Prof. Hery Purnobasuki, M.Si., Ph. Andra Rizqiawan, drg., PhD., SpBM
NIP 196705071991021001 NIP. 19810923 200501 1 001
1
DAFTAR ISI
Halaman
Halaman Pengesahan ........................................................................................................ 1
Daftar Isi............................................................................................................................ 2
Ringkasan .......................................................................................................................... 5
Bab 1 Pendahuluan ......................................................................................................... 7
1.1 Latar Belakang ............................................................................................................ 7
1.2 Rumusan Masalah ....................................................................................................... 9
1.3 Tujuan Penelitian ........................................................................................................ 9
1.4 Manfaat Penelitian .................................................................................................... 10
1.5 Rencana Target Capaian Tahunan ............................................................................ 11
Bab 2 Tinjauan Pustaka ............................................................................................... 13
2.1 Penyembuhan Luka ................................................................................................... 13
2.2 Penyembuhan luka pasca pencabutan gigi ................................................................ 15
2.3 Angiogenesis ............................................................................................................. 15
2.4 Vascular Endothelial Growth Factor-A (VEGF-A).................................................. 17
2.5 Fibroblast Growth Factor-2 (FGF-2)....................................................................... 18
2.6 Fibroblas ................................................................................................................... 19
2.7 Platelet-derived growth factor -B (PDGF-B) .......................................................... 20
2.8 Transforming Growth Faktor-Beta1 (TGF-β1) ....................................................... 21
2.9 Protein penand/ marker proses inflamasi ................................................................. 21
2.9.1 Interleukin-1 (IL-1) ……………………….………………………..…................ 22
2.9.2 Interleukin-6 (IL-6) …………………………………………………………….. 23
2.9.3 Interleukin-10 (IL-10) ……………………………….………………………….. 23
2.9.4 Tumor Necrosis Factor-Alpha (TNF-α) …………… ………………………….. 23
2.9.5 C-Reactive Protein (CRP) ………………………………………………………. 24
2.10 Penanda / Marker Proses Osteogenesis …………………………………………. 24
2.10.1 Bone Sialoprotein (BSP) ………………………………………………………. 26
2.10.2 Alkali Phospahate(ALP) ………………………………………………………. 27
2.10.3 Run-Related Transcription Factor 2 (RUNX2) ………………………………. 28
2.10.4 Colagen 1 Alpha 1 (Coll1α1) …………………………………………………. 29
2.10.5 Osterix (OSX) ………..………………………………………………….......... 29
2
2.11 Kulit Buah manggis ……………………………………………………………… 30
2.12 Methyl-Thiazol-Tetrazolium atau MTT Assay ………………………………….. 31
2.13 Wound Healing Assay …………………………………………………………... 32
2.14 Polymerase Chain Reaction (PCR) …………………………………………….... 32
2.15 Real-Time PCR …………………………………………………………………. 33
2.16 Osteoblastic Cell Line MC3T3-E1 ……………………………………………… 34
2.17 Lipopolisakarida (LPS) ………….……………………………………………… 34
Bab 3 Metode Penelitian ............................................................................................... 36
3.1 Jenis Penelitian .......................................................................................................... 36
3.2 Rancangan Penelitian ................................................................................................ 36
3.3 Sampel dan Besar Sampel ......................................................................................... 36
3.3.1 Jenis Sampel ........................................................................................................... 36
3.3.2 Besar Sampel .......................................................................................................... 36
3.4 Variabel Penelitian .................................................................................................... 37
3.5 Definisi Operasional.................................................................................................. 38
3.5.1 Human Gingival Fibroblas ..................................................................................... 38
3.5.2 Osteoblastic Cell Lini MC3T3-E1 ……………………………………….………38
3.5.3 Lipopolisakarida ..................................................................................................... 38
3.5.4 Ekstak Kulit manggis ............................................................................................. 38
3.6 Tahapan Penelitian …………………………………………………………..…… 42
3.7 Waktu dan Tempat Penelitian ................................................................................... 44
3.8 Alat dan Bahan Penelitian ......................................................................................... 44
3.8.1 Alat penelitian ........................................................................................................ 44
3.8.2 Bahan Penelitian .................................................................................................... 45
3.9 Cara Kerja ................................................................................................................ 47
3.9.1 Pembuatan Ekstrak kulit buah Manggis ................................................................ 47
3.9.2 Kultur sel ………………………………………………………….…………… 48
3.10 PCR …………………………………………………………..………………….. 49
3.10.1 Ekstraksi RNA .................................................................................................. 49
3.10.2 Pengukuran kadar dan kemurnian RNA .............................................................. 49
3
3.10.3 Perancangan dan optimasi PCR primer PDGF, FGF, VEGF, TGF-β, IL-1,
IL-6, IL-10, TNF α, CRP, Osterix, ALP, RUNX2, COL1α, dan
BSP……………………………………………………………………..............50
3.10.4 Visualisasi hasil PCR dengan menggunakan elektroforesis pada gel .................. 51
3.11 PCR Real Time………………………………………………………………….. 52
3.12 MTT Assay …………………………………………..………………………….. 54
3.13 Wound healing assay pada kultur Human Gingival Fibroblast ..……………….. 55
3.14 Analisis Data ......................................................................................................... 55
3.15 Luaran Per Tahun .................................................................................................... 55
3.16 Indikator Capaian….……………………………………………………….......... 55
Bab 4 Road Map Penelitian ………………………………………………………….56
Bab 5 Anggaran Biaya dan Jadwal Penelitian ........................................................... 57
5.1 Anggaran Biaya ......................................................................................................... 57
5.2 Jadwal Penelitian....................................................................................................... 58
5.3 Proyeksi Publikasi Hasil penelitian ……………………………………………….. 59
5.4 Indikator Keberhasilan (Target Capaian) …………………………………………..59
Daftar Pustaka ................................................................................................................. 60
Lampiran ....................................................................................................................... 65
Lampiran 1: Biodata Ketua dan Anggota........................................................................ 63
Lampiran 2: Susunan Organisasi Tim Pengusul dan Pembagian Tugas ......................... 95
Lampiran 3: Skema keterkaitan antara isu, strategi dan tema tema penelitian ............... 98
Lampiran 4: Justifikasi Anggaran Penelitian .................................................................. 99
Lampiran 5: Surat pernyataan ketua peneliti dan anggota ............................................ 102
Lampiran 6 : Memorandum Of Agreement ………………………………………….. 108
4
RINGKASAN
6
BAB 1
PENDAHULUAN
Penggantian gigi yang hilang dapat dilakukan dengan aplikasi gigi tiruan
baik sebagian maupun lengkap, gigi tiruan cekat ( crown dan bridge ) dan dental
implant. Seiring dengan kebutuhan dan keinginan penderita serta perkembangan
tehnologi dalam bidang kedokteran gigi, implant gigi merupakan alternatif
terbaik.
Saat ini banyak penelitian yang telah dilakukan mengenai preservasi soket
dan penyembuhan luka yang memanfaatkan bahan alam. Diantaranya digunakan
7
obat tradisional sebagai antiinflamasi. Hal ini dikarenakan kepercayaan
masyarakat terhadap kelebihan dari obat tradisional dibandingkan dengan obat
modern yaitu efek samping obat tradisional relatif kecil jika digunakan secara
tepat (Katno, 2007).
Bahan dari alam yang dapat dimanfaatkan untuk penyembuhan tulang
adalah kulit dari buah manggis (Garcinia mangostana) (Chaovanalikit, 2012). Di
dalam kulit buah manggis mengandung saponin dan tanin yang dapat merangsang
proliferasi fibroblas. Derivat dari senyawa fenol yaitu antosianin, flavonoid dan
tanin memiliki sifat antioksidan dan antimikroba (Sakagami, 2012). Derivat dari
xanthone yaitu α-mangostin memiliki aktivitas sebagai antijamur, antioksidan,
antiviral, antibakteri, serta anti inflamasi (Chaverri, 2008).
Proses penyembuhan luka setelah pemberian ekstrak kulit buah
manggis melibatkan banyak faktor, salah satunya adalah peningkatan jumlah
fibroblast dan proses angiogesis. Angiogenesis merupakan pembentukan
pembuluh darah baru yang terjadi secara alami didalam tubuh baik dalam
kondisi sehat maupun patologi. Pada keadaan terjadi kerusakan jaringan
proses angiogenesis berperan dalam mempertahankan kelangsungan fungsi
berbagai jaringan dan organ yang terkena luka. Hal ini terjadi melalui
terbentuknya pembuluh darah baru yang menggantikan pembuluh darah yang
rusak ( Frisca et al. 2009 )
Ada berbagai macam growth factor yakni PDGF (Platelet Derived Griwth
Factor) , VEGF ( Vascular Endothelial Growth Factor ), TGF-β ( Transforming
Growth Factor Beta ) FGF ( Fibroblast Growth Factor ), Osx ( Osterix ),
RUNX-2 ( Runt Related Transcription Factor -2 ) dan ALP ( Alkali Phosphatase
) yang dapat mempengaruhi proses migrasi fibroblast dan proses osteogenesis
pada proses penyembuhan ulang. Dengan demikian, penelitian ini bertujuan
untuk mengevaluasi pengaruh ekstrak kulit buah manggis terhadap ekspresi
PDGF, FGF, VEGF, TGF-β, Osterix, Runx-2 dan ALP ditingkat DNA dan
Protein kultur sel human gingiva fibroblast sebagai strategi potensial untuk
mempercepat penyembuhan tulang. Dari penelitian ini dapat dilanjutkan dengan
membuat gel ekstrak kulit buah manggis yang diaplikasikan kepada soket pasca
pencabutan gigi untuk mempercepat penyembuhan luka dan mengurangi infeksi.
8
Proses penyembuhan luka setelah pemberian ekstrak kulit buah manggis
melibatkan banyak faktor, salah satunya adalah peningkatan jumlah Osteoblast
dan proses Osteogenesis. Osteogenesis merupakan proses perkembangan yang
melibatkan pembentukan fibrocartilago dan aktivitas osteogenik dari sel tulang
utama ( Solomon et al, 2010 ). Proses osteogenesis terdiri dari 5 fase, yaitu fase
hematoma, fase inlamasi dan proliferasi seluler, pembentukan callus,
konsolidasi, remodeling (Shapiro, 2008)
Ada berbagai macam marker osteogenesis yaitu Osterix, ALP, RUNX2,
COL1α, dan BSP yang dapat mempengaruhi proses osteogenesis pada proses
penyembuhan tulang. Dan selain itu ada berbagai macam marker inflamasi yaitu
IL-1, IL-6, IL-10, TNF α, dan CRP yang berperan dalam proses inflamasi.
Dengan demikian, penelitian ini bertujuan untuk mengevaluasi pengaruh ekstrak
kulit buah manggis terhadap ekspresi Osterix, ALP, RUNX2, COL1α, dan BSP
serta marker inflamasi IL-1, IL-6, IL-10, TNF α, dan CRP pada media
Osteoblastic Cell Line MC3T3-E1 sebagai strategi potensial untuk menghambat
resorpsi tulang pada proses inflamasi post ekstraksi gigi. Dari penelitian ini
dapat dilanjutkan dengan membuat gel ekstrak kulit buah manggis yang
diaplikasikan kepada soket pasca pencabutan gigi untuk mempercepat
penyembuhan luka, dan menghambat proses resorpsi tulang.
9
b. Membuktikan bahwa ekstrak kulit buah manggis dapat mempercepat
wound healing assay pada kultur sel human gingiva fibroblast
c. Membuktikan bahwa ekstrak kulit buah manggis dapat meningkatkan
ekspresi RNA dan protein PDGF-B pada kultur sel human gingiva
fibroblast.
d. Membuktikan bahwa ekstrak kulit buah manggis dapat meningkatkan
ekspresi RNA dan protein FGF-2 pada kultur sel human gingiva
fibroblast.
e. Membuktikan bahwa ekstrak kulit buah manggis dapat meningkatkan
ekspresi RNA dan protein VEGF-A pada kultur sel human gingiva
fibroblast.
f. Membuktikan bahwa ekstrak kulit buah manggis dapat meningkatkan
ekspresi RNA dan protein TGF-β1 pada kultur sel human gingiva
fibroblast.
g. Mengetahui dosis optimal ekstrak kulit buah manggis pada Osteoblastic
cell line MC3T3-E1
h. Membuktikan bahwa ekstrak kulit buah manggis dapat meningkatkan
Ekspresi gen Osterix, ALP, RUNX2, COL1α, dan BSP pada Osteoblastic
cell line MC3T3-E1
i. Membuktikan bahwa ekstrak kulit buah manggis dapat menurunkan IL-1,
IL-6, IL-10, TNF α, dan CRP pada Osteoblastic cell line MC3T3-E1
10
3. Sebagai model penyembuhan luka untuk memperbaiki atau
mempercepat proses penyembuhan luka pasca pencabutan gigi melalui
proses jalur pencegahan keradangan dan aktivasi proses osteogenesis.
4. Meningkatkan efektifitas pendayagunaan ekstrak kulit buah manggis
sebagai bio-produk yang baik sebagai bahan alternatif untuk
mempercepat penyembuhan luka dan mengurangi terjadinya resorpsi
tulang alveolar pasca pencabutan gigi.
11
Perlindungan Tidak
Tidak Tidak ada Tidak ada
Varietas ada
ada
Tanaman
Perlindungan
Topografi Tidak Tidak
Tidak ada Tidak ada
Sirkuit ada ada
Terpadu
Tidak
6. Teknologi Tepat Guna 7) Draf Produk Penerapan
ada
Model/Purwarupa/Desain/Kary Tidak
7. Draf Produk Penerapan
a seni/Rekayasa Sosial8) ada
Tidak Tidak
8. Buku Ajar (ISBN)9) Tidak ada Tidak ada
ada ada
Tingkat Kesiapan Teknologi
9. 1 2 3 4
(TKT)10)
12
BAB 2
TINJAUAN PUSTAKA
13
menghancurkan semua debris dan bakteri yang ada pada daerah tersebut.
Adanya neutrofil menandakan mulai terjadinya respon inflamasi yang
ditandai dengan peningkatan aliran darah dan permeabilitas pembuluh darah,
aktivasi reseptor nyeri, dan aktivitas neutrofil dan sel darah putih lain yang
mengeliminasi debris dan bakteri. 48 jam setelah terbentuknya luka, sel
makrofag akan menggantikan peran utama sel neutrofil dalam proses
inflamasi. Makrofag berfungsi menghancurkan neutrofil yang mati dan
eksudat lain yang ada pada daerah tersebut (Goepel, 1992).
Sel-sel makrofag kemudian memproduksi senyawa yang
menyebabkan fibroblast menggandakan diri, fibroblast merupakan sel yang
berperan penting dalam memproduksi protein untuk memperbaiki jaringan,
terutama kolagen (Clark, 2001).
2) Tahapan perbaikan jaringan (Proliferasi)
14
secara bertahap. Tensile strength dari jaringan parut bertahap meningkat dan
akhirnya mendekati sekitar 80% dari kekuatan aslinya. Homeostasis kolagen
dan Extra Cellular Matrix (ECM) diatur oleh serine proteases dan matrix
metalloproteinases (MMPs). Inhibitor jaringan dari MMPs mengontrol
aktvitas proteolitik dalam jaringan parut. Setiap gangguan dapat
menyebabkan degradasi matriks yang berlebihan sehingga menghasilkan
bekas luka (Shetty & Bertolami 2004, p.5-6).
2.3 Angiogenesis
Angiogenesis merupakan pertumbuhan pembuluh darah baru yang terjadi
secara alami didalam tubuh, baik dalam kondisi sehat maupun sakit. Proses
angiogenesis terdiri dari beberapa tahapan yang dimulai dari proses inisiasi, yaitu
dilepaskannya enzim protease dari sel endotel yang teraktivasi, pembentukan
15
pembuluh darah vaskular, antara lain terjadinya degradasi matriks ekstraseluler
(Extra Cellular Matrix, ECM), migrasi dan proliferasi sel endotel, serta
pembentukan ECM baru yang kemudian dilanjutkan dengan maturasi atau
stabilisasi pembuluh darah yang terkontrol dan dimodulasi untuk memenuhi
kebutuhan jaringan (Plank, 2004).
16
endotel dari pembuluh darah lama akan mendegradasi ECM dan menginvasi
stroma dari jaringan disekitarnya sehingga sel endotel yang terlepas dari ECM ini
akan sangat responsif terhadap signal angiogenik (Frisca dkk, 2009).
d) Migrasi dan proliferasi sel endotel
Degradasi proteolitik dari ECM segera diikuti dengan migrasinya sel
endotel ke matriks yang terdegradasi. Proses tersebut kemudian diikuti dengan
proliferasi sel endotel yang distimulasi oleh faktor angiogenik, yang beberapa di
antaranya dilepaskan dari hasil degradasi ECM, seperti fragmen peptide, fibrin
atau asam hialuronik (Kleinsmith et al, 2008).
e) Pembentukan lumen dan pembuatan ECM baru
Sel endotel yang bermigrasi tersebut kemudian mengalami elongasi dan
saling mensejajarkan diri dengan sel endotel lain untuk membuat struktur
percabangan pembuluh darah yang kuat. Proliferasi sel endotel meningkat
sepanjang percabangan vaskular. Lumen kemudian terbentuk dengan
pembengkokan dari sel endotel. Pada tahap ini kontak antar sel endotel mutlak
dibutuhkan (Frisca dkk, 2009).
f) Fusi pembuluh darah baru dan inisiasi aliran darah
Struktur pembuluh darah yang terhubung satu sama lain akan membentuk
rangkaian pembuluh darah untuk memediasi terjadinya sirkulasi darah. Pada
tahap akhir, pembentukan struktur pembuluh darah baru akan distabilkan oleh sel
mural (sel otot polos dan pericytes) sebagai jaringan penyangga dari pembuluh
darah yang baru terbentuk. Tanpa adanya sel mural, struktur dan jaringan antar
pembuluh darah sangat rentan dan mudah rusak (Frisca dkk, 2009).
17
Tekanan oksigen dapat berfungsi sebagai regulator VEGF. Paparan kondisi
hipoksia menginduksi ekspresi VEGF dengan cepat. Sebaliknya, dalam
kondisi kadar oksigen normal, ekspresi VEGF menurun dan mengalami
stabilisasi. Tingkat ekspresi VEGF juga bergantung pada jumlah sitokin
inflamatori dan hormon pertumbuhan, termasuk diantaranya Epidermal Growth
Factor (EGF), Interleukin-1β (IL-1β), plateled derived growth factor (PDGF),
Tumor Necrosis Factor (TNF-α), dan transforming growth factor (TGF- β1)
(Goepel. 1992). VEGF beraksi sebagai mitogen yang terbatas pada sel endotel
vaskular dan terlibat dalam banyak tahap respon angiogenik, antara lain
menstimulasi degradasi matriks ekstraseluler disekitar sel endotel, meningkatkan
proliferasi dan migrasi sel endotel, membantu pembentukan struktur pembuluh
darah.
18
lebih tinggi dibandingkan b-FGF. a-FGF banyak terdapat pada otak dan retina
dan diketahui berperan dalam menjaga kondisi fisik tubuh, termasuk diantaranya
menjaga homeostasis tubuh seperti pertumbuhan pembuluh darah menjelang
regenarsi jaringan dan penyembuhan luka. Sedangkan b-FGF berperan dalam
pembentukan tumor, memediasi proses angiogenesis dan juga penyambuhan luka
(Frisca dkk, 2009).
Spesifitas a-FGF dan b-FGF cukup luas pada sejumlah sel target,
termasuk diantaranya adalah sel endotel dan sel otot polos, fibroblas dan sel
epitel. Diketahui bahwa faktor angiogenik ini tidak hanya menstimulasi
proliferasi sel endotel secara in vitro (pada konsentrasi 1 sampai 10 mg/ml)
namun juga pada proses angiogenik in vivo. Diantaranya adalah pertumbuhan
pembuluh darah baru pada proses penyembuhan luka dengan meningkatkan
proses reendotelialisasi pada pembuluh darah yang mengalami kehilangan atau
kerusakan sel endotel dan pembentukan pembuluh darah pada vaskularisasi
jantung (Frisca dkk, 2009).
2.6 Fibroblas
Fibroblas adalah sel dominan pada jaringan ikat. Sel ini bertanggung
jawab untuk pembentukan dan pemeliharaan komponen berserat dan substansi
dasar jaringan ikat. Fibroblas biasanya dikenali dengan ciri khas hubungan sel ini
dengan kumpulan serat kolagen. Sel fibroblas dalam kondisi tidak aktif adalah
sel memanjang dengan sedikit sitoplasma dan gelap, inti pipih mengandung
kromatin kental. Fibroblas aktif memiliki bentuk oval, nukleus dan sejumlah
besar sitoplasma berwarna lebih pucat. Tingkat kapasitas sintetis dan sekresi
fibroblas ini dibuktikan dengan jumlah retikulum endoplasma yang kasar, butiran
sekresi, dan mitokondria, dan sejauh mana kompleks Golgi di sitoplasma (Nanci,
2013).
Sel paling dominan yang ditemukan pada jaringan ikat adalah sel
fibroblas. Fibroblas yang penting dalam proses perkembangan, struktur dan
fungsi gigi. Fungsi utama dari fibroblas adalah pembentukan serat ekstraseluler
pada jaringan ikat. Serat yang dibentuk adalah kolagen, elastis, dan oxytalan.
Selain ini, fibroblas melakukan berbagai fungsi lainnya (Chandra et al, 2010).
19
Fibroblas merupakan sasaran dari banyak golongan protein yang disebut growth
factors yang mempengaruhi pertumbuhan sel dan diferensiasi. Pada orang
dewasa, jaringan ikat fibroblas jarang melakukan pembelahan sel. Namun,
fibroblas akan bermitosis dan melanjutkan siklus sel ketika jaringan
membutuhkan fibroblas tambahan yang dirangsang oleh growth factors yang
dilepaskan secara lokal misalnya, untuk memperbaiki organ yang rusak.
Fibroblas yang terlibat dalam penyembuhan luka kadang-kadang disebut
myofibroblasts (Junqueira & Mescher, 2013).
Migrasi fibroblas ke daerah yang cedera didorong oleh chemokines, TNF,
PDGF, TGF-b, dan FGF. Proliferasi fibroblas selanjutnya juga dipicu oleh
beberapa growth factor, termasuk PDGF, EGF, TGF-b, FGF, dan sitokin IL-1
dan TNF. Makrofag adalah sumber utama untuk zat-zat faktor ini, meskipun sel
inflamasi lain dan trombosit juga dapat menghasilkan zat – zat tersebut (Kumar
et al, 2010).
Fibroblas yang pertama yang masuk ke daerah luka mengandung aktin
melimpah, myosin dan memiliki sifat kontraktil, sehingga sering disebut
contractile fibroblasts atau myofibroblasts. Sel-sel ini menyambung satu sama
lain dan dengan fibril jaringan ikat. Dan ketika berkontraksi, myofibroblasts
dapat menarik tepi luka bersama-sama, sehingga mengurangi luas permukaan
dan memudahkan penyembuhan (Nanci, 2012).
20
pertumbuhan insulin-seperti saya sendiri tidak menyebabkan perubahan morfologi
yang signifikan. FGF yang dikombinasi dengan PDGF-B mengakibatkan
penebalan hanya dari epidermis.
21
Gambar 1. Jalur signal inflamasi ( Paulo V, 2015).
22
Gambar 2. Peran Interleukin-1 pada proses osteogenesis (Germolec DR, 2010).
23
2.9.5 C-Reactive Protein (CRP)
Merupakan marker protein pada fase akut inflamasi, terdiri dari level
serum fibrinogen yang berhubungan dengan pembentukan fibrin, agregrasi
platelet dan viskositas plasma.
24
bertanggung jawab untuk pemeliharaan massa tulang adalah osteoklas
(penyerapan tulang) dan osteoblas (pembentuk tulang) (Sharaway, 2001)
Sel ini diatur dalam bone remodelling units (BRU) atau basic multicellular
units (BMU), yang mempertahankan aktivasi yang berkesinambungan dari
osteoklas diikuti oleh osteoblas yaitu resorpsi diikuti pembentukan tulang.
Osteoblas mensekresikan matriks organik unmineralized yaitu osteoid, yang
sebagian besar terdiri dari kolagen tipe I, selain proteoglikan, glikoprotein, dan
protein noncollagenous lainnya seperti osteocalcin (Lauing et al. 2013).
25
Gambar 4. Proses Osteogenesis (Kalfas, Iain 2001).
Ekspresi gen BSP, yang diinduksi dalam osteoblas yang baru terbentuk,
diatur oleh hormon dan sitokin yang meningkatkan pembentukan tulang dan
diatur oleh faktor-faktor yang menekan pembentukan tulang. Dengan demikian,
BSP memiliki sifat biofisik dan kimia dari nukleator, dan ekspresi temporo-
spasialnya bertepatan dengan mineralisasi de novo di tulang dan sementum.
Namun, kemampuan BSP untuk memediasi perlekatan sel dan memberi sinyal
melalui titik motif RGD untuk fungsi alternatif untuk BSP yang perlu diselidiki
lebih lanjut. Dalam kombinasi, sekuens asam poliglutamat pengikat hidroksiapatit
dan RGD memberikan entitas bi-fungsional yang melaluinya BSP dapat
menengahi penargetan dan perlekatan sel normal dan metastasis pada permukaan
tulang. Bone Sialoprotein (BSP) adalah glikoprotein asam, terfosforilasi yang
disintesis oleh osteoblas dan sel-sel yang menyerupai osteoklastik dalam kultur.
Ini memiliki massa tanpa glukosilasi 33 kDa (glikosilasi, 70-80 kDa). Meskipun
26
fungsi BSP masih belum sepenuhnya dipahami, BSP merangsang pembentukan
hidroksiapatit in vitro dan tampaknya memediasi interaksi sel-sel melalui situs
pengikatan integrin. BSP relatif terbatas pada tulang tetapi juga diekspresikan oleh
trofoblas dan sangat diregulasi oleh banyak tumor ganas (mis. Kanker payudara
dan prostat). Baru-baru ini, telah disarankan bahwa BSP dapat berperan dalam
angiogenesis yang terkait dengan pembentukan tulang, pertumbuhan tumor, dan
metastasis (Bellahcene, 2000). Sejumlah kecil BSP ditemukan dalam sirkulasi
dan dengan demikian merupakan penanda potensial pergantian tulang (Shaarawy,
2001).
Kadar BSP serum dilaporkan meningkat pada penyakit tulang ganas (Diel,
1999; Woitge, 2001) dan osteoporosis pascamenopause, dan menurun dengan
pengobatan antiresorptif (Seibel, 1996; Shaarawy, 2001). BSP stabil pada −80 ° C
tetapi sedikit yang diketahui tentang kinetika dan metabolisme BSP dalam serum.
Penanda dapat berguna dalam deteksi dini metastasis tulang dan gangguan tulang
lainnya, dan pengujian baru dan lebih baik untuk imunoreaktif BSP saat ini
sedang dikembangkan ( Seibel M.J, 1996).
Alkali fosfatase (ALP) adalah grup enzim yang dihasilkan oleh hepar,
tulang, usus, plasenta, dan ginjal (tubulus proksimal). ALP akan meningkat dalam
plasma pada keadaan obstruksi saluran empedu, kolestatik intrahepatik, sirosis
hepatis, fatty liver, tumor hepar, metastase hepar, hepatitis, dan intoksikasi obat
(Sherlock, 1979). Alkaline phosphatase (ALP) merupakan enzim yang banyak
ditemukan di hepar (isoenzim ALP-1) dan tulang (isoenzim ALP-2), serta sedikit
diproduksi oleh sel-sel pada saluran pencernaan, plasenta, dan ginjal. ALP sering
27
digunakan untuk mendeteksi penyakit yang berhubungan dengan organ-organ
tersebut.
Kadar ALP dalam darah sangat bervariasi tergantung dari jenis kelamin, usia,
kehamilan, morfometrik tubuh, serta obat-obatan. Peningkatan kadar ALP dapat
terjadi antara lain karena :
Mekanisme yang bertanggung jawab atas regulasi gen Runx2 sendiri baru
saja mulai dipahami. Sebelumnya diasumsikan bahwa Runx2 mengatur gen
osteogenik dimediasi semata-mata oleh kadar protein Runx2, dan karenanya kadar
mRNA. Asumsi ini didasarkan pada data yang dikumpulkan dari model non-
manusia (biasanya tikus). Studi terbaru miliki menunjukkan bahwa kadar Runx2
28
selama in vitro diferensiasi osteoblas manusia primer tidak menunjukkan
perubahan besar, sedangkan kadar gen hilir seperti sialoprotein tulang dan alkaline
phosphatase meningkat secara dramatis. Data menunjukkan itu Level runx2
mRNA diekspresikan secara konstitutif, dengan kurangnya korelasi antara Runx2
mRNA / tingkat protein dan perolehan fenotip osteoblas (Kirkham GR and
Cartmell SH, 2007).
29
darah menginvasi matriks mineral dari daerah kondrosit yang mengalami
hipertrofi. Sel mesenkimal yang bermigrasi dengan osteoclast dan pembuluh
darah tidak dapat mendeposit matriks tulang, sehingga tidak terjadi penulangan
pada matriks dengan mesenkim (Kazuhisa et al, 2012).
Penelitian yang dilakukan oleh Ying Cao.,Et al.2008 menunjukan adanya
down regulasi pada level transkripsional oleh OSX terhadap ekspresi dan produksi
dari IL-1α, suatu sitokin yang menstimulasi pembentukan osteoklas dengan
memproduksi RANKL oleh sel stromal sumsum tulang dan osteoblast. Sitokin
seperti IL-1α, IL-6, IL-11, dan prostaglandin E2 menunjukan partisipasi dalam
proses bone remodelling dengan menginduksi RANKL dan pembentukan
osteoklas. Karena itu perubahan dari kadar sitokin ini dapat mempengaruhi bone
lysis (Ying Cao et al, 2008)
Manggis merupakan tanaman buah berupa pohon yang berasal dari hutan
tropis yang teduh dikawasan Asia Tenggara, yaitu hutan belantara Malaysia atau
Indonesia. Manggis memiliki nama latin Garcinia mangostana L dan termasuk ke
dalam keluarga Clusiaceae. Buah manggis dikenal dengan sebutan Queen fruit
atau ratunya buah. Hasil penampisan fitokimia ekstrak kulit buah manggis
menunjukkan bahwa ekstrak tersebut mengandung komponen kimia alkaloid,
saponin, tanin, fenolik, flavonoid, triterpenoid, steroid dan glikosida.
Dibandingkan dengan buah yang lainnya, kandungan antioksidan dalam kulit
manggis juga jauh lebih tinggi. Kulit manggis pun dapat dipakai untuk kemoterapi
dan untuk mengurangi dampak dari kemoterapi (Lih-Geeng et al, 2008).
Komponen aktif utama dari buah manggis disebut xanthones. Xanthone
adalah sejenis senyawa polifenol yang secara biologis aktif dan secara struktural
mirip dengan bioflavanoids. Senyawa ini jarang terdapat di alam, paling banyak
ditemukan hanya dalam dua keluarga tanaman. 200 jenis xanthones alami yang
sejauh ini telah diidentifikasi. Sekitar 40 jenis diantaranya telah ditemukan dalam
buah manggis. Xanthone dan turunannya telah terbukti memiliki beberapa
manfaat, termasuk anti-inflamasi dan anti-alergi (Cui et al, 2010). Berdasarkan
studi literatur penelitian Garcinia mangostana L mempunyai aktivitas anti
30
inflamasi adalah -mangosten dan -mangosten yang merupakan senyawa utama
dari xanthone yang menghambat produksi enzim siklooksigenase(COX) yang
merupakan penyebab radang (Jung dkk, 200. Beberapa uji pra-klinik pada hewan
coba tikus menunjukkan zat aktif gamma mangostin (derivat xanthone) secara
langsung menghambat aktivitas enzim Ikappa B kinase mencegah proses
transkripsi gen COX-2 (gen target NF-kappaB), menurunkan produksi PGE2
dalam proses inflamasi (Middleton, 2000). Penelitian sebelumnya membuktikan
bahwa xanthone dalam ekstrak kulit manggis menghambat aktivitas ROS
intraselular. Inhibisi aktivitas ROS intraselular akan menghambat aktivitas enzim
yang mengaktifkan nuclear factor kappa B (NF-kB) untuk translokasi ke dalam
nukleus dan meregulasi mediator pro-inflamasi seperti IL-1, IL-6, TNF-alpha
(Ibrahim, 2014).
31
2.13 Wound Healing Assay
Uji scratch assay secara in vitro adalah metode yang mudah, murah dan
dikembangkan untuk mengukur migrasi sel secara in vitro. Langkah awal dengan
membuat "goresan" dalam sel monolayer, mendokumentasikan gambar di awal
scratch dan secara berkala selama migrasi sel untuk menutup goresan, dan
membandingkan gambar untuk mengukur tingkat migrasi sel. Dibandingkan
dengan metode lain, uji ini sangat sesuai untuk mempelajari tentang efek interaksi
sel-matriks dan sel-sel pada migrasi sel, melihat pola migrasi sel selama
penyembuhan luka secara in vivo dan kompatibel dengan pencitraan sel hidup
selama migrasi secara intraselular. Selain memonitor migrasi populasi sel
homogen, metode ini juga telah diadopsi untuk mengukur migrasi sel individual di
tepi awal goresan. Uji ini biasanya menggunakan waktu yang beragam mulai dari
beberapa jam setelah goresan sampai 24 jam.( Chi Liang et al,2007)
32
dengan cetakan pada daerah sekuen yang komplementer dengan sekuen primer.
Proses annealing biasanya dilakukan selama 1 – 2 menit. Suhu inkubasi kemudian
dinaikkan menjadi 72oC selama 1,5 menit, pada suhu ini DNA polymerase akan
melakukan proses polimerisasi rantai DNA yang baru berdasarkan informasi yang
ada pada daerah cetakan. DNA rantai ganda yang terbentuk selajutnya akan 20
didenaturasi lagi dengan menaikan suhu inkubasi menjadi 95oC. Rantai DNA
yang baru terbentuk selanjutnya akan berfungsi sebagai cetakan bagi reaksi
polimerisasi berikut. Reaksi-reaksi diulang sampai 25–30 siklus. Banyaknya
siklus amplifikasi tergantung dari konsentrasi DNA target di dalam campuran
reaksi, akan tetapi, pada umumnya konsentrasi DNA Taq polimerisasi terbatas
setelah 25–30 siklus (Yuwono, 2006.; Sambrook et al., 1989).
33
sampel dalam waktu bersamaan menggunakan multiwell plates (Soong R et al,
2001).
34
yang dikandung dinding sel bakteri gram negatif dan dikeluarkan ketika bakteri
mati.8 Bakteri agresif penyebab periodontitis terutama adaMetabolit bakteri dan
produk toksik dapat merusak jaringan dan merangsang terjadinya inflamasi, di
antaranya lipopolisakarida endotoksin (LPS) yang dikandung dinding sel bakteri
gram negatif dan dikeluarkan ketika bakteri mati. Bakteri agresif penyebab
periodontitis terutama adalah Porphyromonas gingivalis (P. gingivalis).
P.gingivalis (viable atau konstituennya) teridentifikasi pada plak aterosklerotik
manusialah Porphyromonas gingivalis (P. gingivalis). P.gingivalis (viable atau
konstituennya) teridentifikasi pada plak aterosklerotik manusia (Harazy, 2000).
35
BAB III
METODE PENELITIAN
Rancangan penelitian yang digunakan adalah post test only control group
design.
2
2𝛿 2 (𝑍1−𝛼 + 𝑍1−𝛽 )
𝑛=
(𝜇1 − 𝜇2 )2
n:2
Keterangan:
36
𝑍1−𝛼 : nilai pada distribusi normal standar yang sama denga tingkat kemaknaan
𝑍1−𝛽 : nilai pada distribusi normal standar yang sama dengan power test sebesar
a. Variabel Bebas
b. Variable Tergantung
c. Variable Terkendali
37
3.5 Definisi operasional
Human gingival fibroblast (HGnF) adalah sel yang diisolasi dari human gingiva, di
cryopreserved pada passage one dan dalam kondisi beku. Bebas dari HIV-1, HBV, HCV,
MC3T3-E1 Adalah sel precursor osteoblast yang berasal dari tulang Calvaria Mus
Musculus ( Mouse C57BL/6 calvaria). Dengan medium MEM α + 2mM Glutamine + 10%
3.5.3 LPS
Lipopolisaccharides ( LPS ) adalah komponen karakteristik dari dinding sel bakteri gram
negative, terlokalisasi di lapisan luar membrane dan termasuk dalam golongan tidak
berkapsul, terpapar pada permukaan sel. LPS berkontribusi pada integritas membrane luar,
Ekstrak kulit manggis adalah ekstrak yang dibuat dengan 200gram serbuk kulit manggis
(Garcinia mangostana L.) yang dibasahi dengan pelarut DMSO 0,1% dan dishacker selama
2x24 jam, disaring dengan 3x penyaringan menggunakan kain saring, dan di rotary
38
3.5.5 Ekspresi marker penanda inflamasi
3.5.5.1 IL-1
tunggal, non-glikosilasi yang mengandung 156 asam amino dan memiliki massa molekul
17,9 kDa. IL-1A dimurnikan dengan teknik kromatografi eksklusif. Interleukin 1 alpha
(IL1α) juga dikenal sebagai hematopoietin 1 adalah sitokin dari keluarga interleukin 1
yang pada manusia dikodekan oleh gen IL1A. IL1α diproduksi terutama oleh makrofag
teraktivasi, serta neutrofil, sel epitel, dan sel endotel. Memiliki aktivitas metabolik,
fisiologis, hematopoietik, dan memainkan salah satu peran sentral dalam pengaturan
respons imun. Ia berikatan dengan reseptor interleukin-1 dan di jalur yang mengaktifkan
3.5.5.2 IL-6
Interleukin-6 Mouse Recombinant yang diproduksi di E.Coli adalah rantai polipeptida non-
glikosilasi tunggal yang mengandung 187 asam amino dan memiliki massa molekul 21709 Dalton.
IL-6 dimurnikan dengan teknik kromatografi eksklusif. Interleukin-6 adalah sitokin proinflamasi
yang kuat, utamanya diproduksi oleh sel T teraktivasi dan bermacam sel lainnya termasuk sel
endotel dan makrofag. IL-6 mempengaruhi limfosit B dan T dan telah terbukti memiliki peran
dalam pertahanan inang, reaksi fase akut, respon imun dan hematopoiesis.
3.5.5.3 IL-10
IL10 adalah sitokin yang diproduksi terutama oleh monosit dan pada tingkat lebih rendah oleh
limfosit. Sitokin ini memiliki efek pleiotropik dalam imunoregulasi dan peradangan. Mendown-
regulasi ekspresi sitokin Th1, MHC kelas II Ags, dan molekul costimulatory pada makrofag. Ini
juga meningkatkan kelangsungan hidup sel B, proliferasi, dan produksi antibodi. Sitokin ini dapat
memblokir aktivitas NF-kappa B, dan terlibat dalam regulasi jalur pensinyalan JAK-STAT.
39
3.5.5.3 TNF α
Tumor necrosis factor-α (TNF-α) adalah sitokin proinflamasi yang kuat yang memainkan peran
sentral dalam aktivitas antitumor, modulasi imun, peradangan, anoreksia, cachexia, syok septik,
TNF-α diekspresikan oleh beragam sel, dengan banyak agen induktif dan supresif. Terutama, TNF-
3.5.5.4 CRP
C-Reactive Protein (CRP), juga dikenal sebagai Pentraxin 1, adalah protein pentamerik yang
disekresikan yang berfungsi sebagai sensor dan aktivator untuk respon imun bawaan. Pada
manusia, itu adalah protein fase akut utama; konsentrasinya yang beredar meningkat secara
3.5.6.1 Osterix
Osterix (Osx) adalah faktor transkripsi khusus osteoblas yang penting untuk diferensiasi osteoblas
dan pembentukan tulang. Tikus knock-out Osx kekurangan tulang sepenuhnya. Satb2 sangat
3.5.6.2 Coll1α
Kolagen tipe I bertanggung jawab untuk stabilitas mekanik, elastisitas, kekuatan dan
ketangguhan, diamati pada tendon, ligamen, kulit, kornea, tulang, dentin dan banyak
jaringan lainnya. Kolagen tipe 1 memiliki peran struktural dalam matriks ekstraseluler
40
penyakit genetik yang lebih penting, secara langsung atau tidak langsung melibatkan jenis
kolagen ini termasuk sebagian besar kasus osteogenesis. Kolagen tipe I berkontribusi
maksimal pada kandungan protein berserat pada mamalia. Protein ini memiliki struktur
silinder memanjang dengan ujung meruncing, memiliki heliks tangan kiri dengan tiga
3.5.6.3Runx-2
Faktor transkripsi yang terlibat dalam diferensiasi osteoblastik dan morfogenesis kerangka.
Penting untuk pematangan osteoblas dan osifikasi intramembran dan endokhondral. CBF
berikatan dengan situs inti, 5'-PYGPYGGT-3 ', dari sejumlah peningkat dan promotor,
osteocalcin, osteopontin, sialoprotein tulang, alfa 1 (I) kolagen , Promotor LCK, IL-3 dan
Dalam osteoblas, mendukung aktivasi transkripsi: bersinergi dengan SPEN / MINT untuk
meningkatkan aktivasi yang dimediasi FGFR2 dari elemen responsif FGF osteocalcin FGF
(OCFRE)
3.5.6.4 BSP
BSP (Bone Sialoprotein) adalah komponen dari jaringan mineral seperti tulang, dentin,
sementum dan kartilago terkalsifikasi. BSP adalah komponen signifikan dari matriks
ekstraseluler tulang dan telah disarankan untuk membentuk sekitar 8% dari semua protein
non-kolagen yang ditemukan dalam tulang dan sementum. sebagian besar spesifik untuk
jaringan mineral dan diekspresikan selama pembentukan awal tulang dan sementum.
41
3.5.6.5 ALP
ALP (Alkaline phosphatase) adalah enzim yang ditemukan di beberapa jaringan di seluruh
tubuh. Konsentrasi ALP tertinggi hadir dalam sel -sel yang terdiri dari tulang dan hati.
Peningkatan kadar ALP dalam darah paling sering disebabkan oleh penyakit hati atau
Ekstrak yang didapatkan dari proses ekstraksi kulit buah manggis jenis Garcinia
mangostana dengan metode maserasi yang dilarutkan dalam larutan DMSO 0,1%
1. Pemeliharaan kultur sel thowing human gingival fibroblast dilakukan mulai dari
1. Sel thawing human gingival fibroblast dilakukan multiple scratch dan diinkubasi
selama 24 jam
2. Masing-masing sampel diberi ekstrak kulit manggis sebanyak 800 µg/ml pada
3. Setelah 24 jam maka setiap sampel dilakukan ekstraksi RNA dan protein.
7. Dilakukan penelitian wound healing assay dan dilihat wound closure setiap 24 jam,
42
8. Hasil dari RT-PCR kemudian dilakukan elektroforesis dengan menggunakan gel
elektroforesis dan dilihat dengan bantuan sinar ultraviolet untuk melihat katebalan
dari band.
9. Hasil dari immunohistokimia akan dihitung setiap sel yang memancarkan protein
Ekstrak yang didapatkan dari proses ekstraksi kulit buah manggis jenis Garcinia
mangostana dengan metode maserasi yang dilarutkan dalam larutan DMSO 0,1%
1. kultur sel Osteoblastic cells line MC3T3-E1 dilakukan mulai dari membangunkan
3. Masing-masing sampel diberi ekstrak kulit manggis sebanyak 800 µg/ml pada
5. Kultur sel Osteoblastic cells line MC3T3-E1 dilakukan RT-PCR dengan untuk
6. Kultur sel Osteoblastic cells line MC3T3-E1 dilakukan RT-PCR dengan untuk
7. Dilakukan penelitian dengan waktu perlakuan pada sampel setiap 6 jam, 12 jam,
elektroforesis dan dilihat dengan bantuan sinar ultraviolet untuk melihat katebalan
dari band.
43
3.7 Waktu dan Tempat Penelitian
Penelitian ini dilakukan pada tahun 2019 mulai bulan Agustus sampai Desember, dengan
Airlangga.
b. Pemeliharaan, pemberian perlakuan serta analisis hasil pada kultur sel thowing
Airlangga.
c. Pemeliharaan, pemberian perlakuan serta analisis hasil pada kultur sel osteoblastic
c. Electrophoresis
e. Ependorf micropipette White tips (0,5-10µl), yellow tips (10-100µl) dan blue
g. Transluminator UV
j. Spinator (Millipore)
44
3.8.2 Bahan Penelitian
a. PCR Mix (12,5 µl) yang terdiri: dNTP (ATP, CTP, TTP, GTP), MgCl2 dan
Taq Polimerase.
PDGF ( 489 bp ) :
Forward : 5’ –CTGGGCACGTGAGGGCAGCGTCT-3’
FGF ( 453 bp ) :
Forward : 5’ –CCTAGTGGATGATAAGAATAATCAGTATG-3’
VEGF ( 478 bp ) :
Forward : 5’‐UGUAGCAGCCAGGGCCUAGAGAAGG‐3’
Reverse :5’‐TCCACCACCCTGTTGCTGTA-3’
TGF-β ( 455 bp ) :
Forward : 5’‐ACCACAGTCCATGCCATCAC‐3’
Reverse : 5’‐TGGAGGACCTGGTAGAGGAA‐3’
ALP ( 97 bp ) :
45
Forward : GGCTTCTTCTTGCTGGTGGAA
Reverse : CCTGGTCCATCTCCACTGCT
Reverse : TTTCACCACATCAGACACGCT
Reverse : TAAAGGCCATTCCACCACCA
Reverse : AGTTCTGAAGCACCTGCCTG
Reverse : 5′-GCCCACTATTGCCAACTGC-3′
IL-1 ( 152 bp )
Forward : CAA CCA ACA AGT GAT ATT CTC CAT G
IL-6 (141 bp )
Forward : CAG AAT TGC CAT CGT ACA ACT CTT TTC TCA
IL-10 ( 190 bp )
Forward : GGT TGC CAA GCC TTA TCG GA
TNF α ( 155 bp )
Forward : GGGGCCACCACGCTCTTCTGTC
Reverse : TGGGCTACGGGCTTGTCACTCG
46
CRP (440 )
Forward : TCGTATGCCACCAAGAGACAAGACA
Reverse : AACACTTCGCCTTGCACTTCATACT
C. Bahan Elektroforesis
b. TEMED
c. TBE 0,5%
d. Marker 100 bp
e. Urea
i. Gel Slick®
Kulit buah manggis yang baru diambil dari pohonnya ditimbang sebanyak 2500
gram, dikuliti, ditinggal batangnya saja dan ditimbang lagi hingga 1000 gram. Kemudian
diblender hingga halus dan ditimbang lagi hingga tinggal 850 gram. Ditambahkan
aquadest steril sebanyak 150 cc, kemudian disaring menggunakan alat Bugner yang
dihubungkan dengan Vacuum pump (Gast, USA) hingga tinggal 820 cc ekstrak kulit buah
manggis. Dari hasil freeze dryed, bubuk ekstrak kulit buah manggis ditimbang kembali
hingga tinggal 2.7 gram. Hasil dari freeze dryed kulit buah manggis diambil sebanyak 0.5
47
gram kemudian dihaluskan untuk digunakan dalam penelitian ini. Sedangkan sisanya
disimpan di dalam botol dan ditutup menggunakan kertas perak (Farmakope, 1995).
Kultur sel Human Gingiva Fibroblast dibangunkan dari keadaan beku. Sel kemudian di
kultur kedalam medium DMEM + 10% FBS + 1% Streptomycin dan di inkubasi kedalam
Kultur sel Osteoblastic clls line MC3T3-E1 dibangunkan dari keadaan beku. Sel kemudian
kedalam inkubator 37ºC selama 1 bulan untuk mendapatkan hasil yang maksimal.
3.9.2.3 Pemberian Ekstrak Kulit Buah Manggis Pada Kultur sel Human gingival
Ekstrak kulit buah manggis sebanyak 600 µg/ml di campur dengan medium yang
berisi sel Human gingival Fibroblast dan Osteoblastic cells line MC3T3-E1
pada 6 wells dish dan di inkubasi selama 24 jam didalam inkubator 37ºC.
48
centrifuge 10.000 rpm selama 10 menit temperatur 4 0C, diambil viscous
2. Pada tabung baru tersebut ditambahkan 0,5 ml 100% ethanol (absolute), di bolak-
balik, di inkubasi pada suhu kamar selama 1-3 menit, centrifuge 4000 rpm selama
1-2 menit temperatur 40C. Supernatant dibuang dengan hati-hati agar RNA
3. Pelet dicuci dengan 0,8-1 ml 75% ethanol sebanyak 2 kali dan setiap kali
4. Tabung diletakkan pada posisi tegak selama 0,5-1 menit, setelah itu ethanol 75%
dibuang dengan cara pipeting atau decanting. Pelet dikeringkan dengan cara
5. Pelet yang berisi RNA tersebut dilarutkan dengan 25-30 µl DW, di-vortex
Pengukuran kadar dan kemurnian RNA pada sampel penelitian yang sebelumnya
diukur dengan nilai perbandingan serapan pada panjang gelombang 260 nm dan 280 nm.
Nilai panjang gelombang 260 nm digunakan untuk pengukuran kuantitas atau kadar RNA
Keterangan :
(RNA dikatakan murni atau kualitas RNA baik). Jika nilai ratio lebih kecil dari 1.8, berarti
RNA tersebut telah terkontaminasi dengan protein lain. Namun bila nilai ratio lebih besar
dari 2.0, ada RNA dalam sampel tersebut (QIAGEN, 2001; Jain, 2004; Moore et al, 2004;
3.10.3 Perancangan PCR primer PDGF-B, FGF-2, VEGF-A dan TGF-β1, IL-1, IL-6,
PCR Mix sebanyak 12,5 µl ditambah dengan kedua primer (masingmasing 2,5 µl).
Kemudian DNA dari lokus yang akan diperiksa (vWA). Setelah itu, tambahkan nuclease
detik
- cycle: 10 cycles
primer )
50
3.10.4 Visualisasi hasil PCR dengan menggunakan elektroforesis pada gel
1. Masing-masing plat kaca dietsa pada satu sisi kemudian ditandai. Cuci dengan
ethanol 95% dan Kimwipes® sebanyak 2x pada bagian plat kaca yang panjang dan
yang pendek.
2. Aplikasikan 3ml larutan Gel slick® pada bagian plat kaca yang lebih panjang yang
telah dietsa kemudian diratakan pada seluruh permukaan dengan gerakan memutar
3. Tunggu 5 menit sampai larutan Gel slick® mengering. Bersihkan kelebihan larutan
Gel Slick® yang masih tersisa dengan lap yang telah diberi distilled water, lalu
asam asetat 0,5% didalam 95% ethanol pada tabung 1,5ml. Usap bagian plat kaca
pendek dengan Kimwipes® tissue yang telah disaturasi dengan larutan fresh
binding.
5. Tunggu 5 menit sampai larutan kering. Usap dengan ethanol 95% dan Kimwipes®
6. Hindari kontak antara 2 bagian plat kaca yang telah diberi perlakuan dengan
dengan distilled water 36,25 ml + 10x TBE buffer 3,75 ml+ 40 % acrylamide:bis
persulfate 500µl.
51
10. Tuangkan perlahan larutan acrylamide diantara plat kaca, hindari terbentuknya
gelembung udara dengan cara menuangkan perlahan dan konstan pada satu sisi.
11. Berikan cetakan atau comb pada gel diantara plat kaca (yang dipakai berisi 9
cetakan).
3. Masukkan sampel DNA hasil PCR pada bagian cetakan di gel sebesar masing-
masing 10 µl.
5. Running gel elektroforesis dengan listrik kekuatan 100 volt sampai larutan turun
kebawah seluruhnya.
1. Pengambilan ekstraksi RNA kultur sel dilakukan pada 24, 48 dan 72 jam, dengan cara:
a. Buang medium dari dish
b. Cuci dengan PBS steril
c. Ditambahkan Isogen II (250 µL) sebagai langkah awal ekstraksi RNA
d. Resuspensi untuk melepaskan sel dari dasar plate, kemudian diambil dan
dimasukkan ke microtube.
e. Microtube digoyang dengan shaker selama 15 detik.
f. Ditambahkan ddH2O (100 µL)
g. Microtube digoyang dengan shaker selama 15 detik.
h. Inkubasi 5 menit dalam suhu ruangan
i. Centrifuge 15.000 rpm selama 15 menit dengan suhu 4°C.
j. Didapatkan dua lapis cairan dalam microtube: lapisan bawah merupakan
Isogen II, lapisan atas berwarna jernih (aquaeous phase) merupakan sel.
52
k. Ambil bagian lapisan yang jernih (280 µL) dan dipindahkan ke microtube
baru.
l. Ditambahkan isopropanol 230 µL.
m. Microtube digoyang dengan tangan selama 15 detik.
n. Inkubasi 10 menit dalam suhu ruangan.
o. Centrifuge 15.000 rpm selama 10 menit dengan suhu 4°C
p. Didapatkan pellet dan supernatan, buang supernatantnya.
q. Cuci pellet RNA dengan ethanol 75% 500 µL.
r. Centrifuge 15.000 rpm selama 3 menit dengan suhu 4°C
s. Keringkan pellet RNA di suhu ruangan selama 10 menit (tidak boleh terlalu
kering).
t. Ditambahkan RNAse free water 30µL.
u. Simpan dalam suhu -80°C.
2. Mengukur konsentrasi dan kemurnian RNA:
a. Teteskan 1.5 µL RNA pada bagian detektor RNA biodrop machine.
b. Catat kemurnian dan konsentrasi RNA yang terlihat pada monitor.
3. Proses Two Step Reverse Transcriptase PCR Konvensional menggunakan PCR kit
RiverTra Ace (Toyobo, Tokyo, Japan)
a. Membuat template cDNA dari masing-masing sampel:
- Membuat reverse transcription reaction mix dalam microtube berisi: Nuclease-
Free Water 9.75µl, RiverTra 5X Reaction Buffer 4µl, dNTPs 2µl, OligoDT 1µl,
ReverTra Ace 1µl, Recombinat RNasin Ribonuclease Inhibitor 0,25 µl untuk tiap
1 sampel. Pembuatan total master mix didapatkan dengan mengalikan jumlah
sample dengan tiap-tiap reagen.
- Mencampurkan 2µl RNA dan 18µl reverse transcription reaction mix dalam
microtube.
- Anneal dengan suhu 25°C selama 5 menit
- Extend dengan suhu 42°C selama 60 menit
- Inactivate Reverse Transcriptase dengan suhu 90°C selama 5 menit.
4. Running Real-Time Reverse Transcriptase PCR:
cDNA diamplifikasi dalam volume 10 l dengan 0.11 x SYBR Green I (CAMBREX,
Rockland, ME, USA), 0.2 mM/satuan dNTPs, 0.5 M/satuan tiap pasangan primer, dan
0.5unit Dream Taq Hot Start DNA polymerase (Thermo Fisher Scientific, Waltham,
MA) dalam kondisi sebagai berikut: 95°C selama 5 menit, dilanjutkan 55 PCR siklus
53
pada 95°C selama 30 detik, 60°C selama 20 detik, dan 72°C selama 40 detik. Sinyal
fluorescent diukur secara real time, dan kemudian tiap sample dikuantifikasi menurut
petunjuk dari pabrik. Sekuens primer yang digunakan pada studi ini dapat dilihat pada
table 1. Untuk penghitungan normalisasi dari perbedaan tiap sampel total RNA di tiap
reaksi, Ribosomal protein L13a (Rpl13a) digunakan sebagai kontrol endogenous. Unit
arbitrary ditentukan dengan membagi konsentrasi tiap produk PCR dengan konsentrasi
produk PCR dari Rpl13a. Tiap reaksi real-time PCR analysis dibuat dalam triplikasi,
dan diulang setidaknya 3 kali untuk memastikan hasil yang konsisten.
1. Sel Human Gingiva Fibroblast dilakukan splitting dan dicuci dengan larutan PBS dan
3. Dilakukan splitting dan dipindahkan dalam mikroplate 96 sumuran dan setiap sumuran
di beri sel sebanyak 5x104 + DMEM 100µl dan diinkubasi sampai sel kondisi 80 %
4. Setelah sel dalam kondisi 80% diberi perlakuan dengan Ekstrak kulit buah manggis
bertingkat ( 200 µg/ml, 400 µg/ml, 600 µg/ml, 800 µg/ml, 1000 µg/ml dan 1200 µg/ml )
5. Setelah 24 jam diberi reagen MTT pada setiap sumuran sebanyak 25 µl dan diinkubasi
selama 4 jam.
6. Setelah 4 jam medium pada mikroplate dipindahkan ke mikroplate reader yang baru
sumuran. Scratch yang linier dibuat pada sel yang confluent monolayer dengan
menggunakan pipet 200 µl. Debris sel di bilas dengan menggunakan medium
54
DMEM. Gap scratch diobservasi menggunakan kamera mikroskop cahaya dengan
Data yang diperoleh dilakukan pengamatan langsung hasil band hasil RT-PCR ,
Hasil penelitian ini akan ditulis jurnal dan di masukkan ke dalam jurnal international
scopus dengan minimal grade Q3 sebanyak 2 jurnal. Dan setelah hasil ini dicapai maka
peneliti akan membuat gel ekstrak kulit manggis yang akan dipatenkan ke HAKI.
Indikator capian dapat tercapai setelah 2 jurnal dapat diterima pada jurnal international
55
BAB 4
ROAD MAP PENELITIAN
MC3T3-E1 Osteogenesis
TNFα OSTERIX
CRP Runx2
IL-1 ALP
Xanthone Inflamasi
IL-6 BSP
IL- 10 Coll1α1
Mangosteen
Pericarp
LPS Keterangan :
: menginduksi
: menghambat
: Kandungan / penanda
56
BAB 5
ANGGARAN BIAYA DAN JADWAL PENELITIAN
57
5.2 Jadwal Penelitian
58
5.3 Proyeksi Publikasi Hasil Penelitian
59
DAFTAR PUSTAKA
Hunt KT. 2003. Wound Healing: Current Surgical Diagnosis and Treatment. 12th Ed.,
McGraw-Hills, USA. In: Doherty MG. p75-87
60
Ibelgaufts H. 2002. Wound Healing. Cytokins and Cells Online Pathfinder Encyclopedia.
www.cope.cgi.htm. Accessed on 16 April 2014.
Innis MA, Gelfand DH. 1990. PCR Protocols a Guide to Methods and Applications.
California. Academic Press.
Naqvi AR, Fordham JB, Khan A, Nares S. 2015. microRNAs responsive t o A . a c tin o m
y c e m c o mit a n s a n d P.gingivalis LPS modulate expression of genes regulating
innate immunity in human macrophages. HHS Public Access. I n n a t e I m m u n .
Author manuscript : 540-551. 21
Kent LW, Rahemtulla F, Hockett Jr. RD, Gilleland RC, Michalek SM. 1998. Effect of
Lipopolysaccharide and Inflammatory Cytokines on Interleukin-6 Production by
Healty Human Gingival Fibroblast. U.S. America. American Society for
Microbiology. 66(2) p: 608-614.
Liska-yunitasari. 2011. Gempur 41 Penyakit dengan Buah Manggis : Khasiat dan Cara
Pengolahannya untuk Pengobatan. Yogyakarta: Pustaka Baru Press. Hal 24-34.
61
Kazuhisa Nakashima,2 Xin Zhou,2 Gary Kunkel,3 Zhaoping Zhang, Jian Min Deng,
Richard R. Behringer, and Benoit de Crombrugghe1. The Novel Zinc Finger-
Containing Transcription Factor Osterix Is Required for Osteoblast Differentiation
and Bone Formation. Cell, Vol. 108, 17–29, January 11, 2002.
Yatman E. 2012. Kulit Buah Manggis Mengandung Xanton yang Berkhasiat Tinggi.
Jakarta. Univesitas Borobudur. No. 324. Hal: 2-3.
Ying Cao1, Shu-Fang Jia1, Geetika Chakravarty2, Benoit de Crombrugghe3, and Eugenie
S. Kleinerman1 . 2008. The Osterix Transcription Factor Down-Regulates
Interleukin-1α Expression in Mouse Osteosarcoma Cells. Mol Cancer Res. 2008
January ; 6(1): 119–126. doi:10.1158/1541-7786
Bruderer M, et al. Role and Regulation of RunX2 in Osteogenesis. European Cells and
Materials Vol.282014 (pages 269 - 286) DOI :10.22203/eCM.v028a19) 2014
Kirkham GR and Cartmell SH. Genes and Proteins Involved in the Regulation of
Osteogenesis. Topics in Tissue Engineering, Vol. 3, 2007. Eds. N Ashammakhi, R
Reis & E Chiellini.
Gastelbondo B. Gene expression of collagen type I alpha 2 and its relationship with dental
fluorosis. Journal Oral and Craniofacial Sciences. 2018; 7(6):172-175.
doi:10.17126/joral res.2018.056
62
Lampiran 1. Biodata Ketua Pengusul
A. Identitas diri
B. Riwayat Pendidikan
S-1 Spesialis S-3
Nama Perguruan Universitas Universitas Airlangga Hiroshima
Tinggi Airlangga University
Bidang Ilmu Pendidikan Spesialis Bedah Mulut Oral Health
Dokter Gigi dan Maksilofasial Promotion and
Developmental
Dentistry
Tahun masuk-lulus 1999-2004 2004-2015 2010-2013
Judul Kekuatan Tarik Pengaruh paparan Snail-dependent
skripsi/Thesis/Disertasi Diametral pada rekombinasi protein upregulation of
GIC yang telah Galectin-1 terhadap Galectin-1
kadaluarsa proliferasi sel OM-1 promoted to
complete EMT
process in Snail
Expressing cells
Nama Drg Edhi Arief Prof. Coen Pramono, Prof. Nobuyuki
pembimbing/promotor Sp.KG drg., Sp.BM(K) Kamata
63
C. Pengalaman Penelitian Dalam 5 Tahun Terakhir
No. Tahun Judul Penelitian Pendanaan
Sumber Jml (Juta
Rp)
1 2015 Rancang bangun kit diagnostik DIPA DIT-
oseointegrasi implant dental berbasis LITABMAS
DNA melalui analisis polimorfisme gen
MMP-1
64
12 Bakti Sosial Operasi Bibir Sumbing di SPONSOR 148,320,000
RSUD Tongas - Probolinggo
65
growth factor receptor
family for survival
against 5-fluorouracil Cancer Letters
through NR4A2
induction
66
I. Pengalaman Merumuskan Kebijakan Publik/Rekayasa Sosial lainnya dalam 10
Tahun Terakhir
No. Judul/Tema/Jenis Rekayasa Sosial Tahun Tempat Respon
lainnya yang Telah Ditetapkan Penerapan Masyarakat
1
Semua data yang saya isikan dan tercantum dalam biodata ini adalah benar dan dapat
dipertanggungjawabkan secara hukum. Apabila di kemudian hari ternyata dijumpai ketidak
sesuaian dengan kenyataan, saya sanggup menerima risikonya. Demikian biodata ini saya buat
dengan sebenarnya untuk memenuhi salah satu persyaratan dalam pengajuan Proposal Riset
Mandat Universitas airlangga 2019
67
BIODATA ANGGOTA PENELITI
A. Identitas diri
B. Riwayat Pendidikan
S-1 S-2 S-3
Nama Perguruan Universitas Universitas Universitas
Tinggi Airlangga Airlangga Airlangga
Bidang Ilmu Kedokteran Gigi Ilmu Kesehatan Gigi Ilmu Kedokteran
Tahun masuk-lulus 1989-1995 2001-2004 2007-2011
Judul Pengaruh daya tekan Peran gigi untuk Analisis varian HLA-
skripsi/Thesis/Disertasi hancur pada semen deteksi jenis kelamin DRB1 pada jalur
gypsum Bonded melalui PCR dan imunogenetik sekresi
penentuan usia sIgA saliva sebagai
melalui RST risiko karies gigi
Nama Bob Subijantoro, drg Prof. Indrayana N, Prof. Dr. Harianto
pembimbing/promotor dr.,MS., Notopuro, drg.,MS
SpF(K),DVM
68
DNA odontoblas, Unair
Medical Research Unit, Fakultas
Kedokteran, Universitas Airlangga.
2 2008 : Penentuan usia pada tubulus DIP A PNBP 7
dentin dengan metode Ratio Of Universitas Airlangga.
Sclerosis to Tubulus
sebagai penunjang odontology
forensik.
3 2009 Analisis genotip HLA-DRB1 pada Riset Binaan Ilmu 125
etnis Jawa di Surabaya Pengetahuan dan
Teknologi Kedokteran,
Badan Penelitian Dan
Pengembangan
Penelitian, Departemen
Kesehatan RI
4 2010 Peran Polimorfisme HLA-DRB1 Penelitian Multi Tahun 32,5
Pada Kerentanan Genetik Karies Hibah Bersaing I,
Gigi Melalui Analisis Single Direktorat Pendidikan
Nucleotide Polymorphism ( analisis Tinggi, Departemen
genomik ) Pendidikan Nasional
5 2011 Peran Polimorfisme HLA-DRB1 Penelitian Multi Tahun 35
Pada Kerentanan Genetik Karies Hibah Bersaing II,
Gigi Melalui Analisis Single Direktorat Pendidikan
Nucleotide Polymorphism ( analisis Tinggi, Departemen
proteomik ) Pendidikan Nasional
6 2011 Pemanfaatan Teknologi Phytosome Riset Insentif 200
untuk meningkatkan Kementrian Riset dan
Bioavailabilitas Produk Obat Teknologi.
Herbal
7 2013 Desain Metode diagnosa pre- Penelitian Unggulan 50
symptomatik karies gigi melalui Perguruan Tinggi
analisis jalur imunogenetik sekresi Tahun I
sIgA pada berbagai varian HLA-
DRB1
8 2013 Modulasi Fase Proliferasi Ekstrak Riset Kolaborasi 10
Teripang Emas (Stichopus Dosen-Mahasiswa
Hermanii) Sebagai Terapi FKG UA
Ulkus Mukosa Oral
9 2014 Desain Metode diagnosa pre- Penelitian Unggulan 50
symptomatik karies gigi melalui Perguruan Tinggi
analisis jalur imunogenetik sekresi Tahun II
sIgA pada berbagai varian HLA-
DRB1
10 2014 Efek Anti Inflamasi Ekstrak Riset Kolaborasi 10
Teripang Emas (Stichopus Dosen-Mahasiswa
Hermanii) Sebagai Terapi Ulkus FKG UA
Mukosa Oral
11 2014 Deteksi Α-Amylase Stain Saliva Hibah Penelitian dasar 20
Sebagai FKG UA
Materi Ekstraksi Dna Genomik
Pada
Odontologi Forensik Molekuler
69
12 2016 Rancang Bangun Kit Diagnostik Penelitian Unggulan 65
Karies Gigi Perguruan Tinggi
Berbasis Imunogenetik Melalui
Deteksi Mutasi HLA-DRB1 Ekson
2 Dengan ASO-PCR
70
Kesehatan Dan Peningkatan
Ketrampilan Wirausaha Jamur
Tiram
Kelompok Anak-Anak Tunanetra
7 2016 Pelatihan wirausaha produk pangan BOPTN 30
fungsional Yoghurt Probiotik bagi
Kelompok Lansia Sehat
8 2016 Pelatiahan dan Penyuluhan BPPTNBH 8
Kesehatan Gigi di Pondok
Pesantren Qomarudin Gresik
(Pelatihan dan Penyuluhan
9 2016 Peringatan Dies Natalis UNAIR BPPTNBH 15
tahun 2016
10 2017 Bulan Kesehatan Gigi Indonesia Unilever -
11 2017 Operasi katarak di Kecamatan Kemenko PMK 60
Kedungpring Kab lamongan
12 2017 Operasi katarak di Kecamatan Kemenko PMK 25
Sambeng Kab lamongan
13 2018 Forum Grup Discussion Potensi air Kemenko PMK 25
bersih di Kab Lamongan
14 2018 Revitalisasi Bumi Perkemahan di Kemenko PMK 25
Desa Candisari sambeng lamongan
15 2018 Pendampingan Telemedicine Mandiri 30
Proyek Citarum Harum Sektor 7
Kab Bandung
72
Guided Bone
Regeneration
Membrane
9 The influence Vol 11 No 1 ISSN 1309-100X Journal of
of moderate http://www.jidmr.com Internationa
Exercise on l Dental and
Caspase-3 Medical
Expression In research
Inhibiting
Transformation
of Oral
Squamous
Epithelial Cells
10 Gambaran Vol 3, No 3 (2017): December Majalah
histopatologi https://doi.org/10.22146/majkedgiind.17454 Kedokteran
penyembuhkan Gigi
luka pencabutan Indonesia
gigi pada
makrofag dan
neovaskular
dengan
pemberian
getah batang
pisang ambon
F. Pengalaman Penyampaian Makalah Secara Oral Pada Pertemuan / Seminar Ilmiah Dalam 5
Tahun Terakhir
No Nama Pertemuan Ilmih Judul Artikel Waktu&tempat
1 Hiroshima Confference, Faculty Varian Analysis HLA- 9-10 Oktober 2011
of Dentistry, Hiroshima DRB1 on Hiroshima University,
University Immunogenetic Japan
Pathway of sIgA
Secretion in Saliva as
Dental Caries Risk
2 Seminar Nasional Penelitian Peran Polimorfisme 11 Mei 2011
Hibah Bersaing Direktur Jenderal HLA-DRB1 Pada Surabaya
Pendidikan Tinggi Kementrian Kerentanan Genetik
Pendidikan Nasional Karies Gigi Melalui
Analisis Single
Nucleotide
Polymorphism, ,
3 Asian Conference on Human SNP resulting Manila,Phillpines,Novem
Multidisciplinary Research in in novel mutation of ber 2013
Higher Education 2013 HLA-DRB1 gen for
salivary sIgA secretion
4 East Java Association of Genetic susceptibility Surabaya, 7 Desember
Periodontist Scientific Meeting influencing 2013
osseointegrated dental
implant failure
Scientific Meeting Airlangga – Variant Analysis Of Surabaya, 22 november
5 Kagoshima University HLA-DRB 1 On 2012
73
Immunogenetic
Pathway Of sIga
Secretion In Saliva As
Dental Caries Risk
6 Joint Scientific meeting In Effect Of Dental Surabaya, 2-3 Oktober
Dentistry Health Education 2015
With Audio Media For
Improving
Knowledge And
Attitude Of Dental
Caries On The
Foundation For The
Education Of Blind
Children Surabaya
74
Assessment Of
Cytokine Profile Of
Cd4+ Cells In Patients
With Different Hla-
Drb1 Variants
( Study In Javanesse
Population-Surabaya
Indonesia)
nd
141 2 regional oral biology scientific Deteksi amelogenin Bandung, 3-4 November
meeting dan D21S11 melalui 2017
α-amylase stain saliva
sebagai materi
ekstraksi dna genomic
pada odontology
forensic molekuler
15 Joint Scientific Meeting in Examining The Surabaya, 2-3 Oktober
Dentistry Caries Risk With The 2018
Characteristics Of
Hla Drb1 Gene
75
4 Formula Fitosom dan 2016 Paten(co- No Permohonan
Lipososm Ekstrak Daun inventor) Paten
Ungu Untuk Terapi P 00201608362
Hemorhoid Oral dan
Topikal
5 Varian HLA-DRB1 Pada 2016 Paten (Inventor) No Permohonan
Populasi Jawa di Surabaya Paten
P 00201608899
6 Isolasi DNA genomik dari 2016 Paten(inventor) No Permohonan
stain saliva melalui Paten
pengenalan enzim a- P 00201608900
amilase
J. Penghargaan yang Pernah Diraih dalam 10 tahun Terakhir (dari pemerintah, asosiasi atau
institusi lainnya)
Semua data yang saya isikan dan tercantum dalam biodata ini adalah benar dan dapat
dipertanggungjawabkan secara hukum. Apabila di kemudian hari ternyata dijumpai ketidak
sesuaian dengan kenyataan, saya sanggup menerima risikonya. Demikian biodata ini saya buat
dengan sebenarnya untuk memenuhi salah satu persyaratan dalam pengajuan Proposal Riset
Mandat Universitas airlangga 2019
76
BIODATA ANGGOTA PENELITI
A. Identitas diri
B. Riwayat Pendidikan
S-1 Spesialis S-3
Nama Perguruan Universitas Universitas Airlangga -
Tinggi Airlangga
Bidang Ilmu Kedokteran Gigi Ilmu Bedah Mulut -
dan Maksilofasial
Tahun masuk-lulus
Judul
skripsi/Thesis/Disertasi
Nama
pembimbing/promotor
77
D. Pengalaman Pengabdian masyarakat dalam 5 Tahun terakhir
78
12 Bakti Sosial Operasi Bibir Sumbing di RSUD SPONSOR 148,320,000
Tongas - Probolinggo
SPONSOR
79
E. Pengalaman Penulisan artikel ilmiah dalam jurnal dalam 5 tahun terakhir
F. Pengalaman Penyampaian Makalah Secara Oral Pada Pertemuan / Seminar Ilmiah Dalam 5
Tahun Terakhir
Semua data yang saya isikan dan tercantum dalam biodata ini adalah benar dan dapat
dipertanggungjawabkan secara hukum. Apabila di kemudian hari ternyata dijumpai ketidak
sesuaian dengan kenyataan, saya sanggup menerima risikonya. Demikian biodata ini saya buat
dengan sebenarnya untuk memenuhi salah satu persyaratan dalam pengajuan Proposal Riset
Mandat Universitas airlangga 2019
80
BIODATA ANGGOTA PENELITI
A. Identitas diri
B. Riwayat Pendidikan
S-1 Spesialis S-3
81
M. Publikasi Artikel Ilmiah Dalam Jurnal dalam 5 Tahun Terakhir
No. Tahun Judul Artikel Ilmiah Nama Jurnal Volume/Nomor/Tahun
1 2010 Biochemistry 5/11/2010
Functional roles of 402(1):1-6
biophys res
Cot/Tpl2 in mast cell
commun
responses to
lipopolysaccharide and
FcεRI-clustering.
82
7. 2013 Aging journal
QTL mapping of
1/9/203
leukocyte telomere 5(9):704-16
length in American
Indians: the Strong
Heart Family Study.
8. 2014 Journal
Low intensity pulsed
ultrasound (LIPUS) biological
influences the Chemistry
multilineage
differentiation of 11/4/2014
289(15)/10330-4
mesenchymal stem and
progenitor cell lines
through ROCK-Cot/Tpl2-
MEK-ERK signaling
pathway.
83
12. 2014 PLOS one
MAP3K8 (TPL2/COT)
journal
affects obesity-induced
adipose tissue 24/5/2014
inflammation without 9(2):e89615
systemic effects in
humans and in mice.
84
Differentiation Potency
of Mesenchymal Stem
Cells by Induction in
Nanog Protein
Transcript Levels and
Phosphorylation.
85
Telomere Length in a
Nationally
Representative Sample
of Men Without History
of Prostate Cancer.
86
28. 2019 Journal of Cell 13/9/2019
Low-intensity pulsed
biochemistry 120(9):14657-14669.
ultrasound promotes
bone morphogenic
protein 9-induced
osteogenesis and
suppresses inhibitory
effects of inflammatory
cytokines on cellular
responses via Rho-
associated kinase 1 in
human periodontal
ligament fibroblasts.
29. 2019 Journal of cell
Low intensity pulsed 19/6/2019
ultrasound (LIPUS) signal 62:109345.
maintains osteogenic
potency by the
increased expression
and stability of Nanog
through spleen tyrosine
kinase (Syk) activation.
30. 2019 Candida albicans β- Infection and
Glucan-Containing Immunity 22/5/2019
86(4). pii: e00575-17
Particles Increase HO-1
Expression in Oral
Keratinocytes via a
Reactive Oxygen
Species/p38 Mitogen-
Activated Protein
Kinase/Nrf2 Pathway
87
O. Karya Buku dalam 5 Tahun Terakhir
No. Judul Buku Tahun Jumlah Halaman Penerbit
1
Semua data yang saya isikan dan tercantum dalam biodata ini adalah benar dan dapat
dipertanggungjawabkan secara hukum. Apabila di kemudian hari ternyata dijumpai ketidak
sesuaian dengan kenyataan, saya sanggup menerima risikonya. Demikian biodata ini saya buat
dengan sebenarnya untuk memenuhi salah satu persyaratan dalam pengajuan Proposal Riset
Mandat Universitas airlangga 2019
88
BIODATA ANGGOTA PENELITI
A. Identitas diri
Semua data yang saya isikan dan tercantum dalam biodata ini adalah benar dan dapat
dipertanggungjawabkan secara hukum. Apabila di kemudian hari ternyata dijumpai ketidak
sesuaian dengan kenyataan, saya sanggup menerima risikonya. Demikian biodata ini saya buat
dengan sebenarnya untuk memenuhi salah satu persyaratan dalam pengajuan Proposal Riset
Mandat Universitas airlangga 2019
89
BIODATA ANGGOTA PENELITI
A. Identitas diri
Semua data yang saya isikan dan tercantum dalam biodata ini adalah benar dan dapat
dipertanggungjawabkan secara hukum. Apabila di kemudian hari ternyata dijumpai ketidak
sesuaian dengan kenyataan, saya sanggup menerima risikonya. Demikian biodata ini saya buat
dengan sebenarnya untuk memenuhi salah satu persyaratan dalam pengajuan Proposal Riset
Mandat Universitas airlangga 2019
90
BIODATA ANGGOTA PENELITI
A. Identitas diri
B. Riwayat Pendidikan
S-1 Spesialis S-3
91
D. Publikasi Artikel Ilmiah Dalam Jurnal dalam 5 Tahun Terakhir
No. Tahu Judul Artikel Ilmiah Nama Jurnal Volume/Nomor/Tahu
n n
1. 2007 Apoptosis Signal- Journal of
regulating Kinase (ASK) Biological
2 Functions as a Chemistry
Mitogen-activated 282/10/2007
Protein Kinase Kinase 7522-7531
Kinase in a Heteromeric
Complex with ASK1*
5. 2009 International
ΔNp63α‐dependent
Journal of
expression of Id‐3
Cancer
distinctively suppresses
the invasiveness of 124/12/2009
human squamous cell 2837-2844
carcinoma
92
6. 2010 RHAMM/ERK Laboratory
interaction induces Investigation
proliferative activities
of cementifying fibroma
cells through a 91 : 379-391 (2011)
mechanism based on the
CD44–EGFR
93
10. 2013 Microbiology
Interleukin‐8 and
and
CXCL10 expression in
Immunology
oral keratinocytes and 57/3/2013
fibroblasts via Toll‐like 198-206
receptors
15 2014 Journal of
TMEM16E (GDD1)
. Cellular
Exhibits Protein
Physiology
Instability and Distinct 229/2/2014
Characteristics in 181-190
Chloride Channel/Pore
Forming Ability
94
Keratinocytes and Chemistry
Fibroblasts
95
F. Karya Buku dalam 5 Tahun Terakhir
No. Judul Buku Tahun Jumlah Halaman Penerbit
1
Semua data yang saya isikan dan tercantum dalam biodata ini adalah benar dan dapat
dipertanggungjawabkan secara hukum. Apabila di kemudian hari ternyata dijumpai ketidak
sesuaian dengan kenyataan, saya sanggup menerima risikonya. Demikian biodata ini saya buat
dengan sebenarnya untuk memenuhi salah satu persyaratan dalam pengajuan Proposal Riset
Mandat Universitas airlangga 2019
96
Lampiran 2. Susunan Organisasi Tim Pengusul dan Pembagian Tugas
97
Lampiran 3. Skema Keterkaitan antara isu, strategi dan tema-tema
penelitian
TEMA
Pembuatan Gel Eksrak kulit manggis yang diaplikasikan pada soket bekas pencabutan gigi
OUTCOME
Dapat mengurangi terjadinya resorbsi pada tulang alveolaris yang dapat mendukung
untuk pemasangan dental implan
98
Lampiran 4. Justifikasi Anggaran Penelitian
1. Honorarium
Honor Honor/jam Waktu Minggu Honor per Tahun
(Rp) (Jam/minggu) (Rp)
Tahun ke-1
Ketua 12.270 10 48 5.890.000
Anggota 1 12.270 10 48 3.927.000
Anggota 2 12.270 10 48 3.927.000
Anggota 3 12.270 10 48 3.927.000
Anggota 4 12.270 10 48 3.927.000
Anggota 5 8.166 10 24 1.960.000
Anggota 6 8.166 10 24 1.960.000
Laborat 5.000 10 48 2.400.000
Analis data 5.000 10 7 359.000
Subtotal (Rp) 24.350.000
2. Pembelian bahan habis pakai
Hara Peralatan
Justifikasi Harga
Material Kuantitas Penunjang (Rp)
Pembelian Satuan (Rp)
Tahun ke-1
Pembuatan kulit
Sebagai
buah manggis 5000 gram 500.000 500.000
perlakuan
gel
Kultur Human Jenis sel
Gingival yang 5x 500.000 3.500.000
Fibroblast digunakan
Primer PDGF-B Untuk PCR 2 buah 200.000 400.000
Primer FGF-2 Untuk PCR 2 buah 200.000 400.000
Primer VEGF-A Untuk PCR 2 buah 200.000 400.000
Primer TGF-β1 Untuk PCR 2 buah 200.000 400.000
Kultur Jenis sel
5x 500.000 3.500.000
Osteoblast Cell yang
99
digunakan
Primer IL-1 Untuk PCR 2 buah 200.000 400.000
Primer IL-6 Untuk PCR 2 buah 200.000 400.000
Primer IL-10 Untuk PCR 2 buah 200.000 400.000
Primer TNF-α Untuk PCR 2 buah 200.000 400.000
Primer CRP Untuk PCR 2 buah 200.000 400.000
Primer RunX2 Untuk PCR 2 buah 200.000 400.000
Primer OSX Untuk PCR 2 buah 200.000 400.000
Primer BSP Untuk PCR 2 buah 200.000 400.000
Primer ALP Untuk PCR 2 buah 200.000 400.000
Primer Col1α Untuk PCR 2 buah 200.000 400.000
Pemeriksaan
PCR 4x2 reaksi 500.000 4.000.000
PCR
Medium
DMEM 8 liter 500.000
untuk sel 4.000.000
Nutrisi untuk
FBS 5% 400 ml 6.000.000 6.000.000
medium
Washing
PBS PH 7,4 4 liter 100.000 400.000
Agent
Antibiotik Antibiotik
Penicillin untuk 50 ml 300.000 300.000
Streptomycin medium
Pemeriksaan
Rneasy mini kit 1 – kit 17.000.000 17.000.000
PCR
Pemeriksaan
PCR kit 1- kit 3.000.000 3.000.000
PCR
Gel Pemeriksaan
500.000 500.000
Elektroforesis PCR
dH2O Sterile water 10 liter 100.000 100.000
Glass dan Cover
Kultur sel 200 biji 10.000 2.000.000
glass
Subtotal (Rp) 50.400.000
Perjalanan Justifikasi Kuantitas Harga
100
Perjalanan Satuan (Rp) Tahun ke-1
Perjalanan 2 orang 7.500.000 15.000.000
Administrasi 2.000.000 2.000.000
Etical Clearence 1.500.000 1.500.000
Akomodasi 1.500.000 1.500.000
Konsumsi 1.00.000 1.000.000
Pengolahan data 750.000 750.000
Laporan dan
500.000 500.000
penggandaan
Publikasi 3.000.000 3.000.000
Subtotal (Rp) 25.250.000
TOTAL ANGGARAN YANG DIPERLUKAN 100.000.000
SETIAP TAHUN (Rp)
TOTAL ANGGARAN YANG DIPERLUKAN
100.000.000
SELURUHNYA (Rp)
101
Lampiran 5: Surat Pernyataan Ketua Peneliti
Dengan ini Mengajukan Proposal Hibah Riset Mandat Universitas Airlangga dengan judul:
“ Preservasi residual ridge tulang alveolaris melalui induksi mangosteen pericarp “
saya sebagai Ketua peneliti menyatakan bahwa :
1. Saya bersedia menjadi Ketua/anggota peneliti dengan meluangkan waktu selama
200 jam / bulan untuk melakukan riset termasuk mpnev dan presentasi hasilnya
2. Saya bersedia menyerahkan bukti submit ke Jurnal Internasional terindeks
SCOPUS selambat-lambatnya tanggal 29 Desember 2019 dan paling lambat 15
Agustus 2020 bukti Accepted 5 paper
3. Proposal riset yang saya ajukan diatas belum pernah dibiayai dan tidak sedang
diajukan untuk dibiayai oleh instansi lain.
4. Proposal riset yang saya ajukan diatas tidak mengandung plagiasi atau autoplagiasi
serta pengulangan riset yang telah dilakukan.
Demikianlah pernyataan ini saya buat dengan sesungguhnya dan bersedia mengembalikan
dana riset yang telah saya gunakan apabila terbukti bahwa pernyataan saya diatas tidak
benar.
meterai
Materai 6000
102
SURAT PERNYATAAN ANGGOTA PENELITI
NIDN : 00221169003
Demikianlah pernyataan ini saya buat dengan sesungguhnya dan bersedia mengembalikan
dana riset yang telah saya gunakan apabila terbukti bahwa pernyataan saya diatas tidak
benar.
Surabaya, 29 Juli 2019
Yang Menyatakan,
meterai
Materai 6000
103
SURAT PERNYATAAN ANGGOTA PENELITI
NIDN : 0029128404
Dengan ini Mengajukan Proposal Hibah Riset Mandat Universitas Airlangga dengan judul:
“ Preservasi residual ridge tulang alveolaris melalui induksi mangosteen pericarp “
saya sebagai peneliti menyatakan bahwa :
1. Saya bersedia menjadi anggota peneliti dengan meluangkan waktu selama 200 jam
/ bulan untuk melakukan riset termasuk mpnev dan presentasi hasilnya
2. Saya bersedia menyerahkan bukti submit ke Jurnal Internasional terindeks
SCOPUS selambat-lambatnya tanggal 29 Desember 2019 dan paling lambat 15
Agustus 2020 bukti Accepted 5 paper
3. Proposal riset yang saya ajukan diatas belum pernah dibiayai dan tidak sedang
diajukan untuk dibiayai oleh instansi lain.
4. Proposal riset yang saya ajukan diatas tidak mengandung plagiasi atau autoplagiasi
serta pengulangan riset yang telah dilakukan.
Demikianlah pernyataan ini saya buat dengan sesungguhnya dan bersedia mengembalikan
dana riset yang telah saya gunakan apabila terbukti bahwa pernyataan saya diatas tidak
benar.
meterai
Materai 6000
104
SURAT PERNYATAAN ANGGOTA PENELITI
NIDN : 00221169003
Jabatan : Mahasiswa
Dengan ini Mengajukan Proposal Hibah Riset Mandat Universitas Airlangga dengan judul:
“ Preservasi residual ridge tulang alveolaris melalui induksi mangosteen pericarp “
saya sebagai peneliti menyatakan bahwa :
1. Saya bersedia menjadi anggota peneliti dengan meluangkan waktu selama 200 jam
/ bulan untuk melakukan riset termasuk mpnev dan presentasi hasilnya
2. Saya bersedia menyerahkan bukti submit ke Jurnal Internasional terindeks
SCOPUS selambat-lambatnya tanggal 29 Desember 2019 dan paling lambat 15
Agustus 2020 bukti Accepted 5 paper
3. Proposal riset yang saya ajukan diatas belum pernah dibiayai dan tidak sedang
diajukan untuk dibiayai oleh instansi lain.
4. Proposal riset yang saya ajukan diatas tidak mengandung plagiasi atau autoplagiasi
serta pengulangan riset yang telah dilakukan.
Demikianlah pernyataan ini saya buat dengan sesungguhnya dan bersedia mengembalikan
dana riset yang telah saya gunakan apabila terbukti bahwa pernyataan saya diatas tidak
benar.
meterai
Materai 6000
105
SURAT PERNYATAAN ANGGOTA PENELITI
NIDN : 02141133045
Jabatan : Mahasiswa
Dengan ini Mengajukan Proposal Hibah Riset Mandat Universitas Airlangga dengan judul:
“ Preservasi residual ridge tulang alveolaris melalui induksi mangosteen pericarp “
saya menyatakan bahwa :
1. Saya bersedia menjadi anggota peneliti dengan meluangkan waktu selama 200 jam
/ bulan untuk melakukan riset termasuk mpnev dan presentasi hasilnya
2. Saya bersedia menyerahkan bukti submit ke Jurnal Internasional terindeks
SCOPUS selambat-lambatnya tanggal 29 Desember 2019 dan paling lambat 15
Agustus 2020 bukti Accepted 5 paper
3. Proposal riset yang saya ajukan diatas belum pernah dibiayai dan tidak sedang
diajukan untuk dibiayai oleh instansi lain.
4. Proposal riset yang saya ajukan diatas tidak mengandung plagiasi atau autoplagiasi
serta pengulangan riset yang telah dilakukan.
Demikianlah pernyataan ini saya buat dengan sesungguhnya dan bersedia mengembalikan
dana riset yang telah saya gunakan apabila terbukti bahwa pernyataan saya diatas tidak
benar.
meterai
Materai 6000
106
SURAT PERNYATAAN ORIGINILITAS
Menyatakan bahwa saya tidak melakukan plagiat dalam penelitan saya yang berjudul :
Apabila suatu saat nanti terbukti melakukan plagiat maka saya akan menerima sanksi yang
telah ditetapkan.
Demikian surat pernyataan ini saya buat dengan sebenar-benarnya
meterai
Materai 6000
107