Nutrisi Mikroba A
Nutrisi Mikroba A
Oleh :
Siti Umniyatie
MATERI:
1. Makronutrien‐mikronutrien.
2. Transport nutrisi.
3. Type nutrisi pada bakteri
4. Media
NUTRISI
y Merupakan aspek yang menyangkut fisiologi yang
disepakati sebagi suplai monomer (bahan dasar
monomer)yang dibutuhkan sel untuk tumbuh.
tumbuh
y Substansi yang diperlukan ini disebut NUTRIEN.
y Beda organisme berbeda kebutuhan nutriennya dan
jumlah kebutuhannya.
NUTRIEN‐METABOLISME‐PERTUMBUHAN
NUTRIEN
TRANSPORT
MEMBRAN NUTRIEN
A
SEL
(METABOLISME)
OPERASIONAL SEL : ENERGI
TUMBUH ENTROPI/
ENERGI : TERBUANG
GERAK TRANSPORT SINTESIS
GERAK,TRANSPORT,SINTESIS
Sumber energi, karbon,donor hidrogen
Sumber energi :
1. Cahaya (mikroba fototrof)
2. Zat kimia ( mikroba khemotrof)
Sumber Karbon :
1. Zat an organik /CO2 (mikroba Autotrof)
2. Zat organik
g ((mikroba heterotrof))
Donor Hidrogeng :
1. Zat organik (mikroba organotrof)
2. Zat an organik/H2,NH3,H2S,S, Fe²⁺(mikroba
litotrof).
nutrien
y Makronutrien : nutrien yang dibutuhkan dalam
jumlah banyak.
Komponen vitamin Thiamin,biotin
As. lipoat
p
Kalium (K) Pompa Na
magnesium Stabilisasi Membran,ribosom
(Mg) As. nukleat, aktivitas enzim
Kalsium(Ca) stabilitas Dinding sel
Endospora thd. panas
Sodium/Na pertumbuhan Bakteri halofilik
Zat besi/Fe Komponen sitokrom Pd. Sistem respirasi
Potasium/ Dlm. Sintesis protein Semua organisme
MIKRONUTRIEN
(dibutuhkan dalam jumlah sedikit)
y Mangan
y Molibdenium
y Seng
y Tembaga
y Kobalt
y Nikel
y Vanadium
y Boron
y Klor
y Natrium
y Selenium
y Silika
y Dll.
Mikronutrien dan fungsinya
ELEMEN FUNGSI DLM SEL
FUNGSI DLM. SEL
BORON(B) Antibiotik poliketid
CHROMIUM (Cr)
COBALT (Co) Vitamin B12,transkarboksilase
COPPER (Cu) respirasi, sitokrom c oksidase,fotosintesis dll
BESI (Fe) Sitokrom katalase peroksidase protein Fe
Sitokrom, katalase,peroksidase,protein Fe‐S
S,oksigenase.
oksigenase
MANGANASE (Mn) Aktivator kebanyakan enzim.
MOLIBDENIUM (Mo) Nitrogenase,nitrat reduktase,sulfid oksidase dll.
NICKEL (Ni)
( ) Urease,hidrogenase,koenzim
hd k metanogen.
SELENIUM (Se) Format dehidrogenase, hidrogenase.
VANADIUM (V) Vanadium nitrogenase,bromoperoksidase.
ZINC (Zn) Alkohol dehidrogenase,RNA dan DNA polimerase.
DONOR‐ASEPTOR
DONOR ELEKTRON DAN
ASEPTOR ELEKTRON DAN
FAKTOR TUMBUH
1. Donor dan aseptor elektron :
Berkaitan dg. Proses osidasi‐reduksi dalam mekanisme
transport elektron yang pd. Akhirnya dihasilkan
l k d Akhi dih ilk
energi, ketika donor elektron teroksidasi dan aseptor
elektron tereduksi.
elektron tereduksi
2. Faktor tumbuh : merupakan senyawa organikyg
sangat dibutuhkan mikroba dan tdk. Dapat disintesis
g p
sendiri.Mis ; purin‐pirimidin,vitamin
NUTRIEN
1. Air : sel 70‐85%
2. g
Sumber energi : sinar matahari atau zat kimia
3. Sumber karbon: organik atau an organik (CO2)
4. Sumber nitrogen: organik atau an organik (N2
udara=gas=70%),Nitrat, Nitrit.
5. Sumber aseptor elektron :O2 atau zat organik
6. Sumber mineral
7. Faktor tumbuh
PENYERAPAN EKSTRASELULER
PENYERAPAN EKSTRASELULER
(bagi mikroba heterotrof)
y Bahan –bahan polimer/makromolokul yang terdapat
dilingkungan dpt. Digunakan oleh mikroba.
y Contoh polimer : selulosa, amilum, protein, DNA,
C h li l l il i DNA
lemak, lignin dll.
y Polimer ini akan dihidrolisis menjadi monomer‐
Polimer ini akan dihidrolisis menjadi monomer
monomernya oleh enzim ekstraseluler.
y Enzim ekstraseluler/enzim hidrolisi : enzim yang
berfungsi/bekerja di luar sel.
CONTOH‐CONTOH MAKROMOLOKUL DAN ENZIM YANG
MENGHIDROLISIS
SENYAWA MAKROMOLOKUL ENZIM HIDROLISIS
AMILUM (pati) amilase
SELULOSA
S U OS Selulase
Se u ase
LIGNIN Ligninase
HEMISELULOSA Hemiselulase
LEMAK Li
Lipase
RNA RNA se
DNA DNA se
PROTEIN proteinase
Fig. 5‐7
Glucose Glucose
HO 1 2 3 4 H
Hydrolysis adds a water
molecule breaking a bond
molecule, breaking a bond H2O
HO 1 2 3 H HO H
(b) Hydrolysis of a polymer
Hidrolisis makromolokul
2. Difusi dipermudah/ dengan fasilitas : dibantu adanya karier
protein,untuk molokul polar, masing‐masing mol. Memiliki binding‐site
yg khusus binding‐site akan mengalami perubahan konfigurasi sehingga
yg khusus, binding site akan mengalami perubahan konfigurasi sehingga
menyebabkan terlepasnya molokul yg diangkut. Ex: gula, as. amino
berbagai ion logam.
3. Penyerapan aktif : menggunakan ATP.
P k if k ATP
hidrolisis ATP yg terjadi di dlm. Sel akan menghasilkan energi yg akan
digunakan untuk memompoa H+ keluar sel sehingga H+ di luar sel akan
p g g p p
mempengaruhi konfigurasi protein karier dan afinitas terhadap substrat.
TRANSPORT NUTRIEN
TRANSPORT AKTIF
Lanjutan............................
4. Translokasi gugus : molokul mengalami modifikasi
selama diangkut mis. Glukosa menjadi glukosa –phosphat
Melibatkan 1 komponen spesifik (HPr=protein tahan panas)
Melibatkan 1 komponen spesifik (HPr protein tahan panas)
dan enzim (E1= terletak di sitoplasma), komponen ke 2
adalah Enzim2 yg spesifik utk. Masing‐masing gula
( l k dl
(terletak dlm. Membran)
b )
PEP + HPr → HPr-P + piruvat (oleh enzim 1)
HPr P + gula → Gula –P
HPr-P P + HPr (enzim 2)
5. Transport zat besi : menggunakan sistem siderofor,
siderofor merupakan
p senyawa
y yg diekskresi dlm. Nutrien
dan akan mengikat besi (Fe3+) dan dimasukkan kembali
sebagai ferikrom(yg memiliki afinitas rendah terhadap Fe2+
sehingga Fe2+akan segera dilepaskan dlm dlm. Sel.
Sel
Tipe nutrisi
SEBARAN MIKROBA SESUAI TIPE NUTRISI
TYPE NUTRISI SUMBER ENERGI ASEPTOR elektron CONTOH
& SUMBER C
KHEMOHETEROTROF,A
KHEMOHETEROTROF A ZAT KIMIA ZAT ORGANIK E.Coli
E C li
NAEROB ORGANIK Streptococcuc.sp
(ORGAN
PENCERNAAN)
KHEMOHETEROTROF,A ZAT KIMIA ZAT AN ORGANIK Clostridium.sp(MAKA
NAEROB ORGANIK NAN KALENG)
KHEMOHETEROTROF,ae
KHEMOHETEROTROF ae ZAT KIMIA O2 Semua hewan
rob ORGANIK Fungi
Sebagian bakteri
KHEMO AUTOTROF CO2 O2 BAKTERI
ZAT KIMIA NITRAT NITRIT
NITRAT,NITRIT,
SULFAT (TANAH)
FOTO HETEROTROF SINAR MTHR BAKTHIJAUNon
ZAT ORGANIK sulfur
BAKT.PURPLE,Non
Sulfur (PERAAIRAN)
FOTO AUTOTROF SINAR MTHR AN AEROB – Bakt Sulfur
ZAT ORGANIK pereduksi H2S
Media
y Konsistensi : padat,cair
Konsistensi : padat cair
y Susunan : defined media (yang dibuat dengan jumlah yang
tepat), dan complexs media (media yang tdk
memperhatikan presisi jumlah yang tepat. Exs:
menggunkaan produk hewan casein/protein susu, daging
dsb).
y Kegunaan/Fungsi : medium selektif, medium diferensial,
medium uji, medium utk. Menghitung,medium utk.
M
Menentukank tipe
i pertumbuhan,medium
b h di di k
diperkaya.
MEDIA CAIR
C
Serratia marcescens pd. Media
p
Mac Concey agar.