SOAL-SOAL KUIS DIAGNOSTIK MOLEKULER

1. Perbedaan DNA dan RNA

a. DNA memiliki 4 basa yaitu A G C T, sedangkan
RNA memiliki 4 basa yaitu A G C U
b. Gula pada DNA yaitu 2-Deoxy-D-ribosa, sedangkan
Gula pada RNA yaitu D-ribosa
c. DNA merupakan rantai ganda/double strand
(struktur helix),
RNA merupakan rantai tunggal/single strand
d. Ukuran RNA lebih kecil dari DNA
2. Sebutkan jenis-jenis RNA
a. mRNA (messenger RNA), membawa informasi
genetik dari DNA (di nukleus) menuju ribosom (di
sitoplasma) untuk sintesis protein.
b. rRNA (ribosomal RNA), RNA yang paling banyak,
ditemukan di ribosom (65% ribosom, sisanya
protein), mengenali mRNA
c. tRNA (transfer RNA), RNA terkecil, menerjemahkan
informasi genetik di mRNA dan membawa asam
amino spesifik ke ribosom untuk sintesis protein
(menerjemahkan kode genetik dari mRNA menjadi
asam amino tertentu)
3. Bagaimana cara mengisolasi DNA/RNA ?
Ekstraksi Organik (fenol-kloroform)
Ekstraksi Non-organik (protein K dan salting out)
Metode Adsorbsi (Membran silika gel)
4. Evaluasi terhadap DNA
a. pektrofotometri (kualitatif dan kuantitatif)
dengan mengukur jumlah serapan cahaya oleh
sampel pada panjang gelombang spesifik.
DNA 260 nm
RNA 280 nm
Rasio 1,8 untuk dsDNA (<1,7 mengindikasikan
kontaminasi protein)
 Rasio dari DNA dan RNA >1,8 (murni). Rasio kurang
dari 1,8 mengindikasikan adanya kontaminasi oleh
campuran organik (ex; fenol, alkohol, atau
karbohidrat)
b. Fluorescent dyes (gel elektroforesis)
Menggunakan pewarna, dibandingkan dengan
standar murni (jika standar tidak memiliki pita,
maka hasil pemurnian pun tidak memiliki pita >
dikatakan murni)
Sampel dialirkan melalui agarosa merupakan
metode umum yang digunakan untuk mengecek
degradasi DNA. DNA dengan kualitas yang baik
bermigrasi sebagai pita berbobot molekul tinggi,
dengan sedikit atau tidak ada bukti noda.
5. Perbedaan southern blots, western blots, dan northern
blots
Blotting adalah transfer DNA dari gel ke solid support
(kertas nitroselulosa atau nylon). Ditransfer
menggunakan elektroforesis atau kapiler blot.
Southern blots untuk DNA
Northern blots untuk RNA
Western blots untuk protein
6. Prosedur isolasi
a. Ektraksi dan murnikan DNA dari sel
b. DNA dipotong menggunakan enzim
c. Sortir menggunakan elektroforesis (berdasarkan
ukuran)
d. Denaturasi DNA
e. Ditransfer ke kertas nitroselulosa
f. Block dengan kelebihan DNA
g. Cuci probe yang tidak terikat
h. Autoradiograph