WISDAYANTI
N012211024
PROGRAM PASCASARJANA
UNIVERSITAS HASANUDDIN
MAKASSAR
2022
BAB I
PENDAHULUAN
A. LATAR BELAKANG
Strategi omics telah digunakan dalam sistem biologis yang berbeda untuk
mewakili semua protein yang diekspresikan dalam sel, jaringan, atau organisme,
transkrip RNA, dan metabolom dengan metabolit. Dalam konteks ini, area Omics
baru ini, istilah baru telah diperkenalkan yang mengacu pada area baru
dan glikomik sebagai bagian dari metabolomik atau degradomik sebagai bagian
dari proteomik. Fokus utama artikel ini adalah pada metabolomik - analisis
yang terkandung dalam makhluk hidup pada suatu waktu yang spesifik.
Mass Spectrometry) yang mempunyai resolusi tinggi dan dapat mengukur jumlah
metabolit yang besar secara baik (Simoh et al. 2014) dan digunakan untuk
membuat profil metabolit sekunder pada metabolomik tumbuhan (Okazaki dan
200,000 jenis dengan diversitas yang sangat luas. Jika dibandingkan dengan
molekul lain yang juga diidentifikasi secara omik atau menyeluruh seperti DNA,
RNA, dan protein maka metabolit terdiri atas lebih banyak grup yang heterogen
berdasarkan komponen kimia dan fisika serta bervariasi sangat luas dalam
Salah satu tumbuhan obat yang telah dimanfaatkan dan teruji sebagai
pinang (Areca cathecu Linn). Dari penelitian yang telah dilakukan oleh Meiyanto
(2008), menunjukkan bahwa biji pinang berpotensi sebagai anti kanker. Ekstrak
apoptosis sel kanker payudara. Biji buah pinang mengandung alkaloid, seperti
flavan, senyawa fenolik, asam galat, getah, lignin, minyak menguap dan tidak
menguap, serta garam. Merujuk dari potensi anti kanker yang dimiliki oleh
Arecaceae yang lain. Pada penelitian ini dilakukan pengujian terhadap potensi
anti kanker spesies pinang merah atau Areca vestiaria Giseke. Pemanfaatan
pinang merah selama ini sebagian besar digunakan sebagai tanaman hias. Biji
pinang merah secara empiris oleh masyarakat suku Bolang Mongondow Sulawesi
sebagai zat berpotensi anti kanker pada pinang merah adalah tanin, flavonoid,
dan triterpenoid. Flavonoid dan tanin termasuk dalam golongan senyawa fenolik.
dkk., 2017).
meneliti analisis metabolomik pada biji pinang (Areca catechu) dan melihat
antikanker payudara.
B. RUMUSAN MASALAH
Berdasarkan latar belakang yang telah diuraikan, maka rumusan masalah
dalam penelitian ini yaitu:
1. Bagaimana uji analisis metabolomik pada pinang (Areca catechu)?
2. Bagaimana aktivitas antikanker payudara pada pinang (Areca catechu)
terhadap sel kanker MCF-7?
C. TUJUAN
D. MANFAAT
1. Manfaat Praktis
Penelitian ini diharapkan dapat memberikan informasi kepada
masyarakat terhadap potensi aktivitas antikanker payudara pada pinang
terhadap sel kanker MCF-7
2. Manfaat Ilmiah
Penelitian ini diharapka dapat memberikan kontribusi ilmiah sehingga
dapat dijadikan referensi dalam penemuan atau pengembangan obat
antikanker payudara
E. DEFINISI/ISTILAH
seluruh metabolit yang ada pada suatu organisme atau suatu sistem biologi
4. Sel MCF-7 : Salah satu model sel yang umum digunakan untuk uji efek
A. Metabolomik
1. Sejarah Singkat Metabolomik dan Relevansinya dalam Sistem Biologi
strategi hanya menyediakan data yang terbatas mengingat target biomolekul dan
strategi omics menyebabkan revolusi nyata di bidang ilmiah ini, dan saat ini
mereka banyak digunakan dalam sistem biologi. Strategi omics bertujuan untuk
menghasilkan sejumlah besar data yang dievaluasi oleh alat biostatistik dan
sebagai akibat dari penghapusan atau ekspresi berlebih suatu gen. Metabolome
Oleh karena itu digunakan untuk mengatasi seluruh rangkaian metabolit yang
oleh Fiehn sebagai analisis kuantitatif dan komprehensif dari semua metabolit
dari sistem biologis yang diteliti. Sebelumnya, pada tahun 1999, Nicholson et al.
endogen yang mungkin dihasilkan dari proses penyakit, toksisitas obat, atau
fungsi gen telah dievaluasi dalam sel, jaringan, atau cairan biologis dengan
dari sel, jaringan atau seluruh organisme. Menurut Lindon dkk., metabolomik
modifikasi genetik'. Metabolomik adalah teknik hemat biaya, kurang padat karya
2. Analisis Metabolomik
yang terkandung dalam makhluk hidup pada suatu waktu yang spesifik
diketahui dan mewakili jalur spesifik atau kelas molekul. Metabolomik yang tidak
dan waktu yang dibutuhkan untuk memproses data yang dihasilkan (Braga and
Adamec 2018).
bertarget vs tidak bertarget), jenis sampel (cairan biologis, jaringan, sel, dan/atau
organisme utuh), ukuran sampel (jumlah spesimen yang akan dinilai), kondisi
percobaan untuk sampel mana yang akan diserahkan, frekuensi pengumpulan
biasanya lebih disukai untuk penyimpanan jangka panjang cairan biologis) [23],
platform analitik yang akan digunakan, dan juga strategi persiapan sampel
semuanya harus ditentukan pada saat ini, karena entah bagaimana mereka saling
terkait [24]. Penting untuk ditekankan bahwa studi metabolomik selalu bersifat
komparatif; oleh karena itu, sekelompok sampel kontrol (sampel yang tidak
melakukan kondisi yang diselidiki) dan sampel uji (yang membawa informasi
terkait erat dengan jenis sampel (apakah itu sel, jaringan, atau cairan biologis),
pendekatan metabolomik yang dipilih (analisis bertarget vs. tidak bertarget), dan
kromatografi gas dari biofluida dan ekstrak sel/ jaringan menuntut langkah-
adduct yang mudah menguap [26]. Langkah-langkah ini memakan waktu dan
b. Akuisisi data.
tantangan analitis yang besar karena banyaknya variasi komposisi kimia yang
ditunjukkan oleh sampel biologis, mulai dari senyawa dengan sifat kimia yang
berbeda. Penting untuk ditekankan bahwa saat ini tidak ada platform analitik
serta rentang dinamisnya yang luas, menuntut agar teknik analisis yang berbeda
c. Pengelolah data
jenis platform analitik yang digunakan. Untuk NMR, pengolahan data meliputi
algoritme, seperti PERCH (PERCH Solution Ltd.), Chenomx NMR Suite (Chenomx
(Bruker Corp.), dan MATLAB (The MathWorks Inc.), secara rutin digunakan.
Untuk teknik MS yang ditulis dgn tanda penghubung, pengolahan data mencakup
Beberapa akses gratis dan perangkat lunak berpemilik tersedia untuk memproses
data MS seperti yang dibahas secara komparatif oleh Sugimoto et al. : XCMS,
Mass Profiler Professional (MPP, Agilent Technologies), MZmine, MetAlign,
d. Analisis statistik
Analisis multivariat, yang terdiri dari metode tanpa pengawasan, seperti analisis
laten (OPLS-DA), sering digunakan untuk gambaran umum dan klasifikasi sampel.
divalidasi, yang dilakukan dengan prosedur validasi silang dan uji permutasi
e. Identifikasi metabolit
NMR Suite (Chenomx Inc.), termasuk yang paling sering diakses. MassTRIX juga
konfirmasi harus dilakukan. Hal ini dapat dicapai dengan teknik spiking dengan
standar otentik diikuti dengan perbandingan pola fragmentasi antara sampel dan
dicari. Beberapa database tersedia untuk tujuan ini: KEGG, MetaCyc, SMPDB,
MetaboLights, dan Reaktom, diantara yang lain. Untuk rincian informasi yang
dikompilasi dalam database, review Karp dan Caspi dapat dikonsultasikan. Ketika
alasan dapat diuraikan dalam upaya untuk menjawab pertanyaan biologis asli
g. Validasi biologis
dalam kumpulan sampel yang sama (validasi internal). Validasi biologis juga
dapat dicapai dengan studi spesifik independen yang dilakukan dengan metabolit
diskriminan yang ditemukan dalam studi metabolomik asli. Ganti dkk. melakukan
kanker ginjal dan subjek kontrol yang mengungkapkan tingkat tinggi asilkarnitin
yang terkait dengan status kanker dan tingkat kanker ginjal. Studi ini kemudian
B. KANKER
gumpalan atau massa. Sebagian besar kanker payudara dimulai pada lobulus
(kelenjar susu) atau di saluran yang menghubungkan lobulus ke putting. Dalam
beberapa kasus, tumor menginfiltrasi kulit atau komponen dinding dada seperti
otot pektoralis. Sel tumor juga mampu mengubah lingkungan mikro menjadi
pertumbuhan kanker terbatas pada duktus atau lobulus yang umumnya tidak
organ lain di dalam tubuh (metastasis jauh). Kanker payudara biasanya tidak
memiliki gejala ketika tumor kecil dan paling mudah dirawat, itulah sebabnya
skrining penting untuk deteksi dini. Yang paling umum tanda fisik adalah
getah bening ketiak dan menyebabkan benjolan atau bengkak, bahkan sebelum
tumor payudara aslinya besar cukup untuk dirasakan. Tanda dan gejala yang
1. Tahap in situ (stadium nol) mengacu pada adanya kelainan sel yang terbatas
4. Stadium jauh mengacu pada kanker yang telah menyebar ke organ jauh
tulang selangka.
IB Nodal micrometastases.
invasi kulit.
penyebab utama kematian akibat kanker di kalangan wanita, terhitung 23% dari
total kasus kanker dan 14% dari kematian akibat kanker; Oleh karena itu,
penelitian di bidang ini penting untuk mengatasi keduanya beban ekonomi dan
psikologis. Dalam beberapa tahun terakhir ini telah menjadi jelas bahwa kanker
berbeda tumor yang berasal dari sel epitel payudara Garis sel tampaknya
menjadi elemen kunci untuk molekul diagnosis pada kanker payudara karena
kanker payudara, sel MCF-7 mewakili kandidat yang sangat penting saat
percobaan sel kanker payudara dan banyak sub-klon (Comsa, Serban et al.,
2015).
beberapa kelompok dan terbukti menjadi garis sel model yang cocok untuk
pengetahuan praktis untuk perawatan pasien daripada payudara lainnya garis sel
kanker. Ini adalah ER-positif dan progesterone reseptor (PR)- ositif dan milik
luminal A subtipe molekul. MCF-7 adalah garis sel yang kurang agresif dan non-
C. KERANGKA KONSEPTUAL
Preparasi sampel
Identifikasi metabolomik
(penentuan target
metebolomik)
D. DEFINISI OPERASIONAL
1. Analisis metabolomik: pendekatan awal yang kuat untuk mengetahui
3. Kanker payudara: suatu jenis tumor ganas yang berkembang pada sel-sel
payudara
5. Uji toksistas: uji toksisitas secara in vitro menggunakan kultur sel yang
senyawa
BAB III
METODE PENELITIAN
A. RANCANGAN PENELITIAN
Penelitian ini merupakan penelitian kuantitatif dengan desain penelitian
eksperimen laboratorium.
B. WAKTU DAN LOKASI PENELITIAN
Penelitian ini dilakukan pada Juli-September 2022 di laboratorium Kimia
Farmasi Universitas Hasanuddin dan laboratorium pusat penelitian LIPI (Lembaga
Ilmu Pengetahuan Indonesia).
C. ALAT DAN BAHAN
1. Alat
Alat-alat yang digunakan dalam penelitian ini adalah gelas kimia (pirex),
pipet tetes, lempeng, silica, chamber, alat Soxhlet, oven, incubator,
2. Bahan
Bahan yang digunakan dalam penelitian ini adalah ekstrak biji buah
pinang (areca catechu), etanol, FeCl3, rotary evaporator, kloroform, metanol,
Dragendorf, arekolin.
D. METODE KERJA
1. Preparasi sampel
Matabing, Kec. Larompong, Kab. Luwu. Biji buah pinang dicuci bersih, dipotong-
potong dan dikeringkan dalam oven dengan suhu 70°C. Simplisia yang telah
2. Identifikasi Profil
dilakukan dengan menggunakan Kromatografi Lapis Tipis (KLT) dengan fase diam
silika gel GF254 dan fase gerak Kloroform:Metanol (1:3). Deteksi adanya senyawa
fenolik dilakukan dengan penyemprotan FeCl3 dan memberikan hasil positif bila
bercak mengalami pemadaman pada 254 nm dan fluorosensi pada 366. Deteksi
3. Analisis Metabolomik
dilakukan pada 30 m SPB-50 kolom dengan 0,25 mm diameter dalam dan 0,25
µm ketebalan film (Supelco, Bellfonte, CA, USA). Suhu injeksi adalah 230o C,
antarmuka set untuk 250o C dan scource ion disesuaikan dengan suhu 200o C.
Gas pembawa yang digunakan adalah helium ditetapkan pada laju aliran konstan
diikuti dengan 5o C min-1 jalan suhu oven untuk 310o C dan 1 menit akhir
sebelum injeksi sampel berikutnya. Spektrum massa tercatat di dua scan per
detik dengan m/z 50- 600 kisaran pemindaian. Kromatogram dan spektrum
massa dievaluasi menggunakan program MASSLAB (TermoQuest, Mancester,
UK). Waktu retensi dan spektral massa untuk puncak kuantifikasi otomatis
4. Uji sitotoksik
Sel yang digunakan pada penelitian ini adalah sel MCF-7 koleksi Cancer
dan ditumbuhkan pada medium DMEM (Gibco) dengan 10% FBS (Gibco) dan 1%
PenicillinStreptomycin (Gibco).
mendapatkan pertumbuhan yang baik. Setelah itu medium diganti dengan yang
berbagai konsentrasi dengan cosolvent DMSO (Sigma) dan diinkubasi pada 37ºC
dalam inkubator CO2 5% selama 48 jam. Pada akhir inkubasi, media dan ekstrak
dibuang kemudian sel dicuci dengan PBS (Sigma). Pada masing-masing sumuran,
ditambahkan 100µL media kultur dan 10µL MTT (Sigma) 5 mg/mL. Sel diinkubasi
kembali selama 4-6 jam dalam inkubator CO2 5%, 37ºC. Reaksi MTT dihentikan
Serapan dibaca dengan ELISA reader (Bencmark Bio Rad) pada panjang
Braga, Camila Pereira, and Jiri Adamec. 2018. “Metabolome Analysis.” Pp. 463–
75 in Encyclopedia of Bioinformatics and Computational Biology: ABC of
Bioinformatics. Vols. 1–3. Elsevier.
Comsa, Serban et al., 2015. The Story of MCF-7 Breast Cancer Cell Line: 40 years
of Experience in Research. University of Medicine and Pharmacy,
Department of Histology, Angiogenesis Research Center, Timişoara,
Romania.
Feng Y, Spezia M, Huang S et al., 2018. Breast cancer development and
progression: Risk factors, cancer stem cells, signaling pathways, genomics,
and molecular pathogenesis.
Klassen, Aline, Andréa Tedesco Faccio, Gisele André Baptista Canuto, Pedro Luis
Rocha da Cruz, Henrique Caracho Ribeiro, Marina Franco Maggi Tavares,
and Alessandra Sussulini. 2017. “Metabolomics: Definitions and
Significance in Systems Biology.” Pp. 3–17 in Advances in Experimental
Medicine and Biology. Vol. 965. Springer New York LLC.
Ranjan, Renuka, and Neeraj Sinha. 2019. “Nuclear Magnetic Resonance (NMR)-
Based Metabolomics for Cancer Research.” NMR in Biomedicine 32(10):1–
21.
Yudistira, Adithya. 2017. “Uji Aktivitas Anti Kanker Payudara Ekstrak Daun Pinang
Yaki ( Areca Vestiaria Giseke.) Terhadap Sel Kanker Payudara T47D.”
Pharmacon 6(4).