AGEN ANTIVIRUS

2019-nCoV adalah RNA beta-coronavirus yang diselimuti, beralasan positif, berantai

tunggal. Mirip dengan SARS dan MERS, genom 2019-nCoV mengkodekan protein non-
struktural (seperti protease 3-chymotrypsin, protease seperti papain, helicase, dan RNA
polimerase tergantung RNA), protein struktural (seperti spike glikoprotein) dan protein aksesori
(Gambar 1)
Fig. 1 | Target obat potensial untuk beta-coronavirus. a | Organisasi genomik 2019-nCoV (ID
referensi GenBank: MN908947.3), menunjukkan daerah kode untuk protein yang merupakan
target obat potensial. b | Saku pengikat obat disorot dalam RNA polimerase dependen RNA dari
SARS (PDB: 6NUR, 3H5Y), divisualisasikan menggunakan PyMOL V1.7 (https://pymol.org).
Struktur kimia dari empat inhibitor potensial yang mengganggu RNA polimerase yang
bergantung pada RNA pada 2019-nCoV juga ditunjukkan. 3CL, 3-chymotrypsin seperti; HCV,
virus hepatitis C; ORF, bingkai bacaan terbuka; RSV, virus saluran pernapasan. Film-film
protein tersedia di www.virusface.com.

Empat protein non-struktural yang disebutkan di atas adalah enzim kunci dalam siklus
hidup virus, dan lonjakan glikoprotein sangat diperlukan untuk interaksi reseptor sel virus selama
pemasukan virus. Oleh karena itu kelima protein ini dikenal sebagai target yang menarik untuk
mengembangkan agen antivirus terhadap SARS dan MERS.
Analisis awal urutan genomik dari 2019-nCoV menunjukkan bahwa situs katalitik dari
empat enzim 2019-nCoV yang dapat mewakili target antivirus sangat dilestarikan, dan berbagi
tingkat kemiripan urutan yang tinggi dengan enzim SARS dan MERS yang sesuai. Lebih lanjut,
analisis struktur protein menunjukkan bahwa kantung pengikat obat utama dalam enzim virus
kemungkinan dikonservasi pada 2019-nCoV, SARS dan MERS. Oleh karena itu, masuk akal
untuk mempertimbangkan penggunaan kembali inhibitor MERS dan SARS yang ada untuk
2019-nCoV. Di bawah ini, kami membahas kandidat terpilih dengan fokus pada obat yang
disetujui atau agen eksperimental yang telah diuji dalam uji klinis untuk penyakit lain. Tambahan
Tabel 1 memberikan daftar yang lebih panjang dari agen anti-coronavirus, termasuk senyawa
praklinis yang dapat dipertimbangkan untuk skrining atau titik awal untuk mengoptimalkan agen
antivirus terhadap 2019-nCoV.
Gambar 1. Tinjauan Potensi Platform Vaksin SARS-CoV-2
Struktur partikel virus corona digambarkan di sebelah kiri, dengan protein virus yang berbeda
ditunjukkan. Protein S adalah target utama untuk pengembangan vaksin. Struktur lonjakan yang
ditunjukkan didasarkan pada lonjakan SARS-CoV-1 trimerik (PDB: 5XL3). Satu trimer
ditunjukkan dengan warna biru gelap, dan domain pengikatan reseptor, target utama antibodi
penetral, disorot dengan warna ungu. Dua trimers lainnya ditampilkan dengan warna biru muda.
Calon vaksin SARS-CoV-2 berdasarkan berbeda platform vaksin telah dikembangkan, dan untuk
beberapa di antaranya, percobaan pra-klinis telah dimulai. Untuk satu kandidat berbasis mRNA,
percobaan klinis baru-baru ini mulai mendaftarkan sukarelawan segera (ClinicalTrials.gov:
NCT04283461). Namun, banyak langkah tambahan diperlukan sebelum vaksin ini dapat
digunakan dalam populasi, dan proses ini mungkin memakan waktu berbulan-bulan, jika tidak
bertahun-tahun. Untuk beberapa kandidat, proses cGMP telah ditetapkan. Desain uji klinis dapat
diubah untuk memindahkan vaksin melalui pengujian klinis lebih cepat