Pengantar Mikologi

Makalah Mikologi Dasar

Penyusun
Ageng Wiyatno, S Si
(Peminatan Mikrobiologi)

PROGRAM MAGISTER ILMU BIOMEDIK

FAKULTAS KEDOKTERAN
UNIVERSITAS INDONESIA
2020
I. Pendahuluan

Istilah "mikologi" berasal dari kata Yunani "mykes" yang berarti jamur. Oleh
karena itu mikologi adalah studi tentang jamur. Pada tahun 1910 Raymond
Sabouraud menerbitkan bukunya Les Teignes, yang merupakan studi komprehensif
jamur dermatofit. Ia juga dianggap sebagai bapak mikologi medis. Jamur menghuni
hampir setiap ceruk di lingkungan dan manusia terpapar organisme ini di berbagai
bidang kehidupan. Peran jamur yang bermanfaat di lingkungan:
1. Dekomposisi - daur ulang nutrisi dan karbon.
2. Pabrik biosintetik. Properti fermentasi digunakan untuk produksi industri alkohol,
lemak, sitrat, asam oksalat dan glukonat.
3. Sumber antibiotik penting, seperti Penisilin.
4. Model organisme untuk studi biokimia dan genetik. Misalnya: Neurospora crassa
5. Saccharomyces cerviceae banyak digunakan dalam teknologi DNA rekombinan,
yang meliputi Hepatitis Vaksin.
6. Beberapa jamur bisa dimakan (jamur).
7. Ragi menyediakan suplemen nutrisi seperti vitamin dan kofaktor.
8. Ergot yang diproduksi oleh Claviceps purpurea mengandung alkaloid yang penting
secara medis yang membantu menginduksi uterus kontraksi, mengendalikan
perdarahan dan mengobati migrain.
Efek berbahaya dari jamur:
1. Penghancuran makanan, kayu, kertas, dan kain.
2. Penyakit hewan dan manusia, termasuk alergi.
3. Racun yang dihasilkan oleh jamur beracun dan di dalam makanan (Mycetism dan
Mycotoxicosis).
4. Penyakit tanaman.
5. Kerusakan hasil pertanian seperti sayuran dan sereal di gudang.
6. Kerusakan produk seperti kaset dan disk magnetik, lensa kaca, patung marmer,
tulang dan lilin.
Sifat umum dari jamur:

2
 1. Merupakan eukariotik; sel mengandung organel sel yang terikat membran termasuk
nuklei, mitokondria, alat golgi, retikulum endoplasma, lisosom, dll. Mereka juga
menunjukkan mitosis.
2. Memiliki ergosterol di membrannya dan memiliki ribosom 80S.
3. Memiliki dinding sel yang kaku dan karenanya tidak dapat bergerak, fitur yang
memisahkan mereka dari hewan. Semua jamur memiliki dinding sel yang terbuat
dari kitin.
4. Organisme kemoheterotrof (membutuhkan senyawa organik untuk sumber karbon
dan energi) dan jamur tidak memiliki klorofil dan karenanya tidak autotrofik.
5. Jamur bersifat osmiotropik; mereka memperoleh nutrisi dengan penyerapan.
6. Mereka memperoleh nutrisi sebagai saprofit (hidup dari bahan yang membusuk)
atau sebagai parasit (hidup dari benda hidup).
7. Semua jamur membutuhkan air dan oksigen dan tidak ada yang obligat anaerob.
8. Bereproduksi secara aseksual dan/atau seksual dengan menghasilkan spora.
9. Secara reproduktif tumbuh bertunas, non-reproduktif dengan pemanjangan hifa.
10. Penyimpanan makanan umumnya dalam bentuk lipid dan glikogen.
II. Pembahasan
Jamur awalnya diklasifikasikan dengan tanaman dan merupakan subjek yang
menarik bagi ahli botani; maka pengaruh botani dapat dilihat pada klasifikasinya.
Pada tahun 1969, R.H Whittaker mengklasifikasikan semua organisme hidup
menjadi lima kerajaan yaitu Monera, Protista, Jamur, Plantae, dan Animalia.
Secara tradisional klasifikasi dihasilkan dengan cara ini:
Raya - Subkingdom - Filum / filum - Subphyla - Kelas - Urutan - Keluarga - Genus-
Spesies
Ada pendekatan alternatif dan lebih praktis, satu berdasarkan reproduksi seksual dan
yang lainnya berdasarkan morfologi thallus (struktur vegetatif).
Klasifikasi berdasarkan cara reproduksi:
1. Zygomycetes: yang diproduksi melalui produksi zygospora.
2. Ascomycetes: yang menghasilkan spora endogen yang disebut askospora dalam
sel yang disebut asci.

3
3. Basidiomycetes: yang menghasilkan spora eksogen yang disebut basidiospora
dalam sel yang disebut basidia.
4. Deuteromycetes (Fungi imperfecti): jamur yang tidak diketahui menghasilkan
spora seksual (askospora atau basidiospora). Ini adalah kelompok jamur yang
heterogen di mana belum ada reproduksi seksual yang ditunjukkan.
Klasifikasi berdasarkan Morfologi:
1. Mold/ Kapang: Jamur berserat, Misalnya: Aspergillus sp, Trichophyton rubrum
2. Ragi: Sel bersel tunggal yang tunas misalnya: Cryptococcus neoformans,
Saccharomyces cerviciae
3. Seperti Ragi: Mirip dengan ragi tetapi menghasilkan pseudohyphae Misalnya:
Candida albicans
4. Dimorfik: Jamur yang ada dalam dua bentuk morfologi yang berbeda pada dua
kondisi lingkungan yang berbeda. Jamur dimorfik hidup sebagai ragi dalam
jaringan dan in vitro pada suhu 37OC dan sebagai jamur di habitat alami mereka
dan in vitro pada suhu kamar. Contoh: Histoplasma capsulatum, Blastomyces
dermatidis, Paracoccidiodes brasiliensis, Coccidioides immitis
Sekitar 200 jamur yang bersifat"patogen manusia" telah dikenali dari sekitar
1,5 juta spesies jamur. Jamur ada dalam dua bentuk dasar; bentuk tunas berfilamen
(hyphal) dan sel tunggal (ragi). Untuk kepentingan klasifikasi mereka dipelajari
sebagai jamur, ragi, mirip ragi dan jamur dimorfik. Semua jamur memiliki
morfologi eukariotik yang khas. Mereka memiliki dinding sel yang kaku yang terdiri
dari kitin, yang dapat dilapisi dengan mannans, glukan dan polisakarida lain yang
berhubungan dengan polipeptida. Beberapa jamur yang lebih rendah memiliki
selulosa di dinding selnya. Beberapa jamur seperti Cryptococcus sp dan ragi dari
Histoplasma capsulatum memiliki kapsul polisakarida yang membantu mereka
untuk menghindari fagositosis.
Bagian dalam dinding sel adalah membran plasma yang merupakan membran
bi-layered khas selain adanya sterol. Membran jamur memiliki ergosterol berbeda
dengan kolesterol yang ditemukan dalam sel mamalia. Sitoplasma terdiri dari
berbagai organel seperti mitokondria, alat golgi, ribosom, retikulum endoplasma,

4
lisosom, mikrotubulus, dan inti selaput tertutup. Sifat unik dari membran nuklear
jamur adalah bahwa membran ini bertahan di seluruh metafase mitosis tidak seperti
sel tumbuhan dan hewan di mana ia larut dan terbentuk kembali. Nukleus memiliki
kromosom berpasangan.
Mold:
Mold thallus terbuat dari hifa, yang berbentuk seperti tabung silinder yang
memanjang dengan pertumbuhan di ujung. Massa hifa dikenal sebagai miselium
bertanggung jawab atas sifat filamen dari jamur. Hifa dapat bercabang atau tidak
bercabang, berupa septate atau aseptate. Hifa biasanya memiliki dinding silang yang
membaginya menjadi banyak sel. Dinding silang ini disebut septa, septa memiliki
pori-pori kecil yang dapat dilalui sitoplasma secara terus menerus sepanjang hifa.
Oleh karena itu, semua jamur hifa cenderung bersifat coenocytic (multinucleate).
Dengan pengecualian zygomycetes (Rhizopus, Mucor), semua mold bersifat septate.
Hifa non-septat dianggap lebih primitif karena jika untai hifa rusak, seluruh untai
mati. Ketika untai septat rusak, pori-pori antara kompartemen yang berdekatan dapat
dipasang, sehingga mencegah kematian seluruh untai hifa.
Miselium terdiri dari tiga jenis:
1. Miselium vegetatif adalah mereka yang menembus permukaan medium dan
menyerap nutrisi.
2. Miselium udara adalah mereka yang tumbuh di atas permukaan agar.
3. Miselium subur adalah hifa udara yang mengandung struktur reproduksi seperti
konidia atau sporangia.
Hifa adalah unit struktural dari mold, miselium memberikan warna, tekstur, dan
topografi terhadap koloni. Jamur yang memiliki pigmen melanin di dinding sel
mereka disebut phaeoid atau dematiaceous dan koloninya berwarna abu-abu, hitam
atau zaitun. Contohnya adalah spesies Bipolaris, Cladosporium, Exophiala,
Fonsecaea, Phialophora, dan Wangiella. Hifa yang tidak memiliki pigmen di
dinding selnya disebut hyaline. Hifa mungkin memiliki beberapa struktur atau
penampilan khusus yang membantu dalam identifikasi.
Beberapa di antaranya adalah:

5
a) Hifa spiral: Ini adalah hifa melingkar spiral yang biasanya terlihat pada
Trichophyton mentagrophytes.
b) Badan pektinat: Ini adalah proyeksi pendek,
Ragi:
Ragi adalah sel uniseluler berbentuk bulat hingga ellipsoid. Mereka
berkembang biak dengan tunas, yang menghasilkan pembentukan blastospore
(blastoconidia). Dalam beberapa jenis, ketika sel tunas gagal melepaskan dan
memanjang, ragi akan membentuk rantai hifa memanjang seperti filamen yang
disebut pseudohyphae. Properti ini terlihat di Candia albicans. Spesies yang sama
juga memiliki kemampuan untuk menghasilkan hifa sejati, yang dilihat sebagai
tabung kuman. Perbedaan antara keduanya adalah bahwa ada penyempitan pada
psueudohyphae pada titik tunas, sedangkan tabung kuman tidak memiliki
penyempitan.
   Beberapa ragi seperti Cryptococcus dan bentuk ragi dari Blastomyces
dermatatidis menghasilkan kapsul polisakarida. Kapsul dapat ditunjukkan dengan
metode pewarnaan negatif menggunakan tinta India atau Nigrosin. Kapsul itu
sendiri bisa diwarnai dengan pewarnaan Meyer Mucicarmine. Beberapa ragi
berpigmen. Rhodotorula sps menghasilkan koloni merah muda karena pigmen
karotenoid sementara beberapa ragi seperti Phaeoannellomyces werneckii dan
Piedraia hortae bersifat dematiaceous, menghasilkan koloni berwarna coklat hingga
olivaceous. Ragi sejati seperti Saccharomyces cerviciae tidak menghasilkan
pseudohyphae. Jamur mirip ragi dapat berupa basidiomycetes, seperti Cryptococcus
neoformans atau ascomycetes seperti Candida albicans.
Reproduksi jamur:
Jamur bereproduksi dengan cara aseksual, seksual dan parasexual.
Reproduksi aseksual adalah mode paling umum pada kebanyakan jamur dengan
jamur berpartisipasi dalam mode seksual hanya dalam keadaan tertentu. Bentuk
jamur yang mengalami reproduksi aseksual dikenal sebagai anamorf (atau tahap
tidak sempurna) dan ketika jamur yang sama mengalami reproduksi seksual,
bentuknya dikatakan teleomorph (atau tahap sempurna). Seluruh jamur, termasuk

6
kedua bentuknya disebut holomorph. (Secara taksonomi, teleomorph atau
holomorph digunakan, tetapi secara praktis lebih mudah menggunakan anamorph.)
 Reproduksi aseksual:
Propagul aseksual disebut spora atau konidia tergantung pada mode produksi.
Spora aseksual diproduksi setelah mitosis sedangkan spora seksual dihasilkan
setelah meiosis. Spora aseksual dari zygomycetes, yang dikenal sebagai
sporangiospora terbentuk dalam struktur seperti kantung yang dikenal sebagai
sporangia. Sporangiospora dihasilkan dari pembelahan mitosis sitoplasma di
sporangium. Sporangia ditanggung oleh hifa khusus yang disebut sporangiophore.
Proses pembentukan spora endogen dalam kantung ini dikenal sebagai sporogenesis.
Konidia muncul baik dengan menumbuhkan hifa konidiogen atau dengan
diferensiasi hifa yang terbentuk sebelumnya. Ini berkembang setelah mitosis
nukleus induk dan terbentuk dengan cara apa pun kecuali melibatkan pembelahan
sitoplasma. Proses eksogen ini dikenal sebagai konidiogenesis, suatu proses yang
terjadi baik pada ragi maupun kapang. Konidia ditanggung oleh struktur khusus
yang disebut konidiofor. 
Produksi konidia bisa blastik atau thalik. Dalam perkembangan blastik,
konidium mulai membesar dan septum terbentuk. Di sini konidium berasal dari
bagian induknya. Dalam mode pengembangan thallic conidium dibedakan oleh
septum sebelum diferensiasi. Dengan demikian hasil konidium dari konversi seluruh
sel induk menjadi konidium. Sel yang menimbulkan konidium disebut sel
konidiogen. Konidiofor adalah hifa khusus yang mengandung konidia atau sel
konidiogen. Dalam banyak kasus sel konidiogen disebut sebagai phialides.
 Reproduksi seksual:
Perbanyakan seksual dihasilkan oleh perpaduan dua nuklei yang kemudian
umumnya mengalami meiosis. Langkah pertama dalam metode reproduksi seksual
melibatkan plasmogami (fusi sitoplasma dua sel). Langkah kedua adalah karyogami
(fusi dua inti yang kompatibel), menghasilkan produksi inti diploid atau zigot. Ini
diikuti oleh rekombinasi genetik dan meiosis. Empat spora haploid yang dihasilkan
dikatakan sebagai spora seksual, mis. zygospora, ascospora dan basidiospora.

7
 Jika spora seksual hanya dihasilkan oleh fusi nukleus dari satu tipe kawin
dengan nukleus tipe kawin lainnya (+ dan - galur), jamur dikatakan heterothalik.
Sebaliknya, jamur homothalik menghasilkan spora seksual mengikuti fusi dua inti
dari strain yang sama. Agar reproduksi seksual dapat terjadi, diperlukan dua isolat
yang kompatibel. Zygospora, yang merupakan spora seksual zygomycetes adalah
struktur reproduksi berdinding tebal yang dihasilkan dari penyatuan dua gamentagia.
Ascomycetes menghasilkan spora seksual yang disebut ascospora dalam kantung
khusus seperti sel yang dikenal sebagai ascus. Dalam basidiomycetes basidiospora
dilepaskan dari basidium, yang merupakan sel terminal hifa.
 Reproduksi parasexual:
pReproduksi parasexual, pertama kali terlihat di Aspergillus diketahui terjadi
pada basidiomycetes, ascomycetes dan deuteromycetes. Prosesnya melibatkan
rekombinasi genetik tanpa persyaratan struktur seksual tertentu.
Pentingnya Spora:
A. Biologis
1) Memungkinkan untuk diseminasi
2) Memungkinkan reproduksi
3) Memungkinkan jamur untuk pindah ke sumber makanan baru.
4) Memungkinkan jamur untuk bertahan hidup.
Diagnosis laboratorium mikosis:
Pengumpulan spesimen:
Pengumpulan spesimen tergantung pada lokasi yang terpengaruh. Spesimen yang
berbeda termasuk rambut, kerokan kulit, guntingan kuku, dahak, darah, CSF, urin,
kerokan kornea, pengeluaran atau nanah dari lesi dan biopsi.
Semua spesimen harus dipindahkan ke laboratorium tanpa penundaan untuk
mencegah pertumbuhan bakteri yang berlebihan. Dalam hal spesimen tertunda
kecuali spesimen kulit, darah dan CSF dapat didinginkan dalam waktu singkat.
Beberapa metode identifikasi jamur:
Mikroskopi: Mikroskopi digunakan untuk mengamati spesimen klinis untuk
keberadaan elemen jamur atau untuk mengidentifikasi kultur berikut jamur. Dalam

8
kasus terakhir, lactophenol cotton blue adalah pewarna pilihan, yang mewarnai
elemen jamur biru. Pemeriksaan langsung spesimen klinis bisa terwarnai atau tidak
terwarnai.
• Preparasi basah: Candida dapat diamati pada preparasi basah pada urine
• Preparasi 10-20% KOH: Beberapa spesimen dikenai pemberian KOH untuk
pemeriksaan langsung. Bahan dicampur dengan 20% KOH pada slide dan slip
penutup ditempatkan. Slide kemudian dipanaskan sedikit dengan melewati api 2-3
kali. Slide diamati saat pendinginan. KOH berfungsi untuk mencerna puing-puing
protein dan membersihkan jaringan keratin dan meningkatkan visibilitas.
Penambahan Dimethyl sulphoxide (DMSO) memungkinkan pembersihan cepat
tanpa adanya panas.
 Calcofluor white: Ini adalah pewarna fluoresen, yang mengikat secara selektif
dengan kitin dari dinding sel jamur. Spesimen kemudian dapat diamati di bawah
mikroskop fluorescent.
 Tinta India: Kapsul Cryptococcus neoformans dapat ditunjukkan dengan teknik
pewarnaan negatif ini.
 Pewarnaan Asam-Schiff Berkala: Pada pewarnaan ini, unsur-unsur jamur
tampak berwarna magenta cerah sementara latar belakang berwarna hijau.
Berguna dalam pewarnaan spesimen jaringan.
 Pewarnaan Giemsa: Ini sangat berguna dalam mendeteksi Histoplamsa
capsulatum dalam apusan sumsum tulang.
 Pewarnaan Haematoxylin dan Eosin (H&E): Berguna untuk pewarnaan bagian
jaringan.
 Pewarnaan methenamine silver nitrate (GMS) Gomori: Garis-garis besar jamur
berwarna hitam, bagian internal berwarna merah muda-hitam sementara latar
belakang berwarna hijau muda. Candida dan Aspergillus mungkin terlewatkan
dalam pewarnaan H&E bagian, oleh karena itu bagian berwarna GMS sangat
penting untuk patologi jaringan.
 Pewarnaan Gridley: Pewarnaan dan ragi berwarna biru-merah muda gelap,
jaringan berwarna biru tua dan kuning latar belakang.

9
 Pewarnaan mucicarmine Meyer: Kapsul C. neoformans dan dinding bagian
dalam Rhinosporidium seeberi sporangium berwarna merah muda.
 Pewrnaan Gram: Candida paling baik ditunjukkan dalam spesimen klinis oleh
pewarnaan Gram.
 Pewarnaan Masson-Fontana sangat membantu dalam pewarnaan jamur phaeoid
(dematiaceous) dalam jaringan.
 Imunofluoresensi: antibodi monoklonal berlabel pewarna fluoresen dapat
digunakan untuk mendeteksi beberapa jamur dalam spesimen klinis.
 Kultur: Salah satu media yang paling umum digunakan untuk kultur jamur di
laboratorium adalah Sabouraud's Dextrose Agar (SDA). Ini terdiri dari pepton,
dekstrosa dan agar. Konsentrasi gula yang tinggi dan pH yang rendah (4,5-5,5)
mencegah pertumbuhan sebagian besar bakteri dan membuatnya selektif untuk
jamur. Media basal lain untuk menumbuhkan jamur termasuk Potato Dextrose
Agar, Agar Malt Ekstrak dll.

Kesimpulan
Jamur memiliki keanekaragaman yang tinggi dengan berbagai karakteristik
yang khas dari segi morfologi, cara reproduksi, dan metabolisme biokimiawinya.
Dengan keanekaragaman ini, banyak jamur yang dapat menguntungkan manusia
selain peran alaminya di alam sebagai decomposer. Berbagai peran jamur sebagai
penghasil produk biosintetik seperti penicillin, agen fermentasi berbagai produk
makanan-minuman, dan membantu dalam proses bioteknologi, menunjukan bahwa
jamur memiliki potensi yang besar untuk dikembangkan dan dimanfaatkan bagi
kesejahteraan manusia. Namun, beberapa jenis jamur yang bersifat patogen juga
perlu diwaspadai. Dengan mempelajari karakteristik jamur, patogenisitas, teknik
identifikasi, isolasi dan kultur jamur, maka kita dapat mengendalikan kelompok
organisme jamur ini untuk kesejahteraan manusia dan menjaga alam tetap lestari.

10
Daftar Pustaka
Melnick. Jawetz. Mikrobiologi Kedokteran. Penerbit Buku Kedokteran EGC. Jakarta.
2016.

Alexopoulos, C. J., C. W. Mims, and M. Blackwell. Introductory Mycology, 4th ed.

New York: John Wiley & Sons, 1996.

Arora, D. Mushrooms Demystified: A Comprehensive Guide to the Fleshy Fungi.

Berkeley, CA: Ten Speed Press, 1986.

Hanlin, R.T., and M. Ulloa. Atlas of Introductory Mycology, 2nd ed. Winston-Salem,
MA: Hunter Textbooks Inc., 1978.

Fungi. Internet Web. Accessed from:

 http://www.biologyreference.com/Fo-Gr/Fungi.html#ixzz6Lwf35ICe. 2020.

11