TUGAS KELOMPOK

RESUME IMUNOLOGI

“Dasar struktural pengenalan antibodi-antigen”

Dzakiatul Fahmi Mumtaz,S.Kep,Ns.M.Kep

Untuk Memenuhi Tugas dari Mata Kuliah

IMUNOLOGI

Disusun oleh:

Kelompok B3

1.Tiara Azizah (1911604083)

2.Fieza Windhy Aulia (1911604084)
3.Elyanisa (1911604085)
4.Feby Haria jasesa (1911604086)
5. Gebi Febriani (1911604087)
6. Alma Vikra Nabilla (1911604088)
7.Innayah Uttrujjah (1911604089)
8. Yunicha dwi beatrice (1911604090)
9. Hafizah Ulfah (1911604091)
10. Hidayatus Sa'adah (1911604092)
11.Reta Tri Abdila Putri (1911604093)

PROGRAM STUDI SARJANA TERAPAN

KEPERAWATAN ANESTESIOLOGI

FAKULTAS ILMU KESEHATAN

UNIVERSITAS ‘AISYIYAH YOGYAKARTA

2020
 Dasar struktural pengenalan antibodi-antigen
Fungsi antibodi (Abs) melibatkan pengikatan spesifik terhadap antigen (Ags) dan aktivitas
dari komponen lain dari sistem kekebalan tubuh untuk melawan patogen. Enam hypervariable loop
dalam domain variabel Abs, yang biasanya disebut penentuan saling melengkapi daerah (CDR),
secara luas dianggap bertanggung jawab atas pengakuan Ag, sedangkan domain stant diyakini
memediasi aktivasi efektor. Di sisi Ag dari interaksi, membahas upaya untuk memprediksi epitop sel
B dan gagasan yang disarankan untuk menggabungkan Ab informasi ke dalam skema prediksi epitop
sel-B. Selain meningkatkan pemahaman kekebalan, karakterisasi peran fungsional dari berbagai
bagian molekul Ab dapat membantu dalam rekayasa Ab, desain peptida turunan CDR, dan prediksi
epitope.

PENGANTAR

Antibodi (Abs) memiliki dua fungsi berbeda:satu untuk mengikat spesifikasi untuk antigen target
mereka (Ags); yang lainnya adalah untuk mendapatkan kekebalan tubuh respon terhadap Ag terikat
dengan merekrut sel-sel lain dan molekul ecules. Hubungan antara Ab dan Ag melibatkan segudang
interaksi non-kovalen antara epitop - yang mengikat situs di Ag, dan paratop - situs yang mengikat
pada Ab. Itu kemampuan Abs untuk mengikat hampir semua permukaan non-diri dengan indah
spesifisitas dan afinitas tinggi bukan hanya kunci untuk kekebalan tetapi memiliki juga membuat Abs
alat yang sangat berharga dalam biologi eksperimental ogy, penelitian biomedis, diagnostik dan
terapi. Keragaman kemampuan mengikat mereka sangat mencolok mengingat tingginya kesamaan
struktural antara semua Abs. Ketersediaan peningkatan- Jumlah data struktural dalam beberapa tahun
terakhir sekarang memungkinkan untuk a pemahaman yang jauh lebih baik tentang dasar struktural
dari fungsi Ab secara umum, dan pengakuan Ag pada khususnya. Bagian terakhir berfokus pada
bagian non-CDR dari Ab [yaitu, kerangka kerja wilayah. (FRs) dan domain konstan] untuk Ag
mengikat dan yang terbaru saran mengenai efek non-lokal dan alosterik pada fungsi Ab tion. masalah
yang terkait termasuk ulasan tentang rekayasa Abs (1), stabilitasnya (2), pematangan afinitas (3), dan
pemilihan isotipe (4). Sementara ini topik penting relevan dengan temuan dan ide yang kami ulas di
sini, mereka berada di luar cakupan tinjauan ini

MOTIVASI UNTUK, DAN APLIKASI, STUDI PENGAKUAN Ab-Ag

MEMAHAMI IMUNITAS DAN OTOMATIS

Respon imun adaptif melibatkan dua jenis limfosit: Sel T, yang mengenali Ags yang telah diproses
dan mereka fragmen disajikan oleh molekul MHC, dan sel B yang menghasilkan Abs yang dapat larut
yang juga dapat mengidentifikasi Ag yang utuh dalam asalnya bentuk. Sementara cara sel T
mengenali epitopnya telah dipelajari secara ekstensif ke tingkat yang memungkinkan yang sukses
prediksi epitop sel-T. Mekanisme yang mendasari pengakuan Ab-Ag adalah sangat penting untuk
memahami kekebalan.Sela-Culang et al. Dasar struktural pengenalan antibodi-antigen Sistem
kekebalan memungkinkan Abs untuk membedakan antara yang asing dan molekul. Penyakit autoimun
ditandai oleh respon yang tidak pantas untuk Ags diri. Tidak selalu jelas apa peran dimainkan oleh
Abs dan peran apa yang dimainkan oleh komponen lain dari sistem kekebalan pada autoimunitas.
Berbagai mekanisme molekuler telah diusulkan, termasuk Ags yang diasingkan, mimikri molekuler,
dan aktivasi sel-B poliklonal.
MODEL UNTUK Mempelajari PENGAKUAN BIO-MOLEKULER

Ciri mendasar dari sistem kekebalan adalah kemampuannya untuk terus menghasilkan situs pengenal
protein baru. Tas antarmuka, oleh karena itu, sering dianggap sebagai model sistem untuk
menjelaskan prinsip-prinsip yang mengatur pengakuan biomolekuler. Misalnya, Keskin dan McCoy
et al. Menggunakan struktur kristalografi sinar-X kompleks Ab-Ag untuk menjelaskan prinsip-prinsip
arsitektur molekul antarmuka protein-protein bagaimanapun, melihat antarmuka Ab-Ag sebagai kasus
khusus mungkin tidak memungkinkan generalisasi untuk semua jenis protein-protein antarmuka.
Dengan demikian, skala besar interaksi protein-protein sering mengecualikan kompleks Ab-Ag dari
dataset yang dianalisis.Oleh karena itu, penting untuk menentukan sejauh mana kompleks AbAg
dapat berfungsi sebagai model umum untuk protein-protein interaksi.

TEKNIK ANTIBODI

Spesifisitas molekul Ab terhadap Ag serumpunnya adalah dieksploitasi untuk pengembangan

berbagai immunoassay, vaksinasi, dan terapi. Rekayasa mungkin menawarkan untuk memperluas
aplikasi Abs dengan mengizinkan peningkatan afinitas (20, 21) dan spesifisitas (22, 23). Studi awal
tentang penggunaan Abs tikus pada manusia ditentukan bahwa mereka dapat menjadi imunogenik
(24). Humanisasi dengan mencangkok CDR dari mouse Ab ke FR manusia adalah umum
menggunakan strategi rekayasa untuk mengurangi imunogenisitas (25, 26). Dalam kebanyakan
kasus, desain afinitas tinggi yang sukses, cangkok CDR, Abs mensyaratkan bahwa residu kunci dalam
FRs akseptor manusia sangat penting untuk menjaga konformasi fungsional CDR akan dimutasi
kembali ke asam amino dari murine Ab asli (26, 27). Beberapa kelompok (28-30) menggunakan
struktur Ab-Ag 3-D yang ditentukan secara eksperimental dalam Data Protein Bank (PDB) (31) untuk
menentukan residu mana yang berpartisipasi dalam Ag pengakuan dan mengikat. Pengetahuan
seperti itu bisa dimanfaatkan mengidentifikasi residu yang penting untuk fungsi Ab secara umum
dan untuk pengakuan Ag pada khususnya dan dapat memandu Ab teknik (32, 33). Residu yang
membantu menjaga fungsional konformasi CDR, misalnya, dapat digunakan untuk meningkatkan Ab
upaya humanisasi dengan pencangkokan CDR.

Ab PREDIKSI EPITOP

Epitop antibodi (kadang-kadang disebut sebagai epitop sel-B) adalah struktur molekul dalam Ag yang
membuat kontak tertentu dengan paratope Ab. Epitop sel-B digunakan dalam pengembangan vaksin
dan imunodiagnostik. Identifikasi epitop sel-B dapat meningkatkan kekebalan protektif dalam
konteks penyakit dan potensi infeksi yang muncul dan muncul kembali ancaman bioteroris.

Secara umum, metode saat ini berusaha mengidentifikasi epitopik residu berdasarkan pada kehadiran
fitur yang terkait dengan residu yang mengikat Ab.Satu penjelasan yang mungkin untuk kegagalan
tersebut dari metode ini adalah bahwa perbedaan antara epitop dan lainnya residu tidak
substansial.Memang, beberapa analisis miliki menunjukkan bahwa komposisi asam amino epitop
pada dasarnya tidak bisa dibedakan dari non-epitopik yang terpapar permukaan lainnya
residu.Kurangnya sifat intrinsik yang jelas membedakan antara residu epitopik dan non-epitopik dan
fakta bahwa sebagian besar permukaan Ag dapat menjadi bagian dari epitop dalam beberapa keadaan
menyarankan itu epitop bergantung, sebagian besar, pada Abs yang mengenalinya. Ini dicontohkan
sebagian besar residu permukaan HEL adalah bagian dari epitop setidaknya satu Ab bahkan meskipun
angka ini hanya menunjukkan tiga Abs (dari puluhan diketahui bind HEL). Hampir semua residu yang
diprediksi bersifat epitopik mungkin dianggap sebagai prediksi yang benar karena mereka mengikat
beberapa Ab (Gambar 1C) tetapi juga prediksi yang salah karena tidak mengikat yang lain. Demikian
pula, meramalkan bahwa residu tidak ada dalam epitop mungkin benar negatif atau negatif palsu,
tergantung pada Ab yang dipertimbangkan. Itu baru-baru ini disarankan oleh kami.

Bahwa prediksi epitop harus dilakukan untuk Ab tertentu. Konsep serupa berhasil diterapkan di
Internet kasus metode prediksi epitop sel T: metode ini tidak memeriksa Ag untuk fitur-fitur umum.
Sebaliknya, prediksi berbeda dibuat, tergantung pada pengikatan molekul MHC spesifik dan
menyajikan epitop ke sel T.

PERAN CDR DAN DEFINISI MEREKA

Abs adalah semua protein beta yang terdiri dari empat rantai polipeptida: dua rantai berat identik (H)
dan dua rantai ringan identik (L) . Rantai ringan dan berat terhubung oleh ikatan disulfida untuk
membentuk lengan struktur berbentuk Y, masing-masing arm dikenal sebagai Fab.Fab terdiri dari dua
domain variabel (VH di rantai berat dan VL di rantai ringan) dan dua domain konstan (CH1 dan CL) .
Dalam pemasangan rantai ringan dan berat, dua domain variabel dimerize untuk terbentuk fragmen Fv
yang berisi situs Ag mengikat. Di dalam masing-masing domain variabel terletak enam loop
hypervariable , tiga dalam terang rantai (L1, L2, dan L3) dan tiga di rantai berat (H1, H2, dan H3),
didukung oleh FR yang terlestarikan dari β-sheet. Ringan dan berat domain variabel lipat dengan cara
yang membawa hypervariable loop bersama untuk membuat situs pengikatan Ag atau paratope. Dua
domain tambahan dari rantai berat, CH2, dan CH3, menyusun Wilayah Fc yang bertanggung jawab
untuk memediasi aktivitas biologis dari molekul Ab.

IDENTIFIKASI CDR

CDR diyakini bertanggung jawab pengakuan Ag. Oleh karena itu, fokus utama dalam menganalisis
dasar struktural untuk pengakuan Ag adalah dalam mengidentifikasi batas-batas pasti dari CDR di Ab
yang diberikan.Kabat dan rekan penulis adalah orang pertama yang memperkenalkan pendekatan
sistematis untuk mengidentifikasi CDR pada Abs yang baru diurutkan.Berdasarkan perataan, mereka
memperkenalkan penomoran skema untuk residu di daerah hypervariable dan menentukan posisi
mana yang menandai awal dan akhir masing-masing CDR. Ketika data struktural tersedia,Batas-batas
FR dan CDR ditentukan dan yang terakhir telah ditunjukkan untuk mengadopsi seperangkat
konformasi terbatas, berdasarkan pada keberadaan residu tertentu pada posisi kunci di CDR dan FR
yang mengapit. Kabat dan Chothia skema diperlakukan secara terpisah keluarga yang berbeda dari
domain imunoglobulin, Lefranc dan rekan mengusulkan suatu kesatuan skema penomoran (disebut
skema penomoran IMGT) untuk urutan genomik domain variabel imunoglobulin, termasuk Ab
domain variabel ringan dan berat, serta domain variabel reseptor sel-T. Untuk mengkorelasikan antara
urutan, struktur, dan perilaku lipat domain dari semua domain variabel imunoglobulin, skema
penomoran Aho secara spasial selaras dengan struktur 3-D yang diketahui imunoglobulin dan
menyatukan penomorannya (70). Kelemahan dari penomoran Kabat, Chothia, dan IMGT Skema
adalah bahwa variabilitas panjang CDR hanya memperhitungkan panjang loop paling umum;
Sementara keduanya Kabat dan Chothia skema mengakomodasi penyisipan dengan huruf

Jumlah struktur Ab-Ag yang tersedia untuk umum meningkat dalam beberapa tahun terakhir ke
tingkat yang memungkinkan skala besar analisis. Dalam analisis terbaru (29) kami menggunakan
semua kompleks proteinAb yang tersedia di PDB untuk mengidentifikasi daerah struktural di mana
Pengikatan ag sebenarnya terjadi. Pendekatan ini diimplementasikan ke dalam sebuah metode yang
dijuluki Paratome (30, 74) yang didasarkan pada multi-alignment alignment (MSTA) dari semua
kompleks Ab-Ag yang tersedia dalam PDB. MSTA mengungkapkan wilayah konsensus struktural di
mana pola posisi struktural yang mengikat Ag adalah sangat mirip di antara semua Abs. Daerah ini
mengikat structural konsensus disebut daerah pengikatan antigen (ABR). Sementara CDR,
sebagaimana diidentifikasi dengan metode seperti Kabat (63), Chothia (65), dan IMGT (69), mungkin
kehilangan ∼20% residu pengikatan Ag, ABR menutupi ∼96% residu yang sebenarnya mengikat Ag
(30). Menghindari kebingungan dan nomenklatur rumit, di sini kita secara umum lihat CDR, SDR,
dan ABR sebagai “CDR” kecuali dinyatakan sebaliknya. Gambar 3 menunjukkan contoh CDR yang
diidentifikasi oleh Kabat, Chothia, IMGT, dan Paratome untuk satu Ab (anti-IL-15, PDB ID: 2XQB),
dibandingkan dengan residu pengikatan Ag yang sebenarnya. Itu bisa dilihat bahwa dalam contoh ini,
beberapa CDR (mis., L3, H3) diidentifikasi oleh empat metode hampir identik, sedangkan di CDR
lainnya (mis., L2, H1, dan H2) ada perbedaan substansial antara metode. MSTA of Abs dengan
struktur 3-D yang diketahui juga mengkonfirmasi pengamatan sebelumnya bahwa ada posisi
structural dalam CDR di mana tidak ada, atau hanya sebagian kecil dari Abs hubungi Ag. Ini
ditunjukkan pada Gambar 4 di mana contoh dari posisi seperti itu ditandai dengan panah hijau.

INTEGRALITAS VS MODULARITAS

Sistem yang dirancang sering ditandai sebagai modular atau integral. Dalam sistem modular,
komponen atau modul berbeda, berfungsi independen dari fungsi modul lainnya. Itu generasi Abs
dalam sistem kekebalan didasarkan pada penggabungan elemen yang berbeda, dengan cara yang dapat
dianggap modular di mana setiap komponen mampu mengikat Ag terlepas dari lainnya. Namun,
beberapa analisis menyarankan bahwa Ag mengikat waran pandangan yang lebih integratif dari
hubungan antara yang berbeda komponen Ab. Situs pengikatan protein yang berinteraksi biasanya
terdiri dari tambalan permukaan yang memiliki bentuk yang baik dan komplementer elektrostatik (15,
75, 76). Telah ditunjukkan bahwa CDR
dicirikan oleh komposisi asam amino yang berbeda dari loop protein lain (77) dan juga dari tipe lain
antarmuka protein-protein (58). Jadi, orang akan mengharapkan itu epitop, seperti paratop, harus
memiliki asam amino yang berbeda komposisi. Namun, beberapa analisis terbaru (51, 53) telah
menunjukkan bahwa ini bukan masalahnya: sedangkan epitop berbeda dari jenis lain dari interface
(10, 29, 60), komposisi asam amino mereka sebenarnya sama dengan residu permukaan non-epitopik.
Beberapa penelitian menunjukkan bahwa setiap CDR memiliki keunikannya sendiri komposisi asam
amino, berbeda dengan komposisi CDR lainnya (52, 58, 78). Selain itu, kami telah menunjukkan
bahwa masing-masing Oleh karena itu, CDR memiliki serangkaian preferensi kontak yang unik.

asam amino tertentu lebih dari yang lain (52). Membagi residu epitope menjadi enam himpunan
bagian sesuai dengan CDR yang mereka ikat, kami menemukan itu masing-masing himpunan bagian
memiliki komposisi asam amino yang berbeda, dapat dibedakan dari permukaan non-epitop (52).
integrasi keenam CDR bersama-sama, masing-masing dengan keunikannya sendiri komposisi asam
amino dan preferensi kontak, bisa menjadi respons evolusioner dari sistem kekebalan yang
memungkinkan Abs untuk mengenali hampir semua tambalan permukaan pada Ag.

Terlepas dari efek terintegrasi dari CDR ini, Abs juga dapat dianggap sebagai sistem modular, terdiri
dari berbagai elemen (misalnya sebagai Fab, VH dan VL, atau enam CDR), yang dapat mengikat Ag
sendiri. Fragmen Ab yang lebih kecil yang mempertahankan Ag mengikat afinitas dan spesifisitas,
memegang potensi besar untuk desain obat (79- 81) karena mereka telah meningkatkan
farmakokinetik, jaringan dan tumor penetrasi, dan dapat diproduksi lebih ekonomis (80, 81). Fragmen
VH dan VL biasanya menunjukkan lengket perilaku, kelarutan rendah, dan afinitas pengikatan Ag
berkurang (83-85), meskipun, mereka kadang-kadang mempertahankan kekhususan untuk Ag (83, 85-
87). CDR dapat memberikan tingkat modularitas tambahan. Menurut hipotesis hotspot yang diterima
secara umum, pengikatan energi dua protein sangat ditentukan oleh sejumlah kecil residu antarmuka
kritis (12,88-90). Melakukan siklisasi CDR dengan menambahkan residu Cys di dalamnya edge
disarankan sebagai solusi untuk masalah ini (96, 102-104). Alasan lain mungkin terletak pada
kenyataan bahwa banyak upaya untuk desain peptida turunan CDR dibuat berdasarkan CDR-H3,
sebagaimana adanya dianggap sebagai CDR paling penting untuk pengikatan Ag (67, 105-107).
Namun, panjang rata-rata ABR-H2 secara substansial lebih lama dari H3, dan keduanya biasanya
membentuk angka yang sama interaksi dengan Ag (52). Selain itu, sementara ABR-H3 adalah terbukti
memiliki kontribusi tertinggi untuk energi ikat Ag pada rata-rata (52) Kami telah menunjukkan (102)
bahwa itu adalah CDR dapat mengikat Ag sendiri memiliki karakteristik unik dan, dengan demikian,
dapat diidentifikasi secara komputasional mengingat kompleks Ab-Ag struktur. Ini dapat
meningkatkan desain peptida turunan CDR yang tidak harus didasarkan pada CDR-H3.

DETERMINAN NON-CDR YANG MEMILIKI PERAN DI AG BINDING

FR RESIDUES

domain variabel, CDR diyakini bertanggung jawab untuk pengakuan Ag, sedangkan residu FR
dianggap a perancah untuk CDR. Namun, sekarang sudah mapan itu beberapa residu FR mungkin
memainkan peran penting dalam pengikatan Ag (32, 108). Yang pertama adalah residu FR yang
kontak Ag, dengan demikian adalah bagian dari situs pengikatan (108, 109, 111, 116–123). Beberapa
residu ini berdekatan secara berurutan dengan CDR (sebenarnya mereka mungkin berada dalam batas-
batas CDR menurut beberapa orang Metode identifikasi CDR, tetapi tidak sesuai dengan yang lain,
seperti yang ditunjukkan pada Gambar 3). Residu lainnya adalah residu yang jauh dari CDR secara
berurutan, tetapi berdekatan dengan struktur 3-D. Di khususnya, loop dalam rantai berat FR-3,
kadang-kadang disebut sebagai CDR-H4, menyumbang 1,3% dari kontak Ab-Ag manusia (78, 124).
CDR-H4 ini juga diperkaya (dalam Abs manusia) dalam hypermutations somatik (Burkovitz et al.,
Disampaikan).

Dalam kategori residu yang kedua dapat mempengaruhi pengikatan Ag, yaitu residu yang bersentuhan
dengan Ag , dapat mempengaruhi pengikatan Ag secara tidak langsung. Residu ini dibagi dalam
pendekatan spasial dengan CDR dan ada yang tidak. Untuk yang pertama dapat mengikat yaitu
dengan cara memberikan dukungan struktual dengan CDR , hal ini memungkinkan untuk mengadopsi
konformasi dan orientasi yang tepat. Posisi tertentu dalam rantai berat FR-3 dalam struktur urutan
CDR-H1 dan CDR-H2, mempengaruhi orientasi CDR-H2 yang relative terhadap CDR-H1 sama
halnya dalam rantai samping besar , rantai samping besar dapat memisahkan sementara , sedangkan
rantai samping kecil dapat mendekatkan satu sama lain.
Kerangka residu dapat berperan dalam mempertahankan struktur keseluruhan domain Fv. Namun
residu FR dapat mempengaruhi pengikatan Ag itu sendiri, yaitu dengan cara mengarahkan orentasi
VH vs VL, yang dengan demikian orientasi CDR relatif satu sama lain. Residu FR-2 memainkan
peran penting dalam interaksi VH-VL. FR-2 loop, dapat mengontrol kekuatan interaksi VH-VL serta
ketergantungan dengan Ag mengkat. konformasi loop dapat berubah setelah Ag mengikat lebih dari
residu dalam FRs, dan perubahan konformasi yang mengikat loop ini sama besarnya di CDR . peran
residu FR dalam mengikat Ag sangat penting untuk desain Ab efisien pada umumnya dan untuk
humanisasi pada khususnya. Residu FR dapat mempengaruhi Ag mengikat , dan dapat
mempertimbangkan urutan mutasi pada khususnya. upaya yang dapat dilakukan untuk
mengidentifikasi posisi yang berkontribusi pada pengikatan Ag terdapat dalam banyak kasus .
contohnya (Haidar et al) menggunakan dataset Ab-Ag non-redundan struktur untuk mengidentifikasi
posisi yang sering menghubungi CDR, dan menggabungkan posisi-posisi ini dengan mereka yang
bermutasi kembali. Dasar struktural pengenalan antibodi-antigen sering dalam literatur humanisasi
(Sela-Culang et al) .

WILAYAH KONSTAN

Ada banyak contoh Abs dengan domain variabel identik tetapi berbeda isotipe yang mengikat
Ag yang sama dengan afinitas atau spesifisitas yang berbeda (134-146). Sebagai contoh, dua
Abs berbagi variabel identic tion. Misalnya, anti-HIV-1 IgG1 dan IgA2 Abs yang disebutkan
di atas berbagi sama wilayah variabel, bagaimanapun, mereka telah terbukti memblokir HIV-
1 infeksi berbeda (144). Sementara IgA2 memblokir transcytosis HIV-1 dan infeksi sel CD4
+ secara lebih efisien, IgG1 dan IgA2 bertindak secara sinergis untuk memblokir transfer
HIV-1 dari sel Langerhans ke T sel. Dengan demikian, telah disarankan bahwa vaksin
berbasis IgA mukosa respons harus melengkapi respons vaksin berbasis IgG di memblokir
penularan HIV-1.

SIMPULAN PENUTUP

Abs adalah salah satu biosensor alami yang paling fleksibel, sangat penting untuk
menguraikan struktur dan molekul mekanisme dimana mereka mengenali dan mengikat Ags
mereka. pengetahuan sangat penting untuk memahami kekebalan, memungkinkan prediksi
Ab epitop yang lebih baik, dan membantu dalam rekayasa Ab. temuan terbaru menunjukkan
bahwa tidak semua posisi dalam CDR yang didefinisikan secara tradisional penting untuk
mengikat. Lebih jauh, sudah terbukti banyak posisi yang berkontribusi kritis terhadap energi
ikat berada luar CDR transisi. Selain itu, metode identifikasi CDR yang berbeda mungkin
sering mengidentifikasi peregangan yang sangat berbeda sebagai "CDR," Loop hypervariable
yang mengakomodasi CDR berbeda secara signifikan dari satu sama lain pada berbagai
aspek. Memahami jalan masuk yang mengikat preferensi mereka diintegrasikan untuk
menghasilkan keseluruhan kekhasan Ab adalah struktur yang menarik dan biofisik tantangan.

Perbatasan dalam Imunologi | Biologi Sel B Oktober 2013 domain tetapi mengekspresikan
isotipe yang berbeda ditunjukkan untuk mengikat tubulin dengan afinitas yang sangat
berbeda (135).Dan telah ditunjukkan bahwa kompleks HEL dan Fv versi HyHEL-10 Ab
memiliki urutan disosiasi konstanta yang lebih rendah dari pada kompleks HEL dengan versi
Fab Ab ini (147). Penjelasan yang mungkin untuk fenomena ini akan menjadi pengaruh
alosterik dari domain konstan pada struktur dari domain variabel. Memang, beberapa studi
struktural memberikan beberapa bukti untuk efek struktural seperti itu (133, 146,
147).Contohnya, Janda et al. (133) dianalisis oleh Circular Dichroism (CD) spektrum empat
isotipe Ab berbeda dari keluarga 3E5 yang berbagi domain variabel identik, dan
menunjukkan bahwa isotipe berbeda mengalami perubahan struktural yang berbeda saat
mengikat Ag umum. Hasil serupa diperoleh untuk Abs anti-nuklir juga: Xia et al. (146)
membandingkan empat isotipe berbeda dari PL9-11 anti-nuklir Ab berbagi wilayah variabel
yang sama, dan menemukan bahwa perubahan dalam konten struktur sekunder (seperti yang
diungkapkan oleh analisis CD) sebagai pergeseran panjang gelombang emisi fluoresensi
triptofan, pada pengikatan Ag, keduanya bergantung pada isotipe.