Anda di halaman 1dari 77

Accelerat ing t he world's research.

Apakah DNA
Vivi Lau

Related papers Download a PDF Pack of t he best relat ed papers 

Microbial Genet ics (Genet ika Mikroba)


M Rian

ASAM NUKLEAT
Sona Yudha Diliana

Genet ika
Nurvit a Eka Adiyat i
W a hyu P.P.

Apakah DNA?
Hak cipta dilindungi oleh undang-undang.
Dilarang mengutip atau memperbanyak sebagian atau seluruh isi buku ini tanpa izin
tertulis dari penerbit.

Ketentuan pidana pasal 72 UU No. 19 tahun 2002

1. Barangsiapa dengan sengaja dan tanpa hak mengumumkan atau memperbanyak


suatu ciptaan atau memberikan izin untuk itu, dipidana dengan pidana penjara pal-
ing singkat 1 (satu) bulan dan/atau denda paling sedikit Rp 1.000.000, 00 (satu juta
rupiah), atau pidana penjara paling lama 7 (tujuh) tahun dan/atau denda paling banyak
Rp 5.000.000.000, 00 (lima miliar rupiah).
2. Barangsiapa dengan sengaja menyerahkan, menyiarkan, memamerkan mengedarkan,
atau menjual kepada umum suatu Ciptaan atau barang hasil pelanggaran Hak Cipta
atau Hak Terkait sebagaimana dimaksud pada ayat (1), dipidana dengan pidana penjara
paling lama 5 (lima) tahun dan/atau denda paling banyak Rp 500.000.000, 00 (lima
ratus juta rupiah).

APAKAH DNA?

Penyusun : Wahyu P.P.


Editor : Edi Warsidi & Reissa Y.
Design Sampul : Andri Sheva
Lay Out : Rahmat Deedat
Cetakan Pertama : Tahun 2009
Cetakan Kedua : Tahun 2013

Penerbit:
PT. PURI DELCO
Jl. Terusan Martanegara No. 12 Bandung 40275 - INDONESIA
Telp. 022-7321271 / 7301277
Fax. 022-7321271
E-mail: puri.delco@yahoo.com

Perpustakaan Nasional: Katalog Dalam Terbitan (KDT)

P.P., Wahyu
Apakah DNA? / Wahyu P.P.
Cet. 2 - Bandung: Puri Delco, 2013.
iv + 72 hlm.; ilus; 21 cm

Bibliografi: hlm. 74
ISBN 978-602-8713-20-7

1. Apakah DNA? I. Judul


Kata Pengantar

Tahukah kam u, di dalam set iap int i dari sel- sel


pem ben t u k t u bu h m an u sia y an g k eselu r u h an n y a
berj um lah t rilyunan, t erdapat kum pulan dat a yang
cukup besar unt uk m engisi sebuah ensiklopedi yang
t erdiri dari 900 j ilid? I t ulah DNA.
DNA m em uat t idak hanya rancangan sebuah sel,
t et api j uga rancangan ut uh t ubuh m ak hluk hidup.
St rukt ur organ dalam t ubuh kit a, at au bent uk sayap
burung, singkat nya segala sesuat unya, t erkodekan
dalam DNA hingga bagian- bagiannya yang t erkecil.
Set iap in f or m asi y an g ada ber asal dar i su at u
su m b e r k e ce r d a sa n y a n g m e n j a d i k a n n y a a d a .
I n f or m asi m en ak j u bk an dalam DNA adalah bu k t i
adanya ilm u penget ahuan dan hikm ah luar biasa, sert a
kekuasaan pencipt aan oleh Tuhan.
Dalam buku ini, kam u akan m engenal lebih j auh
m engenai DNA. Selam at m em baca dan m enam bah
wawasan.

Salam ,

Penulis

iii
Daftar Isi
Ka t a Pe nga nt a r .................................................... iii
D a ft a r I si ............................................................. iv

Ba b 1 Pe nda hulua n ............................................... 5


A. Genet ika Manusia ............................................... 5
B. Krom osom ......................................................... 6
C. Gen ................................................................ 20
D. Alel dan Alel Ganda .......................................... 24

Ba b 2 M e nge na l D N A ........................................... 2 7
A. Apakah I t u DNA? .............................................. 28
B. Sej arah DNA .................................................... 33

Ba b 3 M e nge na l St r uk t ur
da n Fu n gsi Biologis D N A ............................ 37
A. St rukt ur DNA ................................................... 37
B. Fungsi DNA ...................................................... 41
C. Replikasi DNA .................................................. 41

Ba b 4 RN A ........................................................... 49
A. St rukt ur RNA ................................................... 49
B. Sint esa Prot ein ................................................. 53
C. Kode Genet ik ................................................... 58

Ba b 5 D N A da n Te k nologi M a sa Kini ................... 61


A. DNA dalam Forensik ......................................... 61
B. DNA dalam Kom put asi ...................................... 62
C. Tes DNA .......................................................... 64

Glosa r iu m ........................................................... 71
I n de k s ................................................................ 73
D a ft a r Pust a k a .................................................... 74
Riw a ya t Pe nulis .................................................. 76

iv
Ba b 1
Pendahuluan

A. Genet ik a M a nusia

1 . Genet ik a M a nusia
Cobalah kam u cerm ati sifat m aupun ciri tubuh yang
terdapat dalam keluarga kam u! Adakah persam aan
ciri tubuh di antara anggota keluarga kam u? Dalam
hal apa sajakah persam aan-persam aan yang ada itu?

Sum be r : www. ext ension.um d.edu

5
Biasanya dalam satu keluarga terdapat kem iripan
atau ciri-ciri yang ham pir sam a. Kesam aan tersebut
dapat terlihat m isalnya pada bentuk ram but (keriting,
lurus), warna kulit (kuning, cokelat), dan sebagainya.
Ma t e r i g e n e t i k a b e r u p a g e n , D N A, d a n
k r om osom . Mat er i genet ik a t er sebut t er dapat di
berbagai sel di seluruh t ubuh, m isalnya pada sel-
sel dar ah , sel t u lan g, sel gam et dan lain - lain ,
t epat nya m at eri genet ika t ersebut berada di dalam
nukleus. Peranan m at eri genet ika t ersebut adalah
untuk m en gat u r p e w a r i sa n si f a t k epada
ket urunannya, m isalnya m engat ur bent uk ram but ,
warna kulit , susunan darah, dan lain- lain sepert i
yang t elah dij elaskanpada fakt a di depan.

B. Kr om osom
Krom osom m erupakan st rukt ur m akrom olekul
besar yang m em uat DNA yang m em bawa inform asi
genet ik dalam sel. DNA t erbalut dalam sat u at au
lebih krom osom .
Sebuah krom osom ( dalam bahasa Yunani chrom a
= warna dan som a= badan) adalah seberkas DNA
y an g san g at p an j an g d an b er k elan j u t an , y an g

6
t erdapat banyak gen unsur regulat or dan sekuens
nukleot ida lainnya.
Dalam k r om osom euk ar iot a, DNA yang t idak
t erkondensasi berada dalam st rukt ur order- quasi
dalam n u k leu s, dim an a ia m em bu n gk u s h ist on
( prot ein st rukt ural, Gam bar 1) , dan di m ana m at erial
k om posit ini disebut chr om at in. Selam a m it osis
( pem belahan sel) , k r om osom t er k ondensasi dan
disebut krom osom m et afase. Hal ini m enyebabkan
m asing- m asing krom osom dapat diam at i m elalui
m ikroskop opt ik.
Set iap k r om osom m em ilik i dua lengan, yang
pendek disebut lengan p ( dari bahasa Perancis pet it
yang berart i kecil) dan lengan yang panj ang lengan
q ( q m engikut i p dalam alfabet ) .
Prokariot a t idak m em iliki hist on at au nukleus.
Dalam keadaan sant ainya, DNA dapat diakses unt uk
t ranskripsi, regulasi, dan replikasi.
Krom osom pertam a kali diam ati oleh Karl Wilhelm
von Nägeli pada 1842 dan ciri- cirinya dij elaskan
dengan detil oleh Walther Flem m ing pada 1882. Pada
1910, Thom as Hunt Morgan m em bukt ikan bahwa
krom osom m erupakan pem bawa gen.

7
Thom a s H unt M or ga n

Sum be r : www .nobelprize.org

Di dalam t ubuh m akhluk hidup di m ana let ak


krom osom it u? Krom osom t erdapat di dalam int i
sel. Kr om osom pada m ak h lu k h idu p ber u k u r an
p an j an g 0 , 2 – 5 0 m ik r on d an d iam et er 0 , 2 – 2 0
m ikron. Pada m anusia ukuran krom osom kurang
lebih 6 m ikron. Krom osom berfungsi m em bawa sifat

8
individu dan m em bawa inform asi genet ika, karena
di dalam k r om osom m engandung gen. Gen- gen
pada k r om osom t er dapat pada t em pat nya yang
disebut dengan lokus. Gen m erupakan bagian dari
m olekul DNA.

Su m be r : www.m bbnet .um n.edu

9
Krom osom dapat diam at i dengan m enggunakan
alat bant u m ikroskop pada wakt u sel m em belah,
yait u ber upa kr om at in. Pada saat sel m em belah
krom at in dapat m enebal dan m em endek.

1 . Susuna n Krom osom


Krom osom pada organism e prokariot ik ada yang
ber upa RNA saj a. I ni dapat dij um pai pada v ir us
m ozaik ( t em bakau) . Krom osom dapat pula berupa
DNA saj a m isalnya pada virus T dan dapat pula
m engandung keduanya yait u DNA dan RNA sepert i
pada bakt eri Escherichia coli.
Krom osom pada organism e eukariot ik t ersusun
dari bagian- bagian berikut .

a. DNA
DNA m en y u su n k r om osom sek it ar 3 5 % dar i
keseluruhan krom osom .

10
Sum be r : www.scq.ubc.ca

b. RN A
RNA m en y u su n k r om osom sek it ar 5 % d ar i
keseluruhan krom osom .

11
Sum be r : www.t igger.uic.edu

c. Pr ot e in
Prot ein ini t erdiri at as hist on yang bersifat basa
dan nonhist on yang bersifat asam . Kedua m acam
pr ot ein ini ber fungsi unt uk m enggulung benang
krom osom sehingga m enj adi pudar dan berperan
sebagai enzim pengganda DNA dan pengkopi DNA.

12
Su m be r : www.oblkt irupifabiounsoed.files.wordpress.com

2 . St ruk t ur Krom osom


Krom osom m em iliki st rukt ur sebagai berikut .

a . Se n t r om e r
Sent rom er m erupakan bagian kepala krom osom
berbent uk bulat yang m erupakan pusat krom osom
dan m em bagi krom osom m enj adi dua lengan.

13
Bag ian in i m er u p ak an d aer ah p en y em p it an
pert am a pada krom osom yang khusus dan t et ap.
Daer ah in i disebu t j u ga k in et ok or at au t em pat
m elek at n ya ben an g- ben an g gelen don g ( spin dle
f o b e r ) . El e m e n - e l e m e n i n i b e r f u n g s i u n t u k
m en gger ak k an k r om osom selam a m it osis at au
sebagian dari m it osis. Pem belahan sent rom er ini
akan m em ulai gerakan krom atid pada m asa anafase.

Su m be r : www.gurungeblog.files.wordpress.com

14
b. Le nga n
Bagian len gan in i m er u pak an bagian badan
ut am a krom osom yang m engandung krom osom dan
gen. Um um nya j um lah lengan pada krom osom dua,
t et api ada j uga beberapa yang hanya berj um lah
sat u. Lengan dibungkus oleh selaput t ipis dan di
dalam nya t erdapat m at riks yang berisi cairan bening
yang m engisi selur uh bagian lengan. Cair an ini
m engandung benang- benang halus berpilin yang
disebut krom onem a.

Su m be r : www.gurungeblog.files.wordpress.com

15
Bagian krom onem a yang m engalam i pem belahan
disebut krom om er yang berfungsi unt uk m em bawa
sifat ket urunan sehingga disebut sebagai lokus gen.
Pad a b ag ian u j u n g k r om osom t er d ap at su at u
t am bahan yang disebut sat elit .

3 . Pem ba gia n Krom osom


Ber dasar k an let ak sen t r om er n ya, k r om osom
dibagi m enj adi em pat , yait u sebagai berikut .

a . Te lose n t r ik
Telosent r ik ini m em iliki cir i- cir i yait u m em iliki
lengan hanya sat u, m em iliki bent uk sepert i bat ang,
dan let ak sent rom ernya berada di uj ung.

b. M e t a se n t r ik
Met asent rik ini m em iliki ciri- ciri yait u m em punyai
dua lengan yang sam a panj ang, dan let ak sent rom er
berada di t engah m em iliki bent uk sepert i huruf V.

c. Ak r ose n t r ik
Akrosent rik m em iliki ciri- ciri yait u m em punyai
d u a l e n g a n y a n g t i d a k sa m a p a n j a n g , l e t a k
sent r om er nya dekat uj ung, dan m em iliki bent uk
sepert i huruf J.

16
d. Su bm e t a se n t r ik
Ked u a len g an h am p ir sam a p an j an g , let ak
sent rom er ham pir di t engah, m em iliki bent uk sepert i
huruf L.

Sum be r : www. im g523.im ageshack.us

4 . Tipe Krom osom


Berdasarkan tipenya, krom osom dibagi m enj adi
dua.

a . Aut osom ( Kr om osom Tubuh)


Au t osom adalah k r om osom t u bu h dan t idak
m enent ukan j enis kelam in. Aut osom ini m em punyai
bent uk pasangan ant ara j ant an dan bet ina, dan
m em iliki j um lah n – 1 at au 2n – 2 dengan sifat nya
diploid. Aut osom biasanya disim bolkan dengan A.

17
b. Gonosom ( Krom osom Sek s)
Gonosom adalah k r om osom sek s yang dapat
m enent ukan j enis kelam in. Gonosom ini m em punyai
bent uk pasangan t idak sam a ant ara j ant an dan
bet ina, berj um lah sat u pasang dan bersifat haploid.

Sum be r : www.m un.ca

4 . Uk ura n da n Jum la h Krom osom


Ukuran dan j um lah krom osom sangat bervariasi
dari berbagai spesies. Sel t ubuh krom osom selalu
b er a d a d a l a m k ea d a a n b er p a sa n g - p a sa n g a n .

18
Kr om osom y an g ber pasan gan den gan m em ilik i
b en t u k , u k u r a n d a n k o m p o si si sa m a d i seb u t
krom osom hom olog. Hal ini dapat dij um pai pada
sel t u b u h lalat b u ah y an g m em ilik i 4 m acam
k r o m o so m hom olog, se d a n g k a n m a n u si a
m em punyai 23 m acam krom osom hom olog.
Perangkat krom osom disebut genom , pada sel
t ubuh t erdapat sepasang krom osom yang disebut
diploid ( 2 n ) , sedan gk an pada sel gam et h an ya
t erdapat sat u pasang krom osom saj a yang disebut
dengan haploid ( n) . Seseorang yang m engalam i
penyakit kanker m aka set krom osom nya lebih dari
dua, kem ungkinan t erj adi t riploid, t et raploid, dan
poliploid.

19
Sum be r : www.3.bp.blogspot .com

C. Gen
Pad a t ah u n 1 9 0 2 , Bov er i d an W. S. Su t t on
m em b u k t i k a n b a h w a g en a d a l a h b a g i a n d a r i
k r om osom y an g t er let ak ber der et - der et secar a
t er at ur pada k r om osom . Gen t er let ak di dalam
k r om osom , yait u di suat u t em pat y ang disebut
dengan lok us. Lokus- lokus ini digam barkan sebagai

20
gar is- gar is pendek yang hor izont al di sepanj ang
krom osom yang digam barkan sebagai garis panj ang
vert ikal.

Su m be r : www.biot ekt anam an.files.wordpress.com

Jik a k am u per h at ik an , m asin g- m asin g lok u s


dit em pat i oleh j aj aran huruf at au abj ad. Huruf- huruf
t er sebu t m er u pak an sim bol dar i gen . Gen - gen
t er seb u t t er l i h at b er j aj ar d ar i at as k e b aw ah

21
sepanj ang garis vert ikal, yang m erupakan sim bol
dari krom osom . Huruf abj ad ada yang dit ulis dengan
huruf besar dan kecil. Huruf besar m enunj ukkan sifat
yan g dom in an dar i gen , sedan gk an h u r u f k ecil
m enunj ukkan sifat yang resesif dari gen.

Sum be r : www.free.vlsm .org

Gen- gen yang m enam pak k an senyaw a k im ia


sebagai subst ansi heredit as m em punyai sifat- sifat
sebagai berikut .
1. Sebagai zarah t ersendiri yang t erdapat dalam
krom osom .
2. Mengandung inform asi genet ik.
3. Dapat m enduplikasi diri saat t erj adi pem belahan
sel.
4. Mem punyai t ugas khusus sesuai fungsinya.
5. Ker j anya dit ent uk an oleh susunan k om binasi
basa nit rogennya.

22
Ge n m e r u p a k a n su b st a n si h e r e d i t a s y a n g
m em iliki fungsi sepert i berikut .
1. Menyam paikan inform asi genet ika dari generasi
ke generasi.
2. Men gon t r ol dan m en gat u r m et abolism e dan
perkem bangan t ubuh. Proses reaksi kim ia dalam
t ubuh dapat t erj adi secara berurut an. Pada set iap
t ahap reaksinya diperlukan enzim . Pem bent ukan
dan pengont rolan kerj a enzim t ersebut dilakukan
oleh g en . Pad a p r oses p er k em b an g an y an g
m em erlukan horm on j uga diat ur oleh gen.
3. Men en t u k an sif at - sif at p ad a k et u r u n an n y a.
Sepert i dicont ohkan pada fakt a di depan. Sifat-
sifat t ersebut dapat berupa warna kulit , bent uk
ram but , bent uk badan, dan lain- lain.

Dalam penam pakan luarnya, gen bekerj a dengan


dipengaruhi oleh fakt or- fakt or berikut .

1 . Gen ya ng Dipenga ruhi Jenis Kela m in


Gen ini disebut dengan Sex I nfluenced Gene,
m er u pak an gen dom in an y an g biasan y a m em -
perlihatkan pengaruh sam a pada sem ua jenis, tetapi
ada gen- gen t ert ent u yang dipengaruhi oleh j enis
kelam in.

23
2 . Ge n ya ng Pe nga r uhnya Te r ba t a s Pa da
Jenis Kela m in Tert ent u
Gen ini disebut Sex Lim it ed Gene, m erupakan
gen yang hanya t am pak pada j enis kelam in t ert ent u
saj a.
Misalnya:

a . Ge n pe nga t ur pe r t um buha n pa yuda r a .


Hal ini hanya t am pak pada j enis kelam in wanit a.

b. Ge n pe nga t ur uk ur a n da n be nt uk pe nis.
Hal ini hanya t am pak pada j enis kelam in pria.

c. Ge n pe nga t ur sifa t k e la m in se k unde r .


Hal ini hanya t am pak pada j enis kelam in t ert ent u.
Sifat kelam in sekunder pada pria, ant ara lain adanya
kum is, j akun, suara besar. Sedangkan sifat kelam in
sekunder pada wanit a ant ara lain kulit halus, pinggul
besar, dan suara t inggi.

D. Alel da n Alel Ga nda


Gen dalam t ubuh yang t erlet ak pada krom osom
t idak hanya sat u, t et api banyak. Alel adalah gen-
gen yang m enem pat i at au t erlet ak pada lokus yang

24
sam a pada krom osom hom olognya yang m em punyai
t ugas berlawanan unt uk suat u sifat t ert ent u.
Alel sebagai anggot a dari sepasang gen yang
m em iliki pengaruh
berlawanan. Misalnya gen B m em iliki peran unt uk
m enum buhk an k ar ak t er pigm ent asi k ulit secar a
norm al. Gen B dapat m em bent uk m elanin karena
diekspresikan sepenuhnya pada penam pakan fisik
or g an ism e. Dalam h al in i g en B m en im b u lk an
karakt er yang dom inan.
Apabila gen B berm ut asi m aka akan berubah
m enj adi b, sehingga pigm ent asi kulit secara norm al,
t idak dapat dilakukan. Gen b m enim bulkan karakt er
yang ber beda, yait u r esesif. Karak t er r esesif ini
m enum buhkan karakt er albinism e ( t idak t erbent uk
m elanin) .
Cont oh yang lainnya, m isalnya:
1. K alelnya k, unt uk ram but kerit ing dan lurus.
2. H alelnya h, unt uk kulit hit am dan put ih dan
sebagainya. Sedangkan alel ganda (m ultiple alelo
m urphi) adalah beberapa alel lebih dari satu gen
yang m enem pat i lokus sam a pada krom osom
hom olognya.

25
Pengaruh lainnya, m isalnya pada warna m at a.
Perhat ikanlah kem ungkinanya.

Su m be r : www.hnz11.files.wordpress.com

26
Ba b 2
Mengenal DNA

Apabila kit a ibarat kan suat u t ubuh, m aka DNA


diibar at k an sebagai ot ak y an g dapat m en gat u r
segala proses di dalam t ubuh. Di sam ping it u, DNA
j uga m em punyai peran pent ing dalam pewarisan
sifat .
DNA m er u pak an su at u sen y aw a k im ia y an g
pen t in g pada m ak h lu k h idu p. Tu gas u t am an y a
m em bawa m at eri genet ik dari suat u generasi ke
generasi berikut nya. DNA j uga m erupakan senyawa
polinukleot ida yang m em bawa sifat- sifat ket urunan
yang khas pada krom osom .
DNA pert am a kali dit em ukan oleh F. Miescher
(1869) dari sel sperm atozoa dan sel eritrosit burung,
selanj utnya dinam akan sebagai nuklein. Penem uan
lain dilakukan oleh Fischer ( 1880) , yait u t ent ang
adanya zat pirim idin (yang berupa Sitosin dan Tim in)
dan dua purin (Adenin dan guanin). Setelah penem uan

27
tersebut, dilengkapi pula dengan penem uan Levine
( 1 9 1 0 ) t en t a n g g u l a 5 k a r b o n r i b o sa , g u l a
deoksiribosa, dan asam fosfat dalam inti.
Keber adaan DNA t er sebut sebagian besar di
dalam n u k leu s ( in t i sel) . Tet api ada j u ga y an g
t erdapat pada m it okondria.

A. Apa k a h I t u DN A?
Asam deoksiribonukleat , lebih dikenal dengan
DNA ( bahasa I nggris: deoxyribonucleic acid) , adalah
sej enis asam nukleat yang t er golong biom olekul
ut am a penyusun berat kering set iap organism e. Di
dalam sel, DNA um um nya t erlet ak di dalam int i sel.
Secara garis besar, peran DNA di dalam sebuah
sel adalah sebagai m at er i genet ik. Ar t inya, DNA
m enyim pan cet ak biru bagi segala akt ivit as sel. I ni
ber lak u um um bagi set iap or ganism e. Di ant ara
perkecualian yang m enonj ol adalah beberapa j enis
virus ( dan virus t idak t erm asuk organism e) sepert i
HI V ( Hum an I m m unodeficiency Virus) .
D NA ad al ah seb u ah m o l ek u l r ak sasa y an g
t ersem bunyi di dalam int i set iap sel hidup. Sem ua
ciri fisik m akhluk hidup dikodekan dalam m olekul

28
berbent uk rant ai heliks ini. Sem ua inform asi t ent ang
t ubuh kit a, dari warna m at a hingga st rukt ur organ-
organ dalam , j uga bent uk sert a fungsi sel- sel kit a,
t erkodekan dalam bagian yang disebut gen dalam
DNA.

Sum be r : www.ghr.nlm .nih.gov

Kode DNA t ersusun at as urut an em pat basa yang


berbeda. Jika kit a anggap set iap basa ini sebagai

29
sat u hur uf, m aka DNA dapat disam akan dengan
sebuah bank dat a yang t ersusun at as abj ad berang-
got ak an em pat hur uf. Sem ua infor m asi t ent ang
m akhluk hidup t ersim pan dalam bank dat a ini.
Jik a k it a m elet ak k an sat u sel bak t er i dalam
lingkungan yang sesuai, dalam beberapa jam kita akan
m enget ahui bahwa ia t elah m enghasilkan rat usan
salinan bakteri yang sam a. Setiap sel hidup m em iliki
kem am puan untuk “m enggandakan dirinya sendiri.”

Sum be r : www.whyfiles.org

30
Hingga pada saat DNA dit em ukan, pert anyaan
t ent ang bagaim ana proses aj aib ini t erj adi belum lah
d ik et ah u i. Den g an p en em u an DNA, t er u n g k ap
bahwa set iap sel hidup m em iliki sebuah “ bank dat a”
yang m enyim pan seluruh inform asi m engenai dirinya
sendiri. Penem uan ini m em perlihat kan keaj aiban
pencipt aan.
Jika kit a m encoba m enuliskan inform asi dalam
DNA, m aka ini akan m enghabiskan sekit ar sat u j ut a
halam an buku. I ni set ara dengan sebuah ensiklopedi
bervolum e em pat puluh kali lebih besar dari The
Encyclopaedia Brit annica, yang m erupakan salah
sat u k um pulan infor m asi t er besar y ang per nah
dibuat m anusia. I nform asi raksasa ini t ersim pan
dalam int i yang sangat kecil dalam sel kit a yang
berukuran sekit ar seperseribu m ilim et er.

31
Sum be r : www.news.bbc.co.uk

Molekul DNA t erdiri dari j ut aan pasang basa yang


t ersusun dalam bent uk heliks. Jika sebuah m olekul
DNA dalam sat u sel kit a dibent angkan, panj angnya
d a p a t m e n ca p a i sa t u m e t e r. Ra n t a i D NA i n i
t er p ad at k an d al am i n t i sel d en g an si st em

32
“ pengem asan” yang luar biasa, sehingga ukurannya
m engecil hingga seperserat us ribu m ilim et er saj a.
St r u k t u r DNA d it em u k an oleh d u a ilm u w an
bernam a Francis Crick dan Jam es Wat son. Meskipun
seorang evolusionis, Crick m engat akan bahwa DNA
t idak m ungkin pernah m uncul secera kebet ulan.

B. Sej a ra h DN A
DNA pertam a kali berhasil dim urnikan pada tahun
1 8 6 8 oleh ilm u w an Sw iss Fr iedr ich Miesch er di
Tu b i n g en , Jer m an , y an g m en am ai n y a n u cl ei n
ber dasar k an lok asinya di dalam int i sel. Nam un
dem ikian, penelit ian t erhadap peranan DNA di dalam
sel baru dim ulai pada awal abad 20, bersam aan
dengan dit em ukannya post ulat genet ika Mendel.
DNA dan prot ein dianggap dua m olekul yang paling
m em u n gk in k an sebagai pem baw a sif at gen et is
berdasarkan t eori t ersebut .

33
Friedrich Miescher
Su m be r : www.upload.wikim edia.org

Dua e k sp e r i m e n pada dek ade 4 0 - an


m em bukt ikan fungsi DNA sebagai m at eri genet ik.
Dalam penelit ian oleh Avery dan rekan- rekannya,
ek st r ak dar i sel bak t er i y an g sat u gagal m en -
t ransform sel bakt eri lainnya kecuali j ika DNA dalam
ekst rak dibiarkan ut uh. Eksperim en yang dilakukan
Hershey dan Chase m em bukt ikan hal yang sam a
d en g an m en g g u n ak an p en car i j ej ak r ad ioak t if
( radioact ive t racers) .

34
Sum ber : www.oni.escuelas.edu.a

Misteri yang belum terpecahkan ketika itu adalah:


bagaim anakah st rukt ur DNA sehingga ia m am pu
bertugas sebagai m ateri genetik? Persoalan ini dijawab
oleh Francis Cr ick dan k oleganya Jam es Wat son
berdasarkan hasil difraksi sinar-x DNA oleh Maurice
Wilkins dan Rosalind Franklin. Crick, Wat son, dan
Wilkins m endapatkan hadiah Nobel Kedokteran pada

35
1962 atas penem uan ini. Franklin, karena sudah wafat
pada waktu itu, tidak dapat dianugerahi hadiah ini.
Kon f ir m asi ak h ir m ek an ism e r ep lik asi DNA
dilak uk an lew at per cobaan Meselson- St ahl yang
dilakukan t ahun 1958.

36
Ba b 3
Mengenal Struktur
dan Fungsi Biologis DNA

A. St ruk t ur DN A
Molekul DNA m em iliki susunan kim ia yang sangat
kom pleks dan rant ai nukleot ida yang panj ang. DNA
m e r u p a k a n r a n g k a i a n n u k l e o t i d a d a n se t i a p
nuk leot ida t er susun dar i subst ansi dasar seper t i
berikut .

1 . Senya w a Fosfa t
Sen y aw a f o sf a t b er f u n g si u n t u k m en g i k a t
m olekul gula sat u dengan gula yang lain.

2 . Gula Pent osa ( deok siribosa )


Gula pent osa m em bent uk rangkaian gula fosfat
yang m erupakan t ulang punggung at au kekuat an
dari st rukt ur double helix DNA.

3 . Ba sa nit rogen
Basa nitrogen ini terikat pada setiap m olekul gula.
Basa nit rogen dibedakan m enj adi dua.

37
a ) Ba sa Pur in
Basa purin dengan st rukt ur cincin gkam u yait u
Adenin ( A) dan Guanin ( G)

b) Ba sa pir im idin
Basa pirim idin dengan st rukt ur cincin t unggal
yait u Tim in ( T) dan Sit osin ( S)

Su m be r : www.evolut ion.berkeley.edu

38
Basa nit rogen yang t erdiri at as purin ( Adenin dan
Guanin) dan pir im idin ( Sit osin dan Tim in) ak an
m em bent uk rangkaian senyawa kim ia dengan gula
p e n t o sa , m em b en t u k n u k l e o si d a . Nu k l eo si d a
b er sen y aw a d en g an g u g u s f osf at m em b en t u k
nukleot ida, yang m em punyai bent uk rant ai panj ang.
Nukleot ida inilah yang akan m enyusun m olekul
DNA. Sat u m olekul DNA t erdiri at as rat usan at au
ribuan nukleot ida. Nukleot ida- nukleot ida t ersebut
m em ben t u k r ant ai panj ang yang d i se b u t
polinuk leot ida. Ant ara rant ai polinuk leot ida sat u
den gan y an g lain n ya salin g ber h u bu n gan pada
bagian basa nit rogen.
Molekul DNA yang m ikroskopis selalu m em bawa
ribuan nukleot ida. Hal ini m erupakan st rukt ur yang
sangat rum it sekali.
Jika diam at i, bent uk st rukt ur dari m olekul DNA
t er sebu t , seben ar n y a m er u pak an st r u k t u r DNA
double helix ( t angga t ali berpilin) .
Model st r uk t ur DNA t er sebut dit em uk an oleh
Jam es Wat son dan Francis Crick pada t ahun 1953.
Model st rukt ur DNA ini kem udian disebut dengan
m odel DNA Wat son- Crick.

39
Sum be r : www. cm gm .st anford.edu

Bagian ibu t angga t ersusun dari deret an gugusan


gula pent osa dan asam fosfat , sedangkan bagian
anak t angga t ersusun dari dua basa nit rogen yang
berpasangan ant ara purin dengan pirim idin, dengan
pasangan yang m ungkin t erj adi yait u Adenin dengan
Tim in, sedangkan Guanin dengan Sit osin. Ant ara
dua basa nit rogen yang berpasangan yait u ant ara
Adenin dengan Tim in, ant ara Guanin dengan Sit osin
dihubungkan oleh ikat an hidrogen. I kat an hidrogen
m erupakan j enis ikat an yang lem ah, t et api karena
h al in ilah j u st r u ak an m em ban t u dalam pr oses
pem belahan dan sint esis prot ein.

40
B. Fungsi DN A
Dar i m at er i y an g su d ah d isam p aik an d ap at
dik et ahui bahw a DNA m er upak an st r uk t ur yang
sangat kom pleks yang t ersusun dari polinukleot ida.
Fungsi at au peranan DNA ini sebenarnya t idak
se k a d a r se b a g a i p e m b a w a m a t e r i g e n e t i k ,
m elainkan j uga m enj alankan fungsi yang sangat
kom pleks pula, ant ara lain:
1. Sebagai pem bawa m at eri genet ika dari generasi
ke generasi berikut nya.
2. Men g on t r ol ak t iv it as h id u p secar a lan g su n g
m aupun t idak langsung.
3. Melakukan sint esis prot ein.
4. Sebagai au t ok at alis, y ait u k em am pu an DNA
unt uk m enggkam ukan diri ( replikasi) .
5. Sebagai het erokat alis, yait u kem am puan DNA
unt uk dapat m ensint esis senyawa lain.

C. Replik a si DN A
Replikasi adalah kem am puan DNA unt uk dapat
m enggandakan diri.

41
Pr oses- p r oses y an g t er j ad i saat t er j ad in y a
replikasi adalah sebagai berikut .
1. I kat an hidrogen m em buka sehingga kedua pit a
akan m em isah.
2. Pit a saling m em isah. Basa nit rogen pada m asing-
m asing pit a ber fungsi sebagai cet ak an yang
m engat ur pengikat an basa kom plem ent er ( basa
pelengkap) pada pit a baru yang dibent uk.
3. Masing- m asing pit a lam a m em bent uk pit a baru,
sehingga m enghasilkan dua pit a double helix.

Sum be r : www.coolschool.ca

42
Proses yang t erj adi t ersebut dipengaruhi oleh
en zim h elik ase, en zim p olim er ase, d an lig ase.
Re p l i k a s i DNA dapat t er j adi m elalu i t iga
kem ungkinan:

1 . Konserva t if
Replikasi konservat if ini m elalui cara, yait u pit a
d ou b le h elik s DNA in d u k t et ap t id ak b er u b ah ,
k em u dian digu n ak an u n t u k m en cet ak du a pit a
double heliks DNA yang baru.

2 . Se m ik on se r va t if
Replikasi sem ikonservat if ini m elalui cara, yait u
pit a double heliks DNA induk t erpisah, kem udian
m en sin t esis p it a DNA y an g b ar u d en g an car a
m elengkapi ( kom plem ent asi) pada m asing- m asing
pit a DNA induk t ersebut .

3 . D ispe r sif
Dispersif ini m elalui cara, yait u kedua pit a double
heliks induk t erput usm em bent uk segm en- segm en
pit a DNA yang baru, kem udian segm en pit a DNA
induk akan disam bung dengan segm en pit a DNA
baru. Sehingga pada perist iw a ini hasil akhirnya
adalah segm en pit a DNA induk dengan segm en pit a

43
DNA yang baru yang t ersebar pada pit a double heliks
DNA yang t erbent uk.

Sum be r : www.coolschool.ca

DNA m erupakan polim er yang t erdiri dari t iga


k o m p o n e n u t a m a , y a i t u g u g u s f o sf a t , g u l a
d eok sir ib osa, d an b asa n it r og en . Seb u ah u n it
m onom er DNA yang t erdiri dari ket iga kom ponen
t er seb u t d in am ak an n u k leot id a, seh in g g a DNA
t ergolong sebagai polinukleot ida.

44
Rantai DNA m em iliki lebar 22- 24 Å, sem entara
panjang satu unit nukleotida 3,3 Å. Walaupun unit
m onom er ini sangat lah kecil, DNA dapat m em iliki
j ut aan nuk leot ida yang t erangk ai seper t i rant ai.
Misalnya, krom osom terbesar pada m anusia terdiri
atas 220 juta nukleotida.

Rangka ut am a unt ai DNA t erdiri dari gugus fosfat


dan gula yang ber selang- seling. Gula pada DNA
adalah gula pent osa ( ber k ar bon lim a) , yait u 2-
deoksiribosa. Dua gugus gula t erhubung dengan
fosfat m elalui ikat an fosfodiest er ant ara at om karbon
ket iga pada cincin sat u gula dan at om karbon kelim a
pada gula lainnya. Salah sat u perbedaan ut am a DNA
dan RNA adalah gula penyusunnya; gula RNA adalah
ribosa.

DNA t er d ir i at as d u a u n t ai y an g b er p ilin
m em bent uk st rukt ur heliks gkam u. Pada st rukt ur
heliks gkam u, orient asi rant ai nukleot ida pada sat u
unt ai berlawanan dengan orient asi nukleot ida unt ai
lainnya. Hal ini disebut sebagai ant iparalel. Masing-
m asing unt ai t er dir i dar i rangk a ut am a, sebagai
st rukt ur ut am a, dan basa nit rogen, yang berint eraksi
dengan unt ai DNA sat unya pada heliks. Kedua unt ai

45
p ad a h elik s g an d a DNA d isat u k an oleh ik at an
hidr ogen ant ar a basa- basa yang t er dapat pada
kedua unt ai t ersebut . Em pat basa yang dit em ukan
pada DNA adalah adenin ( dilam bangkan A) , sit osin
( C, dari cyt osine) , guanin ( G) , dan t im in ( T) . Adenin
berikat an hidrogen dengan t im in, sedangkan guanin
berikat an dengan sit osin

Replikasi m erupakan proses pelipatgkam uan DNA.


Pr oses r ep lik asi in i d ip er lu k an k et ik a sel ak an
m em belah diri. Pada setiap sel, kecuali sel gam et,
pem belahan diri harus disertai dengan replikasi DNA
supaya sem ua sel turunan m em iliki inform asi genetik
y a n g sa m a . Pa d a d a sa r n y a , p r o ses r ep l i k a si
m em anfaatkan fakta bahwa DNA terdiri dari dua rantai
dan rantai yang satu m erupakan “konjugat ” dari rantai
pasangannya. Dengan kata lain, dengan m engetahui
susunan satu rantai, m aka susunan rantai pasangan
dapat dengan m udah dibentuk.

Ada beberapa t eori yang m encoba m enj elaskan


bagaim ana proses replikasi DNA ini t erj adi. Salah
sat u t eori yang paling populer m enyat akan bahwa
pada m asing- m asing DNA baru yang diperoleh pada

46
ak h i r p r oses r ep l i k asi ; sat u r an t ai t u n g g al
m erupakan rant ai DNA dari rant ai DNA sebelum nya,
sedangkan rant ai pasangannya m erupakan rant ai
yang baru disint esis. Rant ai t unggal yang diperoleh
dari DNA sebelum nya t ersebut bert indak sebagai
“ cet akan” unt uk m em buat rant ai pasangannya.

Proses replikasi m em erlukan prot ein at au enzim


pem ban t u ; salah sat u y an g t er pen t in g dik en al
dengan nam a DNA polim erase, yang m erupakan
enzim pem bant u pem bent uk an rant ai DNA bar u
yang m er upak an suat u polim er. Pr oses r eplik asi
diawali dengan pem buk aan unt aian gk am u DNA
pada t it ik- t it ik t ert ent u di sepanj ang rant ai DNA.

Proses pem bukaan rant ai DNA ini dibant u oleh


beberapa j enis prot ein yang dapat m engenali t it ik-
t i t i k t er seb u t , d an j u g a p r ot ei n y an g m am p u
m em buka pilinan rant ai DNA. Set elah cukup ruang
t erbent uk akibat pem bukaan unt aian ganda ini, DNA
polim erase m asuk dan m engikat diri pada kedua
rantai DNA yang sudah terbuka secara lokal tersebut.

47
Pr o se s p e m b u k a a n r a n t a i g a n d a t e r se b u t
b er l an g su n g d i ser t ai d en g an p er g eser an DNA
polim er ase m en gik u t i ar ah m em bu k an ya r an t ai
gkam u. Monom er DNA dit am bahkan di kedua sisi
rant ai yang m em buka set iap kali DNA polim erase
bergeser. Hal ini berlanj ut sam pai seluruh rant ai
t elah benar- benar t erpisah.

Proses replikasi DNA ini m erupakan proses yang


rum it nam un t elit i. Proses sint esis rant ai DNA baru
m e m i l i k i su a t u m e k a n i sm e y a n g m e n ce g a h
t er j adinya kesalahan pem asukan m onom er yang
dapat ber ak ibat fat al. Kar ena m ek anism e inilah
kem ungkinan t erj adinya kesalahan sint esis am at lah
kecil.

48
Ba b 4
RNA

Bahan genet ik, selain DNA adalah RNA. Di dalam


int i sel m akhluk hidup, baik sel prokariot ik m aupun
sel eukariot ik t erdapat asam nukleat yang berupa
DNA dan RNA. Tet api beberapa virus t idak m em iliki
DNA, sehingga hanya m em ilik i RNA saj a, m ak a
dalam hal ini fungsi RNA m enj adi sam a dengan DNA,
b a i k se b a g a i m a t e r i g e n e t i k m a u p u n d a l a m
m en g at u r ak t iv it as sel. RNA m er u p ak an h asil
t ranskripsi dari suat u fragm en DNA, sehingga RNA
m er u pak an polim er y an g j au h lebih pen dek
dibanding DNA.

A. St ruk t ur RN A
Molekul RNA m em punyai bent uk yang berbeda
dengan DNA. RNA m em iliki bent u pit a t unggal dan
t idak berpilin.

49
Susunan RNA t erdiri at as:
- gugus fosfat ,
- gula pent osa ( gula ribosa) ,
- basa nit rogen.
Basa nit rogen dibedakan m enj adi dua j enis.
a) Basa purin yang t ersusun dari Adenin ( A) dan
Guanin ( G) .
b) Basa pirim idin yang t ersusun dari Sit osin ( S) dan
Urasil ( U) .

Sum be r : www.dat a.gat e2biot ech.com

50
1 . RN A dut a ( RN Ad)
RNA duta disebut juga m essenger RNA (m RNA).
RNA dut a m er upakan RNA yang ur ut an basanya
berpasangan dengan salah satu urutan basa rantai
DNA.
RNA dut a dibent uk oleh DNA di dalam int i sel,
f u n g si d a r i RNA d u t a a d a l a h m e n y a m p a i k a n
inform asi genet ik dalam bent uk kode- kode genet ik
dalam int i ke ribosom dan sebagai pola cet akan
d a l a m m em b en t u k p o l i p ep t i d a . RNA d u t a i n i
dibent uk bila diperlukan dan j ika t ugasnya selesai,
m aka akan dihancurkan dalam plasm a.

Sum be r : www.4.bp.blogspot .com

51
2 . RN A ribosom ( rRN A)
RNA ribosom dibent uk oleh DNA dan t erdapat di
dalam ribosom . Fungsi dari RNA ribosom adalah
sebagai m esin perakit dalam sint esis prot ein yang
bergerak ke sat u arah sepanj ang RNA dut a. Di dalam
ribosom m olekul rRNA ini m encapai 30- 46% .

Su m be r : www.upload.wikim edia.org

52
3 . RN A t ra nsfer ( t RN A)
RNA transfer dibentuk oleh DNA dan terletak di
dalam sitoplasm a. RNA transfer berfungsi m engangkut
asam -asam am ino ke ribosom sesuai dengan kode
yang terdapat dalam RNA duta, serta m enerjem ahkan
kode-kode yang dibawa oleh RNA duta.

Su m be r : www.upload.wikim edia.org

B. Sint esa Prot ein


Ga m b a r a n t e n t a n g si n t e si s p r o t e i n d a p a t
diibarat kan sepert i saat kit a m em asak m akanan.
Prot ein kit a ibarat kan sebagai m akanan. Agar dapat

53
diperoleh m akanan dengan cita rasa yang lezat m aka
diperlukan bahan dan proses yang t epat . Dem ikian
j uga dalam sint esis prot ein, bahan dan rangkaian
prosesnya t ert ent u dan urut .

Sum be r :. www.harunyahya.com

Kam u sudah m em pelaj ari t ent ang DNA dan RNA.


Maka di sini akan dibahas bagaim ana DNA dan RNA
tersebut m elaksanakan proses dalam pewarisan sifat
kepada ket urunannya dengan m elakukan sint esis
prot ein, yait u proses penyusunan senyawa prot ein
dengan m em bent uk rangkaian rant ai polipept ida.
Sint esis prot ein ini t erj adi di dalam ribosom dan
pen gat u r an sin t esis pr ot ein dilak u k an oleh gen
( DNA) di dalam int i.

54
Gen , dalam h al in i DNA k et ik a m en j alan k an
fungsinya, yaitu m enyusun protein sangat dipengaruhi
o l eh su su n a n sel ser t a g en - g en l a i n d a l a m
lingkungannya. Kegiat an sel diat ur oleh berbagai
enzim , yaitu senyawa protein yang bekerjanya sangat
spesifik.
Senyawa-senyawa sebagai bahan dan pelaksana
sint esis prot ein ant ara lain DNA, RNA dut a, RNA
transfer, RNA ribosom , dan enzim RNA – polim erase,
energi yang digunakan di dalam m elakukan sintesis
protein adalah berupa ATP. Secara garis besar, tahapan
proses sintesis protein antara lain seperti berikut.

1 . Tra nsk ripsi


Transkripsi adalah pencet akan m RNA ( kode) oleh
DNA ( DNA t em p lat e/ DNA se n se ) den gan
m enggunakan enzim RNA polim erase. Adanya enzim
RNA polim erase ini akan m enyebabkan rangkaian
double helix sebagian akan m em buka, akibat nya
basa- basa pasangannya m enyusun Adenin ( A) pada
m RNA dan set er usnya. Hasil peny usunan m RNA
yan g su dah j adi ak an m en in ggalk an in t i u n t u k
m elekat pada ribosom , yang m erupakan organela
pelaksana sint esis prot ein.

55
Su m be r :www. hnz11.files.wordpress.com

2 . Tra nsla si
Kode pada m RNA ak an t er baca oleh r ibosom
dengan dibant u oleh t RNA yang t erdapat di dalam
sit oplasm a. t RNA ak an dat ang unt uk m em baw a
asam am ino yang sesuai dengan kode yang dibawa
m RNA t ersebut . Kem udian t RNA akan bergabung
dengan m RNA yang sesuai dengan kode pasangan
basa.

56
Bag ian p ad a t RNA y an g t er lib at in i d iseb u t
ant ik odon, yang ber hubungan dengan t iga basa
pada pit a m RNA yang disebut dengan kodon. Asam
am ino akan berj aj ar- j aj ar dalam urut an yang sesuai
dengan kodenya. Dari hal ini akan t erbent uk prot ein
yang ber fungsi sebagai enzim , dalam m engat ur
m et abolism e sel dan reproduksi.

Su m be r :w w w .scienceblogs.com

57
C. Kode Genet ik
DNA m erupakan bahan genet ika yang m em beri
inform asi dari sat u generasi ke generasi berikut nya.
I nform asi yang t erdapat dalam m olekul DNA, yait u
berupa kode- kode yang t erj adi dari dua deret an
rant ai basa nit rogen yang berpilin. Apabila pilinan
t ersebut m em buka, m aka rant ai yang m em bent uk
m RNA d i seb u t r a n t a i b er m a k n a ( D NA sen se)
sedangkan apabila rant ai t ersebut t idak m em bent uk
m RNA disebut rant ai t ak berm akna ( DNA ant isense) .
Macam - m acam basa n it r ogen y an g m en j adi
kode- kode ada em pat , yait u Sit osin ( S) , Tim in ( T) ,
Ad en in ( A) , d an Gu an in ( G) . Jen is k od e y an g
digu n ak an u n t u k k ode asam - asam am in o y an g
berj um lah 20 adalah sebagai berikut .

1 . Kem ungk ina n Kode Singlet


Kem ungkinan kode singlet t erj adi apabila suat u
nukleot ida m em beri kode sat u asam am ino, at au
41 = 4 kodon, unt uk sam pai berj um lah 20, m aka
kode ini m asih kurang 16, sehingga kode ini t idak
m em enuhi syarat , karena hanya m engkode 4 asam
am ino saj a.

58
2 . Kem ungk ina n Kode Duplet
Kem ungkinan kode duplet t erj adi apabila dua
nukleot ida m em beri kode sat u asam am ino, at au
42 = 16 kodon. Kode ini pun hanya m em bent uk 16
kodon sehingga kode ini m asih kurang 4.
3 . Kem ungk ina n Kode Triplet
Kem ungkinan kode t r iplet t er j adi apabila t iga
nukleot ida m em beri kode sat u asam am ino, 43 =
64 kodon. Kode ini akan m em iliki kelebihan yait u
64 – 20 = 44 kodon, t api ini t idak m enj adi m asalah.
Kode ini cukup walaupun sat u asam am ino harus
m em pu n y ai 6 4 : 2 0 = ± 3 m acam k ode basa
n it r og en . Pen elit ian t en t an g k od e g en et ik a in i
dik em u k ak an oleh M. Nir en ber g ( 1 9 6 1 ) dan H.
Mat hei ( 1961) dan kem udian diperkuat oleh G.H.
Khoram a ( 1964) . Kode genet ika adalah kode yang
dibawa oleh m RNA untuk disam paikan ke tRNA. Kode
genet ika yang m erupakan urut an t iga basa nit rogen
yang m em bent uk suat u t riplet disebut kodon. Di
sana t erdapat kodon AUG, kodon ini disebut j uga
k o d o n st a r t k a r e n a u n t u k m e m u l a i si n t e si s
polipept ida, sedangkan UAG, UGA, dan UAA disebut

59
kode t ak berm akna at au st op unt uk m engakhiri dari
suat u prot ein. Kodon- kodon ini bukan m erupakan
kode unt uk sem ua asam am ino.
Walaupun RNA t elah bekerj a dengan t elit i dalam
pr oses sint esis pr ot ein, t et api k esalahan dalam
m en er j em ah k an m u n gk in dapat j u ga t er j adi
seh i n g g a j ik a t er j adi k esal ah an dalam
m enerj em ahkan kode- kode t ersebut , m aka asam -
asam am ino yang t ersusun akan berbeda dan t idak
sesuai dengan yang diharapkan DNA.

60
Ba b 5
DNA dan
Teknologi Masa Kini

A. DN A da la m Forensik
I lm uwan forensik dapat m enggunakan DNA yang
t erlet ak dalam darah, sem en, kulit , liur at au ram but
yang t ersisa di t em pat kej adian kej ahat an unt uk
m engident ifikasi kem ungkinan t ersangka, sebuah
proses yang disebut fingerprint ing genet ika at au
pem rofilan DNA ( DNA profiling) .
Dalam pem rofilan DNA panj ang relat if dari bagian
DNA yang berulang sepert i short t andem repeat s
dan m in isat elit , diban din gk an . Pem r of ilan DNA
dikem bangkan pada 1984 oleh genet ikawan I nggris
Alec Jeffreys dari Universit as Leicest er, dan pert am a
kali digunakan unt uk m endakwa Colin Pit chfork pada
1 9 8 8 d a l a m k a su s p e m b u n u h a n En d e r b y d i
Leicest ershire, I nggris.

61
Banyak yurisdiksi m em but uhkan t erdakwa dari
kejahatan tertentu untuk m enyediakan sebuah contoh
DNA untuk dim asukkan ke dalam database kom puter.
Hal ini telah m em bantu investigator m enyelesaikan
kasus lam a di m ana pelanggar tidak diketahui dan
hanya contoh DNA yang diperoleh dari tem pat kejadian
( terutam a dalam kasus perkosaan antar orang tak
dikenal). Metode ini adalah salah satu teknik paling
t erpercaya unt uk m engident ifikasi seorang pelaku
kejahatan, tetapi tidak selalu sem purna, m isalnya bila
tidak ada DNA yang dapat diperoleh, atau bila tem pat
kejadian terkontam inasi oleh DNA dari banyak orang.

B. DN A da la m Kom put a si
DNA m em ain k an p er an p en t in g d alam ilm u
kom put er, baik sebagai m asalah riset dan sebagai
sebu ah car a k om pu t asi. Riset dalam algor it m a
pencarian st ring, yang m enem ukan kej adian dari
urut an huruf di dalam urut an huruf yang lebih besar,
d i m o t i v a si se b a g i a n o l e h r i se t D NA, d i m a n a
alg or it m a in i d ig u n ak an u n t u k m en car i u r u t an
t ert ent u dari nukleot ida dalam sebuah urut an yang
besar.

62
Su m be r : www.olym pus- global.com

Dalam aplikasi lainnya sepert i edit or t ext , bahkan


algor it m a seder hana unt uk m aslah ini biasanya
m en cu k u p i , t et ap i u r u t an D NA m en y eb ab k an
algor it m a- algor it m a ini unt uk m enunj ukkan sifat
kasus- m endekat i- t erburuk dikarenakan j um lah kecil
dari karakt er yang berbeda.
Teori database juga telah dipengaruhi oleh riset
DvNA, yang m em iliki m asalah khusus untuk m enaruh
dan m em an ipu lasi u r u t an DNA. Dat abase y an g
dik h u su sk an u n t u k r iset DNA disebu t dat abase
genom ik, dam harus m enangani sejum lah tantangan
teknis yang unik yang dihubungkan dengan operasi
pem bandingan k ir a- k ir a, pem bandingan ur ut an,
m encari pola yang berulang, dan pencarian hom ologi.

63
C. Tes DN A
Sekarang ini istilah tes DNA sudah sangat fam iliar
di tengah m asyarakat I ndonesia. Dari berbagai kasus
i n i , t er l i h a t b a h w a t er d a p a t k esu l i t a n d a l a m
m engidentifikasi identitas korban/ m ayat secara fisik
at aupun biom et ri, yang disebabkan kondisi t ubuh
m ayat yang t elah r usak at au hancur. Unt uk it u,
identifikasi dengan m etode tes DNA m enjadi m encuat.

Su m be r : www.hom ednat est ingkit s.net

DNA atau DeoxyriboNucleic Acid m erupakan asam


nukleat yang m enyim pan sem ua inform asi tentang
genetika. DNA inilah yang m enentukan jenis ram but,
warna kulit dan sifat-sifat khusus dari m anusia. DNA
ini akan menjadi cetak biru (blue print) ciri khas manusia
yang dapat diturunkan kepada generasi selanjutnya.
Sehingga dalam tubuh seorang anak kom posisi DNA

64
nya sam a dengan tipe DNA yang diturunkan dari orang
tuanya. Sedangkan tes DNA adalah m etode untuk
m engidentifikasi fragm en-fragm en dari DNA itu sendiri.
At au secara seder hananya adalah m et ode unt uk
m engidentifikasi, m enghim pun dan m enginventarisir
file-file khas karakter tubuh.
Tes DNA um um nya digunakan unt uk 2 t uj uan
yait u ( 1) t uj uan pribadi sepert i penent uan perwalian
anak at au penent uan orang t ua dari anak dan ( 2)
t u j u an h u k u m , y an g m elipu t i m asalah f or en sik
sep er t i id en t if ik asi k or b an y an g t elah h an cu r,
sehingga unt uk m engenali ident it asnya diperlukan
pencocok an ant ara DNA k or ban dengan t er duga
k elu ar ga k or ban at au pu n u n t u k pem bu k t ian
kej ahat an sem isal dalam kasus pem erkosaan at au
pem bunuhan.
Ham pir sem u a sam pel biologis t u bu h dapat
digunakan unt uk sam pel t es DNA, t et api yang sering
digunakan adalah darah, ram but, usapan m ulut pada
pipi bagian dalam ( buccal swab) , dan kuku. Unt uk
kasus- kasus forensik, sperm a, daging, t ulang, kulit ,
air liur at au sam pel biologis apa saj a yang dit em ukan
di t em pat kej adian perkara ( TKP) dapat dij adikan
sam pel t es DNA.

65
DNA yang biasa digunakan dalam t es ada dua
yait u DNA m it okondria dan DNA int i sel. Perbedaan
kedua DNA ini hanyalah t erlet ak pada lokasi DNA
t ersebut berada dalam sel, yang sat u dalam int i sel
sehingga disebut DNA int i sel, sedangkan yang sat u
t er d ap at d i m i t ok on d r i a d an d i seb u t DNA
m it okondria. Unt uk t es DNA, sebenarnya sam pel
DNA yang paling akurat digunakan dalam t es adalah
DNA int i sel karena int i sel t idak bisa berubah.
DNA dalam m it okondria dapat berubah karena
berasal dari garis keturunan ibu yang dapat berubah
seiring dengan perkawinan keturunannya. Sebagai
contoh untuk sam pel sperm a dan ram but. Yang paling
pent ing diperiksa adalah kepala sperm at ozoanya
karena didalam nya t erdapat DNA int i, sedangkan
untuk potongan ram but yang paling penting diperiksa
adalah akar ram butnya. Tetapi karena keunikan dari
pola pewarisan DNA m itokondria m enyebabkan DNA
m itokondria dapat dijadikan sebagai m arka (penanda)
u n t u k t es DNA d alam u p ay a m en g id en t if ik asi
hubungan kekerabatan secara m aternal.
Unt uk akurasi kebenaran dari t es DNA ham pir
m encapai 100% akurat . Adanya kesalahan bahwa
k em ir ipan pola DNA bisa t er j adi secara r andom

66
( kebet ulan) sangat kecil kem ungkinannya, m ungkin
sat u diant ara sat u j ut a. Jikapun t erdapat kesalahan
it u disebabkan oleh fakt or hum an error t erut am a
pada kesalahan int erprest asi fragm en- fragm en DNA
oleh operat or ( m anusia) . Tet api dengan m enerapkan
st andard of procedur yang t epat kesalahan hum an
error dapat dim inim alisir at au bahkan dit iadakan.

1 . M et ode Tes DN A
Metode tes DNA yang um um nya digunakan di dunia
ini m asih m enggunakan m etode konvensional yaitu
elektroforesis DNA. Sedangkan m etode tes DNA yang
terbaru adalah dengan m enggunakan kem am puan
partikel em as berukuran nano untuk berikatan dengan
DNA. Metode ini ditem ukan oleh dua orang ilm uwan
Am erika Serikat yaitu Huixiang Li dan Lewis Rothberg.
Prinsip m etode ini adalah m em pergunakan untai
pendek DNA yang disebut Probe yang telah diberi zat
pendar. Probe ini dirancang spesifik untuk gen sam pel
t ert ent u dan hanya akan m enem pel/ berhibridisasi
dengan DNA sam pel tersebut. Partikel em as berukuran
nano dalam m et ode ini berperan dalam m engikat
Probe yang tidak terhibridasi. Pendeteksian dilakukan
dengan penyinaran pada panjang gelom bang tertentu.

67
Keberadaan DNA yang sesuai dengan DNA Probe dapat
dilihat dari pendaran sam pel tersebut. Jum lah DNA
target tersebut kira-kira berbanding lurus terhadap
intensitas pendaran sinar yang dihasilkan.
Keunggulan m et ode ini dibandingk an dengan
m et ode konvensional adalah pada kecepat an dan
h a r g a n y a y a n g j a u h l eb i h cep a t d a n m u r ah
dibandingk an m et ode elek t r ofor esis DNA. Tet api
karena m etode ini m asih tergolong baru, sehingga
m asih dalam pengem bangan di Am erika Serikat ,
sehingga untuk penguna (user) di I ndonesia, sekarang
ini belum dapat m em anfaat kan fasilit as t ersebut ,
karena m em ang belum terdapat di I ndonesia.

2 . Ta ha pa n M et ode Tes DN A
Di I ndonesia, terdapat dua laboratorium yang dapat
m elayani user dalam t es DNA yait u Laborat orium
Pusdokkes Polri Jakarta Tim ur dan di Lem baga Bio
Molekuler Eijkm an Jakarta Pusat. Untuk di Lem baga
Eijkm an, biaya per paket tes DNA adalah berkisar Rp.
7,5 Juta dengan hasil tes yang dapat diperoleh dalam
12 hari kerja terhitung dari tanggal diterimanya sampel.
Un t u k m et ode t es DNA di I n don esia, m asih
m em anfaat kan m et ode elekt roforesis DNA. Dengan

68
int represt asi hasil dengan cara m enganalisa pola
DNA m en g g u n ak an m ar k a STR ( sh or t t an d em
repeat s) . STR adalah lokus DNA yang t ersusun at as
pengulangan 2- 6 basa. Dalam genom m anusia dapat
dit em ukan pengulangan basa yang bervariasi j um lah
dan j enisnya. Dengan m enganalisa STR ini, m aka
DNA t ersebut dapat diprofilkan dan dibandingkan
dengan sam pel DNA t erduga lainnya.
Dari berbagai literatur yang penulis pelaj ari, pada
dasar nya t ahapan m et ode t es DNA dengan cara
elektroforesis m eliputi beberapa tahapan berikut yaitu
pert am a t ahapan preparasi sam pel yang m eliput i
pengam bilan sam pel DNA ( isolasi) dan pem urnian
DNA. Dalam tahap ini diperlukan kesterilan alat- alat
yang digunakan.
Unt uk sam pel dar ah, dalam isolasinya dapat
digunakan bahan kim ia phenolchloroform sedangkan
unt uk sam pel ram but dapat digunakan bahan kim ia
Chilex. Selanj ut nya DNA dim urnikan dari kot oran-
kot oran sepert i prot ein, sel debris, dan lain lain.
Unt uk m et ode pem urnian biasanya digunakan t ehnik
sent rifugasi dan m et ode filt rasi vakum .

69
Tetapi berbagai ilmuwan telah banyak meninggalkan
cara tersebut dan beralih ke produk-produk pem urnian
yang telah dipasarkan seperti produk butir m agnet dari
Promega Corporation yang memanfaatkan silica-coated
param agnet ic resin yang m em ungkinkan m et ode
pem isahan DNA yang lebih sederhana dan cepat.
Tahapan selanjutnya adalah m em asukan sam pel
DNA yang t elah dim ur nikan kedalam m esin PCR
( p ol y m er ase ch ai n r eact i on ) seb ag ai t ah ap an
am plifikasi. Hasil akhir dari tahap am plifikasi ini adalah
berupa kopi urutan DNA lengkap dari DNA sam pel.
Selanjutnya kopi urutan DNA ini akan dikarakterisasi
dengan elektroforesis untuk m elihat pola pitanya.
Karena urutan DNA setiap orang berbeda m aka
jum lah dan lokasi pita DNA (pola elektroforesis) setiap
individu juga berbeda. Pola pita inilah yang disebut DNA
sidik jari (DNA finger print) yang akan dianalisa pola
STR nya. Tahap terakhir adalah DNA berada dalam
t ah apan t y pin g, pr oses in i dim ak su dk an u n t u k
memperoleh tipe DNA. Mesin PCR akan membaca data-
data DNA dan m enam pilkannya dalam bentuk angka-
angka dan gam bar-gam bar identfikasi DNA. Finishing
dari tes DNA ini adalah m encocokan tipe-tipe DNA.

70
Glosarium

1. Basa ( b a· sa) [ n Ki m ] : Sen y aw a y an g cen d er u n g


m eny um bangk an sepasang elek t r on unt uk digunak an
bersam a- sam a dan cenderung m enerim a prot on.
2. Enzim ( énzim ) [ n] : Molekul prot ein yang kom pleks dan
dihasilkan oleh sel hidup, sert a bekerj a sebagai kat alisat or
dalam ber bagai pr oses k im ia di dalam t ubuh m ak hluk
hidup.
3. Gam et ( ga·m et / gam ét / ) [ n Bio] : Sel sperm a at au t elur,
t er u t am a y an g m at an g d an su d ah b er f u n g si d alam
pem biakan secara seksual.
4. Gen ( gen / gén/ ) [ n Bio] : Bagian krom osom yang m enj adi
lokasi sifat- sifat ket urunan; fakt or ket urunan- - dom inan
gen yang m em perlihat kan bent uknya secara ut uh t anpa
dipengaruhi oleh m odifikasi alelnya; - - t erkait gen yang
cender ung diw ar isk an ber sam a- sam a k ar ena t er dapat
dalam krom osom yang sam a
5. Lo k u s ( l o · k u s) [ n Bi o ] : Bag i an at au t em p at p ad a
krom osom yang diduduki oleh gen; lokus gen.
6. Met abolism e ( m e·t a·bo·lis·m e / m ét abolism e/ ) [ n Kim ] :
Pert ukaran zat pd organism e yang m eliput i proses fisika
dan kim ia, pem bent ukan dan penguraian zat di dalam
badan yang m em ungkinkan berlangsungnya hidup.
7. Mit osis ( m i·t o·sis) [ n] : Proses pem belahan int i sel biasa,
sehingga dari sat u int i sel induk t erj adi dua int i sel baru
yang j um lah dan susunan krom osom nya sam a benar ( j uga
sam a dengan krom osom induk- nya sem ula)
8. Molekul ( m o·le·kul) [ n Fis] : Bagian t erkecil senyawa yang
t erbent uk dari kum pulan at om yang t erikat secara kim ia;
b ag i an t er k eci l sen y aw a y an g m asi h san g g u p
m em perlihat kan sifat- sifat dari senyawa it u.

71
9. Plasm a ( plas·m a) [ n] : Barang cair t idak berwarna yang
m enj adi bagian darah, dalam keadaan norm al volum enya
kira- kira 5% dari berat badan.
10. Polim er ( po·li·m er / polim ér/ ) [ n] : Zat yang dihasilkan
dengan cara polim erisasi dari m olekul yang sangat banyak
dengan sat uan st r uk t ur berant ai panj ang, baik lur us,
bercabang, m aupun m enyilang yg berulang, m sl plast ik,
serat , karet , dan j aringan t ubuh m anusia.
11. Ribosom ( ri·bo·som ) [ n Kim ] : But iran dalam set iap sel
t em pat sint esis prot ein.
12. Segm en ( seg·m en / ségm én/ ) [ Bio] : Sat uan rangkaian
yang pada dasar nya m em punyai st r uk t ur yang sam a;
bagian ruas t ubuh yang berbent uk cincin, sepert i ruas
t ubuh cacing t anah.
13. Senyawa ( se·nya·wa) [ Kim n] : Zat m urni dan hom ogen
yang t erdiri at as dua unsur at au lebih yang berbeda dengan
perbandingan t ert ent u, biasanya sifat nya sangat berbeda
dari sifat unsur- unsurnya; senyawaan.
14. Sint esis ( sin·t e·sis / sint ésis/ ) [ n] : Paduan ( cam puran)
b er b ag ai p en g er t i an at au h al seh i n g g a m er u p ak an
kesat uan yang selaras.

72
Indeks

A M
Akrosent rik 16 Mit rokondria 66
Alel 25 Mit osis 14
Anafase 14 Molekul 32, 39, 49

B P
Bakt eri 30 Polim er 44
Basa 29, 45 Polipept ida 51

G R
Gen 20 Replikasi 7, 48, 47
Guanin 46 Ribosom 55

K S
Kom put asi 62 Sent rifugasi 69
Krom osom 7, 8, 9 Senyawa 27, 41
Sint esis 48
L
Lokus 9, 21

73
Daftar Pustaka

Albert Lehniger. 1982. Principles of Biochem ist ry.


New York: Wort h Publisher, I nc.

Eij k m an I n st it u t e For Molecu lar Biolog i. 2 0 0 8 .


I dent ifikasi DNA. Sit us Web Eij km an I nst it ut e.

Fessenden dan Fessenden. 1986. Kim ia Organik Jilid


2 Edisi Ket iga. Dit er j em ah k an oleh Aloy siu s
Ha d y a n a Pu d j a a t m a k a . Pen er b i t Er l a n g g a .
Jakart a.

Freewebs.com .2006. Pengum pulan DNA, Ekst raksi


DNA, dan Kuant ifikasi DNA. www.freewebs.com /
pengum pulansam peldna/ ekst raksifasepadat .ht m

H.M. Hawab. 2004. Pengant ar Biokim ia. Bayum edia


Publishing. Jawa Tim ur.

Rober t . K. Mur ray. 1999. Har per ’s Biochem ist r y


( Edisi Terj em ahan) . Jakart a.

74
Net - en cy clo. com . 2 0 0 8 . DNA. h t t p : / / w w w . n et -
encyclo.com / id/ DNA.

Sent ausa. 2008. Tes DNA Murah Meriah. Sit us Blog


Sent ausa.

Sinly Evan Put ra. 2006. DNA fingerprint , Met ode


Analisis Kej ahat an pada For ensik . Sit us Web
Kim ia I ndonesia ( www.chem - is- t ry.org)

Supangat . 2007. Pem urnian DNA di Dapur Rum ah


Kit a, Mu n g k in k ah ?. Sit u s Web Ber it a I p t ek
( www.berit aipt ek.com ) .

Tem po I nt erakt if. 2008. Keluarga “ Korban Ryan”


j alan i Tes DNA. Sit u s Web Tem po I n t er ak t if
( www.t em point erakt if.com ) .

M. Wahyu Rizal. 2005. Tes DNA: Mengendus Jej ak


Kej ahat an . Maj alah Nat u r al Edisi 1 1 / Th VI I /
Agust us 2005. Bandar Lam pung.

75
Riw ayat Penulis

W ahyu P.P., lahir di Bandung. Pendidikan form alnya


dit am at k an pada Fak ult as Sast r a Unpad. Selain
m en u lis k ar y a sast r a, ia j u ga m en u lis t en t an g
perkebunan sebab di rum ahnya saat ini t erkenal
se b a g a i d a e r a h p e n g h a si l sa y u r, Le m b a n g .
Pe n g e t a h u a n t en t an g per k ebu n an sa y u r
m em buatnya tergerak untuk m enulis buku Menanam
Aneka Sayuran ( dit erbit kan oleh Sarana Purna I n-
vest ) .

76

Anda mungkin juga menyukai