Penurunan Besar Pada Viral Gastroenteritis Akut Pada Anak-anak Finlandia yang Dirawat Di

Rumah Sakit Karena Rotavirus Kembali Sebagai Patogen Yang Paling Banyak Dideteksi
Abstrak
Pendahuluan: Penelitian ini dilakukan untuk menilai prevalensi dan genotipe rotavirus, norovirus,
dan sapovirus yang bersirkulasi pada anak-anak. Hasilnya dibandingkan dengan penelitian
surveilans sebelumnya yang mencakup tahun 2006–2008, 2009–2011, dan 2012–2014 dengan
metodologi dan pengaturan yang sama, termasuk dimulainya vaksinasi universal dengan RotaTeq
pada tahun 2009.
Metode: Sampel tinja dikumpulkan dari anak-anak Metode usia: Sampel tinja diambil dari anak-
anak berusia <16 tahun dengan gastroenteritis akut di Rumah Sakit Universitas Tampere,
Finlandia, dari 1 Januari 2017 hingga 31 Desember 2018. Sampel dianalisis menggunakan PCR
transkripsi balik dan amplikon positif diurutkan.
Hasil: Sebanyak 178 sampel tinja dikumpulkan dari 214 anak. Rotavirus terdeteksi pada 56
(32%) sampel tinja, norovirus pada 48 (27%), dan sapovirus pada 11 (6,3%). Rotavirus G9P[8]
dan G12P[8] adalah genotipe yang paling banyak terdeteksi pada anak yang divaksinasi dan tidak
divaksinasi. GII.4 terdiri 96% dari deteksi norovirus.
Kesimpulan: Prevalensi semua penyebab gastroenteritis akut di rumah sakit mengalami
penurunan sebesar 51% dibandingkan tahun 2012-2014, dan sebesar 88% dibandingkan tahun
2006-2008. Rotavirus kembali sebagai penyebab paling umum dari gastroenteritis akut virus pada
anak-anak, tetapi prevalensinya tetap pada tingkat yang rendah. Tidak ada perubahan signifikan
yang terlihat pada hasil genotipe norovirus dan sapovirus
1. Pendahuluan
Secara global, diare adalah penyebab kematian kedua paling umum di antara anak-anak dari usia
1 bulan hingga 5 tahun (Liu et al., 2016). Infeksi rotavirus adalah penyebab umum diare pada
bayi dan anak kecil, dan sebelum lisensi vaksin rotavirus diperkirakan menyebabkan 527.000
kematian setiap tahun pada anak di bawah 5 tahun (Parashar et al., 2009). Hingga saat ini, 95
negara telah memasukkan vaksin rotavirus dalam program imunisasi nasional mereka (Soares-
Weiser et al., 2019), tetapi rotavirus masih tetap menjadi salah satu penyebab utama kematian
pada anak-anak usia muda secara global, menyebabkan 128.000 kematian pada tahun 2016 (GBD
2016 Kolaborator Penyakit Diare, 2018). Setelah imunisasi massal rotavirus, dua human
calicivirus – norovirus dan sapovirus – telah menjadi penyebab utama gastroenteritis akut karena
virus dan rawat inap terkait, dengan norovirus terdapat pada 21-34% dan sapovirus pada 4-23%
kasus (Hemming-Harlo et al. , 2016; Heusinkveld et al., 2016; Payne et al., 2013; Platts-Mills et
al., 2018). Pengamatan sebelumnya sangat menyarankan bahwa vaksinasi rotavirus tidak
mengurangi jumlah absolut gastroenteritis norovirus dan sapovirus (Bucardo et al., 2014;
Hemming et al., 2013). Norovirus menghadirkan satu genotipe dominan global, GII.4, yang
menunjukkan kemunculan varian virus secara kronologis, tetapi fenomena serupa belum
dilaporkan pada sapovirus (Tohma et al., 2020). Mengenai norovirus dan sapovirus, respon imun
manusia diketahui sangat spesifik genotipe (Blazevic et al., 2015; Sanchez et al., 2018). RotaTeq
(Merck & Co., Kenilworth, NJ, USA) diperkenalkan ke dalam Program Imunisasi Nasional
Finlandia pada tahun 2009 dan diberikan dalam jadwal tiga dosis pada usia 2, 3, dan 5 bulan, dan
cakupan saat ini adalah 92 –93% (Institut
Kesehatan dan Kesejahteraan Finlandia, 2021). Dibandingkan dengan tahun-tahun pravaksinasi,
deteksi rotavirus berkurang 90%, dan penurunan besar 94% dalam kasus gastroenteritis rotavirus
tipe liar juga terlihat di antara anak-anak yang terlalu tua untuk divaksinasi (Hemming Harlo et
al., 2016). Pada anak-anak Finlandia, norovirus telah menjadi penyebab utama gastroenteritis
akut yang parah, terhitung 29-34% dari kasus yang terlihat di rumah sakit, diikuti oleh sapovirus
pada 5,5% (Hemming-Harlo et al., 2016; Pitkänen et al., 2019 ). Beberapa perubahan dalam
epidemiologi genotipe rotavirus yang bersirkulasi telah dilaporkan sejak diperkenalkannya
vaksinasi rotavirus skala besar. Genotipe rotavirus yang sebelumnya dominan tampaknya secara
bertahap mereda dan strain yang sebelumnya kurang terdeteksi atau tidak terdeteksi, misalnya
G9P[8] dan G12P[8], muncul. Namun, vaksin telah terbukti mempertahankan kemanjurannya
yang tinggi terhadap gastroenteritis akut rotavirus (Leshem et al., 2014; Markkula et al., 2020a).
Tujuan dari penelitian ini adalah untuk menguji posisi epidemiologi rotavirus dan human
caliciviruses saat ini pada anak-anak yang dirawat sebagai pasien rawat jalan atau dirawat di
rumah sakit dengan gastroenteritis akut. Selanjutnya, penampilan klinis dan perkembangan
genetik dari patogen yang bersirkulasi diselidiki.
2. Bahan dan Metode
2.1. Metode klinis
Sebuah studi prospektif mengikuti peraturan Deklarasi Helsinki telah disetujui oleh Komite Etik
Distrik Rumah Sakit Pirkanmaa, Finlandia, dan dilakukan di Rumah Sakit Universitas Tampere,
Finlandia, dari 1 Januari 2017 hingga 31 Desember 2018. Semua anak di bawah 16 tahun yang
mengunjungi ruang gawat darurat (ER) atau dirawat di bangsal anak dengan gejala gastroenteritis
akut memenuhi syarat untuk penelitian. Kasus gastroenteritis akut didefinisikan sebagai
terjadinya diare 3 kali atau 2 episode muntah, atau satu episode diare dan muntah dalam 24 jam
terakhir, dan gejala telah berlangsung maksimal 7 hari sebelum masuk rumah sakit. Dua
kunjungan rumah sakit berikutnya dari satu peserta dianggap terpisah jika ada tujuh atau lebih
hari tanpa gejala antara kunjungan. Skor Vesikari (Ruuska dan Vesikari, 1990) digunakan untuk
menganalisis tingkat keparahan kasus gastroenteritis. Anak-anak dengan penyakit kronis yang
menunjukkan gejala gastroenteritis akut dikeluarkan. Informed consent tertulis diperoleh dari
wali hukum masing-masing peserta dan sampel tinja dikumpulkan dari setiap pasien yang
memenuhi syarat untuk penelitian. Jika sampel tinja tidak dapat dikumpulkan selama kunjungan
rumah sakit, kit sampel rumah disediakan untuk mengirim spesimen tinja dalam minggu
berikutnya. Status vaksinasi anak-anak dikonfirmasi dari catatan klinik kesejahteraan anak.
Penelitian ini merupakan penelitian lanjutan keempat pada gastroenteritis akut pada anak-anak
yang dilakukan di tempat yang sama dengan menggunakan metodologi yang sama. Studi pertama
dilakukan pada musim 2006-2008 dan 2009-2011, sebelum dan sesudah pengenalan vaksinasi
rotavirus nasional di Finlandia (Hemming et al., 2013; Räsänen et al., 2011). Hasil penelitian ini
dibandingkan dengan survei prospektif sebelumnya yang mencakup tahun 2006-2008 (Räsnen et
al., 2011) dan 2012-2014 (Hemming Harlo et al., 2016).

2.2. Metode laboratorium

Setelah pengumpulan, sampel tinja disimpan pada suhu -70 ° C sampai pemeriksaan dengan
metodologi dan pengaturan yang digunakan sebelumnya (Hemming et al., 2013; Pitkänen et al.,
2019). Secara singkat, PCR transkripsi balik digunakan sebagai metode deteksi utama dengan
campuran primer rotavirus yang dimodifikasi yang menargetkan segmen genom protein virus
rotavirus (VP) 7 dan VP4 dan campuran primer yang menargetkan wilayah RNA polimerase yang
bergantung pada RNA dari genom calicivirus. Segmen genom VP6 dari sampel rotavirus-positif
dianalisis untuk menentukan keberadaan virus yang diturunkan dari vaksin (Hemming dan
Vesikari, 2012). Amplikon positif diurutkan menggunakan primer yang sama. Amplikon
dimurnikan menggunakan Qiagen QIAquick Gel Extraction Kit (Qiagen, Hilden, Jerman) dan
diurutkan menggunakan BigDye Terminator v3.1 Cycle Sequencing Ready Reaction Kit (Applied
Biosystems, Foster City, MA, USA) pada ABI 3500XL Genetic Analyzer ( Thermo Fisher
Scientific, Waltham, MA, AS). Urutan dianalisis dengan Sequencher 4.10.1 (Gene Codes Corp.
Inc., Ann Arbor, MI, USA) dan dibandingkan dengan galur referensi dari basis data nukleotida
GenBank (Pusat Informasi Bioteknologi Nasional, Bethesda, MD, USA) dan Noronet,
menggunakan Alat Pencarian Penjajaran Lokal Dasar dan Alat Genotipe Otomatis Norovirus
(Kroneman et al., 2011), masing-masing. Para pasien dikelompokkan berdasarkan kelompok usia
seperti yang ditentukan oleh Organisasi Kesehatan Dunia (2008).
2.3. Metode statistik
IBM SPSS Statistics versi 27 (IBM Corp., Armonk, NY, USA) digunakan untuk analisis statistik.
Semua tes adalah dua sisi dan nilai-P di bawah 0,05 dianggap signifikan secara statistik. Uji Chi-
square Pearson, uji Kruskal-Wallis, dan uji eksak Fisher digunakan untuk menghitung perbedaan
statistik dalam data klinis, jika berlaku.
3. Hasil
Sebanyak 214 pasien direkrut, dari mereka 178 sampel tinja dikumpulkan; 104 (58%)
dikumpulkan pada 2017 dan 74 (42%) pada 2018. Data klinis tersedia untuk 175 (98%) kasus,
membentuk populasi studi akhir. Usia rata-rata anak-anak adalah 2 tahun 2 bulan (kisaran 1 bulan
sampai 14 tahun 5 bulan); 52% adalah perempuan dan 48% adalah laki-laki. Sembilan puluh tiga
anak (53%) dirawat di bangsal dan 82 anak (47%) dirawat di UGD. Dua pasien juga dirawat di
unit perawatan intensif, satu positif untuk norovirus dan yang lainnya untuk rotavirus. Secara
keseluruhan, 132 anak (75%) telah menerima setidaknya satu dosis RotaTeq. Seratus tujuh kasus
(61%) dinyatakan positif untuk satu atau lebih patogen yang diselidiki. Rotavirus adalah patogen
yang paling umum selama masa penelitian dan terdeteksi pada 56 (32%) sampel, diikuti oleh
norovirus pada 48 (27%) sampel dan sapovirus pada 11 (6,3%). Rotavirus dan sapovirus paling
sering terdeteksi pada anak di atas 60 bulan dan norovirus pada anak berusia 24 hingga 59 bulan.
Distribusi usia anak-anak yang positif virus yang diselidiki digambarkan pada Gambar 1.
Menurut data klinis, semua kecuali satu pasien dengan gastroenteritis akut mengalami muntah,
sedangkan demam terlihat sebagian besar pada infeksi rotavirus. Anak-anak dengan infeksi
rotavirus rata-rata juga secara signifikan lebih tua. Presentasi klinis infeksi sapovirus lebih ringan
daripada infeksi norovirus dan rotavirus, seperti yang digambarkan pada Tabel 1. Rotavirus dan
norovirus menunjukkan
musim yang berbeda dengan prevalensi yang lebih tinggi selama bulan-bulan musim dingin,
sedangkan jumlah sapovirus secara keseluruhan rendah (Gambar 2).
3.1. Rotavirus
Rotavirus terdeteksi pada 34% (n = 34) sampel pada tahun 2017 dan 30% (n = 22) pada tahun
2018; perempuan merupakan 50% dari kasus. Tiga puluh tiga anak (59%) dirawat di bangsal anak
(Gambar 1). Dari semua infeksi rotavirus, tujuh (13%) adalah koinfeksi: empat dengan norovirus,
dua dengan sapovirus, dan satu dengan norovirus dan sapovirus. Dalam 28 (50%) kasus, pasien
telah divaksinasi dengan satu atau lebih dosis RotaTeq; dua hanya menerima dosis pertama, satu
menerima dua dosis, dan 25 divaksinasi lengkap. G9P[8] adalah genotipe dominan dengan 31
(55%) deteksi, diikuti oleh sembilan (16%) kasus yang disebabkan oleh G12P[8]. Genotipe lain
terdeteksi lebih sporadis: lima (9%) kasus G9P[4], empat (7%) kasus G3P[8], tiga (5%) kasus
G1P[8], dua (4%) kasus G2P[4], dan satu (2%) kasus G8P[8]. Dua infeksi nosokomial yang
disebabkan oleh G3P[8] dan G9P[4] juga terdeteksi. Dalam satu kasus, infeksi tunggal dengan G1
yang diturunkan dari vaksin terdeteksi dalam sampel tinja bayi berusia 2 bulan, yang telah
menerima dosis pertama RotaTeq 3 minggu sebelum rawat inap karena gastroenteritis akut. Tidak
ada hubungan antara status vaksinasi anak-anak dan jenis rotavirus spesifik (P = 0,60). G9P[8]
dan G12P[8] adalah genotipe yang paling terdeteksi baik pada anak yang divaksinasi maupun
tidak, dan juga sama-sama umum pada kedua kelompok, dengan masing-masing 16 vs 15 kasus
dan 4 vs 5 kasus.
3.2. Norovirus
Norovirus terdeteksi pada 29% (n = 29) sampel selama tahun studi pertama (2017) dan 26% (n =
19) sampel selama tahun kedua (2018). Musiman yang jelas terlihat (Gambar 2). Norovirus
adalah penyebab utama gastroenteritis akut pada anak-anak berusia 6 bulan hingga 5 tahun,
dengan sebagian besar deteksi antara usia 12 dan 24 bulan (Gambar 1). Dua puluh tujuh (56%)
pasien dirawat di bangsal anak dan 48% pasien adalah perempuan. Ada empat infeksi campuran
dengan rotavirus dan satu dengan rotavirus dan sapovirus, dan tidak ada infeksi nosokomial yang
terdeteksi. Durasi rata-rata gejala adalah yang terpanjang dari patogen yang diperiksa. Genogroup
GII (46 kasus, 96%) mencakup hampir semua deteksi norovirus. GII.4 adalah genotipe kapsid
yang paling umum dengan 36 (75%) kasus, dan genotipe 2012 Sydney hadir di semua 33 urutan
GII.4 yang dapat ditetapkan lebih lanjut. Genotipe kapsid lain yang terdeteksi adalah GII.2 (tiga
kasus), GII.3 (enam kasus), GII.6 GI.2, dan GI.6 (masing-masing satu kasus). Genotipe P yang
paling banyak terdeteksi adalah GII.P16 (35%) dan GII.P31 (27%). Strain yang paling umum
adalah GII.4 Sydney[P16] dan GII.4 Sydney[P31] dengan masing-masing 12 kasus, diikuti oleh
GII.4 Sydney[P4 New Orleans] dengan enam kasus. Hasil yang lebih rinci ditunjukkan dalam
Bahan Tambahan (Tabel S1).
3.3. Sapovirus
Ada tiga deteksi sapovirus pada tahun pertama penelitian dan delapan deteksi pada tahun kedua,
dan kasus muncul selama musim dingin dan musim semi (Gambar 2). Dari mereka yang positif,
82% adalah perempuan. Lima pasien (45%) dirawat di bangsal, di mana tidak ada infeksi
nosokomial yang terdeteksi. Kasus-kasus positif tidak terkait dengan
kelompok usia manapun dan tidak ada deteksi sapovirus pada anak-anak berusia antara 3 tahun
dan 5 tahun. Pada tahun 2017, ketiga deteksi sapovirus menunjukkan genogroup GI. Pada tahun
2018, GII merupakan genogroup unggulan, selanjutnya dibagi lagi menjadi genotipe GII.1 dan
GII.3. Tiga infeksi campuran dikaitkan dengan sapovirus genogroup I.
4. Diskusi
Dalam studi epidemiologi berbasis rumah sakit 2 tahun keempat berturut-turut ini, prevalensi
rotavirus, norovirus, dan sapovirus pada gastroenteritis akut pada anak-anak diperiksa
menggunakan pengaturan penelitian serupa dengan tiga penelitian surveilans sebelumnya yang
mencakup tahun 2006-2008 (Räsnen et al., 2011), 2009-2011 (Hemming et al., 2013), dan 2012-
2014 (Hemming-Harlo et al., 2016), memperluas tindak lanjut peningkatan gastroenteritis akut
virus pada anak-anak sampai 12 tahun secara total dan mencakup pengenalan vaksinasi rotavirus
nasional. Prevalensi gastroenteritis akut semua penyebab menurun sebesar 51% dibandingkan
dengan musim pasca-vaksinasi 2012-2014, dan sebesar 88% dibandingkan dengan musim pra-
vaksinasi 2006-2008. Berbeda dengan penelitian surveilans sebelumnya, sedikit peningkatan
jumlah rotavirus tipe liar diamati, dan rotavirus kembali sebagai penyebab paling terdeteksi dari
gastroenteritis akut virus pada anak di bawah usia 16 tahun. Prevalensi norovirus di semua
sampel tinja adalah 27% dan serupa dengan 29% pada 2012-2014. Enam persen sampel tinja
positif mengandung sapovirus, mirip dengan musim 2012–2013 dan 2013–2014, dengan masing-
masing 3% dan 5% (Hemming-Harlo et al., 2016) Proporsi keseluruhan sampel positif rotavirus
meningkat dari 12% pada 2012-2014 menjadi 32% dalam penelitian ini, dengan peningkatan 40%
dalam jumlah absolut kasus yang terdeteksi. Ini secara langsung karena peningkatan kasus
rotavirus tipe liar yang terdeteksi, dari 4,2% menjadi 21% pada anak yang divaksinasi dan dari
27% menjadi 63% pada anak yang tidak divaksinasi dengan gastroenteritis antara musim 2012–
2014 dan 2017–2018 (Hemming-Harlo et al. ., 2016). Cakupan vaksin tetap pada 92-93% selama
6 tahun terakhir (The Finnish Institute for Health and Welfare, 2021), sehingga tidak menjelaskan
peningkatan yang terdeteksi. Dengan cakupan vaksin yang tinggi, rotavirus tipe liar terus beredar
pada tingkat yang rendah. Pergeseran nyata dalam genotipe rotavirus yang beredar terlihat,
sebagai tiga genotipe yang paling terdeteksi, G9P[8] (55% vs 8%), G12P[8] (16% vs 5%), dan
G9P[4] (9% vs tidak terdeteksi), terutama meningkat secara proporsional jika dibandingkan
dengan tahun 2012–2014, sedangkan genotipe dominan dari penelitian sebelumnya, G4P[8]
(28%), tidak terdeteksi dalam penelitian ini . Di Finlandia, semua sampel rotavirus-positif secara
nasional dikumpulkan untuk genotipe lebih lanjut. Data dari database dengan metode deteksi
serupa dengan kami menemukan bahwa galur G12P[8] dominan selama 2017–2018, dengan
G9P[8] dan G9P[4] baru menjadi semakin umum. Mirip dengan temuan ini, G12P[8] dan G9P[8]
adalah strain yang dominan pada anak-anak yang tidak divaksinasi (Markkula et al., 2020a).
Telah didokumentasikan bahwa protein kapsid G9 dan G12 menunjukkan peningkatan jumlah
bagian antigenik yang berbeda dari semua komponen vaksin (Ogden et al., 2018), yang dapat
menjelaskan kebangkitan yang terdeteksi. Pelepasan virus sangat umum terjadi setelah pemberian
vaksin oral (Markkula et al., 2015). Namun, kasus gastroenteritis rotavirus tipe vaksin tetap
jarang terlihat di rumah sakit, seperti yang ditunjukkan dalam hasil kami dan didukung oleh
penelitian nasional, di mana tingkat deteksi virus turunan vaksin RotaTeq sangat rendah,
terhitung <1% (6/827). ) kasus (Markkula et al 2020a). Dalam satu-satunya kasus yang terdeteksi
pada populasi penelitian ini, kemungkinan gejala disebabkan oleh patogen lain karena periode 3
minggu yang relatif lama antara vaksinasi oral dan rawat inap. Peran keseluruhan strain vaksin
dalam
gastroenteritis rotavirus simptomatik masih belum jelas (Markkula et al 2020b). Pada penelitian
surveilans sebelumnya oleh (Hemming-Harlo et al., 2016), perbedaan yang signifikan ditemukan
pada distribusi genotipe rotavirus antara anak yang divaksinasi dan yang tidak divaksinasi, tetapi
hasil yang serupa tidak terlihat pada penelitian ini. Pengurangan lebih lanjut dalam genotipe
vaksin pada populasi yang tidak divaksinasi karena kekebalan kelompok adalah penjelasan yang
mungkin, dan juga kemungkinan munculnya galur rotavirus baru pada kedua kelompok . Tercatat
bahwa anak-anak dengan infeksi rotavirus lebih tua daripada anak-anak dengan infeksi norovirus
atau sapovirus. Pergeseran kejadian gastroenteritis rotavirus ke kelompok usia yang lebih tua
setelah pengenalan vaksin telah dilaporkan sebelumnya (Markkula et al., 2017; Aliabadi et al.,
2019) dan mungkin karena cakupan vaksin yang tinggi terus menerus mulai dari usia dari 6-8
minggu. Pada 2012-2014 (Hemming-Harlo et al., 2016), norovirus adalah agen penyebab utama
gastroenteritis akut virus pada anak-anak, dan hasil serupa telah dilaporkan dari negara lain
dengan cakupan vaksin rotavirus yang tinggi (Halasa et al., 2021; Quee dkk., 2020; Halasa dkk.,
2021). Dibandingkan dengan hasil dari tahun 2012–2014, kami mengamati penurunan besar dari
100 kasus positif norovirus menjadi 46 kasus. Namun, karena penurunan simultan dalam jumlah
keseluruhan kasus, proporsi infeksi norovirus tetap pada tingkat yang sama. Norovirus tetap
sebagai patogen yang paling banyak terdeteksi pada anak-anak berusia 6 bulan hingga 5 tahun,
dan genotipe GII.4 masih menjadi penyebab sebagian besar kasus. Karena tidak ada perubahan
signifikan yang terdeteksi pada genotipe norovirus yang beredar, masuk akal bahwa kekebalan
yang didapat menekan epidemi yang menyebar luas (Rouhani et al., 2016). Khususnya, proporsi
kasus positif norovirus yang dirawat di bangsal rumah sakit meningkat sebesar 15 poin persentase
dari 41% pada 2012–2014. Dalam penelitian ini, usia rata-rata pasien gastroenteritis norovirus
adalah 20 bulan dibandingkan dengan 27 bulan pada 2012-2014, sehingga mungkin menjelaskan
pergeseran yang terdeteksi (Hemming-Harlo et al., 2016). Pada 2012–2014 dan 2017–2018, skor
Vesikari lengkap tersedia untuk 27/41 (66%) dan 19/24 (79%) kasus rawat inap, dengan skor
keparahan rata-rata 13,0 (kisaran 6-19) dan 12,9 ( kisaran 7–16), masing-masing, oleh karena itu
tidak menjelaskan perbedaannya. Sapovirus tetap terdeteksi secara sporadis tanpa musim yang
jelas. Data klinis menunjukkan bahwa pada saat masuk, infeksi sapovirus tampak sama parahnya
dengan infeksi rotavirus dan norovirus, menunjukkan gejala diare yang lebih sedikit tetapi
membutuhkan terapi rehidrasi invasif yang sama seringnya, menurut dokter yang mengevaluasi.
Namun demikian, durasi rata-rata gejala ternyata adalah yang terpendek. Jumlah sel darah putih
tampak lebih tinggi pada pasien ini; namun, ini disebabkan oleh dua kasus yang sangat parah
dalam jumlah kecil dari total infeksi . Beberapa genotipe sapovirus yang berbeda terdeteksi, tetapi
seperti yang dijelaskan sebelumnya (Pitkänen et al., 2019), hanya genogroup GI dan GII yang
ada. Primer yang digunakan dalam penelitian ini sensitif untuk mendeteksi sapovirus tetapi
diketahui menargetkan wilayah terkonservasi dari urutan RNA polimerase yang bergantung pada
RNA parsial dalam genom sapovirus dan oleh karena itu menetapkan batasan untuk kesimpulan
lebih lanjut dari genotipe yang bersirkulasi (Hansman et al., 2005). Jumlah keseluruhan kasus
positif yang kecil dapat menambah bobot wabah sesekali dalam pengaturan institusional
mengenai semua virus yang diperiksa. Rumah sakit studi adalah pusat rujukan pediatrik untuk
sekitar 550 000 orang, dan hasil dari studi database nasional (Markkula et al., 2020a)
menunjukkan bahwa hasil saat ini dapat dengan baik mencerminkan situasi di tingkat nasional .
Seperti terlihat pada rendahnya jumlah kasus yang hanya dirawat di UGD, karena peran yang
kuat dari pusat kesehatan primer dalam layanan darurat, kemungkinan besar kasus gastroenteritis
akut ringan sampai sedang tidak terlihat di rumah sakit, terutama kasus pada anak yang lebih
besar. Di luar jam kerja Puskesmas, semua pasien diarahkan untuk mengunjungi UGD, tetapi
dampak keseluruhan dari hal ini tidak diteliti. Sampel tinja dikumpulkan terutama pada saat
masuk dan berdasarkan gejala terlepas dari alasan utama rawat inap. Data yang terkait dengan
penyakit dengan tingkat keparahan yang berbeda dikumpulkan, dan alasan utama untuk tidak
melengkapi data klinis adalah karena mangkir. PCR digunakan untuk pengujian virus awal, yang
lebih sensitif daripada enzim immunoassay yang digunakan dalam banyak pengaturan.
Kesimpulannya, ada penurunan yang mencolok dalam jumlah total anak yang dirawat di rumah
sakit karena gastroenteritis akut. Peningkatan 40% dalam jumlah absolut kasus rotavirus
gastroenteritis terdeteksi, dan rotavirus kembali sebagai patogen yang paling terdeteksi yang
diselidiki. Peningkatan kasus gastroenteritis rotavirus pada anak yang lebih besar tidak diamati,
menunjukkan bahwa perlindungan yang diinduksi vaksin tetap pada tingkat yang baik selama
bertahun-tahun setelah vaksinasi.
Deklarasi
Pendanaan: Penelitian ini tidak menerima hibah khusus dari lembaga pendanaan di sektor publik,
komersial, atau nirlaba.
Persetujuan etis: Penelitian ini mengikuti peraturan Deklarasi Helsinki dan disetujui oleh Komite
Etik Distrik Rumah Sakit Pirkanmaa, Finlandia.
Konflik kepentingan: Oskari Pitkänen dan Jukka Markkula tidak memiliki konflik kepentingan
untuk dideklarasikan. Maria Hemming-Harlo telah menerima biaya pembicara atau dukungan
penelitian dari MSD Finlandia dan merupakan wakil anggota Komite Penasihat Nasional
Finlandia untuk Vaksin.