Uji Biokimia Metabolisme Bakteri

Juni 19th, 2010 | Author: nunil08 Metabolisme adalah semua reaksi kimiawi yang dilakukan oleh sel yang menghasilkan energi maupun yang menggunakan energi untuk sintesis komponen-komponen sel dan untuk kegiatan-kegiatan selular, seperti pergerakan. Reaksi kimiawi yang membebaskan energi melalui perombakan nutrien disebut reaksi disimilasi atau penguraian. jadi dapat dikatakan bahwa prombakan nutrien dapat pula disebut sebagai kegiatan katabolik sel. Sedangkan reaksi kimiawi yang menggunakan energi untuk sintesis dan fungsi-fungsi sel disebut reaksi asimilasi atau anabolik. Bila sel merombak ikatan-ikatan kimiawi tertentu selama metabolisme, energi yang dilepaskan menjadi tersedia untuk melangsungkan kerja biologis. Selama masa hidup sel, kerja ini bersifat ekstensif dan beragam. Mikroorganisme heterotrofik nonfotosintesik memperoleh energinya dari oksidasi (pelepasan elektron atau atom hidrogen) yang melibatkan senyawa-senyawa anorganik (Pelezer 2006). Cara Bakteri Memperoleh Energi Melalui proses Oksidasi-reduksi. Oksidasi adalah proses pelepasan elektron sedangkan reduksi adalah proses penangkapan elektron. Karena elektron tidak dapat berada dalam bentuk bebas, maka setiap reaksi oksidasi selalu diiringi oleh reaksi reduksi. Hasil dari reaksi oksidasi yaitu terbentuknya energi. Umumnya reaksi oksidasi secara biologi dikatalisis oleh enzim dehidrogenase. Enzim tersebut mentransfer elektron dan proton yang dibebaskan kepada aseptor elektron intermedier seperti NAD+ dan NADP+ untuk dibentuk menjadi NADH dan NADPH. Fosforilasi oksidatif terjadi pada saat elektron yang mengandung energi tinggi tersebut ditransfer ke dalam serangkain transpor elektron sampai akhirnya ditangkap oleh oksigen atau oksidan anorganik lainnya sehingga oksigen akan tereduksi menjadi H2O. Berikut adalah tahapan proses Fosforilasi Oksidatif : 1. Transfer elektron menuju oksigen melalui berbagai caier seperti flavoprotein,quinon maupun citekrom. 2. Adanya transfer elektron ini mengakibatkan aliran proton (H+) dari sitoplasma ke luar sel. Jadi arah aliran adalah dari dalam ke luar. Hal ini akan menimbulkan peredaan konsentrasi proton atau dikenal dengan gradien pH. 3. Umumnya pH 7.5, Gradien pH terjadi jika pH di luar sel lebih kecil dari 7.5. Selanjutnya gradien pH bersama dengan potensial membentukprotonmotive force. Kekuatan (protonmotive force) akan menarik proton dari luar sel kembali ke dalam sel. Bersamaan dengan masuknya kembali proton akan terbentuk energi yang digunakan untuk berbagai aktifitas sel. 4. Para membran terdapat enzim spesifik disebut dengan ATPase. Energi yang disebabkan pada saat masuknya kembali proton akan digunakan oleh ATPase untuk forforilasi ADP menjadi ATP. Energi ini disimpan dalam bentuk ikatan fosfat yang selanjutnya dapat digunakan untuk aktifitas sel. Reaksinya adalah: Adenosin -P ~ P + Pi. energi Adenosin- P~ P~ P Ada dua macam energi yang digunakan oleh makhluk hidup yaitu :

1. Sinar matahari. Organisme ini disebut organisme fotosintesis atau dikenal dengan organisme fototrofik. 2. Oksidasi senyawa kimia. Organisme ini disebut dengan organisme kemosintesis kemotrofik atau autotrofik. Fotosintesis ada dua macam : 1. Fotosintesis tipe Cynobacteria. Fotosintesis tipe ini sama dengan fotosintesis yang terjadi pada tanaman tingkat tinggi dengan keseluruhan reaksi adalah : CO2 + 2H2O sinar matahari H2O + [ CH2O ]n + O2 klorofil Pada sistem fotosintesis ini terdapat 2 fotosistem yaitu fotosistem (PS) I dan II. Aliran elektron dari PS II ke PS I akan mengubah NADP+ menjadi NADPH. Aliran elektron disebut noncyelic phosphorilation. 1. Fotosintesis tipe Noncyanobacteria. Kelompok bakteri ini tidak memiliki fotosistem II untuk memfotolisis H2O. Dengan demikian bakteri ini tidak pernah menggunakan air sebagai reduktan sehingga oksigen tidak pernah dihasilkan dari fotosintesis. Fotosintesis yang demikian berlangsung dalam keadaan anaerob, sehingga dikenal dengan fotosintesis anaerob. Jadi organisme ini memerlukan suplai senyawa organik sebagai donor hidrogennya Persamaan reaksi secara umum adalah: Sinar matahari CO2 +2H2A H2O + [CH2O]n + 2A klorofi

Metabolisme merupakan reaksi-reaksi kimia yang terjadi pada makhluk hidup. Proses metabolisme dibedakan menjadi dua jenis yaitu anabolisme dan katabolisme. Anabolisme (Biosintesis) yaitu reaksi biokimia yang merakit molekul-molekul sederhana menjadi molekul-molekul yang lebih kompleks. Misalnya pembentukkan protein dari asam amino. Secara umum proses anabolik membutuhkan energi. Sedangkan katabolisme yaitu reaksidydear biokimia yang memecah atau menguraikan molekul-molekul kompleks menjadi molekul-molekul yang lebih sederhana. Proses katabolikDedy melepaskan energi yang dibutuhkan oleh sel(Waluyo, 2004).

Aktivitas

metabolisme

tidak

terlepas

dari

adanya

enzim.

Berdasarkan tempat bekerjanya, bakteri memiliki juga jenis enzim yaitu endoenzim dan eksoenzim. Endoenzim yaitu enzim yang berkerja dalam sel. Sistem endoenzim selain bersifat anabolik dapat juga bersifat katabolik.sedangkan eksoenzim yaitu enzim yang disekresikan ke luar sel dan berdifusi ke dalam media. Sebagian besar eksoenzim bersifat hidroliktik, yang berarti bahwa eksoenzim menguraikan molekul kompleks menjadi molekul yang molekul-molekul yang lebih sederhana. Molekulmolekul yang lebih kecil ini kemudian dapat memasuki sel dan digunakan

Pesan Pribadi Laporkan Pelanggar an

untuk kepentingan sel(Waluyo, 2004). Sifat metabolisme bakteri dalam uji biokimia biasanya dilihat dari interaksi metabolit-metabolit yang dihasilkan dengan reagen-reagen kimia. Selain itu dilihat kemampuannya menggunakan senyawa tertentu sebagai sumber karbon dan sumber energi (Waluyo, 2004). E. coli adalah suatu bakteri gram negative berbentuk batang, bersifat anaerobic fakultatif, dan mempunyai flagella peritrikat. E. coli dibedakan atas sifat serologinya berdasarkan antigen o (somatic), K (kapsul) dan H (flagella) (Fardiaz,1992) Medium selektif yang dapat digunakan untuk mengisolasi E.coli misalnya DHL (Desoxycholate Hydrogen Sulfide Lactose) agar atau MacConkey Agar. Koloni E.coli pada DHL dan MacConkey Agar berwarna merah dan dikelilingi oleh areal yang menunjukkan pengendapan bile. E.coli akan menfermentasi laktosa di dalam medium menjadi asam, sehingga mengakibatkan terjadinya pengendapan bile dan penyerapan indikator merah netral(Fardiaz,1992) Uji-uji biokimia yang dilakukan terhadap E. coli termasuk

karakteristik pertumbuhan pada agar TSI (Triple Sugar Iron) dan agar SIM (Sulfite Indole Motility) atau LIM (Lysine Indole Motility). Uji-uji biokimia ditujukan untuk menunjukkan E.coli dan bakteri-bakteri lainnya yang mempunyai sifat-sifat hamper sama, yaitu Klebsiella dan Enterobacter (Fardiaz,1992) Berikut beberapa uji Biokimia yang digunakan untuk identifikasi bakteri antara lain : a. Indol Media ini biasanya digunakan dalam indetifikasi yang cepat. Hasil uji indol yang diperoleh negatif karena tidak terbentuk lapisan (cincin) berwarna merah muda pada permukaan biakan, artinya bakteri ini tidak membentuk indol dari tryptopan sebagai sumber carbon, yang dapat diketahui dengan menambahkan larutan kovacs. Asam amino triptofan merupakan komponen asam amino

yang lazim terdapat pada protein, sehingga asam amino ini dengan mudah dapat digunakan oleh mikroorganisme akibat penguraian protein(Anonim, 2008)

b. 1.

MR-VP Uji MR Hasilnya positif, terjadi perubahan warna menjadi merah setelah ditambahkan methyl red. Artinya, bakteri ini mengahasilkan asam campuran (metilen glikon) dari proses fermentasi glukosa yang terkandung dalam medium MR-VP. Terbentuknya asam

campuran pada media akan menurunkan pH sampai 5,0 atau kurang, oleh karena itu bila indikator metil ditambahkan pada biakan tersebut dengan pH seredndah itu maka indikator tersebut menjkadi merah. Hal ini menandakan bahwa bakteri ini peragi asam campuran(Anonim, 2008) 2. Uji VP Hasilnya negatif, karena tidak terbentuk warna merah pada medium setelah ditambahkan -napthol dan KOH, artinya hasil akhir fermentasi bakteri ini bukan asetil metil karbinol (asetolin) (Anonim, 2008) c. SIM Hasil yang diperoleh pada uji ini adalah positif, hal ini terlihat adanya penyebaran yang berwarna putih seperti akar disekitar inokulasi. Hal ini menunjukan adanya pergerakan dari bakteri yang diinokulasikan, yang berarti bahwa bakteri ini memiliki flagella. Dari uji juga terlihat ada warna hitam, yang berarti bakteri ini menghasilkan Hidrogen Sulfit (H2S) (Anonim, 2008)

d.

Simmons Citrate Hasil uji sitrat yang diperoleh negatif, yang ditandai dengan tidak terjadinya perubahan warna. Artinya bakteri ini tidak mempunyai enzim sitrat permiase yaitu enzim spesifik yang membawa sitrat ke dalam sel(Anonim, 2008)

e.

TSIA Pada uji TSIA warna media slant berubah menjadi merah karena bakteri bersifat basa ini menandakan bahwa bakteri ini tidak memfermentasi laktosa dan sukrosa(Anonim, 2008)

Co2

Pembentukan gas positif ini hasil dari fermentasi H2 dan dapat dilihat dari pecahnya dan terangkatnya agar.

Pembentukan H2S positif ditandai dengan adanya endapan berwarna hitam, endapan ini terbentuk karena bakteri mampu mendesulfurasi asam amino dan methion yang akan menghasilkan H2S, dan H2S akan bereaksi dengan Fe++ yang terdapat pada media dan menghasilkan endapan hitam(Anonim, 2008) Pada media daerah butt media berubah berwarna kuning ini menandakan bakteri memfermentasi glukosa. Media ini biasanya digunakan untuk membedakan Salmonella dan Shigella dengan bakteri Gram negatif bentuk batang lainnya bedasarkan pola fermentasi penghasil hydrogen sulfide. Untuk pengamatan pola-pola pengunaan karbohidrat. TSIA agar mengadung laktosa dan sukrosa dalam konsentrasi 1%, glukosa 0,1% dan phenol red sebagai indicator yang menyebabkan perubahan warna dari merah orange menjadi kuning dalam suasana asam. TSIA juga mengandung natrium trisulfat, yaitu suatu substrat untuk penghasil H2S, ferro sulfat menghasilkan FeS (precipitat), bewarna hitam untuk membedakan bakteri H2S dengan bakteri-bakterinya(Anonim, 2008)

f.

Uji gula-gula(Glukosa, Laktosa, Sukrosa dan Manitol) Uji ini dilakukan untuk mengindetifikasi bakteri yang mampu memfermentasikan karbohidrat. Pada uji gula-gula hanya terjadi perubahan warna pada media glukosa yang berubah menjadi warna kuning, artinya bakteri ini membentuk asam dari fermentasi glukosa. Pada media glukosa juga terbentuk gelembung pada tabung durham yang diletakan terbalik didalam tabung media, artinya hasil fermentasi berbentuk gas(Anonim, 2008)

Perbedaan sifat-sifat E.coli, Klebsiella dan Enterobacter Uji TSI : Fermentasi Sukrosa dan laktosa. Fermentasi glukosa + Produksi gas (+) Produksi H2S ()b (+) + + + E.coli (+)a Klebsiella + Enterobacter +

LIM/SIM Dekarboksilase lisin. () Produksi indol. (+) Motilitas (+) Produksi H2S. + () + (+)

Ket :

a(+),

Kebanyakan Positif. Kebanyakan Negatif.

b(),

DAFTAR PUSTAKA

Anonim,2008: http://hafizluengdaneun.multiply.com/journal/item/1/Laporan_Koasist ensi_Mikrobiologi_ Diakses hari selasa, Pukul 11.45, Samarinda

Fardiaz, S. 1992. Mikrobiologi Pangan 1. Gramedia Pustaka Utama: Jakarta Waluyo, L. 2004. Mikrobiologi Umum. Universitas Muhamadiyah Malang: Malang

Disusun oleh :

Mahasiswa Biologi 06 FMIPA Universitas Mulawarman Samarinda

Dedy Ramadhany

Amiruddin

1 komentar

Halaman:12 2012 Multiply Indonesian Perihal Blog Syarat Privasi Perusahaan Iklankan API Bantuan Sitemap

REAKSI KIMIAWI DALAM PROSES FERMENTASI

Pengertian Fermentasi Fermentasi adalah proses produksi energi dalam sel dalam keadaan anaerobik (tanpa oksigen). Secara umum, fermentasi adalah salah satu bentuk respirasi anaerobik, akan tetapi, terdapat definisi yang lebih jelas yang mendefinisikan fermentasi sebagai respirasi dalam lingkungan anaerobik dengan tanpa akseptor elektron eksternal. Adapun definisi fermentasi yang lain adalah kegiatan mikroba pada bahan pangan sehingga dihasilkan produk yang dikehendaki. Fermentasi pada umumnya menggunakan senyawa organik berupa karbohidrat yang dapat digolongkan sebagai berikut : bahan bergula, seperti tebu, molase, bit gula dan cairan buah-buahan bahan berpati, seperti jagung, ubi kayu dan kentang bahan berselulosa, seperti kayu dan berbagai limbah industri pertanian

Gula adalah bahan yang umum dalam fermentasi. Beberapa contoh hasil akhir fermentasi adalah etanol, asam laktat, dan hidrogen. Akan tetapi beberapa komponen lain dapat juga dihasilkan dari fermentasi seperti asam butirat dan aseton. Reaksi dalam fermentasi berbeda-beda tergantung pada jenis gula yang digunakan dan produk yang dihasilkan. Secara singkat, glukosa (C6H12O6) yang merupakan gula paling sederhana , melalui fermentasi akan menghasilkan etanol (2C2H5OH). Reaksi fermentasi ini dilakukan oleh ragi, dan digunakan pada produksi makanan. Persamaan Reaksi Kimia C6H12O6 2C2H5OH + 2CO2 + 2 ATP (Energi yang dilepaskan:118 kJ per mol) Dijabarkan sebagai Gula (glukosa, fruktosa, atau sukrosa) Alkohol (etanol) + Karbon dioksida + Energi (ATP) Jalur biokimia yang terjadi, sebenarnya bervariasi tergantung jenis gula yang terlibat, tetapi umumnya melibatkan jalur glikolisis, yang merupakan bagian dari tahap awal respirasi aerobik pada sebagian besar organisme. Jalur terakhir akan bervariasi tergantung produk akhir yang dihasilkan. Pada kebanyakan tumbuhan den hewan respirasi yang berlangsung adalah respirasi aerob, namun demikian dapat saja terjadi respirasi aerob terhambat pada sesuatu hal. Maka dari itu hewan dan tumbuhan tersebut melangsungkan proses fermentasi yaitu proses pembebasan energi tanpa adanya oksigen, nama lainnya adalah respirasi anaerob. Dari hasil akhir fermentasi, dibedakan menjadi fermentasi asam laktat/asam susu dan fermentasi alkohol. A. Fermentasi Asam Laktat Fermentasi asam laktat yaitu fermentasi dimana hasil akhirnya adalah asam laktat. Peristiwa ini dapat terjadi di otot dalam kondisi anaerob.

Reaksinya: C6H12O6 > 2 C2H5OCOOH + Energi enzim

Prosesnya :

1. Glukosa > asam piruvat (proses Glikolisis).

enzim C6H12O6 > 2 C2H3OCOOH + Energi

2. Dehidrogenasi asam piravat akan terbentuk asam laktat. 2 C2H3OCOOH + 2 NADH2 > 2 C2H5OCOOH + 2 NAD piruvat dehidrogenasa

Energi yang terbentuk dari glikolisis hingga terbentuk asam laktat : 8 ATP 2 NADH2 = 8 - 2(3 ATP) = 2 ATP. B. Fermentasi Alkohol Pada beberapa mikroba peristiwa pembebasan energi terlaksana karena asam piruvat diubah menjadi asam asetat + CO2 selanjutaya asam asetat diabah menjadi alkohol. Dalam fermentasi alkohol, satu molekul glukosa hanya dapat menghasilkan 2 molekul ATP, bandingkan dengan respirasi aerob, satu molekul glukosa mampu menghasilkan 38 molekul ATP.

Reaksinya: 1. Gula (C6H12O6) > asam piruvat (glikolisis) 2. Dekarbeksilasi asam piruvat. Asampiruvat > asetaldehid + CO2. piruvat dekarboksilase (CH3CHO)

3. Asetaldehid oleh alkohol dihidrogenase diubah menjadi alkohol (etanol). 2 CH3CHO + 2 NADH2 > 2 C2H5OH + 2 NAD. alkohol dehidrogenase enzim Ringkasan reaksi : C6H12O6 > 2 C2H5OH + 2 CO2 + 2 NADH2 + Energi C. Fermentasi Asam Cuka Fermentasi asam cuka merupakan suatu contoh fermentasi yang berlangsung dalam keadaan aerob. Fermentasi ini dilakukan oleh bakteri asam cuka (Acetobacter aceti) dengan substrat etanol. Energi yang dihasilkan 5 kali lebih besar dari energi yang dihasilkan oleh fermentasi alkohol secara anaerob.

Reaksi: aerob C6H12O6 (glukosa)

>

C2H5OH

>

CH3COOH

H2O

116

kal

bakteri asam cuka asam cuka

Views: 1936

Kategori: Sains & Tek ..

Lisensi: All Rights Reserved

Presentasi Deskripsi
Tidak ada deskripsi yang tersedia.

Komentar Presentasi Transkrip

Reaksi biokimia di: Isolat bakteri patogen umum Dr.TVRao MD Biokimia Reaksi dalam 1 Dr.TVRao MD

Laboratorium Investigasi infeksi mikroba: Laboratorium Investigasi infeksi Mikroba Pemeriksaan spesimen untuk mendeteksi mengisolasi dan mengidentifikasi patogen: 1 - 2 Microscopy - teknik Budaya 3 - reaksi biokimia 4 - identifikasi serologis: 5 - teknik biologi molekuler 6 - Bakteriofag mengetik

Identifikasi dari Bakteri Diketahui :: Identifikasi dari Bakteri Diketahui: Dr.TVRao MD 3 mikrobiologi menggunakan tes biokimia, mencatat kemampuan mikroba tertentu untuk memanfaatkan atau menghasilkan bahan kimia tertentu

Uji biokimia membantu dalam Identifikasi isolat bakteri beberapa: Uji biokimia membantu dalam Identifikasi isolat bakteri beberapa SEMUANYA bahwa organisme hidup tidak merupakan hasil dari aktivitas ENZIM suatu, penjumlahan dari kegiatan enzim semua organisme yang sama SIDIK JARI biokimia nya. Artinya, organisme adalah totalitas dari enzim, sehingga dengan menentukan mana enzim yang hadir dalam organisme diketahui seseorang dapat DESCRIBE & IDENTIFIKASI organisme yang 4 Dr.TVRao MD

Reaksi biokimia: Reaksi biokimia Penggunaan substrat dan gula untuk mengidentifikasi patogen: a Gula-fermentasi: Organisme fermentasi gula dengan produksi asam Organisme hanya fermentasi gula dengan produksi asam dan gas Organisme tidak memfermentasi gula b-Produksi indole: Tergantung pada produksi indole dari asam amino triptofan Indole terdeteksi oleh penambahan Penampilan pereaksi Kovac tentang cincin merah pada produksi e-H2S permukaan: Tergantung pada H2S produksi dari protein atau polipeptida Deteksi dengan menggunakan strip kertas filter yang mengandung timbal asetat

Reaksi biokimia (lanjutan): Reaksi biokimia (lanjutan) c-Metil merah reaksi (MR): Fermentasi glukosa dengan produksi jumlah besar pH asam Menurunkan terdeteksi oleh reaksi metil indikator merah d-Voges proskaur ini (VP): Produksi carbinol metil asetil dari fermentasi glukosa carbinol metil Asetil terdeteksi oleh Warna penambahan KOH dari media berubah warna menjadi pink (positif) e-

Reaksi biokimia (lanjutan): Reaksi (lanjutan) Biokimia f-oksidase tes: Beberapa bakteri menghasilkan enzim oksidase Deteksi dengan menambahkan beberapa tetes Koloni reagen oksidase berwarna ungu gilirannya dalam warna (positif) g-Katalase tes: Beberapa bakteri menghasilkan enzim katalase Penambahan H2O2 menyebabkan produksi dari gelembung gas (O2 produksi) h-koagulase tes: Beberapa bakteri menghasilkan enzim koagulase koagulase enzim mengubah fibrinogen ke fibrin (bekuan plasma) Terdeteksi oleh slide atau cara uji tabung i-Urease tes: Beberapa bakteri menghasilkan enzim urease Urease urea enzim menghidrolisis dengan produksi NH3 Alklinity media dan perubahan warna indikator dari kuning menjadi merah muda

Umum Tes Untuk mengidentifikasi isolat bakteri: Umum Tes Untuk mengidentifikasi isolat bakteri Indole Methyl Red / Voges Proskauer Sitrat H2S produksi Urea hidrolisis Motilitas Laktosa Sukrosa fermentasi fermentasi fermentasi Glukosa & produksi gas 8 Dr.TVRao MD

Katalase menguji. : Katalase menguji. Tes ini digunakan untuk mengidentifikasi organisme yang memproduksi enzim, katalase. Enzim ini mendetoksifikasi hidrogen peroksida dengan memecahnya menjadi air dan gas oksigen. Gelembung yang dihasilkan dari produksi gas oksigen jelas menunjukkan hasil katalase positif. 9 Dr.TVRao MD

Katalase tes: Katalase test 'Sepuluh vol.' H2O2, dijalankan ke dalam tabung kapiler, diikuti oleh suspensi. Gas biasanya berkembang segera dan hanya tabung gas tidak menunjukkan dalam 10 detik. Disegel lebih lama pengamatan 10 Dr.TVRao MD

Oksidase TES: UJI oksidase Uji oksidase (juga dikenal sebagai uji oksidase sitokrom) digunakan untuk mencari enzim oksidase dihasilkan oleh bakteri tertentu. Oksidase mengkatalisis transpor elektron antara substrat bertindak sebagai donor elektron dalam bakteri dan tetrametil-p-phenylenediamine ATAU dimetil-pphenylenediamine - hadiah pewarna redoks sebagai garam hidroklorida atau oksalat pewarna ini dikurangi menjadi warna ungu-biru di hadapan enzim oksidase 11 Dr.TVRao MD

Oksidase Uji: Uji oksidase Uji oksidase adalah tes yang digunakan dalam mikrobiologi untuk menentukan apakah bakteri memproduksi sitokrom oksidase tertentu c. Menggunakan disk diresapi dengan reagen seperti N, N, N ', N'-tetrametil-p-phenylenediamine (TMPD) atau N, N-Dimethyl-p-phenylenediamine (DMPD), yang juga merupakan indikator redoks. 12 Dr.TVRao MD

Filter Strip Metode: Metode Strip Filter Rendam potongan kertas saring dalam larutan pewarna segar, tiriskan dan membekukan kering. Strip harus disimpan dalam botol kedap udara dan disimpan dalam lingkungan yang gelap dingin. Strip disiapkan dengan cara ini akan terus selama beberapa bulan, dan memiliki warna pastel-violet pingsan. Untuk menggunakan, mengambil strip dan rendam dalam air suling. Pilih koloni yang akan diuji dengan loop dan gosok ke dibasahi strip. Sebuah perubahan warna dalam waktu 10 detik menunjukkan reaksi positif. 13 Dr.TVRao MD

Pengujian oksidase membutuhkan kontrol: Oksidase kebutuhan pengujian kontrol kendali Positif: Pseudomonas aeruginosa Negatif kontrol Enterobactericia E.coli. Klebsiella spp 14 Dr.TVRao MD

HIDROGEN SULFIDE PRODUKSI: HIDROGEN SULFIDE PRODUKSI Dr.TVRao MD 15 Beberapa bakteri memiliki kemampuan enzimatik untuk menurunkan asam amino (sistein, sistin dll) yang mengandung kelompok sulfhidril (-SH) memproduksi hidrogen sulfida. Hidrogen sulfida bereaksi dengan logam berat seperti timah atau besi membentuk endapan hitam. Anda dapat menggunakan media TSI (mengandung zat besi) atau mempersiapkan agar nutrisi dengan timbal asetat (1g Pb asetat sampai 100 ml agar nutrisi).

PROSEDUR dan Membaca hasil: PROSEDUR dan Membaca hasil Dr.TVRao MD 16 Panen koloni baik terisolasi dan menyuntik tabung TSI dengan menusuk medium. Menetaskan pada 37 C, 24 jam. Reaksi positif jika warna hitam muncul. Bakteri tumbuh di TSI mendegradasi asam amino membentuk sulfida besi yang blackens media

Hidrogen sulfida produksi: Produksi hidrogen sulfida Dr.TVRao MD 17 e-H2S produksi: Tergantung pada H2S produksi dari protein atau polipeptida Deteksi dengan menggunakan strip kertas filter yang mengandung H2S produksi timbal asetat. Produksi H2S, baik melalui katabolisme sistein atau pengurangan tiosulfat, menghasilkan endapan hitam di media.

Nitrat Medium - Nitrate Test pengurangan: Nitrat Medium - Nitrate Test pengurangan ini adalah media diferensial. Hal ini digunakan untuk menentukan apakah suatu organisme mampu mengurangi nitrat (NO3-) menjadi nitrit (NO2-) atau senyawa nitrogen lainnya melalui aksi dari enzim nitratase (juga disebut reduktase nitrat). Tes ini penting dalam identifikasi kedua jenis Gram-positif dan Gram-negatif. 18 Dr.TVRao MD

Nitrat pengurangan Uji: Nitrat pengurangan Uji Setelah inkubasi, tabung ini yang pertama diperiksa untuk kehadiran gas dalam tabung Durham. Dalam kasus fermentor non, ini adalah indikasi pengurangan nitrat menjadi gas nitrogen. Namun, dalam banyak kasus gas yang dihasilkan oleh fermentasi dan pengujian lebih lanjut diperlukan untuk menentukan apakah pengurangan nitrat telah terjadi. 19 Dr.TVRao MD

Nitrat pengurangan Uji: Nitrate Test Pengurangan pengurangan nitrat menjadi nitrit terdeteksi dengan dimetil-anaphthylamin (Wallace & Neave, 1927) dan asam Sulphanilic. Reaksi cepat terasa dengan semua spesies yang diuji, setelah 30 menit. hasilnya konsisten dengan metode budaya biasa 20 Dr.TVRao MD

IM Vi C Pengujian: IM Vi C Tes IM Vi C adalah singkatan yang berdiri untuk indole, metil merah, Voges-Proskauer, dan sitrat. Untuk mendapatkan hasil dari empat tes, tiga tabung reaksi yang diinokulasi: Trypton broth (indole test), metil merah - Voges Proskauer kaldu (MR-VP kaldu), dan uji sitrat. 21 Dr.TVRao MD

Indole Uji: Indole Uji Cara Lakukan Uji: kaldu Trypton menyuntik dengan inokulasi loop. Properti itu tes untuk: Tes ini dilakukan untuk membantu membedakan spesies dari Enterobacteriaceae keluarga. Ini tes untuk kemampuan spesies bakteri 'untuk menghasilkan indole. Bakteri menggunakan enzim, tryptophanase untuk memecah asam amino, triptofan, yang membuat oleh-produk, yang, indol adalah satu. Media dan Reagen Digunakan: kaldu Trypton mengandung tryptophan. Kovac yang reagen-mengandung asam klorida, dimetilaminobenzaldehida, dan amil alkohol berwarna kuning. Membaca Hasil: reagen Kovac bereaksi dengan indole dan menciptakan warna merah di bagian atas tabung reaksi. 22 Dr.TVRao MD

Prinsip Uji Indole: Prinsip Uji Indole Organisme uji diinokulasi ke Trypton kaldu, sumber yang kaya asam amino triptofan. Bakteri positif indole seperti Escherichia coli menghasilkan tryptophanase, enzim yang memotong triptofan, memproduksi produk indole dan lainnya. Ketika reagen Kovac (p-dimetilamino benzaldehida) ditambahkan ke kaldu dengan indole di dalamnya, warna merah muda gelap berkembang. Uji indole harus dibaca oleh 48 jam inkubasi karena indole dapat lebih berkurang jika inkubasi berkepanjangan terjadi. PH asam yang diproduksi oleh Escherichia coli membatasi pertumbuhannya. 23 Dr.TVRao MD

Indole Uji: Indole Uji Indole merupakan produk pemecahan asam amino lain, tryptophan oleh TRYPTOPHANASE enzim. Untuk menguji reagen Kovacs indole ditambahkan ke pertumbuhan menengah SIM berikut. Jika indole adalah menyajikan bentuk cincin merah di sekitar permukaan medium. 24 Dr.TVRao MD

Trypton Broth setelah penambahan Kovacs (+) Uji Indole di sebelah kiri --- (-) Uji Indole di sebelah kanan: Trypton Broth setelah penambahan Kovacs (+) Indole uji pada kiri --- (-) Uji Indole pada MD Dr.TVRao benar 25

Indole reaksi uji: Indole uji reaksi 26 Dr.TVRao MD

Metil Merah / Voges Proskauer (MR / VP): Metil Merah / Voges Proskauer (MR / VP) Cara Melakukan Pengujian: menyuntik 2 kaldu glukosa dengan inokulasi loop. Setelah 48 jam inkubasi, tambahkan beberapa tetes MR untuk satu tabung, dan reagen VP ke tabung lain. Properti yang mereka menguji: Kedua tes digunakan untuk membantu membedakan spesies dari keluarga Enterobacteriaceae. MR-tes untuk produk akhir asam dari fermentasi glukosa. VP-tes untuk produksi acetoin dari fermentasi glukosa. Media dan Reagen Digunakan: Glukosa Broth Methyl indikator merah untuk asam Proskauer Voges reagen-A: 5% AlphaNaphthol, & etanol, B: Kalium Hidroksida Air, & Deionized. 27 Dr.TVRao MD

Metil merah (MR) dan Voges-Proskauer (VP) tes: Metil merah (MR) dan Voges-Proskauer (VP) tes merah metil (MR) dan Voges-Proskauer (VP) tes dibaca dari tabung diinokulasi tunggal MR-VP kaldu. Setelah 24-48 jam inkubasi kaldu MR-VP dibagi menjadi dua tabung. Satu tabung digunakan untuk uji MR, yang lain digunakan untuk uji VP. MR-VP media yang berisi glukosa dan pepton. Semua Enterics mengoksidasi glukosa untuk energi, namun produk akhir bervariasi tergantung pada enzim bakteri. Baik MR dan tes VP digunakan untuk menentukan apa produk akhir terjadi ketika organisme uji degradasi glukosa. 28 Dr.TVRao MD

MR / VP melanjutkan: MR / VP melanjutkan Hasil Membaca: MR-hasil + merah (menunjukkan pH di bawah 6) dan - hasilnya adalah kuning (menunjukkan tidak ada produksi asam) VP-A hasil + merah setelah VP reagen ditambahkan (menunjukkan adanya acetoin ) dan - hasilnya ada perubahan warna. Metil Merah: kiri - + dan kanan - 29 Dr.TVRao MD

Metil Merah: Metil Merah Tes ini digunakan untuk menentukan jalur fermentasi digunakan untuk memanfaatkan glukosa. Dalam jalur fermentasi asam campuran, fermentasi glukosa dan menghasilkan asam organik beberapa (laktat, asetat, asam suksinat, dan format). Produksi stabil asam cukup untuk mengatasi buffer fosfat akan menghasilkan pH di bawah 4,4. Jika indikator pH (metil red) ditambahkan ke alikuot dari kaldu budaya dan pH di bawah 4,4, warna merah akan muncul (gambar pertama, tabung di sebelah kiri). 30 Dr.TVRao MD

Methyl Red Uji: Metil Uji Merah Jika indikator pH (metil red) ditambahkan ke alikuot dari kaldu budaya dan pH di bawah 4,4, warna merah akan muncul (gambar pertama, tabung di sebelah kiri). Jika MR berubah menjadi kuning, pH di atas 6,0 dan jalur asam campuran fermentasi belum digunakan (gambar pertama, tabung di sebelah kanan). 31 Dr.TVRao MD

Metilen biru pengurangan: Metilen biru pengurangan metilen biru Standar dalam konsentrasi dari 0,1 dan 0,01 yo dicampur, dengan suspensi dan disegel. Bacaan yang dibuat setelah 4 dan 24 jam. pada 37 "32 Dr.TVRao. MD

Voges-Proskauer (VP) test: Voges-Proskauer (VP) Tes reagen yang digunakan untuk uji VP adalah milik Barritt A (alpha-napthol) dan s Barritt B (kalium hidroksida). Ketika reagen ditambahkan ke kaldu yang carbinol metil asetil hadir, mereka mengubah warna pink-merah anggur (tes VP positif). Warna ini mungkin memakan waktu 20 sampai 30 menit untuk berkembang. E. coli tidak menghasilkan metil karbinol asetil, tetapi Enterobacter dan Klebsiella lakukan. 33 Dr.TVRao MD

Uji sitrat: Uji sitrat Cara Lakukan Uji: miring menyuntik dengan inokulasi loop. Properti itu tes untuk: Tes ini digunakan untuk membantu membedakan spesies dari Enterobacteriaceae keluarga. Hal ini selektif untuk bakteri yang memiliki kemampuan untuk mengkonsumsi sitrat sebagai sumber karbon sendiri dan amonium sebagai sumber nitrogen tunggal. Media dan Reagen Digunakan: Agar Sitrat Simmon mengandung natrium sitrat (sumber karbon), ion amonium (sumber nitrogen), & pH indikatorbromthymol biru. Membaca Hasil: Hasil + berwarna biru (artinya bakteri dimetabolisme sitrat dan menghasilkan produk akhir asam) dan - hasil tetap hijau 34 Dr.TVRao MD

Simmon yang sitrat agar: Agar sitrat Simmon yang tanpa inokulasi agar sitrat Simmon memiliki pH 6,9, sehingga adalah warna hijau menengah. Pertumbuhan bakteri di media mengarah ke pengembangan warna biru Prusia (sitrat positif). Enterobacter dan Klebsiella yang sitrat positif sementara E.coli adalah negatif. 35 Dr.TVRao MD

Uji sitrat: Uji sitrat Kiri dan kanan positif negatif. 36 Dr.TVRao MD

Urea Hidrolisis: Urea Hidrolisis Cara Lakukan Uji: kaldu Urea menyuntik dengan inokulasi loop. Properti itu tes untuk: Tes ini dilakukan untuk menentukan kemampuan bakteri untuk menghidrolisis urea untuk membuat amonia dengan menggunakan urease enzim. Media dan Reagen Digunakan: kaldu Urea mengandung ekstrak ragi, fosfat monopotassium, disodium fosfat, urea, dan indikator merah fenol. Membaca Hasil: kaldu Urea adalah warna kuning-oranye. Urease enzim akan digunakan untuk menghidrolisis urea untuk membuat amonia. Jika amonia dibuat, kaldu berubah warna pink cerah, dan positif. Jika tes negatif, kaldu tidak memiliki perubahan warna dan amonia tidak dilakukan. 37 Dr.TVRao MD

Urease test: Urease test test ini digunakan untuk mengidentifikasi bakteri yang mampu hidrolisis urea menggunakan urease enzim. Hal ini biasanya digunakan untuk membedakan Proteus genus dari bakteri enterik lainnya. Hidrolisis urea membentuk dasar amonia, lemah, sebagai salah satu produknya. Ini basa lemah meningkatkan pH dari media di atas 8,4 dan indikator pH, fenol merah, berubah dari kuning ke pin 38 MD Dr.TVRao

Uji urease: Urease Urea Uji dipecah oleh enzim urease menjadi karbon dioksida dan amonia. Amonia mengubah alkali menengah, yaitu menimbulkan pH di atas 7,0. Dalam tes ini bakteri yang diinokulasi ke dalam kaldu urea yang mengandung indikator pH (merah fenol) yang berubah dari kuning ke merah / merah muda dengan meningkatnya pH (Atlas pg. 79). Setelah 24 sampai 48 jam dari inkubasi tabung diamati untuk perubahan warna menunjukkan pencernaan urea. 39 Dr.TVRao MD

Urease test: Urease test test ini digunakan untuk mengidentifikasi bakteri yang mampu hidrolisis urea menggunakan urease enzim. Hal ini biasanya digunakan untuk membedakan Proteus genus dari bakteri enterik lainnya. Hidrolisis urea membentuk dasar amonia, lemah, sebagai salah satu produknya. Ini basa lemah meningkatkan pH dari media di atas 8,4 dan indikator pH, fenol merah, berubah dari kuning menjadi merah muda 40 Dr.TVRao MD

Glukosa Fermentasi & Produksi Gas: Glukosa Fermentasi Produksi Gas & Cara Melakukan Uji: kaldu menyuntik dengan inokulasi loop. Properti itu tes untuk: Tes ini dilakukan untuk membantu spesies differnetiate dari Enterobacteriaceae keluarga. Ini tes untuk kemampuan bakteri untuk fermentasi glukosa dan menghasilkan gas dan / atau asam produk akhir .. Media dan Reagen Digunakan: kaldu Glukosa mengandung ekstrak daging sapi, pepton gelatin, dan glukosa. Sebuah indikator merah fenol ditambahkan untuk menunjukkan suatu enproduct asam. Sebuah tabung Durham ditambahkan untuk menunjukkan produksi gas. Hasil Hasil positif untuk asam kuning setelah indikator ditambahkan (menunjukkan fermentasi glukosa) Sebuah hasil positif untuk gas adalah gelembung dalam tabung Durham. Sebuah hasil yang sama sekali negatif tidak memiliki perubahan warna atau warna kemerahan dan gelembung tidak. 41 Dr.TVRao MD

Glukosa kaldu dengan tabung Durham: Glukosa kaldu dengan tabung Durham Ini adalah media diferensial. Ini tes kemampuan organisme untuk memfermentasi gula glukosa serta kemampuannya untuk mengubah produk akhir glikolisis, asam piruvat ke produk sampingan gas. Ini adalah tes yang umum digunakan ketika mencoba untuk mengidentifikasi bakteri Gram-negatif enterik, yang semuanya fermentor glukosa tetapi hanya beberapa yang menghasilkan gas. 42 Dr.TVRao MD

TubesLeft Fermentasi Karbohidrat adalah (+) - Tengah yang ditunjukkan oleh (+) dengan gas - Right adalah (-) test: TubesLeft Fermentasi Karbohidrat adalah (+) - Tengah yang ditunjukkan oleh (+) dengan gas - Right adalah (-) Uji Dr.TVRao MD 43

Gula Fermentasi Pengujian: Tes Fermentasi gula Tabung 1: Asam Negatif / gas 2A Tabung Negatif: Harus menetaskan lagi (hasil ambigu) Tabung 2B: Positif acid / 3A tabung gas Negatif: Asam Positif / Positive gas 44 Dr.TVRao MD

Slide 45: 45 Dr.TVRao MD

Sukrosa Fermentasi: Sukrosa Fermentasi Cara Lakukan Uji: kaldu sukrosa menyuntik dengan inokulasi loop. Properti itu tes untuk: Tes ini dilakukan untuk membantu membedakan spesies dari Enterobacteriaceae keluarga. Ini tes untuk kemampuan bakteri untuk fermentasi sukrosa dan produksi asam produk akhir Media dan Reagen Digunakan: kaldu Sukrosa mengandung ekstrak daging sapi, pepton gelatin, dan sukrosa. Indikator merah fenol ditambahkan untuk menunjukkan asam produk akhir. Hasil Sebuah hasil positif adalah indikator kuning setelah ditambahkan (menunjukkan fermentasi sukrosa) Sebuah hasil negatif tidak memiliki perubahan warna atau kemerahan. 46 Dr.TVRao MD

Fermentasi laktosa: Fermentasi laktosa Cara Lakukan Uji: kaldu laktosa menyuntik dengan inokulasi loop. Properti itu tes untuk: Ini tes untuk kemampuan bakteri memfermentasi laktosa. Media dan Reagen Digunakan: kaldu laktosa mengandung ekstrak daging sapi, gelatin pepton, dan laktosa. Sebuah indikator merah fenol ditambahkan untuk menunjukkan produksi asam dari fermentasi. Hasil Sebuah hasil positif adalah indikator kuning setelah ditambahkan (menunjukkan fermentasi laktosa) Sebuah hasil negatif tidak akan memiliki perubahan warna atau akan redish. 47 Dr.TVRao MD

Laktosa fermentor dan fermentor Non: Laktosa fermentor dan Non fermentor 48 Dr.TVRao MD

Motilitas Pengujian: Motilitas Pengujian agar Motilitas adalah media diferensial digunakan untuk menentukan apakah suatu organisme dilengkapi dengan flagella dan dengan demikian mampu berenang jauh dari tanda tusukan. Hasil agar motilitas seringkali sulit untuk menafsirkan. Umumnya, jika tabung seluruh

keruh, hal ini menunjukkan bahwa bakteri sudah pindah dari tanda tusukan (yang motil). Organisme dalam dua tabung digambarkan di sebelah kanan adalah motil 49 Dr.TVRao MD

Uji koagulase: Uji koagulase Cara Lakukan Uji: menyuntik plasma kelinci dengan satu koloni tunggal. Break up koloni dan aduk sampai rata dalam plasma. Menetaskan pada 37 derajat C selama 24 jam. Properti itu tes untuk: Ini tes untuk kemampuan bakteri untuk plasma darah gumpalan menggunakan enzim koagulase. Jika organisme memiliki koagulase itu akan rumpun plasma kelinci. Media dan Reagen: Media ini mengandung plasma kelinci dilarutkan dalam buffer. 50 Dr.TVRao MD

Koagulase menguji: Koagulase uji koagulase adalah enzim yang membekukan plasma darah dengan menjadi katalis bagi konversi protein terlarut (fibrinogen) ke protein larut (fibrin). Tes ini dilakukan pada Gram-positif, katalase positif spesies untuk mengidentifikasi Staphylococcus aureus koagulase positif. Koagulase merupakan faktor virulensi S. aureus. Pembentukan gumpalan sekitar infeksi yang disebabkan oleh bakteri ini mungkin melindungi dari fagositosis. 51 Dr.TVRao MD

Koagulase Hasil: Koagulase Hasil Hasil Membaca: Jika organisme yang memiliki koagulase itu akan rumpun plasma. Jika organisme tidak memiliki koagulase itu tidak akan rumpun plasma. 52 Dr.TVRao MD

Gula tiga Iron Agar: Tiga Gula Bakteri Agar Besi yang memfermentasi salah satu dari tiga gula dalam medium akan menghasilkan produk sampingan ini sampingan biasanya asam, yang akan mengubah warna dye pHsensitif merah (red fenol) ke warna kuning. Posisi perubahan warna membedakan produksi asam terkait dengan fermentasi glukosa dari produk sampingan asam dari laktosa atau fermentasi sukrosa. Banyak bakteri yang dapat memfermentasi gula di pantat anaerobik dari tabung yang enterobacteria. 53 Dr.TVRao MD

TSI miring: TSI miring kemiringan TSI adalah tabung reaksi yang berisi agar-agar, pewarna pH-sensitif (merah fenol), laktosa 1%, sukrosa 1%, glukosa 0,1%, serta natrium tiosulfat dan besi sulfat atau ammonium sulfat besi. 54 Dr.TVRao MD

TSI - Reaksi: TSI - Reaksi Beberapa bakteri menggunakan anion tiosulfat sebagai akseptor elektron terminal, mengurangi ke sulfida. Jika hal ini terjadi, yang baru terbentuk hidrogen sulfida (H2S) bereaksi

dengan besi sulfat dalam medium untuk membentuk sulfida besi, yang terlihat sebagai endapan hitam. Contoh sulfida yang memproduksi bakteri Salmonella termasuk, Proteus, Citrobacter dan spesies Edwardsiella. The menghitam medium hampir selalu diamati di pantat (bawah) medium. 55 Dr.TVRao MD

TSI - Reaksi: TSI - Reaksi Semua laktosa fermentor menghasilkan miring kuning / pantat kuning (asam / acid reaksi), sedangkan non-laktosa fermentor dapat mengakibatkan pink / kuning atau kuning / kuning (jika sukrosa difermentasi). Menghitam pantat karena produksi H2S dapat menutupi reaksi asam (kuning) di pantat .. 56 Dr.TVRao MD

Membaca hasil pada TSI memungkinkan untuk mengidentifikasi patogen beberapa: Membaca hasil pada TSI memungkinkan untuk mengidentifikasi patogen beberapa MD 57 Dr.TVRao

GELATIN PENCAIRAN TES: GELATIN PENCAIRAN UJI Dr.TVRao MD 58 Tujuan dari tes ini adalah untuk menentukan kemampuan suatu organisme untuk menghasilkan proteolitik seperti enzim dan mencairkan gelatin. Tes ini digunakan untuk membedakan antara spesies dalam genera Staphylococcus dan Clostridium serta bantuan dalam identifikasi spesies lain dan genra.

GELATIN PENCAIRAN TES: PENCAIRAN UJI GELATIN Dr.TVRao MD 59 Gelatin adalah besar untuk masuk ke dinding sel bakteri dan enzymesmust sehingga ekstraseluler catabolize mereka ke dalam komponen yang lebih kecil sebelum mereka dapat dimanfaatkan. Kepemilikan ini gelatinases ekstraseluler dapat membantu dalam diferensiasi bakteri

MENAFSIRKAN HASIL TES :: MENAFSIRKAN HASIL TEST: Dr.TVRao MD 60 UJI POSITIF = liquefied.NEGATIVE UJI media = media tetap solid.

CAMP Uji: CAMP Uji Dr.TVRao MD 61 faktor CAMP adalah, diffusible tahan panas protein yang dihasilkan oleh kelompok B streptokokus. Ini adalah tes sinergis antara Staphylococcus aureus dan Streptococcus agalactiae. S. agalactiae menghasilkan faktor CAMP. S. aureus menghasilkan sphingomyelin C, yang mengikat membran sel darah merah. Kedua bakteri tersebut melesat dengan sudut 90o satu sama lain. Mereka tidak menyentuh

http://primanandafauziah.blogspot.com/2011/11/uji-biokimia.html

UJI BIOKIMIA BAKTERI Bakteri, sebagai kelompok, hidup dan tumbuh di bawah kisaran keadaan yang luas. Beberapa species hidup pada deposit-deposit di parit-parit terdalam di samudera, yang lain hidup di tanah arktik, yang lain lagi di sumber air panas. Untuk menelaah bakteri di laboratorium kita harus dapat menumbuhkan mereka dalam biakan murni. Untuk melakukan hal ini, haruslah dimengerti jenisjenis nutrient yang disyaratkan oleh bakteri dan juga macam lingkungan fisik yang menyediakan kondisi optimum bagi pertumbuhannya. Tidak ada satupun perangkat kondisi yang memuaskan bagi kultivasi semua bakteri di laboratorium. Bakteri amat beragam baik dalam persyaratan nutrisi maupun fisiknya. Beberapa bakteri mempunyai persyaratan nutrient yang sederhana sedangkan yang lain mempunnyai persyratan yang rumit. Beberapa species tumbuh pada suhu terendah 0oC, sedangkan yang lain tumbuh pada suhu sampai 75oC. Beberapa membutuhkan oksigen bebas, sedangkan yang lain dihambat oleh oksigen. Karena alasan ini maka kondisi harus disesuaikan sedemikian sehingga menguntungkan bakteri tertentu yang sedang ditelaah. Begitu tersedia kondisi yang baik untuk kultivasi, maka reproduksi dan pertumbuhan bakteri dapat diamati dan diukur, utnuk menentukan pengaruh berbagai kondisi baik terhadap reproduksi maupun pertumbuhan bakteri tersebut dan untuk menentukan perubahan-perubahan apa saja yang dihasilkan oleh bakteri di dalam lingkungan tumbuhnya.

Persyaratan nutrisi Semua bentuk kehidupan, dari mikroorganisme sampai kepada manusia, mempunyai persamaan dalam hal persyaratan nutrisi tertentu dalam bentuk zat-zat kimiawi yang diperlukan untuk pertumbuhan dan fungsinya yang normal. Pengamatan-pengamatan baerikut ini melukiskan hal tersebut dan juga menampakkan keragaman yang amat besar dalam hal tipe nutrisi yang dijumpai di antara bakteri: Semua organisme hidup membutuhkan sumber energi. Organisme hidup terbagi menjadi fototrof atau kemotrof dan kedua tipe nutrisi ini dijumpai di antara bakteri. Semua organisme hidup membutuhkan karbon; semua membutuhkan sedikitnya sejumlah kecil karbondioksida, tetapi kebanyakan di antaranya juga membutuhkan beberapa senyawa karbon organik, seperti gula-gulaan dan karbohidrat lain.

Semua organisme hidup membutuhkan nitrogen. Bakteri sangat beragam dalam hal ini; beberapa tipe menggunakan nitrogen atmosferik, beberapa tumbuh pada senyawa nitrogen anorganik, dan yang lain membutuhkan nitrogen dalam bentuk senyawa nitrogen organic.

Semua organisme hidup membutuhkan belerang (sulfur) dan fosfor.

Semua organisme hidup membutuhkan beberapa unsur logam, natrium, kalium, kalsium, magnesium, mangan, besi, seng, tembaga dan kobalt untuk pertumbuhnannya yang normal. Walaupun dalam jumlah yang sedikit. Semua organisme hidup membutuhkan vitamin (senyawa organic khusus yang penting untuk pertumbuhan) dan senyawa seperti vitamin yang berfungsi membentuk substansi yang mengaktivasi enzim substansi yang menyebabkan perubahan kimiawi. Semua organisme hidup membutuhkan air untuk fungsi-fungsi metabolic dan pertumbuhannya. Untuk bakteri, semua nutrient harus ada dalam bentuk larutan sebelum dapat memasuki bakteri tersebut. (Pelczar,1986)

Kondisi fisik yang dibutuhkan untuk pertumbuhan Bakteri tidak hanya amat bervariasi dalam persyaratan nutrisinya, tetapi juga menunjukan respons yang berbeda-beda terhadap kondisi fisik di alam lingkungannya. Untuk berhasilnya kultivasi berbagai tipe bakteri, dibutuhkan suatu kombinasi nutrient serta lingkungan fisik yang sesuai. 1. Suhu 2. Atmosfer gas 3. pH (Pelczar,1986).

Mikroorganisme tidak mempunyai varietas dan ciri-ciri anatomi, tidak seperti halnya pada tumbuhan atau hewan yang mudah dipelajari dalam taksonomi. Masalah yang paling mendasar di dalam bakteriologi adalah penyembuhan, pembersihan, dan identifikasi dari kultur bakteri.

Identifikasi bakteri didasarkan pada varietas dari karakteristik yang dimiliki oleh bakteri tersebut, tidak hanya dari morfologi tetapi juga karakteristik kultur mikroorganisme, fisiologi, dan patogenitas (Seeley & VanDemark, 1971). Bakteri dapat diidentifikasi dengan mengetahui reaksi biokimia dari bakteri tersebut. Dengan menanamkan bakteri pada medium, maka akan diketahui sifat-sifat suatu koloni bakteri. Sifat-sifat suatu koloni tersebut ialah sifat-sifat yang ada sangkut pautnya dengan bentuk, susunan, permukaan, pengkilatan, dan sebagainya (Dwidjoseputro, D. 1981.) Identifikasi bakteri dapat diketahui dengan menanamkan sampel bakteri dalam media seperti media gula-gula dan penanaman dalam IMViC. Uji IMViC ini merupakan singkatan dari uji Indol, Metil Red, Voges Proskauer, dan Citrate.

Media gula-gula Media gula-gula ini merupakan media yang dapat digunakan dalam mengidentifikasi bakteri.

Indikator yang digunakan adalah merah fenol, untuk mengetahui terjadinya pembentukan asam atau tidak sebagai hasil penguraian gula pada medium. Di dalam media gula-gula ini digunakan tabung Durham untuk mengetahui ada tidaknya pembentukan gas sebagai hasil penguraian gula dalam medium. Media gula-gula ini terdiri dari glukosa, laktosa, manosa, maltosa, dan saccharosa. 1. Uji Indol Bakteri yang tergolong dalam grup fekal dapat memecah asam amino triptofan dan menghasilkan suatu senyawa berbau busuk yang disebut indol. Bakteri yang telah ditumbuhkan dalam medium yang mengandung triptofan, kemudian diberi 3-5 tetes pereaksi Kovacs yang mengandung amil alkohol atau diberi kristal asam oksalat. Adanya indol akan menyebabkan amil alkohol berubah warnanya menjadi merah tua atau warna kristal asam oksalat menjadi merah muda. Uji yang menggunakan penunjuk amil alkohol disebut metode Kovacs, sedangkan yang menggunakan penunjuk asam oksalat disebut metode Gnezda. 2. Uji Metil Red Test ini adalah untuk mengetahui adanya pembentukan asam dengan pH di bawah 4. Metil Red adalah suatu indicator yang akan menunjukan warna merah bila pH ada di bawah 4. Hasil test positif ditandai dengan terbentuknya warna merah, sedangkan warna kuning menunjukan hasil negative.

Pada uji ini sebelumnya ditambahkan reagen MR (0,4% dalam alcohol 96%) kedalamnya untuk dapat mengetahui reaksi warna. 3. Uji Voges Proskauer Pada reaksi ini akan diselidiki apakah bakteri yang akan diuji dapat membentuk Acethyl Methyl Carbinol atau tidak. Untuk melihat hasil positif maka ke dalam medium yang telah ditanami ditambahkan KOH kemudian dipanaskan sebentar. Dalam hal ini akan terbentuk diacethil. Diacetyl ini dengan sisa-sisa guanidine akan membentuk warna merah kecoklatan yang berupa cincin dipermukaan tabung sebagai VP (+), bila tidak terjadi apa-apa ditulis VP (-). 4. Uji Sitrat Dengan manggunakan medium citrate menurut Simmon, merupakan medium padat yang terdiri dari mono ammonium fosfat, Na citrate, NaCl, air , agar-agar, dan indicator Bromtymol blue. Pada uji ini medium yang tadinya berwarna hijau kebiruan, bila bereaksi positif maka akan berubah menjadi berwarna biru terang. Bila rekasi negative, maka akan tetap berwarna hijau kebiruaan. Berikut merupakan tabel medium yang digunakan pada uji IMViC dan reaksi yang terjadi.

Uji

Medium Tryptone Broth

Produk akhir

Reaksi positif Warna merah pada penambahan pereaksi Kovacs

Indol

atau Indol-Nitrite Proteose Broth

Indol Warna merah muda pada kertas asam oksalat

Metil Red

(MR-VP) atau 1% Glukosa Pepton Broth

Asam organik

Warna merah muda pada penambahan indikator metil red

Warna merah tua pada Voges Proskauer Seperti uji merah metil Koser Citrate Medium Asetil metil karbinol penambahan 5% alfa naftol dan 40% KOH Timbulnya kekeruhan

(Dwijoseputro, 1989)

Selain dari reaksi biokimia, bakteri juga dapat diidentifikasi dengan mengamati pergerakannya atau motilitasnya. Motilitas bakteri ini dibagi dalam empat kelompok yaitu, aerob (organisme yang membutuhkan oksigen), anaerob (tumbuh tanpa oksigen molekular), anaerob fakultatif (tumbuh pada keadaan aerob dan anaerob), dan mikroaerofil tumbuh terbaik bila ada sedikit oksigen atmosfer). Motilitas bakteri ini dapat diamati dengan menumbuhkan bakteri pada semi solid agar (Pelczar, 1986). Daftar Pustaka Buchana, R.E.,dan N.E Gibbons (eds): BergeysManual of Detertminative Bacteriology,8th. Wilias & Wilkins: Baltimore

Dwidjoseputro, D. 1981. Dasar-dasar Mikrobiologi. Djambatan: Jakarta.

Pelczar, M. J., dan E. C. S. Chan. 1986. Dasar-dasar Mikrobiologi. Penterjemah Ratna Siri Hadioetomo., et al. Universitas Indonesia: Jakarta.

Seeley, H. W., dan P. J. VanDemark. 1971. Microbes in Action A Laboratory Manual Of Microbiology. W. H. Freeman and Company: San Fransisco