BIOTEKNOLOGI:

Referensi

– Sukarti Moeljopawiro, Bahan Ajar Biokimia. Universitas Gadjah Mada

 DEFINISI BIOTEKNOLOGI
– BIOTEKNOLOGI: teknologi yang menggunakan dan memanfaatkan sistem hayati
untuk mendapatkan barang dan jasa yang berguna untuk kesejahteraan manusia

– Generasi bioteknologi:
– Generasi pertama = Bioteknologi Tradisional
– Generasi kedua = Bioteknologi Modern
– Generasi ketiga = Generasi Pasca Tahun 2000
GENERASI BIOTEKNOLOGI (lanjt.)

– BIOTEKNOLOGI TRADISIONAL
Menyeleksi bahan, mikrobia dan lingkungan

– BIOTEKNOLOGI MODERN
Keterampilan manusia dalam memanipulasi makhluk hidup
(rekayasa genetika)

– GENERASI PASCA TAHUN 2000

Adalah generasi sesudah diketahui urutan basa genom manusia
ILMU YANG DIBUTUHKAN UNTUK
MENGUASAI BIOTEKNOLOGI

– Biologi molekular  Fisiologi

– Mikrobiologi
 Kimia
– Biokimia
 Fisika
– Genetika
 dan ilmu pendukung
yang lain
 HIRARKI STRUKTUR BIOLOGIS
Organisme

Organ

Jaringan

Sel

BM 106-1010
Multienzim kompleks, ribosom, kromosom,
membran, elemen struktural

Makro Molekul
104-109 Protein Asam nukleat Polisakarida

Unit monomer
100-800 Nukleotida Fosfolipid

Basa aromatik, Palmitat, gliserol,

BM 100-250 Asam amino Glukosa
ribosa kolesterol

BM 18-44
CO2, H2O, N2
HIRARKI STRUKTUR BIOLOGIS (lanjt.)
SEL – KROMOSOM – DNA
REKAYASA GENETIKA

Teknik untuk menghasilkan molekul DNA yang berisi gen baru yang
diinginkan/ kombinasi gen-gen baru atau dapat dikatakan manipulasi
organisme
ILMU YANG MENDUKUNG UNTUK DAPAT
MELAKUKAN DAN MEMANFAATKAN
REKAYASA GENETIKA

– Fisiologi mikrobia
– Genetika molekular
– Biokimia
– Biokimia genetik
– Ilmu pendukung yang lain:
– Kultur jaringan
– Fusi sel
– Bioreaktor
TAHAP PENTING PERKEMBANGAN
BIOTEKNOLOGI MODERN

1944  DNA pembawa informasi genetik (Oswald Avery)

1953  struktur DNA (Watson and Crick)
1961  kodon (Nirenberg and Matthaei)
1968  ditemukan enzim endonuklease restriksi (Smith and
Wilcox)
1971  Pembuatan DNA rekombinan secara in vitro (Paul
Berg)
1973  teknik kombinasi gen berhasil dilakukan
1977  hormon tumbuh diproduksi di bakteri dengan teknik
rekombinasi DNA
TAHAP PENTING PERKEMBANGAN
BIOTEKNOLOGI MODERN (lanjt.)
1978  gen untuk insulin diperbanyak
1982  Humulin mulai dijual
1983  Polymerase Chain Reaction (PCR) (Kary Mullis)
1985  PCR dipublikasikan
1990  Human Genom Project
1990  Terapi gen pertama kali diaplikasikan
2000  Human Genom Project selesai
DOGMA SENTRAL BIOLOGI

Transkripsi Translasi
DNA RNA Protein
Transkripsi Balik
Replikasi
KROMOSOM – DNA
DNA
ENZIM RESTRIKSI
– Enzim restriksi:
– Memotong DNA pada tempat spesifik
– Banyak ditemukan pada banyak spesies bakteri
– Fungsi mengenal dan memotong DNA asing
(DNA sendiri pada urutan tersebut tidak dipotong karena dimetilasi
oleh enzim DNA metilase)

– Ada 3 macam enzim restriksi, yaitu: Tipe I, II dan III

– Tipe I dan III: multisubunit kompleks, berisi aktivitas endonuklease dan
metilase
– Membutuhkan ATP
ENZIM RESTRIKSI (lanjt.)

– Masing-masing mempunyai spesifisitas tempat pemotongan

– Tipe I memotong secara acak 1000 pasang basa dari urutan pengenal
– Tipe III memotong DNA 25 pasang basa dari pengenal
– Tipe II memotong pada urutan basa pengenal

– Enzim restriksi tipe II

– Tidak membutuhkan ATP
– Diisolasi pertama oleh Hamilton Smith
– Enzim yang banyak digunakan dalam DNA rekombinan
– Nama terdiri dari 3 singkatan spesies bakteri:
– BamH I: Bacillus amyloliquefaciens H
– EcoR I: Escherichia coli RY13
 URUTAN
SUMBER ENZIM SINGKATAN
PENGENAL
GGATCC
*
Bacillus amyloliquefaciens H BamH I
CCTAGG
*

TGGCCA
Brevibacterium albidum Bal I
ACCGGT

*
GAATTC
Escherichia coli RY13 EcoR I
CTTAAG
*
*
GGCC
Haemophilus aeqyptius Hae III
CCGG
*
AAGCTT
Haemophilus influenzae Rd Hind III
TTCGAA

GTTAAC
Haemophilus parainfluenzae Hpa II
CAATTG
PENYISIPAN DNA
PENYISIPAN GEN ENZIM LUCIFERASE

Kunang-kunang

Luciferase Tembakau berfluoresen

APLIKASI BIOTEKNOLOGI

BIOPHARMACEUTICAL

TERAPI GEN

STEM CELLS
BIOPHARMACEUTICAL
– Any such pharmaceutical substance produced
specifically via genetic engineering technology is
generally termed a BIOPHARMACEUTICAL

– Tahun 2004, 80 milyar (16%) dari 500 milyar total

penjualan produk farmasi berasal dari biopharmaceutical

– Sekarang?
PRODUK REKAYASA GENETIKA
TUMBUHAN

Dengan rekayasa genetika, tumbuhan dapat digunakan untuk memproduksi:

– Antibodi mamalia
– Vaksin
– Hormon
– Enzim
– Berbagai macam agen terapeutik
TEMBAKAU SEBAGAI
TANAMAN INANG (HOST)
– KELEBIHAN
– Mudah direkayasa
– Pertumbuhannya lebih cepat
– Hasil biomassa yang tinggi (lebih dari 100.000
kg/ha) berpotensi untuk dikembangkan
dalam skala besar

 KELEMAHAN
Produk tidak stabil  untuk pengangkutan dan
pemrosesan, daun perlu dibekukan atau dikeringkan
SEREALIA

 KELEBIHAN
 Tidak mengandung senyawa fenolik
 Protein yang terkandung stabil
sehingga memungkinkan untuk
penyimpanan jangka panjang pada
suhu kamar
 Antibodi yang diekspresikan dari padi-
padian dan leguminosa tetap stabil
selama 3 tahun pada suhu kamar tanpa
kehilangan aktivitas (Stoger et al., 2000)

– KELEMAHAN
Gen dapat tersebar ke tanaman pangan yang lain yang bukan target
BERBAGAI TANAMAN PADI DI
SAWAH
JAGUNG
KELEBIHAN
– Biomassa tinggi
– Mudah direkayasa
– Berpotensi untuk dikembangkan dalam
skala besar

Jagung dimanfaatkan untuk produksi:

 β-glukuronidase (Witcher et al., 1998)
 Antibodi rekombinan (Hood et al., 2002)
 Enzim laccase dan tripsin (Hood, 2002)
 Sampai sekarang telah banyak lagi….
KELEBIHAN TANAMAN DALAM
BIOPHARMACEUTICAL

Tanaman mempunyai banyak kelebihan dibanding pembuatan produk

farmasi secara tradisional, karena:
– Biaya produksi rendah
– Perbanyakan cepat
– Bebas dari mikrobia patogen
– Produk protein yang dihasilkan persis sama dengan yang “ditiru”
TERAPI GEN
– TERAPI GEN: penyisipan atau introduksi gen asing ke sel yang
cacat untuk memperbaiki kesalahan fenotip yang ditimbulkan

– Dua macam terapi gen:

– Terapi gen sel somatik / Somatic gene therapy
– Terapi gen nutfah / Germ-line gene therapy

– Terapi gen yang sudah diterapkan dan dikembangkan terapi gen

sel somatik
TERAPI GEN UNTUK DEFISIENSI
Adenin Deaminase (ADA)
TERAPI GEN UNTUK DEFISIENSI
Adenin Deaminase (ADA) (lanjt.)

(Anderson & Blaese)

Food and Drug Administration (FDA)

belum mengijinkan semua produk terapi
gen untuk dijual
SARAN UNTUK PAKAR TERAPI GEN

– Terbatas pada sel somatik

– Tidak riskan terhadap penderita
– Penyakit yang diobati terbatas pada penyakit genetik
yang disebabkan kerusakan pada gen tunggal
– Penyakit melibatkan sel yang dapat diambil dari
penderita
– Prosedur memenuhi standar keselamatan
DNA PROFILING
– DNA PROFILING
– Cara identifikasi yang sangat potensial
– Ketelitian sangat tinggi
– Dapat diterapkan pada barang bukti dari semua jenis
material biologi

– Dasar DNA Profiling

Keunikan susunan basa pada DNA yang tidak sama pada

setiap individu, dan kesamaan susunan basa DNA pada
seluruh sel pada satu individu
TES DNA
TES DNA (PATERNITY)
1 2 3 4

1. Ibu
2. Anak
3. Pengusaha kaya
4. Tukang sapu
Jadi, bapak anak tersebut
adalah tukang sapu
PROFIL DNA
dalam kasus

1. PATERNITY
2. CRIME

1 2
Terima kasih 