Anda di halaman 1dari 28

MAKALAH KIMIA DASAR II

KONSEP BIOKIMIA ASAM NUKLEAT






DOSEN PEMBIMBING :
AFRIDA, S.Si., M.Si.

OLEH:
KELOMPOK 10
AHMAD JAWADI
ICE LELY TORITO S.
ILHAM GHAZALI
KHATARINA MELDAWATI
SITI FATIMAH JUFRI
YULIANA SIRAIT
VIVI PUTRI

PROGRAM STUDI PENDIDIKAN KIMIA
FAKULTAS KEGURUAN DAN ILMU PENDIDIKAN
UNIVERSITAS JAMBI
2011/2012


KATA PENGANTAR
Puji syukur penulis panjatkan ke hadirat Allah Subhanahu Wataala karena berkat rahmat,
petunjuk dan hidayah-Nyalah penulis dapat dan menyusun menyelesaikan makalah ini tepat
pada waktunya. Makalah ini berjudul KONSEP BIOKIMIA- ASAM NUKLEAT. Pokok
bahasan di dalam makalah ini menguraikan struktur molekul dan komponen asam nukleat,
termasuk macam-macam ikatan kimia yang menghubungkan komponen-komponen tersebut.
Makalah ini disusun bertujuan sebagai salah satu tugas mata kuliah Kimia Dasar II di semester
ini.
Dalam proses penyelesaian makalah ini, penulis banyak menemukan hambatan dan
tantangan, namun akhirnya dapat diatasi atas dorongan dan bimbingan dari semua pihak. Dalam
kesempatan ini penulis mengucapkan terima kasih kepada Dosen mata kuliah Kimia Dasar II
Afrida , S.Si., M.Si. yang memberikan kesempatan kepada penulis sehingga dapat menyusun
makalah ini. Penulis juga berterima kasih kepada rekan-rekan yang ikut berperan dalam
menyelesaikan makalah ini.
Penulis menyadari sepenuhnya bahwa dalam penyusunan makalah ini masih banyak
terdapat kekurangan yang jauh dari kesempurnaan, oleh karena itu penulis mengharapkan kritik
dan saran yang membangun dari pembaca demi kesempurnaan makalah ini. Akhirnya penulis
berharap semoga makalah ini bermanfaat bagi kita semua yang telah membacanya.


Jambi, Juni 2012


Penulis



DAFTAR ISI

KATA PENGANTAR i
DAFTAR ISI ii

BAB I PENDAHULUAN .. 1
1.1. Latar Belakang .. 1
1.2. Rumusan Masalah . 2
1.3. Tujuan Penulisan ... 2
1.4. Metode Penulisan .. 2

BAB II TINJAUAN PUSTAKA . 3
2.1. Asam Nukleat 3
2.2. Nukleotida dan Nukleosida .. 5


BAB III PEMBAHASAN 8
3.1. Struktur Molekul , Kompone-Komponen ,dan Ikatan Kimia
yang Terdapat di dalam Asam Nuklea . 8
3.2 Sifat-sifat Asam Nukleat . 10
3.2.1. Sifat-sifat Fisika-Kimia Asam Nukleat ... 10
3.2.2. Sifat-sifat Spektroskopik-Termal Asam Nukleat 12
3.3. Jenis-jenis Asam Nukleat .. 13
3.3.1. Struktur DNA dan RNA . 13
3.3.2. Sintesis RNA dan DNA .. 16
3.4 Fungsi Asam Nukleat .. 20
BAB IV PENUTUP ... 22
4.1. KESIMPULAN 22
4.2. SARAN 23






















BAB I
PENDAHULUAN

1. 1. Lat ar Bel akang
Asam nukleat merupakan suatu polinukleotida, yaitu polimer linier yang tersusun
darimonomer-monomer nukleotida yang berikatan melalui ikatan fosfodiester. Fungsi
utamaasam nukleat adalah sebagai tempat penyimpanan dan pemindahan informasi
genetik.Informasi ini diteruskan dari sel induk ke sel anak melalui proses replikasi. Sel memiliki
dua jenis asam nukleat yaitu asam deoksiribonukleat (deoxyribonucleic acid /DNA) dan asam
ribonukleat.
DNA ditemukan pada tahun 1869 oleh seorang dokter muda Friedrich Miescher yang
mempercayai bahwa rahasia kehidupan dapat diungkapkan melalui penelitian kimia pada sel-
sel.Sel yang dipilih oleh Friedrich adalah sel yang terdapat pada nanah untuk dipelajarinya dan ia
mendapatkan sel-sel tersebut dari bekas pembalut luka yang diperolehnya dari dari
ruang bedah.Sel-sel tersebut dilarutkannya dalam asam encer dan dengan cara ini diperoleh nya
intisel yang masih terikat pada sejumlah protein.Kemudian dengan menambahkan enzim
pemecah protein ia dapat memperoleh inti sel saja dan dengan cara dan dengan cara ekstraksi terhadap inti sel
ini ia memperoleh suatu zat yang larut dalam basa tetapi tidak larut dalam asam.Pada waktu itu
ia belum menentukan rumus kimia untuk untuk zat tersebut,sehingga ia menamakannya nuclein.
Sebenarnya apa yang ia peroleh dari ekstrak inti sel tersebut adalah campuran senyawa-
senyawa yang mengandung 30% DNA.Asam nukleat terdapat dalam semua sel dan memiliki peranan
yang sangat pentingdalam biosintesis protein.Baik DNA maupun RNA berupa anion dan pada
umumnya terikat pada protein yang mempunyai sifat basa,misalnya DNA dalam inti sel terikat
padahiston.Senyawa gabungan antara asam nukleat dengan protein ini disebut
nukleoprotein.Molekul asam nukleat merupakan suatu polimer seperti protein,tetapi yang
menjadi monomer bukan asam amino ,melainkan nukleotida.
Asam nukleat juga merupakan makromolekul biokimia yang kompleks, berbobot molekul
tinggi, dan tersusun atas rantai nukleotida yang mengandung informasi genetik.Asamnukleat
merupakan biopolimer,dan monomer penyusunnya adalah nukleotida.Setiap nukleotida terdiri dari
tiga komponen, yaitu sebuah basa nitrogen heterosiklik (purin atau pirimidin), sebuah
gulapentosa, dan sebuah gugus fosfat.Jenis asam nukleat dibedakan oleh jenis gula yang terdapat
pada rantai asam nukleat tersebut (misalnya, DNA atau asamdeoksiribonukleat mengandung 2-
deoksiribosa). Selain itu, basa nitrogen yang ditemukan pada kedua jenis asam nukleat tersebut
memiliki perbedaan:adenina, sitosina,dan guanina dapat ditemukan pada RNA maupun DNA,
sedangkan timin dapat ditemukan hanya pada DNA dan urasil dapat ditemukan hanya pada RNA.
1.2.Rumusan Masalah
1. Bagaimana struktur molekul dan komponen-komponen asam nukleat, termasuk macam-
macam ikatan kimia yang terdapat di dalamnya?
2. Apa sifat-sifat asam nukleat?
3. Apa saja jenis asam nukleat?
4. Apu fungsi asam nukleat?
1.3. Tujuan
1. Mengerti struktur molekul dan komponen-komponen asam nukleat, termasuk macam-
macam ikatan kimia yang terdapat di dalamnya.
2. Mengetahui sifat-sifat asam nukleat.
3. Mengetahui jenis- jenis asam nukleat.
4. Memahami fungsi asm nukleat.
1.4. Manfaat
Penulis berharap agar makalah ini dapat bermanfaat dalam kehidupan sehari-hari bagi
semua pembaca. Manfaat dari mempelajari makalah ini akan diperoleh gambaran mengenai
perubahan struktur yang terjadi pada asam nukleat yang dimanipulasi, dan juga mekanisme
manipulasi asam nukleat yang pada dasarnya berkaitan dengan sifat-sifat fisika-kimianya dan
dapat bermanfaat bagi kita dalam menambah ilmu pengetahuan dan wawasan
1.5. Metode Penulisan
Dalam penulisan makalah ini,penulis menggunakan metode pustaka. Metode pustaka
yaitu metode yang dilakukan dengan mempelajari dan mengumpulkan data dari pustaka yang
berhubungan dengan materi dari judul yang berkaitan, baik berupa buku maupun informasi di
internet.
BAB II
TINJAUAN PUSTAKA

2.1. Asam Nukleat
Asam Nukleat merupakan pengemban kode geneticdalam sistem kehidupan. Karena
informasi yang terkandungdalam asam-asam nukleat itu, suatu organismemampumembiosintesis
tipe protein yang berlainan (rambut,kulit, otot, enzim dan sebagainya) dan memproduksi
lebihbanyak organisme dari jenisnya sendiri. Asam nukleat merupakan suatu polimer yang terdiri
dari banyak molekul nukleotida (Syahona,2011).
Ada dua macam asam nukleat, yaitu DNA danRNA. DNA terutama dijumpai dalam inti
sel, asam inimerupakan pengemban kode geneticdan dapat mereproduksiatau mereplikasi dirinya
dengan tujuan membentuk sel-sel baru untuk reproduksi organisme itu, dalam sebagian
besarorganisme, DNA suatu sel mengarahkan sintesis molekul RNA. Satu tipe RNA yakni RNA
pesuruh (mRNA) meninggalkaninti sel dan mengarahkan biosintesis dari berbagai tipeprotein
dalam organisme itu sesuai dengan kode DNAnya.Asam nukleat juga merupakan makromolekul
pertamayang berhasil diisolasi dari dalam inti sel. Asam nukleat berbentuk rantai linier yang
merupakan gabungan monomernukleotida sebagai unit pembangunnya (Syahona,2011).
Asam Nukleat juga merupakan senyawa majemuk yang dibuat dari banyak nukleotida.
Bila nukleotida mengandung ribose, maka asam nukleat yang terjadi adalah RNA (Ribnucleic
acid = asam ribonukleat) yang berguna dalam sintesis protein. Bila nukleotida mengandung
deoksiribosa, maka asam nukleat yang terjadi adalah DNA (Deoxyribonucleic acid = asam
deoksiribonukleat) yang merupakan bahan utama pementukan inti sel. Dalam asam nukleat
terdapat 4 basa nitrogen yang berbeda yaitu 2 purin dan 2 primidin. Baik dalm RNA maupun
DNA purin selalu adenine dan guanine. Dalam RNA primidin selalu sitosin dan urasil, dalam
DNA primidin selalu sitosin dan timin (Yuliamto dkk,2011).
Asam-asam nukleat terdapat pada jaringan tubuh sebagai nukleoprotein, yaitu gabungan
antara asam nukleat dengan protein. Untuk memperoleh asam nukleat dari jaringan-jaringan
tersebut, dapat dilakukan ekstraksi terhadap nukleoprotein terlebih dahulu menggunakan larutan
garam IM. Setelah nukleoprotein terlarut, dapat diuraikan atau dipecah menjadi protein-protein
dan asam nukleat dengan menambah asam-asam lemah atau alkali secara hati-hati, atau dengan
menambah NaCl hingga jenuh akan mengendapkan protein (Yuliamto dkk,2011)..
Cara lain untuk memisahkan asam nukleat dari protein ialah menggunakan enzim
pemecah protein, misal tripsin. Ekstraksi terhadap jaringan-jaringan dengan asam triklorasetat,
dapat pula memisahkan asam nukleat. Denaturasi protein dalam campuran dengan asam nukleat
itu dapat pula menyebabkan terjadinya denaturasi asam nukleat itu sendiri. Oleh karena asam
nukleat itumengandung pentosa, makabila dipanasi dengan asam sulfat akan terbentuk furfural.
Furfural ini akan memberikan warna merah dengan anilina asetat atau warna kuning dengan p-
bromfenilhidrazina. Apabila dipanasi dengan difenilamina dalam suasana asam, DNA akan
memberikan warna biru. Pada dasarnya reaksi-reaksi warna untuk ribosa dan deoksiribosa dapat
digunakan untuk keperluan identifikasi asam nukleat (Yuliamto dkk,2011).
Cara lain untuk memisahkan asam nukleat dari protein adalah menggunakan enzim
pemecah protein, misalnya tripsin.
.














(Syahona,2011).
2.2. Nukleotida dan Nukleosida
Asam nukleat merupakan polimer besar dengan ukuran yang bervariasi antara 25.000
/1.000.000 s/d 1milyar. Asam nukleat baik DNA maupun RNA tersusun dari monomer
nukleotida . Nukleotida tersusun dari gugus fosfat, basa nitrogen dan gula pentosa. Basa nitrogen
berasal dari kolompok purin dan pirimidin.Purin utama asam nukleat adalah adenin dan guanin,
sedangkan pirimidinnya adalah sitosin, timin danurasil. Nukleotida merupakan nukleosida yang
gugus gula pada posisi 5-nya mengikat asam fosfat (gugus fosfat) dengan ikatan ester.
Nukleosida terdiri atas pentosa( deoksiribosa atau ribosa) yang mengikat suatu basa (derivat
purin atau pirimidin) melalui ikatan glikosida.Pentosa yang berasal dari DNA ialah deoksiribosa
dandari RNA ialah ribosa. Basa purin dan pirimidin yangberasal dari DNA ialah adenin, guanin,
sitosin dan timin.Sedangkan basa RNA terdiriatas adenin, guanin, sitosin danurasil
(Syahona,2011).
Dengan demikian nukleosida adalah penyusun nukleotida dan dapat diberi nama
trivial.Nukleotida terdiri dari purin atau primidin yaitu senyawa basa yang mengandung N, gula
pentose (ribosaatau deoksiribosa), dan fosfat. Kebanyakan nukleotida merupakan bahan
pembentuk asam nukleat. ADP(adenosine difosfat) dan ATP (adenosine trifosfat) adalah
modifikasi nukleotida tertentu yang penting dalam mobilisasi energy dalam sel. ATP dibuat dari
ADP melalui penambahan gugus fosfat yang berenergi tinggi.Nukleotida dalam spiral ganda
molekul asam nukleat terikat di antara dua basa tersebut tetapi ikatan itu hanya di antara adenine
dan timin (pada DNA) atau di antara adenine dan urasil (pada RNA) dan di antara guanine dan
sitosin (Syahona,2011).
Molekul nukleotida terdiri atas nukleosida yang mengikat asam fosfat. Molekul
nukleosida terdiri atas pentosa ( deoksiribosa atau ribose ) yang mengikat suatu basa (purin atau
pirimidin). Jadi apabila suatu nukleoprotein dihidrolisis sempurna akan dihasilkan protein, asam
fosfat, pentosa dan basa purin atau pirimidin. Rumus berikut ini akan memperjelas hasil
hidrolisis suatu nucleoprotein (Yuliamto dkk,2011).








Pentosa yang berasal dari DNA ialah deoksiribosa dan yang berasal dari RNA ialah
ribose. Adapun basa purin dan basa pirimidin yang berasal dari DNA ialah adenin,sitosin dan
timin. Dari RNA akan diperoleh adenin, guanin, sitosin dan urasil (Yuliamto dkk,2011).






Urasil terdapat dalam dua bentuk yaitu bentuk keto atau laktam dan bentuk enol atau
laktim.





Pada PH cairan tubuh, terutama urasil terdapat dalam entuk keto. Nukleosida terbentuk
dari basapurin atau pirimidin dengan ribose atau deoksiribosa. Basa purin atau pirimidin terikat
padapentosa oleh ikatan glikosidik, yaitu pada atom karbon nomor 1. Guanosin adalah suatu
nukleosida yang terbentuk dari guanin dengan ribosa. Pada pengikatan glikosidik ini sebuah
molekul air yang dihasilkan terjadi dari atom hidrogen pada atom N-9 dari basa purin dengan
gugus OH pada atom C-1 dari pentosa. Untuk basa pirimidin,gugus OH pada atom C-1
berikatandengan atom H pada atom N-1 (Yuliamto dkk,2011).






Pada umumnya nukleosida diberi nama sesuai dengan nama basa purin atau basa
pirimidin yang membentuknya. Beberapa nukleosida berikut ini ialah yang membentuk dari basa
purin atau dari basa pirimidin dengan ribosa ;
Adenin nukleosida atau Adenosin
Guanin nukleosida atau Guanosin
Urasil nukleosida atau Uridin
Timin nukleosida atau Timidin
Sitosin nukleosida atau Sitidin
(Yuliamto dkk,2011).


BAB III
PEMBAHASAN
3.1. Struktur Molekul , Kompone-Komponen ,dan Ikatan Kimia yang Terdapat di dalam
Asam Nukleat.
Asam nukleat merupakan salah satu makromolekul yang memegang peranan sangat
penting dalam kehidupan organisme karena di dalamnya tersimpan informasi genetik. Asam
nukleat sering dinamakan juga polinukleotida karena tersusun dari sejumlah molekul nukleotida
sebagai monomernya. Tiap nukleotida mempunyai struktur yang terdiri atas gugus fosfat, gula
pentosa, dan basa nitrogen atau basa nukleotida (basa N).
Ada dua macam asam nukleat, yaitu asam deoksiribonukleat atau deoxyribonucleic acid
(DNA) dan asam ribonukleat atau ribonucleic acid (RNA). Dilihat dari strukturnya, perbedaan di
antara kedua macam asam nukleat ini terutama terletak pada komponen gula pentosanya. Pada
RNA gula pentosanya adalah ribosa, sedangkan pada DNA gula pentosanya mengalami
kehilangan satu atom O pada posisi C nomor 2 sehingga dinamakan gula 2-deoksiribosa .
Perbedaan struktur lainnya antara DNA dan RNA adalah pada basa N-nya. Basa N, baik
pada DNA maupun pada RNA, mempunyai struktur berupa cincin aromatik heterosiklik
(mengandung C dan N) dan dapat dikelompokkan menjadi dua golongan, yaitu purin dan
pirimidin. Basa purin mempunyai dua buah cincin (bisiklik), sedangkan basa pirimidin hanya
mempunyai satu cincin (monosiklik). Pada DNA, dan juga RNA, purin terdiri atas adenin (A)
dan guanin (G). Akan tetapi, untuk pirimidin ada perbedaan antara DNA dan RNA. Kalau pada
DNA basa pirimidin terdiri atas sitosin (C) dan timin (T), pada RNA tidak ada timin dan sebagai
gantinya terdapat urasil (U). Timin berbeda dengan urasil hanya karena adanya gugus metil pada
posisi nomor 5 sehingga timin dapat juga dikatakan sebagai 5-metilurasil.













Gambar : komponen-komponen asam nukleat
(a.gugus fosfat , b.gula pentosa ,dan c. basa N)

Di antara ketiga komponen monomer asam nukleat tersebut di atas, hanya basa N-lah yang
memungkinkan terjadinya variasi. Pada kenyataannya memang urutan (sekuens) basa N pada suatu
molekul asam nukleat merupakan penentu bagi spesifisitasnya. Dengan perkataan lain, identifikasi asam
nukleat dilakukan berdasarkan atas urutan basa N-nya sehingga secara skema kita bisa menggambarkan
suatu molekul asam nukleat hanya dengan menuliskan urutan basanya saja.
Penomoran posisi atom C pada cincin gula dilakukan menggunakan tanda aksen (1, 2, dan
seterusnya), sekedar untuk membedakannya dengan penomoran posisi pada cincin basa. Posisi 1 pada
gula akan berikatan dengan posisi 9 (N-9) pada basa purin atau posisi 1 (N-1) pada basa pirimidin melalui
ikatan glikosidik atau glikosilik
Selain ikatan glikosidik yang menghubungkan gula pentosa dengan basa N, pada asam nukleat
terdapat pula ikatan kovalen melalui gugus fosfatyang menghubungkan antara gugus hidroksil (OH) pada
posisi 5 gula pentosa dan gugus hidroksil pada posisi 3 gula pentosa nukleotida berikutnya. Ikatan ini
dinamakan ikatan fosfodiester karena secara kimiagugus fosfat berada dalam bentuk diester.
Oleh karena ikatan fosfodiester menghubungkan gula pada suatu nukleotida dengan gula pada
nukleotida berikutnya, maka ikatan ini sekaligusmenghubungkan kedua nukleotida yang berurutan
tersebut. Dengan demikian,akan terbentuk suatu rantai polinukleotida yang masing-masing
nukleotidanyasatu sama lain dihubungkan oleh ikatan fosfodiester.
Kecuali yang berbentuk sirkuler, seperti halnya pada kromosom dan plasmid bakteri, rantai
polinukleotida memiliki dua ujung. Salah satuujungnya berupa gugus fosfat yang terikat pada posisi 5
gula pentosa. Olehkarena itu, ujung ini dinamakan ujung P atau ujung 5. Ujung yang lainnya berupa
gugus hidroksil yang terikat pada posisi 3 gula pentosa sehinggaujung ini dinamakan ujung OH atau
ujung 3. Adanya ujung-ujung tersebutmenjadikan rantai polinukleotida linier mempunyai arah tertentu.
Pada pH netral adanya gugus fosfat akan menyebabkan asam nukleat bermuatan negatif. Inilah
alasan pemberian nama asam kepada molekul polinukleotida meskipun di dalamnya juga terdapat
banyak basa N.Kenyataannya, asam nukleat memang merupakan anion asam kuat ataumerupakan polimer
yang sangat bermuatan negatif.
3.2 Sifat-sifat Asam Nukleat
3.2.1.Sifat-sifat Fisika-Kimia Asam Nukleat
Di bawah ini akan dibicarakan sekilas beberapa sifat fisika-kimia asam nukleat. Sifat-
sifat tersebut adalah stabilitas asam nukleat, pengaruh asam, pengaruh alkali, denaturasi kimia,
viskositas, dan kerapatan apung.
Stabilitas asam nukleat
Ketika kita melihat struktur tangga berpilin molekul DNA atau pun struktur sekunder RNA,
sepintas akan nampak bahwa struktur tersebut menjadi stabil akibat adanya ikatan hidrogen di
antara basa-basa yang berpasangan. Padahal, sebenarnya tidaklah demikian. Ikatan hidrogen di
antara pasangan-pasangan basa hanya akan sama kuatnya dengan ikatan hidrogen antara basa
dan molekul air apabila DNA berada dalam bentuk rantai tunggal. Jadi, ikatan hidrogen jelas
tidak berpengaruh terhadap stabilitas struktur asam nukleat, tetapi sekedar menentukan spesifitas
perpasangan basa.
Penentu stabilitas struktur asam nukleat terletak pada interaksi penempatan (stacking
interactions) antara pasangan-pasangan basa. Permukaan basa yang bersifat hidrofobik
menyebabkan molekul-molekul air dikeluarkan dari sela-sela perpasangan basa sehingga
perpasangan tersebut menjadi kuat.
Pengaruh asam
Di dalam asam pekat dan suhu tinggi, misalnya HClO
4
dengan suhu lebih dari 100C, asam
nukleat akan mengalami hidrolisis sempurna menjadi komponen-komponennya. Namun, di
dalam asam mineral yang lebih encer, hanya ikatan glikosidik antara gula dan basa purin saja
yang putus sehingga asam nukleat dikatakan bersifat apurinik.
Pengaruh alkali
Pengaruh alkali terhadap asam nukleat mengakibatkan terjadinya perubahan status tautomerik
basa. Sebagai contoh, peningkatan pH akan menyebabkan perubahan struktur guanin dari bentuk
keto menjadi bentuk enolat karena molekul tersebut kehilangan sebuah proton. Selanjutnya,
perubahan ini akan menyebabkan terputusnya sejumlah ikatan hidrogen sehingga pada akhirnya
rantai ganda DNA mengalami denaturasi. Hal yang sama terjadi pula pada RNA. Bahkan pada
pH netral sekalipun, RNA jauh lebih rentan terhadap hidrolisis bila dibadingkan dengan DNA
karena adanya gugus OH pada atom C nomor 2 di dalam gula ribosanya.
Denaturasi kimia
Sejumlah bahan kimia diketahui dapat menyebabkan denaturasi asam nukleat pada pH netral.
Contoh yang paling dikenal adalah urea (CO(NH
2
)
2
) dan formamid (COHNH
2
). Pada konsentrasi
yang relatif tinggi, senyawa-senyawa tersebut dapat merusak ikatan hidrogen. Artinya, stabilitas
struktur sekunder asam nukleat menjadi berkurang dan rantai ganda mengalami denaturasi.
Viskositas
DNA kromosom dikatakan mempunyai nisbah aksial yang sangat tinggi karena diameternya
hanya sekitar 2 nm, tetapi panjangnya dapat mencapai beberapa sentimeter. Dengan demikian,
DNA tersebut berbentuk tipis memanjang. Selain itu, DNA merupakan molekul yang relatif kaku
sehingga larutan DNA akan mempunyai viskositas yang tinggi. Karena sifatnya itulah molekul
DNA menjadi sangat rentan terhadap fragmentasi fisik. Hal ini menimbulkan masalah tersendiri
ketika kita hendak melakukan isolasi DNA yang utuh.
Kerapatan apung
Analisis dan pemurnian DNA dapat dilakukan sesuai dengan kerapatan apung (bouyant density)-
nya. Di dalam larutan yang mengandung garam pekat dengan berat molekul tinggi, misalnya
sesium klorid (CsCl) 8M, DNA mempunyai kerapatan yang sama dengan larutan tersebut, yakni
sekitar 1,7 g/cm
3
. Jika larutan ini disentrifugasi dengan kecepatan yang sangat tinggi, maka
garam CsCl yang pekat akan bermigrasi ke dasar tabung dengan membentuk gradien
kerapatan. Begitu juga, sampel DNA akan bermigrasi menuju posisi gradien yang sesuai
dengan kerapatannya. Teknik ini dikenal sebagai sentrifugasi seimbang dalam tingkat
kerapatan (equilibrium density gradient centrifugation) atau sentrifugasi isopiknik.
Oleh karena dengan teknik sentrifugasi tersebut pelet RNA akan berada di dasar tabung dan
protein akan mengapung, maka DNA dapat dimurnikan baik dari RNA maupun dari protein.
Selain itu, teknik tersebut juga berguna untuk keperluan analisis DNA karena kerapatan apung
DNA () merupakan fungsi linier bagi kandungan GC-nya. Dalam hal ini, = 1,66 + 0,098%
(G + C).
3.2.2. Sifat-sifat Spektroskopik-Termal Asam Nukleat
Sifat spektroskopik-termal asam nukleat meliputi kemampuan absorpsi sinar UV,
hipokromisitas, penghitungan konsentrasi asam nukleat, penentuan kemurnian DNA, serta
denaturasi termal dan renaturasi asam nukleat. Masing-masing akan dibicarakan sekilas berikut
ini.
Absorpsi UV
Asam nukleat dapat mengabsorpsi sinar UV karena adanya basa nitrogen yang bersifat aromatik;
fosfat dan gula tidak memberikan kontribusi dalam absorpsi UV. Panjang gelombang untuk
absorpsi maksimum baik oleh DNA maupun RNA adalah 260 nm atau dikatakan
maks
= 260
nm. Nilai ini jelas sangat berbeda dengan nilai untuk protein yang mempunyai
maks
= 280 nm.
Sifat-sifat absorpsi asam nukleat dapat digunakan untuk deteksi, kuantifikasi, dan perkiraan
kemurniannya.
Hipokromisitas
Meskipun
maks
untuk DNA dan RNA konstan, ternyata ada perbedaan nilai yang bergantung
kepada lingkungan di sekitar basa berada. Dalam hal ini, absorbansi pada 260 nm (A
260
)
memperlihatkan variasi di antara basa-basa pada kondisi yang berbeda. Nilai tertinggi terlihat
pada nukleotida yang diisolasi, nilai sedang diperoleh pada molekul DNA rantai tunggal
(ssDNA) atau RNA, dan nilai terendah dijumpai pada DNA rantai ganda (dsDNA). Efek ini
disebabkan oleh pengikatan basa di dalam lingkungan hidrofobik. Istilah klasik untuk
menyatakan perbedaan nilai absorbansi tersebut adalah hipokromisitas. Molekul dsDNA
dikatakan relatif hipokromik (kurang berwarna) bila dibandingkan dengan ssDNA. Sebaliknya,
ssDNA dikatakan hiperkromik terhadap dsDNA.
3.3. Jenis-jenis Asam Nukleat
Asam nukleat dalam sel ada dua jenis yaitu DNA (deoxyribonucleic acid ) atau asam
deoksiribonukleat dan RNA (ribonucleic acid ) atau asam ribonukleat. Baik DNA maupun RNA
berupa anion dan pada umumnya terikat oleh protein dan bersifat basa. Misalnya DNA dalam
inti sel terikat pada histon. Senyawa gabungan antara protein danasam nukleat disebut
nucleoprotein. Molekul asam nukleat merupakan polimer sepertiprotein tetapi unit penyusunnya
adalah nukleotida. Salah satu contoh nukleutida asam nukleat bebas adalah ATP yang berfungsi
sebagai pembawa energy.

3.3.1. Struktur DNA dan RNA
Asam nukleat biasanya tersusun atas DNA dan RNA yang terdiri dari monomer nukleotida,
dimana nukleotida ini biasanya tersusun atas gugus fosfat, basa nitrogen,dan gula pentosa serta
kelompok basa purin dan piridin seperti: adenine, guanine, sitosin, timin dan danurasil.
A. DNA (deoxyribonucleic acid)
Asam deoksiribonukleotida yang terikat satu sama lain sehingga membentuk rantai
polinukleotida yang panjang. Molekul DNA yang panjang ini terbentuk oleh ini adalah polimer
yang terdiri atas molekul-molekul ikatan antara atom C nomor 3 dengan atom C nomor 5 pada
molekul deoksiribosa dengan perantaraan gugus fosfat. Secara kimia DNA mengandung
karakteri/sifat sebagai berikut:
1. Memiliki gugus gula deoksiribosa.
2. Basa nitrogennya guanin (G), sitosin (C), timin (T) dan adenin (A).
3. Memiliki rantai heliks ganda anti parallel
4. Kandungan basa nitrogen antara kedua rantai sama banyak dan berpasangan spesifik satu
dengan lain. Guanin selalu berpasangan dengan sitosin (GC), dan adenidan adenin berpasangan
dengan timin (A - T), sehingga jumlah guanin selalu sama dengan jumlah sitosin. Demikian pula
adenin dan timin.








B. RNA (Ribonukleat acid)
Asam ribonukleat adalah salah satu polimer yang terdiri atas molekul- molekul
ribonukleotida. Seperti DNA, asam ribonukleat ini terbentuk oleh adanya ikatan antara atom C
nomer 3 dengan atom C nomer 5 pada molekul ribose dengan perantaraan gugus fosfat. Dibawah
ini adalah gambar struktur sebagian dari molekul RNA :






Meskipun banyak persamaannta dengan DNA , RNA mempunyai beberapa perbedaan dengan
DNA yaitu :
1. Bagian pentosa RNA adalah ribosa, sedangkan bagian pentosa DNA adalah deoksiribosa.
2. Bentuk molekul DNA adalah heliks ganda. Bentuk molekul RNA bukan heliks ganda, tetapi
berupa rantai tunggal yang terlipat sehingga menyerupai rantai ganda.
3. RNA mengandung basa Adenin, Guanin dan Sitosin seperti DNA , tetapi tidak mengandung
Timin. Sebagai gantinya, RNA mengandung Urasil. Dengan demikian bagian basa pirimidin
RNA berbeda dengan bagian basa pirimidin
4. Jumlah Guanin adalah molekul RNA tidak perlu sama dengan Sitosin, demikian pula jumlah
adenin tidak harus sama dengan Urasil.

Ada 3 macam RNA, yaitu tRNA (transfer RNA), mRNA (messenger RNA) dan rRNA
(ribosomal RNA). Ketiga macam RNA ini mempunyai fungsi yang berbeda-beda,tetapi
ketiganya secara bersama-sama mempunyai peranan penting dalam sintesis


3.3.2. Sintesis RNA dan DNA
A.Sintesis DNA
Sintesis DNA disini dimaksud adalah replikasi DNA yaitu proses perbanyakan bahan genetic.
Pengkopian rangkaian molekul bahan genetik( DNA atau RNA) sehingga dihasilkan molekul
anakan yang sangat identik.
Model replikasi DNA secara semikonservatif menunjukkan bahwa DNA anakan terdiri atas
pasangan untaian DNA induk dan untaian DNA hasil sintesis baru.





Model ini memberikan gambaran bahwa untaian DNA induk berperanan sebagai cetakan
(template) bagi pembentukan untaian DNA baru. Model ini memberikan gambaran bahwa
untaian DNA induk berperanan sebagai cetakan (template) bagi pembentukan untaian DNA baru.






Komponen utama Replikasi, adalah sebagai berikut :
1. DNA cetakan, yaitu molekul DNA atau RNA yang akan direplikasi.
2. Molekul Deoksiribonukleotida yaitu dATP,dTTP, dCTP, dan dGTp.
Deoksiribonukleotida terdiri atas tiga komponen yaitu: (i) basa purin atau pirimidin,
(ii) gula 5-karbon( deoksiribosa) dan (iii) gugus fosfat.
3. Enzim DNA polimerase, yaitu enzim utama yang mengkatalisi proses polimerisasi nukleotida
menjadi untaian DNA.
4. Enzim primase, yaitu enzim yang mengkatalisis sintesis primer untuk memulai replikasi DNA.
5. Enzim pembuka ikatan untaian DNA induk, yaitu enzim helikase dan enzim lain yang
membantu proses tersebut yaitu enzim girase.
6. Molekul protein yang menstabilkan untaian DNA yang sudah terbuka,yaitu protein SSB
(single strand binding protein).
7. Enzim DNA ligase, yaitu suatu enzim yang berfungsi untuk menyambung fragmen-fragmen
DNA.
Meknisme dasar replikasi, adalah sebagai berikut :
1. Denaturasi (pemisahan) untaian DNA induk,
2. Peng-"awal"-an( initiation, inisiasi) sintesis DNA.
3. Pemanjangan untaian DNA,
4. Ligasi fragmen-fragmen DNA, dan
5. Peng-"akhir"-an (termination, terminasi) sintesis DNA.

Sintesis untaian DNA yang baru akan dimulai segera setelah kedua untaian DNA induk
terpisah membentuk garpu replikasi Pemisahan kedua untaian DNA induk dilakukan oleh enzim
DNA helikase. Sintesis DNA berlangsung dengan orientasi 5'-P 3'-OH. Oleh karena ada dua
untaian DNA cetakan yang orientasinya berlawanan, maka sintesis kedua untaian DNA baru juga
berlangsung dengan arah geometris yang berlawanan namun semuanya tetap dengan orientasi 5'
3'.


Sintesis untaian DNA baru yang searah dengan pembukaan garpu replikasi dapat
berlangsung tanpa terputus (sintesis secara kontinu). Untaian DNA yang disintesis secara kontinu
semacam ini disebut sebagai untaian DNA awal (leading strand). Sintesis untaian DNA baru
yang searah dengan pembukaan garpu replikasi dapat berlangsung tanpa terputus (sintesis secara
kontinu). Untaian DNA yang disintesis secara kontinu semacam ini disebut sebagai untaian DNA
awal (leading strand).

Pada untaian DNA awal, polimerisasi DNA berlangsung secara kontinu sehingga
molekul DNA baru yang disintesis merupakan satu unit. Pada untaian DNA awal, polimerisasi
DNA berlangsung secara kontinu sehingga molekul DNA baru yang disintesis merupakan satu
unit. Fragmen-fragmen DNA pendek yang disintesis tersebut disebut fragmen Okazaki, karena
fenomena sintesis DNA secara diskontinun tersebut pertama kali iungkapkan oleh Reiji Okazaki
pada tahun 1968.
B.Sintesis RNA
Sintesis RNA biasanya dikatalisis oleh enzim DNA-RNA polimerase-menggunakan sebagai
template, sebuah proses yang dikenal sebagai transkripsi. Inisiasi transkripsi dimulai dengan
pengikatan enzim ke urutan promotor dalam DNA (biasanya ditemukan "upstream" dari gen).
DNA helix ganda dibatalkan oleh aktivitas helikase enzim. Enzim kemudian berlanjut sepanjang
untai template dalam arah 3 'to 5', mensintesiskan molekul RNA komplementer dengan elongasi
terjadi di 5 'ke 3' arah. Urutan DNA juga menentukan dimana berakhirnya sintesis RNA akan
terjadi. RNA sering dimodifikasi oleh enzim setelah transkripsi. Misalnya, poli dan topi 5
'ditambahkan ke mRNA eukariotik intron pra-dan dikeluarkan oleh spliceosome.
Ada juga sejumlah polimerase RNA RNA-tergantung yang menggunakan RNA sebagai template
mereka untuk sintesis untai baru RNA. Sebagai contoh, sejumlah virus RNA (seperti virus polio)
menggunakan jenis enzim untuk mereplikasi materi genetic mereka. Juga, RNA-dependent RNA
polimerase merupakan bagian dari jalur interferensi RNA di banyak organisme.
Transkripsi merupakan sintesis RNA dari salah satu rantai DNA, yaitu rantai cetakan atau sense,
sedangkan rantai komplemennya disebut rantai antisense.Rentangan DNA yang ditranskripsi
menjadi molekul RNA disebut unit transkripsi.Informasi dari DNA untuk sintesis protein dibawa
oleh mRNA. RNA dihasilkan dari aktifitas enzim RNA polimerase. Enzim polimerasi membuka
pilinan kedua rantai DNA hingga terpisah dan merangkaikan nukleotida RNA. Enzim RNA
polymerase merangkai nukleotida-nukleotida RNA dari arah 5ke 3, saat terjadi perpasangan
basa di sepanjang cetakan DNA. Urutan nukleotida spesifik di sepanjang cetakan DNA.Urutan
nukleotida spesifik di sepanjang DNA menandai dimana transkripsi suatu gen dimulai dan
diakhiri.
Transkripsi terdiri dari 3 tahap yaitu: inisiasi (permulaan), elongasi (pemanjangan), terminasi
(pengakhiran) rantai mRNA.


1. Inisiasi
Daerah DNA di mana RNA polimerase melekat dan mengawali transkripsi disebut sebagai
promoter. Suatu promoter menentukan di mana transkripsi dimulai, juga menentukan yang mana
dari kedua untai heliks DNA yang digunakan sebagai cetakan.
2. Elongasi
Saat RNA bergerak di sepanjang DNA, RNA membuka pilinan heliks ganda DNA, sehingga
terbentuklah molekul RNA yang akan lepas dari cetakan DNA-nya.
3. Terminasi
Transkripsi berlangsung sampai RNA polimerase mentranskripsi urutan DNA yang disebut
terminator. Terminator yang ditranskripsi merupakan suatu urutan RNA yang berfungsi sebagai
sinyal terminasi yang sesungguhnya. Pada sel prokariotik, transkripsi biasanya berhenti tepat
pada akhir sinyal terminasi yaitu, polimerase mencapai titik terminasi sambil melepas RNA dan
DNA.Sebaliknya, pada sel eukariotik polimerase terus melewati sinyal terminasi,suatu urutan
AAUAAA di dalam mRNA. Pada titik yang lebih jauh kira-kira 10 hingga 35 nukleotida, mRNA
ini dipotong hingga terlepas dari enzim tersebut.

3.4 Fungsi Asam Nukleat
DNA mengandung gen, informasi yang mengatur sintesis protein dan RNA. DNA
mengandung bagian-bagian yang menentukan pengaturan ekspresi gen (promoter, operator, dll.).
Ribosomal RNA (rRNA) merupakan komponen dari ribosom, mesin biologis pembuat protein
Messenger RNAs (mRNA) merupakan bahan pembawa informasi genetik dari gen ke ribosom.
Transfer RNAs (tRNAs) merupakan bahan yang menterjemahkan informasi dalam mRNA
menjadi urutan asam amino RNAs memiliki fungsi-fungsi yang lain, di antaranya fungsi-fungsi
katalis.
Asam nukleat merupakan molekul raksasa yang memiliki fungsi khusus yaitu,
menyimpan informasi genetik dan menerunkannya kepada keturunanya. Susunan asam nukleat
yang menentukan apakah mahluk itu menjadi hewan , tumbuhan, maupun manusia. Begitu pula
susunan dalam sel, apakah sel itu menjadi sel otot maupun sel darah.
Beberapa fungsi penting asam nukleat adalah menyimpan, menstransmisi, dan
mentranslasi informasi genetik; metabolisme antara(intermediary metabolism) dan reaksi-reaksi
informasi energi; koenzim pembawa energi; koenzim pemindah asam asetat, zat gula, senyawa
amino dan biomolekul lainnya; koenzim reaksi oksidasi reduksi.















BAB IV
PENUTUP

4.1.KESIMPULAN
Asam nukleat merupakan salah satu makromolekul yang memegang peranan sangat
penting dalam kehidupan organisme karena di dalamnyatersimpan informasi genetik. Asam
nukleat sering dinamakan juga polinukleotida karena tersusun dari sejumlah molekul nukleotida
sebagaimonomernya. Tiap nukleotida mempunyai struktur yang terdiri atas gugusfosfat, gula
pentosa, dan basa nitrogen atau basa nukleotida (basa N).
Ada dua macam asam nukleat, yaitu asam deoksiribonukleat atau deoxyribonucleic
acid (DNA) dan asam ribonukleat atau ribonucleic acid (RNA). Dilihat dari strukturnya,
perbedaan di antara kedua macam asamnukleat ini terutama terletak pada komponen gula
pentosanya. Pada RNA gula pentosanya adalah ribosa, sedangkan pada DNA gula pentosanya
mengalamikehilangan satu atom O pada posisi C nomor 2 sehingga dinamakan gula 2-
deoksiribosa
Ada beberapa sifat fisika-kimia asam nukleat adalah stabilitas asam nukleat, pengaruh
asam, pengaruh alkali, denaturasi kimia, viskositas, dan kerapatan apung.Sifat spektroskopik-
termal asam nukleat meliputi kemampuan absorpsi sinar UV, hipokromisitas, penghitungan
konsentrasi asam nukleat, penentuan kemurnian DNA, serta denaturasi termal dan renaturasi
asam nukleat.
Asam nukleat merupakan molekul raksasa yang memiliki fungsi khusus yaitu,
menyimpan informasi genetik dan menerunkannya kepada keturunanya. Beberapa fungsi penting
asam nukleat adalah menyimpan, menstransmisi, dan mentranslasi informasi genetik;
metabolisme antara(intermediary metabolism) dan reaksi-reaksi informasi energi; koenzim
pembawa energi; koenzim pemindah asam asetat, zat gula, senyawa amino dan biomolekul
lainnya; koenzim reaksi oksidasi reduksi.

4.2.Saran
Dengan adanya makalah ini penulis harapkan para pembaca dapat mengetahui lebih
banyak lagi tentang Asam Nukleat guna menambah wawasan untuk pembelajaran.



























DAFTAR PUSTAKA
Syahona,Putri Abdian. 2011. ASAM NUKLEAT DAN NUKLEOTIDA .SUMEDANG :
FAKULTAS PETERNAKAN UNIVERSITAS PADJADJARAN
Yulianto, Rahmawan dkk. 2011. ASAM NUKLEAT (NUCLEIC ACID). MALANG :
AGROEKOTEKNOLOGI FAKULTAS PERTANIAN UNIVERSITAS BRAWIJAYA
Utama, Rio Fabian . 2011. Struktur & Fungsi Asam Nukleat. MALANG : FAKULTAS
PETERNAKAN UNIVERSITAS BRAWIJAYA.

http://ml.scribd.com/doc/71030332/pendauluan-isi
http://ml.scribd.com/musrinsalila/d/25523953-ASAM-NUKLEAT
http://www.scribd.com/doc/40163437/BAB-I-ASAM-NUKLEAT
http://biomol.wordpress.com/bahan-ajar/asam-nukleat/
https://docs.google.com/viewer?a=v&q=cache:2FnXeEOsBvYJ:blog.ub.ac.id/sonianeh/files/201
1/12/MAKALAH-BIOKIMIA-ASAM-NUKLEAT.