SIDIK JARI DNA

MISTERI YANG PERLU DIUNGKAP

• DNA :
– Apa ?
– Bagaimana sifatnya ?
– Bagaimana mendapatkannya ?

• SIDIK JARI DNA

– Apa ?
– Bagaimana membuatnya?
– Dapat digunakan untuk apa?
BAR CODE
 Genotipe dan Fenotipe

Genotipe dan fenotipe beda

Genotipe sama tapi fenotipe beda

SEL MANUSIA
 23 pasang
KROMOSOM MANUSIA
 Kromosom, Gen dan DNA

Kromosom

DNA

Gen
DNA MITOKHONDRIA
Dna inti anak berasal dari Ibu dan Bapaknya

VIDEO
Fertilization in humans. The sperm and ovum
unite through fertilization, creating a zygote
that (over the course of 8-9 days) will implant
in the uterine wall, where it will reside over
the course of 9 months.
PACKING DNA EUKARIOT
 MACAM-MACAM VNTR (DNA SATELIT)

Jumlah Panjang Unit

Jenis Tandem Ulangan/Repeat Jumlah Loci Pengulangan
(per loci) (pb)

1-2 per kromosom Ratusan ribu

Satelite 1000 - 10.000.000

Ratusan per genom

Minisatelite 10 - 1000 9-100

Di atas 100.000
pergenom
Microsatelite 10 - 100 (tergantung 1-9
pada motif
pengulangan)
Sidik jari DNA pertama kali digunakan di Inggris dalam suatu kasus perkara
pidana tahun 1987 untuk menghukum pemerkosa. Sejak saat itu Sidik jari
DNA digunakan secara luas dalam Ilmu Forensik, untuk mengidentifikasi
seseorang dengan tingkat kesalahan kurang dari seper sepuluh juta

Kegunaan Analisa DNA dalam Ilmu Forensik Meliputi:

 Identifikasi seseorang yang DNAnya ditemukan dari suatu
peristiwa kejahatan
 Identifikasi bagian tubuh seseorang yang tak dapat
diidentifikasi dengan cara lain
 Identifikasi kebenaran suatu spesies organisme (hewan atau
tanaman), untuk mencegah pemalsuan.
 Identifikasi bapak dari seorang anak dalam kasus garis ayah
 Identifikasi Anggota Keluarga
 Identifikasi individu atas dasar sisa tulang arkeolog/ fosil
Isolasi dan Pemrosesan DNA
Pengambilan Sampel DNA

video
Tahapan Untuk Memperoleh
Sidik DNA:
RAPD DAN RFLP
 Langkah-Langkah dalam membuat Sidik Jari DNA (RFLP):
1. Isolasi DNA
DNA harus diambil dari sel atau bagian dari tubuh. Hanya sebagian kecil dari tubuh seperti darah,
rambut, atau kulit yang dibutuhkan. Misalnya, menggunakan satu akar rambut saja sudah cukup.

2.Pemotongan, Perekatan, Pemilihan

Enzim khusus yang dinamakan enzym restriksi biasanya digunakan untuk memotong DNA pada
tempat yang spesifik.Sebagai contoh, Enzim EcoR1 yang ditemukan pada bakteri hanya akan
memotong DNA ketika terjadi urutan GAATTC. Potongan DNA akan dikelompokkan berdasarkan
ukurannya dengan elektroforesis sehingga membentuk pola tertentu

3.Transfer DNA pada Nilon

Pola hasil potongan DNA di dalam gel ditransfer lembar nilon, dengan menaruh nilon di atas gel
selama semalam

4. Pelacakan
Dengan perendaman lembar nilon dalam larutan yang berisi pelacak yang radioaktif atau yang berwarna, sehingga
menghasilkan suatu pita pada posisi tertentu pada nilon.

5. Sidik Jari DNA

Hasil akhir dari pemeriksaan sidik jari DNA ini diperoleh dengan menggunakan beberapa macam pelacak (5-10 jenis atau) yang
dilakukan secara serempak sehingga diperoleh deretan pita yang menyerupai Bar Code (kode barang) yang biasanya digunakan oleh
toko bahan makanan.
TAHAPAN SIDIK JARI DNA
(SOUTHERN BLOT)

VIDEO
VNTR diwariskan ke anak-cucu
 ANALISIS PATERNITY (RFLP)
IBU ANAK BPK1 BPK2 IBU ANAK BPK1 BPK2
 IDENTIFIKASI PELAKU KEJAHATAN (RFLP)
Tsk1 Tsk2 Tsk3 Darah di TKP
Kembar Identik atau Bukan (RFLP)
 Alat PCR
untuk
TesDNA
Metode
RAPD
Dapat memperbanyak/
mengkopi DNA dengan
2n x semula
Di mana n= jumlah siklus
1 siklus: 5-10 menit
 5’
GCCTGGCCTTTAAATATACG............GGCCTTACTGGTCCGCGT 3’
3’
CGGACCGGAAATTTATATGC............CCGGAATGACCAGGCGCA5’
+ 950C Denatur
asi
5’
GCCTGGCCTTTAAATATACG............GGCCTTACTGGTCCGCGT 3’
VIDEO

3’
CGGACCGGAAATTTATATGC............CCGGAATGACCAGGCGCA5’
+ 600C Anealing
5’
GCCTGGCCTTTAAATATACG............GGCCTTACTGGTCCGCGT5’3’
GCGCA

5’
GCCTG
3’
CGGACCGGAAATTTATATGC............CCGGAATGACCAGGCGCA5’

+ 770C Polimeri
sasi
3’GCCTGGCCTTTAAATATACG............GGCCTTACTGGTCCGCGT 5’
5’ 3’
3’CGGACCGGAAATTTATATGC............CCGGAATGACCAG
CGGACCGGAAATTTATATGC.........CCGGAATGACCAGGCGCA

GCCTG GCCTTTAAATATACG............GGCCTTACTGGTCCGCGT
5’
GCCTTTAAATATACG.........GGCCTTACTGGTCCGCG
3’ 3 5’
VIDEO
RAPD= Random Amplified Polymorphism DNA
(Sidik Jari DNA Berbasis PCR) dari 6 Individu
IDENTIFIKASI KELUARGA ROMANOV (Alm.)

STR: Short Tandem Repeat (Mikrosatelit)

 SIDIK JARI DNA KELUARGA ROMANOV

Ts A A1 A2 A3 P1 P2 TN
36

32

16
15

13
12

11

10

8
7

3
 RANGKUMAN
• Sidik Jari DNA adalah pola garis-garis (seperti Bar Code atau pola grafik) hasil analisis DNA
seseorang
 Ada dua metoda untuk mendapatkan sidik jari DNA yaitu:
- Metoda ”Perbedaan Panjang Fragmen Hasil Pemotongan dengan
Enzim Retriksi” atau Restriction Fragment Length Polymorphism”
(RFLP)
- Metoda Reaksi Berantai polimerisasi DNA atau Polymerise Chain
Reaction (PCR).
Perbedaan utama dari kedua metoda ini ialah
dalam hal proses utama, cara mengenali serta proses
penampakan fragment-fragment VNTR.
 Pada metoda RFLP proses utamanya adalah pemotongan DNA dengan ”enzim retriksi”,
kemudian fragmen-fragmen yang dihasilkan dielektroforesisi kemudian dikenali dan
ditampakkan oleh ”pelacak” khusus yang radioaktif.
 Pada metoda PCR (RAPD= Random Amplified Polymorphism DNA) proses utamanya adalah
perbanyakan DNA (VNTR) yang telah dikenali oleh ”primer” yang khas, kemudian hasilnya
dielektroforesisi dan ditampakkan dengan bantuan zat tertentu.
 Metode RFLP memerlukan sedikitnya 5 mikrogram DNA, sedangkan metoda PCR hanya
memerlukan seperseribunya (0,005 mikrogram) saja.
 SAAT INI YANG DIGUNAKAN HANYA METODE RAPD, karena lebih akurat dan dapat
diotomatisasi
 Sidik jari DNA dapat digunakan untuk mengidentifikasi seseorang dengan sampel sembarang
bagian tubuhnya
 Sidik jari DNA juga dapatdigunakan untuk melacak hubungan kekerabatan antar individu
Terima kasih
 Soal-soal Sidik Jari DNA

1. Devinisikan istilah-istilah berikut, beri contoh masing-masing:

a. Sidik jari DNA
b. VNTR
c. Kembar identik dan kembar tidak identik

2. Jelaskan perbedaan antara:

a. RFLP dan RAPD
b. Mini satelit dan mikrosatelit DNA
c. Single locus dan multi locus VNTR

3. Analisis RAPD single locus terhadap 5 individu (ABCDE), menghasilkan pola elektroforegam dengan
panjang fragmen sbb.
A B C D E
FRAGMEN 1 0,245; 0,175; 0,175; 0,245 dan 0,175 (kb)
FRAGMEN 2 0,560; 0,350; 0,560; 0,560 dan 0,245 (kb)

a. Gambarkan RAPD ke-5 individu tersebut!

b. Adakah hubungan kekerabatan di antara mereka? Tentukan!
c. Data apalagi yang diperlukan untuk menentukan jenis kelamin masing-masing individu?

4. Mengapa:
a. Sekuen genom suatu individu tidak digunakan sebagai identitas individu itu?
b. RAPD memerlukan primer? Apa fungsi utamanya? Bagaimana cara membuatnya?
c. RFLP memerlukan probe? Apa fungsi utamanya? Bagaimana kerjanya?
d. Pada sidik jari DNA memerlukan enzim retriksi dan elektroforesis?
e. Pada RFLP DNA yang sudah dipindahkan ke membran perlu didenaturasi?
f. Sidik jari DNA lebih unggul dari sidik jari biasa? TapiApa kelemahannya?
g. Sidik Jari seseorang selalu berbeda dengan orang yang lain?