UNIVERSITAS NUSA CENDANA Kode / Rev.

FAKULTAS SAINS DAN TEKNIK

PROGRAM STUDI BIOLOGI
RENCANA PEMBELAJARAN SEMESTER (RPS)
MATA KULIAH (MK) KODE MK RUMPUN MK BOBOT (sks) SEMESTER Tgl Penyusunan/revisi
Biokomputasi STBIO 41206 Biologi 2 I 01 Agustus 2023
OTORISASI / PENGESAHAN Dosen Pengembang RPS Kordinator RPM Kordinator Program Studi

Dr. Refli., MSc Vinsensius Manek-Ati., SPt., MSi Andriani Ninda Momo, SSi., MP
NIP. 19650526 199103 1 002 NIP. 19720606 199903 1 002 NIP. 19820928 200812 2 001
Capaian CPL-PRODI yang dibebankan pada MK
Pembelajaran Lulusan CPL-S6 Bekerja sama dan memiliki kepekaan sosial serta kepedulian terhadap masyarakat dan lingkungan
(CPL) CPL-S8 Menginternalisasi nilai, norma, dan etika akademik
CPL-S9 Menunjukkan sikap bertanggungjawab atas pekerjaan di bidang keahliannya secara mandiri
CPL-PP5 Menguasai prinsip dasar piranti lunak untuk analisis dan sintesis sumber daya hayati dalam lingkup spesifik
CPL-PP6 Menguasai pengetahuan faktual tentang teknologi mutakhir di bidang analisis, sintesis, dan bioteknologi sumber daya hayati

CPL-KK1 Mampu menyelesaikan masalah iptek di bidang pengelolaan dan pemanfaatan sumber daya hayati melalui prinsip-prinsip pengorganisasian sistematika, memprediksi,
menganalisis data, informasi dan bahan hayati serta memodulasi struktur dan fungsi sel (organizing principle, predicting, analyzing and modulating), serta penerapan
teknologi yang relevan
CPL-KU2 Mampu menunjukkan kinerja mandiri, bermutu, dan terukur

Capaian Pembelajaran Mata Kuliah (CPMK)

CPMK Dapat mampu menelusuri, manemukan berbagai informasi biologi pada sumber-sumber data dan memanfaatkannya bagi kebutuhan ilmu pengetahuan
melalui penggunaan aplikasi yang relevan
Sub-CPMK-1. Mahasiswa mampu memngoperasikan aplikasi SPPS sesuai tujuan analisis data
Sub-CPMK-2. Mahasiswa mampu mencari Sumber-data Bioinformatika
Sub-CPMK-3. Mahasiswa mampu menelusuri dan menemukan informasi genom suatu spesies dari program NCBI
Sub-CPMK-4. Mahasiswa mampu menelusuri dan menemukan sekuens gen dari program NCBI
Sub-CPMK-5. Mahasiswa mampu menelusuri dan menemukan protein dan urutan asam-asam aminonya melalui situs NCBI
Sub-CPMK-6. Mahasiswa mampu menelusuri dan menguraikan Protein dan urutan asam-asam aminonya melalui situs UniProt
 Sub-CPMK-7. Mahasiswa mampu menjalankan Uji BLAST
Sub-CPMK-8. Mahasiswa mampu menelusuri dan menganalisis nilai kemiripan, gap, match dan unmacth urutan basa dari suatu gen baik dari spesies yang sama maupun
spsies berbeda
Sub-CPMK-9. Mahasiswa mampu menelusuri dan menganalisis nilai kemiripan, gap, match dan unmacth urutan asam-asam amino dari suatu protein baik dari spesies yang
sama maupun spsies berbeda
Sub CPMK-10. Mahasiswa mampu menelusuri dan mengungkapkan Jalur metabolisme melalui situs tersedia
Sub CPMK-11. Mahasiswa mampu mendesain primer suatu gen dengan aplikasi Primer3

Sub CPMK-12. Mahasiswa mampu membuat pohon filogenetik dengan aplikasi Mega
Diskripsi Singkat Pada matakuliah ini mahasiswa belajar tentang penggunaan aplikasi untuk analisis data penenlitian, memilih dan menelussuri sumber data bioinformati antara lain; NCBI, UniProt, KEGG,
MK GENOM.JP, METACY, mampu menelusuru gen dan protein beserta urutannnya, melakukan uji BLAST, menentukan kemiripan, gap, match dan unmacth urutan basa nitrogen gen atau
urutan asam amino pada protein pada spesies yang sama dan berbeda, mampu menelusuri jalur metabolisme, mendesain primer dan menggunakan aplikai mega untuk menentuk
kekerabatan inter spesies dan antar spesies.

Bahan Kajian: Materi 1. Aplkasi SPPS dan fungsinya

pembelajaran 2. Sumber Data Bioinformatika
3. Penelusuran Informasi Genom melalui NCBI
4. Penelusuran Informasi gen melalui NCBI
5. Penelusuran Informasi Protein dan urutan asam amino melalui NCBI
6. Penelusuran Protein dan urutan asam-asam aminonya melalui situs Uni Pro
7. Uji BLAST
8. Nilai kemiripan, gap, match dan unmacth urutan basa nitrogen gen pada spesies yang sama dan berbeda
9. Nilai kemiripan, gap, mtach dan unmacth urutan urutan asam amino suatu protein pada spesies yang sama dan berbeda
10. Penelusuran Jalur Metabolisme
11. Desain Primer dengan aplikan Primer3
12. Aplikasi MEGA dan pohon filogenetik
Referensi UTAMA:
1. Alberts, Johnson, Lewis, Raff, Roberts, Walter. 2016. Molecular Biology of the Cell (MBC). 6th edition. Garland science, Taylor & Francis Group
2. Karp. G. 2016. Cell and Molecular Biology. 8th edition. John Wiley & Sons, Inc
3. Wearver, R.F. 2012. Molecular Biology, 5th edition. The McGraw-Hill Companies, Inc
4. Allison L. A. Fundamental Molecular Biology. 1st ed. Blackwell Publishing Ltd. Carlton, Victoria 3053, Australia

PENDUKUNG:

1. Waite, G. N dan Waite, L.R 2007. Applied Cell and Molecular Biology for Engineers by The Mcgraw-Hill Companies

Media Pembelajaran Perangkat Luna: Google Meet, Aplikasi Mega 8; SPSS v.25 Perangkat keras: Whiteboard, spidol, LCD, pointer
Dosen Pengampu Dr. Refli., MSc; Drs. Djeffry Amalo., MPd; Dr. Ir. Alfred Dima., MSi
 Bahan kajian / Bobot
Bentuk Pembelajaran; Metode Pembelajaran; Penugasan; Materi
Minggu Penilaian Penilaia
Sub-CPMK [ Estimasi Waktu] Pembelajaran n (%)
Ke-
[Pustaka]
Indikator Kriteria & Bentuk Tatap muka/Luring Daring
(1) (2) (3) (4) (5) (6) (7) (8)
1 Sub-CPMK-1. Mahasiswa mampu Kriteria: Metode: Link: 1. Aplikasi SPPS 9
Mahasiswa mampu menjalankan aplikasi  Pedoman  Demonstrasi Siadikno 1.1. Pengenalan
memngoperasikan untuk melakukan: penskoran a. Dosen memperkenalkan aplikasi SPPS serta menjelaskan na.undan fungsi SPSS
aplikasi SPPS sesuai 1. Analisis deskriptif (X, Bentuk non test: manfaat dalam Bidang Biologi? a.ac.id 1.2. Analisis
tujuan analisis data SD, SE)  Penilaian b. Demonstrasi penggunaan aplikasi SPPS dilaksananakan deskriptif
2. Analisis Parametrik (T- keaktifan, inisiatif, dengan tahapan:: 1.3. Analisis
test & Anova one way) kerjasama dan 1) Membuka aplikasi SPPS Parametrik
komunikasi pada 2) Menjelaskan dan menjalankan fungsi pengisian data 1.3.1. t-Test
saat perkuliahan 3) Menjelaskan dan menjalankan fungsi pengolahan 1.3.2. Anova
data (Analisis deskriptif, t-Test, Anova one way)
4) Menginteprestasi hasil analisis data Pustaka:
5) Membuat kesimpulan hasil analisis  Program Aplikasi
6) Memberikan kesempatan kepada mahasiswa SPSS V. 25,
melakukan praktik penggunaan aplikasi SPPS Chicago, Ilinois,
berbasis case methode USA
 Case method
a. Mengumpulkan data yang bersumber dari Dokumen
Skripsi pada Program Studi Biologi FST Undana :
1) Lakukan analisis univariat dan jelaskan hasil analisis
(Kelompok 1)
2) Lakukan analisis bivariat (T-Test) dan jelaskan hasil
analisis (Kelompok 2)
3) Lakukan analisis bivariat (korelasi ) dan jelaskan hasil
analisis (Kelompok 3)
4) Lakukan analisis bivariat (regresi) dan jelaskan hasil
analisis (Kelompok 4)
5) Lakukan analisis bivariat (Anova satu arah ) dan
jelaskan hasil analisis (Kelompok 5)
6) Lakukan analisis bivariat (Anova 2-arah) dan jelaskan
hasil analisis (Kelompok 6)
b. Sesudah tahap analisis dan pembuatan laporan, setiap
kelompok melakukan presentasi di kelas yang dimoderasi
oleh seorang mahasiswa yang ditugaskan.
c. Seluruh pertanyaan, saran dan hasil tanggapan dalam
dalam diskusi kelas dicatat oleh notulis yang ditugaskan
dan selanjutnya didistribusi ke megia group WA kelas.
 Bahan kajian / Bobot
Bentuk Pembelajaran; Metode Pembelajaran; Penugasan; Materi
Minggu Penilaian Penilaia
Sub-CPMK [ Estimasi Waktu] Pembelajaran n (%)
Ke-
[Pustaka]
Indikator Kriteria & Bentuk Tatap muka/Luring Daring
(1) (2) (3) (4) (5) (6) (7) (8)

Waktu:
 TM= 2 x 50 menit
 PT= 1 x 60 menit
 BK = 1 x 60 menit
 Bahan kajian / Bobot
Bentuk Pembelajaran; Metode Pembelajaran; Penugasan; Materi
Minggu Penilaian Penilaia
Sub-CPMK [ Estimasi Waktu] Pembelajaran n (%)
Ke-
[Pustaka]
Indikator Kriteria & Bentuk Tatap muka/Luring Daring
(1) (2) (3) (4) (5) (6) (7) (8)
2 Sub-CPMK-2. . Mahasiswa mampu: Kriteria: Metode: - 2. Sumber Data 6
Mahasiswa mampu 1. Menjelaskan pengertian  Pedoman  Ceramah Bioinformatika
menjelaskan sumber-data bioinformatika penskoran a. Menjelaskan pengertian, manfaat serta sumber data 2.1. NCBI
bioinformatika 2. Memberikan contoh bioinformatika yang tersedia dalam Big Data. 2.2. UniProt
data-data bioinformatika Bentuk Test:  Penugasan Kelompok 2.3. KEGG
3. Menyebutkan sumber-  Makalah a. Setiap mahasiswa secara berkelompok ditugaskan
sumber data untuk menelusuri situs data bioinformasi Referensi Link:
 Dokumen
bioinformatika Presentasi Kelompok 1. NCBI https://www.ncbi.nl
Kelompok 2. UniProt m.nih.gov/
Kelompok 3. KEGG
Adapun substansi Tugas adalah https://www.uniprot
- Asal negara lembaga penyaji data .org
bioinformatika
- Jenis data biinformatika yang dapat diakses
b. Hasil penulusuran dipresentasikan di depan kelas yang
dimoderasi oleh mahasiswa
c. Diskusi dan tanya jawab dilagsunkan. Seluruh
pertanyaan dicatat oleh notulis
Waktu:
 TK= 2 x 50 menit
 PT= 1 x 60 menit
 BM = 1 x 60 menit
 Bahan kajian / Bobot
Bentuk Pembelajaran; Metode Pembelajaran; Penugasan; Materi
Minggu Penilaian Penilaia
Sub-CPMK [ Estimasi Waktu] Pembelajaran n (%)
Ke-
[Pustaka]
Indikator Kriteria & Bentuk Tatap muka/Luring Daring
(1) (2) (3) (4) (5) (6) (7) (8)
3 Sub-CPMK-3. Mahasiswa Mahasiswa mampu dan Kriteria: Metode: - 3. Penelusuran 9
mampu menelusuri dan secara benar  Pedoman  Ceramah informasi genom
menemukan informasi  Melakukan penelusuran penskoran Mengarahkan mahasiswa dalam penelusuran informasi melalui situs NCBI
genom suatu spesies dari genom suatu spesies genom.
program NCBI terpilih melalui NCBI Bentuk Non Test:  Case method Link NCBI
 Menjelaskan bentuk,  Makalah Pada perkuliahan ini, mahasiswa diarahkan untuk https://www.ncbi.nlm.
sekuens dan jumlah  menelusuri dan menemukan bentuk, sekuens dan jumlah nih.gov/
pasang basa, ID number pasang basa, ID number dan author dari genom. Genom
dan author dari genom: yang ditelusuri dan berasal dari
yang dtelusuri dari a. Mitokondria Homo sapiens (Kelompok 1)
spesies terpilih b. Mitokondria Oryza sativa L. (Kelompok 2)
c. Kloroplas Oryza sativa L (Kelompok 3)
d. Nukleus Homo sapiens (Kelompok 4)
e. Escherecia coli (Kelompok 5)
f. Virus covid (Kelompok 6)
 Hasil penelusuran dari dipresentasikan oleh setiap
kelompok yang dimoderasi oleh seorang mahasiswa yang
tidak sedang presentasi
 Seluruh kegiatan dan hasil dicatat oleh notulis yang
ditugaskan

Waktu:
 TK = 2x 50 menit
 PT = ;1 x 60 menit
 PM = 1 x 60 menit
 Bahan kajian / Bobot
Bentuk Pembelajaran; Metode Pembelajaran; Penugasan; Materi
Minggu Penilaian Penilaia
Sub-CPMK [ Estimasi Waktu] Pembelajaran n (%)
Ke-
[Pustaka]
Indikator Kriteria & Bentuk Tatap muka/Luring Daring
(1) (2) (3) (4) (5) (6) (7) (8)
4-5 Sub-CPMK-4. Mahasiswa Mahasiswa mampu dan Kriteria: Metode: Link: 4. Penelusuran 10
mampu menelusuri dan secara benar  Pedoman  Ceramah - Informasi gen
menemukan sekuens  menemukan gen dari penskoran Menjelaskan pengertian, manfaat serta sumber data melalui NCBI
gen dari program NCBI spesies yang akan dikaji Bentuk test: bioinformatika yang tersedia dalam Big Data.
 menjelaskan sekuens  Kuis  Case method
dan jumlah pasang Bentuk non test: Pada perkuliahan ini, mahasiswa diarahkan untuk Referensi Link
basa, ID number dan  Makalah menemukan bentuk, sekuens dan jumlah pasang basa, ID https://www.ncbi.nl
author dari gen: yang number dan author dari gen: m.nih.gov/
ditemukan dari spesies a. Actin pada Homo sapiens (Kelompok 1)
terpilih b. Actin pada Gorylla (Kelompok 2)
c. Actin pada Oryza sativa L. (Kelompok (3)
d. Actin pada Sorghum bicolor L (Kelompok 4)
 Prestasi dan diskusi hasil penugasan kelompok yang
diarahkan oleh seorang moderator yang ditugaskan
 Seluruh kegiatan dan hasil dicatat oleh notulis yang
ditugaskan

6 Sub-CPMK-5 Mahasiswa Mahasiswa mampu dan Kriteria: Metode: 5. Penelusuran 10

mampu mencari dan secara benar  Pedoman  Ceramah Protein dan urutan
menemukan protein dan  Menemukan suatu penskoran Mengarahkan mahasiswa dalam melaksanakan tugas asam amino
urutan asam-asam protein melalui NCBI Bentuk test: kelompok .terkait protepengungkapan urutan dan jumlah melalui NCBI
aminonya melalui situs  Menjelaskan urutan  Kuis asam amino dari suatu protein terpilih
NCBI asam-asam amino dari Bentuk non test:  Case method . Protein yang akan ditelusuhi guna Referensi Link
protein yang ditelusuri  Presentase mengetahui urutan asam amino dan jumlhanya dari NCBI: https://www.ncbi.nl
a. Rubisco pada jagung (Kelompok 1) m.nih.gov/
b. Rubisco pada kedele (Kelompok 2)
c. Rubisco pada kentang (Kelompok 3)
d. Insulin pada manusia (Kelompok 4)
e. Insulin pada Monyet (Kelomok 5)
f. Insulin pada Babi (Kelompok 6)
 Presentasi dan diskusi hasil penugasan kelompok yang
diarahkan oleh seorang moderator yang ditugaskan
 Seluruh kegiatan dan hasil dicatat oleh notulis yang
ditugaskan
 Bahan kajian / Bobot
Bentuk Pembelajaran; Metode Pembelajaran; Penugasan; Materi
Minggu Penilaian Penilaia
Sub-CPMK [ Estimasi Waktu] Pembelajaran n (%)
Ke-
[Pustaka]
Indikator Kriteria & Bentuk Tatap muka/Luring Daring
(1) (2) (3) (4) (5) (6) (7) (8)
7 Sub-CPMK-6 Mahasiswa Mahasiswa mampu dan Kriteria: Metode: 6. Penelusuran 10
mampu menelusuri dan secara benar  Pedoman  Ceramah Protein dan urutan
menemukan protein dan  Menemukan suatu penskoran Mengarahkan mahasiswa dalam melaksanakan tugas asam-asam
urutan asam-asam protein melalui UniProt Bentuk non test: kelompok .terkait protepengungkapan urutan dan jumlah aminonya melalui
aminonya melalui situs  Menjelaskan urutan  Makalah asam amino dari suatu protein terpilih situs Uni Prot
UniProt asam-asam amino dari  Presentase  Case method . Protein yang akan ditelusuhi guna Referensi:
protein yang ditelusuri mengetahui urutan asam amino dan jumlhanya dari NCBI: Link
a. Piruvat dekarboksilase pada jagung (Kelompok 1) https://www.uniprot
b. Piruvat dekarboksilase pada kedele (Kelompok 2) .org
c. Piruvat dekarboksilase pada kentang (Kelompok 3)
d. Glukagon pada manusia (Kelompok 4)
e. Glukagon pada Monyet (Kelomok 5)
f. Glukagon pada Babi (Kelompok 6)
 Presentasi dan diskusi hasil penugasan kelompok yang
diarahkan oleh seorang moderator yang ditugaskan
 Seluruh kegiatan dan hasil dicatat oleh notulis yang
ditugaskan

 TM = 2 x 50 menit
 PT = 1 x 60 menit
 BM = 1 x 60 menit

8
 UJIAN TENGAH SEMESTER
 Bahan kajian / Bobot
Bentuk Pembelajaran; Metode Pembelajaran; Penugasan; Materi
Minggu Penilaian Penilaia
Sub-CPMK [ Estimasi Waktu] Pembelajaran n (%)
Ke-
[Pustaka]
Indikator Kriteria & Bentuk Tatap muka/Luring Daring
(1) (2) (3) (4) (5) (6) (7) (8)
9-10 Sub CPMK 7: Mahasiswa Mahasiswa mampu dan Kriteria:  Ceramah - 7. Uji Blast 10
mampu menjalankan Uji secara benar  Pedoman Memberi penjelasan singkat ke mahasiswa
BLAST  Melakukan dan penskoran a. Bagaimana langkah penggunaan aplikasi BLAST
menunjukkan hasil uji Bentuk non test: b. Tugas kelompok serta hal penting yang perlu dicapai Referensi:
BLAST terhadap gen-  Makalah dalam penugasan.. Link NCBI
gen atau protein dari  Presentase c. Menyampaikan tema tugas yang harus diselesaikan https://www.ncbi.nl
spesies terpilih secara kelompok m.nih.gov/
 Case method . Bagaimana cara melakukan uji BLAST
terhadap gen dan protein dari spesies terpilih . Jenis gen https://www.uniprot
dan protein yang akan diuji BLAST: .org
a. Gen Piruvat dekarboksilase pada jagung, padi,
sorgum, jewawut, kentang, tomat, kedele dan kacang
tanah (Kelompok 1)
b. Protein Piruvat dekarboksilase pada jagung, padi,
sorgum, jewawut, kentang, tomat, kedele dan kacang
tanah (Kelompok 2),
c. Gen glukagon pada manusia, kera, gorila, sapi, domba,
kambing, kucing dan tikus (Kelompok 3)
d. Protein glukagon pada manusia, kera, gorila sapi, ,
domba, kambing, kucing dan tikus (Kelompok 4)
 Presentasi dan diskusi hasil penugasan kelompok yang
diarahkan oleh seorang moderator yang ditugaskan
 Seluruh kegiatan dan hasil dicatat oleh notulis yang
ditugaskan
 TK = 4 x 50 menit
 PT = 2 x 60 menit
 BM = 2x 60 menit
 Bahan kajian / Bobot
Bentuk Pembelajaran; Metode Pembelajaran; Penugasan; Materi
Minggu Penilaian Penilaia
Sub-CPMK [ Estimasi Waktu] Pembelajaran n (%)
Ke-
[Pustaka]
Indikator Kriteria & Bentuk Tatap muka/Luring Daring
(1) (2) (3) (4) (5) (6) (7) (8)
11 Sub-CPMK-8. Mahasiswa Mahasiswa mampu dan Kriteria:  Ceramah 8. Nilai kemiripan, 6
mampu menelusuri dan secara benar  Pedoman Memberi penjelasan singkat ke mahasiswa gap, match dan
menjelaskan nilai  Menemukan dan penskoran a. Menyampaikan bahwa tugas kelompok pada unmacth urutan
kemiripan, gap, match mendisripsikan adanya Bentuk non test: pertemuan ini menggunakan hasil tugas pada basa nitrogen gen
dan unmacth urutan basa nilai kemiripan, gap,  Makalah pertemuaan sebelum (hasil UJI BLAST). pada spesies yang
dari suatu gen baik dari match unmacth urutan  Presentase  Case method . Kasus yang akan diselesaikan adalah sama dan berbeda
spesies yang sama basa dari suatu gen Bagaimana nilai kemiripan, gap, match, unmacth urutan
maupun spsies berbeda antara spesies dari basa dari suatu gen antar spesies :
satu famili a. Gen Piruvat dekarboksilase pada jagung, padi, Referensi:
 Menemukan dan sorgum, jewawut, kentang, tomat, kedele dan kacang Link NCBI
mendisripsikan adanya tanah (Kelompok 1) https://www.ncbi.nl
nilai kemiripan, unmacth b. Gen glukagon pada manusia, kera, gorila, sapi, domba, m.nih.gov
urutan basa dari suatu kambing, kucing dan tikus (Kelompok 3)
gen antara spesies c. Kelompok 2 dan 4 mengorganisasi jalannya diskusi
dari famili yang berbeda termasuk menyiapkan pertanyaan, moderator, notulis
dan pembuatan kesimpulan dari presentasi pada akhir
pertemuan ini.

 TK = 4 x 50 menit
 PT = 2 x 60 menit
 BM = 2 x 60 menit

Minggu Penilaian
Sub-CPMK
Ke-
Indikator
(1) (2) (3)
12 Sub-CPMK-9. Mahasiswa Mahasiswa mampu dan
mampu menelusuri dan secara benar
menjelaskan nilai  Menemukan dan
kemiripan, gap, match dan mendisripsikan adanya
unmacth urutan asam- nilai kemiripan, gap,
asam amino dari suatu match unmacth urutan
protein baik dari spesies basa dari suatu gen
yang sama maupun spsies antara spesies dari satu
berbeda famili
 Menemukan dan
mendisripsikan adanya
nilai kemiripan, unmacth
urutan basa dari suatu
gen antara spesies
dari famili yang berbeda
Bahan kajian / Bobot
Bentuk Pembelajaran; Metode Pembelajaran; Penugasan; Materi
Penilaia
[ Estimasi Waktu] Pembelajaran n (%)
[Pustaka]
Kriteria & Bentuk Tatap muka/Luring Daring
(4) (5) (6) (7) (8)
Kriteria:  Ceramah 9. Nilai kemiripan, 6
 Pedoman Memberi penjelasan singkat ke mahasiswa gap, mtach dan
penskoran a. Menyampaikan bahwa tugas kelompok pada unmacth urutan
Bentuk non test: pertemuan ini menggunakan hasil tugas pada urutan asam amino
 Makalah pertemuaan sebelum (hasil UJI BLAST). suatu protein pada
 Presentase  Case method . Kasus yang akan diselesaikan adalah spesies yang sama
Bagaimana nilai kemiripan, gap, match, unmacth urutan dan berbeda
aasm-asam dari suatu protein antar spesies :
a. Protein Piruvat dekarboksilase pada jagung, padi,
sorgum, jewawut, kentang, tomat, kedele dan kacang
tanah (Kelompok 2)
b. Protein glukagon pada manusia, kera, gorila, sapi,
domba, kambing, kucing dan tikus (Kelompok 4)
c. Kelompok 1 dan 3 mengorganisasi jalannya diskusi
termasuk menyiapkan pertanyaan, moderator, notulis
dan pembuatan kesimpulan dari presentasi pada akhir
pertemuan ini.
 TK = 4 x 50 menit
 PT = 2 x 60 menit
 BM = 2 x 60 menit
 Bahan kajian / Bobot
Bentuk Pembelajaran; Metode Pembelajaran; Penugasan; Materi
Minggu Penilaian Penilaia
Sub-CPMK [ Estimasi Waktu] Pembelajaran n (%)
Ke-
[Pustaka]
Indikator Kriteria & Bentuk Tatap muka/Luring Daring
(1) (2) (3) (4) (5) (6) (7) (8)
13 Sub-CPMK-10 Mahasiswa mampu dan Kriteria:  Ceramah 10. Penulusuran 8
Mahasiswa mampu secara benar  Pedoman Memberi penjelasan singkat ke mahasiswa tentang Jalur
menelusuri dan  Menelusuri contoh jalur penskoran a. Tugas kelompok pada pertemuan dengan memnfaat Metabolisme
mengungkapkan Jalur metabolisme (metabolic Bentuk non test: informasi biologi termasuk informasi ttg jalur Link:
metabolisme melalui situs pathway) yang  Makalah metabolisme pada lebmaga layanan data https://www.geno
tersedia berlangsung pada bioinformatika yang ada dan dapat diakses me.jp/kegg/pathwa
 Presentasi
organisme prokariotik y.html
 Case method . Kasus yang akan diselesaikan adalah
dan eukariotik melalui Bagaimana mekanisme jalur metabolik berlangsung disertai https://metacyc.or
aplikasi yang tersedia tahapannya : g/MetaCycExampl
 Mendisripsikan contoh a. SNARE interactions in vesicular transport (Kelompok 1) es.shtml
jalur metabolisme b. Ribosome biogenesis in eukaryotes (Kelompok 2
(metabolic pathway) c. Fanconi anemia pathway(Kelompok 3)
yang ditemukan d. MAPK signaling pathway (Kelompok 4)
e. Ras signaling pathway (Kelompok 5)
f. Neuroactive ligand-receptor interaction (Kelompok 6)
g. Cytosolic DNA-sensing pathway (Kelompok 7)
h. Thyroid hormone signaling pathway (Kelompok 8)

 TK = 4 x 50 menit
 PT = 2 x 60 menit
 BM = 2 x 60 menit
 Bahan kajian / Bobot
Bentuk Pembelajaran; Metode Pembelajaran; Penugasan; Materi
Minggu Penilaian Penilaia
Sub-CPMK [ Estimasi Waktu] Pembelajaran n (%)
Ke-
[Pustaka]
Indikator Kriteria & Bentuk Tatap muka/Luring Daring
(1) (2) (3) (4) (5) (6) (7) (8)
14 Sub CPMK-11. Mahasiswa dapat Kriteria:  Ceramah 11. Desain Primer 6
Mahasiswa mampu melakukan dengan benar  Pedoman Memberi penjelasan singkat ke mahasiswa tentang dengan Aplikasi
mendesain primer suatu  Cara mendesain primer penskoran a. Tugas kelompok pada pertemuan dengan memanfaat Primer3
gen dengan aplikasi aplikasi yang tersedia Bentuk non test: informasi gen yang akan dipilih dalam latihan ini. . Link:
Primer3  Pemilihan primer yang  Presentase  Case method . Bagaimana cara mendesain suatu primer https://primer3.ut
baik dari gen-gen terpilih dengan menggunakan Aplikasi .ee/
Primer3.
Tentukan : Nilai TM, GC ratio, foward primer & reverse https://www.ncbi.nl
primer, ukuran primer dan sekuens basanya serta m.nih.gov/tools/pri
mer-blast/
kelayakan dari primer yang diperoleh.
a. Gen sod pada padi (Kelompok 1)
96
b. Gen act pada jagung (Kelompok 2)
c. Gen DNApol2 pada Komodo (Kelompok 3)
d. Gen glut2 pada manusia (Kelompok 4)
e. Gen glut4 pada sapi (Kelompok 5)
f. Gen g1pk mencit (Kelompok 6)
 Presentasi dan diskusi hasil penugasan kelompok yang
diarahkan oleh seorang moderator yang ditugaskan
 Seluruh kegiatan dan hasil dicatat oleh notulis yang
ditugaskan
 TK = 4 x 50 menit
 PT = 2 x 60 menit
 BM = 2 x 60 menit
 Bahan kajian / Bobot
Bentuk Pembelajaran; Metode Pembelajaran; Penugasan; Materi
Minggu Penilaian Penilaia
Sub-CPMK [ Estimasi Waktu] Pembelajaran n (%)
Ke-
[Pustaka]
Indikator Kriteria & Bentuk Tatap muka/Luring Daring
(1) (2) (3) (4) (5) (6) (7) (8)
15 Sub CPMK-12. Mahasiswa mampu dan Kriteria:  Ceramah 12. Aplikasi Mega 10
Mahasiswa mampu secara benar  Pedoman Memberi penjelasan singkat ke mahasiswa tentang Tugas dan Pohon
membuat pohon  Membuat pohon penskoran kelompok pada pertemuan ini. Filogenetik
filogenetik dengan filogenetik (kekerabatan) Bentuk non test:  Case method . Bagaimana menghasilkan pohon filigenetik
aplikasi Mega dengan aplikasi Mega11  Hasill kerja dengan memanfaatkan aplikasi Mega.
 Menjelaskan makna kelompok a. Silahkan masing-masing kelompok (6
pohon filogenetik yang  Presentase kelompk) memilih salah satu gen dan 10
dihasilkan kelompok spesies hewan atau tumbuhan
b. Dari 10 spesies: 5 intra spesies dan 5
spesies antar spesies
 Hasil kerja kelompok disusun dalam bentuk makalah singkat
dengan susunan sesuai kaidah ilmiah
 Masing-masing kelompok meempersiapkan dok ppt untuk
dipresentasikan
 Presentasi dan diskusi hasil penugasan kelompok yang
diarahkan oleh seorang moderator yang ditugaskan
 Seluruh kegiatan dan hasil dicatat oleh notulis yang
ditugaskan
 TK = 4 x 50 menit
 PT = 2 x 60 menit
 BM = 2 x 60 menit
16 UJIAN AKHIR SEMESTER