Mikroorganisme

Jamur, Protozoa,
dan Virus
Blok IKGD II – Topik 2
Kelompok A1
Dosen Fasilitator:
Winarti, dr., MM
 Anggota Kelompok A1

Achmad Fauzi (201911001) Aisyah Azka Amila (201911007)

Adillah Najla S. (201911002) Alda Graesela Kauntu (201911008)

Afa Alifia Canopy (201911003) Alifia Rahma Dewi (201911009)

Ahmad Nanda A. (201911005) Alma Tasya Fadillah (201911010)

Ahn Byung Chan (201911006)

Fakultas Kedokteran Gigi

Universitas Prof. Dr. Moestopo (Beragama)
Jamur
Jamur adalah protista nonfotosintetik yang
tumbuh sebagai massa bercabang, filamen
jalinan ("hifa") yang dikenal sebagai miselium.
 Klasifikasi dan Taxonomi
Klasifikasi fungi didasarkan pada mekanisme dan spora yang berasal dari
reproduksi seksual, yang pada sebagian besar keadaan, melibatkan strain
yang dapat berpasangan, menjalani fusi dan meiosis nuklear, dan
pertukaran informasi genetik. Beberapa jamur mengubah strukturnya
berdasarkan habitat aslinya.

Klasifikasi jamur didasarkan pada jenis spora seksual yang mereka hasilkan.
Tercantum adalah contoh divisi dari Kingdom Fungi:
• Zygomycota
• Ascomycota
• Basidiomycota
• Deuteromycota
 Klasifikasi jamur yang memiliki kepentingan medis

• Khamir/yeasts
• Jamur Berserabut
• Jamur Dimorfik

Metode yang digunakan dalam klasifikasi jamur

• Jamur diidentifikasi melalui reaksi biokimia berdasarkan
fermentasi dan asimilasi karbohidrat, pemanfaatan substrat
enzim dan aktivitas metabolisme lainnya
• Jamur dikenali dari warna, tekstur, dan morfologi kolonial
serta mikroskopisnya.
Penamaan dalam taksonomi fungi selalu berubah-ubah seiring dengan
perkembangan dan hasil penelitian terakhir yang berdasarkan sifat morfologi
dan teoriteori biologis. Pengelompokkan taksonomi bermula berdasarkan
pada reproduksi spora, kemudian berdasarkan pada sifat morfologi sifat
vegetatif.

Pada awalnya klasifikasi hanya didasarkan pada sifat morfologinya saja,

tetapi pada zaman modern ini kecuali sifat morfologi, juga diperhatikan
hubungan filogenetik, sifat fisiologi dan sifat biokimia. Penggolongan yang
umumnya sering digunakan dalam mengklasifikasikan jamur, antara lain:
• Kerajaan (Kingdom)
• Divisi (Division)
• Kelas (Class)
• Suku (Family)
• Marga (Genus)
• Jenis (Species).
 Nomenklatur Jamur
Nomenklatur sebagai konsekuensi alami dari upaya orang-orang yang berbeda untuk
menerapkan nama untuk tanaman dan kesulitan menanggung pencetakan dan
bertukar informasi tentang hal ini. Subjek, organisme yang sama sering datang untuk
menanggung lebih dari satu nama.

Setiap spesies mempunyai dua nama;

Pertama adalah genus penghasil spesies tersebut
Kedua adalah nama spesiesnya.

Selanjutnya, sebagai organisme baru yang digambarkan, prinsip prioritas kemudian

diterima untuk menentukan binomial yang tepat
 Struktur Jamur
Sebagai eukariotik, sel-sel fungi mengandung inti membran yang terikat di mana
DNA membungkus protein histone. Sel - sel fungi juga berisi mitokondria dan
sistem membran internal yang rumit, termasuk retikulum endoplasmik dan
peralatan golgi.

Sel fungi tidak memiliki kloroplas atau klorofil. Banyak jamur memiliki warna
cerah yang muncul dari pigmen seluler lainnya, mulai dari merah, hijau
hingga hitam. Amanita muscaria yang beracun (sejenis agat) dapat
dikenali dari topinya yang berwarna merah terang dengan tambal putih.
 Muscaria Amanita yang beracun berasal dari daerah
beriklim sedang dan boreal di Amerika Utara

Lapisan dinding sel fungi yang kaku mengandung polisakarida kompleks yang
disebut kitin dan glucans. Kitin, yang juga terdapat dalam cangkang serangga,
memberi kekuatan struktural pada dinding sel jamur, dinding melindungi sel dar
predator.
a. Pertumbuhan

Jamur dimorfik dapat berubah dari keadaan uniseluler menjadi multiseluler

tergantung pada kondisi lingkungan. Jamur uniseluler umumnya disebut
sebagai ragi. Saccharomyces cerevisiae (ragi roti) dan spesies Candida (agen
sariawan, infeksi jamur yang umum) adalah contoh jamur uniseluler

Candida albicans
Kebanyakan jamur adalah organisme multiseluler. Mereka menunjukkan dua tahap
morfologi yang berbeda:
• Vegetatif
Tahap vegetatif terdiri dari jalinan struktur seperti benang tipis yang disebut hifa
(hifa tunggal). Masa hifa adalah miselium, ia dapat tumbuh di permukaan, di tanah
atau bahan yang membusuk dalam cairan atau di jaringan hidup.

• Reproduktif, bisa lebih mencolok dari vegetatif.

Kebanyakan jamur hifa dibagi menjadi sel-sel terpisah oleh dinding ujung yang
disebut septa (septum tunggal). Dalam kebanyakan filum jamur, lubang kecil di
septa memungkinkan aliran nutrisi dan molekul kecil dengan cepat dari sel ke sel di
sepanjang hifa.

Hifa dalam cetakan roti (yang termasuk dalam Filum Zygomycota) tidak dipisahkan
oleh septa. Sebaliknya, mereka dibentuk oleh sel-sel besar yang mengandung
banyak inti, sebuah susunan yang digambarkan sebagai hifa koenositik
Jamur tumbuh subur di lingkungan yang lembab dan sedikit asam; mereka bisa
tumbuh dengan atau tanpa cahaya

Hifa jamur dapat berupa (a) bersekat, (b) koenositik dan (c) Phialophora
richardsiae menunjukkan septa yang membagi hifa
b. Nutrisi

Seperti hewan, jamur adalah heterotrof: mereka menggunakan senyawa organik

kompleks sebagai sumber karbon, daripada memfiksasi karbon dioksida dari
atmosfer seperti yang dilakukan beberapa bakteri dan kebanyakan tumbuhan. Selain
itu, jamur tidak mengikat nitrogen dari atmosfer.
 Jamur sebagian besar adalah saprob (saprofit adalah istilah yang setara):
organisme yang memperoleh nutrisi dari bahan organik yang membusuk.
Mereka memperoleh nutrisi dari bahan organik yang mati atau membusuk,
terutama dari bahan tanaman. Eksoenzim jamur mampu memecah
polisakarida yang tidak larut, seperti selulosa dan lignin kayu mati, menjadi
molekul glukosa yang mudah diserap

Beberapa jamur bersifat parasit, menginfeksi tumbuhan atau hewan.

Penyakit jamur api dan elm Belanda menyerang tanaman, sedangkan kutu
air dan kandidiasis (sariawan) adalah infeksi jamur yang penting secara
medis pada manusia
 Morfologi Jamur
Jamur menunjukkan dua bentuk
struktur dasar, yaitu: Sementara beberapa jamur mampu ada sebagai
● Bentuk ragi kedua bentuk (dimorfik) pada waktu yang berbeda,
● Bentuk cetakan. yang lain hanya ada dalam satu bentuk. Peralihan
morfologis ini bergantung pada faktor-faktor seperti
lingkungan dan suplai nutrisi.
2
Ragi berbentuk uniseluler dengan badan bulat atau bulat telur; semua khamir
serupa secara morfologis pada pemeriksaan mikroskopis ringan. Cetakan
multiseluler dengan berbagai struktur khusus yang menjalankan fungsi tertentu.
Ukuran dan sifat struktur ini bervariasi dengan genera yang berbeda.

Hifa dibagi menjadi sel-sel unit oleh dinding silang yang disebut septa. Septa
memiliki pori-pori yang memungkinkan pergerakan sitoplasma, dan bahkan
organel, antar sel.
Ragi adalah sel tunggal, biasanya berbentuk bola sampai ellipsoid dalam bentuk dan
diameter bervariasi dari 3 µm sampai 15 µm, kebanyakan ragi berkembang biak
dengan tunas. Beberapa spesies menghasilkan tunas yang secara khas, gagal untuk
melepaskan dan menjadi memanjang

Koloni ragi biasanya lunak, buram, berukuran 1-3 mm, dan berwarna krem. Karena
koloni dan morfologi mikroskopis banyak ragi sangat mirip. Beberapa spesies jamur
bersifat dimorfik dan mampu tumbuh tergantung ragi atau jamur tentang kondisi
lingkungan
 Protozoa
Protozoa adalah istilah informal untuk eukariota non fotosintetik bersel
tunggal yang hidup bebas atau parasit yang berlimpah di lingkungan
berair dan tanah.

Beberapa protozoa mengambil makanan melalui fagositosis,

menelan partikel organik dengan pseudopodia.
 Klasifikasi Protozoa
kelompok utama protozoa

flagellata
sel motil yang memiliki organelpenggerak
seperti cambuk
ciliata
sel yang memiliki organel motilitas seperti
rambut pendek dalam jumlah besar

amuba
sel yang bergerak dengan cara memperluas
pseudopodia
(1) Flagellata memiliki satu atau lebih flagela seperti cambuk dan, dalam beberapa
kasus, membran bergelombang (misalnya, trypanosoma). Ini termasuk flagelata
usus dan genitourinari (masing-masing Giardia dan Trichomonas) dan flagellata
darah dan jaringan (Trypanosoma dan Leishmania).

(2) Amebae biasanya ameboid dan menggunakan aliran pseudopodia atau

protoplasma untuk bergerak. Mereka diwakili pada manusia oleh spesies
Entamoeba, Naegleria, dan Acanthamoeba.

(3) (Sporozoa menjalani siklus hidup yang kompleks dengan fase reproduksi seksual
dan aseksual yang bergantian. Parasit manusia, seperti Cryptosporidium,
Cyclospora, dan Toxoplasma, dan parasit malaria (spesies Plasmodium) semuanya
adalah parasit intraseluler.

(4) Ciliata adalah silia bantalan protozoa kompleks yang tersebar dalam baris atau
tambalan, dengan dua jenis inti pada setiap individu
 Nomenklatur Protozoa

Penamaan protozoa diatur dalam International Code of Zoological Nomenclature

(ICZN). Meskipun tidak mencoba untuk mengikuti Filokode, kelompok garis keturunan
yang disebutkan didefinisikan oleh apomorphine (karakter turunan) sebanyak mungkin,
tetapi definisi berbasis -node dan berbasis -stem digunakan seperlunya.

Dalam klasifikasi ini, akhiran nama yang menyampaikan informasi hierarki dalam
kode tradisional seperti, -Idae, -inae, -ales, -aceae dipertahankan untuk
menghindari perubahan nama yang tidak perlu tetapi tidak dimaksudkan untuk
menyampaikan informasi hierarki.
 Struktur Protozoa
Membran plasma pada beberapa jenis Protozoa ada yang
dilengkapi dengan silia atau flagel. Keduanya berfungsi sebagai
alat bergerak. Sitoplasma mengandung beberapa organel sel,
yaitu:
-vakuola makanan -mitokondria
-vakuola kontraktil (vakuola berdenyut) -ribosom
-nukleus (inti sel) -lisosom
 Morfologi Protozoa

Semua protozoa mempunyai vakuola kontraktil. Vakuola dapat berperan sebagai

pompa untuk mengeluarkan kelebihan air dari sel, atau untuk mengatur tekanan
osmosis. Jumlah dan letak vakuola kontraktil berbeda pada setiap spesies.

Protozoa dapat berada dalam bentuk vegetatif (trophozoite), atau bentuk istirahat yang
disebut kista. Protozoa tidak mempunyai dinding sel, dan tidak mengandung selulosa
atau khitin seperti pada jamurdan algae.

Kebanyakan protozoa mempunyai bentuk spesifik, yang ditandai dengan fleksibilitas

ektoplasma yang ada dalam membran sel. Beberapa jenis protozoa seperti
Foraminifera mempunyai kerangka luar sangat keras yang tersusun dari Si dan Ca
 Virus
Ciri-ciri:
• salah satu bentuk mikroorganisme dan menginfeksi sebagian besar bentuk kehidupan
lainnya: hewan, tanaman, dan bakteri.
• dapat menyebabkan penyakit oral dan orosfacial akut yang parah, menghasilkan
tanda-tanda oral infeksi sistemik, dan ditularkan ke pasien dan staf gigi.
• ukuran kecil (10-100nm).
• genom yang terdiri dari DNA atau RNA.
• tidak bermetabolisme.
Klasifikasi dan Taksonomi
Adapun kriteria tersebut, yaitu:

Jenis asam nukleat, RNA atau DNA

Simetri kapsid

Ada-tidaknya selubung

Banyaknya kapsomer untuk virus ikosahedral atau

diameter nukleokapsid untuk virus helikoidal
Sifat virus untuk penggolongan
Virus RNA
Virus DNA

Virus yang belum diklasifikasi

 Nomenklatur
Famili Subfamili Genus

1 2 3
Nama famili virus Nama subfamili Nama genus virus
ditandai dengan diberi akhiran – ditandai dengan
akhiran -viridae. virinae. akhiran -virus.

Penamaan virus tidak mengikuti penamaan

binomial(Linnaeus).
Struktur
Asam Nukleat Lipid dan Karbohidrat
• bisa berupa DNA atau RNA. • lipid dan karbohidrat virus hanya
• semua virus DNA memiliki genom yang terdiri dari ditemukan di selubungnya dan
satu molekul asam nukleat. sebagian besar berasal dari sel inang.
• genom dari banyak virus RNA terdiri dari beberapa • sekitar 50-60% lipid adalah fosfolipid;
molekul atau segmen berbeda. sebagian besar sisanya adalah
kolesterol.

Protein
Simetri
• terdiri dari dua atau tiga rantai polipeptida yang
berbeda. ada tiga jenis simetri yang dikenali, yaitu:
• meskipun sebagian besar protein virus memiliki • simetri Icosahedral
fungsi struktural, beberapa memiliki aktivitas • simetri heliks
enzimatik. • simetri yang kompleks
 Morfologi
Virus Heliks
• menyerupai batang panjang yang mungkin kaku atau fleksibel.
• terdapat asam nukleat virus yang ditemukan di dalam kapsid
silindris berongga dan berstruktur heliks.
• contoh: virus penyebab rabies, demam berdarah, ebola

Virus Polyhedral
• kapsid dari sebagian besar virus polihedron berbentuk ikosahedron, polihedron
biasa dengan 20 sisi segitiga dan 12 sudut.
• contoh dari virus polihedral dalam bentuk ikosahedron adalah adenovirus.
 Virus Enveloped
• ketika virus heliks atau polihedral tertutup oleh amplop disebut
virus heliks terselubung atau polihedron terselubung.
• contoh virus heliks yang diselimuti adalah virus influenza.
• contoh dari virus polihedral (icosahedral) yang diselimuti adalah
virus herpes simpleks.

Virus Kompleks

• beberapa virus memiliki struktur yang rumit dan disebut virus

kompleks.
• salah satu contoh virus kompleks adalah bakteriofag.
• beberapa bakteriofag memiliki kapsid yang ditempeli struktur
tambahan.
 Morfologi

Virus DNA Virus DNA Virus DNA

Papovaviruses Papilomavirus
berasal dari virus DNA mengandung serotypes
ikosahedral yang mempunyai manusia yang menyebabkan
kapasitas kecil yang akan tumor atau kutil kulit jinak dan
menimbulkan tumor secara in papiloma mulut dan kulit,
vivo dan untuk mengubah virus papiloma mungkin
garis sel yang dikultur. terlibat dalam kanker genital
dan mulut.
Polyomavirus
Genus ini berisi polyomavirus tikus
dan SV40 monyet, yang digunakan
dalam karsinogenesis eksperimental
pada hewan ini
 Virus DNA Virus DNA
Adenovirus Herpesviruses
Virus DNA ikosahedral, Virus utama yang menyebabkan
umumnya terkait dengan infeksi mulut pada manusia;
infeksi saluran pernapasan seringkali infeksi berulang, dan laten
dan mata pada manusia.

Picornaviruses Orthomyxoviruses
Berasal dari keluarga virus RNA terkecil, Virus RNA dengan nukleokapsid tubular dan selubung
tetapi termasuk dalam kelompok virus yang lipoprotein. Virus Influenza A dari burung, mamalia dan
sangat besar, termasuk genus Enterovirus. manusia termasuk dalam kategori ini.
Paramyxoviruses
Virus RNA besar yang diselimuti pleomorfik, penyebab umum
dari croup (laryngotracheobronchitis)

Coronavirus
Virus RNA yang diselimuti dengan nukleokapsid heliks, menginfeksi hewan dan
manusia, dan Mereka menyerupai ortomyxovirus tetapi memiliki proyeksi permukaan
berbentuk kelopak seperti korona matahari.

Retrovirus
RNA genom virus pertama kali ditranskripsikan menjadi DNA oleh enzim khusus
virus, reverse transcriptase. DNA ini kemudian dapat berfungsi sebagai template
untuk sintesis messenger RNA (mRNA).
Daftar Pustaka
• Jawetz, Melnick, Adelberg. Medical Microbiology. New York: McGraw-Hill. 26th ed. 2013. Hal: 675-676,
672-673.
• Brooks GF, et al. Jewetz, Melnick and Adelbreg’s.Medical Microbiology.26th ed. Chicago:Lange.2013:2-
20, 672-703,715-704
• Betsy, T. and J. Keogh. Microbiology Demystified, The McGrawHill Companies, Inc. New York.2005:
170-171
• Lakshman Samaranayake. Essential Microbiology for Dentistry. 4th ed. China: Elsevier; 2012: 185.
• H.M. Subandi, Mikrobiologi (Perkembangan, Kajian, dan Pengamatan Dalam Perspektif Islam),
Bandung: PT. Remaja Rosdakarya, 2010.
• Ika Roehjatun Sastrahidayat, Mikologi Ilmu Jamur, Malang : Uviversitas. Brawijaya Press (UB Press).
2011.
• Gembong Tjitrosupomo, Taksonomi Tumbuhan, Yogyakarta: Gajah Mada Univercity Press, 1994
• Boddy, Lynne., Money Nicholas., Watkinson, Sarah. The Fungi. Academic Press. 3rd Ed. 2015. Hal: 31-
32
• Biology LibreTexts [Internet]. Fungi Cell Structure and Function. 2020. Available at:
<https://bio.libretexts.org/Bookshelves/Introductory_and_General_Biology/Book%3A_General_Biology_(
Boundless)/24%3A_Fungi/24.1%3A_Characteristics_of_Fungi/24.1B%3A_Fungi_Cell_Structure_and_F
unction> [Accessed 3 November 2020].
Daftar Pustaka
• Samaranayake, L. Essential Microbiologi for Dentistry. 4th ed. Elsevier. 2012.
• Brooks, F. Geo. Carroll, Karen C. Butel, Janet S. Morse, Stephen A. Jawets, Melnick, dan
Adelberg’s Medical Microbiology. 24ed. McGrawHill Medical; 2007.
• Jawetz, Melnick, & Adelberg’s. Medical Microbiology. Twenty-Eighth Edition. 2019.
• John O Corliss. Protozoan Taxonomy and Systematics. USA: University of Maryland; 2001.
• Adl et al. Diversity, Nomenclature, and Taxonomy of Protist. Society of Systematic Biology.
2007
• Budirahayu, Ni Luh Eka. Makalah Zoologi Invertebrata Filum Protozoa.2014
• Talaro, K. P., & Chess, B. Foundation in Microbiology. 8 Ed. The McGraw-Hill Companies
Inc: New York. 2012. Hal: 146-148
• Hogg, Stuart. Essential Microbiology. 2nd Ed. UK: Wiley-Blackwell; 2013. Hal. 246-247
• Staf Pengajar Bagian Mikrobiologi. Buku Ajar Mikrobiologi Kedokteran. Edisi Revisi.
Tangerang: Binarupa Aksara Publisher. Hal. 297-305.
• Tortora GJ, Funke BR, Case CL. Microbiology an Introduction. 11th Ed. USA: Pearson
Education; 2013.