CRITICAL JURNAL REVIEW

BIOLOGI MOLEKULER

“UNIQUE And CONSERVED FEATURE Of GENOM And PROTEOME Of

Sars-Coronavirus”

DISUSUN OLEH :

NAMA : JESSIKA JUNIATI SINAGA

NIM : 4173141036

KELAS : PENDIDIKAN BIOLOGI D 2017

PROGRAM STUDI PENDIDIKAN BIOLOGI

JURUSAN BIOLOGI
FAKULTAS MATEMATIKA DAN ILMU PENGETAHUAN ALAM
UNIVERSITAS NEGERI MEDAN
2020

i
 KATA PENGANTAR

Puji dan syukur saya ucapkan kepada Tuhan Yang Maha Esa, karena atas berkat dan
rahmat-Nya sehingga saya dapat menyelesaikan Critical Journal Review (CJR) tentang “
Organisasi genom pada virus Sars-coronavirus”. Critical Journal Review ini telah
diselesaikan untuk memenuhi tugas mata kuliah Biologi Molekuler dan saya berterimakasih
kepada Dosen pengampu atas bimbingannya sehingga Critical Journal Review ini dapat
diselesaikan dengan baik.

Terlepas dari semua itu, saya menyadari sepenuhnya bahwa masih ada kekurangan
baik dari segi susunan kalimat maupun tata bahasanya. Oleh karena itu saya meminta maaf
atas kesalahan dalam penulisan dan dengan tangan terbuka menerima segala saran dan kritik
dari pembaca guna kesempurnaan tugas ini.

Akhir kata saya berharap semoga tugas Critical Journal Review ini dapat memberikan
manfaat maupun inpirasi terhadap pembaca.

Medan, 29 Maret 2020

Penulis

i
 DAFTAR ISI

KATA PENGANTAR.......................................................................................................i
DAFTAR ISI.....................................................................................................................ii
IDENTITAS JURNAL
...........................................................................................................................................
iii
BAB I PENDAHULUAN
1.1 Pengantar...........................................................................................................1
1.2 Manfaat..............................................................................................................1
BAB II RINGKASAN ISI JURNAL................................................................................2
2.1. Abstrak Jurnal...................................................................................................2
2.2. Isi Jurnal............................................................................................................2
2.3. Metode Penelitian..............................................................................................4
2.4. Pembahasan.......................................................................................................5
BAB III KELEMAHAN DAN KELEBIHAN JURNAL
3.1 Kelebihan Jurnal...............................................................................................8
3.2 Kelemahan Jurnal.............................................................................................8
BAB IV IMPLIKASI JURNAL........................................................................................10
BAB V PENUTUP
5.1..............................................................................................................................Simpu
lan.........................................................................................................................11
5.2.............................................................................................................................. Saran
.............................................................................................................................11
DAFTAR PUSTAKA.......................................................................................................12

ii
 IDENTITAS JURNAL

Judul : Unique and Conserved Features of Genome and Proteome of SARS-

Coronavirus, an Early Split-off From the Coronavirus nGroup 2 Lineage

Penulis : Eric J. Snijder, Peter J, Jessika C Doobe, Volker Thiel dll

Jenis Jurnal : Jurnal JMB

Tahun : 2003

Halaman : 1-12

iii
 BAB I

PENGANTAR

1.1. Pendahuluan

Virus adalah organisme subseluler yang karena ukurannya sangat kecil, hanya dapat
dilihat dengan menggunakan mikroskop elektron. Ukurannya lebih kecil daripada bakteri
sehingga virus tidak dapat disaring dengan penyaring bakteri. Virus terkecil berdiameter
hanya 20 nm (lebih kecil daripada ribosom), sedangkan virus terbesar sekalipun sukar dilihat
dengan mikroskop cahaya. Genom virus dapat berupa DNA ataupun RNA. Genom virus
dapat terdiri dari DNA untai ganda, DNA untai tunggal, RNA untai ganda, atau RNA untai
tunggal. Selain itu, asam nukleat genom virus dapat berbentuk linear tunggal atau sirkuler.
Koronavirus sindrom pernapasan akut berat 2 atau SARS-CoV-2 (Severe acute respiratory syndrome
coronavirus 2) adalah salah satu anggota koronavirus yang mengakibatkan infeksi pernapasan
COVID-19. Virus ini pertama kali diidentifikasi di Kota Wuhan, Tiongkok dan menyebabkan wabah
COVID-19. Virus ini juga dikenal sebagai koronavirus Wuhan dan virus pneumonia pasar makanan
laut Wuhan (Wuhan seafood market pneumonia virus). Genom virus ini telah diurutkan.
Perbandingan urutan genetik antara virus ini dan sampel virus lain menunjukkan tingkat kesamaan
dengan SARS-CoV sebesar 79,5% dan dengan koronavirus kelelawar sebesar 96%.Beberapa teori
menyimpulkan bahwa virus ini berasal dari kelelawar. Koronavirus baru ini (SARS-CoV-2) berada
dalam kategori koronavirus yang menyerupai SARS. Dua urutan genom dari Rhinolophus sinicus
dengan kemiripan 80% telah dipublikasikan pada tahun 2015 dan 2017. Urutan genom
betacoronavirus Wuhan menunjukkan kesamaan dengan betacoronavirus yang ditemukan pada
kelelawar. Namun, virus ini secara genetik berbeda dari coronavirus lain seperti coronavirus terkait
SARS dan MERS. Genus betacoronavirus terdiri atas empat garis keturunan (subgenus), SARS-CoV-2
bersama dengan SARS-CoV digolongkan dalam garis keturunan B (subgenus Sarbecovirus).

1.1. Manfaat CJR

1. Mahasiswa dapat mengetahui manfaat critical jurnal dengan jurnal yang diriview
2. Melatih sikap kritis mahasiswa/i terhadap menganalisis informasi.
3. Melatih sikap komunikatif dalam menampilkan/menyampaikan informasi dengan
tata bahasa yang baik serta bertanggung jawab.

1
 BAB II

RINGKASAN JURNAL

2.1. Abstrak Jurnal

Organisasi genom dan strategi yang baru diidentifikasi coronavirus sindrom yang
dapat mengganggu pernafasan akut yang parah (SARS-CoV) telah diprediksi menggunakan
urutan genom yang baru diterbitkan. Empat belas diduga bingkai bacaan terbuka
diidentifikasi, 12 di antaranya diperkirakan diekspresikan dari set bersarang dari delapan
mRNA subgenomik. Sintesisnya dari mRNA ini dalam sel yang terinfeksi SARS-CoV
dikonfirmasi secara eksperimental. protein 4382 dan 7073 residu asam amino protein
replikasi polim SARS-CoV diperkirakan akan dipecah menjadi 16 subunit oleh dua virus
proteinase (menjadikan jumlah total protein SARS-CoV menjadi 28). Sebuah analisis
filogenetik dari gen replicase, menggunakan virus toro ??? yang terkait sebagai outgroup,
menunjukkan bahwa, meskipun ada sejumlah keunikan fitur, SARS-CoV paling erat
kaitannya dengan virus corona grup 2. homolog yang jauh dari enzim pemrosesan RNA
seluler diidentifikasi dalam kelompok 2 coronavirus, dengan empat di antaranya dilestarikan
dalam SARS-CoV. Enzim virus yang baru dikenal ini menempatkan mekanisme sintesis
RNA virus korona dalam perspektif yang sama sekali baru. Selanjutnya, bersama dengan
enzim virus yang dijelaskan sebelumnya, mereka akan menjadi penting target untuk desain
strategi antivirus yang bertujuan mengendalikan penyebaran SARS-CoV lebih lanjut.

2.2. Ringkasan Jurnal

Sindrom pernafasan akut yang parah (SARS) adalah a bentuk pneumonia atipikal
yang mengancam jiwa itu baru-baru ini muncul di Provinsi Guangdong, Cina. Coronavirus
yang sebelumnya tidak dikenal diisolasi dari pasien SARS 1-3 dan dianggap sebagai
penyebabnya penyakit pernapasan yang muncul ini. Dalam upaya ekstra biasa, urutan genom
full-length dari SARS-coronavirus (SARS-CoV) telah ditangguhkan dalam beberapa minggu
setelah identifikasi ini patogen novel dan diterbitkan oleh Michael Pusat Ilmu Pengetahuan
smith Genome (Vancouver Kanada, 4 nomor akses Entrez Genom NC_004718 (AY274119)),
Centers for Disease Kontrol dan Pencegahan (Atlanta, AS, 5 GenBank nomor tambahan
AY278741), dan lainnya. Itu Genom sARS-CoV adalah, panjang 29,7 kb dan berisi 14 frame
membaca terbuka (ORF) diapit oleh 50 dan 30 - daerah yang diterjemahkan dari 265 dan 342

2
nukleotida, masing-masing homolog protein dilestarikan di semua coronavirus dikodekan
oleh ORF 1a dan 1b yang tumpang tindih, dan oleh ORF 2, 4, 5, 6 dan 9a.

Coronaviruses merupakan positif Virus RNA (þRNA), dengan untai tunggal genom
antara 27 kb dan 31,5 kb, terbesar di antara virus RNA yang dikenal. Genom dari virus
korona dan virus terkait dalam urutan idovirales bersifat polikistronik dan diekspresikan
melalui kombinasi canggih yang buruk memahami mekanisme pengaturan.6,7 Coronavirus
ekspresi genom dimulai dengan terjemahan dua ORFs replikasi besar , yang kapasitas
pengkodeannya sekitar dua kali lipat dari rata-rata genom virus þRNA lengkap. Melalui a 21
frameshift ribosomal, 10 poliprotein ORF1a (pp1a; .4000 residu asam amino) dapat
diperpanjang dengan urutan yang dikodekan ORF1b untuk menghasilkan a .7000 residu asam
amino pp1ab polyprotein. Pemrosesan replicase polyprotein dilakukan oleh dua atau tiga
proteinase virus yang dikode ORF1a Produk-produk pemrosesan sebagian besar adalah
kelompok enzim replikatif yang tidak ditandai (diduga), termasuk RNA polimerase
tergantung RNA, sebuah RNA helicase yang menyatu dengan kompleks N-terminal Zn-
finger, dan mengandung Zn-ribbon proteinase seperti papain.12 - 15 Subunit replikasi
diperkirakan berkumpul menjadi replikasi virus kompleks yang ditargetkan untuk membran
sitoplasma oleh berbagai protein virus yang terkait membran.16–18 Selain replikasi genom,
coronavirus replikasi kompleks memediasi sintesis suatu seperangkat mRNA subgenomik
(sg) yang luas (Transkripsi) untuk mengekspresikan semua ORF di hilir ORF1b, yang
mengkodekan berbagai struktur dan aksesori protein. 6–9 Jumlah dan komposisi dari 30 ini
ORF-proksimal sangat bervariasi di antara keduanya coronavirus, tetapi mereka selalu
menyertakan gen untuk protein struktural S, M, E dan N, yang menggerakkan perakitan virus
plasmik cyto. Mekanisme yang mendasari sintesis RNA genomik dan subgenomik adalah
kurang dipahami. untuk menjelaskan struktur komposit dari mRNA sg, yang keduanya 50
dan 30 coterminal dengan genom virus, beberapa model telah diajukan, 6,9 di antaranya yang
mendalilkan sintesis terputus negatif-untai template sg untuk sg mRNA sintesis19 telah
diterima dukungan luas baru-baru ini.

Replikasi virus corona mencakup berbagai enzim pemrosesan RNA yang diduga.
Produksi satu set molekul RNA yang kompleks dan beragam oleh nidovirus (termasuk
SARSCoV) terkait dengan kerumitan tak tertandingi dari replikasi raksasa mereka, yang
mengandung berbagai fungsi enzimatik (diduga) dan sejumlah domain yang sama sekali tidak
dikarakterisasi. Karakterisasi replikasi virus corona oleh genomik komparatif, 12 dan secara
teratur memperbarui analisis ini selama beberapa tahun terakhir) .18, 32 Analisis

3
berkelanjutan kami sekarang telah mengidentifikasi homolog coronavirus jauh yang berjarak
tidak kurang dari lima enzim seluler yang terkait dengan pemrosesan RNA poli (U) -
endoribonuklease spesifik (XendoU42), exonuclease 30-ke-50 (ExoN) yang termasuk dalam
superfamili DEDD, ribosa yang bergantung pada S-adenosylmethionine, 20-
Omethyltransferase (20-O-MT) dari keluarga RrmJ, 44 adenosin diphosphate-ribose 100-
phosphatase (ADRP45), dan cyclic phosphodiesterase (CPD) .45,46

Dalam proteom SARS-CoV, domain yang dikonservasi yang kemungkinan terkait

dengan aktivitas ini dipetakan (dari ujung N ke C) ke domain X47 dari nsp3 (ADRP), domain
terminal N dari nsp14 (ExoN), sebuah “nidovirus-spesifik ”Mereplikasi domain26,48 di
bagian terminal-C dari nsp15 (XendoU), dan nsp16 (20-O-MT). Domain yang terkait dengan
CPD tidak dilestarikan dalam SARS-CoV, tetapi diidentifikasi dalam produk ORF249 dari
virus corona grup 2 yang sudah mapan, dan dalam domain yang sangat terminal C dari
torovirus ORF1a polyprotein, 50 serta dalam beberapa rantai ganda. RNAvirus rNA.
Konservasi dalam domain nidovirus yang terkait dengan ExoN, 20-O-MT dan CPD
mencakup residu katalitik dan residu-situs aktif lainnya yang diidentifikasi dalam enzim
seluler prototipe. Meskipun residu situs aktif dari keluarga ADRP dan XendoU belum
dikarakterisasi, asam amino yang paling terkonservasi dari keluarga ini ditemukan dalam
homolog diduga nidovirus mereka. Beberapa domain nidovirus mungkin berisi domain
tambahan yang unik dan dilestarikan. Sebagai contoh, kami mencatat bahwa homolog ExoN
nidovirus mengandung domain yang dikonservasi tambahan yang menyerupai Znfnger
mononuklear , antara blok I dan II yang dilestarikan secara universal, yang meliputi residu
katalitik (dua Asp dan satu Glu). 51 Modul mirip Zn-jari lainnya telah disisipkan di antara
blok II dan III dalam homolog ExoN ronivirus, subset nidovirus (data tidak ditampilkan).
Pengamatan gabungan kami menunjukkan bahwa homolog nidovirus dari enzim pemrosesan
RNA seluler ini harus aktif secara enzimatik, meskipun mereka mungkin telah berevolusi
untuk bertindak pada substrat spesifik (dan unik) atau memiliki komponen unik tambahan.

2.3. Metode Penelitian

Penelitian ini menggunakan teknik sel vero yang terlebih dahulu objek akan diinfeksi
dengan SARS-CoV (Frankfurt 1atau HKU-39849) pada MOI 0,01 atau terinfeksi tiruan. Pada
awal efek sitopatogenik (sekitar 40 jam pasca infeksi), RNA intraseluler diisolasi oleh lisis
sel selama sepuluh menit pada suhu kamar dengan 5% (w / v) lithium dodecyl sulfate dalam
buffer LET (10 mM Tris – HCl (pH 7,4), 100 mM LiCl, 1 mM EDTA), mengandung 20 mg /

4
ml proteinase K. Setelah pencukuran DNA seluler menggunakan jarum suntik, lisat
diinkubasi pada 42 8C selama 15 menit, diekstraksi dengan fenol (pH 4.0) dan kloroform,
dan RNA diendapkan dengan etanol. Itu RNA dipisahkan dalam denaturasi 1% (b / v)
agarosa gel yang mengandung 2,2 M formaldehid dan buffer Mops (10 mM Pel (garam
natrium) (pH 7), 5 mM natrium asetat, 1 mM EDTA). Gel kering digunakan untuk langsung
hibridisasi dengan oligonukleotida berlabel 32P SARSV001 (50-
CGAGGTTGGTTGGCTTTTCCTG-30) dan SARSV002 (50
-CACATGGGGATAGCACTAC-30), yang saling melengkapi untuk urutan dalam pemimpin
SARS-CoV urutan dan akhir genomik 30, masing-masing. Setelah hibridisasi, gel dianalisis
menggunakan Personal FX Imager molekuler dan perangkat lunak Quantity One (keduanya
dari Bio-Rad). Untuk menyelidiki sintesis SARS-CoV RNA secara lebih rinci, sel-sel Vero
terinfeksi dengan isolat SARS-CoV Frankfurt-13 dan HKU-39849,1 dan RNA intrasel
dianalisis dengan hibridisasi dengan probe oligonukleotida yang melengkapi bagian dari 50
urutan pemimpin dan urut hanya bagian hulu dari 30 ekor poli (A). Coronavirus IBV, 41
yang juga bereplikasi dalam sel Vero, digunakan sebagai penanda kontrol dan ukuran.
Seperti, RNA genomik dan semua delapan transkrip subgenomik yang diprediksi terdeteksi
dengan kedua probe SARS-CoV, yang mengkonfirmasi fakta bahwa RNA ini mengandung
urutan 50 terminal dan 30 terminal umum. Hebatnya, sedikit pergeseran mobilitas diamati.

2.4. Pembahasan

SARS-CoV menghasilkan delapan mRNA subgenomik untuk mengekspresikan ORFs

yang terletak di bagian 30-proksimal genom. Dalam paralel yang mencolok dengan fitur unik
dari nsp3, bagian 30-proksimal dari genom SARS-CoV berisi lima ORF (6, 7a, 7b, 8a dan
8b) yang tidak ada dalam kelompok koronavirus kelompok 2 yang sudah mapan dan yang
tidak jelas. homolog dapat diidentifikasi berdasarkan perbandingan urutan. Lebih lanjut,
SARS-CoV tidak memiliki rekanan untuk dua gen yang disisipkan di antara replikasi ORF1b
dan gen S dalam virus subkelompok 2a.6,7 Semua ORF ini (dari 2 hingga 9b) diperkirakan
akan diekspresikan dari sg mRNA di SARSCoV. Pada anggota genus Coronavirus dan
keluarga terkait Arteriviridae, semua sR mRNA adalah 30 maskerminal dengan genom virus,
dan mengandung 50 urutan pemimpin umum yang identik dengan genom. 6,7,9,39
Penggabungan pemimpin ke bagian pengkodean (atau "tubuh") dari masing-masing sg

5
 RNA melibatkan langkah diskontinyu dalam sintesis RNA, yang saat ini diyakini
terjadi selama sintesis untai minus, sehingga menghasilkan templat beruntai negatif
subgenomik komposit untuk sintesis mRNA sg (Gambar 3 (C)) .19,39,40 Pemimpin-tobody
yang bergabung adalah dipandu oleh interaksi pasangan-basa yang melibatkan sekuens
transkripsi yang mengatur sekuens (TRS; juga sebelumnya disebut "sekuen intergenik (IGS)"
dalam coronaviruses, yang ditemukan pada ujung 30 pemimpin genomik (pemimpin TRS)
dan pada akhir masing-masing 50 dari badan RNA sg (TRS tubuh), sering terletak tepat di
antara dua gen, tetapi kadang-kadang terletak di dalam urutan pengkodean gen hulu.

Dalam genom SARS-CoV dapat mengidentifikasi pemimpin potensial TRS (50-

CUAAACGAACUUU-30) yang memiliki 6-11 nukleotida yang cocok dengan sejumlah
urutan dalam 30 genom, yang banyak di antaranya ditempatkan tepat di hulu virus. gen
(Gambar 3 (A)). Sebagaimana diakui juga oleh orang lain, 4,5,34 urutan 50-ACGAAC-30
benar-benar dilestarikan dan dapat dianggap sebagai inti dari SARS-CoV TRS. Berdasarkan
urutan SARSCoV dengan segmen 50 terminal terbesar (nomor akses AY2787415), urutan
pemimpin SARS-CoV adalah (setidaknya) 72 panjang nukleotida, mirip dengan mis. bahwa
BCoV, dengan yang dimilikinya.

MRNA subgenomik yang dihasilkan dari penggunaan TRS ini untuk fusi pemimpin-
ke-tubuh digambarkan di bawah ini, dengan mRNA yang diprediksi secara fungsional
bikistronik ditunjukkan dengan tanda bintang (p). (B) Analisis hibridisasi RNA virus
intraseluler dari sel Vero yang terinfeksi dengan isolat SARS-CoV, Frankfurt-1 (Fr) dan
HKU-39849 (HK). Lihat Bahan dan Metode untuk detail teknis. Oligonukleotida melengkapi
urutan dari urutan pemimpin SARS-CoV dan ke wilayah dalam genomik 30 keduanya
mengakui satu set sembilan spesies RNA (genom (RNA1) dan delapan RNA subgenomik)
yang mengkonfirmasi keberadaan urutan 50 dan 30 yang umum. RNA dari sel-sel Vero yang
terinfeksi virus avian infectious bronchitis virus (IBV), yang hanya menghasilkan lima
mRNA subgenomik dengan ukuran yang diketahui41 dijalankan dalam gel yang sama dan
digunakan sebagai penanda ukuran. (C) Model untuk sintesis RNA nenovirus subgenomik
dengan ekstensi diskontinyu untai minus terputus.19,39 Sedangkan replikasi genom
bergantung pada sintesis untai minus kontinu (antigenom), untai minus subgenomik akan
dihasilkan dengan melemahkan sintesis untai yang baru lahir di TRS tubuh (merah) bar),
diikuti oleh translokasi untai yang baru lahir ke TRS pemimpin dalam templat genom.
Mengikuti pemasangan pasangan antara komplemen TRS tubuh pada ujung 30 untai minus
dan TRS pemimpin, sintesis RNA akan dilanjutkan untuk menyelesaikan untai minus

6
subgenom yang kemudian akan berfungsi sebagai templat untuk transkripsi mRNA
subgenomik.

Atas dasar lokasi TRSs pada tubuh terjadi proses sintesis sembilan mRNA oleh
SARS-CoV diharapkan: mRNA genomik (RNA1) dan delapan mRNA subgenomik dengan
ukuran sekitar 8,4, 4,6, 3,8, 3,5, 3,0, 2,6, 2,1 dan 1,8 kb (termasuk 50 leader dan 30 poly (A)
-tail). Namun, dalam analisis eksperimental pertama yang diterbitkan dari mRNA spesifik
SARS-CoV yang dihasilkan dalam sel Vero yang terinfeksi, sintesis hanya lima mRNA virus
yang dapat dikonfirmasi.5 Untuk menyelidiki sintesis RNA SARS-CoV secara lebih rinci, sel
Vero terinfeksi dengan Isolat SARS-CoV Frankfurt-13 dan HKU-39849,1 dan RNA
intraseluler dianalisis dengan hibridisasi dengan probe oligonukleotida yang melengkapi
bagian dari urutan ke-50 pemimpin dan urutan tepat di bagian atas dari ekor 30 poli (A).
Koronavirus IBV, 41 yang juga bereplikasi dalam sel Vero, digunakan sebagai penanda
kontrol dan ukuran. Seperti diilustrasikan dalam Gambar 3 (B), RNA genomik dan semua
delapan transkrip subgenomik yang diprediksi terdeteksi dengan kedua probe SARS-CoV,
yang mengkonfirmasi fakta bahwa RNA ini mengandung urutan 50 terminal dan 30 terminal
umum. Hebatnya, sedikit pergeseran mobilitas diamati untuk RNA 7 dan lebih besar dari
isolat Frankfurt-1. Analisis urutan selanjutnya dari virus ini mengungkapkan bahwa ini
disebabkan oleh penghapusan 45-in-frame di ORF7b, 34 mungkin contoh terdokumentasi
pertama dari adaptasi genetik SARSCoV dengan kondisi kultur sel. Konfirmasi situs fusi
pemimpin-tubuh dari mRNA subgenom SARS-CoV akan dipublikasikan di tempat lain.34
Hebatnya, hingga empat dari delapan mRNA subgenom SARS-CoV (3, 7, 8, dan 9) dapat
berfungsi secara bikistronik (Tabel 7). 2), seperti yang diamati sesekali untuk mRNA
subgenomik coronavirus lainnya.

7
 BAB III

KELEBIHAN DAN KELEMAHAN JURNAL

3.1. Kelebihan Junal

No. Penilaian Jurnal Kelebihan Jurnal

1. Kegayutan Antar Jurnal ini bersifat informative, dan uraian teori sudah relevan
Elemen dengan latar belakang, jurnal ini juga dapat memanfaatkan
mahasiswa sebagai sumber pengetahuan dan informasi bahan ajar.
2. Originalitas temuan Jurnal ini sudah mengetahui dan melakukan pengembangan teori
terhadap struktur genom dari Sars-CoVid 19.
Jurnal ini sudah dapat dikatakan muktahir karena penelitian yang
Kemuktahiran dilakukan sudah bertaraf international dan dilakukan di laboratorium
3.
masalah yang modern dan pelaksanaan dalam kurun waktu yang lama dalam
menentukan kevalitan data.
4. Kohesi dan koherensi Penggunaan tanda baca yang tepat serta petunjuk dari diagram dan
isi penelitian. keterangan gambar yang memudahkan pembaca mnegrti isi jurnal.

3.2. Kelemahan Jurnal

No. Penilaian Jurnal Kelemahan Jurnal

Kegayutan antar Metode perhitungan memiliki kelemahan, yaitu banyaknya sisa nilai
elemen penyusutan yang tidak digunakan, mengingat perhitungan finansial
didasarkan pada waktu pemakaian alat selama proses produksi skala
laboratorium.

Originalitas temuan Hasil penelitian pada jurnal ini tidak dapat dikatakan originalitas
temuan karena masih dalam tahap penelitian sturktur genom pada
virus Sars-Coronavirus

Kemuktahiran Prosedur kerja dalam menyelesaikan masalah dibutukan waktu yang

masalah lama dan penentuan hasil yang lama.

Kohesi dan koherensi Menurut saya kohesi dan koherensi bahasa yang digunakan memiliki
isi penelitian kekurangan yaitu terdapat paragraph yang tidak berkaitan antara satu
sama lain yang terdapat dihasil pendahuluan.

8
 BAB IV

IMPLIKASI JURNAL

9
 Implikasi Materi Pembahasan
Jurnal
Teori Pada jurnal ini tidak memilki teori yang dapat mendukung terhadap
latar belakang masalah, pada isi jurnal hanya membahas tentang
pengertian namun tidak disertai teori ahli yang mendukung
kebenaran teori tersebut.
Program Jurnal ini membahas tentang stuktur genom pada virus Sars-CoVid
Pembangunan di 19, saat ini penelitian ini terus dilakukan guna untuk mengurangi
Indonesia dampak dari pandemi Sars-CoVid 19 struktur genom pada virus
Sars-CoVid 19 ini dapat membantu penelitian peneliti dan tim
medis dalam menemukan vaksin sebagai penangkal virus yang
merugikan dunia saat ini.
Pembahasan dan Pembahasan dan analisis sudah relevan karena sudah dilakukan
analisis dengan analisis menggunakan metode penelitianteknik sel vero
yang terlebih dahulu objek akan diinfeksi dengan SARS-CoV
(Frankfurt 1atau HKU-39849) pada MOI 0,01 atau terinfeksi
tiruan.

BAB V

PENUTUP

6.1. Simpulan

10
 SARS-CoV-2 diklasifikasikan sebagai jenis virus coronavirus terkait sindrom
pernafasan akut berat (SARSr-CoV). Genom virus ini telah diurutkan. Perbandingan urutan
genetik antara virus ini dan sampel virus lain menunjukkan tingkat kesamaan dengan SARS-
CoV sebesar 79,5% dan dengan koronavirus kelelawar sebesar 96%.SARS-CoV
menghasilkan delapan mRNA subgenomik untuk mengekspresikan ORFs yang terletak di
bagian 30-proksimal genom. Koronavirus merupakan virus beramplop dengan genom RNA
utas tunggal plus dan nukleokapsid berbentuk heliks simetris. Jumlah genom koronavirus
berkisar antara 27–34 kilo pasangan basa, terbesar di antara virus RNA yang diketahui. Nama
koronavirus berasal dari bahasa Latin corona yang artinya mahkota, yang mengacu pada
tampilan partikel virus (virion), mereka memiliki pinggiran yang mengingatkan pada
mahkota atau korona matahari. Protein yang menyusun struktur koronavirus yaitu protein
tonjolan (spike) (S), amplop (E), membran (M), dan nukleokapsid (N). Khusus pada virus
SARS, letak pengikatan reseptor pada protein S memediasi perlekatan virus ke reseptor sel
inangnya yaitu, enzim pengubah angiotensin (ACE2). Beberapa koronavirus (khususnya
anggota Betacoronavirus garis keturunan A) juga memiliki tonjolan protein pendek yang
disebut hemaglutinin esterase.

6.2. Saran

Untuk melakukan sebuah penelitian terhadap jurnal , peneliti harus melakukan dengan
cara yang sistematis, dan dilakukan dengan benar agar data yang terkumpul sesuai dengan
keberadaanya, untuk pengumpulan data seharusnya digunakan metode yang efektif dan tidak
rumit tetapi dapat menghasilkan data yang akurat, jurnal ini masih memiliki kelemahan oleh
sebab itu penulis kedepannya lebih memperhatikan dalam pembuatan jurnal agar
meminimalisir kelemahan jurnal ini

DAFTAR PUSTAKA

Colome. S, Jaime dan Cano, J, Raul.(2006). Biologi Molekuler. Jakarta : Erlangga.

11
Snijder, J. Petter,.Doobe, Jessika.C.(2003).Unique and Conserved Features of Genome and
Proteome of SARS-Coronavirus, an Early Split-off From the Coronavirus nGroup 2
Lineage. Journal JMB. Hal: 1-12.

12