PAUTAN

Sri Mumpuni Wahyu W

• Dugaan: 1 kromosom  1 gen
• Penelitian: drosophila (8 kromosom)  >
3000 gen
• Artinya: 1 kromosom lebih dari 1 gen
• Dua or lebih gen dlm kromosom yg sama 
PAUTAN (linkage)
• Gen  gen-gen terpaut (linked genes)
 PAUTAN PD AUTOSOM
• Misal: tanaman dihibrid
T : batang tinggi --- t : batang pendek
U : bunga ungu --- u : bunga putih
• MAKA:
1. JIKA GEN TSB TIDAK TERPAUT
h. Mendel I : pemisahan gen scr bebas
Genotip hibrid: TtUu
• Gb lokasi gen dlm kromosom
T
t
U
u

2. Jk gen tsb terpaut, ada 2 kemungkinangen2

terpaut dlm keadaan:
a. Coupling fase
T U

t u
T u

t U
 Macam pautan
1. terpaut sempurna
• Gen2 letaknya sangat berdekatan satu dg yg
lain, selama meiosis gen2 tdk mengalami
perubahan (gen2 yg terangkai menuju ke
gamet scr bersama-sama)
A. coupling fase (sis)
• Contoh: pada zea mays:
 + atau R = aleuron merah
 r = aleuron putih
• Jika F1 menyerbuk sendiri, maka perbandingan
fenotip F2 -- 3:0:0:1 atau 3:1
• Ini menyimpang dr h. mendel 9:3:3:1
P x

F1

F2 ++ +b r+ rb
Tidak ada Tidak ada
++ - -

+b - - - -
Tidak ada
r+ - - - -
Tidak ada
rb - -
• Jika F1 menyerbuk sendiri, maka
perbandingan fenotip F2 -- 2:1:1:0 atau 2:1:1
• Ini menyimpang dr h. mendel menghasilkan
perbandingan fenotip 9:3:3:1
P x

F1

F2 ++ +b r+ rb
Tidak ada Tidak ada
++ - - - -
Tidak ada
+b - -

r+ - -

rb - - - -
Tidak ada
2. Gen2 terpaut tidak sempurna
• Apabila gen2 letaknya saling berjauhan dlm
satu kromosom – gen2dpt mengalami
perubahan letak akibat pertukaran segmen dr
kromatid pada ps kromosom homolog
 A B

a b

Peristiwa pertukaran segmen dr kromatid2

Pd sepasang kromosom homolog  crossing
over
• F1 diuji silang, hasilnya:
– 172 bunga ungu, biji bulat
– 46 bunga ungu, biji kisut
– 30 bunga merah, biji bulat
– 152 bunga merah, biji kisut
• Perbandingan bukan 1:1:1:1 tetapi n:1:1:n
P x
F1

testcross
F2 genotip fenotip jumlah frekuensi tipe

Ungu, 172 n 0,430 Parental

bulat

Ungu, kisut 46 1 0,115 Rekombinasi

Merah, 30 1 0,075 Rekombinasi

bulat

Merah, 152 n 0,380 Parental

kisut

jumlah 400 1,000

• F1 diuji silang, hasilnya:
– 48 bunga ungu, biji bulat
– 177 bunga ungu, biji kisut
– 103 bunga merah, biji bulat
– 32 bunga merah, biji kisut
• Perbandingan bukan 1:1:1:1 tetapi 1:n:n:1

P x
F1

testcross
F2 genotip fenotip jumlah frekuensi tipe

Ungu, 48 1 0,430 Rekombinasi

bulat

Ungu, kisut 177 n 0,115 Parental

Merah, 103 n 0,075 Parental

bulat

Merah, 32 1 0,380 Rekombinasi

kisut

jumlah 400 1,000

 Crossing over
• Peristiwa pertukaran segmen2 dr kromatid2
tak serupa pd ps kromosom homolog
• Terjadi saat meiosis
• Dibedakan atas:
1. PS tunggal (SCO)
• PS ganda/DCO
 catatan
• Gamet tipe parental dibentuk dlm jml banyak
dr gamet rekombinan
• Pada PS ganda  gen yg letaknya diujung
kromosom menempati tempat yg sama, yg
mengalami perubahan tempat hanya gen di
tengah saja
Faktor mempengaruhi Crossing Over:
Temperatur
Umur
Zat kimia
Penyinaran dengan sinar – X
Jarak antara gen-gen yang terangkai
Jenis kelamin
 Pautan pd kromosom X
• Pada drosophila
– + = warna tubuh kelabu (normal)
– y = warna kuning
– + = mata merah (normal)
– w = mata putih

P x
F1
• Pada drosophila
– + = warna tubuh kelabu (normal)
– y = warna kuning
– + = mata merah (normal)
– w = mata putih

P x
F1
 ++ ¬ • Lalat betina semua
++ normal – tdk bisa
pembuatan peta
+w kromosom X
• Lalat jantan memisah
y+ dlm bbr kelas fenotip
• Jumlah lalat betina
yw
kira2 sama dg jantan
Pemetaan kromosom
• Mencari urutan yg tepat
Misal: jarak A-B = 16 unit, B-C = 12 unit, A-C = 4
unit.
• Andai gen B ditengah, maka:
A 16 B 12 C

– Jarak antara A-C tidak sesuai

• Andai gen C ditengah, maka:
A 4 C 12 B

– Jarak A-B sesuai, yaitu 16 unit

• Maka gen C harus terletak di tengah
• Uji silang 3 tempat
– Untuk mendeteksi PS ganda menggunakan
trihibrid
• Jika di testcross maka trihibrid mbk 8 macam gamet
• Ind resesif mbk 1 macam gamet
– Shg menghasilkan 8 macam keturunan
– Pemetaan kromosom dibedakan:
• Peta autosom
• Peta kromosom X
 Peta autosom
• Pada zea mays 3 ps gen terpaut

+ = aleuron + = biji penuh + = biji bertepung

berwarna

c = aleuron tidak sh = biji kisut wx = biji berlilin

berwarna
• Uji silang tanaman trihibrid
fenotip Gamet induk jumlah
heterozigot
Tak berwarna, penuh, lilin c + wx 2708
berwarna, kisut, tepung + sh + 2538
Tak berwarna, penuh, tepung c + + 626
berwarna, kisut, lilin + sh wx 601
Tak berwarna, kisut, tepung c sh + 116
berwarna, penuh, lilin + + wx 113
berwarna, penuh, tepung + + + 4
Tak berwarna, kisut, lilin c sh wx 2
jumlah 6708
 Belum diketahui
• urutan letak gen
• Ps gen terpaut coupling or repulsion fase (cis
atau trans)
• Sementara: CcShshWxwx
• Hasil uji silang tidak 1:1:1:1:1:1:1:1  terpaut
• Tipe parental: hsl yg paling banyak shg
kombinasi gen2 parental c+wx dan +sh+
• Urutan gen yg benar blm diketahui
B. menentukan urutan letak gen
• Jarak antara gen
– c-sh = 3,50 unit
– sh-wx = 18,38 unit
– c-wx = 21,70 unit
• Kesimpulan:
– wx paling jauh
– c dan wx disebelah luar
– sh ditengah
c 3,5 sh 18,36 wx
21,88
– Angka 21,88 untuk jarak c-wx lebih akurat drpd
21,70
• C. interferensi dan koinsidens
• Frek rekombinan antara:
– c-sh = 3,50 unit
– sh-wx = 18,38 unit
• Apabila PS di daerah c-sh tdk tergantung dr PS
di daerah sh-wx, maka bgn dr gamet2
rekombinan ganda yg dpt diharapkan: 3,5% +
18,38% = 0,0350 + 0,1838 = 0,0064 atau
0,0064 x 6708 = 43 rekombinan PS ganda dr
seluruh hsl ujisilang
 Pembuatan peta kromosom X
• Pada drosophila
+ = bulu nomal + = mata merah + = sayap normal
(normal)
f= bulu bercabang g = mata merah m = sayap miniatur
jambu
• Perkawinan betina trihibrid dg jantan normal:
– Betina (1000) semua normal
– Jantan (1000) :

+++ = 408 +gm = 64 fgm = 199 f++ = 59

++m = 30 +g+ = 4 fg+ = 33 f+m = 3
• Pada kromosom apakah gen-gen itu terpaut?
Beri alasan.
• Buat peta kromosomnya
• Karena semua keturunan: lalat betina normal,
sedangkan keturunan jantan memisah ke
berbagai macam genotip dan fenotip  gen2
tersebut terpaut kromosom X
• Peta kromosom:
• Menghitung jarak antar gen
• Keturunan yg jmlnya banyak: +++ dan fgm 
dianggap tipe parental
• Krn blm tahu urutan letak gen sebenarnya,
anggap betina trihibrid adalah +++/fgm
 + + +

f g m

• Rekombinan antara f-g =

(+gm)+(f++)+(+g+)+(f+m) X 100%
1000
= 64+59+4+3 X 100% = 13% = 13 unit
1000
 + + +

f g m

• Rekombinan antara g-m

(++m)+(fg+)+(+g+)+(f+m) X 100%
1000
= 30+33+4+3 X 100% = 6,7% = 6,7 unit
1000
• Rekombinan antara f-m
(+gm)+(f++)+(++m)+(fg+)+(+g+)+(f+m) X 100%
1000
= 64+59+30+33+4+3 X 100% = 19,3% = 19,3 unit
1000
• Jarak f-g = 13 unit, g-m = 6,7 unit dan f-m =
19,3 unit  gen m letaknya paling jauh, shg
gen f dan m tdpt di sebelah luar dan g
ditengah.
• Gb peta kromosomnya:
f 13 g 6,7 m

19,7
• Menghitung KK dan I
– R PSG yg diperoleh = (4+3)/1000 = 0,007
– R PSG yg diharapkan = 0,13 X 0,067 = 0,009
• KK = (0,007)/(0,009) = 0,78
• I = 1 – 0,78 = 0,22