BIOKIMIA SEL

BIOKIMIA SEL

Biokimia :
 Ilmu yang mempelajari molekul dlm sel
hidup dan reaksi kimianya.
 Proses biokimia normal merupakan dasar
kesehatan .

Sel : merupakan unit struktural dan fungsional

terkecil dalam makhluk hidup
 Manusia terdiri dari 1014 sel.
 Individu Sistem organ

Sel Jaringan Organ

 Reaksi kimia Biokimia
 Ukuran besar (ml)  Ukuran sel kecil (nm
 Suhu dan tekanan =10- 9m)
tinggi  Suhu relatif rendah
 Bahan non biologik  Dinding rapuh dan
(kuat) tebal hanya beberapa
 Ada pereaksi kuat molekul
 Ada pelarut organik  Media cair
Sel

Variasi :
 Ukuran
 Bentuk
 Fungsi khusus

Tetapi semuanya mempunyai

kesamaan CIRI STRUKTUR DASAR
 EUKARYOTIK PROKARYOTIK
 Struktur kompleks  Struktur sederhana
 Diamater 20-30um  Diameter 1-2 um
 Inti sel bentuk baik  Membran sel rapuh
dengan membran ganda  Molekul tunggal DNA.
 Ada organella internal
(mitokondria, retikulum
endoplasma, badan  Contoh E.coli (di usus)
golgi)
Struktur dasar sel

Meliputi :
 1. Membran sel
 2. Inti sel
 3. Sitoplasma
Dalam sitoplasma terdapat organella
mitokondria, retikulum endoplasma,
badan golgi, lisosom, peroksisom,
sitoskeleton.
MEMBRAN SEL

 Tersusun dari 2 lapis molekul lipid dan

protein khusus
 Terdapat enzim Na-K -ATP ase
 Sifat : selektif permiabel
 Fungsi :
1. Mengangkut nutrien dan garam
2. Membuang sisa makanan dari sel keluar
3. Terdapat reseptor hormon
HORMON TIPE I HORMON TIPE II

 Reseptor di intra sel Reseptor di membran sel

 Sifat lipofilik Sifat hidrofilik
 Punya protein Tidak punya protein
pengangkut pengangkut
 Waktu paruh panjang Waktu paruh pendek
 Pembawa : kompleks Pembawa : cAMP, cGMP,
hormon-reseptor Ca atau
(HRE) fosfatidilinositol,
kinase/lint.fosfat
 Contoh hormon tipe I : Contoh hormon tipe II :
androgen, kalsitriol, 1. cAMP
estrogen, katekolamin, ACTH, ADH,
glukokortikoid, Angiotensi II, Kalsitonin,
hCG, FSH, LH, Glukagon,
mineralokortikoid, MSH, PTH, TSH,
progesteron, tiroid Somatostatin.
(T3 dan T4) 2. cGMP
ANF (Paktor Natriuretik
Atrial), NO (Nitrat Oksida)
 Protein pengangkut : 3. Ca/ fosfatidilinositol
Albumin - aldosteron Asetilkolin,
TBG – triyodotironin katekolamin, ADH,
TBG – tiroksin gastrin, GnRH,
oksitosin, TRH
SHBG – Estrogen
4. Kinase/lint. Fosfat
CBG - Hidrokortison
CS, GH, Prolaktin,
Insulin, eritropoeitin
SITOPLASMA

 Tempat berlangsungnya hampir semua reaksi

enzimatis dari metabolisme sel
 Sel menggunakan energi kimia untuk
membangun dan mempertahankan
strukturnya, serta melakukan pergerakan sel
atau kontraksi.
SITOPLASMA

Terdiri dari :
1. Komponen granula (ribosom bebas,
granula glikogen, butiran lemak)
2. Sitosol (larutan encer seperti gel dengan
komposisi kompleks)
Sitosol dijaga dalam keadaan seimbang,
pada konsentrasi dan proporsi yang tetap.
Kandungan sitosol:
 Enzim
 Protein (pengikat, penyimpan dan
pengangkut)
 Mineral
 Ion mineral
 Biomolekul (asam amino, nukleotid, zat
metabolit, koenzim)
INTI SEL

 Tempat terjadinya replikasi genetik dan

penyimpanan dalam bentuk DNA (asam
deoksiribonukleat)
MITOKONDRIA

 Mitokondria : pusat energi

 Semua energi dari asam lemak,
karbohidrat dan asam amino  ekuivalen
pereduksi (H)  rantai pernafasan  ATP
(Adenosin Trifosfat)
RETIKULUM ENDOPLASMA (RE)

 Merupakan saluran membran yang berliku-

liku yang amat kompleks yang membentuk
banyak lipatan dan belokan ke seluruh ruang
sitoplasma
 Ruangan di dalam RE disebut CISTERNA
(fungsi untuk saluran pengangkut dan
penyimpan berbagai produk)
 RE ada 2 :
 1. Kasar (ada ribosom)
 2. Halus (tidak ada ribosom)

 Ribosom berupa granula kecil berdiameter 18-

22 nm yang berfungsi untuk sintesa protein.
 Hasil protein ( ribosom)  membran RE 
cisterna  diangkut keluar sel.
BADAN GOLGI

 Badan golgi merupakan sekelompok kantong

pipih (vesikel) yang dikelilingi membran.
 Badan golgi menerima produk sel tertentu
dari retikulum endoplasma dibawa ke
kantong pembuangan  dibawa keluar
membran.
 EKSOSITOSIS : proses membukanya kantong
dan membebaskan isi kantong ke luar.
LISOSOM

 Lisosom berupa kantong atau gelembung

bulat yang dikelilingi membran.

 Terdapat enzim pencerna yaitu enzim

yang menghidrolisa protein,polisakarida
dan lipid yang tidak dibutuhkan lagi.
PEROKSISOM

 Dikenal sebagai MICROBODIES

 Terdapat enzim yang membentuk dan
menggunakan hidrogen peroksida sehingga
disebut peroksisom.
 Enzim yang berperan : KATALASE
Katalase

 2 H2O2 2 H2O + O2 .
(Racun)
SITOSKELETON

 Merupakan suatu kerangka fleksibel dengan

struktur dinamik, berubah-ubah, tidak kaku,
yang berfungsi untuk :
 1. Pergerakan sel
 2. Memberi bentuk khusus
 3. Tempat melekat organella
 4. Komunikasi antar bagian sel
Sitoskeleton terdiri dari :
 1. Mikrofilamen
 2. Mikrotubul
 3. Mikrotrabekuler
1. Mikrofilamen

 Mikrofilamen (membentuk jaring-jaring lepas

di bawah membran sel, diameter 5 nm, terdiri
dari aktif + miosin mirip pada sistem kontraksi
otot rangka ,
 Fungsi mikrofilamen :
 1. Untuk pergerakan struktur dalam sel,
 2. Untuk melipat dan mengembangnya
membran sel
 2.Mikrotubuli

 Terdiri dari rangkaian molekul protein yang

tersusun berdekatan mengelilingi suatu
ruang kosong di tengah-tengahnya.
 Fungsi : pergerakan benang mitotik selama
pembelahan sel
 Pada sel saraf berpartisipasi dalam
pergerakan senyawa dari badan sel menuju
ujung sel (akson)
3.Mikrotrabekuler

 Masih diteliti
 Jalinan filamen amat tipis, dengan komposisi
kimia belum diketahui, diduga mengandung
protein.
 ORGANELA INTRASELULER UTAMA
ORGANELA/FRAKSI PENANDA FUNGSI UTAMA
NUKLEUS DNA TEMPAT KROMOSOM,TRANSKRIPSI

MITOKONDRIA GLUTAMAT SIKLUS ASAM SITRAT, POSPORILASI

DEHIDROGENASE OKSIDATIF
RETIKULUM ENDOPLASMA GLUKOSA 6P SINTESIS PROTEIN, LIPID,OKSIDASI
XENOBIOTIKS(CYTOKROM P450
RIBOSOM RNA YG TINGGI SINTESIS PROTEIN (TRANSLASI)

LISOSOM ASAM POSPATASE TEMPAT HIDROLASE ( REAKSI

DEGRADASI)
MEMBRAN PLASMA Na,K,ATPase;5 NUkluotidase TRANSPORT MOLEKUL DARI DAN KE
DALM SEL;ADESI INTERSELULER DAN
KOMUNIKASI
APARATUS GOLGI GALAKTOSIL REAKSI SULFASI,
TRANSFERASE GLIKOSILASI,PEMILIHAN PROTEIN
PEROKSISOME KATALASE;ASAM URAT DEGRADASI ASAM LEMAK DAN ASAM
OKSIDASE AMINO;PRODUSKI DAN DEGARDASI
H2O2
SITOSKELETON MIKROFILAMEN,
MIKROTUBULI,FILAMEN PERANTARA
SITOSOL LAKTAT DEHIDROGENASE ENSIM GLIKOLISIS, SINTESIS ASAM
LEMAK
Proses metabolisme tubuh
OKSIDASI ASAM LEMAK

 Disebut juga proses ß-oksidasi

 Hasilnya yaitu unit 2 atom C (Asetil KoA)
Proses :
1. Pengaktifan asam lemak.
 Asam lemak asil KoA sint. Asil KoA (btk aktif)
 Pengaktifan terjadi di luar mitokondria (sitosol).
 Pengangkutan ke dlm mitokondria dibantu :
Karnitin.
OKSIDASI ASAM LEMAK

2. Oksidasi
 Terjadi di dalam mitondria
 Ada peran FADH2 dan NADH
 Hasil Asetil KoA dan ATP.
 Asetil KoA akan masuk SK dan memproduksi
ATP berikutnya.
OKSIDASI ASAM LEMAK
METABOLISME ASAM AMINO
Rangka C Asam amino

AA masuk ke Siklus Krebs melalui jalur :

1. Oksaloasetat (mis : Asn, Asp).
2. -Ketoglutarat (mis : Glu, Gln, Pro, Arg, His).
3. Piruvat (mis : Gly, Ser, Ala, Cys, Thr, Hyp).
4. Asetil KoA (mis : Tyr, Phe, Trp, Lys)
5. Suksinil KoA (mis : Met, Ile, Va).
Siklus krebs
Rangka N Asam amino
Glikolisis
Glukoneogenesis
Glukoneogenesis
Fosforilasi oksidatif
Flavoprotein (gugus prostetik enzim, derivat
riboflavin)
misal : FAD, FMN

Nikotinamid (koenzim, derivat niasin)

misal : NAD, NADP

SITOKROM
 Suatu hemoprotein yang mengandung Fe
 Berfungsi membawa elektron
 Misal : sitokrom a, sitokrom b, sitokrom c
ATP atau energi untuk :
1.Sintesis
2.Kontraksi otot
3.Eksitasi saraf
4.Transport aktif
5.Gerak sel dll
Metabolisme otot

Sumber ATP otot :

1. Kreatin fosfat
2. Glikolisis
3. Fosforilasi oksidatif
1. Kreatin fosfat

 Simpanan energi utama di otot

 Berperan mencegah deplesi ATP yang cepat.
 Terbentuk saat relaksasi

 Energi otot :
1. ATP  ADP + P + energi (detik (pertama)
2. Kreatin fosfat + ADP  ATP (beberapa detik
berikutnya)
2. Glikolisis
Siklus Cori

 Ditemukan oleh Carl Cori dan Gerty Cori

 Yaitu siklus energi yang dibentuk antara
lintasan yang menghasilkan 3 senyawa
(asam laktat, asam piruvat, alanin) dengan
lintasan glukoneogenesis.
 Terjadi antara jaringan hepar dan otot.
Siklus Cori
3. Fosforilasi oksidatif
 Sumber ATP otot
•Glikogen otot
Kreatin fosfat
•Fosforilase
otot
•Glukosa
•Glikolisis
ATP Kontraksi otot
•Miosin
fosfatase
•Fosforilasi
•ADP + pi
oksidatif
•AMP

•ADP

•Mioadenilat
siklase
Ciri otot rangka cepat dan lambat

Cepat Lambat
Miosin ATP ase Tinggi Rendah
Kebutuhan Tinggi Rendah
energi
Warna Putih Merah
Mioglobin Tak ada Ya
Kecepatan Cepat Lambat
kontraksi
Lama (durasi) singkat memanjang
Contoh olahraga

Kreatin Gabungan Glikolisis Gabungan Fosforilasi

fosfat (KP) KP + Glik (GLI) Gli + FO oksidatif
(FO)

Lari cepat Lari cepat Lari cepat Lari cepat Marathon

(100 m) (200 m) (400 m) (800 m)

Melompat Bola basket Berenang Berenang Jogging

(100 m) (200 m)

Angkat berat Baseball Tenis Tinju Cross country

Menyelam Sepakbola
Sumber Pustaka :
 Lehninger, 1997, Dasar-dasar Biokimia,
Penerbit Erlangga, Jakarta.
 Robert K.Murray, 1997, Biokimia Harper,
Penerbit EGC, Jakarta.
Alhamdulillah