MIKROBIOLOGI DAN PARASITOLOGI

MATERI 12
MIKROBIOLOGI TERAPAN
Dwi Faqihatus Sy. Has. M.Epid
 Tujuan Perkuliahan
MATERI 12 Mikrobiologi Industri

Mahasiswa mampu menjelaskan : Mikrobiologi Lingkungan

Mikrobiologi Terapan
Mikrobiologi Farmasi
 Mikrobiologi Terapan
• Mikrobiologi adalah cabang ilmu yang berurusan dengan mikroba,
karakter mereka, aplikasi dan konsep terkait lainnya. Ini juga meluas
ke aspek bagaimana tubuh berurusan dengan mikroba, bagaimana
mengendalikan mereka untuk kesehatan dan manfaat lainnya dalam
berbagai bidang kehidupan
• Mikrobiologi terapan mempelajari tentang manfaat dan peran
mikroorganisme dalam berbagai kehidupan dan kebutuhan mahluk
hidup salah satunya adalah manusia.
4
 MIKROBA
• Industri fermentasi adalah istilah yang digunakan
untuk proses menghasilkan produk dengan
memanfaatkan kapasitas mikroba.
• Produk yang dihasilkan oleh mikroba, dinilai
memiliki keuntungan yang sangat besar.

5
 METABOLISME
PRIMER & SEKUNDER
• Metabolisme primer adalah hasil dari proses
metabolisme energi dan merupakan kelanjutan dari
pertumbuhan mikroorganisme.
• Metabolisme sekunder adalah hasil dari reaksi
kompleks yang terjadi setelah tahap akhir dari
pertumbuhan primer.
• Pada tahap metabolisme sekunder, terbagi ke dalam
dua fase, diantaranya:
➢Fase awal/ Pertumbuhan/ Tropofase
➢Fase proses metabolisme sekunder/ Idiofase
6
Gambar 31.1 ( Produksi selular dari metabolisme primer dan sekunder)
Periode pemanfaatan substrat, tumbuhnya sel, dan melakukan
metabolisme primer (A) dan metabolisme sekunder (B)

7
 Produk Komersial yang Dihasilkan Mikroba

I.Makanan, penyedap rasa, c. Minuman

suplemen makanan, serta
minuman - Wine / Anggur
a. Makanan - Bir
- Daging yang difermentasi - Wiski
- Keju dan produk susu d. Vitamin
- Jamur - B12
- Roti atau ragi roti - Riboflavin
- Kopi II. Asam organik
- Acar Asam sitrat
- Protein sel tunggal / PST III. Antibiotik
b. Penyedap rasa dan suplemen Biosid
makanan IV Insulin
- Cuka Hormon Pertumbuhan Manusia
- Asam amino
- Vitamin
8
 PROTEIN SEL TUNGGAL & JAMUR
• Protein sel tunggal merupakan bagian terpenting pada mikroba,
dimana protein dari sel tunggal / PST dapat dikonsumsi bagi manusia
dan hewan (seperti Spirulina yang digunakan sebagai suplemen
makanan)
• Beberapa jenis jamur merupakan makanan yang penting bagi
manusia. Agaricus bisporus dan Lentinus edulus merupakan dua dari
beberapa jamur yang dibudi daya sebagai bahan makanan.

9
 JAMUR BUDI DAYA

Agaricus bisporus →

Lentinus edulus →

10
 PRODUK HASIL FERMENTASI
• Keju merupakan makanan yang telah ada sejak lama. Pembuatan
keju diawali di negara bagian timur tengah. Selanjutnya,
menyebar ke Yunani dan Roma.
• Pembuatan keju dapat dibagi kedalam empat tahapan, antara lain:
➢Pengentalan susu menjadi bentuk didih
➢Pemisahan dadih dari air dadih
➢Pembentukan dadih
➢Masak hingga rasa dan teksturnya sesuai dengan yang diinginkan

11
lanjutan…
• Yogurt dibuat dari pemanasan/ pasteurisasi susu
rendah lemak yang dikentalkan dengan
penghilangan air atau dengan menambahkan
bubuk susu. Penghilangan susu diinokulasi dengan
sebuah campuran Streptococcus thermophilus dan
Lactobacillus bulgaricus dan diinkubator selama
45oC selama 12 jam. Pertumbuhan Streptococcus
thermophilus menghasilkan asam laktat, serta
Lactobacillus bulgaricus memberikan asam laktat
dan bau / rasa pada produk yang dihasilkan.

12
lanjutan…

• Sel ragi dapat menjadi sumber dari protein sel

tunggal dan bisa juga digunakan sebagai suplemen
makanan.
• Sel ragi banyak digunakan dalam industri
pembuatan roti.

13
 (3)Enzim molase yang berupa
(1) Inokulum ragi (2) …Sampai terisi gula monomer
dipindahkan ke tangki… 200.000 liter untuk menghasilkan
yang akan difermentasi substrat
pada pertumbuhan ragi

(5)Ragi terbentuk
dan siap untuk dikomersilkan

(4) Fermentor dicampur

dengan udara agar
pertumbuhannya cepat
dan mencegah terbentuk etanol
14
 lanjutan…
• Coklat didapat dari biji coklat, yakni suatu biji yang ditutupi oleh
buah. Biji-biji dilepas dari buah dan difermentasikan dalam wadah
selama beberapa hari.
• Kecap diperoleh dari campuran rendaman dan kukusan kacang
kedelai dengan pemerasan terigu dan penginokulasian Aspergillus
oryzae.

15
 lanjutan…
• Daging hasil fermentasi merupakan daging spesial yang dihasilkan
oleh fermentasi bakteri, misalnya sosis. Secara umum, organisme
yang memfermentasikan daging adalah Pediococcus cerevisiae dan
Lactobacillus plantarum.
• Dalam menghasilkan produk makanan, Lactobacillus mesenteroides
atau Lactobacillus plantarum digunakan sebagai inokula dalam
pembuatan asinan kubis.

16
 PENYEDAP RASA &
SUPLEMEN MAKANAN
• Vinegar atau cuka telah ada sejak + 10.000 tahun yang lalu, yang diawali
dengan pembuatan minuman anggur. Nama dari vinegar berasal dari
bahasa Perancis yaitu vin (anggur) dan aigre (asam), jadi Vinegar merupakan
minuman anggur yang diasamkan.
• Organisme yang digunakan dalam pembuatan vinegar adalah Acetobacter
aceti dan Gluconobacter oxydans
• Dua mesin utama yang digunakan dalam pembuatan cuka / vinegar, yaitu
aliran generator (the trickling generator) dan fermentasi batchwise.

17
 Semprotan etanol, Pembuangan
air , dan asam asetat uap
pada lapisan atas
Selang
Semprotan karet
Kecepatan aliran
diatur pada suhu 290C
pada atas tangki,
dan 350C bag bwh

Pengukur kapasitas
air encer
Pompa mengalirkan
campuran etanol,
air, dan asam asetat Pipa udara
dari lubang
menuju bagian atas tangki
Pompa
Penyaring Kumpulan Pengisian gas diatur untuk
cuka lubang mencegah evaporasi dan
terbentuknya asam asetat
Pembuatan Vinegar dengan fermentasi lanjutan
Frings-tipe trickling generator untuk mengahasilkan vinegar 18
 Perusak buih
Katup busa
Tangki terisi etanol, inokulum bakteri,
dan nutrient (hanya beberapa),
Udara bersih kadar gas tetap
dan diaduk dengan kec. tinggi

Gulungan Sirkulasi pendingin

pendingin tangki 30oC
Katup
pengatur
udara
Pendingin
Klep keluar otomatis

Mesin

pembuatan vinegar dengan fermentasi batchwise

Frings acetor, dengan sistem merendam dalam menghasilkan vinegar 19
 MINUMAN BERALKOHOL
Minuman beralkohol salah satu industri penunjang ekonomi, banyak
diantaranya di produksi dengan menggunakan bakteri. Selain menggunakan
bakteri minuman beralkohol juga menggunakan variasi tanaman glukosa
buah atau polisakarida gandum.
Sebagian besar tanaman glukosa dapat menghasilkan substrat fermentasi
minuman yang mengandung alkohol, antara lain:

1. Wine
2. Bir

20
 WINE
• Ada dua macam jenis wine/ minuman anggur yang terbuat dari buah anggur,
yaitu wine putih dan wine merah.
• Wine putih terbuat dari ekstrak kulit anggur putih, biasanya fermentasi wine
putih yaitu 3-10 hari. Sedangkan pada wine merah bisa menggunakan biji
ataupun kulit dari anggur merah, biasanya fermentasi wine merah berkisar 12- 36
jam.

21
 BIR
• Bahan dasar pembuat bir adalah barley.
• Proses pembuatan bir yaitu dengan substrat gula,
yang di fermentasikan dari ekstrak gandum.
• Selama proses pembuatannya terdapat enzim,
yakni enzim amilase dan proteinase yang
diaktifkan, sehingga menyebabkan pelepasan gula
dan asam amino dari butiran biji.

22
 ASAM ORGANIK
• Asam sitrat merupakan asam yang disintesis oleh
mikroba fermentasi.
• Awalnya, asam sitrat diambil dari buah jeruk
(lemon = 7% sampai 9% asam sitrat).
• Pada tahun 1923 fermentasi dikembangkan untuk
menghasilkan kadar asam sitrat yang tinggi.

23
 ENZIM
• Di lingkungan, mikroorganisme memanfaatkan
enzim untuk membongkar protein, pati, pektin,
lipid dan molekul besar lain yang tidak larut.
• Enzim hidrolitik ini umumnya ekstraseluler atau
terletak pada permukaan sel dan diproduksi oleh
bakteri dan jamur.
• Sebagai enzim ekstraselular, enzim tersebut
dapat pulih cukup cepat melalui pertumbuhan
media

24
ENZIM MIKROBA DAN PERANANNYA
DI DUNIA PERINDUSTRIAN

25
 TRANSFORMASI MIKROBA
• Anti-aktivitas inflamasi senyawa steroid tergantung
pada adanya oksigen atau hidroksil dalam 11 -
posisi.
• Steroid alami diproduksi dalam jumlah yang
signifikan, seperti dari ragi atau tanaman, yang
tidak memiliki 11-hidroksilasi. Sebelum penemuan
bahwa mikroba dapat hidroksilasi steroid inti dan
sedikit pun hasil stoikiometrik virtual, yang
hidroksilasi itu dilakukan secara kimia dan hasilnya
sangat rendah.

26
 INOKULA
1. Bakteri asam laktat terdapat di antara mikroorganisme yang tumbuh
dalam massal dan dijual untuk fermentasi dalam produk yang
difermentasikan, misalnya keju dan daging.
2. Penggunaan susu dipasteurisasi sebagai bahan awal untuk produksi
keju, yang diperlukan dalam mencegah penyebaran penyakit tulang.
Namun, pasteurisasi menurunkan populasi alami asam laktat bakteri
dan inokulasi dengan strain yang diinginkan, untuk menghasikan
produksi keju yang diperlukan.
3. Industri sosis dan fermentasi daging dengan hasil yang terbaik, dicapai
dengan proses inokulasi dengan bakteri yang sesuai.

27
 INHIBIDITOR
• Mikroba yang dapat berperan sebagai katabolisme dengan cara biosid
sebagai penghilang racun dalam eukariota atau antibiotik yang
menghambat spesies prokariotik lain.
• Antibiotik terhadap bakteri, jamur, virus, dan tumor secara aktif
sangat diperlukan. Pencarian ini termasuk antimikroba yang efektif
terhadap mikroba penyebab penyakit yang tidak terkendali.

28
 31.15
GRAFIK PEMBUATAN OBAT STEROLS

29
 GAMBAR 31.16
INSECSIDA BAKTERI Bacillus thuringiensis

30
 TABEL 31.9
ANTIBIOTIK YANG BERASAL DARI SEL EUKARIOTIK

31
 PENEMUAN ANTIBIOTIK BARU
Langkah-langkahnya adalah…
• Kenali sumber produsen yang berpotensi
• Isolasi organismenya
• Persiapkan Uji coba cawan petri
• Uji aktivitas novel
• Penyaringan Lebih lanjut

32
 PRODUKSI KOMERSIL
• Penicillin → dihasilkan oleh bakteri Penicillin chrysogenum.
• Cephalosporin → dihasilkan oleh bakteri Chepalosporin
acremonium
• Streptomycin → dihasilkan oleh bakteri Streptomyces griseus
• Macrocyclic Lactones merupakan antibiotik sebagai eritromicyn.
Contohnya adalah Rifamycin yang dihasilkan oleh bakteri Nocardia
mediterranei.

33
lanjutan…
• Tetracyclin melawan bakteri gram negatif dan
positif seperti Rickettsia, Mycoplasma, Leptospira,
Spirochetes, dan Chlamydia.

34
 REKAYASA GENETIKA
MIKROORGANISME
1. Insulin Manusia atau pembuatan Hormon
insulin untuk manusia
1. Hormon Pertumbuhan Manusia (HGB)
2. Vaksin
3. Sistem Kloning Gen
4. Interferon
5. Protein Darah
6. Faktor Pertumbuhan Tulang
7. Faktor Pertumbuhan Epidermal
8. Potensi untuk Perkembangan yang Lebih Lanjut (Genetika Masa Depan)
35
lanjutan…
• Faktor Pertumbuhan Tulang
• Faktor Pertumbuhan Epidermal
• Potensi untuk Perkembangan yang Lebih Lanjut
(Genetika Masa Depan)

36
37
 PENDAHULUAN
• Mikroorganisme adalah agen utama untuk
menghilangkan limbah dan racun.
• Mikroorganisme heterotrop cocok untuk proses
pembuangan limbah organik.
• Mikroorganisme tersebut dapat tumbuh
diberbagai kondisi lingkungan, suhu, Ph,
konsentrasi nutrisi dan kadar oksigen.

38
 PROSES PENGOLAHAN LIMBAH
• Berbagai kotoran hewan dapat terurai oleh mikroba.
• Sistem pengolahan limbah menggunakan mikroba
sebagai sarana utama untuk mendegradasi bahan
organik tersebut.

39
 MIKROORGANISME PATOGEN
MIKROORGANISME PENYAKIT
Bakteri
Salmonella typhosa Demam tipus
Vibrio cholera Kolera
Shygella dysenteriae Disentri bakteri
Protozoa
Entamoeba hystolitica Disentri amoeba
Giardia lamblia Giardiasis
Naeglaria Meningoencephalitis
Virus
Infeksi hepatitis Hepatitis B

40
 PENGOLAHAN PRIMER LIMBAH
• Pengendapan dari bahan partikel
• Pemisahan dari bahan terlarut

41
 PENGOLAHAN SEKUNDER LIMBAH
• Proses pengolahan ini merupakan proses
mikrobiologis.
• Cairan bagian dari tangki utama dilewatkan
kedalam tangki lain (tangki air limbah sekunder),
selanjutnya di uapkan ke udara.

42
43
PENGOLAHAN TERSIER LIMBAH
Pengolahan limbah dapat dilihat dari rumus berikut
:

Bahan organik → XO2+NH3+SO4-2+PO4-3.

44
 PENGOLAHAN AIR MINUM
Sistem pengolahan air minum terdiri dari:
1. Koagulasi
2. Sedimentasi
3. Filtrasi
4. Desinfeksi

45
 TEMPAT PEMBUANGAN SAMPAH &
PENGOMPOSAN

• Mikroba juga terlibat dalam degradasi sampah &

dalam proses pengomposan.
• sampah di kubur dalam tanah, Kemudian ditutup
menggunakan tanah dan di biarkan membusuk
secara alami

46
47
 PENGOMPOSAN
• Yaitu sebuah proses dimana material
tanaman(akar, batang, dan daun) diuraikan
• Kelompok mikroba terpenting yang dilibatkan
adalah bakteri, khususnya Actinomycetes, seperti
fungi
• Logam-logam berat, pestisida,dan bahan-bahan
berbahaya lainnya yang digunakan dalam
perkebunan dapat dikonsentrasikan dengan
mengompos

48
 PESTISIDA
• Yaitu, substansi kimia yang diolah dengan industri
kimia untuk mengontrol serangga (insektisida)
atau rumput (herbisida)
• DDT adalah pestisida yang paling terkenal (gambar
32.10)

49
50
lanjutan…
• DDT dikonsentrasikan pada rantai makanan dalam
sebuah proses yang disebut biomagnifikasi (gambar
32.10 B)
• DDT terbukti sangat merugikan burung pemakan
serangga / ikan dengan konsentrasi pestisida yang
tinggi
• Contoh lain bahwa herbisida sangat persisten
dilingkungan dapat dilihat pada gambar 32.11

51
52
lanjutan…
• Alternatif lain pada penggunaan pestisida
persisten yaitu insektisida biologis

53
 BIOREMIDIASI
• Campuran-campuran yang ada di air tanah antara lain
terdapat pada tabel 32.2

• Metode praktis untuk pemulihan lingkungan yang

tercemar oleh limbah berbahaya disebut bioremidiasi

54
55
lanjutan…
Keuntungan bioremidiasi:
1. Mudah dalam penggunaannya
2. Biaya yang terjangkau
3. Rendahnya dampak dari terjadinya kontaminasi
saat pembersihan berlangsung
Metode Remidiasi:
1. Memompa dan menarik/menghilangkan
2. Bioreaktor
3. Gundukan/tumpukan
4. Lahan pertanian

56
 HUJAN MINERAL ASAM

• Terjadi ketika batubara dan minyak mengandung sejumlah besar

sulfur yang terbakar menjadi fuel (bahan bakar).
• Ketika sumber energi tersebut terbakar, gas sulfur dioksida
dibebaskan ke atmosfer. Jika pada saat yang bersamaan terdapat
cahaya dan air, ini dapat menyebabkan produksi asam sulfur
hingga terjadilah hujan asam.

57
58
 Mikrobiologi Farmasi
Farmasi dan perusahaan farmasi menggunakan mikrobiologi secara
ekstensif. Itu digunakan untuk:
1. Untuk produksi obat obatan
2. Untuk sterilisasi obat-obatan yang diproduksi.
3. Penemuan obat baru:

59
 (1) Produksi Obat Obatan
• Produski Obat obatan seperti antibiotik, enzim, vaksin, insulin, vitamin, steroid,
dll. Beberapa zat secara eksklusif diperoleh dari pembiakan mikroba. Kebanyakan
antibiotik diperoleh hanya dari mikroba.
• Vitamin-B12 (cyanocobalamin) diperoleh dari pembiakan bakteri. Demikian pula,
insulin manusia untuk penderita diabetes murni berasal dari pembiakan mikroba
oleh teknologi rDNA.
• Awalnya, penderita diabetes diberi suntikan insulin yang diperoleh dari hewan.
Tetapi karena permintaan yang besar dan juga masalah kompatibilitas (karena itu
bukan berasal dari manusia), ada kebutuhan untuk beberapa sumber insulin
manusia lainnya. Kemudian teknik rDNA yang melibatkan bakteri E.coli diadopsi
untuk menghasilkan insulin manusia dalam jumlah besar yang bahkan aman.

60
 (1) Produksi Obat Obatan
• Enzim seperti streptokinase yang membantu dalam pemecahan bekuan
diperoleh dari bakteri.
• Vaksin adalah obat-obatan yang membantu mencegah penyakit dan infeksi
di masa depan. Ada berbagai jenis vaksin dan vaksin hidup dan mati yang
diproduksi dari bakteri.
• Vitamin seperti vitamin B-12 (cyanocobalamin) diperoleh dari fermentasi
bakteri dari bakteri yang dimodifikasi secara genetik.

61
 (2) Sterilisasi Obat yang diproduksi
• Obat yang diproduksi memiliki tanggal kedaluwarsa. Tanggal kadaluwarsa
ini menunjukkan sampai kapan obat tersebut aktif. Kehadiran
mikroorganisme dapat meningkatkan degradasi obat. Juga, kehadiran
mereka dapat menyebabkan infeksi baru pada pasien ketika diberikan.
• Oleh karena itu obat-obatan harus dijaga bebas dari segala bentuk
organisme hidup. Sterilisasi benar-benar mencapai ini dan menghancurkan
semua jenis mikroba.
• Sterilisasi sudah pernah di berikan pada bab sebelumnya…..

62
 (3) Penemuan Obat Baru
• Banyak obat baru dalam pencarian dengan menggunakan mikrobiologi.
Karena banyak antibiotik, enzim dll berasal dari mikroba; tetap saja,
mikroorganisme menjadi sumber lebih banyak obat baru.

63
 Bingung ih….
Biar ndak bingung…Yuk Bikin ringkasan tentang
materi Mikrobiologi Terapan diatas dengan
menggunakan diagram yang mudah dipahami oleh
kalian sendiri. Boleh soft copy atau tulis tangan…
(Paling lambat jam 12.00 hari ini ya teman
teman…….)

Tugas Hari ini …..

TERIMAKASIH