Lokakarya Nasional Usaha Ternak Kerbau Mendukung Program Kecukupan Daging Sapi

SELEKSI PADA TERNAK KERBAU BERDASARKAN NILAI

PEMULIAAN
EKO HANDIWIRAWAN

Pusat Penelitian dan Pengembangan Peternakan

Jl. Raya Pajajaran Kav E-59, Bogor 16151
e-mail : eh_wirawan@yahoo.com

ABSTRAK

Seleksi dilaksanakan dengan maksud untuk mendapatkan kemajuan genetik pada generasi selanjutnya
dan memperoleh populasi ternak yang lebih seragam. Sampai saat ini belum pernah dilakukan seleksi secara
sistematis dan terencana baik pada ternak kerbau di Indonesia. Seleksi pada kerbau Indonesia sebenarnya
akan mudah dilakukan karena adanya variasi individu yang sangat besar. Penerapan metode seleksi pada
ternak kerbau dapat dilakukan dengan cara seperti yang biasa dikerjakan pada sapi potong atau sapi perah.
Namun demikian sebagaimana seleksi yang dilakukan pada sapi potong dan sapi perah, sistem rekording data
yang akurat dan pengumpulan data yang teratur dengan jumlah contoh yang mencukupi merupakan hal pokok
yang perlu dibangun dengan baik agar pengolahan dan analisis data yang dilakukan dapat menghasilkan
informasi yang dapat dipercaya. Sifat yang dipilih harus dibuat minimal karena tiap sifat yang disertakan
dalam seleksi akan mengurangi intensitas seleksi yang dimungkinkan untuk sifat lain. Beberapa kriteria
seleksi yang disarankan digunakan untuk kerbau meliputi angka reproduksi, kecepatan pertumbuhan atau
berat pada umur tertentu, kualitas karkas, kekuatan dan daya tahan kerja serta temperamen. True breeding
value dari ternak tidak dapat diketahui, yang dapat dilakukan adalah menghitung estimated breeding value
(EBV) berdasarkan petunjuk performans (nilai fenotipik) yang ada pada ternak itu sendiri, saudara, progeni
atau tetuanya. Kecermatan pendugaan EBV tersebut dipengaruhi oleh (1) jumlah catatan, (2) heritabilitas, (3)
ripitabilitas dan (4) hubungan silsilah/kekerabatan. Metode Best Linear Unbiased Prediction (BLUP) dapat
menghitung EBV dengan menggunakan data dari kelompok ternak yang berasal dari farm atau ranch yang
berbeda atau dari dekade yang berbeda.

Kata kunci: Kerbau, seleksi, nilai pemuliaan

PENDAHULUAN Perbaikan mutu genetik ternak pada

Sumbangan sangat besar telah diberikan
oleh Robert Bakewell (1725-1795) sebagai
pionir besar dalam penerapan ilmu pemuliaan
ternak (JOHANSSON dan RENDEL, 1966),
sehingga saat ini teori tentang pemuliaan
ternak telah mengalami banyak sekali
kemajuan. Sifat-sifat produksi beberapa jenis
ternak telah mengalami kemajuan yang sangat
mengesankan dengan aplikasi ilmu pemuliaan
ternak. Pertambahan bobot badan dan efisiensi
pakan yang telah dicapai saat ini pada ternak
broiler demikian pula produksi telur pada
layer merupakan contoh kemajuan yang cukup
mengesankan dalam bidang pemuliaan ternak.
Kapasitas produksi berbagai komoditas ternak
yang ada saat ini jelas sangat jauh mengalami
perbaikan dibandingkan ketika belum
“tersentuh” ilmu pemuliaan.
umumnya dapat dilakukan dengan jalan
seleksi dan persilangan. Dengan seleksi
generasi berikutnya akan memiliki frekuensi
gen yang lebih seragam sesuai dengan arah
yang dikehendaki pemulia, sebaliknya
persilangan menyebabkan penambahan variasi
gen pada generasi selanjutnya. Walaupun
nampaknya saling bertolak belakang namun
keduanya dapat diarahkan untuk membentuk
populasi yang memiliki mutu genetik lebih
baik dari sebelumnya yang ditunjukkan
dengan penampilan sifat-sifat produksi dari
sebelumnya. Dalam prakteknya seleksi dan
persilangan dapat berjalan bersama-sama
secara berkesinambungan tidak dilakukan
secara terpisah, seperti dilakukan pada
pembentukan bangsa ternak baru misalnya.
HARDJOSUBROTO (1994) mengemukakan
bahwa seleksi adalah suatu tindakan untuk
memilih ternak yang dianggap mempunyai

79
 Lokakarya Nasional Usaha Ternak Kerbau Mendukung Program Kecukupan Daging Sapi
mutu genetik baik untuk dikembangbiakkan
lebih lanjut serta memilih ternak yang
dianggap kurang baik untuk disingkirkan dan
tidak dikembangbiakkan lebih lanjut.
Tindakan pemulia untuk menentukan ternak-
ternak mana yang boleh bereproduksi dan
menghasilkan generasi selanjutnya dikatakan
sebagai seleksi buatan. Di samping seleksi
buatan, secara simultan sebenarnya juga
bekerja seleksi alam, yaitu seleksi yang
bekerja akibat pengaruh kekuatan-kekuatan
alam untuk menentukan ternak-ternak mana
yang akan dapat bereproduksi selanjutnya.
Seleksi alam didasarkan kepada daya adaptasi
ternak terhadap pengaruh lingkungan dan pada
umumnya mengakibatkan perubahan yang
sangat lambat.
Seleksi buatan dilakukan pemulia
berdasarkan keunggulan yang dimiliki ternak
sesuai dengan keinginan dan kebutuhan
manusia/pasar. Hal ini dilakukan untuk
mempercepat perubahan mutu genetik ternak.
Ukuran mutu genetik ternak yang diperguna-
kan sebagai pegangan dalam melakukan
seleksi, salah satunya adalah Nilai Pemuliaan
(Breeding Value) ternak yang bersangkutan.
Nilai Pemuliaan adalah penilaian dari mutu
genetik ternak untuk suatu sifat tertentu, yang
diberikan secara relatif atas dasar kedudukan-
nya di dalam populasinya (HARDJOSUBROTO,
1994).
Sampai saat ini belum pernah dilakukan
seleksi secara sistematis dan terencana baik
pada ternak kerbau di Indonesia. Seleksi pada
kerbau Indonesia sebenarnya akan mudah
dilakukan karena variasi individu kerbau di
Indonesia sangat besar dalam hal konformasi
bentuk tubuh, produksi daging, pertumbuhan,
temperamen dan produksi susu
(HARDJOSUBROTO, 1994). Penerapan metode
seleksi pada ternak kerbau dapat dilakukan
dengan cara seperti yang biasa dikerjakan
pada sapi potong atau sapi perah. Dalam
makalah ini akan dibahas metode seleksi
berdasarkan nilai pemuliaan yang dapat
diterapkan pada kerbau seperti yang
diterapkan pada sapi potong dan sapi perah.
Namun demikian sebagaimana seleksi yang
dilakukan pada sapi potong dan sapi perah,
rekording data yang akurat dan pengumpulan
data yang teratur dengan jumlah contoh yang
mencukupi merupakan hal pokok yang perlu
dibangun dengan baik agar pengolahan dan
80
analisis data yang dilakukan dapat
menghasilkan informasi yang dapat dipercaya.
PENGARUH SELEKSI TERHADAP
KEMAJUAN GENETIK
Fungsi seleksi adalah mengubah frekuensi
gen, di mana frekuensi gen-gen yang diingin-
kan akan meningkat sedangkan frekuensi gen-
gen yang tidak diinginkan akan menurun.
Perubahan frekuensi gen-gen ini tentunya
akan mengakibatkan rataan fenotipe dari
populasi terseleksi akan lebih baik dibanding-
kan dari rataan fenotipe populasi sebelumnya.
Perbedaan antara rataan performans dari
ternak yang terseleksi dengan rataan
performans populasi sebelum diadakannya
seleksi disebut sebagai diferensial seleksi,
yang dinyatakan dengan rumus (BECKER,
1985; HARDJOSUBROTO,1994):
S = XS - X
di mana :
S = diferensial seleksi
X = rataan fenotipe populasi
XS = rataan fenotipe sesudah adanya
seleksi
Ada beberapa faktor yang mempengaruhi
nilai diferensial seleksi, yaitu (1) pada seleksi
untuk satu sifat, semakin sedikit ternak yang
dipilih semakin besar diferensial seleksinya;
(2) diferensial seleksi dapat lebih besar pada
kelompok ternak dengan jumlah yang besar,
sebab pada populasi yang besar akan semakin
besar pula kemungkinan dijumpai ternak-
ternak yang performansnya di atas atau di
bawah rataan; (3) diferensial seleksi pada
ternak jantan lebih tinggi daripada ternak
betina, karena ternak jantan memiliki potensi
untuk menghasilkan lebih banyak keturunan
dibandingkan ternak betina (NOOR, 1996).
Tidak seluruhnya perbedaan performans
diturunkan ke generasi selanjutnya, proporsi
dari diferensial seleksi yang dapat diwariskan
kepada generasi berikutnya adalah hanya yang
bersifat genetik saja, yaitu sebesar angka
pewarisannya (heritabilitas). Dengan demi-
kian besarnya diferensial seleksi yang
diwariskan yang merupakan tanggapan seleksi
yang akan muncul pada generasi berikutnya
adalah sebesar (HARDJOSUBROTO, 1994;
FALCONER dan MACKAY, 1996):
 Lokakarya Nasional Usaha Ternak Kerbau Mendukung Program Kecukupan Daging Sapi
R = h2 . S
di mana :
R = tanggapan seleksi atau tanggapan
seleksi per generasi
h2 = heritabilitas sifat yang diseleksi
S = diferensial seleksi
Rumus di atas hanya dapat digunakan
untuk menghitung tanggapan seleksi sebagai
akibat dari seleksi yang telah atau sedang
dilakukan sekarang dan tidak dapat digunakan
untuk keperluan perencanaan, karena sukar
untuk menghitung nilai S. Untuk suatu
perencanaan maka tanggapan seleksi dapat
dihitung dengan rumus (HARDJOSUBROTO,
1994; FALCONER dan MACKAY, 1996) :
R = i.h2.σp
di mana :
i = intensitas seleksi = S/σp
σp = simpangan baku dari fenotipe
Untuk menghitung tanggapan seleksi per
tahun maka rumus di atas harus dibagi dengan
interval generasinya (=l). Interval generasi
adalah rataan umur tetua pada saat anak
dilahirkan (HARDJOSUBROTO, 1994;
FALCONER dan MACKAY, 1996).
i.h2.σp
R=
l yang dapat dipertimbangkan dalam program
Dari persamaan di atas maka dapat
diketahui bahwa tanggapan seleksi atau
kemajuan genetik akibat seleksi dipengaruhi
oleh (1) akurasi/kecermatan seleksi; (2)
intensitas seleksi; (3) variasi genetik; dan (4)
interval generasi (BOURDON, 1997).
Kecermatan seleksi sangat berkaitan langsung
dengan nilai heritabilitas. Menurut WARWICK
et al. (1990) beberapa cara yang dapat
dilakukan untuk menaikkan kecermatan
seleksi adalah (1) membakukan prosedur
pengelolaan semaksimal mungkin dan
membuat penyesuaian terhadap pengelolaan
atau lingkungan yang tidak mungkin
dikendalikan (mengurangi ragam lingkungan);
(2) jika memungkinkan, melakukan peng-
ukuran berulang terhadap suatu sifat; dan (3)
penggunaan informasi performans individu
dan saudara secara optimal. Intensitas seleksi
yang tinggi, populasi yang sangat bervariasi
dan interval generasi yang lebih pendek dapat
meningkatkan laju kemajuan genetik. Idealnya
keempat faktor tersebut dibuat maksimal
untuk mempertinggi kemajuan genetik, yaitu
kecermatan seleksi, intensitas seleksi dan
variasi genetik dimaksimalkan dan interval
generasi dibuat minimal. Namun demikian
tidak mungkin semua faktor dibuat maksimal
karena perubahan pada satu faktor terkadang
mempengaruhi faktor yang lain (BOURDON,
1997). Dengan demikian, yang dapat
dilakukan adalah menentukan kombinasi
terbaik dari keempat faktor tersebut yang
dapat memperoleh kemajuan genetik yang
optimal.
Saling keterkaitan keempat faktor tersebut
dalam menentukan kemajuan genetik telah
dijelaskan oleh BOURDON (1997).
Pengurangan interval generasi biasanya
menyebabkan pengurangan/penurunan
kecermatan seleksi. Hal ini disebabkan hanya
sedikit catatan (catatan progeni) tersedia yang
dapat dipergunakan dalam membuat
prediksi/pendugaan genetik. Intensitas seleksi
yang sangat tinggi bagi ternak pengganti akan
menyebabkan banyak ternak yang
dipertahankan di dalam populasi sehingga
interval generasi akan menjadi panjang.
Seleksi seharusnya ditujukan kepada sifat-
sifat yang betul-betul penting ditinjau dari
segi ekonomi. Tabel 1 menunjukkan daftar
sejumlah sifat dari sapi potong dan sapi perah
seleksi. Dalam praktek, seleksi sering tidak
hanya ditujukan kepada satu sifat saja tetapi
dilakukan terhadap beberapa macam sifat.
Beberapa macam sifat tersebut terkadang
dianggap sama-sama pentingnya dalam segi
ekonomi sehingga harus dilakukan semuanya.
Walaupun demikian perlu dipahami bahwa
seleksi secara simultan terhadap beberapa
sifat dapat menurunkan diferensial seleksinya
sehingga sifat mana yang dipilih harus
dipertimbangkan secara seksama. Jumlah sifat
yang dipilih harus dibuat minimal karena tiap
sifat yang disertakan dalam seleksi akan
mengurangi intensitas seleksi yang
dimungkinkan untuk sifat lain. Ada tiga cara
untuk melakukan seleksi terhadap beberapa
macam sifat yang dapat dijalankan secara
tunggal atau kombinasi dari cara-cara
tersebut. Ketiga cara tersebut adalah (1)
memilih satu sifat sampai pada tingkat
perbaikan yang diinginkan, kemudian baru
memilih sifat yang kedua, demikian
seterusnya (Tandem Selection); (2) memilih
81
 Lokakarya Nasional Usaha Ternak Kerbau Mendukung Program Kecukupan Daging Sapi
individu-individu yang mencapai tingkat
minimal yang ditentukan untuk masing-
masing sifat dan semua individu di bawah
tingkat yang ditentukan untuk setiap sifat akan
disisihkan dengan tidak memandang kelebihan
pada sifat yang lain (Independent Culling
Levels); (3) menggabungkan semua informasi
Tabel 1. Daftar sifat-sifat yang mungkin dipertimbangkan dalam program seleksi
Jenis ternak Sifat-sifat obyektif
Sapi perah Produksi susu per laktasi
Produksi susu selama hidup
% lemak
% bahan kering tanpa lemak
Lama memerah (mesin)
Bobot lahir, dan pada umur-umur berbeda sampai
dewasa
Besar badan (ukuran tubuh)
Umur saat pubertas
Jarak beranak
Sapi potong Umur saat pubertas
Keteraturan beranak
Bobot lahir
Bobot sapih
Laju pertumbuhan pasca sapih
Konversi pakan
Bobot dewasa & besar kerangka
Kualitas karkas
Kemampuan kerja (kekuatan menarik dan kecepatan)
Sumber: WARWICK et al. (1990)
Untuk kerbau, HARDJOSUBROTO (1994)
menyarankan beberapa kriteria seleksi yang
dapat digunakan yaitu meliputi angka
reproduksi, kecepatan pertumbuhan atau berat
pada umur tertentu, kualitas karkas, kekuatan
dan daya tahan kerja serta temperamen.
Apabila kriteria pemilihan berdasarkan
kekuatan dan daya tahan kerja sukar dilakukan
maka disarankan berdasarkan berat badan pada
umur tertentu, karena ada alasan kuat
mengatakan bahwa kekuatan kerja kerbau
dipengaruhi oleh besarnya tubuh.
NILAI PEMULIAAN
Nilai Pemuliaan dari seekor ternak adalah
sebuah gambaran nilai gen-gen ternak yang
bersangkutan untuk keturunannya (KINGHORN,
82
dari semua sifat dari suatu individu ke dalam
suatu skor atau penilaian keseluruhan untuk
digunakan sebagai dasar untuk memilih atau
menyisihkan ternak (Index Selection)
(WARWICK et al., 1990; HARDJOSUBROTO,
1994).
Sifat-sifat subyektif
Bentuk tubuh
Ketiadaan cacat
Mudah diperah (dengan tangan)
Tabiat
Kekuatan (vigor)
Tidak ada kesulitan beranak
Bentuk tubuh
Ketiadaan cacat
Tidak ada kesulitan beranak
Libido
Tabiat
Bentuk karkas
Kekuatan (vigor)
1992). Seleksi dilaksanakan biasanya
bertujuan untuk memilih tetua yang memiliki
Nilai Pemuliaan paling tinggi dari semua
ternak yang tersedia, supaya keturunan dari
tetua yang terseleksi mencapai rataan
performans setinggi mungkin. Seandainya
dapat diketahui secara pasti Nilai Pemuliaan
sebenarnya (true breeding value) dari setiap
ternak maka tujuan tersebut dapat dicapai
secara efisien dengan meranking ternak-
ternak menurut true breeding value tersebut
dan memilih dari daftar teratas.
Namun demikian, dalam praktek true
breeding value dari ternak-ternak tersebut
tidak diketahui, yang ada hanya satu atau
lebih petunjuk untuk true breeding value itu.
Petunjuk itu terdiri dari satu atau lebih ukuran
performans (nilai fenotipik) yang ada pada
 Lokakarya Nasional Usaha Ternak Kerbau Mendukung Program Kecukupan Daging Sapi
ternak itu sendiri atau pada saudaranya.
Dengan menggunakan petunjuk-petunjuk
tersebut dapat diperkirakan true breeding
value dari setiap ternak dan kemudian ternak-
ternak tersebut dapat diranking menurut
estimated breeding value (EBV). Dengan
meranking ternak menurut EBV maka
sebenarnya telah cenderung meranking ternak-
ternak tersebut menurut true breeding value.
Lebih akurat perkiraan true breeding value
tersebut maka lebih akurat ranking yang telah
dibuat tersebut (NICHOLAS, 1987).
Rumus umum untuk menghitung perkiraan
Nilai Pemuliaan dari sumber informasi tunggal
menurut BOURDON (1997) adalah :
I = b.x
di mana :
I = nilai indeks (predicted
value)
b = koefisien regresi
x = (PI - P) = deviasi dari
rataan contemporary
Nilai indeks (I) adalah Nilai Pemuliaan
dugaan yang terdiri dari beberapa bentuk,
biasanya berupa Estimated Breeding Value
(EBV), Expected Progeny Difference (EPD)
atau Most Probable Producing Ability
(MPPA). Koefisien regresi (b) merupakan
regresi dari true value (BV, PD atau PA) atas
evidence (fakta) yang mengukur perubahan
(expected) true value per unit perubahan
evidence. Nilai koefisien regresi tergantung
pada sumber informasi catatan produksi dan
metode prediksi Nilai Pemuliaan.
HARDJOSUBROTO (1994) memberikan
pengertian dari istilah EBV, EPD dan MPPA.
Estimated Breeding Value (EBV) atau Nilai
Pemuliaan dugaan adalah hasil pendugaan dari
Nilai Pemuliaan yang sesungguhnya yang
dihitung berdasarkan atas performans individu
dan keluarga dekatnya dibandingkan dengan
performans populasinya. Expected Progeny
Difference (EPD) atau Ramalan Beda Produksi
adalah ramalan perbedaan antara performans
di kelak kemudian hari dari anak seekor
pejantan bila dibandingkan dengan
performans populasinya. Most Probable
Producing Ability (MPPA) atau Penduga
Kemampuan Berproduksi adalah suatu
pendugaan dari produksi ternak di masa
mendatang yang didasarkan atas produksi
sekarang dan di masa yang lalu.
Sumber informasi untuk menghitung Nilai
Pemuliaan
Dalam menduga Nilai Pemuliaan seekor
ternak, ada empat macam sumber informasi
yang dapat dipergunakan, yaitu (1) fenotipe
individu itu sendiri; (2) fenotipe saudara
kolateral; (3) fenotipe anak keturunannya;
dan (4) fenotipe tetuanya (HARDJOSUBROTO,
1994). Dengan rumus umum I = b.x,
BOURDON (1997) memberikan contoh rumus
koefisien regresi yang dipakai untuk
menghitung Nilai Pemuliaan dari sumber
informasi tunggal (catatan individu, catatan
saudara kolateral dan catatan progeni) seperti
terlihat pada Tabel 2.
Berdasarkan Tabel 2 tersebut dapat
diambil contoh jika akan dihitung EBV
seekor induk sapi perah dari n catatan dirinya
sendiri, maka rumusnya adalah :
I = b.x
nh 2
EBV = . (PI - P)
1 + (n − 1)r
di mana :
h2 = heritabilitas
r = ripitabilitas
PI = rataan catatan produksi ternak
yang sedang diduga
P = rataan produksi populasi
Demikian juga untuk pendugaan yang lain
berlaku aturan seperti contoh di atas.
83
 Lokakarya Nasional Usaha Ternak Kerbau Mendukung Program Kecukupan Daging Sapi

Tabel 2. Contoh rumus koefisien regresi yang dipakai untuk menghitung nilai pemuliaan dari
sumber informasi tunggal dan kecermatannya
Pendugaan Sumber Koefisien regresi (b) Kecermatan
(I) informasi (x)
EBV Catatan tunggal h2 h
individu
EBV Rataan n catatan nh 2
dari individu nh 2
1 + (n − 1)r 1 + (n − 1)r
MPPA Rataan n catatan nr
dari individu
nr
1 + (n − 1)r 1 + (n − 1)r
EBV Rataan catatan mh 2
tunggal dari m
1 2
mh
half sib 4 + (m − 1)h 2 4
4 + (m − 1)h 2
EPD Rataan catatan 1
tunggal dari m mh 2
half sib 2
4 + (m − 1)h 2
EBV Rataan catatan
tunggal dari m
1 2
mh
full sib 2
2 + (m − 1)( h 2 + 2c FS
2
)
EBV Rataan catatan 2 ph 2
tunggal dari p
progeni 4 + ( p − 1)h 2
EPD Rataan catatan ph 2
tunggal dari p ph 2
progeni 4 + ( p − 1) h 2 4 + ( p − 1) h 2
EBV Rataan catatan
progeni tunggal
2lkh2 lkh2
dari l litter dari 4+(k −1)(2h2 +4cFS
2
) +(l −1)kh2 4 + (k − 1)(2h2 + 4cFS
2
) + (l − 1)kh2
sebanyak k anak
EBV Rataan n catatan 1 1
masing-masing ph 2 ph 2
dari p progeni 2 4
1 + ( n − 1) r h2 1 + ( n − 1) r h2
+ ( p − 1) + ( p − 1)
n 4 n 4
Sumber: BOURDON (1997)

Pendugaan Nilai Pemuliaan atas dasar P = rataan performans populasi

sumber informasi performans dari tetuanya
(seleksi silsilah) dapat dilakukan dengan
rumus berikut (HARDJOSUBROTO, 1994):
NP = 1/2 h2 (PD - P) + 1/2 h2 (PS - P)
di mana :
PS = performans bapaknya
PD = performans induknya
Seandainya tidak tersedia informasi dari
kedua tetuanya maka informasi dari nenek,
kakek, terus ke atas dapat digunakan tetapi
dengan merubah koefisien di depan h2 sesuai
dengan hubungan individu tersebut dengan
moyangnya tersebut. Hubungan individu
dengan kedua tetua (parent) adalah 1/2,

84
 Lokakarya Nasional Usaha Ternak Kerbau Mendukung Program Kecukupan Daging Sapi

dengan kakek dan neneknya (grandparent) tersebut (KINGHORN, 1992). Sebagai contoh,
adalah 1/4, dengan buyut (grade seandainya dua ekor ternak mempunyai
grandparent) adalah 1/8 demikian EBV yang sama tetapi kecermatan EBV satu
seterusnya makin jauh makin rendah, yang ekor ternak lebih tinggi dibandingkan yang
mencerminkan sumbangan darah dari lain maka masih dianggap bahwa dua ekor
moyangnya tersebut. Dengan demikian ternak tersebut mempunyai genetik yang
contoh rumus Nilai Pemuliaan seekor ternak sama. Walaupun demikian, ada resiko yang
dengan menggunakan informasi dari induk lebih besar bahwa true breeding value dari
dan neneknya adalah (HARDJOSUBROTO, ternak dengan kecermatan EBV lebih rendah
1994): secara signifikan lebih rendah daripada yang
diharapkan/diperkirakan dibandingkan
NP = 1/2 h2 (PD - P) + 1/4 h2 (PN - P)
ternak satunya.
di mana :
Banyak faktor yang mempengaruhi
PN = performans neneknya
kecermatan pendugaan seperti terlihat pada
Kedua rumus pendugaan Nilai rumus dalam Tabel 2. Faktor-faktor tersebut
Pemuliaan dari informasi silsilah di atas sama dengan faktor yang mempengaruhi
ditulis dalam bentuk yang telah koefisien regresi yaitu (1) jumlah catatan,
disederhanakan. (2) heritabilitas, (3) ripitabilitas dan (4)
Kecermatan pendugaan nilai pemuliaan hubungan silsilah/kekerabatan. Pengaruh
(accuracy prediction) menunjukkan keempat faktor tersebut terhadap kecermatan
keterandalan (reliability) dari pendugaan pendugaan Nilai Pemuliaan dapat dilihat
tersebut, kecermatan tidak dapat dipakai dengan jelas pada Tabel 3.
untuk memperbaiki kebenaran pendugaan

Tabel 3. Kecermatan pendugaan nilai pemuliaan dari sumber informasi tunggal

Sumber Hubungan Jumlah Heritabilitas
informasi kekerabatan catatan 0,05 0,30 0,70
Individu 1,00 1 0,22 0,55 0,84
Half sib 0,25 1 0,06 0,14 0,21
10 0,17 0,33 0,41
20 0,22 0,39 0,45
100 0,37 0,47 0,49
1.000 0,48 0,49+ 0,49+
Progeni 0,50 1 0,11 0,27 0,42
10 0,34 0,67 0,82
20 0,45 0,79 0,90
100 0,75 0,94 0,98
1.000 0,96 0,99 0,99+
Sumber: BOURDON (1997)

Dari Tabel 3 terlihat bahwa makin tinggi
nilai heritabilitas maka kecermatan pendugaan
makin meningkat, hal ini dikarenakan
heritabilitas mengukur kekuatan hubungan di
antara Nilai Pemuliaan dengan nilai fenotipe.
Kecermatan pendugaan paling tinggi diperoleh
dari penggunaan catatan individu, selanjutnya
catatan progeni dan kemudian catatan half sib.
Hal ini berhubungan dengan proporsi gen yang
dikandung dari sumber informasi untuk
pendugaan. Semakin banyak jumlah catatan,
kecermatan terlihat semakin lebih baik. Dapat
dilihat pula bahwa jika heritabilitas tinggi,
maka catatan performans individu merupakan
petunjuk yang baik dari Nilai Pemuliaannya
karena memiliki kecermatan yang tinggi
(0,84). Catatan progeni merupakan sumber
informasi yang sangat berharga karena
dengan jumlah catatan yang cukup,
kecermatan pendugaan Nilai Pemuliaan
mampu melebihi kecermatan pendugaan
dengan sumber informasi catatan performans

85
 Lokakarya Nasional Usaha Ternak Kerbau Mendukung Program Kecukupan Daging Sapi
individu itu sendiri walaupun pada sifat
dengan heritabilitas yang rendah. Dapat dicatat
pula bahwa catatan dari saudara hanya dapat
meningkat kecermatan pendugaan tidak
melebihi 0,5.
Best linear unbiased prediction
Pendugaan Nilai Pemuliaan yang dilakukan
di atas dilakukan dengan asumsi bahwa
informasi performans yang dipergunakan
berasal dari kelompok ternak kontemporari
yang mirip secara genetis. Seandainya ingin
melakukan pendugaan menggunakan data dari
kelompok ternak kontemporari yang berbeda
secara genetis, yaitu misalnya berasal dari
farm atau ranch yang berbeda atau dari dekade
yang berbeda maka metode yang cocok dengan
keadaan tersebut adalah dengan menggunakan
Best Linear Unbiased Prediction (BLUP)
(BOURDON, 1997), suatu metode yang telah
dikembangkan oleh HENDERSON (NICHOLAS,
1987; SCHNEEBERGER, 1992). BLUP merupa-
kan metode analisis uji zuriat yang meng-
gunakan berbagai macam informasi dari anak
dan lingkungannya, sehingga peramalan mutu
pejantan dapat dikatakan tidak mengalami bias
(HARDJOSUBROTO, 1994).
Metode BLUP tidak lain adalah kombinasi
dari seleksi indeks dengan teknik least square
(HARDJOSUBROTO, 1994). Pengaruh lingkung-
an dan nilai pemuliaan dari ternak diestimasi
serentak (simultan) sehingga perbedaan
genetik di antara herd diperhitungkan dengan
benar (SCHNEEBERGER, 1992). BLUP memer-
lukan perhitungan yang sangat intensif dengan
menggunakan multiple sumber informasi dan
melibatkan solusi (cara penyelesaian) simultan
dari sejumlah persamaan. BLUP menggabung-
kan berkali-kali sejumlah persamaan yang
akan dipergunakan untuk indeks seleksi yang
sesuai, hal ini karena sekali analisis, BLUP
menyediakan pendugaan untuk keseluruhan
populasi ternak, tidak hanya untuk satu ternak
pada suatu waktu (BOURDON, 1997).
Untuk sedikit menggambarkan bagaimana
dan pengaruh apa saja yang digunakan dalam
analisisnya, berikut ini adalah model statistik
yang dipakai dalam menghitung BLUP
(HARDJOSUBROTO, 1994) :
W = HY + BY + A + G + S + 1/2G’ + 1/2S’ + e
di mana:
86
W = nilai BLUP
HY = pengaruh tahun (herd year effect)
BY = block calving effect
A = pengaruh umur saat beranak
G = pengaruh kelompok pejantan
(sire group)
S = pengaruh pejantan
G’ = maternal grandsire group effect
S’ = maternal grandsire effect
e = galat (error)
Dari model tersebut di atas dapat dilihat
bagaimana kompleksnya cara menghitung
nilai W. Dimasukkannya bermacam-macam
faktor itu dengan maksud untuk mening-
katkan kecermatan dalam menghitung nilai
W. Oleh karena itu, perhitungan dengan cara
demikian disebut dengan unbiased prediction,
yaitu peramalan yang tanpa penyimpangan
(HARDJOSUBROTO, 1994).
NICHOLAS (1987) telah mengemukakan
empat langkah dasar metode BLUP di dalam
melakukan pendugaan Nilai Pemuliaan,
sekaligus memberikan contoh perhitungan
sederhana dari keempat langkah tersebut,
yang meliputi:
1. Menuliskan sebuah ekspresi (disebut
sebuah model) yang menggambarkan
performans individu yang berhubungan
dengan semua faktor yang diperlukan
untuk dimasukkan ke dalam perhitungan.
2. Menuliskan persamaan kuadrat terkecil
(least squares equations), yang berhu-
bungan dengan model.
Menambahkan σ e σ s ke koefisien
2 2
3.
diagonal dari sisi kiri setiap persamaan
yang menunjukkan pengaruh sire, di
mana σ 2s adalah ragam pengaruh sire
(=1/4VA = 1/4h2VP), dan σ 2e adalah
(=VP- σ s = (1-
2
residual error variance
1/4h2)VP), di mana VP adalah ragam
fenotipik. Persamaan tersebut sekarang
disebut persamaan mixed-model (mixed-
model equations).
4. Menghasilkan sebuah estimasi dari setiap
pengaruh dengan menyelesaikan per-
samaan mixed-model setelah menentukan
beberapa pembatas-pembatas yang perlu,
seperti μ=0.
 Lokakarya Nasional Usaha Ternak Kerbau Mendukung Program Kecukupan Daging Sapi

BLUP telah membuktikan sebagai metode
yang sangat berguna untuk menduga Nilai
Pemuliaan (SCHNEEBERGER, 1992), dan lebih
andal daripada pendekatan seleksi indeks
konvensional (NICHOLAS, 1987), dengan
kesalahan pendugaan sangat diminimalkan
(tidak bias) dengan korelasi antara yang
diduga dengan penduganya maksimal
(HARDJOSUBROTO, 1994). Karena kemam-
puannya untuk menghitung perbedaan genetik
di antara kelompok kontemporari dan dapat
menyediakan pendugaan genetik untuk banyak
ternak pada suatu waktu, maka BLUP adalah
metode yang disukai untuk evaluasi genetik
skala besar yaitu evaluasi genetik dari populasi
yang sangat besar, khususnya segala bangsa
(BOURDON, 1997).
Ada beberapa tipe model BLUP, yaitu sire
model, sire-maternal grandsire model, animal
model, repeat measure model, direct-maternal
model, multiple-trait model. Perbedaan di
antara model-model tersebut adalah pada
ternak yang menerima pendugaan genetik
(misalnya hanya bapak, semua tetua, atau
semua ternak), jumlah atau macam pendugaan
yang dibuat dan kesukaran perhitungan. Pada
umumnya lebih rumit model, lebih banyak
persamaan yang terlibat, dan lebih banyak
fasilitas komputer yang diperlukan
(BOURDON, 1997). BLUP animal model saat
ini dipergunakan pada banyak negara untuk
sejumlah spesies, termasuk sapi perah, sapi
potong, babi, kuda, domba dan ikan
(SCHNEEBERGER, 1992).
BOURDON (1997) telah membuat diagram
yang menggambarkan perbedaan pendugaan
Nilai Pemuliaan dengan cara BLUP animal
model dan Selection index sire model
(Gambar 1). Dari diagram tersebut terlihat
bahwa BLUP animal model menggunakan
informasi perfor-mans dari seluruh ternak
yang memiliki hubungan kekerabatan, tidak
hanya half sib tetapi juga saudara sepupu
karena mereka mempunyai nenek bersama
(common granddam). Sementara itu,
pendugaan Nilai Pemuliaan dengan
menggunakan metode Selection index sire
model menggunakan kelompok bapak dengan
mengabaikan hubungan maternalnya.
Individu X dan Y terlihat tidak lebih sebagai
half sib dan Y dan Z terlihat tidak mempunyai
hubungan.

1. BLUP animal model

Grandsire 1
X

Y Sire 1
Granddam
Dam

Z Sire 2 Grandsire 2
2. Selection index sire model
Grandsire 1
X
Sire 1
Y
Z Sire 2 Grandsire 2

Gambar 1. Diagram yang menggambarkan perbedaan pendugaan nilai pemuliaan dengan cara BLUP animal
model dan selection index sire model

KESIMPULAN generasi selanjutnya, di mana kemajuan yang

Seleksi pada ternak kerbau dapat
dikerjakan dengan metode seleksi yang biasa
digunakan pada sapi potong dan sapi perah.
Seleksi dilaksanakan dengan maksud untuk
mendapatkan kemajuan genetik pada
dicapai tergantung pada (1)
akurasi/kecermatan seleksi; (2) intensitas
seleksi; (3) variasi genetik dan (4) interval
generasi. Seleksi secara simultan terhadap
beberapa sifat dapat menurunkan diferensial
seleksi sehingga jumlah sifat yang dipilih

87
 Lokakarya Nasional Usaha Ternak Kerbau Mendukung Program Kecukupan Daging Sapi
harus dibuat minimal karena tiap sifat yang
disertakan dalam seleksi akan mengurangi
intensitas seleksi yang dimungkinkan untuk
sifat lain. Beberapa kriteria seleksi yang
disarankan digunakan untuk kerbau meliputi
angka reproduksi, kecepatan pertumbuhan
atau berat pada umur tertentu, kualitas
karkas, kekuatan dan daya tahan kerja serta
temperamen. True breeding value dari ternak
tidak dapat diketahui, yang dapat dilakukan
adalah menghitung estimated breeding value
(EBV) berdasarkan petunjuk performans
(nilai fenotipik) yang ada pada ternak itu
sendiri, saudara, progeni atau tetuanya.
Kecermatan pendugaan EBV tersebut
dipengaruhi oleh (1) jumlah catatan, (2)
heritabilitas, (3) ripitabilitas dan (4)
hubungan silsilah/kekerabatan. Metode Best
Linear Unbiased Prediction (BLUP) dapat
menghitung EBV dengan menggunakan data
dari kelompok ternak yang berasal dari farm
atau ranch yang berbeda atau dari dekade
yang berbeda.
DAFTAR PUSTAKA
BECKER, W. A. 1985. Manual of Quantitative
Genetics. Fourth Edition. Academic
Enterprises. Pullman, Washington.
BOURDON, R. M. 1997. Understanding Animal
Breeding. Prentice-Hall, Inc. New Jersey.
88
FALCONER, D. S. and T. F. C. MACKAY. 1996.
Introduction to Quantitative Genetics. Fourth
Edition. Longman Group Ltd. England.
HARDJOSUBROTO, W. 1994. Aplikasi Pemulia-
biakan Ternak di Lapangan. PT. Gramedia
Widiasarana Indonesia. Jakarta.
JOHANSSON, I. and J. RENDEL. 1966. Genetics and
Animal Breeding. Translated by M. TAYLOR.
W. H. FREEMAN and Company. San
Francisco.
KINGHORN, B. 1992. Principles of Estimated
Breeding Values. In: Animal Breeding, The
Modern Approach. Post Graduate Foundation
in Veterinary Science, University of Sidney.
New South Wales, Australia.
NICHOLAS, F. W. 1987. Veterinary Genetics.
Oxford University Press Inc., New York.
NOOR, R. R. 1996. Genetika Ternak. PT. Penebar
Swadaya. Jakarta.
SCHEEBERGER, M. 1992. The Alternative
Evaluation Procedures. In: Animal Breeding,
The Modern Approach. Post Graduate
Foundation in Veterinary Science, University
of Sidney. New South Wales, Australia.
WARWICK, E. J., J. M. ASTUTI, dan W.
HARDJOSUBROTO. 1990. Pemuliaan Ternak.
Gadjah Mada University Press. Yogyakarta.