkan OL bukan
bagian dari keputusan.
Membuat Faga λ
Struktur yang sudah jadi kapsid ditentukan dengan karakteristik fisik dari protein
struktural bahwa mereka dibuat dari faga dan protein host yang digunakan untuk perakitan
capsids membutuhkan setidaknya 10 protein yang disandikan dengan faga dan dua protein
host-encoded. Kapsul terakhir adalah terdiri dari delapan protein, E, D, B, W, FII, B *, X1, dan
X2. Awalnya, B, C, dan Nu3 (semua protein faga) membentuk inisiator kecil dan tidak jelas. Ini
struktur adalah substrat untuk Groel yang dikodekan host dan protein Groes. GroEL dan Groes
bertindak berdasarkan protein atau kompleks protein dan bantu merombak mereka Itu
protein mantel utama, E, adalah ditambahkan ke struktur ini membentuk fag yang belum
matang kepala (Gambar 3.12). Itu Kepala fag belum matang dikonversi menjadi dewasa.
Virologi 124
Gambar 3.12 Virus memiliki dua mode Replikasi DNA: theta replikasi (a) dan lingkaran
bergulir replikasi (b). Replikasi theta terjadi pada awal infeksi dan Rolling circle terjadi
terlambat dalam infeksi Rolling circle replikasi menghasilkan concatomers untuk kemasan ke
kepala faga
Sumber :Sumber :htttp://http://www.microinmuno.qb.fcen.uba.ar/03-Bacteriophage.pdf
Gambar 3.13 Jalur perakitan untuk l. (a) Struktur inisiator untuk kepala terdiri dari B, C, dan
Protein Nu3 (b) E, protein utama kepala, ditambahkan ke struktur ini. Nu3 terdegradasi, B
dibelah menjadi a bentuknya lebih kecil (B *), dan E dan C dilebur dan dibelah pada posisi
baru untuk membentuk X1 dan X2. Ini membentuk kepala fag belum matang (c) Kepala fag
yang belum dewasa sekarang siap untuk DNA dari konsatomer. D Protein ditambahkan ke
kapsid pada titik ini. (d) Kemasan dimulai pada situs cos dan dilanjutkan ke cos berikutnya
situs (e) DNA dimasukkan ke dalam kapsid dan disegel di dalam oleh protein W dan FII. (f)
Ekor ditambahkan ke kapsid penuh untuk membentuk faga.
Sumber :htttp://http://www.microinmuno.qb.fcen.uba.ar/03-Bacteriophage.pdf
Kepala faga oleh degradasi Nu3, pembelahan B ke B *, dan peleburan protein C dan
beberapa protein E diikuti oleh pembelahan protein yang menyatu menjadi dua yang baru
protein, X1 dan X2 (Gambar 3.13c).
Kepala faga dewasa sekarang siap untuk DNA. Sebagai DNA dimasukkan ke dalam faga
Kepala, itu mengembang dan protein D ditambahkan ke permukaan kapsid. DNA-nya tidak
bisa Dikemas dari monomer DNA tetapi hanya dari concatomers yang biasanya diproduksi
dengan memutar lingkaran replikasi (Gambar 3.13c). DNA dipotong pada satu lokasi cos oleh
sebuah l yang dikodekan enzim dan dimasukkan ke dalam kepala faga. Terminase terikat pada
Virologi
125
situs cos dan fag kepala, memotong situs cos, dan memasukkan ujung DNA ke kepala faga
(Gbr. 3.13d). Terminase memotong situs cos secara asimetris, membiarkan 12 pasangan dasar
overhang. Enzim penghentian kemudian melacak sepanjang concatomer dari l DNA sampai
mencapai a situs cos kedua Sebagai jalur pelepasan, DNA dimasukkan ke dalam kepala faga.
Ketika sebuah Situs cos kedua tercapai, terminase memotong DNA dan bit DNA terakhir
dimasukkan ke kepala faga (Gambar 3.13e).
Kepala faga ini dengan DNA yang baru dimasukkan tidak stabil dan tidak bisa bergabung
dengan fag ekor Protein W dan FII ditambahkan ke dasar kepala penuh (Gambar
3.13e). Ini keduanya menstabilkan kepala yang mengandung DNA dan membangun konektor
yang menjadi ekornya akan mengikat Ekor menambahkan secara spontan ke struktur ini
(Gambar 3.13f).
Ekor dibangun dari 12 produk gen. Seperti kapsul, ekornya terbentuk dari kompleks
inisiator yang tidak jelas. Kompleks ini membutuhkan J, I, L, K, H, G, dan M protein fag Mereka
ditambahkan ke kompleks dalam urutan yang terdaftar diawali dengan J protein. Untuk alasan
ini, diperkirakan ekor dibangun dari ujung yang dikenali bakteri menjelang akhir yang mengikat
kepala fag. Setelah struktur inisiator terbentuk, protein ekor utama, V, ditambahkan. Protein
H digunakan sebagai alat ukur tongkat dan tentukan berapa lama ekornya. Setelah ekor
mencapai yang benar panjang, protein U ditambahkan untuk mencegah pertumbuhan lebih
lanjut dan protein H dibelah. Protein Z ditambahkan terakhir dan diperlukan untuk membuat
fag menular. Ekor tanpa Z akan mengikat kepala fag penuh namun partikel yang dihasilkan
tidak menular. (Hersey, 1952)
Sistem kemasan faga mengemas molekul DNA berdasarkan cos situs daripada
berdasarkan panjang molekul DNA. Memvariasikan panjang dari Molekul DNA, dalam batasan
yang ditetapkan, dapat dikemas selama molekul mengandung sebuah situs cos di kedua
ujungnya. Jika jarak antara dua lokasi cos kurang dari ~ 37 kb, partikel fag yang dihasilkan tidak
stabil. Bila DNA berada di dalam kapsid itu, itu Tekanan pada kapsid. Demikian pula kapsul
memberikan kekuatan batin pada DNA. Jika tidak ada cukup DNA di dalam kapsid, itu akan
meledak dari dalam kekuatan kapsid. Jika jarak antara dua lokasi cos terlalu jauh (~ 52 kb),
maka kapsid akan diisi sebelum cos kedua tercapai. Ekor tidak bisa ditambahkan karena DNA
yang menggantung dari kapsid ada di jalan dan tidak ada partikel fag yang menular diproduksi.
Virologi 126
semacam protease khusus. Yang diaktifkan RecA berinteraksi dengan LexA, yang
menyebabkan pembelahan LexA. Hal ini menyebabkan pengaktifan sejumlah gen yang Produk
memperbaiki kerusakan DNA di dalam sel. Aku sudah mengetuk ke dalam sistem ini melalui
protein CI. Represor CI bisa berinteraksi dengan RecA yang diaktifkan, yang mengarah ke
pembelahan CI. Hal ini menyebabkan ekspresi gen litik fag dan produksi fag Yang rasional
untuk respon ini adalah bahwa l tidak mau mengambil risiko tinggal di sel yang memiliki
kerusakan DNA dan mungkin tidak bertahan.(carter, 2007)
Superinfeksi
Jika sel adalah l logenogen, faga lain yang menginfeksi tidak mampu menjalani
perkembangan litik dan menghasilkan fag. Fase yang masuk bisa menyuntikkan DNA-nya,
bagaimanapun, DNA segera dimatikan dan tidak ada transkripsi atau terjemahan dari para
inisiat saya. lysogens kebal terhadap infeksi oleh partikel faga lain, yang disebut superinfeksi.
Superinfeksi adalah diblokir karena lysogen terus memproduksi repressor CI. Lysogen itu
Sebenarnya menghasilkan lebih banyak represor daripada perlu mematikan satu fag.
Tambahan ini represor mengikat DNA fag superinfeksi pada OL dan OR dan mencegahnya
transkripsi dari PL dan PR(Carter, 2007).
Virologi
127
atau modifikasi sistem yang mengenali urutan DNA yang berbeda. Enzim restriksi dimurnikan
dan digunakan secara in vitro untuk membelah DNA pada urutan DNA tertentu, tergantung
pada pengakuannya urutan enzim yang bersangkutan. Enzim restriksi digunakan untuk
membelah dan fragmen DNA kloning seperti yang dijelaskan
sebelumnya.
Gambar 3.14 Tanggapan SOS menginduksi l. Pengobatan UV terhadap sel (a) merusak DNA
dan daun membentang DNA beruntai tunggal (b). DNA beruntai tunggal mengaktifkan RecA
(c). Diaktifkan RecA berinteraksi dengan CI, memimpin untuk pembelahan CI dan induksi
lysogen (d). Diaktifkan RecA juga berinteraksi dengan LexA dan menyebabkan inaktivasi
LexA
(e). Inaktivasi LexA mengarah ke ekspresi dari sejumlah gen, termasuk beberapa perbaikan
DNA enzim.
Sumber :Sumber :htttp://http://www.microinmuno.qb.fcen.uba.ar/03-Bacteriophage.pdf
Virologi 128
Perlindungan genom M13
DNA M13 yang berakhir di sitoplasma adalah molekul DNA beruntai tunggal yang
melingkar. Strand yang hadir dalam partikel fag dikenal sebagai plus atau + strand. Setelah
masuk ke dalam sitoplasma, DNA untai + segera dilapisi dengan E. coli yang disewa DNA
mengikat protein yang dikenal sebagai SSB. Lapisan SSB melindungi DNA dari degradasi.
Replikasi DNA M13
Untai M13 plus diubah menjadi molekul beruntai ganda masuk ke E. coli (Gambar 3.15).
Sintesis untai komplementer dilakukan seluruhnya oleh mesin sintesis DNA E. coli. Untai
komplementer disebut minus atau untai. Hanya untai minus yang digunakan sebagai template
untuk sintesis mRNA dan akhirnya itu adalah template untuk terjemahan produk gen M13
yang dikodekan. SSB yang melapisi untai plus saat masuk DNA ke dalam sitoplasma E. Coli
gagal untuk mengikat ~ 60 nukleotida dari molekul (Gambar 3.15c). Nukleotida ini membentuk
lingkaran hairpin yang terlindungi dari degradasi nuklease. M13 gpIII dari fag ditemukan
berhubungan dengan hairpin loop. Lingkaran hairpin dikenali oleh E. coli RNA polimerase
sebagai asal replikasi DNA dan digunakan untuk memulai transkripsi primer RNA pendek
(Gambar 3.15d). Primer RNA diperluas dengan E. coli DNA polymerase III untuk membuat untai
minus (Gambar 3.15e). Primer RNA akhirnya dihapus oleh aktivitas eksonuklease DNA polimer
E. coli I. Kesenjangan diisi oleh aktivitas polimerisasi 5 ¢ sampai 3 ¢ dari polimerase DNA yang
sama. E. coli ligase membentuk ikatan fosfodiester terakhir menghasilkan sirkuler beruntai
ganda tertutup kovalen Kromosom M13. Bentuk doublestranded dari M13 Kromosom disebut
DNA bentuk replika (RF).
Bentuk RF direplikasi dengan menggulung lingkaran replikasi mirip dengan mekanisme
yang digunakan oleh kromosom l (lihat Gambar 3.12b). Protein yang dikodekan M13 gen II
adalah endonuklease yang menorehkan untaian plus DNA RF pada spesifik tempat untuk
memulai proses replikasi DNA RF M13. Sekitar 100 salinan DNA RF M13 dibuat. Sementara
kromosom M13 sedang direplikasi, gennya pengkodean protein mantel ditranskripsikan dan
diterjemahkan. Bila protein M13 gpV terakumulasi menjadi cukup tingkat, sebuah saklar dari
sintesis DNA RF untuk disintesis untai plus terjadi. GpV blok sintesis untai minus, mungkin
dengan menggeser SSB pada ditambah untai dan mencegah untai plus dari keberadaan
digunakan sebagai template Untai plus disirkulasikan.
Virologi
129
Gambar 3.15 Konversi dari M13 ditambah untai ke doublestranded Molekul DNA Itu
ditambah untai memasuki sel (a dan b) dengan gpIII terpasang ini segera dilapisi dengan
inang SSB (c). RNA polimerase mensintesis primer pendek (d) dan DNA polimerase
mensintesis untai minus.
Sumber :Sumber :htttp://http://www.microinmuno.qb.fcen.uba.ar/03-Bacteriophage.pdf
Virologi 130
3.18). Proteinnya memotong DNA, membuat a akhir untai ganda. Ini akhir dimasukkan ke
dalam fag kepala. DNA berlanjut didorong masuk ke dalam kepala sampai kepala penuh, a
proses yang disebut pengemasan penuh. Setelah yang pertama Kepala fag diisi, yang lain fag
kosong dimulai pengemasan. Percobaan menunjukkan bahwa sampai lima headfulls DNA bisa
jadi dikemas secara berurutan dari satu situs pac pada efisiensi 100%. Lima tambahan DNA
headfull bisa dikemas meski efisiensinya berangsur-angsur menurun Lima headfull terakhir
hanya sekitar 5%. Sementara masing-masing kepala faga mengandung hal yang sama gen,
urutan gen berubah. Ini dikenal sebagai permutasi lingkaran dari genom. Setelah kepala penuh
DNA, doublestranded Potongan dibuat dan ekor dilekatkan. Ini bagian dari Perkembangan
faga sangat banyak merupakan jalur perakitan. P1 akan mengkodekan endolysin dan holin
untuk digunakan dalam pelisisan sel, mirip dengan yang dijelaskan untuk virus.
Gambar 3.16 M13 dilepaskan dari sel tanpa lysing bakteri. (a) Untai plus, dilapisi dengan gpV
berinteraksi dengan membran melalui gpVII dan gpIX. (b) Sebagai DNA Melintasi membran,
gpV digantikan oleh gpVIII.
Sumber :Sumber :htttp://http://www.microinmuno.qb.fcen.uba.ar/03-Bacteriophage.pdf
Virologi
131
Gambar 3.17 genom P1 keduanya sirkuler dan hampir habis. Terminal redundansi
berarti bahwa urutan yang sama ada pada kedua ujung satu molekul DNA.
Permutasi sirkuler berarti bahwa urutan gen Setiap molekul DNA berbeda
tapi setiap molekul DNA mengandung gen yang sama.
Partikel transduksi P1
Salah satu aspek yang tidak biasa dari perkembangan P1 adalah pembentukan partikel
transduksi atau partikel fag yang mengandung DNA kromosom dan bukan DNA fag. E. Coli
kromosom berisi banyak situs pseudopac atau situs yang bisa digunakan untuk memulai
pengemasan DNA kromosom inang ke fag yang jatuh tempo. Situs pseudopac ini adalah
digunakan jauh lebih jarang daripada situs pacaran faga tapi penggunaannya. Hasilnya fag
membawa potongan acak kromosom sebagai pengganti genom fag. Itu Kemampuan untuk
mengemas setiap potongan DNA kromosom alih-alih DNA fag membuat P1 a Fase transduksi
umum. Partikel transduksi digunakan untuk memindahkan potongan DNA kromosom inang
dari satu strain ke strain lainnya untuk tujuan yang dijelaskan bab sebelumnya. kromosom
berisi banyak situs pseudopac atau situs yang bisa digunakan untuk memulai pengemasan DNA
kromosom inang ke fag yang jatuh tempo. Situs pseudopac ini adalah digunakan jauh lebih
jarang daripada situs pacaran faga tapi penggunaannya. Hasilnya fag membawa potongan acak
kromosom sebagai pengganti genom fag. Itu Kemampuan untuk mengemas setiap potongan
DNA kromosom alih-alih DNA fag membuat P1 a Fase transduksi umum. Partikel transduksi
digunakan untuk memindahkan potongan DNA kromosom inang dari satu strain ke strain
lainnya untuk tujuan yang dijelaskan sebelumnya.
Virologi 132
Gambar 3.18 paket P1 DNA dari situs pac (a) dan paket antara 7 dan 12% lebih dari
satu genom P1, sampai fag kepala penuh (b dan c). Sekali Kepala fag
penuh, a kepala preassembled ditambahkan (d).
Sumber :htttp://http://www.microinmuno.qb.fcen.uba.ar/03-Bacteriophage.pdf
Virologi
133
untuk sintesis DNA dan gen akhir mengkodekan protein yang dibutuhkan membangun struktur
kapsul dan ekor. Banyak tahap faga ekspresi gen mereka dalam mode temporal ini untuk
memastikan konstruksi partikel fag yang tepat. Genom T4 tidak mengandung residu sitosin.
Semua sitosin dimodifikasi dengan metilasi. Beberapa gen awal mengkodekan protein yang
menurunkan sitosin DNA inang. DNA fag terlindungi dari degradasi. T4 genom, seperti P1
keduanya sirkuler dan halus dan redundan. T4 punya sekitar Redundansi terminal 3%. Tidak
seperti P1, T4 tampaknya tidak menggunakan redundansi terminal ini untuk disebarkan pada
T4 memulai replikasi segera setelah awal Produk gen dibuat. T4 bereplikasi sebagai molekul
linier dan menggunakan replikasi dan rekombinasi untuk kedua meniru seluruh genom dan
membuat concatomers untuk paket ke kepala faga (Gambar 3.19). Seperti fag lainnya, kapsul,
ekor, dan concatomers DNA faga adalah premade dan dirakit menjadi partikel faga menular di
akhir faga pengembangan.
Gambar 3.19 T4 mereplikasi DNA-nya dengan menggunakan replikasi dan rekombinasi. (a) Molekul
DNA T4 linier disuntikkan ke sitoplasma inang. (b) Replikasi DNA dimulai dari suatu asal dan hasil
bidirectionally ke ujung. Namun, karena kebutuhan DNA polimerase untuk primer, sepotong DNA di
salah satu ujung molekul tidak dapat direplikasi dan tetap terdampar tunggal. (c) ini bagian dari DNA
beruntai tunggal dapat menyerang DNA dupleks di tempat mana ia memiliki homologi, seperti awal
reaksi dalam rekombinasi. (d) Replikasi DNA molekul ini akan menyebabkan konsatomasi fag genom
Bergantung pada tempat invasi untai terjadi, molekul bercabang juga bisa terbentuk. T4 paket DNA
keluar dari concatomers. Untai tunggal yang terlantar bebas untai menyerang struktur concatomer.
Sumber :htttp://http://www.microinmuno.qb.fcen.uba.ar/03-Bacteriophage.pdf
Virologi 134
Mutasi T4 RII dan sifat kode genetiknya
Studi dua gen di T4 telah memberikan kontribusi signifikan terhadap pemahaman kita
tentang kode genetik dan sifat gen. Pada akhir 1950-an dan 1960-an pemahaman dari sifat
gen itu masih dalam masa pertumbuhan. Pikiran yang berlaku adalah bahwa Gen adalah unit
genetik terkecil dan diwarisi sebagai satu kesatuan. Sifat kimia DNA baru saja dijelaskan oleh
Watson dan Crick. Hubungan antara DNA dan gen itu tidak dipahami. Seymour Benzer
menggunakan lokus T4 rII dan genetik logika untuk menggambarkan beberapa ciri utama gen.
rII mengkodekan dua protein, A dan B. Beberapa ribu titik mutasi dan delesi diisolasi dalam
dua gen ini. Mutasi ini dimanfaatkan dengan baik. Sebuah fag membawa satu mutasi dan fag
yang membawa mutasi kedua dicampur bersama dan tumbuh dengan tepat tuan rumah untuk
menentukan apakah ada keturunan telah direkombinasi kembali ke tipe liar Banyak dari fag
ini persilangan dilakukan dan digunakan untuk membuat peta dimana mutasi tinggal di lokus
rII. Beberapa kesimpulannya adalah diambil dari studi ini. Mutasi penghapusan adalah
didefinisikan sebagai mutasi itu tidak bisa menghasilkan wildtype rekombinan kapan
disilangkan dengan lebih dari satu dari mutasi lainnya Mutasi penghapusan adalah kehilangan
sebagian gen. Dalam ribuan persilangan yang dilakukan, frekuensi mendapatkan rekombinan
tipe liar dapat diprediksi berdasarkan posisi awal mutasi Hal ini menyebabkan kesimpulan
bahwa DNA adalah a molekul linier di seluruh panjang gen dan bukan a molekul bercabang.
Jika DNA sedang bercabang, maka frekuensi rekombinasi harus sangat berbeda Ketika satu
mutasi tinggal di satu sisi cabang dan mutasi lainnya tinggal di seberang cabang. Dengan
menggunakan frekuensi rekombinasi, ditentukan rekombinasi itu bisa terjadi di dalam gen dan
tidak hanya di luarnya telah dipikirkan Ini mengubah definisi gen dari unit keturunan yang
bermutasi ke keadaan yang berubah dan digabungkan kembali dengan gen lainnya. Sekarang
diakui bahwa gen adalah unit fungsional yang harus utuh dalam DNA untuk mengarah pada
yang spesifik karakteristik atau fenotip. Masing-masing studi ini menyoroti perilaku gen dan
sifat mutasi.
Salah satu penghapusan menyatukan gen A ke gen B sehingga gen A tidak fungsional tapi
gen B (Gambar 3.20). Beberapa mutasi titik di A bisa jadi menyeberang ke fag yang sama yang
membawa penghapusan tersebut. Jika mutasi titik di A tidak mempengaruhi aktivitas B pada
gen yang menyatu maka mutasi titik ditafsirkan menjadi mutasi missense Mutasi Missense
dapat menyebabkan perubahan pada kode genetik tanpa mempengaruhi produksi produk
protein. Mutasi titik lain di A Apakah mempengaruhi aktivitas B. Ini ditafsirkan sebagai mutasi
yang tidak masuk akal atau perubahan yang menghentikan produksi protein B. Studi ini
mengarah langsung ke konsep gen modern dan bagaimana fungsinya.
Virologi
135
Gambar 3.20 lokus T4 rII adalah digunakan untuk melakukan studi di sifat gen. (a) rII adalah Terdiri dari
dua gen A dan B yang biasanya dibuat menjadi protein terpisah (b) spesifik penghapusan dijelaskan
dari studi pemetaan Penghapusan ini (disebut r1589) menyatu dengan A dan B gen, meninggalkan A
nonfunctional tapi B fungsional. (c) Beberapa mutasi di A, disebut missense mutasi tidak mengganggu
Fungsi B. (d) Mutasi lainnya di A memang mengganggu B fungsi. Mutasi ini terjadi dikatakan "palsu"
dan mengganggu produksi dari B.
Sumber : htttp://http://www.microinmuno.qb.fcen.uba.ar/03-Bacteriophage.pdf
Virologi 136
Latihan
Untuk dapat memperdalam pemahaman saudara mengenai materi di atas, kerjakanlah
Latihan berikut!
Ringkasan
Bakteriofaga atau faga adalah virus yang menginfeksi bakteri saja. Sebaliknya ke sel
tumbuh dari peningkatan jumlah komponennya dan bereproduksi. Virus bersifat nukleat
molekul asam yang dikelilingi oleh lapisan pelindung. Mereka tidak mampu menghasilkan
energi dan bereproduksi di dalam sel. Asam nukleat di dalam lapisan, disebut genom faga
dalam bakteriofag, mengkodekan sebagian besar produk gen yang dibutuhkan untuk
membuat lebih banyak faga. Genom faga dapat dibuat dari dua atau dua DNA untai tunggal
atau RNA, tergantung pada bakteriofaga yang dimaksud. Genom bisa melingkar atau linier
Lapisan pelindung atau kapsid yang mengelilinginya Genom faga terdiri dari protein yang
disandikan faga. Banyak penemuan penting telah dibuat dengan menggunakan sistem faga
sebagai model. Dari penemuan bahwa kodon nonsense menghentikan sintesis protein ke
perkembangan pertama beralih ke dipahami pada tingkat molekuler, fagatelah terbukti sangat
berguna. Dalam bab ini, kita akan melihat perkembangan fagamenggunakan T4, l (lambda),
P1, dan M13 sebagai contoh. Masing-masing fagaini menginfeksi E. coli. Kami akan memeriksa
penemuan spesifik menggunakan fagabatau sifat spesifik dari faga yang telah membuat
mereka sangat berguna bagi ahli biologi.
Virologi
137
Tes 2
Pilihlah salah satu jawaban yang paling benar!
2. Sebutkan satu gugus yang dipakai bakteri sebagai salah satu pertahanan dalam
menghalau infeksi faga.
A. CH3
B. H2S
C. NO3
D. SO4
E. CO
Virologi 138
4. Dari gambar diatas Bagaimana hubungan antara fase litik dan lisogenik pada
bakteriofaga?
A. Virus dalam keadaan lingkungan tertentu pada saat mengalami fase lisogenik dapat
berpindah ke fase litik
B. Virus dalam keadaan lingkungan tertentu pada saat mengalami fase lisogenik tidak
dapat berpindah ke fase litik
C. Virus dalam keadaan lingkungan apapun pada saat mengalami fase lisogenik dapat
berpindah ke fase litik
D. Virus dalam keadaan lingkungan apapun pada saat mengalami fase lisogenik tidak
dapat berpindah ke fase litik
E. Virus dalam keadaan lingkungan tertentu tetap mengalami fase litik dan lisogenik
Virologi
139
6. Bagian bakteriofaga yang masuk ke dalam tubuh sel inang adalah ...
A. DNA
B. Kapsid
C. Ekor
D. Kapsomer
E. Leher
7. Bakteri yang terinfeksi virus ketika berada dalam daur lisogenik tidak memperlihatkan
gejala terganggu karena …. A. Virus belum matang
B. Virus tidak bersifat parasit
C. Virus belum menginjeksikan materi genetik
D. DNA virus belum aktif
E. Jumlah asam nukleat virus masih sedikit
A. 5 B. 1 C. 3
D. 2
E. 4
10. Pada saat virus berada dalam tahap lisogenik, mengapa tubuh tidak merasa sakit? Hal ini
disebabkan virus …. A. Tidak bersifat parasit
B. Merusak sistem imun
Virologi 140
C. Dapat masuk ke fase litik
D. Belum cukup matang
E. Masih berada dalam sel sehingga sistem imun tidak dapat mendeteksi benda asing
14. Bagian dari Bakteriofaga T4 yang berfungsi untuk mengeluarkan DNA ke mangsanya
adalah.. A. Bagian leher
B. Bagian ekor
C. Bagian Kepala/Kapsid
D. Bagian Penyengatnya
E. Bagian kapsid
15. Replikasi virus yang diakhiri dengan matinya sel inang disebut ….
A. Infeksi sel inang
B. Lisis
C. siklus litik
D. Proliferasi
E. Siklus lisogenik
Virologi
141
Kunci Jawaban Tes
Test Formatif 1
1. E
2. C
3. E
4. A
5. E
6. C
7. B
8. C
9. E
10. D
11. A
12. A
13. E
14. B
15. D
Test Formatif 2
1. E
2. A
3. A
4. A
5. B
6. C
7. D
8. C
9. D
Virologi 142
10. E
11. D
12. A
13. C
14. B
15. C
Glosarium
A
Agen Delta : : Agen penyebab penyakit hepatitis D
Adsorpsi Suatu bentuk penempelan virus pada permukaan agen
Asam Nukleat : merupakan biopolimer, dan monomer penyusunnya
adalah nukleotida
Anelloviruses : merupakan familli virus diklasifikasikan sebagai virus vertebrata dan
memiliki kapsid yang tidak tertutup, yang bulat dengan isometric
Apoptosis : mekanisme biologi yang merupakan salah satu jenis kematian sel
terprogram
Arenaviruses : grup virus yang dapat menyebabkan infeksi pada mata, usus, paru,
dan saluran napas
Arteriviridae : merupakan salah satu golongan virus yang terdiri dari satu benang
tunggal RNA (bukannya DNA)
Astroviruses : Virus yang bisa menyebabkan diare pada remaja biasanya diisolasi
dari mamalia
B
Bakteriofaga : merupakan virus yang menyerang bakteri
Birnaviridae : virus familia ini mempunyai asam nukleat beruntai ganda dengan dua
segmen yang berbeda, dan tidak beramplop
Bornaviruses : Virus yang dilihat di bawah mikroskop elektron, mahkota terlihat
seperti tancapan paku-paku yang terbuat dari S glikoprotein
Bunyaviruses : memiliki ciri virion yang berbentuk sferis dengan diameter 90100nm,
dan membentuk selubung lipid yang tebuat dari glikoprotein
C
CD4 : jenis sel darah putih atau limfosit
Virologi
143
CD21 : protein yang pada manusia dikodekan oleh gen CR2
Capsid : bagian struktur oligomerikyang tersusun dari protomer
Capsomer : Subunit protein repetitif yang membentuk kapsid; sering tersusun
dalam pola simetris
Circoviridae : virus yang tidak beramplop, bersifat imunosupresan dan resisten
terhadap desinfektan
D
daur litik : pada fase akhir siklus replikasi, sel yang menjadi inang dalam replikasi
virus akan mengalami lisis (mati)
daur lisogenik : virus yang tidak menyebabkan bakteri mengalami lisis
DNA : : merupakan materi genetik dari sebagian besar organisme
Defective viruses : virus yang bervirulensi
Virologi 144
:
E
Eukariota sel tersebut memiliki membran inti yang jelas, kromosomnya jamak,
mempunyai dua jenis
DNA yaitu DNA inti yang berbentuk linier yang terikat pada protein histon
dan DNA mitokondria yang berbentuk sirkuler, contohnya protozoa,
spermatozoa, dan sel penyusun tubuh mamalia
G
Genom : jumlah kromosom atau materi genetik dalam susunan haploid yang
terdapat dalam sel setiap individu suatu spesies
Glycoproteins : suatu protein yang mengandung rantai oligosakarida yang mengikat
glikan dengan ikatan kovalen pada rantai polipeptida bagian
samping
H
Hervesvirus : Kelompok virus umumnya memiliki karakter yang unik, yaitu
memiliki kemampuan untuk survive latent dalam sel inang untuk
jangka waktu yang lama, dan akan menjadi aktif kembali apabila ada
pemicu
Hepadnaviruses : keluarga virus Hepadnaviridae, mampu menyebabkan infeksi hati
pada manusia dan hewan
I
ICAM-1 : ( Intercellular Adhesion Molecule 1) juga dikenal sebagai adalah
protein yang pada manusia dikodekan oleh gen ICAM1
K
Kodon : proses penerjemahan urutan nukleotida yang ada pada molekul
mRNA menjadi rangkaian asam-asam amino yang menyusun suatu
polipeptida atau protein
Koreseptor : reseptor penunjang
L
Lisis : tahap ketika partikel virus keluar dari sel inang dengan merusak sel
tersebut
Lipids : jaringan lemak
Virologi
145
:
lysogenic growth : faga mereplikasi dan menginduksi lisis sel inang yang melepaskan
faga progeni ke lingkungan, sementara pada pertumbuhan lisogenik,
genom fag terintegrasi ke dalam kromosom inang dan direplikasi
bersamaan dengan DNA inang.
M
Mendegradasi mRNA : : Melisiskan, menghancurkan
(messenger RNA) adalah RNA yang menjadi model cetakan dalam
sintesis protein pada saat translasi
N
Nukleokapsid Gabungan asam nukleat dan kapsid
O
Orthomyxovirus Penyebab penyakit Avian Influenza adalah virus yang digolongkan
sebagai orthomyxovirus
P
Progeni: : keturunan yg berasal dr sumber yg sama
Prokariota : organisme pertama, dan bertahan hidup sampai sekarang sebagai
organisme hidup yang paling luas tempat hidupnya dan paling
banyak jumlahnya
Poliovirus : Virus penyebab folio
Penetrasi : masuknya kedalam lubang dengan atau tanpa luka jaringan
Parvovirus : merupakan salah satu virus yang menyerang saluran pencernaan
Papillomavirus : virus enginfeksi pada manusia (human papilloma virus/HPV) pada
kelamin adalah contoh infeksi menular seksual (IMS) yang paling
umum
Peplomers : Protein spesifik pada virus
Protomer : Protein dan bagian-bagian pembentuk oligomer
R
RNA : molekul polimer yang terlibat dalam berbagai peran biologis dalam
mengkode, dekode, regulasi, dan ekspresi gen
Rhinovirus : virus yang memiliki RNA dan merupakan bagian dari famili
Picornaviridae
Virologi 146
:
Reovirus : merupakan golongan virus yang terdiri dari genus reovirus, arbovirus
dan rotavirus. Sifat-sifat dari Reoviridae : Ukuran diameter virion 60-
80 nm dan memiliki dua kulit kapsid yang terpusat (kosentris),
dimana tiap virion berbentuk ikosahedral (rotavirus mempunyai tiga
lapisan).
Reseptor : molekul protein yang menerima sinyal kimia dari luar sel yang
mengarahkan kegiatan sel seperti membelah atau mengizinkan
molekul tertentu untuk masuk atau keluar sel
Replikasi : proses penggandaan rantai ganda DNA
S
Sel penjamu : semua faktor yang terdapat pada diri manusia yang dapat
mempengaruhi timbulnya serta perjalanan penyakit.
T
Transkripsi : Pembuatan RNA dengan menyalin sebagian berkas DNA
V
Virion : Selubung virus
Virus Eipstein-Barr : virus yang paling umum untuk mempengaruhi manusia. EBV
menyerang dua jenis sel dalam tubuh termasuk sel kelenjar liur dan
sel darah putih yang diketahui sebagai limfosit B (sel B).
Vaksin bagian virus yang di lemahkan yang diapakai untuk membentuk
antibodi
Virus mikroorganisme peralihan, yang hanya tersusun DNA atau RNA
Viral : infeksi yang disebabkan oleh virus
Virologi
147
:
Virologi 148
Daftar Pustaka
Anonim, Bacteriophace Chapter 7. htttp://
http://www.microinmuno.qb.fcen.uba.ar/03Bacteriophage.pdf, diunduh 23 Desember 2017
Aditya, dkk, Makalah Karakteristik, dan Reproduksi Virus, universitas Islam negri Alauddin, Makasar
2014
Neidhardt, R. Curtiss III, J.L. Ingraham, E.C.C. Lin, K.B. Low, B. Hagasanik, Biology, 2nd edn., eds. F.C.
Campbell, A.M. 1996. Bacteriophages. In Escherichia coli and Salmonella typhimurium: Cellular and
Molecular
Carter, JB.; Saunders, VA. (2007), Virology: Principles and Application, England: John Wiley & Sons
Ltd., ISBN 978-0-470-02386-0
Clinical Microbiology Rev 2006; 19: 165.Girones R: Melacak virus yang mencemari lingkungan.Microbe
2006; 1: 19
DO.; Fenner, F. (1994), Medical virology, California: Academic Press, ISBN 978-0-12-746642-2
Espy MJ, Uhl JR, Sloan LM, dkk: PCR real-time secara klinismikrobiologi: Aplikasi untuk pengujian
laboratorium rutin.
Hershey AD, Chase M (1952). "Independent Function of Viral Protein and Nucleic Acid in Growth
of Bacteriophage" (pdf). Journal of General Physiology 36: 39–56.
Jawetz, Melnick, & Adelberg's, Geo. F. Brooks, Karen C. Carroll, Janet S. Butel, Stephen A.
Morse, Timothy A. Mietzner. 2007. Medical Microbiology, 25 th edition, The McGrawHill
Companies. New York.
King AMQ, Adams MJU, Carstens, EB, Lefkowitz EJ (editor):Taksonomi Virus: Klasifikasi dan
Nomenklatur Virus.
Knipe DM, Howley PM (editor-in-chief): Bidang Virologi, edisi ke-5.Lippincott Williams &
Wilkins, 2007.Mencegah munculnya penyakit menular: Sebuah strategi untuk tanggal
21 abad. Ikhtisar rencana CDC yang telah diperbarui. MMWR Morb
Mahy, BWJ.; van Regenmortel, MHW. (2010),Desk Encyclopedia of General Virology, San
Diego: Elsevier, ISBN 978-0-12-375145-1
Virologi
149
Nimade, dwisarini desa, Virus,http://nimadesastridwisarinisma3dps.blogspot.co.id/2010, diunduh 22
Desember 2017
Ptashne, M. 1993. A Genetic Switch. 2nd edn. Cambridge, MA: Blackwell Scientific.
Young, R., Wang, I.-N., and Roof, W. 2002. Phage will out: Strategies of host cell lysis. Trends
in Microbiology,8: 120–8.
Strauss, JH.; Strauss, EG. (2008), Viruses and Human Disease, London: Elsevier, ISBN 978-012-
375145-1
SAASTA. (2010.) Biotechnology and Medical Research. Diunduh dari http:// www.pub.
ac.za/ pdfs/factfile_biotech_med.pdf, diakses tanggal 2 Maret 2017)
Talaro, Kathleen Park Foundations in Microbiology: Basic Principles 8th Edition Mc.
McGrawHill Published by McGraw-Hill, a business unit of The McGraw-Hill Companies,
Inc., 1221 Avenue of the Americas,New York, NY 10020. Copyright © 2012
Woolhouse MEJ: Darimana asal patogen yang muncul? Microbe 2006; 1: 511.
W.S. Rexnikoff, M. Riley, M. Schaechter, and H.E. Umbarger, pp. 2325–38. Washington, DC:
ASM Press.
Zaman, G., Smetsers, A., Kaan, A., Schoenmaters, J., and Konings, R. 1991. Regulation of
expression of thegenome of bacteriophage M13. Gene V protein regulated translation
of the mRNAs encoded by genes I,II, V and X. Biochimica et Biophysica Acta, 1089: 183–
92.
Virologi 150
Bab 4 REAKSI IMUNOLOGI DAN VAKSIN
VIRUS
Drh.Ocky Dwi Suprobowati,M.Kes
Pendahuluan
ada modul 4 ini kita akan membahas tentang reaksi imunologi dan vaksin virus.
P Studi tentang imunologi merupakan suatu bidang luas yang meliputi penelitian dasar
dan aplikasi klinis, berhubungan dengan reaksi pertahanan pejamu terhadap entitas
asing (bukan diri) yang dikenal sebagai antigen, molekul pengenalan
antigen, dan fungsi pertahanan pejamu yang diperantarai sel. Terutama yang
berkaitan dengan imunitas terhadap penyakit, hipersensitivitas (termasuk alergi),
autoimunitas, imunodefisiensi, dan transplantasi. Bab ini membahas tentang prinsip dasar
imunologi dan vaksin virus.
Tubuh manusia akan selalu terancam oleh paparan bakteri, virus, parasit, radiasi
matahari dan polusi. Stres emosional atau fisiologis dari kejadian ini adalah tantangan lain
untuk mempertahankan tubuh yang sehat. Biasanya manusia dilindungi oleh sistem
pertahanan tubuh, sistem kekebalan tubuh, terutama makrofag, dan cukup lengkap
kebutuhan gizi untuk menjaga kesehatan. Kelebihan tantangan negatif, bagaimanapun dapat
menekan sistem pertahanan tubuh, sistem kekebalan tubuh, dan mengakibatkan berbagai
penyakit fatal.
Sistem kekebalan atau sistem imun adalah sistem pertahanan manusia sebagai
perlindungan terhadap infeksi dan makromolekul asing, termasuk virus, bakteri, protozoa dan
parasit. Sistem kekebalan juga berperan dalam perlawanan terhadap protein tubuh dan
molekul lain seperti yang terjadi pada autoimunitas.
Pada proses peradangan, penderita dapat merasa tidak nyaman oleh karena efek
samping yang dapat ditimbulkan sifat toksik senyawa organik yang dikeluarkan sepanjang
proses perlawanan berlangsung.
Sejak ditemukan vaksin pada abad ke 18 maka teknologi pembuatan vaksin dan ilmu
pengetahuan tentang vaksin telah maju dengan sangat pesatnya dan hal positif yang kita lihat
dan kita rasakan dari vaksin adalah bahwa dunia kedokteran saat ini telah berhasil
mengeliminasikan beberapajenis penyakit infeksi yang dahulu kala sangat mematikan,
misalnya penyakit cacar airyang setiap kali terjadi wabah akan membawa korban
Virologi
151
meninggalcukup banyak, penyakit polio dibeberapa bagian dunia ini, dan beberapa penyakit
infeksi lain yang bisa diatasi dengan pemberian vaksin yang tepat dan vaksinasi. Dengan
kemajuan teknologi pembuatan vaksin, maka kita juga telah mengenal banyak jenis vaksin
yang tersedia untuk berbagai macam penyakit infeksi yang bisa dicegah dengan vaksin.
Setelah anda mempelajari bab ini, anda diharapkan dapat menjelaskan tentang daya
tahan tubuh terhadap virus dan reaksi imunitas tubuh terhadap virus serta pengertian vaksin
dan macam-macam vaksin.
Virologi 152
Topik 1
Reaksi Imunologi
I tubuh terhadap pengaruh biologis luar dengan mengidentifikasi dan membunuh munitas atau
kekebalan adalah sistem mekanisme pada organisme yang melindungi
patogen serta sel tumor. Sistem ini mendeteksi berbagai macam pengaruh biologis luar
yang luas, organisme akan melindungi tubuh dari infeksi, bakteri, virus sampai cacing parasit,
serta menghancurkan zat-zat asing lain dan memusnahkan mereka dari sel organisme yang
sehat dan jaringan agar tetap dapat berfungsi seperti biasa.
Untuk menimbulkan penyakit, virus harus memasuki suatu inang, berkontak dengan sel
yang rentan, bereplikasi dan menimbulkan cidera sel. Langkah-langkah khusus yang terjadi
pada patogenitas virus tersebut adalah masuknya virus ke dalam sel inang. Beberapa keadaan
fisik dan kimiawi yang berpengaruh terhadap kehidupan virus antara lain suhu, stabilitas virus
dengan garam-garam, derajat keasaman (pH), radiasi, pengecatan vital, kepekaan terhadap
eter, pengaruh obat-obat kemoterapeutika dan kemoprofilaksis, serta efek terhadap
desinfektan.
Virologi
153
Morbilli dan Mumps, Na2SO4 1 mol menstabilkan terhadap virus Herpes simplex danHerpes
zoster.
Adakalanya efek stabilisasi dengan garam ini digunakan untuk membunuh virus
kontaminan. Misalnya pada pembuatan vaksin Polio Sabin. Vaksin ini dibuat dengan cara
menanam virus dalam biakan jaringan ginjal kera Rhesus. Kera ini mungkin saja mengandung
virus SV 40 tanpa menunjukkan gejala sakit, sedangkan menurut penelitian virus SV 40 ini bisa
menyebabkan sarkoma pada hamster dan sudah dibuktikan pula bahwa virus SV 40 berhasil
ditemukan kembali dari tinja orang yang sudah divaksinasi. Untuk mencegahnya maka virus
Polio yang sudah dipanen dari biakan jaringan ginjal kera tadi diberi MgCl 2 1 mol, panaskan
60oC 1 jam, virus Polio tidak diinaktivasi tetapi virus SV 40 mati.
C. Derajat keasaman (pH)
Virus biasanya hidup subur pada pH 5-7,5 dan diluar suhu tersebut virus akan mati atau
inaktif, kecuali golongan Arbovirus yang tahan sampai pH 9. Dan yang paling baik virus
biasanya hidup pada pH 7,0-7,4 oleh karena itu setiap buffer yang digunakan untuk mengolah
virus serta untuk kepentingan tes serologis biasanya digunakan pH 7,0-7,4.
D. Radiasi
Pada umumnya sinar X (sinar Rontgen), ultraviolet (UV) dan partikel berenergi tinggi
dapat menghilangkan aktivitas virus atau membunuh virus. Dosisnya bervariasi untuk setiap
jenis virus.
E. Pengecatan Vital
Virus dapat ditembus sampai tingkat tertentu oleh zat warna vital, seperti toluidin blue,
netral red, proflavin atau acridin orange. Zat warna ini akan diserap dan mengikat asam
nukleat virus sehingga virus akan menjadi peka terhadap cahaya biasa dan virus akan
diinaktivasi. Cara inaktivitasi seperti ini disebut inaktivasi fotodinamik.
F. Kepekaan Terhadap Eter
Kepekaan terhadap eter sangat penting karena dapat menunjukkan apakah virus di dalam
envelopnya mengandung lipida yang larut oleh eter yang menyebabkan virus menjadi inaktif
atau mati, lipida yang tidak dilarutkan oleh eter, envelopnya tidak mengandung lipid.
Berdasarkan kepekaan terhadap eter ini maka dapat dilakukan pembagian virus sebagai berikut :
a. Golongan virus yang sensitive terhadap eter yaitu :
Golongan Arbovirus, Influenza, Parainfluenza, Herpes simplex, Herpes zooster, Pseudorabies,
Japanese B Encephalitis (JBE virus), Cytomegalovirus.
b. Golongan yang tahan(resisten) terhadap eter yaitu :
Golongan Picornavirus, Papovavirus, Poxvirus, Adenovirus, Parvovirus.
G. Pengaruh obat-obat Khemoterapeutika (obat-obat sulfa dan antibiotika) dan Kemoprofilaksia
Hanya virus tidak sejati yang bisa diobati dengan khemoterapeutika (sulfa dan antibiotik).
Untuk golongan virus sejati harus diusahakan obat-obat yang dapat menghambat atau
mencegah absorpsi virus oleh sel (viropeksis), menghambat/mencegah penetrasi virus ke
dalam sel (pinositosis), mencegah pembentukan komponen-komponen virus baru, mencegah
atau menghambat pelepasan virus-virus baru dari sel-sel asal ke sel lain.
Ini berarti bahwa jenis obat yang dipilih harus :
Virologi 154
1. Bereaksi dengan protein kapsid sehingga asam nukleatnya tidak bisa dilepaskan.
2. Mencegah terjadinya perubahan metabolisme sel yang dimasuki virus sehingga protein
dan asam d-nukleat sel yang dimasukinya tidak mungkin berubah menjadi protein dan
asam nukleat virus baru.
3. Hanya efektif terhadap sel yang dimasuki virus, tidak terhadap sel-sel hospes yang lain.
Contoh :Guanidin, mempunyai efek yang baik sekali terhadap golongan Picornavirus
(Polio, Echo, Coxsackie).
Efek kerjanya mencegah pelepasan protein kapsid dari virus secara normal menjadi
abnormal sehingga pembentukan kapsid pada sel yang baru dimasuki dapat dicegah,
kapsid yang baru dibentuk dalam virus yang baru ternyata kosong tidak mengandung
nukleat, bila asam nukleat dibentuk, maka asam nukleat tidak mungkin dilepas dari sel
yang dimasuki ke sel lain.
H. Efek Terhadap Desinfektan
Desinfektan adalah zat (biasanya kimia) yang dipakai untuk maksud desinfeksi
(membunuh organisme-organisme patogen). Pengaruh desinfektan ini ternyata berbedabeda
(Depkes, 1996) :
1. Lisol dan khlor
Dalam konsentrasi tinggi bisa membunuh virus. Khlor dalam konsentrasi tinggi dipakai dalam
kolam renang untuk membunuh virus Polio.
2. Formalin
Dapat menginaktivasi virus terutama virus Polio (pembuatan vaksin). Dipakai pada
pembuatan vaksin Polio Salk (inactivated vaccine). Sesudah ditambah formalin, virus Polio
akan inaktif tetapi daya antigeniknya masih tinggi.
3. Betapropiolaktan
Untuk menginaktivasi virus Rabbies, tetapi daya antigeniknya tetap tinggi. Juga untuk
menginaktiasi Arbovirus, tetapi hasilnya belum memuaskan bagi pembuatan vaksin.
Imunitas atau kekebalan adalah sistem mekanisme pada organisme yang melindungi
tubuh terhadap pengaruh biologis luar dengan mengidentifikasi dan membunuh patogen
serta sel tumor.Sistem ini mendeteksi berbagai macam pengaruh biologis luar yang luas lalu
organisme akan melindungi tubuh dari infeksi, bakteri, virus sampai cacing parasit, serta
menghancurkan zat-zat asing lain dan memusnahkan mereka dari sel organisme yang sehat
dan jaringan agar tetap dapat berfungsi seperti biasa. Deteksi sistem ini sulit karena adaptasi
patogen dan memiliki cara baru agar dapat menginfeksi organisme.
Jika sistem kekebalan melemah, kemampuannya untuk melindungi tubuh juga
berkurang dan membuat mudah terjangkiti virus.Penyakit defisiensi imun muncul ketika
sistem imun kurang aktif daripada biasanya kemudian menyebabkan munculnya infeksi.
Defisiensi imun merupakan penyebab dari penyakit genetik, seperti severe combined
immunodeficiency, yang diproduksi oleh farmaseutikal atau infeksi, seperti sindrom defisiensi
imun dapatan (AIDS) yang disebabkan oleh retrovirus HIV. Penyakit autoimun menyebabkan
sistem imun yang hiperaktif menyerang jaringan normal seolah-olah jaringan tersebut
Virologi
155
merupakan benda asing.Penyakit autoimun yang umum termasuk rheumatoid arthritis,
diabetes melitus tipe 1 dan lupus erythematosus.
Respons imun merupakan respons tubuh berupa suatu urutan kejadian yang kompleks
terhadap antigen untuk mengeliminasi antigen tersebut. Respons imun ini dapat melibatkan
berbagai macam sel dan protein, terutama sel makrofag, sel limfosit, komplemen, dan sitokin
yang saling berinteraksi secara kompleks. Mekanisme pertahanan tubuh terdiri atas
mekanisme pertahanan non spesifik dan mekanisme pertahanan spesifik (Narayan, 2008).
Virologi 156
zat kemotaktik, karena sel-sel ini mempunyai reseptor untuk komponen
komplemen (C3b) dan reseptor kemotaktik. Zat kemotaktik akan memanggil sel
monosit dan polimorfonuklear ke tempat mikroorganisme dan memfagositnya.
4) Protein fase akut. Protein fase akut adalah protein plasma yang dibentuk tubuh
akibat adanya kerusakan jaringan. Hati merupakan tempat utama sintesis protein
fase akut. C-reactive protein (CRP) merupakan salah satu protein fase akut.
Dinamakan CRP oleh karena pertama kali protein khas ini dikenal karena sifatnya
yang dapat mengikat protein C dari pneumokokus. Interaksi CRP ini juga akan
mengaktivasi komplemen jalur alternatif yang akan melisiskan antigen.
5) Sel ‘natural killer’ (NK) dan interferon.Sel NK adalah sel limfosit yang dapat
membunuh sel yang dihuni virus atau sel tumor.Interferon adalah zat yang
diproduksi oleh sel leukosit dan sel yang terinfeksi virus, yang bersifat dapat
menghambat replikasi virus di dalam sel dan meningkatkan aktivasi sel NK.
Virologi
157
antigen. Sel limfosit B akan berdiferensiasi menjadi sel plasma dan memproduksi
antibodi yang akan menetralkan atau meningkatkan fagositosis antigen dan lisis
antigen oleh komplemen, serta meningkatkan sitotoksisitas sel yang mengandung
antigen yang dinamakan proses antibody dependent cell mediated cytotoxicy (ADCC).
Terdapat pula beberapa faktor fisiologis yang mempengaruhi daya tahan tubuh
terhadap penyakit virus antara lain; umur, suhu, genetik, hormonal. Beberapa faktor
diatas dapat kita jabarkan dibawah ini :
a. Umur
Umumnya bila terjadi infeksi virus masa perinatal (dalam kandungan) terutama
pada trimester I kehamilan maka penyakit umumnya berat bagi janinnya dan dapat
berakibat abortus atau kecacatan kongenital.
Bila virus menjangkiti masa infancy (0-3 tahun) umumnya penyakitnya tidak
seberat penyakit masa perinatal.Bila infeksi terjadi pada masa anak -anak (5-9 tahun)
penyakit lebih ringan dan jarang menimbulkan kematian.Bila menjangkiti usia
tuainfeksinya sangat berat.
Ada beberapa penyakit yang khas menjangkiti anak-anak seperti varicella dan
morbilli. Tetapi apabila penyakit tersebut menjangkiti orang dewasa (pada mereka
yang mempunyai kelainan imunologik) maka penyakitnya sangat berat bahkan sering
fatal. Ada pula beberapa penyakit virus yang khusus menjangkiti orang dewasa dan
jarang/tidak pernah menjangkiti anak-anak, seperti mononukleosis infeksiosa,
molluscum contagiosum, herpes zoster. b. Suhu
Suhu diluar tubuh sangat mempengaruhi suhu tubuh manusia dan hal ini bisa
mempengaruhi/mempermudah terjangkitnya penyakit virus. Misalnya suhu rendah
(dingin) mempermudah penjangkitan penyakit disaluran pernapasan oleh virus-virus
Infulenza, Coryza (common cold), Rhinovirus dan Parainfluenza. Keadaan tersebut
sering terjadi di negara yang mempunyai 4 musim dan wabah akan terjadi pada musim
dingin. Biasanya isolasi virus dengan tikus bayi berumur 1-3 hari. Karena pada umur
tersebut pusat pengaturan suhunya belum sempurna. c. Genetik
Beberapa jenis penyakit virus berhubungan dengan genetik, misalnya Creutzfeldt
Jakobs desease dan penyakit virus dengan infeksi lambat (slow infection). Pada
penyakit ini dalam satu generasi selalu ada satu atau beberapa orang yang menderita.
Penyakitnya selalu fatal dan mempunyai masa tunas sampai 30 tahun.
d. Hormonal
Penyakit polio lebih banyak mengakibatkan paralisis berat sampai fatal pada
wanita hamil dibandingkan dengan wanita yang tidak hamil dari golongan umur yang
sama. Hal ini disebabkan pada waktu hamil terjadi perubahan hormonal.
Pada keadaan yang lain yaitu pada penyuntikan intraserebral virus Coxsackie A
pada tikus bayi, 1 minggu kemudian pasti timbul gejala penyakit disusul kematian.
Keadaan ini tidak terjadi pada tikus putih dewasa, tetapi keadaan tersebut akan
berubah bila tikus dewasa disuntik terlebih dahulu dengan kortison (sejenis hormon).
Virologi 158
Maka dalam 1 minggu setelah penyuntikan virus intraserebral timbul gejala-gejala
seperti pada tikus bayi.
Sedangkan pada pembenihan biakan jaringan apabila ditambahkan preparat
hormon maka pertumbuhan virusmenjadi lebih subur.Jadi pada penyakit virus
sebaiknya tidak diberi preparat kortikosteroid (merupakan kontradiksi)kecuali pada
keadaan-keadaan sangat gawat (Depkes,1996).
Lapisan pelindung pada imunitas
Sistem kekebalan tubuh melindungi organisme dari infeksi dengan lapisan
pelindung kekhususan yang meningkat.Pelindung fisikal mencegah patogen seperti
bakteri dan virus memasuki tubuh. Jika patogen melewati pelindung tersebut, sistem
imun bawaan menyediakan perlindungan dengan segera, tetapi respon tidak-spesifik.
Sistem imun bawaan ditemukan pada semua jenis tumbuhan dan binatang. Namun jika
patogen berhasil melewati respon bawaan vertebrata memasuki perlindungan lapisan
ketiga, yaitu sistem imun adaptif yang diaktivasi oleh respon bawaan. Baik imunitas
bawaan dan adaptif bergantung pada kemampuan sistem imun untuk memusnahkan
molekul sendiri dan non-sendiri. Padaimunologi, molekul sendiri adalah komponen
tubuh organisme yang dapat dimusnahkan dari bahan asing oleh sistem imun.
Sebaliknya, molekul non-sendiri adalah yang dianggap sebagai molekul asing.Satu
kelas dari molekul non-sendiri disebut antigen (kependekan dari generator antibodi)
dan dianggap sebagai bahan yang menempel pada reseptor imun spesifik dan
mendapatkan respon imun.
Beberapa perisai melindungi organisme dari infeksi, termasuk perisai mekanikal,
kimia dan biologi.Kulit ari tanaman dari banyak daun, eksoskeleton serangga, kulit telur
dan membran bagian luar dari telur dan kulit adalah contoh perisai mekanikal yang
merupakan pertahanan awal terhadap infeksi, namun karena organisme tidak dapat
sepenuhnya ditahan terhadap lingkungan mereka, sistem lainnya melindungi tubuh
seperti paru-paru, usus, dan sistem genitourinari. Pada paru-paru, batuk dan bersin
secara mekanis mengeluarkan patogen dan iritan lainnya dari sistem
pernapasan.Pengeluaran air mata dan urin juga secara mekanis mengeluarkan
patogen, sementara ingus dikeluarkan oleh saluran pernapasan dan sistem
pencernaan untuk menangkap mikroorganisme. Perisai kimia juga melindungi
terhadap infeksi.Kulit dan sistem pernapasan mengeluarkan peptida antimikroba
seperti β-defensin. Enzim seperti lisozim dan fosfolipase A2 pada air liur, air mata dan
air susu ibu juga antiseptik. Sekresi vagina merupakan perisai kimia selama menarche,
ketika mereka menjadi agak bersifat asal, sementara semen memiliki pertahanan dan
zinc untuk membunuh patogen.Pada perut, asam lambung dan protase menyediakan
pertahanan kimia yang kuat melawan patogen yang tertelan ketika dimakan.
Dalam saluran pencernaan dan sistem genitourinari, flora komensal merupakan
perisai biologi yang bersaing dengan patogen untuk makanan dan tempat, dan pada
beberapa kasus dengan mengubah kondisi lingkungan mereka, seperti pH atau besi
yang ada. Hal ini mengurangi kemungkinan bahwa patogen akan menyebabkan
penyakit. Namun, sejak kebanyakan antibiotik mengincar bakteri dan tidak menyerang
fungi, antibiotik oral dapat menyebabkan “pertumbuhan lebih” fungi dan dapat
Virologi
159
menyebabkan kondisi seperti kandiasis vagina.Terdapat bukti baik bahwa perkenalan
kembali flora probiotik, seperti budaya asli lactobacillus yang ada pada yogurt,
menolong mengembalikan keseimbangan kesehatan populasi mikrobial pada infeksi
usus anak-anak dan mendorong data pendahuluan pada penelitian gastroenteritis
bakterial, radang usus, infeksi saluran urin dan infeksi setelah operasi.
Virologi 160
menimbulkan gejala seperti bengkak, mata berair, pilek alergi, bahkan bisa menimbulkan
reaksi alergi hebat yang mengancam jiwa yang disebut anafilaksis. Berbagai macam reaksi
alergi yang ditimbulkan antara lain adalah asma, eksim, pilek alergi, batuk alergi, alergi
makanan, alergi obat dan alergi terhadap toksin.
Jumlah antibodi bisa diukur secara tak langsung dengan jumlah CD4.Jika jumlahnya
kurang maka dicurigai seseorang mempunyai penyakit immunocompromised dimana
daya tahan tubuhnya sangat rendah, hal ini bisa terjadi pada orang yang terkena
HIV/AIDS, dan non HIV (pengguna kortikosteroid lama, individu yang terkena
kanker,penyakit kronik seperti gagal ginjal, gagal jantung, diabetes, dll).
Kekebalan secara umum dibagi dua :
1. Kekebalan humoral
Berhubungan erat dengan pembentukan immunoglobulin (IgG, IgM, IgA). Apabila
seseorang terinfeksi oleh virus dan terjadi viremia (virus masuk peredaran darah) maka
antigen virus akan mencapai sel-sel tubuh yang berfungsi membentuk Ig
(immunoglobulin).
Alat-alat ini antara lain : hati, limpa, kelenjar getah bening dan sistem retikuloendotelial
yang lain.
Sebagai reaksi terhadap viremia timbul : a.
IgG :
IgG akan dibentuk dan mencapai titer maksimal yang tinggi selama jangka waktu yang
lama, lama menurun sangat lambat. IgG ini dapat ditemukan dalam darah selama
beberapa tahun.
b. IgM :
Dibentuk hanya waktu pertama kali mendapat infeksi dengan virus, segera sesudah
terjadi infeksi. Mencapai titer maksimal jauh lebih cepat daripada IgG. Bila 2-3
bulan sesudahnya kita cari, IgM sudah tidak ada lagi.
c. IgA :
Berhubungan erat dengan pembentukan kekebalan/pertahanan lokal dan dibentuk
oleh sel-sel plasma mukosa saluran pernapasan, saluran pencernaan dan saluran
urogenitalis. Bertanggung jawab atas kekebalan lokal pada tempat produksi
dengan maksud membentuk barrier untuk mecegah penyebaran virus lebih lanjut.
Tidak dapat melalui placenta karena berat molekulnya tinggi sehingga tidak bisa
ditemukan dari darah tali pusat bayi baru lahir. IgA juga ditransportasi dalam
sekret-sekret seperti mukus bronkhial, saliva, cairan intestinum dan dalam serum.
2. Kekebalan seluler
Sangat berperan pada anak-anak yang mempunyai kelainan kongenital
imunologik sehingga tidak mempunyai kemampuan membentuk Ig dan menderita
hipogamaglobulinemia. Walaupun mereka tidak bisa membentuk Ig, maka sembuh
bila ditulari virus (terjadi viremia) morbilli, varicella, mumps dan sebagainya. Hal ini
disebabkan sel limfosit dan sel makrofag langsung mengadakan infiltrasi ke daerah/ke
sel-sel yang dimasuki oleh virus da terjadilah proses peradangan lokal intensif.
Virologi
161
Limfositnya (sensitizedlymphocyte) dan makrofagnya (activatedmacrophage)
berusaha menyingkirkan sel-sel yang sudah diserbu / terkena virus. Fenomena ini
terjadi dalam 24-48 jam (delayed hypersensitivity reaction).
Bila anak menderita selain kelainan kekebalan humoral, juga kekebalan seluler
yang disebut Swiss type hypogamaglobulinemia maka anak ini akan meninggal pada
usia sangat muda karena bila pertama kali diinfeksi oleh penyakit apapun langsung
meninggal (DEPKES, 1996).
Peranan zat anti dalam pencegahan infeksi virus
Bayi yang baru lahir akan membawa kekebalan bawaan dari ibunya terhadap cacar,
polio, morbilli dan sebagainya. Zat anti tersebut biasanya dalam bentuk IgG, sesudah
lahir konsentrasi IgG makin lama makin menurun dan suatu ketika IgM dan IgA akan
ditemukan dalam darahnya. Ini merupakan tanda bahwa sistem imunologik bayi mulai
bekerja. IgM dibentuk lebih dulu daripada IgA. IgM mencapai titer maksimal dalam 10
hari, kemudian menurun sampai masa adolensens. IgA titernya meninggi sangat
lambat dan baru dapat diukur sesudah bayi berusia kira-kira 1 bulan. IgG juga baru
mulai dibentuk secara aktif sesudah berusia 1-1,5 bulan.
Pada manusia beberapa jenis kekebalan dapat dibentuk yaitu kekebalan pasif dan kekebalan
aktif.
1. Kekebalan pasif
a. Kekebalan pasif bawaan
Fetus mendapat kekebalan (IgG) dari ibunya melalui plasenta. Hewan selain
mendapat kekebalan pasif dalam kandungan juga didapat dari kolostrum (air
susu minggu pertama) berupa IgM da IgA.
Zat anti bawaan pada bayi berguna untuk melindungi bayi dari infeksi,
memberi proteksi total, kadang-kadang meringankan perjalanan penyakit
virus, memodifikasi penyakitnyasehingga tidak terjadi komplikasi. Contoh :
Cacar; bayi mendapat proteksi terjadap cacar selama 3 bulan pertama. Pencacaran
dilakukan bayi berusia 3 bulan.
Polio, Morbilli, Rubella ; proteksi sampai 5-6 bulan, vaksinasi dilakukan pada umur
5-6 bulan.
Herpes simplex ; proteksi sampai 7-11 bulan (bila ibu mengandung zat anti).
Pengecualian pada Polio :
Proteksi tidak hanya 6 bulan, tergantung apakah bayi itu segera sesudah
lahir mendapat ASI, karena ASI mengandung protein yang mempunyai daya
menetralisasi virus Polio. Oleh karena itu Polio kebanyakan menjangkiti
golongan sosio-ekonomi tinggi karena bayi diberi susu botol (susu buatan)
segera sesudah lahir. Dianjurkan bayi diberi ASI sampai usia ± 2 tahun.
b. Kekebalan pasif didapat (acquired passive immunity)
Yaitu bila memberi seseorang (anak/dewasa) zat anti, sehingga orang ini tidak perlu
membentuk zat anti sendiri bisa dalam bentuk serum;
Virologi 162
Serum konvalesens berasal dari orang yang sudah mendapat infeksi virus tertentu
(serum homolog).
Serum imun berasal dari kuda/hewan tertentu yang sengaja disuntikan pada
manusia (serum heterolog). Karena merupakan protein asing, bisa terjadi
gejala sampingan berbahaya seperti serum sickness atau shock anafilaktik
yang fatal. Pemberian serum ini bisa mengandung bahaya ikutnya virus
hepatitis serum.
Daya pencegahan pengebalan pasif :
Tergantung dari jangka waktu antara terjadinya infeksi dengan pemberian
pengebalan pasif. Efeknya bisa mencegah total, tidak sakit, memodifikasi penyakit
menjadi lebih ringan, tidak ada komplikas, sama sekali tidak memberi proteksi /
meringankan penyakit
2. Kekebalan Aktif
a. Disengaja :
Maksudnya virus atau antigen diberikan kepada seseorang. Adapun caranya
yaitu bisa melalui kulit/mukosa traktus respiratorius atau digestivus. Derajat
kekebalan yang dibentuk tergantung dari potensi antigen, jumlah antigen yang
dibentuk semasa virus berkembang biak, tempat atau lokasi pemberian
antigen, daya perkembangbiakan dan penyebaran virusnya.
Pada umumnya pengebalan aktif lebih disukai daripada pengebalan pasif karena:
1. Kekebalan bersifat lebih spesifik, yaitu ditujukan kepada virus yang bersangkutan
2. Berlangsungnya jauh lebih lama, bertahun-tahun sampai seumur hidup sedangkan
pengebalan pasif hanya1 bulan
3. Lebih murah karena cara pembuatannya hanya membunuh, menginaktivasi atau
melemahkan virus sedangkan pengebalan pasif harus memisahkan imunoglobulin.
4. Tak ada bahaya serum sickness, shock anafilaktik
5. Pemberian lebih mudah, bisa peroral (tablet, sirup), bisa aerosol (spray), pengebalan
pasif harus parenteral.
Virologi
163
Harus yakin bahwa semua virus yang hidup sudah dilemahkan.
Ada kekhawatiran bahwa sesudah virus masuk dalam tubuh, virulensinya berubah dari
avirulen menjadi virulen.
2. Inactivated vaccine :
Daya infeksi dikurangi atau dihilangkan tetapi sifat antigeniknya masih kuat.
Contoh : Polio (salk), Rabies, Influenza, Morbilli.
Kerugian Inactivated vaccine :
Harus yakin bahwa semua virus sudah diinaktivasi karena strain yang digunakan selalu
sangat virulen.
Harus parenteral, tidak bisa peroral atau intranasal.
Perlu revaksinasi setiap tahun karena kekebalan paling lama 1 tahun.
Daya proteksinya kurang karena tidak diberikan pada port d’entree seperti infeksi
alami.
Misalnya :
- Vaksin Influenza diberikan parenteral, padahal lebih baik secara spray (traktus
respiratorius).
- Vaksin Polio Salk diberikan dengan suntikan
intramuskuler,lebih baikdiberikanperoral (Sabin).
b. Tidak disengaja :
Pada orang-orang yang mengalami infeksi alami, lamanya kekebalan
tergantung daya perkembangan virus, penyebaran dan lamanya penyebaran
virus selama sakit.
Contoh :
Penyakit trakhoma dengan infeksi pada konjungtiva mata yang lokasi dan
superfisial. Maka jumlah antigen yang dibentuk sangat sedikit. Antigen ini tidak
menyebar dan tidak sampai ke sel-sel tubuh yang membentuk zat anti. Karena
itu tidak ada zat dalam darah dan mudah terjadi terinfeksi trakhoma. Berlainan
dengan penyakit-penyakit dengan viremia, maka kekebalan bisa terjadi
sebagai berikut :
Berlangsung dalam beberapa tahun, seperti cacar, influenza, dan herpes simplex.
Berlangsung seumur hidup. Bila dijangkiti kedua kalinya berarti ada kelainan
imunologik atau diagnosa pertama salah.
Contoh : Morbilli, Mumps, Rubella, Varicella, Yellow fever, Polio (tipe homolog),
Dengue (tipe homolog). (Depkes, 1996)
Virologi 164
Latihan
Untuk dapat memperdalam pemahaman Anda mengenai materi di atas, kerjakanlah Latihan
berikut!
1. Jelaskan beberapa kondisi fisiologis yang mempengaruhi daya tahan tubuh terhadap penyakit virus
2. Jelaskan yang anda ketahui tentang lapisan pelindung pada imunitas
3. Apakah yang dimaksud dengan mekanisme pertahanan non spesifik
4. Jelaskan tentang jenis kekebalan pasif
5. Jelaskan tentang jenis kekebalan aktif
Agar saudara dapat mengerjakan soal di atas dengan baik, cermati kembali bab 4 topik 1dan
diskusikan jawaban saudara dengan teman-teman sejawat. Setelah itu, rumuskan jawaban
yang paling tepat.
Respons imun adalah respons tubuh berupa suatu urutan kejadian yang kompleks
terhadap antigen untuk mengeliminasi antigen tersebut. Respons imun ini dapat melibatkan
berbagai macam sel dan protein, terutama sel makrofag, sel limfosit, komplemen, dan sitokin
yang saling berinteraksi secara kompleks. Mekanisme pertahanan tubuh terdiri atas
mekanisme pertahanan non spesifik dan mekanisme pertahanan spesifik.
Beberapa faktor fisiologis yang mempengaruhi daya tahan tubuh terhadap penyakit virus
adalah:
1. Umur: Ada beberapa penyakit yang khas menjangkiti anak-anak seperti varicella dan
morbilli.Tetapi ada pula beberapa penyakit virus yang khusus menyerang orang dewasa
dan jarang bahkan tidak pernah menyerang anak-anak, seperti mononukleosis infeksiosa,
molluscum contagiosum, herpes zoster.
2. Suhu: Suhu diluar tubuh sangat mempengaruhi suhu tubuh manusia dan hal ini bisa
mempengaruhi atau mempermudah terjangkitnya penyakit virus. Misalnya suhu rendah
(dingin) mempermudah penjangkitan penyakit disaluran pernapasan oleh virus-virus
Infulenza, Coryza (common cold), Rhinovirus dan parainfluenza.
3. Genetik: Beberapa jenis penyakit virus berhubungan dengan genetik, misalnya
Creutzfeldt Jakobs desease, penyakit virus dengan infeksi lambat (slow infection). Pada
penyakit ini dalam satu generasi selalu ada satu atau beberapa orang yang menderita.
Penyakitnya selalu fatal dan mempunyai masa tunas sampai 30 tahun.
4. Hormonal: Penyakit polio lebih banyak mengakibatkan paralisis berat sampai fatal pada
wanita hamil dibandingkan dengan wanita yang tidak hamil dari golongan umur yang
sama. Hal ini disebabkan pada waktu hamil terjadi perubahan hormonal.
Jika sistem kekebalan melemah, kemampuannya untuk melindungi tubuh juga berkurang
sehingga membuat patogen termasuk virus yang menyebabkan penyakit. Penyakit defisiensi
Virologi
165
imun muncul ketika sistem imun kurang aktif daripada biasanya, menyebabkan munculnya
infeksi. Defisiensi imun merupakan penyebab dari penyakit genetik, seperti severe combined
immunodeficiency, atau diproduksi oleh farmaseutikal atau infeksi, seperti sindrom defisiensi
imun dapatan (AIDS) yang disebabkan oleh retrovirus HIV. Penyakit autoimun menyebabkan
sistem imun yang hiperaktif menyerang jaringan normal seperti jaringan tersebut merupakan
benda asing. Penyakit autoimun yang umum termasuk rheumatoid arthritis, diabetes melitus
tipe 1, dan lupus erythematosus.
Pada manusia beberapa jenis kekebalan dapat dibentuk yaitu :
1. Kekebalan pasif : kekebalan pasif bawaan dan kekebalan pasif didapat (acquired passive immunity)
2. Kekebalan Aktif
a. Disengaja Contoh : Polio (salk), Rabies, Influenza, Morbilli.
b. Tidak disengaja :Pada orang – orang yang mengalami infeksi alami, lamanya kekebalan
tergantung daya perkembangan virus, penyebaran dan lamanya penyebaran virus selama
sakit.
Tes 1
Pilihlah salah satu jawaban yang paling benar!
3. Sekelompok antimikroba yang terdiri atas 21 protein seru dan termasuk ke dalam pertahanan
nonspesifik dikenal dengan nama
A. Sistem kekebalan
Virologi 166
B. Sistem komplemen
C. Interferon
D. Antigen
E. Antibody
4. Molekul asing yang mendatangkan suatu respon spesifik dari sistem kekebalan tubuh disebut
A. Pirogen
B. Limfosit T penolong
C. Limfosit B
D. Antigen
E. Antibody
6. Jenis limfosit T yang berfungsi menghancurkan sel yang telah terinfeksi adalah
A. Limfosit T penolong
B. Limfosit T sitotoksik
C. Limfosit T supresor
D. Limfosit T memori
E. Limfosit T helper
7. Respon kekebalan yang bukan termasuk mekanisme pembuangan antigen oleh antibody
A. Kekebalan seluler
B. Kekebalan humoral
C. Kekebalan buatan
D. Kekebalan pasif
E. Kekebalan non spesifik
Virologi
167
E. Sel efektor dan sel B
10. Respon berlebihan terhadap suatu antigen yang masuk ke dalam tubuh disebut
A. Alergi
B. Autoimunitas
C. Hipersensitif
D. Myasthenia gravis
E. Addison’s disease
11. Autoimun yang ditandai dengan diserangnya kelenjar adrenalin oleh antibody adalah
A. Myasthenia gravis
B. Addison’s disease
C. Alergi
D. Diabetes mellitus
E. AIDS
12. Antibody monoclonal adalah antibodi yang
A. Dihasilkan oleh klon sel-sel hibridoma
B. Dihasilkan dari darah hewan yang diimunisasi
C. Dapat mengenali semua jenis antigen
D. Memberi kekebalan terhadap virus influenza
E. Dapat langsung mematikan sel-sel kanker
13. Vaksinasi dapat diberikan per oral misalnya vaksin untuk mencegah penyakit :
A. Cacar
B. Rabies
C. Tuberculosis
D. Polio
E. Disentri
14. Respon berlebihan terhadap suatu antigen yang masuk ke dalam tubuh disebut :
A. Alergi
Virologi 168
B. Autoimunitas
C. Hipersensitif
D. Myasthenia gravis
E. Addison’s disease
15. Sistem kekebalan tubuh non spesifik internal sangat tergantung pada :
A. Sel limfosit B
B. Limfosit T
C. Antibodi
D. Lisozim
E. Sel fagosit
Topik 2
Vaksin Virus
V aksin berasal dari bahasa latin vacca (sapi) dan vaccinia (cacar sapi). Vaksin adalah
Virologi
169
terutama bakteri, virus, atau toksin. Vaksin juga bisa membantu sistem kekebalan untuk
melawan sel-sel degeneratif (kanker).
Pemberian vaksin diberikan untuk merangsang sistem imunologi tubuh untuk
membentuk antibodi spesifik sehingga dapat melindungi tubuh dari serangan penyakit yang
dapat dicegah dengan vaksin. Ada beberapa jenis vaksin. Namun, apa pun jenisnya tujuannya
sama, yaitu menstimulasi reaksi kekebalan tanpa menimbulkan penyakit.
Sejak ditemukannya vaksin pada abad ke 18, maka teknologi pembuatan vaksin dan
ilmu pengetahuan tentang vaksin telah maju dengan sangat pesatnya dan hal positif yang kita
lihat dan kita rasakan dari vaksin adalah bahwa dunia kedokteran saat ini telah berhasil
mengeliminasikan beberapa jenis penyakit infeksi yang dahulu kala sangat mematikan,
misalnya penyakit cacar air, yang setiap kali terjadi wabah akan membawa korban meninggal
yang cukup banyak, penyakit polio dibeberapa bagian dunia ini, dan beberapa penyakit infeksi
lain yang bisa diatasi dengan pemberian vaksin yang tepat dan vaksinasi.
Dengan kemajuan teknologi pembuatan vaksin maka kita juga telah mengenal banyak
jenis vaksin yang tersedia untuk berbagai macam penyakit infeksi yang bisa dicegah dengan
vaksin.Saat ini telah tersedia sekitar 23 jenis vaksin dan masih banyak vaksin baru yang sedang
dalam proses penelitian dan pengembangan, misalnya vaksin HIV AIDs, vaksin demam
berdarah dengue, vaksin malaria, dan vaksin TBC baru.
Kita akan mencoba membahas jenis dan macam vaksin yang tersedia saat ini dan pada akhir
materi ini, diharapkan pembaca sudah mempunyai gambaran jelas dan ringkas tentang jenis
dan macam vaksin dan keperluan/indikasi pemakaian.
A. Pengertian Vaksin
Vaksin adalah produk yang diberikan melalui suntikan, oral, atau pun semprot untuk
menghasilkan kekebalan terhadap penyakit tertentu.Tetapi, banyak orang belummemahami
apa yang sebenarnya menjadi kandungan di dalam vaksin tersebut.
Pada saat baru lahir, bayi memiliki kekebalan terhadap kuman tertentu melalui antibodi atau zat
kekebalan tubuh yang didapat dari ibu saat bayi masih berada di dalam kandungan. Beberapa waktu
setelah lahir, zat kekebalan tubuh ini akan hilang secara alami karena bayi sudah tidak berada di dalam
kandungan ibu. Oleh karena itu, untuk mendapatkan perlindungan terhadap bakteri atau virus
tertentu yang dapat menyebabkan penyakit perlu diberikan vaksin.
Vaksin merupakan antigen yang mengandung bakteri, racun, atau pun virus penyebab
penyakit yang “hidup” atau pun yang sudah dimatikan. Vaksin hidup atau mati ini bekerja
untuk merangsang sistem kekebalan tubuh manusia, sehingga tubuh mengira bahwa ia sedang
diserang kuman aktif. Proses ini kemudian direspons tubuh dengan memproduksi antibodi
yang diam dalam tubuh dan akan melindungi tubuh di masa yang akan datang. Proses
pembentukan antibodi inilah yang disebut imunisasi.
Berikut ini adalah beberapa jenis vaksin berdasarkan kandungan yang terdapat di dalamnya, yaitu:
1. Vaksin Mati
Vaksin mati atau disebut juga vaksin tidak aktif mengandung virus atau bakteri yang sudah
dihancurkan dengan suhu panas, radiasi, atau bahan kimia, sehingga mati atau tidak aktif.
Proses ini membuat virus tetap utuh, tetapi tidak dapat berkembangbiak dan menyebabkan
Virologi 170
penyakit dalam tubuh. Melainkan membuat tubuh menciptakan reaksi kekebalan.Meski
demikian, vaksin mati sering membutuhkan beberapa dosis untuk meningkatkan sistem
kekebalan tubuh karena vaksin mati ini umumnya memproduksi respons imun yang lebih
rendah daripada vaksin hidup. Vaksin polio, DPT, dan vaksin flu adalah beberapa contoh vaksin
mati.Vaksin mati ini memang berpotensi menyebabkan ruam atau demam setelah disuntikkan
tapi efek samping ini merupakan situasi normal dan tidak berbahaya.Karena efek kekebalan
yang dihasilkan vaksin ini lebih lemah maka vaksin jenis ini seringkali membutuhkan dosis
pemberian ulang atau booster.
2. Vaksin Hidup
Vaksin hidup adalah vaksin yang dilemahkan di laboratorium, tapi bukan dihancurkan.
Virus atau bakteri yang disuntikkan tidak akan menyebabkan sakit, tapi dapat berkembangbiak
untuk memunculkan respons sistem imun. Vaksin hidup ini mendatangkan kekebalan yang
lebih kuat dan bisa memberikan perlindungan seumur hidup meskipun hanya diberikan satu
atau dua kali.Namun, vaksin ini tidak dapat diberikan pada mereka yang mengalami gangguan
sistem kekebalan tubuh, seperti ODHA atau yang sedang menjalani kemoterapi, karena
kekebalan tubuh yang lemah justru dapat berisiko memicu penyakit yang ingin dicegah.
Contoh dari vaksin hidup adalah vaksin MMR, BCG, cacar air, dan vaksin flu semprot. Sebelum
diberikan, vaksin-vaksin ini perlu disimpan di dalam lemari pendingin khusus agar tetap hidup.
Hal ini dapat menjadi kendala jika vaksin akan dikirim atau disimpan di daerah dengan
infrastruktur yang masih bermasalah seperti seringnya mati lampu. Suhu yang tidak sesuai
untuk penyimpanan vaksin akan memengaruhi kualitas vaksin sehingga imunitas yang
terbentuk tidak optimal.
3. Vaksin Toksoid
Vaksin ini berguna untuk menghasilkan kekebalan tubuh guna menghalau dampak buruk dari
racun atau toksin yang dihasilkan oleh bakteri tertentu.Para ahli menemukan bahwa racun yang
dihasilkan oleh bakteri tertentu ketika menginfeksi seseorang dapat dinetralisir dengan formalin
atau zat kimia lainnya.Dengan menghasilkan zat mirip racun yang telah diolah secara khusus
tersebut, maka vaksin jenis ini dapat diberikan untuk merangsang tubuh dalam membentuk sistem
kekebalan guna melawan efek buruk racun yang dihasilkan oleh kuman.Contoh vaksin jenis toksoid
ini diantaranya tetanus toxoid dan difteri.
4. Vaksin Biosintetik
Jenis vaksin ini memiliki kandungan antigen yang diproduksi secara khusus hingga
menyerupai struktur protein dari bagian tertentu pada virus atau bakteri untuk menghasilkan
kekebalan tubuh. Pada bayi, ketika vaksin jenis ini diberikan saat sistem kekebalan tubuh
masih berkembang, vaksin ini dapat membantu agar sistem kekebalan tubuhnya mengenali
bakteri atau virus berbahaya yang akan masuk ke dalam tubuhnya di kemudian hari. Contoh
vaksin jenis ini adalah vaksin Hib.
Agar dapat efektif, vaksin perlu mengandung bahan-bahan lain yang aman, tahan lama,
sekaligus mendatangkan manfaat.Bahan tersebut antara lain adalah thiomersal (merkuri)
yang merupakan bahan pengawet vaksin, serum albumin, formalin, gelatin, dan antibiotik.
Kandungan utama vaksin ini terdiri dari bahan pelancar untuk membuat vaksin bekerja
lebih efektif, penstabil untuk menjaga agar kandungan vaksin tidak berubah saat terpapar
Virologi
171
faktor lingkungan seperti suhu dan cahaya serta pengawet agar masa simpannya tahan
lama.Tidak semua bahan kandungan yang tertulis sebagai bahan vaksin benar-benar
terkandung di dalamnya. Sebagian besar bahan hanya digunakan dalam proses produksi.
Banyak orang meragukan manfaat vaksin karena kekhawatiran akan dampak buruk yang
bisa terjadi jika seseorang diberikan vaksin, seperti pada beberapa waktu lalu di mana sempat
muncul kekhawatiran bahwa vaksinasi dapat menimbulkan efek samping yang tidak diinginkan
seperti autisme. Dari berbagai penelitian didapatkan fakta bahwa ternyata vaksinkhususnya
vaksin MMR tidak berkaitan dengan autism.Untuk mencegah penyakit campak dan rubella kini
pemerintah sedang mendukung program pemberian vaksin MR menggantikan vaksin MMR
sebelumnya. Tetapi apabila sudah mendapatkan vaksin MMRAnda tidak perlu khawatir,
karena kedua vaksin tersebut memberi perlindungan untuk penyakit yang sama.
Setelah melakukan berbagai penelitian, para ahli dan pakar kesehatan dari berbagai
institut kesehatan menyepakati bahwa pemberian vaksin aman dan bermanfaat.Vaksinasi
dapat memberikan perlindungan terhadap penyakit, sehingga komplikasi fatal dan dampak
buruk akibat penyakit dapat tercegah.Vaksin memang memiliki beberapa efek samping,
seperti bengkak dan kemerahan pada kulit di daerah suntikan, demam, dan bayi atau anak
bisa menjadi rewel setelah diberi vaksin. Namun, berbagai efek samping vaksin ini akan
membaik dalam beberapa hari.
B. MACAM-MACAM VAKSIN
Dengan kemajuan teknologi pembuatan vaksin, maka kita juga telah mengenal banyak
jenis vaksin yang tersedia untuk berbagai macam penyakit infeksi yang bisa dicegah dengan
vaksin, saat ini telah tersedia sekitar 23 jenis vaksin, dan masih banyak vaksin baru lain yang
sedang dalam proses penelitian dan pengembangan, misalnya vaksin HIV AIDs, vaksin demam
berdarah dengue, vaksin malaria, vaksin TBC baru.
Kita akan mencoba membahas jenis dan macam vaksin yang tersedia saat ini, dan pada
akhir materi ini, diharapkan pembaca sudah mempunyai gambaran jelas dan ringkas tentang
jenis dan macam vaksin dan keperluan/indikasi pemakaiannya.
Kita bisa membagi jenis vaksin yang ada berdasarkan hal hal berikut :
1. Pembedaan jenis vaksin dari antigen yang dipergunakan untuk merangsang sistim
imunologi/daya pertahanan tubuh membuat zat antobodi.
2. Pembedaan vaksin atas dasar cara membuat vaksin tersebut, sehingga kita mengenal
adanya vaksin hidup yang dilemahkan (live attenuated vaccine) dan vaksin mati (killed
vaccine/inactivated vaccine). Terdapat juga yang kita kenal dengan nama vaksin
Monovalent dan vaksin Polivalent.
3. Pembedaan vaksin untuk imunisasi bayi anak, dan vaksin untuk imunisasi orang dewasa
dan orang berusia lanjut
4. Pembedaan vaksin berdasarkan tujuan pemakaiannya, misalnya ada vaksin wisatawan,
bagi wisatawan yang akan berkunjung ke suatu daerah dengan endemik penyakit infeksi
tertentu, vaksinwanita hamil untuk mencegah keguguran janin (abortus), dan mencegah
janin lahir dengan cacat fisk bawaan (anomali congenital).
Virologi 172
5. Vaksin masa depan : misalnya vaksin utuk malaria, vaksin untuk demam berdarah dengue,
vaksin untuk tumor otak glioblastoma, vaksin untuk kanker prostate, vaksin untuk
diabetes, dll
Pembahasan :
1. Pembedaan jenis vaksin dari antigen yang dipergunakan untuk merangsang sistim imunologi/daya
pertahanan tubuh membuat zat antobodi.
Antigen adalah (bagian dari) bakteri atau (bagian dari) virus yang dipergunakan
sebagai zat aktif yang dikandung didalam vaksin, dan antigen ini bertujuan untuk
merangsang sistim imunologi tubuh atau sistim pertahanan tubuh kemudian membuat
zat antibodiyang diperlukan untuk melawan dan membasmi bibit penyakit yang
menyerangmasuk dalam tubuh kita.
Antigen ini diambil dari (sebagian atau seluruh) bakteri atau virus penyebab penyakit.
Antigen bibit penyakit ini sebelumnya telah diolah sedemikan rupa sehingga tidak akan
menimbulkan penyakit bila disuntikkan kembali ke dalam tubuh.Namun akan merangsang
sistim imunologi tubuh untuk memberi reaksi dan membuat zat antibodi yang diperlukan
untuk melawan dan mematikan bibit penyakit yang sama bila infeksi masuk dalam tubuh
kita sehingga kita terhindar dari penyakit dan kita menjadi kebal/imunterhadap penyakit
tersebut.
Karena antigen yang diambil itu bisa berasal dari kuman atau juga dari virus penyebab
penyakit, maka kita akan mendapatkan jenis vaksin yaitu vaksin bakteri yang berasal dari
antigen bakteri dan vaksin virus yang berasal dari antigen virus.
Virologi
173
merangsang tubuh membuat zat antibodi untuk bibit penyait tersebut. Ini yang dikenal
sebagai VAKSIN HIDUP yang dilemahkan (Lived Attenuated Vaccine).
- Kita bisa membedakan antara vaksin mati dan vaksin hidup yang dilemahkan dengan
melihat kelebihan dan kekurangan antara kedua jenis vaksin ini.
Vaksin Mati
Kelebihannya :bisa dipergunakan untuk semua orang termasuk untuk wanita hamil,
mereka yang mengalami kelainan sistim imunologi/sistim pertahanan tubuh, misalnya
penderita penyakit HIV AIDs, orang yang dicangkok organ tubuh, pasien ginjal yang
melakukan dialisis (cuci) darah, atau pasien yang mendapat pengobatan
kortikosteroid.Karena hanya mengandung bakteri atau virus mati, tidak ada lagi
kemungkinan mutasi genetik dari bibit penyakit kembali menjadi ganas sehingga aman
bagi pemakai vaksin tersebut.
Cara menyimpan vaksin mati ini juga lebih mudah daripada vaksin hidup, cukup disimpan
dalam suhu 2 – 8 derajat Celsius.
Kelemahannya :karena bakteri atau virus penyebab penyakitnya telah dimatikan, maka
reaksi perangsangan terhadap sistim imunologi tubuh lebih lemah, sehingga untuk
mendapatkan hasil proteksi yang optimal, dan berlangsung lama, diperlukan
pengulangan vaksinasi yang disebut dosis booster atau dosis penguat ulangan.
Catatan: dalam penelitian ditemukan bahwa vaksin mati lebih baik dipakai untuk
mencegah penyakit infeksi karena bakteri daripada penyakit infeksi virus.
Contoh : Vaksin Polio Inactivated (IPV), Vaksin DPT, Vaksin Hepatitis A dan B, Vaksin
Pneumonia, Vaksin Meningitis, Vaksin Hib, dan Vaksin Influenza, Vaksin Human
Papiloma Virus, dan Vaksin Demam Typhoid.
Vaksin Hidup
Kelebihannya : karena mengandung bibit penyakit hidup yang dilemahkan sehingga
menimbulkan reaksi rangsangan yang sangat kuat terhadap sistim imunologi tubuh
kita untuk memproduksi zat antibodi dan reaksi ini bertahan cukup lama bahkan
seumur hidup, sehingga kita tidak memerlukan mengulang vaksinasi atau dosis
booster.
Kelemahannya : mengandung bakteri yang hidup meski telah dilemahkan sehingga
vaksin jenis ini tidak boleh diberikan untuk wanita hamil, mereka yang mengalami
kelainan sistim imunologi/sistim pertahanan tubuh, misalnya penderita penyakit HIV
AIDs, orang yang dicangkok organ tubuh, pasien ginjal yang melakukan dialisis (cuci)
darah dan penderita yang diobati dengan kortikosteroid.Karena bibit penyakit masih
hidup meskipun telah dilemahkan, masih ada kemungkinan terjadi mutasi genetik,
dimana bibit penyakit menjadi ganas kembali sehinggga menimbulkan penyakit bagi
penerima vaksin tersebut.Juga dikatakan bahwa kemungkinan efek samping lebih
banyak ditemukan dengan vaksin hidup yang dilemahkan daripada dengan vaksin
matikarena mengandung bibit penyakit yang masih hidup, maka dalam penyimpanan
vaksin ini diperlukan suhu rendah untuk menyimpannya, biasanya adalahsuhu minus
20 derajat Celsius.
Virologi 174
Catatan: dalam penelitian vaksin, ditemukan bahwa vaksin hidup lebih baik dipakai
untuk mencegah penyakit infeksi karena virus daripada penyakit infeksi karena
bakteri.
Contoh:Vaksin MMR, Vaksin Oral Polio (OPV), Vaksin Varicella, Vaksin Yellow Fever/Demam
Kuning, Vaksin Rotavirus.
Virologi
175
- Meningkatkan kepatuhan jadwal vaksinasi dan imunisasi bayi dan anak juga bagi orang
dewasa dan lanjut usia
- Efisiensi dan ekonomis bagi orang tua dan juga bagi rumah sakit dan dokter vaksinator
- Memudahkan transportasi, rantaidingin (coldchainvaccine) dan ruang
penyimpanan/storage vaksin
Virologi 176
10. Vaksin Influenza (vaksin virus mati, monovalent)
11. Vaksin pneumonia (vaksin bakteri mati, monovalent)
12. Vaksin Rabies (vaksin virus hidup dilemahkan, monoovalent)
13. Vaksin Varicella (vaksin virus hidup dilemahkan, monovalent)
14. Vaksin Human Papiloma Virus/HPV (vaksin virus mati, tetravalent)
15. Vaksin Rotavirus (vaksin virus hidup dilemahkan, monovalent)
16. Vaksin Hepatitis A dan Vaksin Hepatitis B (vaksin virus mati, bivalent)
Virologi
177
Vaksin untuk pengobatan penyakit (Vaccine for Treatmet)
Kelak kita akan mempunyai vaksin yang dipergunakan untuk mengobati penyakit bukan
hanya untuk mencegah penyakit infeksi seperti yang kita kenal dan pergunakan saat ini.
(Seluk Beluk Vaksin, 2013)
Agar saudara dapat mengerjakan soal di atas dengan baik, cermati kembali bab 4 topik 2dan
diskusikan jawaban saudara dengan teman-teman sejawat. Setelah itu, rumuskan jawaban
yang paling tepat.
Ringkasan
Vaksin berasal dari bahasa latin vacca (sapi) dan vaccinia (cacar sapi). Vaksin adalah
bahan antigenik yang digunakan untuk menghasilkan kekebalan aktif terhadap suatu penyakit
sehingga dapat mencegah atau mengurangi pengaruh infeksi oleh organisme alami atau liar.
Vaksin dapat berupa galur virus atau bakteri yang telah dilemahkan sehingga tidak
menimbulkan penyakit.
Vaksin adalah produk yang diberikan melalui suntikan, oral, atau pun semprot untuk
menghasilkan kekebalan terhadap penyakit tertentu.
Beberapa jenis vaksin berdasarkan kandungan yang terdapat di dalamnya :
- Vaksin Mati. Disebut juga vaksin tidak aktif yang mengandung virus atau bakteri yang
sudah dihancurkan dengan suhu panas, radiasi, atau bahan kimia, sehingga mati atau
tidakaktif.
- Vaksin Hidup. Vaksin yang dilemahkan di laboratorium tapi bukan dihancurkan. Virus atau
bakteri yang disuntikkan tidak akan menyebabkan sakit tapi dapat berkembang biak
untuk memunculkan respons sistem imun. Vaksin hidup ini mendatangkan kekebalan
yang lebih kuat dan bisa memberikan perlindungan seumur hidup meskipun hanya
diberikan satu atau dua kali.
- Vaksin Toksoid. Berguna untuk menghasilkan kekebalan tubuh guna menghalau dampak
buruk dari racun atau toksin yang dihasilkan oleh bakteri tertentu.
Virologi 178
- Vaksin Biosintetik. Jenis vaksin ini memiliki kandungan antigen yang diproduksi secara
khusus hingga menyerupai struktur protein dari bagian tertentu pada virus atau bakteri
untuk menghasilkan kekebalan tubuh.
Virologi
179
3. Sekelompok antimikroba yang meliputi 21 protein serum dan termasuk kedalam pertahanan
nonspesifik dinamakan
A. Antibody
B. Sistem kekebalan
C. Interferon
D. Sistem komplemen
E. Antigen
4. Suatu molekul asing yang mendatangkan suatu respon spesifik dari sistem kekebalan tubuh
manusia dinamakan
A. Antibodi
B. Pirogen
C. Limfosit B
D. Limfosit penolong
E. Antigen
5. Jenis limfosit T yang mempunyai fungsi untuk menghancurkan sel yang telah terinfeksi yaitu
A. Limfosit T helper
B. Limfosit T penolong
C. Limfosit T supresor
D. Limfosit T sitotoksik
E. Limfosit T memori
6. Respon kekebalan yang tidak termasuk dalam mekanisme pembuangan antigen oleh antibody
yaitu kekebalan
A. Nonspesifik
B. Seluler
C. Buatan
D. Humoral
E. Pasif
8. Respon yang berlebihan terhadap suatu antigen yang masuk ke dalam tubuh manusia dinamakan
A. Addison’s disease
Virologi 180
B. Alergi
C. Hipersensitif
D. Autoimunitas
E. Myasthenia gravis
9. Proses vaksinasi bisa diberikan per oral, contohnya vaksin untuk mencegah penyakit
A. Disentri
B. Cacar
C. Tuberculosis
D. Rabies
E. Polio
10. Mekanisme kekebalan tubuh manusia dalam melindungi tubuh dari berbagai mikroba penyebab
pathogen (penyakit) memanfaatkan komponen di bawah ini , kecuali
A. Protein antimikroba
B. Limfosit
C. Trombosit
D. Monosit
E. Trombosit
11. Suatu mekanisme pertahanan yang dilakukan oleh sel-sel fagosit dengan cara mencerna partikel
asing /mikroba dinamakan
A. Interferon
B. Antibodi
C. Inflamasi
D. Limfosit
E. Fagositosis
13. Diantara pilihan di bawah ini, tentang cara kerja antibody yang berfungsi menghalangi tempat
pengikatan virus yaitu
A. Aglutinasi
Virologi
181
B. Fiksasi
C. Presipitasi
D. Vaksinasi
E. Netralisasi
14. IgM merupakan antibody yang dilepaskan ke aliran darah ketika erjadi infeksi (respon kekebalan
primer) berfungsi pada saat
A. Infeksi kedua
B. Infeksi pertama kali
C. Permukaan epithelium terinfeksi
D. Saat alergi
E. Semua jawaban benar
15. Semua bakteri yang masuk ke dalam tubuh akan dihancurkan oleh
A. Histamin
B. Antibiotik
C. IgA
D. Sel T pembantu
E. Fagosit
2. C
3. D
4. C
5. B
6. A
7. C
8. C
9. A
10. B
11. A
12. D
Virologi 182
13. A
14. E
Test Formatif 2
1. B
2. A
3. C
4. E
5. D
6. B
7. C
8. B
9. E
10. E
11. E
12. A
13. E
14. B
15. E.
Glosarium
Anafilaksis : reaksi alergi berat yang berujung pada kematian jika
terlambat ditangani secara medis. Hal ini terjadi ketika
sistem kekebalan tubuh mengeluarkan zat kimia sebagai
reaksi terhadap alergen sehingga membuat tubuh dalam
keadaan syok
CD4 : merupakan jenis sel darah putih atau limfosit. Sel tersebut
adalah bagian yang penting dari sistem kekebalan tubuh
kita. Sel CD4 kadang kala disebut sebagai sel-T
Virologi
183
Creutzfeidt Jakobs Desease : suatu penyakit kelainan otak yang ditandai dengan
penurunan fungsi atau mental yang terjadi dengan cepat ,
disertai kelainan perderakan, biasa disebut juga dengan
penyakit anjing gila.
Denaturasi : perubahan bentuk protein melalui beberapa bentuk
tekanan eksternal (misalnya dengan menerapkan panas,
asam atau basa) sedemikian rupa sehingga tidak akan lagi
dapat menjalankan fungsi selular.
Devensive medicine : merupakan suatu deviasi alur praktek kedokteran yang
ditujukan untuk antisipasi kemungkinan ancaman tuntutan
malpraktek di kemudian hari. Dasar pertimbangan dalam
defensive medicine lebih ditujukan untuk mengantisipasi
pertanggungjawaban hukum dibandingkan untuk
kemanfaatan pasien.
Diferensiasi : proses ketika sel primitif menjadi jenis sel yang lebih
khusus. Diferensiasi terjadi beberapa kali selama
perkembangan organisme multiselular ketika organisme
berubah dari zigot sederhana menjadi suatu sistem
jaringan dan jenis sel yang rumit.
Farmaseutikal : virus yang dipakai sebagai bibit virus untuk produksi
vaksin.
Fagositosis : proses dimana sel-sel hidup tertentu yang disebut fagosit
menelan atau memakan sel lain atau partikel. Fagosit
mungkin organisme bersel satu, yang hidup bebas seperti
amuba, atau salah satu dari sel-sel tubuh, seperti sel darah
putih.
Flora komensal : kumpulan organisme yang ditemukan secara alamiah pada
tubuh manusia di lokasi anatomi tertentu dan jumlah
tertentu serta tidak menyebabkan penyakit dalam kondisi
normal.
Hipogamaglobulinemia : gangguan yang disebabkan oleh defisiensi limfosit-B dan
imunoglobulin (antibodi) dalam darah. Imunoglobulin
berperan ganda dalam respon kekebalan tubuh dengan
mengenali antigen asing dan memicu respon biologis yang
berujung pada penghapusan antigen
Inaktivasi virus : menonaktifkan virus.
Infancy : periode pertama kehidupan. sesudah kelahiran ketika
individu yangbersangkutan relatif sangat tidak berdaya dan
bergantung sekali pada orangtuanya.
Infektivitas : kemampuan unsur penyebab atau agent untuk masuk dan
berkembang biaksertamenghasilkan infeksi dalam tubuh
pejamu.
Virologi 184
Immunoglobulin : senyawa protein yang digunakan untuk melawan kuman
penyakit (virus, bakteri, racun bakteri dll.), ada di dalam
darah, orang sering menyebutnya antibodi.
Ig A : imunoglobulin yang memiliki peran utama dalam sekresi.
Ig G : imunoglobulin primer di dalam serum dan ditransfer dari
ibu ke janin.
Ig M : imunoglobulin pertama yang diproduksi dalam respon
imun, merupakan imunoglobulin terbesar
Ig E : imunoglobulin yang memainkan peran primer pada alergi
dalam melawan parasit
Infiltrasi : bocornya cairan atau obat-obatan ke jaringan, yang dapat
menyebabkan pembengkakan
Kemotaktis : pergerakan menuju arah tertentu yang disebabkan oleh
zat-zatkimia. Kemotaktik menyebabkan leukosit bergerak
langsung menuju ke jaringan yang cedera atau rusak
Virologi
185
Scleroderma : sebuah penyakit autoimun yang ditandai oleh kulit yang
mengeras. Istilah scleroderma berasal dari dua kata dalam
bahasa Yunani, Sclero (keras) dan Derma (kulit),
merupakan penyakit tidak menular, non-kanker, dan tidak
menginfeksi.
Sitotoksisitas : kemampuan sel untuk bertahan hidup karena adanya
senyawa toksik. Kemampuan sel untuk bertahan hidup
dapat diartikan sebagai tidak hilangya metabolik atau
proliferasi dan dapat diukur dari bertambahnya jumlah sel,
naiknya jumlah protein, atau DNA yang disintesis.
Virulensi : derajat tingkat patogenitas yang diukur oleh banyaknya
organisme yang diperlukan untuk menimbulkan penyakit
pada jangka waktu tertentu. Virulensi berkaitan erat
dengan infeksi dan penyakit
Viremia : keadaan dimana di dalam darah ditemukan virus.
Zat kemotaktik : gerakan dari sel tubuh, bakteri atau organisme sebagai
respon akibat terpapar zat kimiawi tertentu dalam
lingkungannya. Kemotaksis merupakan hal yang sangat
penting bagi mikroorganisme untuk menemukan
makanannya
Daftar Pustaka
Anonim 2013. Seluk Beluk Vaksin (URL :http://selukbelukvaksin.com/2013/12/). (Diambil 2 Februari
2018)
Depkes RI. (1996). Virologi Umum. Jakarta : Pusat Pendidikan Tenaga Kesehatan
Jawet, Melnick, and Adelberg.(2014). Mikrobiologi Kedokteran Edisi 25.Jakarta : Buku Kedokteran EGC
Virologi 186
Kresno B.(2001).Diagnosis dan Prosedur Laboratorium Edisi 4. Jakarta : Balai Penerbit FKUI
Kate Rittenhouse, Olson and Ernesto De Nardin.(2017). Immunologi dan Serologi Klinis Modern.Jakarta
: Buku Kedokteran EGC
Pendahuluan
V irus tidak bisa hidup pada diri mereka sendiri dan untuk kelangsungan hidup
Virologi
187
mereka virus harus menyebar ke inang lain seperti manusia, hewan dan
tumbuhan. Pada Bab 5 ini kita akan mempelajari mengenai ruang lingkup
penyebaran virus dan infeksi virus. Setelah mempelajari bab ini, mahasiswa akan mampu menjelaskan
tentang penyebaran virus dan menjelaskan tentang konsep infeksi virus.
Manfaat mempelajari Bab ini adalah membantu Saudara untuk dapat memahami lebih
dalam tentang bagaimana penyebaran virus pada manusia, hewan dan tumbuhan, serta
identifikasi penyakit yang disebabkan oleh infeksi virus.
Agar memudahkan Saudara mempelajari Bab ini, maka materi yang akan dibahas kita bagi
menjadi 2 topik, yaitu:
1. Penyebaran virus, yang membahas secara umum tentang mekanisme penyebaran virus serta
fase penyebaran virus dalam tubuh manusia.
2. Infeksi virus, membahas tentang pengertian infeksi virus, patogenesis penyakit, gambaran
umum infeksi virus pada manusia serta pencegahan dan terapi infeksi virus.
Selanjutnya agar Anda berhasil dalam mempelajari materi yang tersaji dalam Bab 5ini,
perhatikan beberapa saran sebagai berikut:
c. Pelajari setiap topik materi secara bertahap
d. Usahakan mengerjakan setiap latihan dengan tertib dan sungguh-sungguh.
Kerjakan tes yang disediakan dan diskusikan bagian-bagian yang sulit Anda pahami dengan
teman sejawat atau tutor, atau melalui pencarian di internet.
Topik 1
Penyebaran Virus
orang ke orang melalui kontak. Cara utama Penyebaran meliputi infeksi droplet atau
enyebaran virus terjadi melalui cara-cara berikut yaitu (1) Penyebaran langsung dari
aerosol (misalnya, influenza, campak, smallpox); melalui kontak seksual (contohnya,
papillomavirus, virus hepatitis B, herpes simpleks tipe 2, dan human immunodeficiency
virus); melalui kontak tangan-mulut, tangan-mata, atau mulut-mulut (misalnya, virus herpes
simpleks, rhinovirus, virus Epstein Barr), atau melalui darah yang terkontaminasi (misalnya,
virus hepatitis B, Human Immunodeficiency Virus). (2) Penyebaran tak langsung melalui jalur
fekal oral (misalnya, enterovirus, rotavirus, hepatitis A infeksius) atau melalui muntahan
(misalnya, virus Norwalk, rhinovirus). Penyebaran dari hewan ke hewan, dengan manusia
Virologi 188
sebagal pejamu aksidental. Penyebaran dapat terjadi melalui gigitan (rabies) atau melalui
infeksi droplet atau aerosol dari daerah yang terkontaminasi hewan pengerat (contohnya,
arenavirus, hantavirus). (3) Penyebaran melalui vektor artropoda (misalnya, arbovirus,
sekarang terutama diklasifikasikan sebagai togavirus, flavivirus, dan bunyavirus).(Depkes RI
Pusdikes, 1996).
Ekologi adalah studi interaksi antara organisme hidup dan lingkungannya. Virus-virus
yang berbeda telah mengembangkan mekanisme yang cerdik dan seringkali rumit untuk
bertahan hidup di alam dan untuk menular dari satu inang ke inang berikutnya. Cara
penyebaran yang digunakan oleh virus tertentu tergantung pada sifat interaksi antara virus
dengan inang. Pada umumnya penyebaran virus sama dengan penyebaran bakteri yaitu
melalui kontak langsung, kontak tidak langsung (Jawetz, 2014).
A. PENYEBARAN VIRUS
Melalui Kontak Langsung
Cara-cara penyebaran melalui kontak langsung ini ada dua cara, yaitu:
1. Secara mutlak antara lain berbagai jenis penyakit kulit, bila kulit yang sakit dan mengandung
banyak virus kemudian kontak atau menyentuh kulit yang sehat maka virus tersebut akan
menular.Contohnya adalah
a. Pada penyakit kulit seperti Verruca vulgaris dan Moluscum contagiosum, penularan terjadi
karena pecahnya nodula kulit yang berisi virus.
b. Penyakit kelamin karena kohabitasi seperti Lymfogranuloma Venereum.
2. Secara droplet infection, ada dua macam:
a. Droplet infection perinhalasi, misalnya penyakit influenza, parainfluenza, campak (morbilli),
gondongan (mumps), rubeola, cacar (variola) dan cacar air (varicella).
b. Droplet infection peroral. misalnya penyakit polio, hepatitis infeksiosa, penyakit karena virus
Echo, Coxsackie dan mumps (Depkes RI Pusdikes, 1996).
Virologi
189
Vektornya berupa serangga (Arthopoda). Di sini virus tidak mengalami
perkembangbiakan/perubahan bentuk di dalam tubuh vektor, Jadi virus hanya
menempel saja pada moncong, kaki dan sayap. Serangganya biasanya yang
menghinggapi sampah, kotoran manusia, sekret konjungtiva atau kulit yaitu lalat
rumah, lipas dan semut. Misalnya: lalat dapat menularkan penyakit polio. Echo,
Coxsackie dan Hepatitis infectiosa.
b. Vektor sejati (obligat)
Biasanya serangga pengisap darah. Mikroorganisme akan masuk ke dalam tubuh
vektor dan berkembangbiak dengan perubahan bentuk sebelum ditularkan ke hospes
lain. Dengan demikian mikroorganisme dapat tumbuh dulu dalam tubuh vektor dan
disebut masa tunas ekstrinsik, yang lamanya bisa berbeda-beda tergantung Jenis
mikroorganismenya. Arthopoda merupakan hospes perantara sedangkan manusia
hospes reservoar. Contohnya Dengue, (hospes perantaranya Aedes aegypti, masa
tunas ekstrinsik 11 hari), Chikungunya (hospes perantaranya Aedes aegypti, Culex
fatigans dan Mansonia), Urban yellow fever (hospes perantaranya Aedes aegypti)
Arthopoda merupakan hospes perantara, vertebrata hospes reservoar sedangkan
manusia hospes insidental. Contohnya adalah JBE/Japanese B. encephalitis(hospes
reservoar: babi dan burung yang hidup dekat air, Vektor: Culex tritaeniorhynchus), Jungle
yellow fever (hospes reservoar: kera. hospes perantara nyamuk Haemagogus).
Arthopoda merupakan hospes perantara dan hospes reservoar, vertebrata dan
manusia merupakan hospes insidental. Jadi sebenarnya virusnya adalah parasit dan
serangga. Pada serangga infeksi bisa secara turun temurun melalui penularan transovarial.
Jadi arthopoda juga merupakan carrier. Contohnya adalahColorado tick fever dan Rocky
mountain spotted fever yang disebar oleh sengkenit Dermacentor andersonii.
Pada vertebrata, invasi sebagian besar virus membangkitkan reaksi keras, biasanya
pada durasi pendek. Hasilnya bersifat menentukan. Inang bisa menyerah ataupun hidup
dengan memproduksi antibodi yang menetralisir virus. Tanpa melihat keadaan ini, virus
biasanya aktif dalam waktu yang pendek, walaupun bisa terjadi infeksi persisten atau laten
yang berlangsung berbulan-bulan atau bertahun-tahun (hepatitis B, herpes simpleks,
cytomegalovirus, retrovirus). Pada vektor arthropoda virus, hubungannya biasanya agak
berbeda. Virus biasanya tidak menimbulkan atau hanya sedikit menimbulkan efek
penyakit dan tetap aktif dalam arthropoda selama hidupnya Dengan demikian,
arthropoda, berbeda dengan vertebrata, berperan sebagai inang permanen dan reservoar.
(Indan, 2009).
Telah dikenal setidaknya tiga pola penyebaran yang berbeda pada virus yang ditularkan
artropoda:
1. Siklus manusia-artropoda: Contoh: demam kuning urban (urban yellow fever), demam
dengue.
Virologi 190
2. Siklus vertebrata tingkat rendah-artropoda dengan infeksi tangensial pada manusia: Contoh:
demam kuning hutan (jungle yellow fever), ensefalitis St. Louis. Manusia yang terinfeksi
merupakan pejamu "buntu!' Metode ini merupakan mekanisme transmisi yang lebih lazim
dijumpai.
Pada siklus ini, virus dapat ditularkan dari artropoda dewasa ke keturunannya melalui
telur (penyebaran transovarian). Dengan demikian, siklus tersebut dapat berlanjut dengan
atau tanpa intervensi pejamu vertebrata yang mengalami viremia. (Indan, 2009)
Pada vertebrata, invasi oleh kebanyakan virus menyebabkan reaksi yang hebat, dan
biasanya berlangsung singkat. Hasilnya bersifat mutlak. Pejamu dapat kalah atau tetap hidup
berkat pembentukan antibodi yang menetralkan virus. Tanpa mengindahkan hasil akhirnya,
persinggahan virus aktif biasanya berlangsung singkat, meskipun infeksi persisten atau laten
yang menetap selama berbulan-bulan hingga bertahun-tahun dapat terjadi (hepatitis B,
herpes simpleks, cytomegalovirus, retrovirus). Pada vektor artropoda virus, hubungan yang
terjadi biasanya agak berbeda. Virus menyebabkan kesakitan yang ringan atau tidak
menimbulkan penyakit sama sekali dan tetap aktif di dalam artropoda sepanjang siklus hidup
Virologi
191
alami artropoda tersebut. Dengan demikian, artropoda, berkebalikan dengan vertebrata,
berperan sebagai pejamu tetap dan reservoar.
Mekanisme penyebaran virus bervariasi, tetapi rute yang paling umum terjadi melalui
aliran darah atau limfe. Adanya virus di dalam darah disebut viremia. Virion dapat berada
bebas di dalam plasma (mis, enterovirus, togavirus) atau berhubungan dengan tipe sel
tertentu (mis, virus campak) (Tabel 5.1). Beberapa virus bahkan bermultiplikasi di dalam sel
tersebut. Fase viremia berlangsung singkat pada banyak infeksi virus, Dalam beberapa kasus,
terjadi penyebaran neuronal; inilah rupanya cara virus rabies mencapai otak sehingga
menyebabkan penyakit, dan cara virus herpes simpleks berpindah ke ganglia untuk memulai
infeksi laten, Virus cenderung menunjukkan spesifisitas organ dan sel, tropisme menentukan
pola penyakit sistemik yang terjadi selama infeksi virus, Sebagai contoh, virus) Hepatitis B
bersifat tropik terhadap hepatosit hati dan hepatitis adalah penyakit utama yang disebabkan
virus.
Tropisme jaringan dan sel oleh virus tertentu biasanya mencerminkan kehadiran
reseptor permukaan sel spesifik untuk virus tersebut. Reseptor adalah komponen permukaan
sel tempat bagian permukaan virus (kapsid atau selubung) dapat berinteraksi secara spesifik
dan mengawali terjadinya infeksi. Reseptor adalah konstituen sel yang berfungsi dalam
metabolisme seluler normal, tetapi juga mempunyai afinitas terhadap virus tertentu. Identitas
reseptor seluler spesifik diketahui untuk beberapa virus, tetapi tidak diketahui pada banyak
kasus.
Faktor-faktor yang memengaruhi ekspresi gen virus merupakan determinan penting
pada tropisme sel. Bagian enhancer yang menunjukkan beberapa spesifisitas tipe-sel dapat
mengatur transkripsi gen virus. Sebagai contoh, enhancer JC polyomavirus jauh lebih aktif
pada sel glia dibandingkan pada jenis sel lainnya. Mekanisme lain mengenai tropisme jaringan
melibatkan enzim proteoglikan. Paramiksovirus tertentu tidak bersifat infeksius hingga
selubung glikoprotein mengalami pembelahan proteolitik. Siklus replikasi virus multipel tidak
terjadi pada jaringan yang tidak menunjukkan enzim pengaktif yang tepat (Jawetz, 2014).
Virologi 192
Sel darah merah Parvovirus B19 Virus Colorado Tick Fever
Virologi
193
timol 40%, dan klorofom. Obat-obatan antivirus seperti Acyclovir diindikasikan dalam
manajemen infeksi HSV primer dan pada pasien dengan imunosupresif.
Cara Penularannya melalui kontak fisik dengan penderita, seperti: hubungan seksual,
berciuman (bila herpes di mulut), maupun oral seks. Cara Pencegahannya denganselalu
menjaga higienis (kebersihan/kesehatan) organ genitalia (atau alat kelamin pria dan wanita
secara teratur), setia kepada pasangannya, dengan tidak berganti-ganti pasangan, jangan lupa
menggunakan kondom, bila pasangan kita sudah terinfeksiPMS (Penyakit Menular Seksual),
mintalah jarum suntik baru tiap kali menerima pelayanan medis yang menggunakan jarum
suntik.
3. Virus Ebola
Ebola (Virus Kongo) adalah sejenis virus dari genus Ebolavirus, familia Filoviridae, dan juga
nama dari penyakit yang disebabkan oleh virus tersebut. Penyakit Ebola sangat mematikan.
Tingkat kematian sampai 90%. Asal katanya adalah dari sungai Ebola di Kongo. Virus ini mulai
menular dari salah satu spesies kera di Kongo kemudian mulai menyebar ke manusia, jangka
waktu manusia mulai terjangkit virus ini sampai menemui ajalnya sekitar 1 minggu karena
saking ganasnya virus ini.
Virus ini masih berada di dataran Afrika dan kabarnya juga telah sampai ke Filipina. Suatu
ketika Negeri Eropa melakukan pengimporan kera dari Kongo, ketika mengetahui virus ini
akhirnya seluruh kera ini dimusnahkan agar tidak menyebar kemana-mana, dan sampai saat
ini belum ditemukan Vaksin yang dapat menyembuhkan penyakit ini.
Gejala:
a. Demam, sakit kepala, nyeri otot.
b. Mual, muntah, sakit perut.
c. Pendarahan di luar dan dalam anus.
d. Timbul bercak-bercak merah pada badan, muka, dan lengan.
e. Terjadi peradangan hati, ginjal rusak, dan penurunan jumlah trombosit secara drastis.
Cara Penyebarannya melalui kotak langsung dengan cairan tubuh atau kulit.Cara
Pencegahannya menghindari bepergian ke daerah yang dilanda wabah ebola atau daerah yang
memiliki riwayat wabah ebola, menghindari kontak dengan cairan tubuh pasien/orang yang
terinfeksi ebola seperti darah, feses, air liur, cairan muntahan, air kencing, bahkan keringat,
tidak berhubungan langsung (bersentuhan) dengan pasien ebola, bila terpaksa kontak
langsung, harus menggunakan pelindung diri (proteksi diri) seperti kaca mata, masker, pakaian
khusus, sepatu boot dan sarung tangan.
Virologi 194
paramyxovirus. Setelah melalui masa yang cukup lama, akhirnya WHO mengumumkan bahwa
yang menjadi dalang SARS adalah Coronavirus.
Coronavirus adalah virus yang berbentuk bulat dan berdiameter sekitar 100-120 nm.
Karena itu, pencegahan infeksi Coronavirus akan efektif bila menggunakan masker yang
berpori-pori lebih kecil dari 100 nm.
Virus ini memiliki RNA positive sebagai genomnya, dan biasanya sering disebut virus RNA.
Mutasi virus terjadi pada saat replikasi dan virus RNA bermutasi sekitar 1 juta kali lebih cepat
dari pada virus DNA. Kalau virus DNA mempunyai kecepatan mutasi 10-8 sampai 10-11
nukleotida setiap kali proses replikasi, virus RNA berkecapatan 10-3 sampai 10-4. Karena itu,
tidak bisa dimungkiri bahwa virus penyebab SARS adalah Coronavirus yang sudah bermutasi.
Selain menginfeksi manusia, Coronavirus juga menginfeksi binatang seperti babi, anjing,
kucing, tikus, kelinci, sapi, dan ayam. Pada binatang-binatang ini, infeksi virus ini umumnya
juga menyebabkan gejala gangguan pernapasan (pneumonia) seperti halnya pada manusia.
Berdasarkan antigennya Coronavirus dibagi atas tiga kelopmpok. Lebih terperinci lagi,
hasil analisa gen dan asam amino pembentuk protein N, protein S, dan protein M menunjukan
bahwa Coronavirus SARS terpisah dari ketiga kelompok ini. Artinya, Coronavirus yang menjadi
penyebab SARS adalah jenis Coronavirus yang baru yang merupakan hasil dari mutasi. Dan
virus ini diberi nama virus SARS.
Cara Penyebarannya melalui udara, seperti bersin dan batuk dari penderita SARS ke orang
yang ada di dekatnya.Cara Pencegahan dengan menjaga kekebalan tubuh agar tetap tinggi
dan kuat, yaitu dengan makan makanan bergizi dan tidur yang cukup untuk mempertinggi sel
imunitas, menjaga udara sekeliling bebas virus: Udara yang masuk ke dalam air conditioner
(AC) terlebih dahulu dilewatkan ke sistem yang bertemperatur tinggi (300oC) agar semua virus
dan bakteri menjadi mati, baru dialirkan ke AC, sehingga diperoleh udara yang sesuai dengan
temperatur yang diinginkan, memakai masker di dekat orang yang terkena SARS, sebisa
mungkin menjauhinya. Masker yang efektif adalah masker yang berpori-pori lebih kecil dari
100 nm.
Virologi
195
sebelumnya. Bahkan, jika terjadi komplikasi dapat menyebabkan penderita meninggal dunia.
Gejala: Demam, batuk, pilek, pegal-pegal dan mudah lelah, timbul bisul kecil dan bintikbintik
merah di kulit.
Cara Penyebarannya melalui kontak langsung, seperti: doplet, air liur, tinja, cairan dari
vesikel atau ekskreta, melalui kontak tidak langsung: dari barang-barang yang terkontaminasi
oleh sekresi itu, melalui hewan: lalat dan kecoak. Cara Pencegahan antara lain orangtua
sebaiknya mencuci tangan dengan bersih dan benar sebelum menyentuh bayi untuk
menghindari bayi dari virus, dan mengajarkan cuci tangan yang benar kepada anaknya,
mencuci tangan terutama setelah membersihkan hidung, menggunakan toilet, atau
mengganti popok, membersihkan bagian tangan dan kaki terutama bagian yang sering
menjadi sarang kuman.
Virologi 196
2) Dengue klasik, penderita mengalami demam tinggi selama 4 - 7 hari, nyeri-nyeri pada
tulang, diikuti dengan munculnya bintik-bintik atau bercak-bercak perdarahan di bawah
kulit.
3) Dengue Haemorrhagic Fever (Demam berdarah dengue/DBD) gejalanya sama dengan
dengue klasik ditambah dengan perdarahan dari hidung (epistaksis atau mimisan),
mulut, dubur, dsb.
4) Dengue Syok Sindrom, gejalanya sama dengan DBD ditambah dengan syok / presyok.
Bentuk ini sering berujung pada kematian. Cara
Penyebaran :
a. Melalui virus yang mendapat virus dengue sewaktu digigit atau menghisap darah orang
yang sakit DBD, atau melalui orang yang tidak sakit DBD tapi dalam darahnya terdapat
virus Dengue (karena orang ini memiliki kekebalan terhadap virus Dengue.)
b. Melalui orang yang mengandung virus Dengue tapi tidak sakit, dapat pergi kemana-mana
dan menularkan virus itu kepada orang lain di tempat yang ada nyamuk Aedes aegypti.
c. Virus dengue yang terhisap akan berkembangbiak dan menyebar ke seluruh tubuh nyamuk
termasuk kelenjar liurnya. nyamuk tersebut menggigit atau menghisap darah orang lain,
virus itu akan dipindahkan bersama air liur nyamuk.
Cara Pencegahan:
a. Menghapuskan atau mengurangi vektor nyamuk demam berdarah.
b. Menguras bak mandi setiap seminggu sekali.
c. Mengubur barang-barang bekas yang dapat menjadi sarang perkembangan jentik-jentik nyamuk.
d. Menutup wadah yang dapat menampung air.
e. Melakukan kebiasaan baik, seperti makan makanan bergizi, rutin olahraga, dan istirahat yang
cukup.
f. Fogging atau pengasapan hanya akan mematikan nyamuk dewasa, sedangkan bubuk abate akan
mematikan jentik pada air.
g. Segera berikan obat penurun panas untuk demam apabila penderita mengalami demam atau
panas tinggi.
8. Campak
Penyakit Campak (Rubeola, Campak 9 hari, measles) adalah suatu infeksi virus yang
sangat menular, yang ditandai dengan demam, batuk, konjungtivitis (peradangan selaput ikat
mata atau konjungtiva) dan ruam kulit. Penyakit ini disebabkan karena infeksi virus campak
golongan Paramyxovirus.
Penularan infeksi terjadi karena menghirup percikan ludah penderita campak. Penderita
bisa menularkan infeksi ini dalam waktu 2-4 hari sebelum rimbulnya ruam kulit dan 4 hari
setelah ruam kulit ada.
Sebelum vaksinasi campak digunakan secara meluas, wabah campak terjadi setiap 2-3
tahun, terutama pada anak-anak usia pra-sekolah dan anak-anak SD. Jika seseorang pernah
menderita campak, maka seumur hidupnya dia akan kebal terhadap penyakit ini.
Gejala:
Virologi
197
a. Panas badan, nyeri tenggorokan, hidung meler ( Coryza ), batuk ( Cough ), Bercak Koplik,
nyeri otot, mata merah (conjuctivitis ).
b. 2-4 hari kemudian muncul bintik putih kecil di mulut bagian dalam (bintik Koplik). Ruam
(kemerahan di kulit) yang terasa agak gatal muncul 3-5 hari setelah timbulnya gejala
diatas. Ruam ini bisa berbentuk makula (ruam kemerahan yang mendatar) maupun
papula (ruam kemerahan yang menonjol). Pada awalnya ruam tampak di wajah, yaitu di
depan dan di bawah telinga serta di leher sebelah samping. Dalam waktu 1-2 hari, ruam
menyebar ke batang tubuh, lengan dan tungkai, sedangkan ruam di wajah mulai
memudar.
c. Pada puncak penyakit, penderita merasa sangat sakit, ruamnya meluas serta suhu
tubuhnya mencapai 40° Celsius. 3-5 hari kemudian suhu tubuhnya turun, penderita mulai
merasa baik dan ruam yang tersisa segera menghilang.
d. Demam, kecapaian, pilek, batuk dan mata yang radang dan merah selama beberapa hari
diikuti dengan ruam jerawat merah yang mulai pada muka dan merebak ke tubuh dan
ada selama 4 hari hingga 7 hari.
Cara Penyebarannya melalui saluran hidung. Virus campak yang berasal dari cairan hidung
dan tenggorokan yang keluar dari penderita pada saat bersin, bantuk, dan bernapas.Cara
Pencegahannya dengan imunisasi serta menghindari penderita, karena campak dapat
ditularkan melalui saluran pernapasan. Virus campak yang berasal dari cairan hidung dan
tenggorokan yang keluar dari penderita pada saat bersin, bantuk, dan bernapas.
9. Cacar Air
Cacar air (Varisela, Chickenpox) adalah suatu infeksi virus menular, yang menyebabkan
ruam kulit berupa sekumpulan bintik-bintik kecil yang datar maupun menonjol, lepuhan berisi
cairan serta keropeng, yang menimbulkan rasa gatal.
Penyebabnya adalah virus Varicella zoster. Virus ini ditularkan melalui percikan ludah penderita
atau melalui benda-benda yang terkontaminasi oleh cairan dari lepuhan kulit.
Penderita bisa menularkan penyakitnya, mulai dari timbulnya gejala sampai lepuhan
yang terakhir telah mengering. Untuk mencegah penularan, sebaiknya penderita diisolasi
(diasingkan).
Jika seseorang pernah menderita cacar air, maka dia akan memiliki kekebalan dan tidak
akan menderita cacar air lagi. Tetapi virusnya bisa tetap tertidur di dalam tubuh manusia, lalu
kadang menjadi aktif kembali dan menyebabkan herpes zoster.
Gejala:
a. Demam, pilek, cepat merasa lelah, lesu, dan lemah.
b. Pada kasus yang lebih berat, bisa didapatkan nyeri sendi, sakit kepala dan pusing.
c. Beberapa hari kemudian timbullah kemerahan pada kulit yang berukuran kecil yang
pertama kali ditemukan di sekitar dada dan perut atau punggung lalu diikuti timbul di
anggota gerak dan wajah.
Virologi 198
d. Kemerahan pada kulit ini lalu berubah menjadi lenting berisi cairan dengan dinding tipis.
Ruam kulit ini mungkin terasa agak nyeri atau gatal sehingga dapat tergaruk tak sengaja.
Jika lenting ini dibiarkan maka akan segera mengering membentuk keropeng (krusta)
yang nantinya akan terlepas dan meninggalkan bercak di kulit yang lebih gelap
(hiperpigmentasi). Bercak ini lama-kelamaan akan pudar sehingga beberapa waktu
kemudian tidak akan meninggalkan bekas lagi.
e. Lain halnya jika lenting cacar air tersebut dipecahkan. Krusta akan segera terbentuk lebih
dalam sehingga akan mengering lebih lama. kondisi ini memudahkan infeksi bakteri
terjadi pada bekas luka garukan tadi. setelah mengering bekas cacar air tadi akan
menghilangkan bekas yang dalam. Terlebih lagi jika penderita adalah dewasa atau dewasa
muda, bekas cacar air akan lebih sulit menghilang.
Cara Penyebaran : a.
Sentuhan
b. Droplet : bila penderita cacar air, batuk, pilek dan jika bicara mengeluarkan semacam liur
tapi dalam ukuran super kecil. Droplet ini masuk ke tubuh orang sehat, terus tinggal di
tubuh tersebut selama 7 - 10 hari.
c. Bila selama periode itu, ia tetap sehat, virus tidak berkembang, atau berkembang dengan
pertumbuhan tertekan, sehingga pada beberapa orang, ia tidak merasa pernah kena
cacar air padahal dia sebenarnya sudah kena tapi nggak pernah muncul ke kulit.
d. Bila selama periode itu, si sehat jadi lemah, virus menyebar dan muncul ke permukaan
dan jadilah cacar air.
Cara Pencegahan:
a. Imunisasi tersedia bagi anak-anak yang berusia lebih dari 12 bulan. Imunisasi ini
dianjurkan bagi orang di atas usia 12 tahun yang tidak mempunyai kekebalan. Penyakit
ini erat kaitannya dengan kekebalan tubuh.
b. Kepada orang yang belum pernah mendapatkan vaksinasi cacar air dan memiliki resiko
tinggi mengalami komplikasi (misalnya penderita gangguan sistem kekebalan), bisa
diberikan immunoglobulin zoster atau immunoglobulin varicella-zoster. Vaksin varisela
biasanya diberikan kepada anak yang berusia 12-18 bulan.
10. Gondong
Gondong (Mumps, Parotitis epidemika) adalah penyakit menular, disebabkan oleh virus
(Myxovirus parotitidis), berlangsung cepat (akut) yang ditandai dengan pembesaran kelenjar
ludah, terutama kelenjar di bawah telinga (parotis).
Gejala:
a. Pada tahap awal (1-2 hari) penderita gondong mengalami gejala: demam, sakit kepala, nyeri
otot, kehilangan nafsu makan, nyeri rahang bagian belakang saat mengunyah dan
adakalanya disertai kaku rahang (sulit membuka mulut).
Virologi
199
b. Selanjutnya terjadi pembengkakan kelenjar di bawah telinga (parotis) yang diawali dengan
pembengkakan salah satu sisi kelenjar kemudian kedua kelenjar mengalami
pembengkakan.
c. Pembengkakan biasanya berlangsung sekitar 3 hari kemudian berangsur mengempis.
d. Kadang terjadi pembengkakan pada kelenjar di bawah rahang (submandibula) dan kelenjar
di bawah lidah (sublingual). Pada pria akil balik adalanya terjadi pembengkakan buah zakar
(testis) karena penyebaran melalui aliran darah.
Cara Penyebarannya melalui kontak langsung, percikan ludah (droplet), muntahan, air seni
(kencing). Cara Pencegahan paling efektif adalah dengan imunisasi MMR (Mumps, Morbili,
Rubela) yang diberikan melalui injeksi pada usia 15 bulan. Imunisasi MMR tidak menimbulkan
panas dan efek lainnya. Imunisasi dapat juga diberikan kepada remaja dan orang dewasa yang
belum menderita Gondong. (Chiu W, 1997).
Virologi 200
a. Vaksinasi yang teratur sesuai dengan program yang dianjurkan yaitu:
1) Umur ayam antara Umur ayam antara 4-7 hari, vaksinasi dengan vaksin aktif melalui tetes
mata yaitu cukup tetes pada mata kiri atau kanan juga dilakukan vaksinasi inaktif yang
disuntikan pada kulit leher dengan menggunakan Spuit dengan dosis 0,2-0,25 CC pada waktu
yang sama.
2) Umur ayam antara 18-21 hari dilakukan vaksinasi (revaksinasi) dengan vaksin aktif galur
lasota atau Clone melalui tetes mata atau air minum.
3) Setelah vaksinasi kedua, vaksinasi selanjutnya dapat dilakukan pada umur ayam tiga bulan
atau empat bulan atau setiap akan memasuki bulan peralihan.
b. Memelihara ayam dalam kandang terbatas serta menjaga kebersihan ayam, jangan
memasukkan ayam luar sebelum dikarantina atau divaksin dan dipastikan tidak membawa
penyakit.
2. Rabies
Rabies merupakan suatu penyakit hewan menular akut yang disebabkan oleh virus
neurotropik dari ssRNA virus; genus Lyssavirus; famili Rhabdoviridae. Virus Rabies termasuk
dalam serotipe 1, serotipe 2 (Lagos bat virus), serotipe 3 (Mokola rhabdovirus), dan serotype
4 (Duvenge rhabdovirus).
Rabies menyerang sistem syaraf pusat hewan berdarah panas dan manusia. Bersifat
zoonosis yaitu dapat menular pada manusia lewat gigitan atau cakaran. atau dapat pula lewat
luka yang terkena air liur hewan penderita rabies Hewan yang terinfeksi dapat berubah
menjadi lebih agresif atau ganas dan dapat menyerang manusia. Rabies sangat berbahaya, bila
ditemukan gejala klinis dan penanganannya tidak benar biasanya diikuti kematian, baik pada
hewan maupun manusia.
Gejala pada hewan:
a. Suka bersembunyi di tempat yang gelap dan sejuk.
b. Terjadi kelumpuhan tubuh, hewan tidak dapat mengunyah dan menelan makanan, rahang bawah
tidak dapat dikatupkan dan air liur menetes berlebihan.
c. Kejang berlangsung singkat dan kadang sering tidak terlihat.
d. Tidak ada keinginan menyerang atau mengigit. Kematian akan terjadi dalam beberapa jam.
Gejala pada manusia:
a. Timbul gejala-gejala lesu, nafsu makan hilang, mual, demam tinggi, sakit kepala, dan tidak bisa
tidur.
b. Rasa nyeri di tempat bekas luka gigitan dan nampak kesakitan serta menjadi gugup, bicara tidak
karuan, dan selalu ingin bergerak
c. Rasa takut pada air yang berlebihan, peka suara keras dan cahaya serta udara.
d. Air liur dan air mata keluar berlebihan, pupil mata membesar.
e. Kejang-kejang lalu mengalami kelumpuhan dan akhirnya meninggal dunia. Biasanya penderita
meninggal 4-6 hari setelah gejala-gejala atau tanda-tanda pertama timbul.
Cara Penyebaran : melalui air liur yang mengandung virus rabies.
Cara Pencegahan:
Virologi
201
a. Memelihara anjing dan hewan lainnya dengan baik dan benar. Jika tidak dipelihara dengan baik
dapat diserahkan ke Dinas Peternakan atau para pecinta hewan.
b. Mendaftarkan anjing ke Kantor Kelurahan atau Desa atau Petugas Dinas Peternakan setempat.
c. Pada hewan virus rabies dapat ditangkal dengan vaksinasi secara rutin 1-2 kali setahun tergantung
vaksin yang digunakan, ke Dinas Peternakan, Pos Kesehatan Hewan atau Dokter Hewan Praktek.
d. Semua anjing atau kucing yang potensial terkena, divaksin setelah umur 12 minggu, lau 12 bulan
setelahnya, dilanjutkan dengan tiap 3 tahun dengan vaksin untuk 3 tahun, untuk kucing harus
vaksin inaktif.
e. Penangkapan/eliminasi anjing, kucing, dan hewan lain yang berkeliaran di tempat umum dan
dianggap membahayakan manusia.
f. Pengamanan dan pelaporan terhadap kasus gigitan anjing, kucing, dan hewan yang dicurigai
menderita rabies.
g. Penyuluhan kepada masyarakat tentang penyakit rabies.
h. Menempatkan hewan didalam kandang, memperhatikan serta menjaga kebersihan dan kesehatan
hewan.
i. Setiap hewan yang beresiko rabies harus diikat/dikandangkan dan tidak membiarkan anjing bebas
berkeliaran.
j. Menggunakan rantai pada leher anjing dengan panjang tidak lebih dari 2 meter bila tdak dikandang
atau saat diajak keluar halaman rumah.
k. Tidak menyentuh atau memberi makan hewan yang ditemui di jalan
l. Daerah yang sudah bebas rabies, haeus mencegah masuknya anjing, kucing atau hewan sejenisnya
dari daerah yang tertular rabies.
m. Pada area terkontaminasi dilakukan desinfeksi menggunakan 1:32 larutan (4 ounces per gallon)
dari pemutih pakaian untuk menginaktifkan virus dengan cepat.
Virologi 202
sakit juga bisa mengendalikan penyebaran penyakit ini, menjaga kebersihan selama proses
pemerahan, pemerah yang menggunakan sarung tangan dan desinfektan celup putting yang
baik dari golongan Chlorhexidine bisa digunakan untuk mengendalikan penyebaran penyakit
ini.
Virologi
203
Gejala yang ditimbulkan adalah bercak-bercak kuning pada daun yang menyebar,
sepertimosaik. TMV adalah virus pertama yang ditemukan orang.
Adolf Meyer (1883) menunjukkan pertama kali bahwa gejala mosaik ini dapat menular,
seperti penyakit bakteri. Keberadaan adanya substansi non-bakteri pertama kali ditunjukkan
oleh Dmitri Ivanovski, ahli biologi Rusia, pada tahun 1892. Daun sehat yang diolesi ekstak
dauntembakau yang menunjukkan gejala mosaik dapat tertular. Ketika ekstrak itu disaring
dengan saringan keramikyang sangat halus sehingga bakteri pun tidak dapat menembus dan
dioleskan pada daun sehat, daun itu pun tetap tertular. Ivanovski berpendapat ada substansi
super kecil yang bertanggung jawab atas gejala tersebut. Martinus Beijerinck mengonfirmasi
hal ini. Isolasi pertama kali dilakukan oleh Wendell M. Stanley (1935) dari Institut Rockefeller
AS.
Gejala:
a. Agak tergantung pada tanaman inang dan dapat termasuk mosaik.
b. Bintik-bintik, nekrosis, pengerdilan, daun keriting, dan menguning dari jaringan tanaman.
Cara Penyebaran melalui tangan pekerja yang telah terkontaminasi oleh cairan tembakau
yang telah kena penyakit Mosaik. Cara Pencegahan dengantidak merokok sambil menangani
tanaman, karena cerutu, rokok, dan tembakau pipa bisa terinfeksi virus Mosaik tembakau,
melakukan sanitasi, memotong tanaman yang terinfeksi agar tidak menyebar, mensterilkan
alat dan bahan yang digunakan untuk memotong.
3. Penyakit Tungro
Tungro disebabkan oleh dua jenis virus yang berbeda yaitu virus bentuk batang Rice
Tungro Bacilliform Virus (RTBV) dan virus bentuk bulat Rice Tungro Spherical Virus (RTSV).
Kedua jenis virus tersebut tidak memiliki kekerabatan serologi dan dapat menginfeksi
tanaman secara bersama-sama.
Gejala:
a. Tanaman padi menjadi kerdil, daun berwarna kuning sampai kuning jingga disertai bercak-bercak
berwarna coklat.
b. Perubahan warna meluas mulai dari ujung ke bagian pangkal.
c. Terjadi penurunan jumlah malai per rumpun.
Cara Penyebaran dan ditularkan melalui wereng hijau. Nephotettix virescens merupakan
wereng hijau yang paling efisien sehingga perlu diwaspadai keberadaannya.Cara Pencegahan
dengan menanam varietas tahan, artinya mampu mempertahankan diri dari infeksi virus dan
atau penularan virus oleh wereng hijau, memusnahkan tanaman yang sudah terserang agar
tidak menyebar luas, menggunakan insektisida sistemik butiran (carbofuran), tidak membuat
persemaian di sekitar lampu untuk menghindari berkumpulnya wereng hijau di persemaian.
(Collier et al, 2006).
Latihan
Virologi 204
Untuk dapat memperdalam pemahaman Anda mengenai materi di atas, kerjakanlah Latihan
berikut!
Jawablah pertanyaan dibawah ini dengan singkat dan jelas dengan hanya menuliskan esensinya saja !
1) Jelaskan tiga pola penyebaran pada virus yang ditularkan artropoda !
2) Sebutkan lima macam virus yang menyerang manusia ?
3) Bagaimana cara penyebaran virus rabies dan Papilomavirus ?
4) Siapakah nama orang yang menunjukkan pertama kali bahwa gejala mosaik pada tembakau dapat
menular, seperti penyakit bakteri ?
Ringkasan
Pada umumnya penyebaran virus sama dengan penyebaran bakteri
A. kontak langsung
Cara-cara penyebaran melalui kontak langsung ini ada dua cara, yaitu (1) Secara mutlak
antara lain berbagai jenis penyakit kulit, bila kulit yang sakit dan mengandung banyak virus
kemudian kontak atau menyentuh kulit yang sehat maka virus tersebut akan menular (2)
Secara droplet infection, ada dua macamdroplet infection perinhalasi dan droplet infection
peroral.
B. Kontak tidak langsung
Cara-cara penularan melalui kontak tidak langeung menggunakan perantaraan suatu
media dan meliputi beberapa macam diantaranyamelalui debu, makanan, minuman dan alat-
alatnya, gigitan hospes reservoar, melalui hospes perantara.
Secara epidemiologis ada dua hospes perantara yaituvektor mekanis: Vektornya berupa
serangga (Arthopoda), vektor sejati (obligat) biasanya serangga pengisap darah.
Arthopoda merupakan hospes perantara dan hospes reservoar, vertebrata dan manusia
merupakan hospes insidental. Jadi sebenarnya virusnya adalah parasit dan serangga. Pada
serangga infeksi bisa secara turun temurun melalui penularan transovarial. Jadi arthopoda
juga merupakan carrier. Contoh : Colorado tick fever dan Rocky mountain spotted fever yang
disebar oleh sengkenit Dermacentor andersonii.
Pada vertebrata, invasi sebagian besar virus membangkitkan reaksi keras, biasanya pada
durasi pendek. Hasilnya bersifat menentukan. Inang bisa menyerah ataupun hidup dengan
memproduksi antibodi yang menetralisir virus. Tanpa melihat keadaan ini, virus biasanya aktif
Virologi
205
dalam waktu yang pendek, walaupun bisa terjadi infeksi persisten atau laten yang berlangsung
berbulan-bulan atau bertahun-tahun (hepatitis B, herpes simpleks, cytomegalovirus,
retrovirus). Pada vektor arthropoda virus, hubungannya biasanya agak berbeda. Virus
biasanya tidak menimbulkan atau hanya sedikit menimbulkan efek penyakit dan tetap aktif
dalam arthropoda selama hidupnya Dengan demikian, arthropoda, berbeda dengan
vertebrata, berperan sebagai inang permanen dan reservoar.Cara penyebaran dan
pencegahan virus, meliputi virus yang menyerang manusia, virus yang menyerang hewan,
virus yang menyerang tumbuhan.
Tes 1
Pilihlah salah satu jawaban yang paling benar!
1. Beberapa virus ditandai dengan simetri heliks pada nukleokapsid mereka. Pernyataan yang
paling benar mengenai virus dengan simetri heliks adalah
A. Semua virus berselubung dengan simetri heliks diklasifikasikan dalam famili virus yang sama
B. Nukleokapsid heliks terutama ditemukan dalam virus yang mengandung DNA
C. Semua virus manusia dengan nukleokapsid heliks memiliki suatu selubung
D. Partikel heliks kosong dalam jumlah berlebihan yang tidak berisi asam nukleat lazim
dihasilkan dalam sel terinfeksi
E. Nukleokapsid heliks terutama ditemukan dalam virus yang mengandung RNA
2. Sel-sel terinfeksi virus sering kali mengalami perubahan morfologis yang dinamakan efek
sitopatik. Pernyataan yang paling tepat mengenai perubahan sitopatik yang dicetuskan virus
adalah
A. Bersifat patognomonik untuk virus penginfeksi
B. Jarang menyebabkan kematian sel
C. Dapat berupa pembentukan sel raksasa
D. Hanya dapat dilihat dengan mikroskop elektron
E. Hanya dapat dilihat dengan mikroskop medan terang
3. Virus biasanya memulai infeksi dengan berinteraksi terlebih dahulu dengan reseptor pada
permukaan sel. Apa pernyataan yang paling tepat mengenai reseptor sel untuk virus?
A. Reseptor sel untuk virus tidak memiliki fungsi seluler
B. Semua virus dalam satu famili menggunakan reseptor sel yang sama
C. Semua sel dalam pejamu yang rentan akan mengekspresikan reseptor virus
D. Keberhasilan infeksi suatu sel oleh suatu virus dapat melibatkan interaksi dengan lebih dari
satu jenis reseptor
E. Semua virus dalam satu famili menggunakan reseptor sel yang berbeda
Virologi 206
4. Pemeriksaan apa yang dapat digunakan untuk mengetahui jumlah titer infeksius virus?
A. Assay plak
B. Mikroskop elektron
C. Hemaglutinasi
D. Polymerase Chain Reaction
E. Presipitasi
6. Dua mutan poliovirus telah diisolasi, satu (MutX) dengan mutasi pada gen X dan mutan kedua
(MutY) dengan mutasi pada gen Y. Jika sel diinfeksi oleh salah satu mutan saja, tidak dihasilkan
virus. Jika sebuah sel diinfeksi oleh kedua mutan sekaligus, apa yang paling mungkin terjadi?
A. Penataan ulang segmen-segmen genom dapat terjadi sehingga terbentuk virus
jenis liar yang viabel
B. Genom mungkin mengalami transkripsi terbalik menjadi DNA dan dihasilkan kedua jenis
virus, MutX dan MutY
C. Komplementasi antara produk-produk gen mutan dapat terjadi sehingga
dihasilkan virus MutX atau MutY
D. Sel-sel akan mengalami transformasi dalam frekuensi tinggi karena mereka tidak akan
dibunuh oleh mutan-mutan poliovirus
E. Komplementasi antara produk-produk gen mutan dapat terjadi sehingga
dihasilkan kedua virus, MutX dan MutY
7. Virus apa yang memiliki genom RNA yang infeksius setelah dimurnikan?
A. Virus influenza
B. Poliovirus
C. Papillomavirus
D. Virus campak
E. Variola
8. Virus-virus yang termasuk dalam kelompok apa yang mungkin menyebabkan infeksi laten?
A. Poxvirus
Virologi
207
B. Filovirus
C. Herpesvirus
D. Virus influenza
E. Poliovirus
9. Beberapa virus menyandi polimerase RNA yang bergantung pada RNA virus. Pernyataan apa
yang mengandung prinsip tentang polimerase RNA?
A. Semua virus RNA memiliki molekul polimerase RNA di dalam partikel virus karena enzim
tersebut diperlukan untuk menginisiasi siklus infeksius berikutnya
B. Antibodi terhadap polimerase RNA virus akan menetralkan infektivitas virus
C. Virus RNA untai-negatif menyuplai polimerase RNA bergantung-RNA mereka sendiri karena
sel eukariota tidak memiliki enzim tersebut
D. Protein-protein polimerase RNA virus juga berperan sebagai protein struktural inti mayor
dalam partikel
E. Antibodi terhadap polimerase RNA virus akan mengaktifkan infektivitas virus
11. Banyak virus dapat ditumbuhkan di laboratorium. Pernyataan berikut yang salah mengenai
perbanyakan virus adalah
A. Sebagian virus dapat diperbanyak dalam medium bebas-sel
B. Sebagian virus mamalia dapat dikultur dalam telur ayam
C. Beberapa virus yang memiliki banyak pejamu dapat memperbanyak diri dalam
berbagai tipe sel
D. Sebagian virus manusia dapat ditumbuhkan dalam tikus
E. Semua virus hanya hidup pada sel hidup
12. Infeksi laboratoris dapat diperoleh saat bekerja dengan virus, kecuali praktik laboratorium yang
baik benar- benar ditaati. Di antara pilihan berikut, pernyataan apa yang bukan merupakan
praktik biosafety yang baik?
A. Penggunaan teknik aseptik
B. Penggunaan alat pelindung diri
C. Tidak memipet dengan mulut
Virologi 208
D. Membilas limbah eksperimental melalui wastafel E. Penggunaan disinfektan pada meja
kerja.
Cocokkanlah jawaban Anda dengan Kunci Jawaban Tes 1 yang terdapat di bagian akhir Bab 5 ini.
Virologi
209
Topik 2 Infeksi Virus
mikroba. Seperti namanya, infeksi bakteri adalah infeksi yang disebabkan oleh aik infeksi
bakteri maupun infeksi virus, keduanya sama-sama disebabkan oleh
bakteri, dan infeksi virus adalah infeksi yang disebabkan oleh virus. Terkadang, kedua infeksi
ini mempunyai tanda-tanda yang sama pada orang yang terkena infeksi tersebut, seperti
batuk-batuk, demam, hidung berair, diare, radang, muntah, dan lemas. Akan tetapi, bakteri
dan virus adalah dua mikroba yang berbeda dan cara pengobatan untuk kedua jenis infeksi
tersebut sama sekali berbeda.
Bakteri adalah mikroba yang termasuk keluarga Prokaryotes. Bakteri memiliki dinding
sel yang tipis tapi keras, dan membran yang seperti karet melindungi cairan di dalam sel
tersebut. Bakteri dapat berkembang biak sendiri, yaitu dengan cara pembelahan. Hasil
penelitian fosil-fosil menyatakan bahwa bakteri sudah ada sejak 3,5 miliar tahun yang lalu.
Bakteri dapat hidup di berbagai keadaan lingkungan, termasuk lingkungan-lingkungan yang
ekstrem, seperti lingkungan yang sangat panas atau sangat dingin, di lingkungan yang
mengandung radioaktif, dan di dalam tubuh manusia.
Virus adalah mikroba yang tidak bisa hidup tanpa menempel pada inangnya. Virus baru
bisa berkembang biak bila menempel dengan makhluk hidup lain. Ukuran virus juga jauh lebih
kecil daripada bakteri. Setiap virus memiliki material genetik, antara RNA atau DNA. Biasanya,
virus akan menempel di suatu sel dan mengambil alih sel tersebut untuk mengembangbiakkan
virus-virus lain sampai akhirnya sel tersebut mati. Atau pada kasus lain, virus mengubah sel
normal menjadi sel yang berbahaya untuk kesehatan.
Sebagian besar virus bisa menyebabkan penyakit berbanding terbalik dengan bakteri.
Virus juga “pemilih”, alias menyerang sel tertentu secara spesifik. Misalnya, virus-virus
tertentu menyerang sel pada pankreas, sistem pernapasan, dan darah. Pada kasus tertentu,
virus juga menyerang bakteri. Durasi tanda-tanda terinfeksi virus biasanya terjadi sebentar
tetapi akut, sedangkan tanda-tanda terinfeksi bakteri biasanya terjadi selama 10-14 hari
secara terus-menerus. Kalau memang diperlukan, dokter biasanya meminta untuk tes darah
atau tes urine untuk mengkonfimasi diagnosis, atau melakukan tes kultur untuk
mengidentifikasi tipe bakteri atau virus yang menginfeksi Anda (Staf Pengajar FKUI, 1994).
Virologi 210
A. PENGERTIAN INFEKSI VIRUS
Pengertian Infeksi virus adalah masuknya virus kedalam tubuh inang (manusia, hewan,
tumbuh-tumbuhan termasuk bakteri) melalui siklus lisis dan lisogenik sampai timbul gejala
sakit. Virus dapat menginfeksi inangnya dan menyebabkan berbagai akibat bagi inangnya. Ada
yang berbahaya, namun juga ada yang dapat ditangani oleh sel imun dalam tubuh sehingga
akibat yang dihasilkan tidak terlalu besar. Infeksi akut merupakan infeksi yang berlangsung
dalam jangka waktu cepat namun dapat juga berakibat fatal. Infeksi kronis merupakan infeksi
virus yang berkepanjangan sehingga ada risiko gejala penyakit muncul kembali.
Prinsip-prinsip penting menyangkut infeksi virus adalah sebagai berikut: (1) banyak
infeksi virus bersifat subklinis; (2) infeksi yang sama dapat disebabkan oleh berbagai virus; (3)
virus yang sama dapat menyebabkan berbagai infeksi; (4) infeksi yang diakibatkan tidak
Virologi
211
berhubungan dengan morfologi virus; dan (5) keluaran pada kasus apapun ditentukan oleh
faktor virus, pejamu, dan dipengaruhi oleh gen masing-masing.
Patogenesis virus adalah proses yang terjadi ketika virus menginfeksi pejamu.
Patogenesis penyakit adalah suatu bagian dari kejadian selama infeksi yang menyebabkan
manifestasi penyakit pada pejamu. Sebuah virus bersifat patogenik terhadap pejamu tertentu
jika dapat menginfeksi dan menyebabkan tanda-tanda penyakit pada pejamu tersebut.
Sebuah strain virus tertentu lebih virulen dibanding strain lainnya jika ia secara umum
menyebabkan penyakit yang lebih berat pada pejamu yang peka. Virulensi virus pada hewan
yang tidak mengalami luka (intak)sebaiknya tidak dikacaukan dengan sitopatogenisitas untuk
sel yang dikultur; virus sangat sitosidal secara in vitro, mungkin tidak berbahaya secara in vivo
dan sebaliknya, virus nonsitosidal mungkin menyebabkan penyakit berat.(Jawetz, 2014).
Tabel 5.2 Gambaran penting dua kategori umum infeksi virus akut (lokal dengan sistemik)
Infeksi Lokal Infeksi Sistemik
Contoh penyakit spesifik Pernapasan (rhinovirus) Campak
Lokasi Patologi Port d’entree Tempat yang jauh
Masa inkubasi Relatif singkat Relatif lama
Viremia Tidak ada Ada
Durasi imunitas Bervariasi-mungkin singkat Biasanya seumur hidup
Peran antibodi sekretori Biasanya penting Biasanya tidak penting
(IgA) dalam resistensi
Sumber : Jawetz, Melnick, & Adelberg. Mikrobiologi Kedokteran. Edisi 25. Jakarta. Penerbit EGC.
2014.
Virologi 212
konjungtiva. Sebagian besar virus masuk ke pejamunya melalui mukosa saluran pernapasan
atau gastrointestinal (Tabel 5.3). Pengecualian terutama pada virus yang langsung dimasukkan
ke aliran darah olehjarum (hepatitis B, human immunodeficiency virus (HIV), melalui transfusi
darah, atau melaui vektor serangga (arbovirus). Virus biasanya bereplikasi di port d’entree,
Beberapa seperti virus influenza (infeksi pernapasan) dan norovirus (infeksi gastrointestinal),
menyebabkan penyakit di port d’entree dan biasanya tidak mengalami sistemik lebih lanjut.
Virus tersebut menyebar secara lokal melalui permukaan epitel, tetapi tidak terdapat
penyebaran ke tempat yang jauh. (CDC, 1998).
Tabel. 5.3 Jalur Infeksi virus pada manusia yang sering terjadi
Menyebabkan Infeksi
Menyebabkan Gejala
Jalur Masuk Kelompok Virus Sistemik Ditambah
Lokal pada port d’entree
Penyakit Organ Spesifik
Virologi
213
Kulit
Trauma Ringan Papillomavirus Sebagian besar tipe
Herpesvirus Virus herpes simpleks Virus
Poxvirus molluscum contangiosum,
virus ort
Injeksi Hepadnavirus Hepatitis B
Herpesvirus Virus Epstein
Barr,
Retrovirus cytomegalovirus
Human
Gigitan Togavirus immunodeficiency virus
Banyak spesies,
termasuk virus ensefalitis
Flavivirus eastern equine
Banyak spesies, termasuk
virus yellow
Rhabdovirus
fever
Virus rabies
Sumber : Jawetz, Melnick, & Adelberg. Mikrobiologi Kedokteran. Edisi 25. Jakarta. Penerbit EGC. 2014.
Virologi 214
b. Kerusakan sel dan penyakit klinis
Gambar 5.2 Mekanisme penyebaran virus melalui tubuh pada infeksi virus manusia Sumber
: Jawets, Melnick, & Adelberg. Medical Microbiology 27th edition. United States.
Penerbit MC Graww Hill Education. 2016. (Dimodifikasi dan direproduksi atas izin dari Mims
CA, White DO: Viral Pathogenesis and Immunology. Blackwell, 1984)
Virologi
215
virus tersebut secara persisten. Infeksi jangka panjang tersebut dijelaskan di bawah ini. d.
Pelepasan virus
Tahap akhir dalam patogenesis adalah pelepasan virus yang infeksius ke lingkungan. Ini
merupakan tahap penting untuk menjaga infeksi virus berada dalam populasi pejamu.
Pelepasan biasanya terjadi dari permukaan tubuh yang terlibat dalam proses masuknya virus
(Gambar 5.2) Pelepasan terjadi pada tahapan penyakit yang berbeda-beda, bergantung pada
agen tertentu yang terlibat. Pelepasan virus menandakan bahwa individu yang terinfeksi
bersifat infeksius terhadap orang lain. Pada beberapa infeksi virus, seperti rabies, manusia
merupakan tempat infeksi terakhir, dan tidak terjadi pelepasan. a. Respons imun pejamu
Akibat dari infeksi virus mencerminkan hubungan saling memengaruhi antara virus dan
faktor pejamu. Mekanisme pertahanan pejamu nonspesifik biasanya didapati sesaat setelah
infeksi virus. Di antara respons imun alami, yang paling dominan adalah induksi IFN(). Respons-
respons tersebut membantu menghambat pertumbuhan virus selama jangka waktu yang
diperlukan untuk menginduksi imunitas humoral spesifik dan imunitas seluler.
Baik komponen humoral maupun seluler dari respons imun terlibat dalam pengendalian
infeksi virus. Virus menimbulkan respons jaringan yang berbeda dengan bakteri patogen. Jika
leukosit polimorfonuklear membentuk respons seluler utama terhadap inflamasi akut yang
disebabkan oleh bakteri piogenik maka infiltrasi oleh sel mononuklear dan limfosit merupakan
ciri reaksi inflamasi lesi virus tanpa komplikasi.
Protein tersandi virus berperan sebagai target bagi respons imun. Sel terinfeksi virus
dapat dilisiskan oleh limfosit T sitotoksik akibat pengenalan polipeptida virus pada permukaan
sel. Imunitas humoral melindungi pejamu dari reinfeksi oleh virus yang sama. Antibodi
penetral langsung menyerang protein kapsid sehingga menghambat inisiasi infeksi virus,
barangkali pada tahap penempelan, masuk, atau pelepasan selubung. Antibodi IgA sekretori
penting untuk melindungi pejamu dari infeksi virus yang melalui saluran pernapasan dan
pencernaan.
Karakteristik khusus virus tertentu dapat berpengaruh besar terhadap respons imun
pejamu. Beberapa virus menginfeksi dan merusak sel sistem imun. Contoh yang paling
dramatis adalah retrovirus manusia penyebab acquired immunodeficiency syndrome(AIDS)
yang menginfeksi limfosit T dan merusak kemampuannya untuk berfungsi.
Kepekaan pejamu dan respons terhadap infeksi ditentukan secara genetik, perbedaan
ini biasanya terdapat pada gen yang mengatur respons imun. Virus telah mengembangkan
berbagai cara untuk menekan atau menghindari respons imun pejamu sehingga dapat
terhindar dari penghancuran. Sering kali, protein virus yang terlibat dalam pengaturan respons
pejamu tidak penting untuk pertumbuhan virus pada kultur jaringan, kegunaannya hanya
disadari saat eksperimen patogenesis pada hewan. Selain menginfeksi sel sistem imun dan
meningkatkan fungsinya (HIV), virus juga dapat menginfeksi nefron yang mengekspresikan
sedikit atau tidak ada MHC kelas I (herpesvirus), atau dapat menyandi protein imunodulator
yang menghambat fungsi MHC (adenovirus, herpesvirus) atau menghambat aktivitas sitokin
(poxvirus, virus campak).Virus dapat bermutasi dan mengubah situs antigeniknya pada protein
virion (virus influenza, HIV) atau dapat menurunkan tingkat ekspresi protein permukaan sel
virus (herpesvirus). Sebagian besar virus mempunyai strategi anti-IFN.
Virologi 216
Suatu jenis gangguan imunopatologik diobservasi pada orang yang diimunisasi dengan
vaksin yang mengandung campak yang dimatikan atau respiratory syncytial virus (tidak lagi
digunakan). Beberapa orang mengalami respon imun tidak biasa yang memberikan
konsekuensi serius ketika mereka terpajan oleh virus infektif yang terjadi secara alami.
Demam berdarah dengue dengan sindrom syok, yang teriadi pada orang yang telah
mengalami minimal satu kali infeksi sebelumnya dengan dengue serotipe lainnya, mungkin
merupakan manifestasi yang terjadi secara alami dari ictus imunopatologi yang sama.
Efek samping berbahaya lainnya dari respons imun adalah perkembangan autoantibodi.
Jika sebuah antigen menimbulkan antibodi yang secara kebetulan dikenali determinan
antigenik pada protein seluler di jaringan normal, maka kerusakan seluler atau kehilangan
fungsi vang tidak berhubungan dengan infeksi virus dapat terjadi. Saat itu besarnya masalah
potensial ini pada manusia belum diketahui. (Jawetz, 2014).
Perbandingan Patogenesis Penyakit Virus A. Pada kulit dan sistem saraf pusat
Patogenesis mousepox, sebuah penyakit kulit, dan poliomielitis manusia, sebuah
penyakit sistem saraf pusat, diuraikan pada Gambar 5.3. Kedua virus bermultiplikasi di port
d’entree sebelum menyebar secara sistemik ke organ target. Pada mousepox, virus masuk ke
dalam tubuh melalui abrasi kecil pada kulit dan bermultiplikasi di sel epidermis. Pada saat yang
bersamaan, virus tersebut dibawa oleh pembuluh limfe menuju kelenjar limfe regional,
tempat multiplikasi juga terjadi. Beberapa partikel virus yang memasuki sirkulasi darah melalui
pembuluh limfe eferen ditangkap oleh makrofag hati dan limpa. Virus bermultiplikasi dengan
cepat pada kedua organ tersebut. Setelah pelepasan dari hati dan limpa, virus bergerak
mengikuti peredaran darah dan menempatkan diri pada lapisan epidermis basal kulit, di sel
konjungtiva, dan di dekat folikel limfe usus. Virus terkadang juga menempatkan diri pada sel
epitel ginjal, paru, kelenjar submaksila, dan pankreas. Lesi primer terbentuk di port d’entree
virus. Lesi primer tampak sebagai pembengkakan terlokalisasi yang bertambah besar dengan
cepat, menjadi edematous, ulkus, lalu terbentuk jaringan perut. Selanjutnya terjadi ruam
generalisata yang berperan melepaskan sejumlah besar virus ke lingkungan.
Pada poliomielitis, virus masuk melalui saluran pencernaan, bermultiplikasi di tempat
awal implantasi virus (tonsil, Plak Peyer) atau kelenjar limfe yang ada pada jaringan tersebut,
dan mulai tampak pada tenggorokan dan feses. Penyebaran virus sekunder terjadi melalui
aliran darah ke jaringan peka lainnya secara spesifik, kelenjar limfe lain dan sistem saraf pusat.
Dalam sistem saraf pusat, virus menyebar sepanjang serabut saraf. Jika terjadi multiplikasi
tingkat tinggi bersamaan dengan penyebaran virus melalui sistem saraf pusat maka terjadi
kerusakan neuron motorik dan paralisis. Pelepasan virus ke lingkungan tidak bergantung pada
penyebaran virus sekunder ke sistem saraf pusat. Penyebaran ke sistem saraf pusat lebih
mudah dicegah dengan adanya antibodi yang dipicu oleh infeksi sebelumnya atau vaksinasi.
Virologi
217
Gambar 5.3 Ilustrasi skematik patogenesis mousepox dan poliomielitis. SSP,
susunan saraf pusat
Sumber : Jawet, Melnick, & Adelberg. Medical Microbiology 27th edition. United States.
Penerbit MC Graww Hill Education. 2016.
Virologi 218
persisten (karier kronik), sebagian besar karier bersifat asimtomatik. Pada infeksi kronik virus
RNA, populasi virus sering mengalami banyak perubahan genetik dan antigenik.
Herpesvirus secara khas menimbulkan infeksi laten, Herpesvirus simpleks memasuki
ganglia sensorik dan menetap selama fase non infeksius (Gambar 5.4). Saat lesi yang
mengandung virus infeksius tampak pada lokasi perifer (mis, vesikel demam), dapat terjadi
reaktivasi periodik. Virus cacar air (varicella-zoster) juga menjadi bersifat laten di ganglia
sensorik. Rekurensi jarang dan terjadi beberapa tahunkemudian, biasanya mengikuti distribusi
saraf perifer (zoster). Anggota famili herpesvirus lainnya juga menimbulkan infeksi laten,
termasuk cytomegalovirus dan virus Epstein-Barr. semuanya dapat direaktivasi dengan
adanya imunosupresi. Maka dari itu, reaktivasi infeksi herpesvirus dapat merupakan
komplikasi serius bagi orang-orang yang mendapatkan terapi imunosupresan.
Infeksi virus persisten kemungkinan berperan jauh dalam penyakit manusia. Infeksi
virus persisten berhubungan dengan jenis kanker tertentu pada manusia serta penyakit
degeneratif yang progresif pada sistem saraf pusat manusia. Contoh berbagai jenis infeksi
virus persisten ditampilkan dalam Gambar 5.5 (dibawah ini).
Ensefalopati spongiform adalah sekelompok infeksi sistem saraf pusat yang kronik,
progresif, fatal yang disebabkan oleh agen non konvensional, dapat ditularkan yang disebut
prion. Prion dianggap bukan virus. Contoh paling baik dari jenis infeksi 'lambat" ini adalah
ensefalopati spongiform pada domba dan sapi ternak, kuru dan penyakit Creutzfeldt-Jakob
yang terjadi pada manusia.
Virologi
219
Gambar 5.5 Berbagai jenis interaksi virus-pejamu
Sumber : Jawetz, Melnick, & Adelberg. Medical Microbiology 27th edition. United States.
Penerbit MC Graww Hill Education. 2016.
Virologi 220
Commond cold Obstruksi Rhino Rhino Rhino
hidung, Adeno Adeno Corona
discharge hidung
Faringitis Sakit tenggorokan Adeno Adeno Adeno
Herpes Coxsackie Coxsackie
Simpleks
Laringitis/croup Suara serak, batuk Parainfluenza Parainfluenza Parainfluenza
“menggonggong” Influenza Influenza Influenza
Tracheobronchitis Batuk Parainfluenza Parainfluenza Influenza
Influenza Influenza Adeno
Bronkiolitis Batuk, dispnea Sensitial Jarang Jarang
Pernapasan
Parainfluenza
Pneumoniae Batuk, nyeri dada Sinsitial Influenza Influenza
Pernapasan Parainfluenza Adeno
Influenza
Tabel 5.4 Infeksi virus saluran pernapasan
Sumber : Jawet, Melnick, & Adelberg. Mikrobiologi Kedokteran. Edisi 25. Jakarta. Penerbit
EGC. 2014.
Virologi
221
Gambaran umum infeksi virus kulit
Kulit merupakan sawar yang kuat dan impermeabel terhadap masuknya virus. Namun,
beberapa virus dapat menerobos barier ini dan memulai infeksi pada pejamu (Tabel
5.2).Beberapa virus mendapatkan jalan masuk melalui abrasi kecil pada kulit (poxvirus,
papilomavirus, herpesvirus simpleks), yang lainnya masuk melalui gigitan vektor artropoda
(arbovirus) atau pejamu vertebrata terinfeksi (virus rabies, herpesvirus B), dan yang lainnya
lagi masuk melalui transfusi darah atau manipulasi lainnya termasuk jarum yang
terkontaminasi, seperti akupunktur dan tato (virus hepatitis B, HIV).
Beberapa agen tetap terlokalisasi dan menimbulkan lesi di port d'entree (Papilomavirus
dan Moluskum kontangiosumsebagian besar menyebar ke tempat lain. Lapisan epidermis
sama sekali tanpa pembuluh darah dan serabut saraf, jadi virus yang menginfeksi sel-sel
epidermis cenderung tetap terlokalisasi. Virus yang masuk lebih dalam ke dermis pembuluh
darah, limfe, sel dendritik, dan makrofag serta biasanya menyebar dan menyebabkan infeksi
sistemik.
Banyak ruam kulit generalisata yang disebabkan oleh otefilik. Virus terjadi karena virus
menyebar ke kulit melalui darah setelah bereplikasi pada beberapa tempat lain. Seperti itu
berasal dari jalur lain (mis, infeksi virus pernapasan), dan kulit menjadi terinfeksi dari bawah.
Lesi pada ruam kulit berupa makula, papula, vesikel yang disebabkan oleh dilatasi lokal
pembuluh darah dermis, berkembang menjadi papul jika terdapat edema dan infiltrasi seluler
di daerah tersebut. Vesikel terjadi jika epidermis terkena, dan menjadi pustul jika reaksi
inflamasi mendatangkan leukosit polimorfonuklear ke lesi tersebut. Kemudian terjadi ulserasi
dan keropeng. Ruam hemoragik dan petekie terjadi ketika terdapat keterlibatan pembuluh
darah dermis yang lebih berat.
Lesi kulit sering tidak berperan dalam transmisi virus. Virus infeksius tidak dikeluarkan
dari ruam makulopapular campak atau dari ruam yang berhubungan dengan infeksi arbovirus.
Sebaliknya, lesi kulit berperan penting dalam penyebaran poxvirus dan herpesvirus simpleks.
Partikel virus infeksius ditemukan dalam titer tinggi dalam cairan ruam vesikopustular
tersebut, dan pertikel tersebut dapat menyebarkan infeksi melalui kontak langsung dengan
pejamu lain. Namun, dalam kasus ini pun, virion yang ada di sekret orofaring dipercaya
memiliki peran lebih penting untuk menyebarkan penyakit dibandingkan dengan lesi kulit.
(Jawetz, 2014).
Virologi 222
Jalan lain menuju sistem saraf pusat adalah melalui saraf perifer. Virion dapat masuk ke
saraf sensorik atau ujung saraf motorik dan berjalan melalui akson, melalui ruang endoneural,
atau melalui infeksi sel Schwann, Herpesvirus berjalan di akson menuju neuron ganglion radiks
dorsal. Jalur penyebaran virus tidak hanya melalui satu cara saja, tetapi dapat melalui lebih
dari satu metode, Banyak virus, termasuk herpes, togaviridae, flavivirus, enterovirus,
rhabdoviridae, paramikso dan bunyavirus, dapat menginfeksi sistem saraf pusat dan
menyebabkan meningitis, ensefalitis, atau keduanya, Ensefalitis yang disebabkan oleh
herpesvirus simpleks merupakan penyebab ensefasilitis sporadik pada manusia yang paling
sering. Reaksi patologik terhadap infeksi virus sitosidal sistem saraf pusat mencakup nekrosis,
inflamasi, dan fagositosis oleh sel-sel glia. Penyebab gejala pada beberapa infeksi sistem saraf
pusat lainnya, seperti rabies, tidak jelas. Ensefaitis pasca infeksi campak (sekitar satu per 1000
kasus) dan lebih jarang lagi setelah infeksi rubella ditandai oleh diemilinasi tanpa degenerasi
neuronal dan mungkin merupakan sebuah penyakit autoimun.
Terdapat beberapa gangguan neurodegeneratif yang jarang, disebut infeksi virus lambat
yang secara keseluruhan bersifat fatal. Gambaran infeksi ini mencakup periode inkubasi yang
lama (bulan sampai tahun) yang diikuti oleh kaitan penyakit klinis dan keadaan umum yang
memburuk secara progresif, menyebabkan kematian dalam waktu beberapa minggu sampai
bulan; biasanya hanya sistem saraf pusat yang terkena. Beberapa infeksi virus lambat, seperti
leukoensefalopati multifokal progresif (JC polyomavirus) dan Subacute sclerosing
panencephalitis (virus campak), disebabkan oleh virus khusus. Sebaliknya, ensefalopati
spongiform subakut, diwakili oleh sapi gila, adalah penyakit yang di sebabkan oleh agen non
konvensional yang disebut prion. Pada infeksi ini, perubahan neuropatologik khas terjadi,
tetapi tidak ada respon imun atau inflamasi yang dicetuskan.
Virologi
223
menyebabkan kematian janin. Virus yang kurang bersifat sitolitik, seperti rubella, dapat
memperlambat kecepatan pembelahan sel. Jika ini terjadi selama masa kritis perkembangan
organ, dapat terjadi defek struktural dan anomali kongenital. Banyak virus yang sama dapat
menyebabkan penyakit serius pada neonatus (Tabel 5.5). Infeksi seperti ini bisa didapat dari
ibu selama persalinan (natal) melalui sekret genital, feses, atau darah yang terkontaminasi.
jarang terjadi, infeksi dapat diperoleh dalam beberapa kasus pertama setelah kelahiran
(pascanatal) dari ibu, anggota keluarga, personil rumah sakit atau transfusi darah. (DJ
Bonthius, 2007).
Gambar 5.6 Infeksi virus pada janin (atas ijin dari L Catalano dan J Sever) Sumber : Jawetz,
Melnick, & Adelberg. Mikrobiologi Kedokteran. Edisi 25. Jakarta. Penerbit EGC. 2014.
Virologi 224
Rubella + - Jarang 0,1 – 0,7
Cytomegalovirus + ++ + 5 – 25
Herpes simplex + ++ + 0,03 – 0,5
Varicella-zoster + Jarang Jarang Jarang
Hepatitis B + ++ + 0–7
Enterovirus + ++ + Tidak umum
HIV + ++ Jarang Bervariasi
Parvovirus B19 + - Jarang Jarang
Sumber : Jawetz, Melnick, & Adelberg. Mikrobiologi Kedokteran. Edisi 25. Jakarta. Penerbit
EGC. 2014.
Virologi
225
pelepasan partikel anak virus. Senyatanya, antivirus yang dapat membedakan proses replikasi
pejamu dan proses replikasi virus sangat sulit dikembangkan.
Akan tetapi, pada dekade terakhir telah dikembangkan sejumlah senyawa yang
mempunyai manfaat dalam terapi beberapa penyakit virus, terutama terhadap herpesvirus
dan infeksi HIV (Tabel 5.6). Contoh-contohnya diringkaskan di bawah ini. Antivirus memiliki
mekanisme kerja yang bervariasi. Sering kali obat tersebut harus diaktifkan oleh enzim di
dalam sel sebelum ia dapat bertindak sebagai inhibitor replikasi virus; Obat yang paling selektif
diaktifkan oleh enzim penyandi virus pada sel yang terinfeksi. Yang penting dilakukan pada
masa mendatang adalah mempelajari bagaimana meminimalkan munculnya varian virus yang
resisten obat dan menciptakan antivirus yang lebih spesifik berdasarkan pengetahuan
molekuler dalam struktur dan replikasi kelas virus yang beragam. (A Alcami, 2005).
Tabel 5.6 Contoh senyawa antivirus yang digunakan untuk terapi infeksi virus
Virologi 226
inhibitor Reverse HIV-1, HIV-2
transcriptase
Lamivudine Ya inhibitor HIV
(3TC) protease inhibitor HIV-1, HIV-2, HBV
Inhibitor masuk
Tidak (menghambat
Lopinavir pengikatan HIV-1
Tidak terhadap
Maraviroc CCRS) HIV-1
Reverse
transcriptase
Tidak inhibitor
Nevirapin Viral neuraminidase HIV-1
inhibitor
Tidak Integrase inhibitor
Oseltamivir Mungkin memblok Influenza A dan B
Tidak capping mRNA virus
Raltegravir Ya HIV-1
Ribavirin HIV protease Respiratory syncytial virus,
inhibitor HIV influenza A dan B, Lassa
Tidak protease fever, hepatitis C, lainnya
Ritonavir inhibitor HIV-1, HIV-2
Tidak Reverse
Saquinavir transcriptase HIV-1, HIV-2
Ya inhibitor
Stavudin (d4T) Viral polymerase HIV-1, HIV-2
inhibitor
Ya Viral polymerase
Trifluridin inhibitor Herpes simpleks,
Ya Viral polymerase cytomegalovirus, vaccinia
Valasiklovir inhibitor Reverse Herpesvirus
Ya transcriptase
Vidarabin inhibitor Reverse Herpesvirus, vaccinia, HBV
Ya transcriptase
Zalcitabine (ddC) inhibitor HIV-1, HIV-2, HBV
Ya
Zidovudine (AZT) HIV-1, HIV-2, HTV-1
Virologi
227
Sumber : Jawet, Melnick, & Adelberg. Mikrobiologi Kedokteran. Edisi 25. Jakarta. Penerbit EGC.
2014.
a. Analog nukleosida
Mayoritas agen yang tersedia adalah analog nukleosida, Agen ini menghambat replikasi
asam nukleat dengan cara menghambat polimerase yang digunakan untuk replikasi asam
nukleat. Selain itu. beberapa analog juga dapat dimasukkan ke dalam asam nukleat dan
menghambat sintesis lebih lanjut mengganggu fungsinya.
Analog dapat menghambat enzim seluler sebagaimana enzim penyandi virus. Analog yang
paling efektif adalah yang dapat secara spesifik menghambat enzim penyandi virus, dengan
hambatan minimal terhadap enzim sel pejamu yang sejalan. Varian virus yang resisten
terhadap obat biasanya muncul suatu ketika, biasanya sangat cepat. Penggunaan kombinasi
Obat antivirus dapat menghambat munculnya varian yang resisten (mis, terapi "kombinasi tiga
obat" yang digunakan untuk terapi infeksi HIV). Contoh analog nukleosida adalah asiklovir
(asikloguanosin), lamivudin (3TC), ribavirin, vidarabin (adenin arabinosida), dan zidovudin
(azidotimidin; AZT).
b. Analog nukleotida
Analog nukleotida berbeda dari analog nukleosida dalam hal grup fosfat yang terikat.
Kemampuannya menetap di dalam sel untuk periode waktu yang lama meningkatkan
potensinya. Contohnya adalah Sidofovir (HPMPC).
d. Inhibitor protease
Saquinavir adalah inhibitor protease pertama yang disetujui untuk terapi infeksi HIV. Ini
adalah agen peptidomimetik yang dirancang menggunakan model komputer sebagai sebuah
molekul yang cocok dengan situs aktif enzim protease HIV. Obat seperti ini menghambat
protease virus yang diperlukan pada tahap akhir siklus replikatif untuk memotong gag virus
dan prekursor polipeptida gag pol sehingga membentuk selubung virion matur dan
mengaktifkan reverse transcriptase yang akan digunakan pada siklus infeksi selanjutnya.
Penghambatan protease menghasilkan partikel virus noninfeksius. Contoh inhibitor protease
adalah indinavir, ritonavir dan yang lainnya tidak dicantumkan di sini. (ACIP, 2006).
Virologi 228
e. Inhibitor fusi
Fuzeon adalah sebuah peptida besar yang menghalangi terjadinya peleburan antara virus dan
membran seluler yang terlibat dalam masuknya HIV- I ke dalam sel.
2. Interferon
IFN adalah protein yang disandi pejamu yang merupakan anggota famili sitokin yang
besar dan menghambat replikasi virus. IFN dihasilkan sangat cepat (dalam hitungan jam)
sebagai respons terhadap infeksi virus atau penginduksi lainnya serta merupakan salah satu
respons pertahanan tubuh yang pertama dalam menghadapi infeksi virus. INF adalah sitokin
pertama yang dikenali. IFN merupakan suatu respons imun antivirus alami. IFN juga mengatur
imunitas seluler dan humoral serta mempunyai aktivitas pengaturan pertumbuhan Sel yang
luas, tetapi di sini akan difokuskan pada efek antivirusnya.
a. Sifat lFN
Terdapat banyak spesies IFN yang terbagi dålam tiga kelompok utama, yaitu IFN-a, IFNp,
IFN-Y (Tabel 5.7). Baik IFN-a maupun IFN-p dianggap tipe I atau IFN virus, sedangkan IFN-Y
adalah tipe Il atau IFN imun. Famili IFN-a dikode oleh minimal 20 gen pada genom manusia:
IFN-P dan IFN -y dikode oleh masing-masing satu gen. Ketiga famili gen ini berbeda sehingga
sekuens koding tidak berhubungan erat. Ketiga kelas IFN memiliki ukuran yang hampir sama
tetapi berbeda secara antigenik. IFN-O dan IFN-F resisten terhadap pH rendah. IFN-F dan IFN-
Y terglikosilasi, gula tidak penting untuk aktivitas biologik, jadi klon yang dihasilkan bakteri
bersifat aktif secara biologi dendritik adalah penghasil IFN yang potensial tantangan virus yang
sama, sel dendritik dapat mel IFN 1000 kali lebih banyak dibandingkan fibroblas.
b. Sintesis IFN
IFN diproduksi oleh semua spesies vertebrata. sel normal secara umum tidak mensintesis IFN
Sampai sel tersebut terinduksi untuk melakukannya. Infeksi Virus merupakan pengganggu poten yang
menyebabkan induksi; virus RNA menginduksi IFN lebih kuat dibandingkan dengan virus DNA. IFN juga
Virologi
229
dapat diinduksi oleh RNA untai ganda, endotoksin bakteri, dan molekul kecil seperti tiloron. IFN-y tidak
terinduksi oleh sebagian besar virus tetapi terinduksi oleh stimulasi mitogen.
IFN kelas yang berbeda dihasilkan oleh jenis sel yang berbeda. IFN-α dan IFN- disintesis
oleh banyak jenis sel, tetapi IFN-y dihasilkan terutama oleh limfosit, khususnya sel T dan sel
natural killer (NK). Sel dendritik merupakan penghasil IFN poten; di bawah kondisi tantangan
virus yang sama, sel dendritik dapat mensekresi IFN 1000 kali lebih banyak dibandingkan
dengan fibroblas.
Tipe
Sifat
Alfa Beta Gamma
Nomenklatur saat ini IFN-α IFN- IFN-
Penamaan terdahulu Leukosit Fibroblas Interferon imun
Tipe interferon Tipe I Tipe I Tipe II
≥ 20 1 1 Jumlah
gen yang menyandi famili
Sumber sel utama Sebagian besar jenis Sebagian besar jenis sel Limfosit
sel
Agen penginduksi Virus ; dsRNA Virus ; dsRNA Mitogen
Stabilitas pada pH Stabil Stabil Labil
2,0
Glikosilasi Tidak Ya Ya
Intron dalam gen Tidak Tidak Ya
Homologi dengan 80–95% 30% <10%
IFN-α
Lokasi kromosom gen 9 9 12
Virologi 230
c. Aktivitas antivirus dan efek biologik Iainnya
IFN pertama kali dikenal karena kemampuannya mengganggu infeksi virus pada sel yang
dikultur. IFN dapat dideteksi segera setelah terjadi infeksi virus pada hewan yang intak, dan
kemudian produksi virus berkurang (Gambar 5.7). Antibodi tidak tampak di dalam darah
hewan hingga beberapa hari setelah produksi virus berkurang. Hubungan sementara ini
menunjukkan bahwa IFN mempunyai peran utama dalam pertahanan nonspesifik pejamu
terhadap infeksi virus. Kesimpulan ini juga didukung oleh observasi bahwa orang-orang yang
menderita agamaglobulinemik biasanya sembuh dari infeksi virus primer sebagaimana halnya
orang normal.
IFN tidak melindungi sel terinfeksi-virus yang menghasilkannya, dan IFN sendiri bukanlah
agen antivirus. Sebaliknya, IFN menginduksi keadaan antivirus sel lainnya dengan mendorong
sintesis protein lain untuk menghambat replikasi virus. Molekul IFN berikatan dengan reseptor
permukaan sel spesifik pada sel target. IFN-α dan IFN- mempunyai reseptor yang sama,
sedangkan IFN-y mengenali reseptor yang berbeda. Pengikatan resepor memicu fosforilasi
tirosin dan aktivasi faktor transkripsi (protein dan nukleus) memerantarai transkripsi gen-gen
yang dapat menginduksi IFN (yang terjadi dalam hitungan menit setelah pengikatan IFN). Ini
mengakibatkan sintesis beberapa enzim yang dipercaya menjadi instrumen dalam
perkembangan antivirus.
Beberapa jalur yang tampak terlibat, termasuk yang berikut. (1) protein kinase dependen
ds-DNA, PKR yang memfosforilasi dan menginaktifkan faktor infiltrasi seluler elF-2 dan dengan
demikian mencegah pembentukan kompleks inisiasi yang diperlukan untuk sintesis protein
virus; (2) oligonukleotida sintetase, 2-5A sintetase yang mengaktifkan endonuklease seluler,
RNase L yang selanjutnya mendegradasi mRNA; (3) fosfodiesterase yang menghambat
elongasi rantai peptida dan (4) nitrat oksida sintetase yang diinduksi oleh IFN-Y di makrofag.
Akan tetapi, penjelasan ini gagal menyingkap mengapa kondisi antivirus ini bekerja secara
selektif terhadap mRNA virus dan tidak terhadap mRNA seluler. Fase replikasi virus yang lain
juga dapat dihambat oleh INF.
Virologi
231
Sumber : Jawetz, Melnick, & Adelberg. Mikrobiologi Kedokteran. Edisi 25. Jakarta. Penerbit
EGC. 2014.
IFN juga hampir selalu berfungsi spesifik terhadap spesies pejamu tertentu, tidak spesifik
terhadap suatu virus tertentu. Replikasi berbagai macam virus DNA dan RNA dapat dihambat.
Ketika IFN ditambahkan ke sel-sel sebelum terjadinya infeksi, terjadi inhibisi replikasi virus
yang bermakna, tetapi dengan fungsi sel yang hampir normal. IFN sangat poten, jadi untuk
kerjanya diperlukan jumlah yang sangat kecil. Kurang dari 50 molekul IFN per sel diperkirakan
cukup untuk menginduksi kondisi antivirus.
e. Penelitian klinis
Pada awalnya, interferon diharapkan dapat menjadi jawaban untuk mencegah banyak
penyakit virus, seperti penyakit pernapasan yang kemungkinan disebabkan oleh berbagai jenis
virus. Namun, penggunaannya berubah menjadi tidak praktis karena supaya efektif maka dosis
besar harus diberikan sebelum terpajan oleh virus atau pada awal infeksi (sebelum munculnya
tanda klinis penyakit). Rekombinan IFN-α bermanfaat dalam mengontrol infeksi virus hepatitis
B dan hepatitis C pada hati, walaupun relaps setelah penghentian terapi umum terjadi. IFN
topikal pada mata dapat menangani keratitis herpetik dan mempercepat penyembuhan.
Beberapa sediaan IFN disetujui untuk penggunaan klinis. IFN menyebabkan banyak efek
samping, yang paling umum adalah sistemik dan hematologik. (CA Bonjardim, 2005).
3. Vaksin Virus
Tujuan vaksin virus adalah memanfaatkan respons imun pejamu untuk mencegah
penyakit virus. Beberapa vaksin telah terbukti sangat efektif dalam menurunkan insidens
tahunan penyakit virus (gambar 5.8). Vaksinasi merupakan metode yang paling cost-effective
dalam pencegahan virus yang berbahaya. a. Prinsip umum
Imunitas terhadap infeksi virus berdasarkan pada kembangan respons imun terhadap
antigen spesifik yang berlokasi pada permukaan partikel virus atau sel-sel terinfeksi virus.
Untuk virus yang berselubung, antigen yang penting adalah glikoprotein yang ada di
permukaan. Walaupun hewan yang terinfeksi dapat mengembangkan antibodi terhadap
protein selubung virion atau protein nonstruktural yang terlibat dalam replikasi virus, tetapi
respons imun tersebut dipercaya tidak berperan atau mempunyai peran yang kecil dalam
perkembangan resistensi terhadap infeksi. Vaksin tersedia untuk pencegahan beberapa
Virologi 232
penyakit manusia yang penting. Vaksin yang sekarang tersedia (Tabel 5.8) digambarkan secara
detil pada bab yang berhubungan dengan famili virus spesifik dan penyakit.
Patogenesis infeksi virus tertentu memengaruhi tujuan imunoprofilaksis. Imunitas
mukosa (IgA lokal) berperan penting dalam menahan infeksi virus yang bereplikasi dalam
membran mukosa (rhinovirus, virus influenza, rotavirus) atau menginvasi melalui mukosa
(papilomavirus). Virus yang mempunyai cara penyebaran viremia (polio, hepatitis A dan B,
yellow fever, varicella, mumps, campak) dikendalikan oleh antibodi serum. Imunitas seluler
juga terlibat dalam perlindungan terhadap infeksi sistemik (campak, herpes).
Karakteristik tertentu sebuah virus atau penyakit virus dapat menyulitkan pembuatan
sebuah vaksin yang efektf. Adanya banyak serotipe, seperti rhinovirus, dan reservoir hewan
yang banyak, seperti virus influeza, membuat produksi vaksin menjadi sulit. Rintangan lain
meliputi integrasi DNA virus ke DNA kromosom pejamu (retrovirus) dan infeksi sel sistem imun
pejamu (HIV). (S Virgin, 2007)
Gambar 5.8 Insiden tahunan berbagai penyakit virus di Amerika Serikat Sumber : Jawetz,
Melnick, & Adelberg. Medical Microbiology 27th edition. United States. Penerbit MC
Graww Hill Education. 2016
Virologi
233
Umum Hepatitis A Mati Fibroblas diploid manusia (MRC-5)
Hepatitis B Subunit (HbaAg) Ragi (DNA rekombinan)
Influenza A dan B Mati Telur ayam yang mengandung embrio
Influenza A dan B Hidup Telur ayam yang mengandung embrio
Campak Hidup Fibroblas embrio ayam
Mumps Hidup Telur ayam yang mengandung embrio dan
fibroblas embrio ayam Ragi
Papiloma Subunit (L1) (DNA rekombinan)
Poliovirus (IPV) Mati Sel ginjal monyet (vero)
Poliovirus (OPV) Hidup Sel ginjal monyet
Rabies Mati Fibroblas diploid manusia (MRC-5) atau sel
diploid paru janin rhesus atau fibroblas ayam
Rotavirus Hidup Sel ginjal monyet (vero)
Rubella Hidup Fibroblas diploid manusia (WI-38)
Varicella Hidup Fibroblas diploid manusia (MRC-5)
Zoster Hidup Fibroblas diploid manusia (MRC-5)
Virologi 234
Jumlah dosis Multipel Tunggal
Perlunya adjuvan Ya Tidak
Durasi imunitas Lebih singkat Lebih panjang
Efektivitas proteksi (lebih Lebih rendah Lebih tinggi
dekat menyerupai infeksi
alami)
Imunoglobulin yang IgG IgA dan IgG
dihasilkan
Imunitas mukosa yang Jelek Ya
dihasilkan
Imunitas diperantai sel yang Jelek Ya
dihasilkan
Virus virulen residual di Mungkin Tidak
dalam vaksin
Kembalinya virulensi Ekskresi Tidak Mungkin
virus vaksin dan penularan Tidak Mungkin
ke kontak
nonimun
Gangguan oleh virus lain Tidak Mungkin
pada pejamu
Stabilitas pada suhu kamar Tinggi Rendah
Sumber : Jawetz, Melnick, & Adelberg. Mikrobiologi Kedokteran. Edisi 25. Jakarta. Penerbit
EGC. 2014.
Virologi
235
4. Respons imun seluler terhadap vaksin inaktif umumnya jelek.
5. Beberapa vaksin virus mati justru menginduksi hipersensitivitas terhadap infeksi
selanjutnya, kemungkinan disebabkan terhadap respons imun yang tidak seimbang
terhadap antigen permukaan virus yang gagal meniru infeksi dengan virus alami.
Gambar 5.9 Respon serum dan antibodi sekretori terhadap pemberian oral vaksin
polio hidup yag dilemahkan dan terhadap inokulasi intramuskular vaksin polio yang
mati
Sumber : Jawetz, Melnick, & Adelberg. Mikrobiologi Kedokteran. Edisi 25. Jakarta. Penerbit
EGC. 2014.
c. Vaksin virus yang dilemahkan
Vaksin virus hidup menggunakan virus mutan yang antigennya hampir mirip dengan virus tipe
liar, tetapi beberapa tahapan dalam patogenesis penyakitnya dibatasi (Tabel 5.9).
Dasar genetik untuk melemahkan sebagian besar vaksin virus tidak diketahui, karena
diseleksi secara empiris melalui multiplikasi serial pada hewan atau kultur sel (biasanya dari
spesies berbeda pada pejamu alami). Seperti yang telah dipelajari bahwa gen virus yang
terlibat dalam patogenesis penyakit merupakan kandidat vaksin yang dilemahkan dan dapat
dirancang di laboratorium.
Vaksin virus hidup yang dilemahkan mempunyai keuntungan menyerupai infeksi alami
dilihat dari segi imunitasnya. Virus tersebut bermultiplikasi di dalam pejamu dan cenderung
untuk merangsang produksi antibodi jangka panjang, untuk menginduksi respons imun seluler
yang bagus, dan untuk menginduksi produksi antibodi serta resistensi pada port d'entree
infeksi (Gambar 5.9).
Virologi 236
1. Risiko kembalinya ke virulensi yang lebih besar selama multiplikasi di dalam vaksin.
Walaupun pengembalian tersebut belum terbukti menjadi masalah dalam praktik tetapi
ada potensinya.
2. Agen luar tak dikenal yang secara tersembunyi menginfeksi substrat kultur (telur, kultur
sel primer) dapat memasuki stok vaksin. Virus yang ditemukan di dalam vaksin mencakup
avian leukosis virus, simian polyomavirus SV40, dan simian cytomegalovirus. Masalah
kontaminan dari luar dapat dihindari dengan penggunaan sel normal secara serial yang
diperbanyak di dalam kultur (mis, lini sel diploid manusia) sebagai substrat untuk
pengolahan virus vaksin.
3. Penyimpanan dan masa hidup yang terbatas dari vaksin dilemahkan mendatangkan
masalah, tetapi ini yang dapat diatasi pada beberapa kasus dengan penggunaan stabilizer
virus (mis, MgCl2 untuk vaksin polio).
4. Gangguan oleh adanya koinfeksi yang terjadi secara alami, virus jenis liar dapat
menghambat replikasi virus vaksin dan menurunkan efektivitasnya. Ini telah diketahui
pada strain vaksin poliovirus yang dapat dihambat oleh infeksi enterovirus yang terjadi
bersamaan.
Virologi
237
1. Penggunaan teknik DNA Rekombinan untuk menyisipkan gen yang menyandi protein
tertentu ke dalam genom sebuah virus avirulen dapat diberikan sebagai vaksin (seperti
virus vaksin).
2. Yang dimasukkan ke dalam vaksin hanya komponen subvirus yang diperlukan untuk
menstimulasi antibodi protektif, dengan demikian meminimalkan terjadinya efek
samping terhadap vaksin.
3. Penggunan protein murni yang diisolasi dari virus murni atau yang disintesis dari gen yang
dikloning (vaksin virus hepatitis B rekombinan mengandung protein virus yang disintesis
pada sel ragi). Ekspresi gen-gen yang dikloning terkadang menghasilkan partikel yang
mirip dengan virus kosong.
4. Penggunaan peptida sintetik berhubungan dengan determinan antigenik protein virus
sehingga menghindari setiap kemungkinan untuk kembalinya virulensi karena tidak ada
asam nukleat virus walaupun respons imun yang diinduksi oleh peptida sintetik dianggap
lebih lemah daripada yang diinduksi oleh protein intak.
5. Perkembangan vaksin oral melalui tumbuhan transgenik yang mensintesis antigen dari
virus patogenik dapat memberikan cara baru yang cost effective dalam pemberian vaksin.
6. Penggunaan vaksin DNA telanjang secara potensial sederhana, murah, dan aman yang
plasmid rekombinannya membawa gen untuk protein tertentu tersebut diinjeksikan ke
dalam pejamu dan DNA menhasilkan protein pengimunisasi.
7. Pemberian vaksin secara lokal untuk menstimulasi antibodi pada tempat masuk (seperti
vaksin aerosol untuk virus penyakit pernapasan). (G Ada, 2001).
Latihan
Untuk dapat memperdalam pemahaman saudara mengenai materi di atas, kerjakanlah Latihan
berikut!
Jawablah pertanyaan dibawah ini dengan singkat dan jelas dengan hanya menuliskanesensinya saja !
1) Sebutkan 8 faktor yang menyebabkan timbulnya penyakit virus ?
2) Apa yang dimaksud dengan patogenesis virus ?
3) Apa nama penyakit pencernaan untuk jangka pendek dengan gejala yang berkisar dari ringan,
diare encer sampai penyakit demam berat yang ditandai oleh muntah, dan lemas. Rotavirus, virus
Norwalk, dan Calicivirus adalah penyebab utama penyakit ini. Bayi dan anak-anak paling sering
terkena.
4) Sebutkan tiga macam interferon yang anda ketahui ?
Petunjuk Jawaban Latihan
Untuk membantu saudara dalam mengerjakan soal latihan tersebut silakan pelajari kembali materi
tentang :
1) Pengertian infeksi virus
2) Prinsip-prinsip infeksi virus
3) Gambaran infeksi virus saluran pencernaan
Virologi 238
4) Pencegahan dan terapi infeksi virus
Ringkasan
Pengertian Infeksi Virus
Virus dapat menginfeksi inangnya dan menyebabkan berbagai akibat bagi inangnya.
ada yang berbahaya, namun juga ada yang dapat ditangani oleh sel imun dalam tubuh
sehingga akibat yang dihasilkan tidak terlalu besar. Infeksi akut merupakan infeksi yang
berlangsung dalam jangka waktu cepat namun dapat juga berakibat fatal. Infeksi kronis
merupakan infeksi virus yang berkepanjangan sehingga ada risiko gejala penyakit muncul
kembali.
Penyakit virus timbul mengikuti satu dari ketiga pola umum; pengenalan agen baru,
peningkatan penyakit yang mendadak yang disebabkan oleh suatu agen endemik, dan invasi
pada populasi inang baru.Contoh terbaru dari merebaknya infeksi virus pada bagian dunia
yang berbeda antara lain adalah virus Ebola, penyakit paru-paru hantavirus, infeksi HIV,
demam berdarah dengue, demam Lassa, demam Rift valley, dan ensefalopati spongioform
bovinum.
Prinsip-prinsip infeksi virus
Proses dasar infeksi virus adalah sildus replikatif virus. Prinsip-prinsip penting menyangkut
infeksi virus adalah sebagai berikut: (1) banyak infeksi virus bersifat subklinis; (2) infeksi yang
sama dapat disebabkan oleh berbagai virus; (3) virus yang sama dapat menyebabkan berbagai
infeksi; (4) infeksi yang diakibatkan tidak berhubungan dengan morfologi virus; dan (5)
keluaran pada kasus apapun ditentukan oleh faktor virus, pejamu, dan dipengaruhi oleh gen
masing-masing.
Langkah-langkah patogenesis virus
a. Proses masuk dan replikasi primer
b. Kerusakan sel dan penyakit
c. Pemulihan dari infeksi
d. Pelepasan virus
e. Respons imun pejamu
Perbandingan Patogenesis Penyakit Virus
a. Pada kulit & sistem saraf pusat : Infeksi bersifat akut saat virus pertama kali menginfeksi
pejamu yang rentan. Infeksi virus biasanya sembuh sendiri
b. Gambaran umum infeksi virus saluran pencernaan: Banyak virus memulai infeksi melalui
saluran pencernaan. Virus terpajan dari saluran pencernaan sampai elemen keras yang
terlibat dalam pencernaan makanan asam, garam empedu (deterjen), dan enzim
proteolitik.
c. Gambaran umum infeksi virus kulit: Kulit merupakan sawar yang kuat dan impermeabel
terhadap masuknya virus. Beberapa virus mendapatkan jalan masuk melalui abrasi kecil
pada kulit (poxvirus, papilomavirus, herpesvirus simpleks).
Virologi
239
d. Gambaran umum infeksi virus sistem saraf pusat : Virus dapat memperoleh akses ke otak
melalui dua rute: melalui aliran darah (penyebaran hematogen) dan melalui serabut saraf
perifer (penyebaran neuronal).
e. Gambaran umum infeksi virus kongenital : Beberapa virus menyebabkan penyakit pada
janin manusia. Sebagian besar infeksi virus maternal tidak menyebabkan viremia dan
keterlibatan janin. Akan tetapi, jika virus menembus plasenta dan terjadi infeksi intrauteri,
kerusakan yang serius dapat terjadi pada janin.
Tes 2
Pilihlah salah satu jawaban yang paling benar!
Virologi 240
1. Interferon adalah bagian yang penting dari pertahanan pejamu terhadap infeksi virus.
Apa prinsip utama cara kerja interferon?
A. Interferon terdapat di dalam serum individu sehat, memberikan peran surveilans virus
B. Interferon menyelubungi partikel virus dan menghambat penempelannya ke sel
C. Interferon menginduksi sintesis satu atau lebih protein seluler yang menghambat translasi
atau transkripsi
D. Interferon melindungi sel-sel terinfeksi virus yang menghasilkannya dari kematian sel
E. Interferon terdapat di dalam serum individu sehat, memberikan peran sebagai antibodi
terhadap virus
2. Seorang bayi perempuan berusia 9 bulan dibawa ke ruang gawat darurat karena demam dan
batuk persisten. Pada pemeriksaan fisik terdengar ronkhi di dada kirinya. Pada foto thoraks
tampak infiltrat di paru kirinya. Didiagnosis pneumonia. Apa penyebab yang paling mungkin?
A. Rotavirus
B. Rhinovirus
C. Adenovirus
D. Repiratory syncytial virus
E. Coxackievirus
3. Manakah berikut ini yang merupakan prinsip dasar yang menyebabkan penyakit virus?
A. Satu jenis virus menginduksi sindrom penyakit tunggal
B. Banyak infeksi virus bersifat subklinis dan tidak menyebabkan penyakit klinis Banyak infeksi
virus bersifat subklinis dan menyebabkan penyakit klinis
C. Jenis penyakit yang disebabkan oleh virus dapat diprediksi melalui morfologi virus tersebut
D. Sebuah sindrom penyakit tertentu disebabkan virus tunggal
E. Banyak infeksi virus bersifat subklinis dan tidak menyebabkan penyakit klinis
4. Kulit adalah barier yang tidak dapat ditembus untuk masuknya virus, tetapi beberapa virus mampu
menerobos barier ini dan menginfeksi pejamu. Manakah berikut ini yang merupakan contoh virus
yang masuk melalui abrasi kulit?
A. Adenovirus
B. Rotavirus
C. Rhinovirus
D. Papilomavirus
E. Poliovirus
5. Seorang laki-laki 40 tahun mempunyai ciri-ciri HIV/ AIDS berupa kadar CD4 yang rendah dan viral
load yang tinggi. Pasien ini akan diberikan highly active antiretroviral therapy (HAART). Salah satu
Obat yang dipertimbangkan adalah analog nukleosida yang menghambat reverse transcriptase
virus dan aktif terhadap HIV dan HBV. Obat tersebut adalah
A. Acyclovir
Virologi
241
B. Amantadine
C. Ribavirin
D. Amoxicillin
E. Lamivudine
6. Mengenai pasien HIV/AIDS pada Pertanyaan 5, sebuah agen peptidomimetik yang memblok
pembelahan yang diperantarai virus dari prekursor protein struktural virus dipilih sebagai Obat
kedua. Obat tersebut adalah...
A. Acyclovir
B. Amantadine
C. Ribavirin
D. Saquinavir
E. Riboflavin
7. Seorang wanita berusia 63 tahun dirawat di rumah sakit untuk terapi leukemia. Satu hari setelah
mengalami menggigil, demam, batuk, sakit kepala, dan mialgia. la mengatakan bahwa suaminya
mempunyai penyakit yang mirip beberapa hari sebelumnya. Terdapat kekhawatiran besar tentang
Wabah virus pernapasan pada stafbangsal kemoterapi dan pada pasien di bangsal. sebuah amin
sintetik yang menghambat virus influenza dengan memblok pelepasan selubung virus dipilih
untuk terapi profilaktik bagi stafdan para pasien. Obat tersebut adalah...
A. Acyclovir
B. Riboflavin
C. Ribavirin
D. Saquinavir
E. Amantadine
8. Manakah pernyataan berikut ini yang menyatakan manfaat vaksin virus mati melebihi dari vaksin
yang dilemahkan?
A. Vaksin virus mati menginduksi respons imun yang lebih luas daripada vaksin virus hidup yang
dilemahkan
B. Vaksin virus mati lebih menyerupai infeksi alami daripada vaksin virus hidup yang dilemahkan
C. Vaksin virus mati tidak mempunyai risiko bahwa virus vaksin dapat ditularkan ke kontak yang
peka
D. Vaksin virus mati manjur terhadap infeksi virus pernapasan karena ia menginduksi imunitas
mukosa yang baik
E. Vaksin virus mati tidak berbahaya dibandingkan dengan vaksin yang dilemahkan.
9. Jenis vaksin hepatitis B apa yang saat ini digunakan di Amerika Serikat?
A. Vaksin peptida sintetik
Virologi 242
B. Vaksin virus mati
C. Vaksin virus hidup yang dilemahkan
D. Vaksin subunit yang dihasilkan oleh DNA rekombinan
E. Vaksin polipeptida sintetik
10. Manakah kalimat berikut ini yang secara akurat menerangkan antibodi netralisasi virus?
A. Langsung berhadapan dengan penentu protein virus pada bagian luar partikel virus
B. Tampak pada pejamu lebih segera setelah infeksi virus dibandingkan dengan interferon
C. Langsung berhadapan dengan sekuens asam nukleat virus
D. Diinduksi hanya oleh virus penyebab penyakit
E. Diinduksi oleh berbagai virus penyebab penyakit
11. Banyak virus menggunakan saluran pernapasan sebagai jalur masuk untuk memulai infeksi.
Manakah kelompok virus berikut yang tidak ?
A. Adenovirus
B. Coronavirus
C. Hepadnavirus
D. Paramiksovirus
E. SARS
12. Manakah vaksin virus berlisensi berikut adalah vaksin subunit yang dibuat menggunakan teknologi
DNA rekombinan?
A. Campak, mumps, rubella
B. Varicella
C. Hepatitis A
D. Papiloma
E. Polio
13. Penyebab infeksi kulit virus apa yang manifestasi kliniknya bersifat makulopapular ?
A. Molluscum countagonium
B. Dengue
C. Variola
D. Varicella zoster
E. Herpes simplex
14. Penyebab infeksi virus apa pada bayi yang menderita ikterus pada waktu lahir atau setelah lahir ?
A. Hepatitis A virus
B. Hepatitis B virus
Virologi
243
C. Arbovirus
D. Rubella virus
E. Echovirus
15. Virus rabies menghasilkan inklusion bodies dalam sitoplasma sel yang bernama ?
A. Pachen bodies
B. Guarnierri bodies
C. Negri bodies
D. Lilie bodies
E. Elementary bodies
Cocokkanlah jawaban saudara dengan Kunci Jawaban Tes 2 yang terdapat di bagian akhir Bab 5
ini.
Virologi 244
2. C
3. D
4. A
5. B
6. E
7. B
8. E
9. C
10. E
11. A
12. D
13. E
14 .......................................................................................................................................................................... 142
15 .......................................................................................................................................................................... 142
Test Formatif 2 1 ................................................................................................................................................ 142
2 ............................................................................................................................................................................ 142
3 ............................................................................................................................................................................ 142
4. D
5. E
6. D
7. E
8. C
9. D
10. A
11. C
12. D
13. C
14. B
15. C
Virologi
245
Glosarium
Abrasi : cedera, termasuk luka dangkal yang terjadi akibat goresan antara kulit
dengan permukaan kasar.
Adekuat : memenuhi syarat; memadai; sama harkatnya.
Analog : bersangkutan dengan analogi; sama; serupa.
Anomali : 1 ketidaknormalan; penyimpangan dari normal; kelainan;2
penyimpangan atau kelainan, dipandang dari sudut konvensi
gramatikal atau semantis suatu bahasa; 3 penyimpangan dari
keseragaman sifat fisik, sering menjadi perhatian ekplorasi (misalnya
anomali waktu-lintas, anomali magnetik).
Anoreksia : keadaan kehilangan selera makan.
Arthopoda : filum yang paling besar dalam dunia hewan dan mencakup serangga,
laba-laba, udang, lipan, dan hewan sejenis lainnya. Artropoda biasa
ditemukan di laut, air tawar, darat, dan lingkungan udara, termasuk
berbagai bentuk simbiosis dan parasit.
Asimtomatik : Infeksi virus yang tidak menyebabkan gejala apapun (tidak menyadari
gejala apapun) pada pejamu/pasien.
Autoantibodi : antibodi patologik yang terbentuk akibat sistem imun tubuh tidak
dapat membedakan antara “self ” dan “nonself ”.
Bulbar : batang otak (otak tengah, pons, dan medula), penyakit yang ditandai
dengan kelemahan atau paralisis dari otot-otot yang dipersarafi oleh
motor nukleus dari batang otak bagian bawah (bulbar palsy),
Calicivirus adalah penyebab utama gastroenteritis.
Cost-Effective : biaya yang efektif; menghasilkan yang terbaik dengan nilai uang
tertentu.
Defek : kesalahan atau kekurangsempurnaan yang berarti pada produk.
Definitif : sudah pasti (bukan untuk sementara).
Dilatasi : pengembangan (pemuaian) suatu ruangan, rongga, dan sebagainya.
Ekologi : merupakan ilmu yang mempelajari interaksi antara organisme hidup
dan lingkungan mereka.
Fenomena : 1 hal-hal yang dapat disaksikan dengan pancaindra dan dapat
diterangkan serta dinilai secara ilmiah (seperti fenomena alam);
gejala: 2 sesuatu yang luar biasa; keajaiban: 3 fakta; kenyataan.
Ganglia : merupakan kumpulan badan sel saraf yang membentuk simpulsimpul
saraf dan di luar sistem saraf pusat.
Virologi 246
Gastroenteritis akut : bentuk penyakit pencernaan untuk jangka pendek dengan gejala yang
berkisar dari ringan; diare encer sampai penyakit demam berat yang
ditandai oleh hepatosit sel parenkimal utama pada hati yang
berperan dalam banyak lintasan metabolisme, dengan bobot sekitar
80% dari massa hati, dan inti sel baik tunggal maupun ganda.
Immunoglobulin : senyawa protein yang digunakan untuk melawan kuman penyakit
(virus, bakteri, racun bakteri dll.), ada di dalam darah, orang sering
menyebutnya antibodi/ Antibodi merupakan suatu fraksi plasma
Virologi
247
Mutan : Individu yang memperlihatkan perubahan sifat (fenotipe) akibat
mutasi.
Nefron : unit fungsional terkecil dari ginjal yang terdiri atas tubulus kontortus
proximal, tubulus kontortus distal dan duktus koligentes.
Neuronal : penyebaran melalui serabut saraf perifer.
Nodula : suatu masa jaringan padat yang tebal.
Pajanan : peristiwa yang menimbulkan risiko penularan.
Patogenesis penyakit : suatu bagian dari kejadian selama infeksi yang menyebabkan
manifestasi penyakit pada pejamu.
Patogenesis virus : proses yang terjadi ketika virus menginfeksi pejamu.
Penyakit virus : suatu abnormalitas berbahaya yang disebabkan oleh infeksi virus
pada organisme pejamu.
Perinhalasi : cara penularan infeksi melalui udara pernafasan.
Petekie : merupakan perdarahan di kulit atau membran mukosa yang
diameternya kurang dari 2 mm.
Port d’entree : tempat masuknya bibit penyakit.
Prion : pembawa penyakit menular yang hanya terdiri dari protein.
Rekurensi : gejala penyakit yang timbul kembali (kambuh).
Reseptor : komponen permukaan sel tempat bagian permukaan virus (kapsid
atau selubung) dapat berinteraksi secara spesifik dan mengawali
terjadinya infeksi.
Reservoar : tempat penampungan sementara.
Sawar : pertahanan.
Sekuens : sebuah seri huruf-huruf mewakilkan struktur primer dari molekul DNA
atau "strand" nyata atau hipotetis.
Sel glia : sel-sel yang mendukung tidak bersemangat dari sistem saraf.
Sitokin sitotoksik : senyawa yang dapat bersifat toksik untuk menghambat dan
menghentikan pertumbuhan sel.
Sporadik : suatu keadaan dimana suatu masalah kesehatan (umumnya
penyakit) yang ada di suatu wilayah tertentu frekuensinya
berubahubah menurut perubahan waktu.
Transmisi : penyebaran penyakit.
Transovarial : penyebaran virus melalui sel telur.
Tropisme : pergerakan dalam pertumbuhan sel (umumnya pada sel tumbuhan)
yang menyebabkan pergerakan organ tumbuhan utuh menuju atau
menjauhi sumber rangsangan (stimulus).
Ulserasi : proses atau fakta adanya luka terbuka yang mungkin sulit untuk
sembuh.
Vektor : organisme yang tidak menyebabkan penyakit tetapi
menyebarkannya dengan membawa patogen dari satu inang ke yang
lain.
Virologi 248
Vertebrata : semua hewan yang memiliki tulang belakang yang tersusun dari
vertebra. vertebrata dapat dimasukkan semua jenis ikan (kecuali
remang, belut jeung, "lintah laut", atau hagfish), amfibia, reptil,
burung, serta hewan menyusui.
Vesika urinaria : kandung kemih merupakan kantong musculomembranosa yang
berfungsi untuk menampung air kemih (urin).
Vesikel : sebuah ruang pada sel yang dikelilingi oleh membran sel.
Viremia : adanya virus di dalam darah.
Virion : partikel virus lengkap, yang utuh secara struktural dan menular.
Xenograft : (xenotransplantasi) transplantasi organ atau jaringan dari spesies
yang berbeda.
Daftar Pustaka
Ada, G. (2001). Vaccines and vaccination. (pp.345:1042). [PMID: 115869581].N Engl : J Med.
Alcami A, Koszinowski UH. (2000). Viral mechanisms of immune evasion. Trends Microbiology.
(pp.8:410). [PMID: 10989308].
Bonjardim CA. (2005). Interferons (IFNs) are key cytokines in both innate and adaptive antiviral
immune responses and viruses counteract IFN action. Microbes and Infection. (pp.
7:569). [PMID: 15792636].
Bonthius DJ, Perlman S. (2007). Congenital viral infections of the brain : Lessons learned from
lymphocytic choriomeningitis virus in the neonatal rat. Pathogens (pp.3:e149). [PMID:
180525271].
Brooks F Geo,Carrol C Karen, Butel S Janet, Morse A Stephen, Adelberg's, Melnick, Jawetz. (2014).
Mikrobiologi Kedokteran. Jakarta : EGC.
Centers for Disease Control and Prevention. (2006). Recommended childhood and adolescent
immunization schedule UnitedStates. Rep:54 (Nos. 51 & 52).MMWR Morb Mortal Wkly.
Virologi
249
Chiu W, Burnett RM, Garcea RL (editors). (1997). Structural Biology of Viruses. United Kingdom : Oxford
University Press.
Collier, Leslie & Oxford, John. (2006). Human Virology Second Edition. Hong Kong : Oxford University
Press.
Departemen Kesehatan RI Pusat Pendidikan Tenaga Kesehatan. (1996).Virologi Umum Untuk Akademi
Analis Kesehatan. Jakarta : Depkes.
Entjang, Indan. (2009).Mikrobiologi dan Parasitologi. Bandung : PT. Citra Aditya Bakti.
FKUI. (1994). Buku Ajar Mikrobiologi Kedokteran. Edisi Revisi. Jakarta : Binarupa Aksara.
G. Johnson, Arthur et al. (2011).Essential Mikrobiologi dan Imunologi. Jakarta : Binarupa Aksara.
Preventing emerging infectious diseases. (1998). A strategy for the 21st century. Overview of the
updated CDC plan. (Rep;47).MM WR Morb Mortal Wkly.
Randall RE, Goodbourn S. (2008). Interferons and viruses: An interplay between induction,
signalling, antiviral responses and virus countermeasures. (pp.89:1). (PMID:
180897271).J Gen Virol.
Virgin S. Knipe DM et al (editors). (2007). Pathogenesis of viral infection. In: Fields Virology, 5th ed.
Lippincott Williams & Wilkins.
Virologi 250
Bab 6 DIAGNOSIS LABORATORIUM VIRUS
DAN PENJAMINAN MUTU
Lis Kurniati, S.Pd., M.Kes.
Pendahuluan
D baik antara dokter dan tenaga laboratorium medik serta bergantung kepada iagnosis dan
pengendalian mutu di bidang virologi memerlukan komunikasi yang
kualitas spesimen dan informasi yang diberikan kepada tenaga laborium
medik.Pilihan metode untuk konfirmasi laboratorium pada infeksi virus bergantung pada
tahapan penyakit. Metode diagnostik berdasarkan teknik amplifikasi asam nukleat saat ini
menjadi jenis pemeriksaan yang paling terkini, karena memerlukan sampel yang relatif sedikit
dengan hasil yang mampu dipertanggungjawabkan. Akan teteapi, keberhasilan dan
pertanggung jawaban dari diagnostik dan pemeriksaan virus tentu perlu ditunjang suatu
pengendalian mutu. Sehingga pada bagian ini juga akan disajikan bagaimana upaya
pengendalian mutu khususnya dibidang virologi sehingga proses dan pelaksanaan diagnosis
penyakit yang disebabkan virus bisa dilakukan dengan tepat, akurat dan bisa
dipertanggungjawabkan.
Virologi
251
Padabab ini kita akan mempelajari mengenai diagnosis laboratorium virus dan
pengendalian mutu dibidang virus. Setelah mempelajari Bab 6 ini, Saudara diaharapkan dapat:
1. Menjelaskan tentang diagnosis pemeriksaan laboratorium virus dari berbagai spesiemen dan
metoda-metodanya;
2. Menjelaskan cara diagnosis pemeriksaan laboratorium virus secara mikroskopis
3. Menjelaskan cara diagnosis pemeriksaan laboratorium virus dengan teknik isolasi
4. Menjelaskan tata cara penjaminan mutu dibidang virologi sehingga yakin dengan pemeriksaan
yang akurat.
Mempelajari bab ini,membantu Saudara untuk dapat memahami lebih dalam tentang
diagnosis dan pemeriksaan laboratorium virus serta pengendalian mutu di laboratorium yang
menangani sampel virus sehingga yakin bahwa pemeriksaan laboratorium tentang virus
tersebut memiliki hasil yang akurat dan mampu dipertanggungjawabkan.
Agar memudahkan Anda mempelajari bab ini, maka materi yang akan dibahas terbagi menjadi
2topik, yaitu:
1. Diagnosis laboratorium, yang membahas tentang pemeriksaan laboratorium virus meliputi secara
mikroskopis, isolasi serta tes serologi.
2. Penjaminan Mutuyang membahas tentang pengambilan, pengemasan serta pengiriman sampel,
dan juga tentang kendali mutu pemeriksaan laboratorium.
Selanjutnya agar Saudara berhasil dalam mempelajari materi yang tersaji dalam Bab 6 ini,
perhatikan beberapa saran sebagai berikut :
a. Pelajari setiap topik materi secara bertahap
b. Usahakan mengerjakan setiap latihan dengan tertib dan sungguh-sungguh.
c. Kerjakan tes yang disediakan dan diskusikan bagian-bagian yang sulit Saudara pahami dengan
teman sejawat atau tutor, atau melalui pencarian di internet.
Virologi 252
Topik 1
Diagnosis Pemeriksaan Laboratorium Virus
tenaga laboratorium medik serta bergantung kepada kualitas spesimen dan informasi
emeriksaan laboratorium virus memerlukan komunikasi yang baik antara dokter dan
yang diberikan kepada laboratorium.Pilihan metode untuk konfirmasi laboratorium
pada infeksi virus bergantung pada tahapan penyakit. Uji antibodi membutuhkan
sampel yang diambil pada interval yang tepat, dan diagnosis seringkali tidak dapat dipastikan
hingga masa konvalens. Isolasi virus atau deteksi antigen perlu dikerjakan ketika timbul
epidemi baru, seperti pada kasus influenza ketika uji serologi tidak bermanfaat, dan ketika
penyakit klinis yang sama dapat disebabkan oleh banyak agen yang berbeda. Sebagai contoh,
meningitis aseptik (nonbakterial) dapat disebabkan oleh berbagai macam virus, serupa
dengan hal ini sindrom penyakit pernafasan dapat disebabkan oleh berbagai macam virus
serta mikoplasma dan agen lain (WHO, 2003)
Metode diagnostik berdasarkan teknik amplifikasi asam nukleat sebentar lagi akan
menggantikan beberapa metode pemeriksaan, tetapi tidak semua teknik kultur virus. Akan
tetapi, kebutuhan akan pengumpulan sampel dan interpretasi hasil uji yang baik tidak akan
berubah. Lebih lanjut, akan ada saatnya ketika agen penyebab infeksi perlu diperoleh.
Isolasi virus mungkin tidak dapat menetapkan penyebab suatu penyakit. Ada banyak
faktor lain yang perlu diperhatikan. Beberapa virus bertahan hidup dalam penjamu manusia
untuk jangka waktu yang lama, sehingga isolasi herpesvirus, poliovirus, echovirus, atau
koksavirus dari seorang pasien dengan penyakit yang tidak terdiagnosis tidak membuktikan
bahwa virus tersebut merupakan penyebab penyakit. Pola klinis dan epidemiologi yang
konsisten harus ditetapkan sebelum satu agen khusus dapat ditentukan sebagai penyebab
atas munculnya gambaran klinis tertentu.
Sebagian besar virus paling baik diisolasi selama beberapa hari pertama penyakit.
Spesimen yang digunakandalam pemeriksaan isolasi virus ada dalam tabel yang akan disajikan
pada bab ini. Hubungan antara isolasi virus dan keberadaan antibodi membantu menegakkan
diagnosis, tetapi upaya ini jarang dilakukan.
Spesimen dapat disimpan dalam kulkas hinbgga 24 jam sebelum kultur virus dikerjakan,
kecuali virus respiratory syncytial dan beberapa virus lai. Selain itu, materi harus dibekukan
(sebaiknya pada suhu -60°C atau lebih dingin) jika kemungkinan akan terlambat dibawa
kelaboratorium. Spesimen yang tidak boleh dibekukan antara lain darah utuh yang diambil
untuk menentukan antibodi, serum harus dipisahkan dari darah utuh sebelum dibekukan, dan
jaringan dari kultur organ atau sel yang harus disimpan dalam suhu 4°C dan segera dibawa
kelaboratorium.(WHO, 2003)
Virologi
253
Virus pada penyakit saluran pernafasan dijumpai dalam sekresi hidung atau faring. Virus
dapat ditemukan dalam cairan tenggorok dan apusan dari dasar ruam vesikuler. Pada infeksi
mata, virus dapat dideteksi dalam apusan atau kerokan konjungtiva dan didalam air mata.
Ensefalitis biasanya didiagnosis lebih cepat melalui perangkat serologi atau metode amplifikasi
asam nukleat. Arbovirus dan herpesvirus biasanya tidak ditemukan dalam cairan spinal, tetapi
jaringan otak dari penderita ensefalitis viral dapat menunjukan virus penyebabnya. Pada
penyakit yang berkaitan dengan enterovirus seperti penyakit sistem saraf pusat, perikarditis
dan miokarditisakut virus dapat diisolasi dari feses, apusan tenggorok, atau cairan
serebrospinal. Akan tetetapi seperti telah dinyatakan seblumnya metode amplifikasi asam
nukleat merupakan metode yang dianjurkan untuk mendeteksi enterovirus didalam cairan
serebrospinal. Uji antibodi fluoresens langsung sama sensitifnya, seperti kultur dalam
mendeteksi infeksi saluran pernafasan oleh virus respiratory syncytial, virus influenza A dan B,
virus parainfluenza, dan adenovirus. Berbagai uji ini menghasilkan jawaban dalam beberapa
jam setelah pengumpulan spesimen, dibandingkan dengan waktu beberapa hari yang
diperlukan untuk kultur virus, dan karena alasan inilah uji ini menjadi uji pilihan untuk
menegakan etiologi dan diagnoosis infeksi saluran pernafasan akibat virus.
Cara mendiagnosis penyakit virus adalah menentukan jenis penyakit virus pada manusia
dan hewan. Pada prinsipnya diagnosis penyakit virus sama dengan diagnosis penyakit bakteri,
hanya cara pelaksanaanya lebih rumit serta biayanya lebih mahal. Diagnosis penyakit virus
dapat ditegakkan dengan cara :
1. Polio
Penyakit Polio pada anak-anak, gejalanya yang khas adalah demam tinggi, setelah demam turun
timbul kelumpuhan.
2. Variola
Demam tinggi 39oC-40oC selama 7-10 hari, demam kontinyu sehingga sulit dibedakan dari
typhoid dan morbilli. Kemudian timbul gejala kulit diseluruh tubuh yang berada dalam satu
stadium (single crop).
3. Morbilli
Demam tinggi 39oC-40oC selama kira-kira 1 minggu, bersamaan dengan menurunnya
demam akan timbul skin rash berupa eksantema diseluruh tubuh disertai konjuntivitis
(radang mata).
4. Mumps (parotitis epidemika)
Terdapat pembengkakan kelenjar parotis unilateral atau bilateral, disertai rasa nyeri
terutama bila menelan makanan yang asam. Dengan gejala-gejala yang khas, dapat
didiagnosis penyakit virus, tetapi adakalanya (80%) tidak terdapat gambaran klinik yang
khas. Contoh :
a. Polio abortif, demam dengan diare atau demam dengan faringitis, tanpa paralisis.
b. Variola sine eruptione, tidak terjadi kelainan kulit.
Virologi 254
c. Morbilli, bisa sine eruption, tapi ternyata ada komplikasi encephalitis.
d. Mumps, kadang-kadang tanpa pembesaran kelenjar parotis tetapi ada komplikasi
meningoensephalitis.
B. DIAGNOSIS LABORATORIUM
Diagnosis laboratorium pada umumnya dapat dilakukan dengan 3 cara yaitu pemeriksaan
langsung terhadap materi klinis secara mikroskopik dan pewarnaan, Isolasi virus dan tes
serologi. Walaupun hasil laboratorium positif tetapi diagnosis penyakit tetap ditegakkan
berdasarkan kombinasi dari gejala klinik, gejala hematologik dan hasil laboratorium virus.
S
umber: Jawetz, Melnick, & Adelberg’s Medical Microbiology Twenty-Sixth Edition
Virologi
255
Dengan pewarnaan khusus (tergantung jenis virus) dicari elementary bodies dan
inclusion bodies. Keuntungannya: cepat Kerugiannya :
1) Belum semua elementary bodies (e.b) dan inclusion bodies ditemukan 2)
Belum semua pewarnaan diketahui.
3) Bila hasil negatif, belum tentu diganosa negatif.
4) Memerlukan latihan khusus.
5) Sulit membedakan virus yang mempunyai inclusion bodies (i.b) yang sama.
Contoh: Variola mempunyai i.b yang sama dengan Vaccinia, tetapi
epidemiologinya sangat berbeda. Contoh-contoh pewarnaan :
a. Variola
Bahan pemeriksaan berupa kerokan macula atau papula, isi papula, isi vesikula atau
keropeng. Buat sediaan apus dan warnai dengan Gispen. Akan tampak e.b yang
disebut Paschen bodies di dalam sitoplasma sel yang berbentuk bundar, ukuran 1/3
dari kokus, berwarna coklat kehitaman dengan dasar kuning muda. Bila diwarnai
secara paschen eb. berwarna merah cerah dengan dasar merah muda.
b. Rabies
Bahan pemeriksaan dari otak (kera, anjing). Buat sediaan dep dan warnai secara
Seller’s : tampak i.b (Inclusion bodies) di dalam sel syaraf. Negri bodies ini bisa satu
atau lebih dalam sitoplasma sel, berwarna merah cerah dan bergranuler biru
lembayung dengan dasar sitoplasma yang biru.
c. Molluscum contagiosum
Bahan pemeriksaan berupa isi nodula pada kelainan kulit. Buat preparat apus dan
warnai dengan lugol, tampak di dalam sitoplasma sel epitel i.b (Molluscum bodies)
yang sangat besar dan berwarna coklat kekuning kuningan. Ternyata dalam i.b ini
terdiri dari e.b yang diikat satu dengan yang lain oleh glikogen yang kemudian beraksi
dengan lugol.
d. Trakhoma
Bahan pemeriksaan berupa kerokan folikel konjungtiva, dibuat sediaan apus dan
diwarnai dengan giemsa. Tampak i.b dari Halber-Steadter-Prowazek di dalam
sitoplasma sel epitel dengan warna merah cerah yang jumlahnya kadang-kadang lebih
dari satu, dengan dasar sitoplasma yang biru.
Virologi 256
2. Isolasi
Virologi
257
2007 John Wiley & Sons, Ltd ISBNs: 978-0-470-02386-0 (HB); 978-0-470-02387-7 Persiapan
Inokula
Materi cairan bebas bakteri, seperti cairan serebrospinal, whole blood, plasma atau
lapisan dadih (buffy coat) sel darah putihdapat diinokulasikan ke dalam kultur sel secara
langsung atau setelah diencerkan dengan larutan fosfatdapar (pH 7,6). Inokulasi sel berembrio
atau hewan untuk mengisolasi virus umumnya hanya dikerjakan di laboratorium khusus.
Jaringan dibilas dalam media atau air steril, dicincang menjadi potongan kecil
menggunakan gunting, dan digiling menjadi pasta homogenik. Ditambahkan diluent dalam
jumlah cukup agar konsentrasinya menjadi 10-20% (berat/volume). Suspensi ini dapat di
sentrifugasi dengan kecepatan rendah (tidak > 2000 rpm) selama 10 menit untuk
mengendapkan debris seluler yang tidak larut. Cairan supernatan dapat diinokulasi, jika
terdapat bakteri bakteri segera dieliminasi dengan cara seperti dibawah ini.
Jaringan dapat juga diberi tripsin, dan suspensi sel yang dihasilkan dapat diinokulasikan
ke satu-lapisan sel kultur jaringan yang ada, atau ditanam dengan suspensi sel lain yang
diketahui bebas virus.Jika materi yang akan diuji mengandung bakteri (bilasan tenggorok,
feses, urine, jaringan yang terinfeksi atau serangga), bakteri harus dibuat tidak aktif atau
diangkat sebelum materi diinokulasi.
Agen bakterisidal, antibiotik umumnya digunakan bersama dengan sentrifugasi diferensial (lihat
dibawah).
Metode mekanis,
a. Penyaringan, sebaiknya digunakan penyaring membran tipe-milipori yang terbuat dari
selulose asetat atau materi lembaran serupa.
b. Sentrifugasi diferensial, ini merupakan metode yang baik untuk mengangkat banyak
bakteri dari sediaan yang terkontaminasi virus berukuran kecil dalam jumlah banyak.
Bakteri diendapkan dengan kecepatan rendah yang tidak akan mengendapkan virus,
dan sentrifugasi berkecepatan tinggi kemudian akan mengendapkan virus. Endapan
yang mengandung virus kemudian diresuspensi dalam jumlah kecil.
Virologi 258
Virologi
259
Virologi 260
Sumber: Jawetz, Melnick, & Adelberg’s Medical Microbiology Twenty-Sixth Edition
Kultur didalam tabung uji dipersiapkan dengan menambahkan sel yang telah disuspensi
dalam 1-2 mL cairan nutrien yang mengandung larutan garam seimbang dan berbagai macam
faktor pertumbuhan (biasanya serum, glukosa, asam aminodan vitamin).
Virologi
261
Sel fibroblastik dan epitel yang melekat dan tumbuh didinding tabung uji ditempat inilah selsel
tersebut dapat diperiksa dengan bantuan mikroskop daya rendah.
Pada banyak virus pertumbuhan agen penyebab penyakit disertai dengan degenerasi
sel-sel tersebut. (Gambar 6.1) beberapa virus menghasilkan efek sitopatik yang khas (CPE)
dalam kultur sel sehingga perkiraan diagnosis dapat dipikirkan dengan cepat jika sindrom
klinisnya diketahu. Contoh virus respiratory synticyal secara khas menhasilkan sel raksasa
multinuklear, sementara adenovirus menghasilkan kelompok sel yang bulat dan besar
menyerupai anggur. Beberapa virus (contoh virus rubella) tidak menghasilkan perubahan
sitopatik langsung tetapi dapat dideteksi melalui interferensinya terhadap CPE dari virus
kedua sebagai pembanding (interferensi virus). Virus influenza dan beberapa paramiksovirus
dapat terdeteksi dalam waktu 24-48 jam jika ditambahkan eritrosit kedalam kultur yang
terinfeksi. Pematangan virus di membran sel menghasilkan hemaglutinin yang mampu
membuat eritrosit menyerap permukaan sel (hemadsorpsi). Identitas isolat virus ditentukan
melalui antiserum spesifik untuk tiap tipe yang menghambat pertumbuhan virus atau bereaksi
dengan antigen virus.
Beberapa virus dapat ditumbuhkan dalam kultur tetapi proses ini sangat lama dan sulit.
Pemeriksaan lain diluar kultur dikerjakan untuk menegakan diagnosis tersebut. Lihat dibawah.
Gambar 6.4 A. Monolayer sel ginjal kera normal tanpa pewarna dalam kultur (120X), B: kultur sel
ginjal kera yang tidak terwarnai menunjukan tahapan awal efek sitopatik yang khas untuk infeksi
enterovirus (120X). Sekitar 25% sel di dalam kultur menunjukan efek sitopatik yang mengarah ke
multiplikasi viru efek sitopatik (+1). C: kultur sel ginjal kera yang tidak diwarnai menunjukan efek
Virologi 262
sitopatik enterovorius lebih lanjut (efek sitopatik 3+ hingga 4+) (120X). Hampir 100 % sel terinfeksi,
dan kebanyakan selubung sel telah lepas dari dinding tabung kultur.
Sumber Jawetz, Melnick, & Adelberg’s Medical Microbiology Twenty-Sixth Edition
Virologi
263
dinkubasi selama 18-24 jam, satu vial diwarnai dengan reagen antibodi imunofluorens yang
telah "dikumpulkan yang mampu mendeteksi semua virus saluran pernapasan yang umum
dijumpai.lika pewarnaannya positif, sel di kaca penutup vialkedua kemudian dikerok,
diinokulasikan ke sediaan berceruh delapan, lalu diwarnai dengan reagen antibodi monoklonal
tersendiri yang mendeteksi virus tertentu. Isolat tidak di- peroleh melalui teknik shell vial ini.
Jika diperlukan isolat untuk uji sensitivitas terhadap obat antivirus, harus digunakan teknik
kultur sel klasik.
Deteksi Antigen
Deteksi antigen virus banyak dipergunakan dalam virologi diagnostik. Tersedia kit di
pasaran untuk mendeteksi banyak virus, termasuk herpes simpleks I dan II, influenza A dan B,
virus respiratory syncytial, adenovirus, virus parainfluenza rotavirus, dan sitomegalovirus,
Dipergunakan pula berbagai macam pemeriksaan: EIA, antibodi fluoresens langsung antibodi
fluoresens tidak langsung, aglutinasi lateks, dan lain lain. Keuntungan berbagai prosedur ini
adalah mampu mendeteksi virus yang tidak bertumbuh dalam kultur sel (contoh, rotavirus,
virus hepatitis A) atau yang sangat lambat bertumbuh (contoh, sitomegalovirus). Umumnya,
pemeriksaan deteksi antigen virus tidak sesensitif kultur virus dan metode amplifikasi asam
nukleat.
Gambar 6.6. Deteksi DNA spesifik /RNA Spesifik menggunakan DNA yang di label
Sumber: Jawetz, Melnick, & Adelberg’s Medical Microbiology Twenty-Sixth Edition
Virologi 264
Hibridisasi Asam Nukleat
Hibridisasi asam nukleat untuk mendeteksi virus sangat sensitif dan spesifik. Spesimen
ditotolkan di atas membrarn nitroselulosa, kemudian asam nukleat virus yang ada di dalam
sampel akan terikat; asam nukleat kemudian didenaturasi dengan alkali in situ, dihibridisasi
dengan fragmen asam nukleat virus yang dilabel, dan produk hibridisasi pun dideteksi. Untuk
rotavirus yang mengandung RNA untai ganda, metode hibridisasi titik ini jauh lebih sensitif
daripada EIA. RNA di dalam sampel feses yang didenaturasi dengan panas dan mengandung
rotavirus diimobilisasi menurut tahapan di atas, dan hibridisasi in situ pun dijalankan
denganajur untai-tunggal berlabel yang diperoleh melalui transkripsi rotavirus in vitro.
Gambar 6.7 pemisahan protein dan berat molekul. lane 2 mengandung 4 protein kapsid dari
picorna virus SDS-PAGE. Lane 1 dan 3 mengandung protein standar yang berat molekulnya
diketahui
Sumber : Jawetz, Melnick, & Adelberg’s Medical Microbiology Twenty-Sixth Edition
Mengukur Respons Imun terhadap Infeksi Virus
Virologi
265
Gambar 6.8 Kuantifikasi DNA virus hepatitis B (HBV) DNA dengan PCR real-time. Bila ada 108
salinan DNA HBVDalam sampel, fluoresensi mulai meningkat pada jumlah siklus awal.
Kenaikan dimulai secara progresif nantisiklus dengan penurunan jumlah salinan DNA HBV.
Data dari Ho et al..
Sumber:Virology : Principles and applications / John Carter and Venetia
Biasanya, infeksi virus mencetuskan respons imun terhadap satu antigen virus atau
lebih.Baik respons imun selular maupun humoral biasanya timbul sehingga pengukuran
terhadap salah satunya dapat digunakan untuk menegakkan diagnosis infeksi virus.Imunitas
selular dapat dinilai melalui hipersensitivitas dermal, transformasi limfosit, dan uji
sitotoksisitas.Respons imun humoral memiliki makna diagnostik yang besar. Antibodi kelas
IgM akan muncul di awal dan dikuti oleh antibodi IgG. Antibodi IgM akan hilang dalam
beberapa minggu, sementara antibodi IgG akan terus bertahan selama bertahun-tahun.
Diagnosis infeksi virus ditegakkan secara serologis melalui adanya peningkatan titer antibodi
terhadap virus atau antibodi antivirus kelas IgM.Metode yang digunakan mencakup uji
netralisasi (Nt), uji CF uji inhibisi hemaglutinasi (HI), dan uji IF, hemaglutinasi pasif serta
imunodifusi.
Pengukuran antibodi melalui berbagai macam metode tidak harus memberikan hasil
yang serupa.Antibodi yang dideteksi melalui uji CF muncul selama berlangsungnya infeksi
enterovirus dan dalam periode konvalesens, tetapi antibodi ini tidak bertahan lama. Antibodi
yang dideteksi melalui uji Nt juga tampak selama infeksi berlangsung dan bertahan selama
bertahun-tahun. Penilaian antibodi melalui beberapa metode pada seseorang atau
sekelompok orang menyajikan informasi diagnostik serta informasi mengenai ciri
epidemiologik penyakit.
Uji serologi untuk mendiagnosis virus paling berguna ketika virus memiliki periode
inkubasi yang panjang sebelum manifestasi klinis muncul.Sebagian virus yang termasuk dalam
kelompok ini, meliputi virus Epstein-Barr, virus hepatitis, dan HIV. Biasanya, uji antibodi
terhadap virus ini merupakan langkah pertama dalam menegakkan diagnosis dan kemudian
dapat dikuti dengan amplifikasi asam nukleat yang digunakan untuk menilai kadar virus dalam
sirkulasi sebagai perkiraan tingkat infeksi dan/atau respons terhadap terapi antiviral tertentu.
Manfaat uji serologi yang lain adalah untuk menilai kerentanan seseorang atau pajanan virus
sebelumnya serta potensi terjadinya reaktivasi dalam keadaan imunosupresi atau
transplantasi organ. Pemeriksaan Mikroskop Elektron Imun
Virologi 266
Gambar 6.9 Persiapan spesimen mikroskop cryo-elektron. Diubah, dengan izin dari penulis
dan American Society for Microbiology, dari Baker, Olson dan Fuller (1999) Mikrobiologi dan
Biologi Molekuler
Sumber: Virology : Principles and applications / John Carter and Venetia
Virus yang tidak terdeteksi melalui teknik konvensional dapat diamati melalui
pemeriksaan mikroskop elektron imun (IEM).Kompleks antigen-antibodi atau agregat yang
terbentuk di antara partikel virus dalam suspensi disebabkan adanya antibodi di dalam
antiserum yang ditambahkan, dan ini terdeteksi lebih cepat serta lebih pasti daripada partikel
virus itu sendiri. IEM digunakan untuk mendeteksi virus yang menyebabkan enteritis dan
diare; virus ini umumnya tidak dapat dibiakkan dengan kultur virus rutin. Rotavirusdideteksi
melalui EIA.
HIV
Human immunodefciency virus-I dijumpai di seluruh dunia.sementara HIV-2, terutama
dijumpai di Afrika Barat dan beberapa area geografik lain Infeksi HIV menjadi kasus khusus
dalam virologidiagnostik. Diagnosis laboratorium harus di tetapkan dengan pasti, dengan
sedikit atau tanpa kemungkinan adanya hasil positif palsu. Setelah diagnosisditegakkan, uji
laboratorium digunakan untuk mengikuti perkembangan infeksi dan membantu memantau
efektivitas terapi. Bank darah menggunakan uji yang sangat sensitif untuk mendeteksi HIV-1
dalam darah donor sehinggamencegah infeksi HIV-1-terkait, transfusi.
Pemahaman tentang uji diagnostik untuk HIV dan ujiuntuk memantau infeksi
memerlukan pemahaman akan struktur dan replikasi HIV serta respons imun terhadap infeksi.
Ringkasan mengenai topik ini disajikan di sini.
Virologi
267
HIV-I dan HIV-2 merupakan retrovirus. Virus ini memiliki selubung dan untai tunggal RNA
sens positif. Melalui penggunaan enzim virus reverse transcriptase, RNA ditranskripsi ke dalam
DNA yang kemudian diintegrasi kedalam genom sel pejamu. Protein virus yang paling
seringdiperiksa langsung adalah p24. Respons antibodi terhadapberbagai macam produk gen
HIV, antara lain: produk env glikoprotein (gp) 160 (gp160, gp120, gp4l): gag p24. pl7, p9,P7
dan pol, p66, p51, p32, pll.
Dua sampai enam minggu setelah infeksi. 50% pasien atau lebih menderita sindrom yang
menyerupai mononukleosis infeksiosa. Saat ini, terdapat kadar tinggi HIV-1 di dalam darah
yang dapat dideteksi melalui kultur atau PCR reverse terhadap protein HIV-1 dapat terdeteksi
2-8 minggu setelah infeksi. Terdapat respons IgM terhadap produk gen gag yang perlahan
akan bergeser menjadi respons IgG. Umumnya, respons IgG terhadap p24 dan gp120 terjadi
di awal penyakit, dikuti oleh respons terhadap gp41 dan protein lain. Viremia dan kadar p24
dalam darah turun seiring dengan respons antibodi dan dapat tidak terdeteksi selama periode
asimtomatik infeksi, sementara kadar antibodi p24 tetap tinggi. Dalam tahap lanjut penyakit,
kadar antibodi p24 menurun, sementara antigen p24 meningkat. Segerasetelah infeksi, ketika
terjadi viremia HIV-1 dalam kadartinggi, hitung sel T CD4 akan menurun. Di awal
periodeasimtomatik, angka ini kembali normal dan menurun secarabertahap seiring
berjalannya waktu dan lebih cepat dalamtahap lanjut AIDSPemeriksaan yang digunakan untuk
menegakkan diagnosis infeksi HIV-1 tersedia di pasaran; pemeriksaan ini sudah begitu maju
dan telah distandardisasi. Beberapa set pemeriksaan tersedia untuk jenis uji yang sama.
Pemeriksaan ini dibahas dalam paparan umum berikut.
Virologi 268
Western blot
Uji Western blot digunakan sebagai alat pengukur antibodiHIV-1 spesifik untuk
memastikan hasil ELISA yang positif. Dalam uji Western blot, protein HIV-1 dipisahkan
melaluimetode elektroforesis pada strip nitroselulosa. Strip inikemudian diinkubasi dengan
serum pasien. Antibodi HIV-spesifik kemudian dideteksi menggunakan antihuman
IgGterkaitenzim. Reaksi kolometrik yang positif membentukpita pada kertas nitroselulosa
yang sesuai dengan posisiantigen HIV-1 spesifik. Kriteria untuk suatu uji yang positif adalah
adanya salah satu dari kedua pita sesuai dengan p24gp41, dan gp120/160. Tidak adanya pita
menunjukkan hasilnegatif, sementara adanya pita yang tidak memenuhi kriteriahasil positif
menunjukkan hasil meragukan. Hasil uji positif-palsu dan negatif palsu relatif jarang dijumpai.
Pasien denganhasil ELISA positif dan Western blot meragukan perlu menjalani pemeriksaan
dan evaluasi klinis ulang. Seorangbayi yang lahir dari ibu penderita HIV-1 dapat saja memiliki
hasil Western blot positif, tetapi ini perlahan akan menjadi negatif jika sang bayi tidak betul-
betul terinfeksi HIV-1.
Pemeriksaan untuk Mendeteksi Langsung Infeksi HIV
1. Deteksi antigen p24
ELISA digunakan untuk mendeteksi antigen p24.Antibodi anti-p24 diimobilisasi pada
permukaan padat dan diinkubasi dengan serum pasien.Jumlah p24 dideteksi
menggunakananti -HIV-1 IgG terkait-enzim dan reaksi kolorimetrik. Antigen p24 dideteksi
selama tahap viremik akut dan tahap lanjut infeksi AIDS. Sejumlah kecil penderita infeksi
HIV-asimtomatik ternyata menunjukkan hasil positif antigen p24.
2. Deteksi RNA HIV-1
Tersedia berbagai macam pemeriksaan di pasaran untuk mendeteksi dan menghitung
jumlah RNA HIV1, Ini meliputi pemeriksaan PCR, NASBA, dan bDNA untuk mendeteksi dan
melakukan kuantitatif HIV-1. Pemeriksaan ini dapat digunakan untuk mendeteksi infeksi
HIV-sebelum masa infekssi ketika uji antibodi menunjukkan hasi negatif. Uji ini juga
dipergunakan untuk memantau efektivitas terapi anti HIV-1.
3. Deteksi DNA provirus HIV-1
DNA diekstraksi dari sel mononuklear yang diperoleh dari darah perifer yang diberi
antikoagulan. Primer oligonukleotida yang spesifik terhadap DNA provirus HIV-1
terintegrasi digunakan dalam pemeriksaan PCR. Jenis pemeriksaan ini dapat digunakan
pada bayi yang positif menunjukkan antibodi dan terlahir dari ibu penderita HIV untuk
menentukan apakah sang bayi juga terinfeksi. Uji ini dianjurkan bagi bayi yang berusia
kurang dari 18 bulan.
4. Kultur HIV-1
Kultur jaringan merupakan uji pertama yang dikembangkan untuk menegakkan diagnosis infeksi
HIV-1.Pemeriksaan ini dahulu digunakan untuk menetapkan HIV-I sebagai penyebab AIDS. Sel
mononuklear darah perifer dari pasien yang kemungkinan terinfeksi dikultur bersama dengan sel
mono-nuklear darah perifer dari orang yang tidak terinfeksi yang telah dirangsang dengan
fitohemaglutinin dan interleukin-2 Kulturkemudian diamati untuk mencariadanya pembentukan
sel raksasa multinuklear, aktivitas reversetranscriptase HIV-1 atau produksi antigen p24 HIV-1.
Virologi
269
Kultur sel kuantitatif dan kultur plasma kuantitatif juga dapat turut dikerjakan. Kultur
membutuhkan banyak waktu dan biaya sehingga tidak efektif secara biaya untuk penggunaan
rutin.
Virologi 270
Keuntungan pemeriksaan isolasi adalah dapat langsung dinyatakan virus penyebabpenyakitnya.
Adapun beberapa kelemahan diagnosis laboratorium secara isolasi ini, yaitu :
• Memakan waktu yang lama.
Misalnya pada pemeriksaan virus Polio.Bahan pemeriksaan berupa tinja, ditanam pada
biakan jaringan ginjal kera (bjgk), eramkan selama 2 minggu tanpa diperlihatkan ada
tidaknya cpe, lalu dipasase pada biakan jaringan yang baru. Setelah 2 minggu, pasase lagi
pada bjgk, periksa adanya cpe. Bila cpe negatif (-), berarti Polio negatif (-), tetapi bila cpe
positif (+), harus dilakukan tipering Polio, yaitu dilakukan penanaman kembali pada bjgk
untuk titrasi, biarkan selama 2 minggu, lalu tentukan tipenya. Hasil isolasi (+) atau (-)
sangat berarti bagi epidemiologi untuk dilaporkan pada departemen kesehatan bahwa
pada tempat tertentu ada penjangkitan penyakit tersebut.
• Positif atau negatifnya hasil isolasi tergantung dari :
a. Jenis bahan pemeriksaan untuk isolasi.
Misalnya untuk isolasi penyakit Influenza.
Bahan pemeriksaan, bisa berupa hapus atau air cucian tenggorok. Jangan mengirim
air liur atau air kumur mulut, sebab hasilnya akan negative. Cara mengambil
bahanpemeriksaan tersebut, yaitu dengan memberikan larutan NaCl physiologis pada
penderita kemudian tenggorokannya dicuci dengan kepala menengadah ke atas. Pada
bayi dan anak-anak bahan pemeriksaan diambil dari dinding belakang tenggorokan.
b. Saat mengambil bahan pemeriksaan harus tepat.
Gambar 6.11 Derivasi garis sel terus menerus sel manusia dan hewan. Sebagian besar jenis sel
diambil dari Tubuh tidak tumbuh dengan baik dalam biakan. Jika sel dari a kultur primer dapat
disubkultur mereka tumbuh sebagai garis sel. Mereka bisa disubliskan hanya sejumlah terbatas kali
kecuali mereka diabadikan, dalam hal ini mereka dapat disubkultur tanpa batas waktu sebagai
saluran seluler kontinyu. Sel kanker sudah diabadikan, dan garis sel terus menerus. Sumber:
Virology : Principles and applications / John Carter and Venetia
Misalnya :
1) Untuk virus Influenza : bahan pemeriksaan berupa hapus tenggorok, diambil 2 hari sebelum
sampai 2 hari setelah gejala timbul.
Virologi
271
2) Untuk Cacar : bahan pemeriksaan berupa darah, diambil pada saat demam dan sebelum
gejala kulit timbul, sebab gejala kulit telah timbul virus sudah berada di dalam kulit.
3) Untuk virus Dengue : bahan pemeriksaan berupa darah, diambil sebelum hari ketiga dari
demam supaya virusnya masih terdapat di dalam darah. Jika sudah hari keempat atau hari
kelima, virus sudah tidak ada di dalam darah.
Mahal
Misalnya untuk isolasi virus Dengue. Suntikan pada tikus bayi umur 1-3 hari. Diamati
selama 2 minggu, ambil otaknya lalu pasase pada tikus bayi biarkan selama 2 minggu.
Setelah 2 minggu, ambil otaknya lalu pasase lagi biarkan 3 minggu baru dinyatakan positif
atau negatif.
Gambar 6.12 Labu kultur sel, piring dan piring. Foto produk kultur sel TPP milik MIDSCI.
Sumber: Virology : principles and applications / John Carter and Venetia
Virologi 272
Gambar 6.13 Kultur sel bekerja. Tindakan pencegahan untuk menghindari kontaminasi
termasuk bekerja dalam lemari dan pakaian sterilsarung tangan dan topeng Foto milik
Novartis Vaccines.
Sumber: Virology :Principles and applications / John Carter and Venetia
Virologi
273
Gambar 6.15 Plak dibentuk oleh bakteriofaga di dalam bakteri. Cawan petri kontrol di
sebelah kiri diinokulasi hanya dengan bakteri host. Cawan petri di sebelah kanan diinokulasi
dengan bakteri faga dan bakteri. Foto milik PhilipO'Grady.
Sumber: Virology :Principles and applications / John Carter and Venetia
Virologi 274
Gambar 6.16 pemurnian artial virion oleh sentrifugasi diferensial. Penyiapan mentah virus yang
mengandung host puing-puing dikenai sentrifugasi berkecepatan rendah / singkat
misalnya 10 000 g / 20 menit) diikuti dengan kecepatan tinggi / lama sentrifugasi (misalnya
100 000 g / 2 jam). Siklus ini bisa diulang untuk mendapatkan tingkat kemurnian yang lebih
tinggi. Itu Pelet akhir yang mengandung sebagian virus yang dimurnikan disuspensikan
kembali dalam volume kecil cairan.
Sumber: Virology : principles and applications / John Carter and Venetia
Gambar 6.17 Pemurnian virion dengan sentrifugasi gradien kepadatan. Persiapan virus yang
sebagian dimurnikan lebih lanjut dimurnikan dalam gradien kerapatan. Tingkat sentrifugasi
zonal melibatkan layering preparasi di atas pre-formed gradien. Sentrifugasi kesetimbangan
sering bisa dilakukan dimulai dengan suspensi virus tidak murni dalam larutan dari bahan
gradien; gradien terbentuk selama sentrifugasi.
Sumber: Virology :Principles and applications / John Carter and Venetia
Virologi
275
3. Tes Serologik
Gambar 6.18 Prinsip tes untuk mendeteksi antigen virus. Spesimen tersebut diobati dengan
antibodi anti-virus. Dalam Uji tidak langsung antibodi kedua berlabel mendeteksi antibodi anti-
virus yang terikat pada antigen.
Sumber:Virology : Principles and applications / John Carter and Venetia
Tabel 2.1 Molekul yang digunakan untuk memberi label antibodi (dan asam nukleat) dan
teknik yang digunakan untuk mendeteksinya
Label Teknik Deteksi
Enzim Enzim-linked Imunosorben assay
Fluoresensi Mikroskop fluoresensi
Fluorometri
Argon Electron Mikroskop
Radio aktif Auto-radiografi
Sumber:Virology : principles and applications / John Carter and Venetia
Pemeriksaan serologi mempunyai arti diagnostik lebih tinggi dibandingkan isolasi virus.
Serodiagnostik ini berpedoman bahwa diagnosis positif bila selama sakit terjadi kenaikkan
paling sedikit 4 kali.
Ada 2 jenis serum yang diamati yaitu serum akut (SI) dan serum konvalesen (SII) Keuntungan
tes serologi :
a) Waktu yang digunakan lebih pendek dari pada isolasi.
b) Lebih murah, karena kadang-kadang tidak memerlukan hewan percobaan.
Virologi 276
c) Bila isolasi negatif, tetapi bila ada kenaikan titer 4 kali atua lebih, maka diagnosis positif.
Pada keadaan tertentu tes serologis tidak mungkin untuk dilakukan, maka isolasi mutlak
dipergunakan untuk mendiagnosis penyakit-penyakit virus tersebut, hal ini terutama pada
keadaan-keadaan sebagai berikut :
a. Bila ada wabah : Bila ada kelumpuhan pada anak-anak, harus dicari apakah penyebabnya
virus polio, ECHO dll.Demam dan diare pada anak usia kurang dari 3 tahun, bisa
disebabkan oleh Amoeba, Shigella, Virus morbilli, Polio atau ECHO.
b. Bila ada antigenik overlapping artinya sebagian antigen ada yang sama (saling
menutupi).Misalnya yellow fever, dengue 1, 2, 3, 4, japanese B Encephalitis.
c. Untuk memperkuat diagnose mikroskopik. Misalnya, keropeng secara mikroskopik
memperlihatkan Paschen bodies. Untuk memastikan apakah Variola atau Vaccinia, maka
dilakukan isolasi pada CAM telur berembio.
d. Bila ada kumpulan gejala yang bisa disebabkan oleh lebih dari satu jenis virus, mutlak
harus dilakukan isolasi. Contohnya Meningitis serosa, bisa disebabkan oleh virus Polio,
ECHO, Coxsackie, Herpes simplex, Mumps dan Limpogranuloma venerum.Demam dengan
diare bisa disebabkan oleh virus Polio, ECHO, Morbilli dan Coxsackie.
e. Bila ada infeksi campuran. Misalnya infeksi virus Polio dan virus Ensephalitis pada orang
yang sama dengan meningoensephalomyelitis. Isolasi dengan bahan pemeriksaan dari
tinja, hapus tenggorok, liquor dan jaringan otak.
Latihan
Untuk dapat memperdalam pemahaman Anda mengenai materi di atas, kerjakanlah Latihan
berikut!
Untuk membantu Saudara dalam mengerjakan soal latihan tersebut silakan pelajari kembali materi
tentang
1) Diagnosis pemeriksaan laboratorium virus dari berbagai spesiemen dan metodametodanya;
2) Diagnosis pemeriksaan laboratorium virus secara mikroskopis
3) Diagnosis pemeriksaan laboratorium virus dengan teknik isolasi
4) Diagnosis pemeriksaan laboratorium metoda imuno-serologi
Virologi
277
Ringkasan
Pilihan metode untuk konfirmasi laboratorium pada infeksi virus bergantung pada
tahapan penyakit. Metode diagnostik berdasarkan teknik amplifikasi asam nukleat saat ini
menjadi jenis pemeriksaan yang paling terkini, karena memerlukan sampel yang relatif sedikit
dengan hasil yang mampu dipertanggungjawabkan. Akan teteapi, keberhasilan dan
pertanggung jawaban dari diagnostik dan pemeriksaan virus tentu perlu ditunjang suatu
pengendalian mutu. Sehingga pada bagian ini juga akan disajikan bagaimana upaya
pengendalian mutu khususnya dibidang virologi sehingga proses dan pelaksanaan diagnosis
penyakit yang disebabkan virus bisa dilakukan dengan tepat, akurat dan bisa
dipertanggungjawabkan.
Untuk diagnosis pemeriksaan laboratorium virus ada beberapa cara yang bisa kita lakukan:
1. Pemeriksaan berdasarkan gejala klinis
2. Pemeriksaan secara laboratorium, Meliputi pewarnaan preparat, isolasi serta tes serologi
Masing-masing metode memiliki kelebihan dan kekurangan, akan tetapi dengan
perkembangan zaman pastilah akan selalu melalui suatu perkembangan teknologu yang mana
perubahan teknologi tersebut diharapkan akan menunjang ketepatan dan kecepatan dalam
membantu menegakan diagnosis dibidang infeksi yang disebabkan virus.
Tes 1
Pilihlah salah satu jawaban yang paling benar!
2. Seorang laki-laki berusia 42 tahun diketahui menderita HIV AIDS. Mana dari metode
berikut yang paling tepat untuk memantau perkembangan terapi antiretroviral sangat
aktif (highly active antivetroviral therapy, HAART) yang sedang ia jalani?
A. Penentuan beban virus
B. Pemantauan kadar antibodi anti HIV-1
C. Menggunakan Western blot untuk menilai kadar anti-P24
D. Kultur darah ulangan untuk HIV-1 untuk menentukan apakah kultur telah menjadi negatif
E. Mengidentifikasi genotipe isolat HIV-1 untuk menentukan sensitivitas anti retroviral
Virologi 278
3. Seorang anak berusia 2 tahun menderita diare. la dicurigai menderita infeksi rotavirus. Mana
dari pernyataan berikut yang paling bermanfaat dalam menegakkan diagnosis infeksi
rotavirus?
A. Pewarnaan antibodi fluoresens terhadap spesimen feses
B. Pemenksaan mikroskop cahaya untuk mendeteksi sel mukosa dengan efek sitopatik
C. Deteksi antigen virus di dalam feses melalui penetapan kadar imunosorben tautenzinm
D. Kultur virus
E. Kultur dan identifikasi agen
4. Mana dari pernyataan berikut yang tepat untuk menentukan diagnosis etiologik infeksi?
A. Hibridisasi DNA-DNA atau DNA RNA untuk men deteksi gen spesifik patogen pada
spesimen pasien
B. Pembuktian adanya antibodi atau respons imun berperantara-sel yang bermakna
terhadap agen penyebab infeksi
C. Identifikasi morfologik agen dengan pewarnaan terhadap spesimen atau potongan
jaringan melalui pemeriksaan mikroskop cahaya atau elektron
D. Deteksi antigen dari agen penyebab melalui pemeriksaan imunologik E. Kultur dan
identifikasi agen
Virologi
279
7. Seorang pasien transplantasi ginjal berusia 5 tahun yang seang mendapat terapi siklosporin
menderita gangguan limfoproliferatif. Mana dari virus berikut yang paling mungkin berperan
menyebabkan penyakit ini?
A. Sitomegalovirus
B. irus herpes simpleks
C. Virus Coxsackie
D. Virus hepatitis D
E. Virus Epstein Barr
8. Berikut merupakan indikasi uji serologis yang tepat untuk memeriksa virus kecuali
A. Sebagai indikasi kerentanan seseorang terhadapinfeksi virus tertentu
B. Untuk menegakkan diagnosis infeksi virus yangmemiliki periode inkubasi yang panjang
C. Untuk tujuan skrining
D. Untuk memastikan infeksi virus
E. Untuk memantau respons terapi
9. Di bulan Agustus, seorang anak laki-laki berusia 2 tahun datang dengan keluhan demam,
tanda-tanda nyeri kepala, penurunan status mental, dan kekakuan leher Pada pemeriksaan
fisik, ia dipastikan menderita demamserta kaku leher ringan, dan meskipun pasien rewel
dansedikit somnolen, ia masih dapat dibangunkan dan minum cairan. Hasil pemeriksaan
cairan serebrospinal menunjukkan adanya protein 60 μg/dL, glukosa 40 μg/dLdan total
leukosit sebanyak 200, kebanyakan sel mononuklear. Penyebab infeksi yang paling
memungkinkan pada anak ini adalah
A. Bakteri
B. Virus
C. Protozoa
D. Jamur
E. Mikobakteria
10. Pada kasus di atas, pemeriksaan yang paling bergunauntuk menegakkan secara cepat
diagnosis definitif agen penyebabnya adalah A. Uji antigen Streptococcus pneumoniae
B. Uji aglutinasi lateks untuk antigen Kriptokokus
C. Ui amplifikasi asam nukleat untuk mendeteksiRNA virus.
D. Kultur pada media selektif yang digabung denganPewarnaan Giemsa terhadap cairan
cerebrospinal
E. Cukup dilihat gejala klinis saja
11. Berikut merupakan kerugian dari pemeriksaan virus menggunakan mikroskop biasa, kecuali?
A. Semua e.b dan i.b. ditemukan
Virologi 280
B. Belum semua pewarnaan diketahui
C. Memerlukan Latihan Khusus
D. Sulit membedakan virus yang memiliki i.b.
E. Bila hasil negatif belum tentu diagnosis negatif
12. Virus biasanya menghasilkan sel sitopatik yang khas. Contoh sel yang dihasilkan oleh virus
Respiratory synticyal adalah....
A. Sel yang uninuklear
B. Sel raksasa multinuklear
C. Sel tiny multinuklear
D. Sel yang tiny uninukklear
E. Sel yang raksasa uninuklear
13. Uji serologi untuk mendiagnosis virus paling berguna ketika virus?
A. Memiliki periode inkubasi yang panjang sebelum manifestasi klinis muncul
B. Memiliki periode inkubasi yang panjang sesudah manifestasi klinis muncul
C. Memiliki periode inkubasi yang pendek sebelum manifestasi klinis muncul
D. Memiliki periode inkubasi yang pendek sesudah manifestasi klinis muncul E. Memiliki
periode inkubasi yang panjang saat manifestasi klinis muncul
14. Berikut merupakan beberapa pemeriksaan untuk mendeteksi langsung infeksi HIV, kecuali?
A. Deteksi antigen p24
B. Deteksi RNA HIV-1
C. Deteksi DNA provirus HIV-1
D. Kultur HIV-1
E. Kultur HIV-2
15. Berikut merumakan beberapa kelemahan diagnosis laboratorium secara isolasi yaitu:
A. Memakan waktu yang lama
B. Memakan waktu yang relatif tidak tentu
C. Positif atau negatifnya sangat mutlak
D. Relatif tidak mahal
E. Berlaku untuk semua golongan virus
Virologi
281
Topik 2 Penjaminan Mutu
diperhatikan. Pemantapan mutu (quality assurance) laboratorium adalah semua ada
Virologi 282
C. Verifikasi
Verifikasi adalah tindakan yang dilakukan untuk mencegah terjadinya kesalahan dalam
melakukan kegiatan laboratorium mulai dari tahap pra-analitik, analitik sampai dengan pasca-
analitik. Setiap tahapan tersebut harus dipastikan selalu berpedoman pada mutu sesuai
dengan bakuan mutu yang ditetapkan.
D. Validasi hasil
Validasi hasil pemeriksaan merupakan upaya untuk memantapkan kualitas hasil
pemeriksaan yang telah diperoleh melalui pemeriksaan ulang oleh laboratorium rujukan.
Validasi dapat mencegah keragu-raguan atas hasil laboratorium yang dikeluarkan.
E. Audit
Audit adalah proses menilai atau memeriksa kembali secara kritis berbagai kegiatan
yang dilaksanakan di laboratorium. Audit ada dua macam, yaitu audit internal dan audit
eksternal. Auditinternal dilakukan oleh tenaga laboratorium yang sudah senior. Penilaian yang
dilakukan haruslah dapat mengukur berbagai indikator penampilan laboratorium, misalnya
kecepatan pelayanan, ketelitian laporan hasil pemeriksaan laboratorium dan mengidentifikasi
titik lemah dalam kegiatan laboratorium yang menyebabkan kesalahan sering terjadi.
Audit eksternal bertujuan untuk memperoleh masukan dari pihak lain di luar
laboratorium atau pemakai jasa laboratorium terhadap pelayanan dan mutu laboratorium.
Pertemuan antara kepala-kepala laboratorium untuk membahas dan membandingkan
berbagai metode, prosedur kerja, biaya dan lain-lain merupakan salah satu bentuk dari audit
eksternal.
Virologi
283
spesimen yang tepat, dan bahwa hasil yang benar dan interpretasi yang tepat. dikirim ke orang
yang tepat pada waktu yang tepat "
Banyak variabel dapat mempengaruhi kualitas hasil antara lain latar belakang pendidikan dan
pelatihan personil laboratorium, kondisi spesimen, kontrol yang digunakan dalam pengujian
berjalan, penafsiran hasilnya, transkripsi hasil, pelaporan hasil
Komponen yang harus terus dipantau dan mewakili aspek fundamental dari program QA yang baik
1. Record Keeping
Laboratorium yang efisien akan dapat memantau catatan spesimen sejak sampel sampai
pada saat hasilnya dilepaskan. Buku catatan merupakan langkah penting dalam
pencatatan spesimen laboratorium dan harus dirahasiakan. Setiap spesimen yang
ditentukan tidak memadai untuk pengujian atau yang tidak mengandung informasi
penting misalnya untuk tes HIV, tidak boleh diuji dan catatan harus dimasukkan ke dalam
buku catatan. Lembar kerja harus menyertai setiap uji coba di laboratorium. Lembar kerja
berfungsi sebagai panduan saat menempatkan sampel dalam pelarian. Catatan QC penting
dalam memvalidasi hasil laboratorium. Manual prosedur operasi standar harus disimpan
di laboratorium setiap saat dan harus sering ditinjau dan diperbarui.
2. Staf Laboratorium Pemantauan
Manajer laboratorium mungkin ingin secara berkala memantau kinerja staf laboratorium
mereka. Sampel dengan hasil yang diketahui dapat dikirim ulang secara diam-diam
bersamaan dengan beban kerja rutin.
Virologi 284
3. Kewaspadaan di Laboratorium
Kewaspadaan mengacu pada penelitian dan selalu terdiri dari mengamati bahwa identifikasi
pada spesimen sesuai dengan slip permintaan, mencatat kondisi spesimen saat mereka
diterima, meninjau grafik QC setiap hari, mengamati rekan kerja, berhatihatilah agar
laboratorium tetap menjadi tempat yang aman untuk bekerja, memeriksa ulang dokumen
dan lembar kerja sebelum melaporkan hasilnya.
4. Verifikasi Benar Positif dan Negatif
Hasil positif HIV adalah masalah serius dan setiap laboratorium harus benar-benar yakin
bahwa setiap hasil spesimen positif benar. Setelah sampel ditemukan positif dengan tes
skrining, sebuah aliquot dari tabung spesimen awal harus diuji ulang, Sebisa mungkin,
spesimen kedua harus dikumpulkan dari individu dan beristirahat untuk menghilangkan
kemungkinan penanganan, pelabelan, atau kesalahan klerikal.
5. Pengujian Paralel spesimen Resubmitted
Pengujian paralel spesimen yang dikirim ulang penting pada pasien yang spesimennya telah
menghasilkan hasil yang tidak pasti.
6. Mengkaji langkah-langkah transkripsi
Kesalahan transkripsional atau klerikal mencakup kesalahan yang dilakukan selama
pengiriman informasi dari pembacaan tes ke lembar kerja, dan dari lembar kerja ke
komputer atau formulir laporan. Jenis kesalahan ini mungkin menyebabkan sebagian
besar kesalahan di laboratorium. Mekanisme yang memungkinkan termasuk memiliki
teknolog kedua untuk memeriksa hasil akhir dan supervisor untuk memeriksa hasilnya
sebelum melepaskannya.
7. Pelaporan Hasil
Dalam kasus tes HIV, penanganan hasilnya harus dikontrol sehingga kerahasiaan semua
orang yang diuji terlindungi. Keputusan kebijakan penanganan hasil tes HIV harus
ditetapkan dan diberlakukan secara seragam di laboratorium. Bila hasil yang tidak pasti
dilaporkan, perhatian harus diberikan untuk memastikan bahwa klinisi memahami
pentingnya hasil tersebut dan pentingnya spesimen tindak lanjut.
8. Interaksi dengan Dokter
Hubungan antara petugas laboratorium dan dokter harus menjadi salah satu kepercayaan dan rasa
saling percaya.
9. Penyimpanan spesimen untuk uji lanjutan
Setelah spesimen diuji, sebaiknya disimpan pada Suhu -20 o C pada botol yang sesuai. Sedimen
yang teratur atau bank spesimen lainnya harus tersedia
10. Efisiensi Laboratorium
Tujuannya adalah untuk memberikan waktu penyelesaian untuk sampel yang diajukan.
Item tertentu harus dievaluasi secara berkala untuk meningkatkan efisiensi di
laboratorium.apakah tes terbaik yang tersedia dan ekonomis sedang digunakan?, apakah
tes baru terus dievaluasi?, Apakah anggaran laboratorium dibagi dengan benar dan
dimanfaatkan?
Virologi
285
11. Total Quality Management (TQM)
TQM mengacu pada pendekatan organisasi yang komprehensif yang difokuskan untuk
terus meningkatkan kualitas dan efisiensi dimana laboratorium beroperasi. QA adalah
program yang didefinisikan yang berfokus pada memaksimalkan deteksi kesalahan
laboratorium, sementara TQM bertujuan untuk membantu proses ini dengan
memaksimalkan efisiensi. TQM tidak hanya memperhatikan pemantauan program QC /
QA, namun juga harus mencakup pertimbangan teknis atau administratif lain yang secara tidak
langsung dapat mempengaruhi kualitas dan efisiensi operasi laboratorium. Ini termasuk evaluasi
staf laboratorium dan pendidikan berkelanjutan.
Virologi 286
Gambar 6. 19: Contoh Chart kontrol pemeriksaan HAV dengan metode Elisa
Sumber : UK Standards for Microbiology Investigations Quality Assurance in the Diagnostic
Virology and Serology Laboratory
Aturan Peringatan
1. Nilai kontrol melebihi mean dengan 2 sd (p <.005)
2. Dua nilai berturut-turut melebihi nilai target pada sisi mean yang sama dengan 2 sd. Hal ini
dapat mengindikasikan adanya kesalahan sistematis.
3. Empat nilai kontrol berturut-turut melebihi batas yang sama. Ini sekali lagi menunjukkan
kemungkinan adanya kesalahan sistematis dan mungkin mengindikasikan perlunya
melakukan perawatan instrumen atau kalibrasi peralatan.
Aturan wajib
1. Nilai kontrol melebihi nilai target sebesar 3.sd (p <0,01: 99,7% dari nilai harus berada dalam 3
sd) Hal ini mengindikasikan bahwa uji lari tidak terkendali.
2. Dimana sampel IQC diuji dalam rangkap dua, perbedaan SD antara duplikat tidak boleh melebihi
4 SD
3. 10 nilai berturut-turut berada pada sisi yang sama dengan mean atau nilai target. Ini mendeteksi
kesalahan sistematis. Hal ini mungkin terjadi saat batch tes baru atau diperkenalkan atau diubah
dalam kalibrasi peralatan.
Virologi
287
Gambar 6. 20 Contoh hasil pemeriksaan ELISA IgG menggunakan diamana ada 1 data dengan
nilai 3 SD
Sumber : UK Standards for Microbiology Investigations Quality Assurance in the Diagnostic
Virology and Serology Laboratory
Gambar 6. 21 Contoh hasil pemeriksaan ELISA IgG menggunakan diamana ada 1 data dengan
nilai 10 X
Sumber : UK Standards for Microbiology Investigations Quality Assurance in the Diagnostic
Virology and Serology Laboratory
Virologi 288
Penilaian Kualitas
Penilaian kualitas adalah sarana untuk mengetahui kualitas hasil. Biasanya evaluasi
eksternal terhadap kinerja laboratorium yang bergantung pada menggabungkan panel
kemampuan dari serum yang ditandai dengan baik ke dalam rutinitas pengujian. Penilaian
kualitas eksternal (EQA) sekarang diakui sebagai komponen penting dari jaminan kualitas dan
satu-satunya cara untuk memberi manajer laboratorium sarana mandiri untuk memastikan
bahwa pengendalian kualitas rutinnya memadai dan efektif. Skema Penilaian Kualitas
Eksternal Nasional (NEQAS) dikelola oleh PHLS
Berikut ini didistribusikan di bawah skema NEQAS adalah serologi Hepatitis B, serologi
HIV, serologi Rubella (IgM dan IgG), serologi virus secara umum, isolasi virus, mikroskop
elektron
Penting bagi laboratorium yang berpartisipasi untuk merawat spesimen NEQAS
dengan cara yang sama seperti spesimen rutin normal. Rubella IgM dan HIV saat ini
kekurangan sediaan referensi nasional, berlawanan dengan rubella IgG dan HBsAg. Terkadang,
spesimen yang lebih sulit dari biasanya didistribusikan sebagai materi "pendidikan", seperti
yang mengandung HBsAg atau anti HIV yang sangat rendah. Skor biasanya tidak dialokasikan
untuk jenis spesimen ini, namun peserta mungkin merasa berguna untuk membandingkan
hasil mereka dengan jenis rekan mereka.
Sistem penilaian untuk NEQAS adalah sebagai berikut
2 : laporan yang benar sepenuhnya
1 : sebagian laporan yang benar misalnya identifikasi sebagian virus atau hasil serologis samar
0 : hasil yang keliru yang tidak akan memiliki konsekuensi klinis yang serius misalnya IgG rubella negatif
palsu
-1 : hasil yang keliru yang akan memiliki konsekuensi klinis yang serius, misalnya HBsAg negatif palsu
atau anti-HIV
Sangat diharapkan laboratorium itu sendiri memiliki program penilaian kualitas
internal, dimana sampel klinis anonim diserahkan ke laboratorium. Skema penilaian kualitas
internal dapat digunakan untuk memantau kualitas pekerjaan lebih sering dan akurat daripada
skema EQA, karena sampel EQA biasanya jarang diterima dan biasanya diperlakukan berbeda
dari spesimen rutin. Pengalaman di laboratorium yang memiliki skema penilaian kualitas
internal pada umumnya adalah skema internal jauh lebih baik dalam mengidentifikasi masalah
kualitas di laboratorium daripada skema eksternal.
Virologi
289
1. Secara fisik terpisah dari laboratorium mikrobiologi dan tidak berbagi hasil udara biasa atau
peralatan seperti kerudung dan inkubator.
2. Lingkungan harus dikontrol sehingga suhu sekitar 22-26 o C dan kelembaban relatif 30-50%.
3. Fasilitas harus berada di bawah tekanan negatif terhadap area laboratorium lainnya.
4. Secara internal, laboratorium dapat dibagi menjadi daerah tekanan udara positif dan negatif;
yang positif untuk kultur jaringan dan persiapan media, negatif untuk isolasi virus atau
serologi karena mereka menangani patogen yang layak.
5. Semua permukaan harus terdiri dari bahan yang bisa didekontaminasi dengan mudah.
6. Langkah mikrobiologi standar yang baik harus diperhatikan seperti dekontaminasi harian
pada semua permukaan kerja, pakaian laboratorium yang tepat, penggunaan perangkat
pipet yang aman, dan untuk meminimalkan pembentukan aerosol.
7. Kerudung keamanan biologi harus tersedia untuk kultur jaringan dan isolasi virus. Kamar
berkamar sebaiknya tidak memiliki ducting udara umum dan knalpot dari kerudung dimana
patogen ditangani secara eksternal dibuang.
8. Fasilitas harus dipelihara dengan baik; limbah biohazard dibuang dengan benar, lantai
didesinfeksi secara berkala, keseimbangan tekanan udara diperiksa.
Spesimen transportasi
Spesimen untuk isolasi virus sering diadakan dalam jangka waktu lama sebelum mencapai
laboratorium. Virus yang dilipat seperti RSV dan CMV sangat rentan terhadap suhu kamar dan
siklus pencairan beku sedangkan virus yang tidak tertutup seperti enterovirus mentoleransi
kondisi ini dengan baik. Sebagai aturan umum, spesimen virus yang ditahan dalam waktu
singkat harus didinginkan, sementara untuk waktu yang lebih lama dapat dibekukan pada
suhu -20 atau -70 o C.
Media Transportasi: komposisi dan jenis media pengangkutan virus dapat mempengaruhi
tingkat isolasi virus. Secara umum, media harus menjadi larutan isotonik seimbang pada pH
fisiologis. Ini harus mengandung zat yang akan menstabilkan virus seperti gelatin, serum betis
janin atau albumin serum sapi, dan antibiotik melawan bakteri dan jamur. Usap harus terbuat
dari bahan yang tidak beracun terhadap virus, seperti dakron atau rayon.
Virologi 290
Smear : smear menjadi semakin populer karena banyaknya teknik pewarnaan. BTA harus
mengandung sejumlah sel yang masuk akal, berukuran cukup masuk akal dan tidak terlalu
terkontaminasi oleh darah atau nanah, karena obat ini bisa menyebabkan pewarnaan
nonspesifik.
Spesimen untuk Serologi : Spesimen dengan hemolitik, lipaemik, bakteri yang terkontaminasi,
atau bocor harus ditolak. Antisera harus dilarutkan dengan panas tergantung pada tes yang
akan dilakukan. Jika spesimen ditolak, bangsal harus diberitahu, sebaiknya dengan laporan
lisan diikuti dengan yang tertulis. Kondisi yang meluas mungkin menjamin penerimaan
spesimen di bawah standar.
Virologi
291
Reagen dan Kit
Reagen dan kit harus dipesan dari produsen atau dealer ternama dengan sistem
transportasi yang andal. Setelah menerima, reagen harus diperiksa untuk kerusakan atau
kontaminasi yang jelas. Kuantitas, sumber, jumlah lot dan tanggal penerimaan harus
dimasukkan dalam buku catatan dan reagen disimpan sesuai dengan spesifikasi penyimpanan
pabrik pembuatnya. Ketika banyak pereaksi baru dibuka, tanggal harus dicatat di wadah.
Perhatian harus dilakukan dalam hal kit karena berbagai komponen kit mungkin memiliki
kondisi penyimpanan dan tanggal kadaluwarsa yang berbeda.
Instrumen
Instrumen laboratorium harus menjalani perawatan preventif rutin dan diperiksa dan
dikalibrasi secara teratur. Beberapa pemeriksaan ini dapat dilakukan oleh staf laboratorium
dan masuk ke buku catatan.Berikut adalah beberapa rekomendasi untuk pemeliharaan rutin
dan pemeriksaan kinerja instrumen.
1. Inkubator - suhu harian, CO 2 dan cek kelembaban. Dekontaminasi mingguan interior
2. Lemari pengaman - cek tekanan udara harian dan pembersihan lampu UV. Permukaan kerja
harus didekontaminasi setelah digunakan. Pemeriksaan tahunan untuk kecepatan udara dan
integritas filter dan dekontaminasi paraldehid sebagaimana berlaku.
3. Mikroskop - pembersihan tujuan dan tahap harian, log penggunaan lampu dan perombakan
tahunan
4. Lemari es dan freezer - cek suhu harian; cek tahunan tingkat kompresor dan refrigeran
5. Mandi air - cek suhu harian, dekontaminasi mingguan
6. Sentrifugal - dekontaminasi mingguan, kalibrasi kecepatan kuartalan dengan tachometer,
inspeksi tahunan motor dan sistem penggerak
7. Autoklaf - pemeriksaan suhu harian dan pengujian spora strip
8. pH meter - buffer buffer referensi tunggal sebelum digunakan, cek titik ganda setiap bulan
9. Perangkat pipetting - cek volume gravimetrik setiap bulan; perombakan tahunan
Sistem Inggris
Di Inggris, akreditasi departemen patologi dilakukan oleh perusahaan pembuat nirlaba
independen yang dikenal sebagai BPA (Akreditasi Patologi Klinis) yang dimiliki bersama oleh
beberapa badan termasuk Royal College of Pathologists. Ada badan serupa untuk akreditasi
Virologi 292
laboratorium di negara lain seperti yang dioperasikan oleh Colloege of American Pathologists
di AS dan NATA di Australia. Dulu, standar badan akreditasi ini bervariasi.
Akreditasi adalah audit eksternal terhadap organisasi pemohon dan program
penjaminan mutu. BPA mendefinisikan standar untuk organisasi dan kinerja patologi klinis.
Departemen pemohon menilai diri mereka terhadap standar tersebut dan mengisi formulir
untuk menunjukkan kepatuhan terhadap atau, pembebasan dari mereka dan
mengirimkannya, beserta rincian fasilitas dan repertoar mereka kepada CPA.Pada tahap ini,
akreditasi sementara diberikan jika semua tampaknya sesuai. Beberapa waktu kemudian,
departemen tersebut melakukan pemeriksaan di tempat. Jika semua nampaknya baik,
akreditasi penuh diberikan pada tahap ini. Jika inspektur mengidentifikasi masalah, akreditasi
penuh ditahan sampai masalah terpecahkan dengan kepuasan CPA. Jika itu tidak tercapai
dalam waktu yang wajar, penyimpangan akreditasi sementara. Penolakan akreditasi dapat
diajukan banding oleh departemen pemohon, keputusan dewan CPA akan mengikat.
Sepenuhnya dan sementara departemen terakreditasi akan dimasukkan ke dalam register
CPA. Mereka yang memiliki akreditasi penuh akan diinvestasikan kembali secara berkala,
mungkin setiap 4 tahun sekali. Petugas pemeriksa BPA biasanya akan mengunjungi setiap
departemen secara berpasangan, masing-masing tim terdiri dari konsultan atau ilmuwan klinis
dan MLSO senior. Ini berarti bahwa untuk rumah sakit NHS "rata-rata" dengan empat
departemen patologi, delapan inspektur akan berkunjung selama satu hari penuh. Selain
pemeriksaan laboratorium di tempat, pengguna layanan dan manajer rumah sakit akan
diwawancarai.
Virologi
293
spesimen. Harus ada pencahayaan, pemanas, ventilasi, drainase gas dan air yang memadai.
Lingkungan kerja yang aman harus tersedia dimana petugas keamanan bertanggung jawab.
Ada fasilitas penyimpanan, pengambilan dan komunikasi data yang sesuai. Ada peralatan
ilmiah yang sesuai dengan benar yang harus dijaga dengan baik.
4. Kebijakan dan Protokol
Harus ada panduan pengguna untuk membantu dokter memberikan sampel yang tepat,
untuk menggunakan layanan ini dengan efek terbaik dan bantuan serta saran apa yang
tersedia. Formulir laboratorium harus mencakup identitas pasien dan informasi pendukung
yang unik. Laporan harus akurat, komprehensif dan relevan secara klinis dan harus mencakup
identitas, waktu dan tanggal pengumpulan, pengujian dan pelaporan pasien yang memadai.
Catatan tertulis dari semua bahan reagen, kalibrasi dan kontrol kualitas. Harus ada protokol
tertulis untuk kinerja setiap pengujian termasuk persiapan peralatan yang tepat, reagen
sampel, perhitungan hasil dan interpretasi kinerja pengendalian kualitas internal. Ada
protokol tertulis untuk pelaporan normal dan laporan hasil lisan. Juga harus ada protokol
untuk perawatan rutin serta dekontaminasi semua item peralatan dan ruang kerja. Sebuah
kebijakan yang menjelaskan layanan jam kerja harus dilembagakan. Di rumah sakit, konsultan
mikrobiologi yang ditunjuk bertanggung jawab atas pengendalian infeksi institusional.
5. Pengembangan Staf dan Pendidikan
Ada program pelatihan tertulis untuk semua anggota staf, fasilitas, sumber daya dan
fasilitas yang tepat untuk menghadiri seminar, pertemuan dan konferensi eksternal, dan
program pendidikan berkelanjutan.Selain itu harus ada skema penilaian staf yang mapan.
6. Evaluasi
Departemen harus berpartisipasi dalam semua program penilaian kualitas eksternal yang
sesuai yang harus dipublikasikan secara luas di departemen tersebut. Audit klinis terhadap
layanan harus terus dilakukan dan staf senior harus secara teratur berpartisipasi dalam
kegiatan audit spesialisasi klinis lainnya.
Virologi 294
5. Komersial - saat laboratorium meningkatkan kontak mereka dengan organisasi komersial, misalnya
dengan pekerjaan yang menghasilkan pendapatan, pelanggan mungkin ingin mencari informasi
tentang kualitas layanan yang ingin mereka beli. Audit merupakan bagian penting dari program
penjaminan mutu laboratorium. Program penjaminan mutu mencakup semua aspek layanan yang
diberikan. Ini mungkin termasuk kebijakan tentang induksi dan pelatihan staf baru, pengembangan
staf, manual laboratorium, kebijakan keselamatan, perawatan peralatan, dll. Audit adalah alat
untuk menilai apakah seseorang mencapai tujuan yang telah ditetapkan. Ada lima pertanyaan
kunci dalam proses auditapa yang harus kita lakukan?, apa yang kita lakukan?, apakah kita
melakukan apa yang seharusnya kita lakukan?, bisakah kita memperbaiki apa yang kita lakukan?,
sudahkah kita membaik?
Audit keuangan dan pekerjaan komisi audit dilakukan oleh auditor dari luar laboratorium. Ahli
virologi medis mungkin memiliki peran penting dalam audit medis dan laboratorium.
Audit Medis
Semua dokter diwajibkan untuk mengikuti audit medis yang didefinisikan sebagai analisis kritis
sistematis terhadap kualitas perawatan medis. Ahli virologi medis dapat dilibatkan sebagai
bagian dari tim multidisiplin yang dapat mencakup topik seperti pengendalian infeksi,
penggunaan laboratorium virologi yang tepat, penggunaan antiviral.
Audit Laboratorium
Audit laboratorium terutama berkaitan dengan aspek pekerjaan departemen sehari-hari dan
merupakan sarana untuk memberi umpan balik kepada pengguna laboratorium dan stafnya.
Audit laboratorium biasanya diselenggarakan secara internal meskipun skema Akreditasi
Paten NEQAS dan Clinical Pathology dapat melengkapi program audit internal. Virologi
diagnostik mungkin ingin memeriksa area berikut melalui audit.
1. Meminta formulir; apakah mereka mudah digunakan? Apakah semua rincian yang
relevan disediakan oleh pengguna. Misalnya, tanggal kontak atau onset akan sangat
berguna dalam kasus permintaan serologi rubella
2. Spesimen; apakah spesimen yang tepat diterima pada waktu yang tepat? Apakah
investigasi yang tepat dipilih oleh staf laboratorium? Adalah penting bahwa spesimen
untuk isolasi virus harus sampai di laboratorium sesegera mungkin setelah
pengumpulan atau kemungkinan isolasi akan berkurang. Ini tidak begitu penting untuk
tes serologis. Staf laboratorium akan memiliki lebih banyak kelonggaran dalam
memilih tes di departemen serologi umum daripada departemen lain.
3. Waktu putar untuk setiap permintaan. Upaya harus dilakukan untuk memantau waktu
turn-around di setiap departemen dan melihat apakah perbaikan dapat dilakukan.
Laboratorium Virologi umumnya memiliki reputasi buruk untuk waktu turn-around
dibandingkan laboratorium patologi lainnya.
4. Apakah jangkauan investigasi tersedia sesuai? Jumlah permintaan untuk tes tertentu
dan tingkat positif harus diaudit. Tes yang permintaannya jarang dan / atau memiliki
tingkat positif rendah harus ditarik.
5. Apakah metode uji coba dilakukan sesuai prosedur operasi standar?
Virologi
295
6. Penggunaan laboratorium tidak berjam-jam. Pada layanan laboratorium panggilan
mahal dan hanya boleh diberikan bila diperlukan. Catatan harus disimpan untuk setiap
panggilan keluar individu.
7. Kebijakan dan prosedur keselamatan. Setiap laboratorium harus memiliki kebijakan
keamanan yang komprehensif. Setiap kecelakaan di laboratorium harus dicatat dan
perbaikan dilakukan jika perlu.Penggunaan zat berbahaya harus diaudit.
8. Efisien penggunaan staf. Apakah staf senior melakukan tugas yang seharusnya atau
bisa didelegasikan kepada orang lain. Penggunaan staf yang efisien akan menjadi
pertimbangan yang jauh lebih penting di laboratorium kecil daripada laboratorium
yang lebih besar. Pelatihan semua staf dapat diaudit.
9. Pembelian peralatan, reagen, stasioner dan barang lainnya
10. Laporan laboratorium: apakah mereka tepat dan jelas?
11. Penyimpanan reagen dan spesimen
12. Keluhan dan tindakan perbaikan yang dilakukan
Proses audit dimulai dengan auditor menyusun daftar periksa audit yang disusun dari manual
sistem mutu dari bagian yang diaudit. Auditor kemudian memeriksa kepatuhan,
ketidakpatuhan atau kemungkinan ketidakpatuhan terhadap daftar periksa ini dan menulis
laporan. Permintaan tindakan korektif kemudian dapat diajukan sebagai bagian dari laporan.
Sistem mutu itu sendiri dapat diaudit oleh orang non teknis, sedangkan kegiatan teknis harus
diaudit oleh orang yang memiliki latar belakang teknis yang memadai. Secara umum, lebih
baik melakukan serangkaian audit kecil daripada satu audit besar. Setiap kesalahan yang
diidentifikasi oleh audit harus mengarah pada tindakan perbaikan segera dan perubahan
dokumentasi yang sesuai, yang harus didiskusikan dalam tinjauan manajemen.
Latihan
Untuk dapat memperdalam pemahaman Anda mengenai materi di atas, kerjakanlah Latihan
berikut!
Virologi 296
Untuk membantu Saudara dalam mengerjakan soal latihan tersebut silakan pelajari kembali materi
tentang
1. Pengendalian mutu
2. Westgard Rule
3. Umpan balik terhadap proses audit
4. Contoh aturan yang dipakai dalam system pengendalian mutu
Ringkasan
Dalam virologi produk bentuk layanan yang berkualitas dapat didefinisikan sebagai
"hasil yang tepat pada spesimen yang tepat dari pasien yang tepat yang akurat, tepat waktu
dan benar ditafsirkan". Oleh karena itu, tujuan dari setiap laboratorium pengujian adalah
untuk menghasilkan hasil yang efektif, akurat, dapat diulang dan tepat waktu yang sebanding
dengan hasil yang diperoleh di laboratorium serupa di tempat lain yang segera
dikomunikasikan dengan tepat dan tepat kepada pengguna layanan. Hasilnya pasti tak
tertandingi. Dengan cara ini kualitas produk atau layanan bisa terjamin.
Cara laboratorium mencapai kualitas layanan ini adalah melalui penjaminan mutu yang
dapat diartikan sebagai "total proses dimana kualitas laporan laboratorium dapat terjamin".
Pada dasarnya ini terdiri dari semua langkah yang berbeda yang diambil untuk memastikan
keandalan investigasi. Ini berusaha meminimalkan variabilitas dalam hasil uji yang timbul dari
variabel seperti kualitas dan pendidikan staf, kualitas reagen, laboran dan spesimen dan
kesesuaian teknik yang digunakan.
Jaminan kualitas berkaitan dengan keseluruhan proses diagnosis infeksi yang dimulai
dan diakhiri dengan pasien. Tidak masalah seberapa baik pengendalian prosedur pengujian di
laboratorium jika terjadi kesalahan pada tahap pra atau pasca pemeriksaan yang mungkin
mengakibatkan pasien salah diidentifikasi, spesimen yang salah diambil, spesimen telah
disalahgunakan selama transportasi ke laboratorium, kesalahan entri data yang terjadi pada
penerimaan spesimen, interpretasi yang salah atas hasil atau hasilnya telah dikirim ke alamat
yang salah. Kami umumnya memfokuskan sebagian besar usaha kami pada aspek kualitas
penjaminan laboratorium, walaupun umumnya disepakati bahwa sebagian besar kesalahan
terjadi selama tahap pra dan pasca pemeriksaan.
Penjaminan mutu dalam tahap pemeriksaan adalah istilah kolektif untuk beberapa
prosedur berbeda yang digunakan untuk memantau kinerja semua aspek pekerjaan di
laboratorium. Skema penjaminan mutu harus digunakan untuk mengidentifikasi masalah
prosedural dan teknis, memeriksa kecukupan teknik saat ini, menghitung frekuensi kesalahan
dan pada akhirnya meningkatkan kepercayaan pada prosedur dan teknik yang digunakan dan
dalam laporan yang dikeluarkan.
Tes 2
Pilihlah salah satu jawaban yang paling benar!
Virologi
297
1. Jika diketahui dalam pemeriksaan virus menggunakan ELISA diperoleh hasil kontrol. Dimana
dalam data satu bulan ada data yang nilainya 3SD. Sikap analis dalam mengatasi hal tersebut
adalah
A. Melanjutkan pemeriksaan
B. Mengulangi Pemeriksaan
C. Membuang data Kontrol tersebut
D. Tetap menggunakan data tersebut
E. Melakukan konsultasi dengan analis lain
2. Dalam suatu pemeriksaan virus disuatu laboratorium menggunakan metode serologi diperoleh
rapid tes, ternyata setelah diamati sudah expired. Akan tetapi pemeriksaan telah dilakukan dan
diperoleh hasil negatif. Sikap analis terhadap kasus tersebut adalah
A. Mengeluarkan hasil
B. Mengulang dengan metode yang sama
C. Mengambil sampel yang baru dari pasien
D. Cukup konsultasikan dengan dokter penanggung jawab
E. Mengerjakan dengan reagen baru, dan tidak expired
3. Jika dalam suatu kurva diperoleh data pemeriksaan dimana setelah diamati ada data yang
memenuhi kriteria West gard Rule yaitu 10 X. Dengan mengacu pada data ini apa yang bisa kita
simpulkan? A. Tidak bisa ditarik kesimpulan
B. Kemungkinan ada kesalahan Random
C. Kemungkinan ada keslahan sistemik misalnya instrumen
D. Kemungkinan ada kesalahan random misalnya human eror dan kesalahannya beragam
E. Kemungkinan adanya keslahan random dan mungkin saja ada keslahan sistemik dan banyak
faktor lainnya
4. Sarana untuk mengetahui kualitas hasil. Biasanya evaluasi eksternal terhadap kinerja
laboratorium yang bergantung pada menggabungkan panel kemampuan dari serum yang
ditandai dengan baik ke dalam rutinitas pengujian merupakan pengertian dari?
A. Penilaian Kualitas
B. Penilaian Kinerja
C. Penilaian dan evaluasi sistem
D. Penilaian pemeriksaan laboratorium
E. Pengendalian mutu eksternal laboratorium
Virologi 298
B. 2 : laporan yang benar sepenuhnya
C. 1 : sebagian laporan yang benar misalnya identifikasi sebagian virus atau hasil serologis samar
D. 0 : hasil yang keliru yang tidak akan memiliki konsekuensi klinis yang serius misalnya IgG
rubella negatif palsu
E. - : hasil yang keliru yang akan memiliki konsekuensi klinis yang serius, 1 misalnya HBsAg
negatif palsu atau anti-HIV
6. Berikut merupakan beberapa standar CPA Inggris yang diberlakukan dalam pengendalian mutu
terutama bagian patologi kecuali?
A. Organisasi dan administrasi
B. Kepegawaian dan arah
C. Kebijakan dan protokol
D. Pengembangan staf dan pendidikan
E. Penyesuaian
7. Dalam sebuah pengendalian mutu instrumen merupakan alat yang harus menjalanai perawatan
preventif, diperiksa dan dikalibrasi secara teratur. Berikut contoh perawatan instrumen kecuali:
A. Inkubator - suhu harian, CO 2 dan cek kelembaban. Dekontaminasi mingguan interior
B. Lemari pengaman - cek tekanan udara harian dan pembersihan
lampu
UV. Permukaan kerja harus didekontaminasi setelah digunakan.
Pemeriksaan tahunan untuk kecepatan udara dan integritas filter dan dekontaminasi
paraldehid sebagaimana berlaku.
C. Mikroskop - pembersihan tujuan dan tahap harian, log penggunaan lampu dan perombakan
tahunan
D. Otoklaf - pemeriksaan suhu harian dan pengujian tanpa menggunakanspora strip
E. pH meter - buffer buffer referensi tunggal sebelum digunakan, cek titik ganda setiap bulan
8. Berikut merupakan salah satu bentuk pengendalian mutu untuk reagen kit, diantaranya?
A. Reagen dan kit harus dipesan dari produsen atau dealer ternama dengan sistem transportasi
yang handal.
B. Setelah menerima, reagen tidak harus diperiksa untuk kerusakan atau kontaminasi yang jelas.
C. Kuantitas, sumber, jumlah lot dan tanggal penerimaan harus jangan dimasukkan dalam buku
catatan dan reagen disimpan sesuai dengan spesifikasi penyimpanan pabrik pembuatnya.
D. Ketika banyak pereaksi baru dibuka, tanggal jangan dicatat di wadah.
E. Perhatian harus dilakukan dalam hal kit karena berbagai komponen kit mungkin memiliki
kondisi penyimpanan dan tanggal kadaluwarsa yang sama.
Virologi
299
B. Antisera harus dilarutkan dengan panas tergantung pada tes yang akan dilakukan.
C. Jika spesimen ditolak, bangsal harus diberitahu, sebaiknya dengan laporan lisan diikuti
dengan yang tertulis.
D. Kondisi yang meluas mungkin menjamin penerimaan spesimen di bawah standar.
E. Spesimen dengan hemolitik, lipaemik, bakteri yang terkontaminasi, atau bocor bisa diterima
dengan catatan.
10. Media transportasi merupakan salah satu bagian dari pengendalian mutu dibidang virologi,
sebaiknya..... kecuali
A. Secara umum, media harus menjadi larutan isotonik seimbang
B. pH fisiologis.
C. Mengandung zat yang akan menstabilkan virus seperti gelatin, serum betis janin atau albumin
serum sapi, dan antibiotik melawan bakteri dan jamur.
D. Usap harus terbuat dari bahan yang tidak beracun terhadap virus, seperti dakron atau rayon.
E. Tahan pada pemanasan tinggi.
11. Dalam pengendalian mutu, fasilitas yang dirancang khusus untuk virologi klinis harus:
A. Secara fisik menyatu dari laboratorium mikrobiologi dan tidak berbagi hasil udara biasa atau
peralatan seperti kerudung dan inkubator.
B. Lingkungan tidak perlu dikontrol sehingga suhu sekitar 22-26 o C dan kelembaban relatif 30-
50%.
C. Fasilitas harus berada di bawah tekanan negatif terhadap area laboratorium lainnya.
D. Secara internal, laboratorium tidak dapat dibagi menjadi daerah tekanan udara positif dan
negatif; yang positif untuk kultur jaringan dan persiapan media, negatif untuk isolasi virus atau
serologi karena mereka menangani patogen yang layak.
E. Semua permukaan harus terdiri dari bahan yang bisa didekontaminasi dengan tahapan
tertentu.
12. Jika dalam pelaksanaan kontrol harian Dimana sampel QC diuji dalam rangkap dua, perbedaan
SD antara duplikat melebihi 4 SD, maka:
A. Data bisa diapakai dengan catatan tertentu
B. Data harus di ulang
C. Data tidak boleh dipakai
D. Data bisa disimpan
E. Boleh kita melakukan pemeriksaan sampel
Virologi 300
13. Lihat contoh Chart diatas. Empat nilai kontrol berturut-turut melebihi batas yang sama. Ini sekali
lagi menunjukkan:
A. kemungkinan adanya kesalahan sistematis dan mungkin mengindikasikan perlunya
melakukan perawatan instrumen atau kalibrasi peralatan.
B. kemungkinan tidak adanya kesalahan sistematis dan mungkin mengindikasikan perlunya
melakukan perawatan instrumen atau kalibrasi peralatan.
C. kemungkinan adanya kesalahan sistematis dan tidak mungkin mengindikasikan perlunya
melakukan perawatan instrumen atau kalibrasi peralatan.
D. kemungkinan tidak adanya kesalahan sistematis dan tidak mungkin mengindikasikan perlunya
melakukan perawatan instrumen atau kalibrasi peralatan.
E. Suatu bentuk kesalahan random
14. Dua nilai berturut-turut melebihi nilai target pada sisi mean yang sama dengan 2 SD. Hal ini dapat
mengindikasikan adanya ? A. kesalahan sistematis.
B. Kesalahan random
C. Kesalahan bahan kontrol
D. Kesalahan dari manusia
E. Kesalahan metode
Virologi
301
D. Item tertentu tidak harus dievaluasi secara berkala untuk meningkatkan efisiensi di
laboratorium
E. Item tertentu harus dievaluasi secara berkala untuk meningkatkan kualitas di laboratorium
3. C
4. A
5. D
6. F
7. D
8. B
9. B
10. E
11. B
12. C
13. A
14. C
Virologi 302
Test Formatif 2
1. C
2. E
3. C
4. A
5. A
6. E
7. D
8. A
9. A
10. E
11. D
12. C
13. A
14. A
15. C
Glosarium
Kapsid : pembungkus, atau mantel protein yang membungkus genom asam
nukleat.
Kapsomer : unit morfologis yang nampak dipermukaan partikel virus
ikosahedral dengan miksoskop elektron. Kapsomer terdiri atas
kelompokan polipeptida, tetapi unit-unit morfologis tidak selalu
memiliki padanan unit struktural yang jelas struktur kimianya.
Virus detektif : suatu partikel virus yang memiliki defek fungsional pada beberapa
aspek replikasi.
Virologi
303
Selubung (envelope) : suatu membran mengandung lipid yang mengelilingi beberapa
partikel virus. Selubung diperoleh saat pematangan virus melalui
proses pertunasan menembus membrane sel.
Glikoproteinglikoprotein yang disandi virus terpajan di permukaan
selubung.
Tonjolan-tonjolan tersebut dinamakan peplomer.
Nukleokapsid : kompleks asam nukleat protein yang merupakan bentuk genom
virus berselubung. Isitlah ini lazim digunakan jika nukleokapsid
merupakan substruktural partikel virus yang lebih kompleks.
Unit struktural : blok pembangun dasar protein yang menyusun kapsid. Mereka
biasanya merupakan kumpulan lebih dari satu subunit protein non
identik. Unit strkctural tersebut sering kali disebut sebagai
protomer.
Subunit : satuan rantai polipeptida virus berlipat.
Virion : partikel virus lengkap. Pada beberapa virus (mis, papillomavirus,
picomavirus), virion identik dengan nukleokapsid. Pada virion yang
lebih kompleks (herpesvirus, orthomyxovirus), virion mencakup
nukleokapsid ditambah selubung (envelope) luar. Struktur tadi,
virion, berperan untuk menstranfer asam nukleat virus dari satu
sel ke sel lain.
Quality Control : QC mengacu pada tindakan yang harus disertakan selama setiap
pengujian untuk memastikan bahwa tes tersebut bekerja dengan
benar.
Jaminan Mutu : QA didefinisikan sebagai keseluruhan program yang memastikan
hasil akhir yang dilaporkan oleh laboratorium benar.
Penilaian Kualitas : dikenal sebagai uji profisiensi adalah sarana untuk mengetahui
kualitas hasil yang dihasilkan oleh laboratorium. Biasanya evaluasi
eksternal terhadap kinerja laboratorium. Program penilaian
kualitas internal juga dapat dilembagakan. Penilaian kualitas
merupakan tantangan terhadap efektivitas program QA dan QC.
Daftar Pustaka
Thaib, Soeprapti, (1983), Virologi Umum, Bagian Mikrobiologi Fakultas Kedokteran Universitas
Padjadjaran Bandung, Bandung.
Pusdiknakes, (1989), Virologi Umum Buku Pegangan Untuk Sekolah Menengah Analis
Kesehatan, Jakarta.
Virologi 304
Staf Pengajar Fakultas Kedokteran Universitas Indonesia, (1993), Buku Ajar Mikrobiologi Kedokteran,
Binarupa Aksara, Jakarta.
Arthur G. dkk, Alih Bahasa E.S, Yulius, (1994), Seri Ringkasan Mikrobiologi dan Imunologi, Cetakan
Pertama, Binarupa Aksara, Jakarta.
DTMH, Soedarto, (1988), Dasar–Dasar Virologi Kedokteran, CV EGC Penerbit Buku Kedokteran,
Jakarta.
Levinson, W and Jawetz, E., (2003): Medical Microbiology & Immunology, Examination & Board
Review, Seventh Edition, Lange-McGraw Hill
Kuncoro, T., et. al., (1997), Manajemen Proses di Laboratorium Klinik Menuju Produk yang
Bermutu, Dalam : Sianipar, O. (ed), 1997, Prinsip-prinsip Manajemen Untuk
Peningkatan Mutu Pelayanan Laboratorium Patologi Klinik Rumah Sakit, Magister
Manajemen Rumah Sakit, Universitas Gadjah Mada, Yogyakarta.
Lewandrovsky, Kent, (2002), Clinical Chemistry : Laboratory Management and Clinical Corellations,
Lippincot William & Wilkins, Philadelphia, USA.
Nawawi, H. Hadari, (2000), Manajemen Sumber Daya Manusia, cetakan ke-3, Gama Press, Yogyakarta.
Sulistiyani, Ambar T. dan Rosidah, (2003), Manajemen Sumber Daya Manusia : Konsep, Teori
dan Pengembangan Dalam Konteks Organisasi Publik, Graha Ilmu, Yogyakarta.
World Health Organization, (2003) Manual Of Baslc Techniques For A Health Laboratory, 2ad
Ed. (Trl041173)Pedoman Teknik Dasar Untuk Laboratorium Kesehatan, Ed. 2, Alih
bahasa': Drs. Chairlan, M.Biomed & Dra Estu Lestari, MM,
Virologi
305