Nama Kelompok :

DANI FITRAH HAYATI

(08121006011)
MELVIA PERMATASARI
(08121006013)
RIZKY SINTYA
(08121006057)
HASTI RIZKY WAHYUNI
(08121006069)
MUTIARA BELLA
(08121006073)

HUBUNGAN
STRUKTUR
PROTEIN DENGAN
FUNGSI

Catatan-Catatan Penting
1.PROTEIN YANG MENGIKAT OKSIGEN
2. MIOGLOBIN
Hemoglobin dan mioglobin adalah dua
adalah protein pertama yang memiliki
protein yang mengikat oksigen, yang
struktur tiga dimensi yang ditentukan
terdapat dalam organisme multisel
dengan X-ray cristallography
dan
besar .
Hemoglobin mengangkut
merupakan protein globular terdiri dari
oksigen dalam darah dan terletak di
rantai polipeptida tunggal dan heme.
eritrosit,
sedangkan
mioglobin
menyimpan oksigen dalam otot .
4. PENGIKATAN OKSIGEN KE HEME
3. HEMOGLOBIN
memiliki struktur kuaterner, yang
terdiri dari empat rantai
polipeptida : dua rantai alfa dan
dua rantai beta , masing-masing
dengan kelompok prostetik heme
. Meskipun keduanya memiliki
sedikit kesamaan dalam urutan
utamanya, polipeptida
hemoglobin memiliki struktur tiga
dimensi hampir identik dengan
rantai polipeptida dari mioglobin

Kelompok prostetik heme terdiri dari

protoporfirin cincin IX dan atom Fe2+ sentral
yang membentuk empat ikatan dengan
cincin porfirin . di samping itu, di satu sisi
dari cincin porfirin Fe2+ membentuk ikatan
dengan histidin proksimal (His F8) , sebuah
residu delapan asam amino sepanjang F helix hemoglobin . Ikatan keenam dari Fe2+
adalah molekul O2 . Dekat dengan tempat
O2 mengikat residu histidin lain, histidin
distal (His E7) , yang mencegah karbon
monoksida mengikat paling efisien .

Catatan-Catatan Penting
5. ALOSTERIK
Hemoglobin merupakan suatu protein
alosterik, yang mengikat O2 secara
koperatif, pengikatan O2 ke salah satu
subunit
meningkatkan
kemudahan
mengikat molekul O2 lebih lanjut untuk
subunit lainnya .
Kurva disosiasi oksigen hemoglobin
adalah sigmoidal sedangkan untuk
mioglobin adalah hiperbolik.

7. EFEK BOHR
H, CO2, dan 2,3-bisphosphoglycerate
adalah efektor alosterik, yang
mempromosikan pelepasan O2 dari
hemoglobin .
H dan CO2 terikat ke berbagai bagian
rantai polipeptida, sementara 2,3bisphosphoglycerate terikat pada bagian
tengah antara empat subunit .

6. MEKANISME PERUBAHAN ALOSTERIK

Oksihemoglobin memiliki struktur kuaterner
yang berbeda dari deoxyhemoglobin.
O2 yang mengikat Fe2+ mendistorsi
kelompok heme dan memindahkan histidin
proksimal. Sehingga mengubah gerak F-Helix
dan mengubah interaksi antara empat sub
unit.

8. HEMOGLOBINOPATHIES
adalah penyakit yang disebabkan
oleh hemoglobin yang abnormal,
yang ditransmisikan secara
genetik, contohnya penyakit
hemolitik anemia sel sabit

1. Protein-Protein yang mengikat oksigen

Hemoglobin adalah satu dari dua protein yang mengikat oksigen
dan ditemukan pada vertebrata. Hemoglobin yang merupakan
molekul protein pada sel darah merah berfungsi sebagai media
transport oksigen dari paru - paru ke jaringan lain didalam tubuh,
dan mensuplai O2 ke sel untuk proses fosforilisasi oksdatif.
Hemoglobin berada didalam eritrosit pada darah. Sel eritrosit ini
pada dasarnya berperan sebagai kantung untuk membawa
hemoglobin, karena eritrosit dewasa tidak memiliki organel
internal seperti nukleus, mitokondria dan lain-lain.
Protein yang mengikat O2 lainnya adalah mioglobin. Mioglobin
menyimpan oksigen sebagai cadangan untukmenghadapi
kekurangan oksigen. Mioglobin dengan konsentrasi yang tinggi
dapat ditemukan pada otot rangka dan otot jantung yang
memerlukan O2 dalam jumlah besar karena mereka
membutuhkan sejumlah besar energi selama kontraksi.

2. Mioglobin

Mioglobin adalah protein yang relatif kecil dengan massa 17,8 kDa
dan mempunya dua komponen molekuler yaitu suatu rantai
polipeptida tunggal yang mengandung 153 residu asam amino dan
suatu gugusan heme yang merupakan biomelekul yang mengandung
zat besi.
Heme dari mioglobin dikenal sebagai gugusan prostetik karena
merupakan suatu molekul organic nonprotein yang berkaitan erat
dengan struktur polipeptida.
Mioglobin protein pertama yang memiliki struktur tiga dimensi yang
ditentukan oleh kristalografi sinar-X oleh John Kendrew pada tahun
1957.
Mioglobin merupakan suatu protein globular yang memiliki struktur
yang sangat kompak dan tersusun dalam delapan regio heliks-,
dimana sebagian besar residu polar terletak dipermukaan dan residu
nonpolar terletak di bagian dalam molekul.

3. Hemoglobin

Pada 1959 Max perutz berhasil menentukan struktur tiga

dimensi dari hemoglobin dengan menggunakan X-ray
kristalografi.
Hemoglobin terdiri dari 4 ikatan polipeptida, yang masingmasing memiliki struktur tiga dimensi yang sangat mirip
dengan rantai polipeptida tunggal dalam mioglobin meskipun
urutan asam amino mereka berbeda.
Hemoglobin orang dewasa (HbA) terdiri dari dua rantai
polipeptida yang berbeda, yakni : rantai- yang terdiri dari 141
residue asam amino dan rantai- yang terdiri dari 146 residu.
masing-masing rantai, mirip seperti mioglobin, terdiri dari
delapan heliks dan masing-masing berisi kelompok prostetik
heme. Heme terletak dalam suatu celah nonpolar dekat
permukaan molekul.

(a) Struktur mioglobin dengan rantai polipeptida tunggal

(b) Struktur dari hemoglobin dengan 4 ikatan polipeptida, yaitu ; 2 rantai-
dan 2 rantai-

4. Pengikatan Oksigen Di Heme

Kelompok prostetik heme di myoglobin
dan hemoglobin terdiri dari struktur
cincin protoporfirin IX dengan atom
besi dalam keadaan besi teroksidasi
(Fe2+). Fe2+ ini terikat dengan empat
atom nitrogen di tengah cincin
protoporfirin dan membentuk dua
ikatan tambahan di kedua lokasi
bidang cincin protoporfirin. Salah
satunya adalah residu histidin yang
terletak diantara delapan residu helix F
dari
hemoglobin,
yaitu
histidin
proksimal (His F8).

HEME

Salah satu atom oksigen terikat pada ikatan keenam dalam

molekul O2. Di dekat tempat O2 terikat dengan heme adalah
residu histidin lain, yaitu histidin distal (His E7) yang memiliki
dua fungsi yang sangat penting :
1. Mencegah kelompok heme berdekatan dengan molekul
hemoglobin agar tidak kontak satu sama lain dan oksidasi
kedudukan Fe3+ di mana mereka tidak bisa lagi mengikat O2.
2.

Mencegah karbon monoksida (CO) terikat dengan

konfigurasi yang paling aktif dari Fe2+, sehingga dapat
menurunkan afinitas heme. ini penting karena setelah CO
terikat ireversibel dengan heme, protein tidak bisa lagi
mengikat O2.

Dengan kata lain, meskipun pengikatan oksigen dalam

hemoglobin dan myoglobin adalah hanya bagian kecil dari
seluruh protein, rantai polipeptida memodulasi fungsi kelompok
prostetik heme.

 Fe2+

Pengikatan Oksigen di Heme.

dari cincin protoporpirin terikat ke His F8 tapi tidak ke His E7 yang
berada didekatnya.

5. Alosterik

Hemoglobin adalah protein alosterik. ini berarti bahwa pengikatan O 2

ke salah satu subunit dipengaruhi oleh interaksinya dengan subunit
lainnya. Adanya pengikatan O2 ke salah satu subunit hemoglobin
akan menginduksi perubahan konformasi yang disampaikan ke
subunit lain, yang membuatnya lebih mampu mengikat O 2 dengan
cara menaikkan afinitas dari molekul tersebut sehingga mengikat O 2
dengan hemoglobin dikatakan kooperatif. Sebaliknya, pengikatan O2
ke unit polipeptida tunggal dari myoglobin adalah nonkooperatif.
ini jelas terlihat dari kurva disosiasi oksigen untuk dua protein: bahwa
untuk hemoglobin adalah sigmoidal, mencerminkan ini mengikat
kooperatif, sedangkan untuk mioglobin adalah hiperbolik. dari kurva
disosiasi O2 juga dapat dilihat bahwa untuk setiap tekanan oksigen
tertentu derajat kejenuhan mioglobin lebih tinggi dari hemoglobin.
artinya bahwa dalam kapiler darah di otot, misalnya, hemoglobin akan
melepaskan O2 ke myoglobin untuk disimpan disana

Kurva disosiasi oksigen Hemoglobin dan Mioglobin

6. Mekanisme Perubahan Alosterik

Hasil kristalografi x-ray menunjukkan bahwa oxyhemoglobin

memiliki 4 molekul O2 yang saling terikat, berbeda dengan
struktur kuartener deoxyhemoglobin yang tidak terikat dengan
O2.
Dengan tidak adanya O2 terikat, Fe2+ berada hanya di salah
satu sisi cincin porfirin. Dengan molekul O2 yang terikat pada
heme akan menarik Fe2+ ke dalam bidang cincin porfirin.
Gerakan Fe2+ menyebabkan histidin proksimal juga
bergerak. Hal ini akan menggeser posisi helix F dan wilayah
dari rantai polipeptida di kedua ujung heliks. Dengan demikian,
gerakan di tengah subunit ditransmisikan ke permukaan, di
mana hal itu menyebabkan interaksi ionik dari empat subunit
secara bersama-sama dan reformasi dalam posisi yang
berbeda, sehingga mengubah struktur kuaternernya.

7. Efek Bohr
Apa itu Efek Bohr ??

Pengaruh konsentrasi ion H+ pada afinitas Hb untuk Oksigen.

Bila konsentrasi ion H+ meningkat, afinitas Hb untuk O2
menurun, menyebabkan pelepasan O2 ke jaringan.
Pengikatan O2 dengan hemoglobin dipengaruhi oleh
konsentrasi ion H+ dan CO2 di jaringan sekitarnya
Pada metabolisme jaringan yang aktif, seperti otot, konsentrasi
ion H+ dan CO2 yang relatif tinggi
Ion H+ cenderung menggantikan O2 dari HbO2 untuk
membentuk DeoxyHb
Peningkatan CO2 juga menyebabkan peningkatan ion H+
karena aksi enzim Karbonat anhidrase, yang mengkatalisis
reaksi:

Bagaimana CO2 diangkut dalam darah?

1. Pada Jaringan :
CO2 yang dihasilkan selama metabolisme
RBC adalah tempat pembentukan H+ dan
ion
HCO3- dalam darah oleh aksi
Karbonat anhidrase.
Ion H+ dalam RBC yang terdeoksigenasi
Hb (HHB) terbentuk ketika OxyHb
menyerahkan O2 ke jaringan.
Pada jaringan, konsentrasi ion H+ dan
CO2 yang relatif tinggi dibanding O2.

2. Pada paru-paru :

PCO2 dalam darah kapiler paru lebih

tinggi dari PCO2 di Alveoli
Rendahnya tingkat PCO2 di Alveoli
dikelola oleh ventilasi.
Pada paru-paru, konsentrasi ion H+
dan CO2 yang relatif rendah dibanding
O2, yang merupakan kebalikan pada
jaringan.

c. Bagaimana 2,3-BPG (2,3Bifosfogliserat) mempengaruhi afinitas

Hb??

2,3-bisphosphoglycerate adalah molekul fosfat organik yang

sangat anionik dalam RBC bersama dengan Hemoglobin.
2,3-BPG mendorong pelepasan O2 dari HbO2 dengan
menurunkan afinitas Hemoglobin.
Satu molekul 2,3-BPG terikat dalam rongga kecil yang terletak
antara -rantai di DeoxyHb sehingga menstabilkan struktur
kuaterner dari DeoxyHb
Agar O2 terikat dengan Hb, dibutuhkan konsentrasi O2 yang
lebih tinggi.
Tekanan O2 dalam paru-paru cukup tinggi di bawah kondisi Hb
yang hampir jenuh, bahkan ketika konsentrasi 2,3-BPG tinggi
Pengikatan 2,3-BPG untuk HbO2 tidak terjadi karena rongga
terlalu kecil dan karena itu tidak dapat menampung 2,3-BPG.

8. Hemoglobinopathies
Perbandingan urutan hemoglobin dari spesies yang berbeda
menunjukkan bahwa hanya sembilan asam amino residu yang tidak
bervariasi . Beberapa residu sesuai pada substitusi konservatif
antara satu residu dengan residu yang lain dengan sifat yang mirip ,
sedangkan residu lain dengan substitusi non konservatif dimana
satu residu asam amino digantikan oleh residu lain dengan sifat
yang berbeda.
SUBSTITUSI adalah Hasil tergantinya satu asam amino
dengan asam amino lainnya yang dapat menyebabkan
perubahan bentuk dan fungsi molekul.
SUBTITUSI
KONSERVATIF
adalah Hasil
dalam
perubahan asam amino. Namun, sifat dari asam amino
tetap (misalnya hidrofobik, hidrofilik, dll) yang sama.
SUBSTITUSI NON KONSERVATIF adalah Hasil dalam
perubahan asam amino yang memiliki sifat yang berbeda
dari jenis liar.

Sebagai contoh :
Penyakit anemia sel sabit yang disebabkan oleh mutasi titik tunggal
(mutasi missense) dalam versi beta-Hb gen yang mengubah
GAG kodon dalam GUG, dan mengganti asam glutamat menjadi
asam amino valin pada posisi 6 dari rantai 5 yang mengakibatkan
perubahan sifat dari hidrofilik ke hidrofobik yang menghasilkan
HbS. Di sudut antara heliks E dan F dari rantai beta , deoksi HbS
adalah sisi yang menempel yang sifatnya hidrofobik. Sehingga sisi
pelengkap pada deoksi molekul HbS dapat mengikat molekul deoksi
lainnya mengakibatkan pembentukan serat panjang molekul Hb
pada eritrosit tersebut. Hal ini terjadi ketika HbS memiliki
konsentrasi deoksigenasi tinggi.
Ini adalah contoh dari mutasi non-konservatif (missense).

Dasar molekuler untuk agregasi molekul deoxyhemoglobin pada

anemia sel sabit

Anemia sel sabit yang ditransmisikan secara genetik merupakan

penyakit hemolitik.
Eritrosit sel sabit :
lebih rapuh daripada eritrosits normal,
lebih mudah lisis
memiliki paruh pendek,
mengarah ke anemia berat.
Anemia sel sabit ditularkan secara genetik dimana homozigot
memiliki dua salinan gen abnormal sedangkan heterozigot memiliki
satu abnormal dan satu salinan normal.

Jadi :
anemia sel sabit adalah penyakit yang
disebabkan oleh substitusi non konservatif
dari glutamat dengan valin , sehingga
tampilannya tidak sesuai dengan
hidrofobik pada permukaan protein . Hal
ini memungkinkan panjang agregat serat
molekul hemoglobin untuk membentuk
dan mendistorsi bentuk sel darah merah .