Actomyosin Bentukkompleks in vitro antar myosin dan aktin yang memperlihatkan sifat
pasti dari otot,seperti kontraksi pada kehadiran ATP.
Acyl adenylate Campuran anhydridedimana kelompok molekul carboxyl terhubung pada
kelompok phosphoryl AMP;bentuk dari acyl adenylates berfungsi untuk mengaktifasi
kelompok carboxyl dalam reaksi biokimia, seperti pembentukan molekul dari lemak acyl
CoA dari asam lemak bebas dan koenzim A.
acyl carrier protein, protein pembawa Acyl Bakteri polipeptida yang terhubung pada
phosphopantetheine dan bertindak sebagai carrier dari rantai lemak acyl yang sedang
tumbuh selama biosintesis dari asam lemak.
adaptation, adaptasi Pengaturan ulang level sensitivitas dari reseptor-reseptor
dikarenakan kehadiran terusmenerus dari ligand. Dapat disebut juga desentisasi.
addition to or formation of double bond, penambahan atau pembentukan ikatan
ganda Reaksi dimana suatu kelompok fungsional ditambahkan padaikatan ganda atau
kelompok yang dipindahkan dari suatu molekul untuk membentuk ikatan ganda.
Adeninylate cyclase Suatu enzim yang membentuk cAMP, pemberi pesan keduadari
ATP.
Adenylate cyclase cascade Jalur transduksi sinyal yang mempekerjakan cAMP dan
serangkaian enzim untuk mengubah (mengkonversikan) sinyal ekstraseluler kepada
sinyal intraseluler.
adipocytes, adiposit sel mamalia yang merupakan penyimpanan utama untuk
triacylglycerols.
A-DNA helix Bagian sebelah kanan dari helix ganda terbuat dari untaiantiparalel
disatukan oleh pasangan basa A-T dan G-C;lebih lebar dan pendek dari DNA-B dan dapat
dilihat padaDNA dehidrasi jugapada bagian untai ganda dari RNA didalam RNA-DNA
helix.
aerobic, aerob Terdapat oksigen didalamnya.
affinity chromatography, kromatografi afinitas Sebuah teknik pemurnian dari protein
berdasarkan ketinggian afinitas dari banyak protein untuk kelompokkimia yang spesifik.
Kelompok ini terikatpada matriks inest;dan sampel protein diajukan,hanya proteinprotein dengan afinitas untuk kelompok tersebut yang terikat.
affinity labeling, pelabelan afinitas Pemetaan sisiaktif dari enzim dengan menggunakan
substrat analog yang terikat pada sisi aktif dan membentuk ikatan kovalen dengan asam
amino terdekat.
Agonists Molekul yang terikat pada protein reseptor dan pemicu jalur sinyal.
Alcaptonuria Kelainan penyakit menurun yang tidak berbahaya diakibatkan oleh hasil
pemecahan dari tyrosine dan phenylalanine.
Hal 3 (10604085, Yenny Indriati B)
alcoholic fermentation, fermentasi alkohol. Peristiwa perubahan secara anaerobik dari
glukosa menjadi etanol, seiring dengan pembentukan ATP.
jalur persinyalan. Sama hal-nya dengan molekul yang berperan sebagai zat kompetitif
inhibitor pada enzim.
antibody Suatu protein yang disintesis oleh hewan dalam merespon suatu substansi
asing, atau suatu antigen; sering berikatan dengan antigen, menetralisir substansi asing
tersebut atau menghancurkannya.
anticodon Suatu rangkaian tiga buah nukleotida dari RNAt yang memiliki pasangan basa
satu buah kodon dalam RNAm.
antigen Suatu substansi asing yang dapat mendatangkan sintesis antibodi.
antigenic determinant Bertempat di antigen di mana suatu antibody berikatan padanya.
Disebut juga sebagai epitope.
antimycin A Sebuah antibiotik dari bakteri Streptomyces yang menghambat system
pernafasan dengan cara memblokir transfer elektron dalam reduktase kompleks sitokrom.
antiporter Sebuah sistem transport di mana suatu molekul dibawa melewati membran
yang arahnya berlawanan dengan ion, yang pada gilirannya dipompa kembali melewati
membran selama transport aktif yang berkaitan dengan hidrolisis ATP.
antiserum Serum diambil dari darah hewan yang terimunisasi berisi antibody terlarut
yang khusus untuk antigen yang memiliki ke-khas-an tertentu.
apoptosis Suatu peristiwa peluncuran enzim proteolitik yang berperaan dalam
pengontrolan kematian sel dalam responnya terhadap kerusakan sel yang signifikan atau
perkembangan yang yang terprogram secara spesifik. Disebut juga sebagai kematian sel
yang terprogram.
arachidonate Merupakan derivat dari linoleat, derived from linoleate, 20:4 asam lemak
yang merupakan precursor utama terhadap beberapa sinyal molekul, termasuk
prostaglandin.
arrestin Suatu protein yang berperan dalam terminasi galur transduksi sinyal visual
melalui pengikatan rhodopsin yang terfosforilasi serta pencegahan terjadinya interaksi
dengan transducin. Arrestin mungkin memiliki peran yang sama dalam galur transduksi
sinyal 7TsM-bebas lainnya.
ascorbate (vitamin C) Merupakan vitamin yang larut dalam air yang berfungsi sebagai
antioksidan dan dibutuhkan dalam hidroksilasi kolagen; dan sebagai obat defisiensi
vitamin C (sariawan).
Hal 6 (10604121, Dwi Ratnasari)
aspartyl proteases, aspartil protease kelas enzim pendegradasi protein yang
aktivitasnya tergantung kepada residu aspartat pada daerah aktif. Aspartil protease
diperlukan untuk replikasi HIV.
ATP (Adenosin 5-trifosfat) nukleotida yang terdiri dari unit-unit adenin, ribosa, dan
trifosfat yang berperan sebagai peredaran energi selular.
ATP-ADP translocase, ATP-ADP translokase adenin nukleotida pembawa protein
transport yang membawa ADP ke dalam mitokondria dan ATP keluar secara berpasangan.
ATP-binding cassette (ABC) domain karakteristik domain ikatan ATP dari protein
transport membran yang spesifik, yang disebut transporter ABC; transporter ini juga
mengandung wilayah membrane-spanning.
ATP-grasp fold domain protein yang mengelilingi ATP dan mengorientasikannya untuk
menyerang nukleofilik pada fosfat . Enzim yang mengandung domain ini mengkatalisis
formasi ikatan karbon-nitrogen melewati asilfosfat intermediet.
ATP synthase, ATP sintase penyusunan molekuler dari membran dalam mitokondria
yang bertanggungjawab untuk sintesis penggerak-rantai-respirasi ATP. Juga disebut
kompleks V, ATPase mitokondria, H+-ATPase, or F0F1-ATPase.
atractylocide, atraktilosida glikosida dari tanaman yang menghambat translokasi ATPADP.
attenuation, pelemahan pada bakteri, mekanisme untuk regulasi transkripsi yang akan
menurunkan laju translasi dari operon mRNA mengurangi laju transkripsi operon
tersebut.
autoimmune disease, penyakit autoimun penyakit, seperti ketergantungan insulin pada
penyakit diabetes dan multiple sclerosis, sebagai hasil dari kegagalan dalam menekan
respon imun antigennya sendiri.
autoradiography, autoradiografi istilah untuk molekul radioaktif pendeteksi yang tidak
bergerak dalam medium pemisahan seperti poliakrilamida; radioaktifitas dari molekul
akan menghitamkan film sinar-x.
autotrophs, autotrof organisme fotosintetik yang mensintesis glukosa dari karbon
dioksida dan air, dengan menggunakan cahaya matahari sebagai sumber energi; glukosa
yang dihasilkan kemudian digunakan sebagai bahan baker untuk metabolisme selular.
avidity, aviditas kekuatan dari ikatan yang terdiri dari banyak interaksi ikatan
independen antapasangan, seperti antara antigen dan antibodi.
axoneme, aksonema desain pokok dari silia dan flagella; mengandung berkas
mikrotubul, ditutupi oleh membran, dimana setiap sembilan mikrotubul ganda
melingkupi dua mikrotubul tunggal.
B
blymphocyte, blimfosit pelopor untuk sel plasma, yang merupakan pensekresi antibodi.
Hal 7 (10604130, Selvy S. Y.)
bacitracin suatu antibiotik yang menghambat transfer dari oligosakarida dari dolihol
fosfa ke protein.
bacteriorhodopsin suatu membran integral 26-kd yang menyerap cahaya dan merubah
energinya menjadi enaga penggerak proton, yang kemudian digunakan untuk mensintesis
ATP.
base-excision repair Suatu metode perbaikkan DNA dimana bagian basa yang rusak
digantikan oleh basa yang sama dan membuatnya seperti semula.
B-DNA helix suatu double helik kanan yang mempunyai karakteristik sebagai berikut;
dua untai yang anti-paralel; basanya terdapat didalam untai sedangkan gugus fosfat dan
gula deoksiribosanya berada diluar; adenin membentuk ikatan hidrogen dengan timin,
dan guanin dengan sitosi; tiap pasangan basa berbentuk coplanar; dan terdapat 10.4
residues per turn, dan mempunyai puncak di 35 .
Beer's law hubungan dari penyerapa cahaya (A) dengan suatu campuran, yang
mempunyai koefisien tetap (), konsentrasi (c) dan panjang (l) cahaya: A = cl
beriberi suatu penyimpangan neurologic dan kardiovascular yang disebabkan oleh
kekurangan vitamin B1.
sheet struktur umum dalam protein, dimana dua atau lebih untai yang berikatan
sebagai tumpukkan dari suatu cincin, yang distabilkan oleh ikatan hydrogen di dalam
cincin; sejumlah untai mengarah pada arah yang sama membentuk lembaran lipatan ,
dimana untai sejenis mengaran pada posisi yang berbeda dari betuk ani parallel lembaran
lipatan.
-galactosidase enzim yang pentinga dalalm metabolisme laktosa yang menghidrolisi
laktosa menjadi galaktosa dan glukosa.
bifunctional enzyme enzim dengan 2 perbedaan, sering berentangan, proses katalis pada
satu rantai polipepidanya. Sebagai contoh, fosfatfruktokinase 2 mensintesis sukrosa 2,6bisphosphate dan fruktosa 2,6-bisphosphatase menghidrolisis fosfatfruktokinase, dan
keduanya berada pada sisi aktif rantai polipeptida yang sama.
bile salt suatu turunan kolesterol yang dibuat dalam liver, dan dikumpulkan pada kantung
kemih,dan dilepaskan ke intestine, dimana mereka berperan sebagai detergen untuk
melarutkan lemak, memfasilitsi unuk pencernaan dan penyerapan.
binding energy energi bebas yang dilepaskan pada saat formasi interaksi terlemah antara
enzim dan substrat.
biopterin suatu kofaktor yang diambil dari tetrahydrobiopterin pembawa electron.
biotin vitamin yang memainkan peran penting dalam reaksi karboksilasi dan
dekarboksilasi.
Bohr effect observasi yang dibuat oleh Christian Bohr dengan menaikkan H+ dan CO2
untuk melepaskan oksigen dari oksihemoglobin.
bongkrekic acid Suatu antibiotik yang menghambat kerja dari ATP-ADP translokase.
Hal 8 (10605001, Lylyk Eka Suranny)
branch migration Kemampuan untai pasangan DNA beserta untai komplemennya untuk
bergerak, mengganti untaian homolog dan memperpanjang pasangannya.
Bromodomain Domain yang termasuk dari empat heliks ganda peptide yang terdiri atas
acetyllysin.Juga disebut dengan untai domain acetyllysin.
C3 plant Tumbuhan yang tidak mempunyai jalur C4
C4 pathway Tumbuhan yang mempunyai empat komponen karbon, yaitu oxaloasetat dan
malat, membawa karbondioksida dari sel mesofil dan bereaksi dengan udara kedalam
sel,yang merupakan tempat utama dari fotosintesis. Jalur ini mempercepat fotosintesis
dengan konsentrasi karbondioksida pada sel fotosintesis.
C4 plant Tanaman yang memanfaatkan jalur C4
CAAT box Komponen dari eukariotik yang mendukung ikatan 5-GNCAATCT-3
Calcium ATPase (Ca2+ ATPase) Bagian dari ATP yang mengendalikan dan memelihara
gradient elektrokimia dari ion kalsium pada membrane plasma.
Calmodulin Pada vertebrata protein ini terdapat di mana-mana,ketika berikatan dengan
kalsium menstimulasi banyak enzim dan pengangkutan.
calmodulin-dependent kinase Protein yang mempunyai aktivitas untuk mengikat
kompleks Ca2+-calmodulin
Calnexin Inti pada membran reticulum endoplasma,sebuah chaperon protein yang
mencegah pengiriman glikoprotein yang belum matang atau glikoprotein yang tidak aktif
dengan mengikat residu glukosa pada glikoprotein.
caloric homeostasis Pemeliharaan keseimbangan berat badan dengan jaringan yang
kompleks dari interaksi hormonal.
calorie Jumlah panas yang diperlukan untuk meningkatkan temperature 1 gr air dari
14.5C sampai 15.5C.
Calvin cycle Pada tanaman, merupakan metabolic siklik dimana karbondioksida
merupakan campuran ribolus 1,5-bipospat yang digunakan untuk sintesis glukosa.
5' cap Struktur pada ujung 5 dari mRNA eukariot yang menstabilkan
mRNA,mempercepat translasi.Cap terdiri atas sebuah 7-methyl guanylate merupakan
residu dari triphosphate yang berhubungan dengan gula pada ujung 5 ,pada mRNA
dengan jarak hubungan hubungan 5-5
capsaicin receptors Ion channel yang mengekspresikan espon stimulus yang berbahaya
misalnya panas, keasaman kimia misalnya capsaicin, respon kimiapanaspada saat
mencoba makanan pedas.Juga disebut reseptor vanilloid 1(VR1).
Hal 9 (10605002, Tazkiyah Izzati)
capsid, kapsid. Protein yang menyelubungi DNA atau RNA pada virus.
carbamoyl phosphate synthetase, karbamol fosfat sintetase. Merupakan enzim yang
memulai siklus urea dengan cara mengkatalisis sintesis karbamoyl fosfat dari bikarbonat,
ion ammonium dan ATP. Enzi mini juga mengkatalisis reaksi awal dari biosintesis
pirimidin.
carbohydrates, karbohidrat. Sakarida, yang memiliki gugus aldehid atau keton dan
terdiri dari banyak gugus hidroksil. Juga didefinisikan sebagai materi organic dengan
rumus empirik (CH2O)n.
carbonium ion, ion karbonium. Merupakan komponen karbon yang terdapat atom
karbon bermuatan positif; karbonium sangat penting untuk katalisis oleh lisozim.
Carboxylase, karboksilase Merupakan enzim yang menkatalisis reaksi perpindahan
karboksil; biasanya biotin diperlukan sebagai koenzim.
CD4 suatu protein yang muncul dibagian permukaan dari helper yang, bersama dengan T
sel reseptor, mengikat pada protein kelas II MHC proteins pada antigen sel. CD4 adalah
sumber dari helper T sel yang spesifik untuk interaksi dengan kelas II MHC.
CD8 permukaan protein dari suatu sel yang diekspresikan oleh sitotik T sel yang,
berhubungan dengan in T sel reseptor, mengenali kompleks kelas I MHC-peptide. CD8
mengikat pada protein MHC itu sendiri.
cDNA Komplemen DNA unuk susunan mRNA.
CDP-alcohol bentuk aktif dari suatu alcohol yang digunakan dalam sintesis dari
phosphoglycerides dengan mengombinasi diacylglycerol pada gugus hidroksil bebas dari
gliserol; sebagai contoh, CDP-choline bisa bereaksi dengan diacylglycerol untuk
membentuk phospholipid phosphatidylcholine.
CDP-diacylglycerol (cytidine diphosphodiacylglycerol) Dibentuk dari phosphatidate
dan cytidine triphosphate (CTP); mengaktifkan diacylglycerol, untuk dipergunakan dalam
sintesis phosphoglycerides seperti phosphatidyl serine.
cell type sel dalam organisme yang mempunyai genetic yang sama tapi mempunyai
tanggung jawab yang berbeda untuk ekspresi gen yang berbeda.
cellular immune response system untuk proses pengenalan seluler dari zat asing dengan
menggunakan sel-pengikat T-sel reseptor untuk menghilangkan sel yang terinfeksi oleh
suatu yang berbahaya atau untuk menstimulus reaksi antigen tertentu yang distimulasi
oleh produksi antibodi B-limfosit.
cellulose bentuk tidak bercabang dari homopolisakarida pada anaman, terdiri dari residu
glukosa pada sambungan -1,4; struktur utama polisakarida di tanaman.
centromere tempat melekatnya benang spindle pada proses mitosis di krokosom.
Hal 11 (10605005, Nova Virgiana)
11ceramide (N-acyl sphingosine) suatu sphingosine dengan rantai gugus asil yang
panjang dan menempel pada gugus amino.
cerebroside sphingolipid dimana glukosa atau galaktosa berikatan dengan terminal
hidroksil dari gugus ceramide.
cGMP phosphodiesterase enzim yang menghidrolisi cincin GMP menjadi GMP; dalam
visualisasinya, hidrolysis ini mengarah pada generasi potensial aksi.
cGMP-gated calcium channel suatu chanel pada sel rod yang membuka akibat dari
cGMP untuk bertanggung jawab atas pemasukkan ion kalsium dan sodium ke dalam sel;
menutupnya chanel merupakan akibat dari hidrolisis cGMP memulai proses visual dari
transduksi sinyal.
channel suatu jalur protein yang secara kontinyu dan cepat yang memungkinkan ion
masuk melewati membran eukariot dari bagian dengan konsentrasi tinggi ke bagian
dengan konsentrasi yang lebih rendah. Channels (juga dikenal sebagai pori pada bakteri)
umumnya terdiri dari 4 sanpai 6 subunit, atau domain, dan di rintangi oleh potensial
membran, efektor allosteric, atau modifikasi kovalen.
chaperone proteins ATPase lambat yang mengikat protein yang baru disintesis dan
coenzyme Q Suatu pembawa electron yang merupakan komponen dari respirasi chain;
yang menggumpalkan oksida-ubiquinone untuk mengurangi pembentukan ubiquinol
melalui cara semiquinone intermediate; kecuali electron dari NADH-Q NADH-Q
reductase juga succinate-Q reductase.
cohesive ends Pada rantai ganda suatu DNA molekul, In double-stranded DNA
molecules, complement dari rantai tunggal yang diakhirnya diproduksi oleh staggered
cuts. Cohesive ends yang spesific pada DNA bisa dibuat oleh sejenis enzim restriksi,
seperti Ecori, dan bisa digunakan untuk menyambung DNA molekul yang tidak
berhubungan dengan cara annealing dan menggabungkan dengan DNA ligase.
colchicine Suatu alkaloid yang membentuk the autumn crocus yang mencegah
polimerisasi dari tubulus untuk membentuk mikrotubulus; dan akibatnya, ini
menghambat siklus sel pada fase metafase.
combinatorial chemistry Proses yang memproduksi secara besar - besarn molekul yang
kemudian akan dipilih untuk menjadi bagian dari suatu biokimia.
combinatorial control Proses pengontrolan ekspresi pada sel eukariot dimana tiap factor
transkripsi, tidak secara spontan memberi efek pada transkripsi, mengambil protein lain
untuk membangun suatu kompleks yang menjalankan transkripsi.
committed step Proses irreversible yang pertama kali dalam jalur metabolisme dibawah
kondisi psikologis; proses ini dikatalis oleh suatu enzim allosteric dan menghasilkan
produk yang penting untuk molekul kimia.
Hal 14 (10605008, Nursiva Azlia)
compartmentation Tempat lokasi metabolisme, enzim ataupun jalurnya pada membran
organel yang berbeda pada sel eukariot.
competitive inhibition Penurunan laju reaksi enzim yang diamai pada saat enzim bisa
berikatan dengan substrat atau inhibitor tapi tidak sekaligus berikatan dengan keduanya.
Inhibitor kompetitif mirip dengan substrat dan bersaing dengan substrat untuk berikatan
pada sisi aktif suatu enzim. Pencegahan dari inhibitor dengan cara memenuhi dengan
substra adalah suatu jenis peningkatan energi kinetik dari suatu inhibitor kompetitif.
complementarity-determining region (CDR) Rantai L dan H pada suatu
immunoglubin, segmen polipeptida yang mempunyai variasi urutan yang besar dan
bertanggung jawab untuk menetapkan antigen apa yang cocok.
concerted mechanism Suatu model yang menerangkan tentang energi kinetik dari enzim
allosteric dimana perubahan semua sisi aktifnya antara keadaan T dan R berlangsung
secara terus menerus.
cone Sebuah sel fotoreseptor yang berfungsi untuk menangkap cahaya terang dan
memberikan warna.
consensus sequence Susunan basa ideal yang biasa terdapat pada sisi promotor.
conservative substitutions Mutasi yang terjadi karena adanya perubahan pada salah satu
asam amino digantikan dengan asam amino yang lain yang sma dalam ukuran dan
kimiawainya.
constant region Terminal karboksil yang terdapat pada ujung light chain G dari suatu
immunoglobulin G atau heavy chain Ig G. untuk kebanyakan antibodi, bagian ini
merupakan salah satu susunan dari rantai polipeptida yang mempunyai asam amino yang
sama antara yang satu dengan yang lainnya; light chain punya satu wilayan tetap,
sedangkan heavy chain punya tiga wilayah, yang masing - masing saling menyusun
wilayah untuk mengenali molekul immunoglogulin asing.
constitutive genes gen yang tidak penting dalam regulasi dan secara tetap di transkrip.
conventional kinesin Suatu motor protein, di bangun di sekitar inti p-loop NTPase,yang
mempunyai beberapa struktur yang sesuai dengan myosin; suatu kinesin umum yang
bergerak ke arah akhir miktotubulus yang positif.
convergent evolution Proses dimana dengan cara yang berbeda berakhir pada satu solusi
yang sama dalam masalah biokimia.
cooperativity Bagian dari kebanyakan enzim allosteric dimana pada saat ada substrat
yang terikat pada satu sisi aktifnya akan menginduksi terjadinya transisi semua sisi aktif
dari keadaan T menjadi keadaan R, yang akan berdampak pada meningkatnya aktivitas
kerja enzim.
Hal 15 (10605010, Vanessa Letiza)
core glycosylation Penambahan karbohidrat ke protein dan proses dari karbohidrat ini
bertempat di reticulum endoplasma.
core particles Partikel core yaitu partikel yang merupakan hasil dari pencernaan
microccocal nuclease pada nukleosome, mengandung 140-bp DNA dan histone octamer
pada nukleosome.
corepressor Molekul kecil yang terikat dengan protein repressor, corepressor-repressor
complex akan berikatan dengan DNA operator pada operon particular untuk menghambat
proses transkripsi.
Cori cycle Siklus Cori merupakan siklus metabolik dimana asam laktat dikonversi
menjadi glukosa oleh hati pada otot yang aktif dan mensuplai hasil sintesa glukosa
tersebut ke otot dan jaringan lainnya.
Cori disease Penyaki Cori yaitu penyakit yang disebabkan karena struktur dari hati dan
glikogen otot yang abnormal dan jumlahnya pun menurun. Hal itu disebabkan
ketidakmampuan untuk menghidrolisis ikatan -1,6-glycosidic pada glikogen, dan fungsi
hati pun menjadi terpengaruh.
coupled reaction Reaksi pasangan yaitu pasangan dari reaksi endergonic dengan reaksi
exergonic, seperti hidrolisis pada ATP, maka pasangan reaksi tersebut akan berlangsung
sesuai dengan kondisi sel.
covalent catalysis Katalisis kovalen yaitu katalisis yang di sisi aktifnya mengandung
kelompok reaktif yang menjadi kovalen secara temporer yang dibentuk di dalam proses
katalisis.
covalent intermediate Intermediate kovalen, pada mekanisme katalisis, intermediate
mengandung komponen dari substrat yang terikat secara kovalen dengan enzim.
deletion, delesi tipe mutasi yang mana satu atau lebih pasangan basa keluar pada
replikasi DNA; juga, ketidakhadiran satu atau lebih basa dari nukleotida sequen dalam
sebuah gen
denaturation, denaturasi gangguan dalam konformasi asli dari makromolekul yang
menyebabkan kehilangan fungsi normalnya.
de novo pathway, jalur de novo. jalan kecil pada biosynthetic pathway yang
membangun produk akhir dari prekusor sederhana.lihat juga salvage pathway.
density-gradient equilibrium sedimentation, sedimentasi gradient konsentrasi yang
equilibrium. teknik sentrifuga untuk memisahkan molekul biologi berdasarkan pada berat
jenisnya di dalam larutan air solution of a salt such as cesium chloride. Ketika beberapa
larutan disentrifuga pada kecepatan yang tinggi, melawan gaya dari sedimentasi dan
difusi membentuk gradient konsentrasi dari garam; molekul dalam gradient tersebut
dikendalikan oleh gaya sentrifugasi kedalam wilayah dimana kekentalan larutan
deoxyhemoglobin salah satu bentuk konformasi dari hemoglobin yang tidak mampu
untuk mengikat oksigen. Disebut juga dengan T atau bentuk tense .
deoxynucleotide nukleotida yang berisi basa purin dan pirimidin yang secara kovalen
berkaitan dengan deoksiribosa, berkaitan juga dengan satu atau lebih grup.
Hal 18 (10605013, Adinda Meutia Hapsari)
deoxyribose monosakarida lima karbon (C5H9O5) yang mengandung korbohidrat dari
deoksinukleotida; deoxyribose umumnya ditemukan dideoxynucleotides adalah 2deoxyribose.
desensitization proses merestart level sensitivitas dari suatu reseptor dikarenakan
kehadiran kligan yang terus menerus. Juga dikenal dengan proses adaptasi.
diabetes suatu penyakit yang bercirikan produksi glukosa yang berlebih oleh hati dan
dibawah kontrol organ lain. Diabetes tipe satu terjadi karena produksi insulin yang terlalu
sedikit. Sedangkan tipe II terjadi akibat reseptor insulin tidak aktif untuk merespon pada
suatu hormon.
diacylglycerol menyampai pesan kedua pada phosphoinositide cascade, yang mengarah
pada pengaktifan protein kinase C.
diagonal electrophoresis suatu cara untuk menentukan ikatan disulfida pada suatu
protein. Pencampuran suatu protein berlangsung saat elektroforesis pada satu jalur kecil
dengan satu arah, ikatan disulfida merupakan ikatan yan irreversibly,dan suau smpel
dielektroforesis dengan arah lurus dengan arah asal. Peptida bermigrasi sebagai satu
ikatan pada arah yang pertama akan menjadi 2 grup pada arah yang kedua jika
mengandung ikatan disulfida.
diastereoisomers sepasang molekul, masing - masing mempunyai lebih dari 1 pusat yang
asimetris, yang mempunyai konfigurasi yang berlawanan pada bagian pusatnya tapi tidak
tumpang tindih jika dicerminkan; pada seri aldotetrose, Derythrose dan D-threose adalah
diastereoisomers.
dicoumarol Lawan dari vitamin K, dimana merupakan factor penting dalam karboksilasi
dari karbon atom di glutamate residu dan pada wilayah asam amino terminal dari
prothrombin; prothrombin yang disintesis dengan kehadiran dari dicoumarol tidak bisa
mengikat ion calcium dan juga tidak bisa menstimulus terjadinya blood-clotting.
differential centrifugation Cara untuk memisahkan komponen sel dengan secara
bertahap meningkatkan kekuatan sentrifugasi. Supernatant dari setiap proses kemudian
disentrifugasi lagi dengan kekuatan yang lebih besar untuk memproduksi pellet dan
supernatant yang lain, dimana yang berikutnya disenrifugasi kembali dengan kekuatan
yang lebih besar. Material awal terdiri dari sel dengan plasma membran yang terganggu.
diffusion coefficient dalam konteks membran, suatu cara untuk mengekspresikan
pergerakan kesamping dari membran; untuk lemak, koefisien difusinya adalah 2 m2 s-1.
digitalis campuran dari cardiotonic steroids yang didapat dari daun kering tanaman
foxglove; steroid ini menghambat pompa sodium-potassium pump.
dihedral angle suatu ukuran untuk sudut rotasi dari suatu ikatan, biasanya diambil antara
-180 dan +180 degrees. Juga disebut dengan torsion angles.
dihydrofolate reductase enzim yang mengkatalis regenerasi tetrahydrofolate dari
dihydrofolate dibentuk pada sintesis dari thymidylate.
Hal 19 (10605016, Ayukireina Siskahaning P.) (10605091, Nur Mustaqim 19-36)
diphtheria toxin suatu racun, diproduksi oleh Corynebacterium diphtheriae, yang
mendapatkan jalan masuk ke dalam sel dengan bantuan endositosis media reseptor dan
membunuh sel dengan ADP-ribosylation dari sintesi elongasi protein faktor 2, ini
menghambat semua sintesis enzim.
direct repair suatu cara memperbaiki DNA yang rusak dimana daerah yang rusak
diperbaiki. Sebagai contoh, pirimidin dimmer sangat mudah dilipat untuk
mengembalikan nukleotida aslinya.
dismutase suatu enzim yang mengkatalis reaksi dismutation dimana satu reaktan diubah
menjadi dua produk yang berbeda.
distributive enzyme enzyme yang mengkatalis elongasi aau degradasi dari suatu polimer
tapi terpisah dari polimer - polimer yang lain setelah tiap proses katalis.
disulfide bond ikatan kovalent yang terbentuk hasil oksidasi dari dua gugus sulfidril;
oksidasi dari residu sistein dalam polipeptida menghasilkan ikatan disulfida
menghubungkan dua residu tersebut.
divergent evolution proses evolusi dari suatu protein dimana suatu property protein
dihasilkan dari nenek moyang yang sama.
DNA gyrase suatu topoisomerase yang mengkatalis ATP-driven yang merupakan
pengenalan yang bersifat negatif kepada DNA. Juga disebut sebagai topoisomerase II.
DNA ligase suatu enzim yang mengkatalis formasi dari ikatan phosphodiester antara
gugus 3'-OH group pada akhir dari salah satu rantai dan dari gugus 5'-phosphate pada
akhir rantai yang satu lag; enzim ini mempunyai peran pada proses sintesis, perbaikan,
dan pemotongan DNA.
DNA polymerases Enzime yang mengkatalis template, unit tambahan dari
bergantung pada faktor-faktor seperti muatan bersih, ukuran, dan bentuk molekul.
electrospray ionization mass spectrometry Suatu cara untuk menentukan massa
protein. Sampel protein disemprotkan ke dalam spektrometri massa, dan massa dari
protein ditentukan oleh perbandingan massa dan muatan protein yang berbeda dalam
jumlah proton yang terikat.
ELISA (enzyme-linked immunoabsorbant assay) Uji untuk mengukur keberadaan
antigen dengan menggunakan enzim yang dihubungkan pada antibodi dari antigen yang
bersangkutan.
elongation, elongasi Bagian kedua dari tiga tahap keseluruhan reaksi polimerisasi
biologi. Pada tahap ini, polimerisasi diakibatkan oleh pengulangan karakteristik proses
utama dari molekul spesifik yang disintesis.
elongation factor, faktor elongasi : Satu dari kumpulan protein yang memfasilitasi fase
elongasi dari sintesis protein.
elongation factor G (EF-G) Anggota dari keluarga protein-G yang menyerupai
kompleks EF-Tu dan tRNA. Hidrolisis GTP oleh EF-G menyebabkan tRNA dan mRNA
bergerak melewati ribosom menyesuaikan jarak ke satu kodon.
Hal 21 (10605018, Pramila Deva E.)
elongation factor Ts (EF-Ts) protein yang terikat pada GDP membentuk EF-Tu dan
memyebabkan lepasnya GDP, dan memungkinkan EF-Tu untuk berparisipasi dalam
proses elongasi yang lain.
elongation factor Tu (EF-Tu) anggota dari kelluarga G-protein yang mengantarkan
aminoacyl-tRNAs ke sisi A dari suatu ribosome bersamaan dengan berlangsungnya
proses hidrolisis dari GTP ke GDP.
Embden-Meyerhof pathway glikolisis.
enantiomers sepasang molekul, masing- masing mempunyai stu atau lebih atom C kiral,
yang saling tumpang tindih jika keduanya dihadapkan.
endocytosis proses membuat bagian eksternal membran menjadi bagian dalam dengan
invaginasi dan melipat sel membran.
endoplasmic reticulum (ER) perluasan dari system membran sitoplasmik yang terdiri
dari setengah total sel membran. Wilayah dari RE yang berikatan dengan ribosom disebut
RE kasar sedangkan yang tidak memiliki ribosom disebu RE halus.
endosome komponen dari jalur endositosis mediate reseptor dimana keputusan untuk
mensortir tentang perlu tidaknya material endositosis dibuat; endosomes diurunkan dari
vesikula- vesikula yang kehilangan jubah clathrinnya.
energy charge suatu car untuk menentukan status energi dari suatu sel, sama dengan
konsentrasi ATP ditambah 1,5 konsentrasi dari ADP, dan semuanya dibagi dengan total
konsentrasi adenin.
enhancers untai DNA ynag tidak mempunyai promotor untuk beraktifitas, tapi bisa
meningkatkan aktifitas promotor yang lain; yang menaikkan aktifitas bisa menghasilkan
efek stimulatory dari jarak beberapa ribu nukleotida. enhancers can exert their
evolusi dengan melakukan penataan ulang exon yang ditandai dengan struktur unsure
yang mempunyai cirri-ciri sendiri.
Exonuclease Enzyme yang mencernakan asam nukleat dari molekul akhir, dari pada pada
bagian dalam; exonuclease dapat dispesifikkan untuk pencernaan dari 3 atau 5 akhir dari
asam nukleat.
Extinction coefficient () Ukuran kemampuan senyawa untuk menyerap cahaya,
pemberian pada setiap unit, yang mana unit tersebut merupakan timbal balik molaritas
dan jarak dalam sentimeter (M-1 cm-1 ).
Extrinsic clotting pathway Blood-cloting mengalir pada aktivitas enzyme yang
dikenali oleh aktivasi factor VII dan pelepasan factor jaringan lipoprotein, dimana
keduanya digerakkan oleh jaringan trauma.
Hal 23 (10605020, Ega Wisnu Adiguna)
Fab fragment satu dari dua rantai polipeptida 50-kd yang diproduksi saat
immunoglobulin G terlipat oleh protease papain; fragment Fab mengikat anigen tetapi
tidak bisa menyatukan antar antigen, karena tiap fragment hanya punya satu sisi aktif
untuk satu antigen. bind antigens but cannot cross-link them, because each fragment has
only one binding site for an antigen.
Fc fragment satu dari dua rantai polipeptida 50-kd yang diproduksi saat immunoglobulin
G terlipat oleh protease papain; fragment Fc yang lengkap dengan IgG molekul tidak bisa
berikatan dengan antigen tetapi bisa menjadi media untuk aktivitas penting biologi
lainnya sepert fiksasi.
facilitated diffusion Transport dari suatu ion atau molekul menurini gradien konsentrasi,
diamana.G untuk species yang ditransprkan bernilai negatif. Disebut juga dengan pasif
transport.
F-actin filamen dari monomer G-actin yang bersifat polar, merangkai sendiri, dan
polimer yang dinamik.
facultative anaerobes organisme yang bisa bernafas secara aerob dan anaerob,
menggunakan fermentasi sebagai sumber dari energi selular, pada saat oksige tidak ada.
FAD and FADH2 (flavin adenine dinucleotide) sutu pembawa electron yang penting
dalam oksidasi bahan bakar molekul. Mengoksidasi bentuk FAD dan mereduksi bentuk
FADH2. dan mengandung flavin moiety dan unit AMP; electron dibawa pada
isoalloxazine dari suatu melekul.
familial hypercholesterolemia penyakit yang berasal dari tidak berfungsinya reseptor
endositosisuntuk kolesterol. Penyakit ini menyebabkan kadar kolesterol dalam darah
meninggi dan mengakibatkan penyempitan pembuluh darah dan serangan jantung.
fatty acid synthase suatu sisem enzim yang mengkatalis sintesis dari suatu rantai
panjang asam lemak dari asetil CoA, malonil CoA, dan NADPH; pada bakteri, unsur
pokok dari kompleks pensintesisan bisa dipisahkan pada saat ekstrak sel siap; pada
mamalia, semua unsure pokok aktivitas enzim pada sintesis asam lemak adalah bagian
dari polipeptida yang sama.
fatty acids asam karboksilat yang mengandung rantai hidrokarbon yang panjang yang
merupakan sumber bahan bakar penting seperti komponen penting pada membran lemak.
feedback inhibition suatu metode regulasi enzim dimana produk akhir dari suatu
biosintesis menghambat enzim yang pertama kali mengkatalis pada jalur metabolisme.
feedforward stimulation pengaktivasian dari enzim allosteric dengan menggunakan
produk hasil reaksi yang pertama kali terjadi dalam jalur metabolisme.
fermentation proses menghasilkan ATP dimana komponen organic bertindak sebagai
donor dan penerima electron; fermentasi bisa dilakukan pada lingkungan yang tidak ada
oksigennya.
Hal 24 (10605022, M. Fernando)
ferrihemoglobin hemoglobin yang mana komponen besi dari gugus prostetik heme
adalah dalam bentuk ferri (+3); ferrihemoglobin tidak bisa mengikat oksigen.
ferrohemoglobin hemoglobin yang mana komponen besi dari gugus prosterik adalah
dalam bentuk ferro (+2); ferrohemoglobin dapat mengikat oksigen.
fertility factor, factor fertilitas sebuah plasmid bakteri yang mengandung gen-gen yang
dibutuhkan untuk konjugasi.
first messenger hormon; molekul-molekul yang mentranduksi sinyal dari satu jaringan
ke jaringan yang lain (jaringan target) melalui darah
Fischer projection, proyeksi fischer merupakan gambaran stereokimi dari molekul.
Dalam proyeksi Fischer suatu molekul, atom-atom bergabung pada atom karbon
asimetrik dengan mengikat secara horizontal dan vertical.
flagella, eukaryotic struktur menyerupai rambut yang disusun oleh mikrotubul dan
terletak di permukaan sel; pergerakannya mendorong sel.
flagella, prokaryotic bagian ekstraseluler yang digunakan untuk pergerakkan bacteria;
dibutuhkan energi yang diturunkan secara langsung dari pompa-proton melalui
membrane sel
Flagellin komponen protein dari flagella bakteri
Flavin pembawa electron yang menggunakan riboflavin dalam reaksi electron-transer;
FAD, FADH2, FMN, dan FMNH2 adalah contoh flavin
Flavin mononukleotida (FMN) Ko-enzim untuk reaksi oksidasi-reduksi yang
diturunkan dari vitamin riboflavin. Akseptor electron dari FMN, cincin isoalokazin,
identik dengan FAD, tetapi FMN kehilangan komponen adenil nukleotida dari FAD.
Flavoproteins protein yang berasosiasi dengan FAD atau FMN; flavoprotein berperan
penting dalam banyak reaksi oksidasi reduksi
Fli G sebuah protein bakteri flagelar yang merupakan bagian dari cincin MS (membrane
dan supermembran) ; Fli G dalam kombinasi dengan protein flagelar MotA/MotB,
membentuk sebuah saluran proton yang mengendarai rotasi dari flagela
Model mozaik fluid gambaran dari membrane sebagai solusi dua
dimensional dari lipid dan protein globular
fluid mosaic model,
G- actin . monomer aktin yang bergabung untuk membentuk filament yang disebut aktin
-F
G ( olf ) sebuah sub unit , yang terekspresikan secara unik dalam cilia olfaktori dari
protein G yng bergabung dengan receptor Odorant.
Hal 26 (10605024, Jayanti Anggraeni)
galactosemia Penyakit berupa muntah-muntah, diare, disfungsi hati, dan terkadang
terhambatnya perkembangan mental, disebabkan oleh akumulasi galaktosa karena
defisiensi transfer galaktosa 1-fosfat uridyl.
-galactosidase Enzim essensial yang menghidrolisis laktosa menjadi galaktosa dan
glukosa dalam metabolisme laktosa.
ganglioside Sebuah ceramide, biasa terdapat di sistem saraf, dimana oligosakarida
dihubungkan dengan ceramide tersebut oleh residu glukosa.
gap junctions Jalur antara bagian dalam dua sel yang berdekatan/berbatasan. Juga
dikenal sebagai saluran sel ke sel.
GC box Komponen dari beberapa promotor sel eukariot, terutama pada diekspresikannya
gen. Urutan umum untuk GC box adalah 5'-GGGCGG-3'.
gel-filtration chromatography Teknik pemisahan berdasarkan perbedaan ukuran.
Sampel dimasukkan ke kolom berpori. Molekul besar berpindah melalui kolom lebih
cepat dibanding molekul kecil karena molekut tersebut tidak dapat memasuki pori dan
memiliki jalur yang lebih singkat.
gene duplication Duplikasi gen pada proses replikasi. Salah satu produknya dapat
mengakumulasikan mutasi dan secara berkala berevolusi menjadi gen berbeda tetapi
terkait fungsinya.
general acid-base catalysis Katalisis dimana molekul selain air melakukan pengaturan
pada donor proton atau penerima proton.
general acid catalysis Katalisis asam dimaa sumber protonnya adalah gugus donor yang
memiliki atom H+ berlebih.
genetic code Hubungan antara rangkaian informasi asam nukleat dan rangkaian
informasi protein.
genomic library Kumpulan fragmen DNA, yang disisipkan pada molekul vektor, yang
menampilkan keseluruhan genom suatu organisme.
gigaseal Ciri resitansi (perlawanan) tingakat tinggi yang dibentuk antara pipet dan
potongan kecil membran plasma, dibutuhkan dalam teknik patch-clamp.
globin fold Struktur lipatan rantai polipeptida, terbentuk dari myoglobin dan subunit
hemoglobin, yang menciptakan lingkungan untuk mengikat oksigen pada gugus heme
secara reversibel.
Glucagons Hormon polipeptida yang diseksresikan oleh sel-sel pankreas saat tingkat
glukosa darah rendah dan memecah glikogen di hati dan melepas glukosa ke darah.
unit
siklus glioksilat Sebuah jalur metabolisme yang mengubah unit duakarbon menjadi suksinat (succinate) untuk produksi energi dan biosintesis; pada
umumnya ditemukan pada bakteri dan tumbuhan, siklus ini melalui dua langkah
dekarboksilasi pada siklus asam sitrat dan memungkinkan formasi jala dari glukosa dan
molekul lain untuk melewati oksaloasetat dari asetat atau asetil KoA.
glyoxylate cycle,
efisiennya jumlah hemoglobin normal atau ketidakaftifan jumlah normal dari rantai
hemoglobin
Hemophilia kekacauan dari penggumpalan darah, dimana satu atau protein lain pada
jalur pembekuan darah tidak aktif atau hilang.
Hal 31 (10605033, Rafi Herfini)
heptoses Monosakarida yang mempunyai tujuh atom karbon.
hereditary nonpolyposis colorectal cancer (HPCC) Suatu bentuk yang biasa
diturunkan pada penyakit kanker usus besar disebabkan tidak sempurnanya perbaikan
dari DNA yang tidak sebanding.
Hers disease Penyakit yang diakibatkan karena kekurangan glycogen phosphorylase hati,
glycogen menimbulkan naiknya jumlah dengan sedikit efek klinis.
heterotrophs Organisme yang mendapat energi hanya dari bahan bakar kimia dan
akhirnya bergantung kepada autotrof untuk bahan bakar.
heterotropic effects Efek dari molekul nonsubstrat pada enzim.
hexokinase Suatu kinase yang memfosforilase enam gula karbon, biasanya glukosa, di
lakukan oleh ATP.
hexoses monosakarida yang mempunyai enam karbon.
high-density lipoprotein (HDL) Suatu lipoprotein yang mengambil kolesterol dari sel
yang sekarat, dari membran dikeluarkan, di esterifikasi, lalu kolesterol ester di transfer ke
hati dan jaringan lainnya.
histone acetyltransferase (HAT) Enzim yang mengkatalis kumpulan asetil dari aselit
KoA menjadi sisa spesifik residu di daerah terminal amino darihistone. enzim ini
mempunyai peran penting di dalam modifikasi struktur kromatin yang mempertinggi
transkripsi.
histone deacetylase Enzim yang mengkontribusi penghambatan proses transkripsi
dengan deasetilasi dari sisan asetilasi lisin di histones.
histones tingginya konsentrasi sekumpulan kecil protein ditemukan di eukariot
bergabung dengan DNA untuk membentuk nudeosomes.
Holliday junction Struktur yang bersilang, dibentuk dari empat rantai polinukleotida
yang merupakan kunci lanjutan di proses rekombinan.
holoenzyme Enzim yang mengandung komponen protein membangun tubuh utama dari
enzim (apoenzim) dan kofaktor yang penting, dan biasanya kecil.
homologous recombination Rekombinasi diantara segmen yang homolog dari dua
molekul DNA, dan biasa disebut rekombinasi umum.
Homologs Molekul yang berkembang dari leluhur yang biasa, juga berfungsi sebagai
molekul yang homolog.
homotropic effects Efek dari molekul substrat di enzim allosteric.
horizontal gene transfer perpindahan rangkaian dari DNA (plasmid) diantara spesies
metilglutaril CoA reduktase Sebuah enzim peregulasi tertinggi, yang dapat mengatalisis
tahapan sistesis kolesterol; formasi mevalonat dari 3-hidroksi-3-metilglutaril CoA.
Hal 33 (10605035, Wulan Sary)
hyperammonemia Suatu kondisi tingginya kadar ammonia dalam darah akibat siklus
urea yang menurun, yang dapat mengakibatkan kerusakan pada otak dan kematian.
hyperchromism Kenaikan tingkat penyerapan cahaya disebabkan oleh pasangan basa
yang tidak bertumpuk saat rantai ganda DNA melebur menjadi rantai tunggal.
hypersensitive sites Daerah pada kromosom yang sensitive pada pencernaan oleh
exogenous DNAses; daerah yang biasanya berlokasi pada ujung 5 gen yang aktif
ditranskripsi.
hyperuricemia Kadar blood urate yang berlebihan; hyperuricemia dapat menyebabkan
penyakit encok.
hypervariable loop Pada cahaya immunoglobulin dan rantai berat, segmen polipeptid
yang memiliki variasi urutan yang bagus dan bertanggungjawab pada kekhususan
antigenic.
hypervariable segment Pada cahaya immunoglobulin dan rantai berat, segmen
polipeptid yang memiliki variasi urutan yang bagus dan bertanggungjawab pada
kekhususan antigenic.
hypocromism Penurunan dalam koefisien penyerapan saat rantai tunggal DNA menjadi
bentuk rantai ganda.
hypoxanthine Basa purin yang bereaksi dengan 5-phosphoribosyl-1-pyrophosphate
(PRPP) menjadi bentuk inosinate; reaksi merupakan bagian dari jalan penyelamatan
purin.
I
I-cell disease Penyimpanan penyakit lisosomal yang lepas dari lisosom dalam proses
hidrolase tertentu karena kerusakan pada sintesis sinyal target lisosomal.
IDLs (intermediate-density lipoproteins) Partikel lipoprotein yang tersisa banyak dari
triacylglycerides yang berasal dari proses hidrolisis dan penyerapan VLDL oleh jaringan
lain; dapat diserap oleh hati atau diubah kedalam LDL
immunoglobulin Lihat antibody
immunoglobulin A (IgA) Kelas utama antibody dalam sekresi eksternal seperti saliva,
air mata, lendir pada cabang tenggorokan dan lender pada usus.
immunoglobulin D (IgD) Suatu antibody yang belum diketahui fungsinya.
immunoglobulin E (IgE) Suatu antibody ssbagai proteksi untuk melawan parasit; IgE
juga memulai proses reaksi suatu alergi.
immunoglobulin fold Struktur umum immunoglobulin dimana dua lembaran luas dari
untaian antiparalel mengelilingi bagian rantai yang hidroponik dan secara
komplementer mendeterminasi bagian pasangan domain variable untuk membentuk
daerah yang berikatan pada anti gen.
Hal 34 (10605036, Irma Hediyanti)
immunoglobulin G ( IgG) Antibodi utama di (dalam) serum; IgG
[memiliki/mempengaruhi] dua sisi pengikatan antigen.
immunoglobulin M (IgM) Kelas antibodi utama yang muncul dalam serum setelah
pembukaan suatu antigen; IgM [memiliki/mempengaruhi] sepuluh sisi pengikatan
antigen.
Daerah intraselular
dari Ig- dan Ig- membran protein B sel yang belum dewasa; ketika antigen mengikat
membrane loncatan dari sel B, wilayah ITAM Ig- and Ig- telah difosforilasi dimana
inisiasi mendorong ke arah pertumbuhan sel dan diferensiasi sel B.
immunoreceptor tyrosine-based activation motif (ITAM)
Induced fit Modifikasi bentuk dari suatu lokasi aktif di (dalam) suatu enzim setelah
substrat terikat.
Inducer Suatu molekul kecil yang mengikat pada suatu represor dan mengubah
interaksinya dengan suatu operator.
Inhibitor 1 Suatu protein yang, ketika di fosforilasi, menghalangi aktivitas protein
phosphatase 1 dan dengan demikian mendukung penguraian glikogen dan menghalangi
sintesis glikogen.
inisiasi Hal pertama dari tiga langkah umum untuk semua polymerisasi
reaksi biologi; langkah ini menetapkan kondisi-kondisi untuk permulaan proses
polymerisasi.
initiation,
faktor inisiasi Salah satu dari satu set protein yang membantu
asosiasi ribosome, mRNA, dan inisiator tRNA untuk memulai proses sintesis protein.
initiation factor,
Inosinate Suatu purine nucleotida yang dibentuk oleh reaksi hypoxanthine dengan 5phosphoribosyl-1- pyrophosphate ( PRPP); sebuah precursor untuk AMP dan GMP.
Inositol 1,4,5-trisphosphate pembawa kedua dari aliran phosphoinositid yang
menyebabkan peningkatan level Kalsium intraseluler.
insersi suatu jenis mutasi di mana satu atau lebih pasangan basa yang tidak
sesuai tersisip ke dalam DNA.
insertion,
insertion sequence, urutan insersi DNA transposon sederhana, disusun dari urutan
kilobasa yang menspesifikasi transposase dan dibatasi ujung lain oleh pengulangan
terminal yang berlawanan; urutan insersi dapat menyisipkan dirinya sendiri ke setiap sisi
pada kromosom bakteri.
insertional inactivation, inaktivasi insersi inaktivasi gen yang berlangsung ketika
fragmen DNA yang tidak berkerabat disisipkan pada sisi restriksi; inaktivasi gen untuk
resistensi antibiotik pada plasmid dapat digunakan untuk mendeteksi letak pada plasmid
tersebut yang telah disisipkan oleh fragmen DNA.
Insulin Hormon polipeptida yang disekresikan oleh sel-sel pancreas, yang menstimulasi
penyimpanan gula darah dan sintesis protein.
integral membrane proteins, protein integral membran Protein terdapat pada
membran yang berinteraksi secara luas dengan rantai hidrokarbon pada lipid membran
dan biasanya membentangkan membran.
intercalating agents, agen interkalasi datar, bahan aromatik yang dapat disisipkan di
antara pasangan basa yang berdekatan pada DNA rantai ganda; agen ini, seperti etidium
bromide, dapat menyebabkan insersi dan delesi.
intermediate filaments, filament intermediet Filamen-filamen yang disusun dari
komponen sitoskeleton sel epitel yang kira-kira berdiameter 7-10 nm; keratin merupakan
filament intermediet.
intrinsic clotting pathway, jalur penggumpalan intrinsik Penggumpalan aliran darah
pada aktivitas enzim diinisiasi oleh aktivasi faktor XII selama kontak dengan protein
aktivasi (kininigen dan kalikrein) dengan permukaan sel yang abnormal disebabkan oleh
luka; setidaknya enam protein telah teraktivasi pada jalur pembentukan thrombin dan
melanjutkan urutan guna pembekuan darah.
intrinsic factor, faktor intrinsik Glikoprotein disekresikan ke usus untuk mengikat
vitamin B12 dan membantu absorpsi sampai ke epitel usus halus.
Introns Bagian transkripsi utama yang dihapus pada mRNA yang matang. Disebut juga
urutan intervening.
Inversion, inverse Urutan nukleotida dimana keadaan normal dibalikkan di dalam gen
atau kromosom.
inverted region, bagian yang mengalami inversi Ditujukan untuk laju optimal pada
transfer elektron sebagai fungsi dari energi bebas pada gaya yang diarahkan; laju transfer
elektron meningkat terhadap bagian yang mengalami inversi seperti energy bebas pada
gaya yang diarahkan meningkat, namun kemudian menurun dengan dilanjutkan oleh
meningkatnya gaya tersebut.
inverted terminal repeats, pengulangan terminal yang mengalami invers Urutan 2
atau lebih pasang basa di ujung yang berlawanan pada urutan insersi bakteri.
ion channels, saluran ion Sistem transpor pasif untuk ion pada laju transport yang
sangat tinggi; saluran ion sering menampilkan derajat yang tinggi pada spesifikasi untuk
ion transport.
Ion-exchange chromatography, kromatografi penukar-ion Teknik pemurnian protein
berdasarkan muatan protein. Protein diterapkan sebagai matriks inert tempat
menempelnya kedua bagian yang bermuatan (misalnya gugus karboksil). Protein akan
berikatan pada matriks yang daya tarik yang seimbang untuk isi dari konterion (misalnya
muatan positif yang dimiliki matriks karboksil).
Hal 36 (10605038, Putri Astriani)
IRE (iron-response amount) Sebuah protein besi yang sensitif yang dapat meregulasi
kemampuan menerjemahkan dari ferritin mRNA dan kestabilan transferrin penerima
mRNA dengan berikatan kepada struktur putaran batang disebut juga elemen respon besi
yang terdapat pada molekul mRNA.
iron-response element (IRE), elemen respon besi Struktur putaran batang ditemukan di
dalam mRNA untuk ferritin dan penerima transferrin yang berinteraksi dengan ikatan
protein-IRE dan meregulasi penerjemahan dari mRNA.
iron-sulfur proteins, protein besi-sulfur Protein yang terdiri dari sekelompok besi dan
sulfur yang memegang peranan dalam reaksi transfer electron; siklus besi diantara Fe2+
and Fe3+. Disebut juga nonheme protein besi.
irreversible inhibitor, inhibitor yang tak dapat balik Sebuah inhibitor yang mengikat
dengan sangat kuat kepada enzim targetnya, baik kovalen maupun nonkovalen; seperti
inhibitor yang berasosiasi dengan sangat lambat terhadap enzim.
isocitrate dehydrogenase Enzim yang mengkatalisis isositrat oksidatif dekarboksilat
menjadi bentuk -ketoglutarate; berperan dalam mengontrol kecepatan dari siklus citric
acid.
isocitrate lyase Enzim dari siklus glyoxylate, isositrat lyase memecah isositrat ke dalam
succinate and glyoxylate
isoelectric focusing, pemusat isoelektrik Suatu teknik untuk memisahkan protein.
Campuran protein menjalani elektroforesis di dalam gradient pH; setiap protein akan
bermigrasi di dalam medium elektrik sampai mencapai nilai isoeletrik.
isoelectric point (pI) pH protein yang mana harga netnya sama dengan nol.
Isomerase Sebuah enzim yang mengkatalisis antarkonversi dari bentuk isomer dari suatu
senyawa.
isomerization reaction,
molekulnya disusun.
Isopentenyl pyrophosphate Isoprena aktif: bangunan dasar dari kolesterol.
3-isopentyl pyrophosphate Pertanda dari kolesterol sebaik beberapa macam biomolekul
lainnya seperti vitamin K, koenzim Q, dan karotenoid, Isopentyl pyrophosphate didapat
dari mevalonate.
isopropylthiogalactoside (IPTG) Penyebab dari lac operon; IPTG mengikat penahan
lac dan mengurangi afinitas penahan untuk DNA operator, yang mempersilakan
transkripsi untuk mengambil tempat.
Hal 37 (10605039, Utami Kusuma D.) (10605093, Kusnata 37-55)
Isozim Enzim yang terdapat pada organisme yang mengkatalis reaksi yang sama tapi
berbeda dalam struktur; perbedaan ini mungkin berasal dari satu atau beberapa residu
asam amino. Juga disebut isoenzim
J
joule Sejumlah energi yang dibutuhkan untuk menggunakan kekuatan 1 newton untuk
menenpuh 1 meter; satu kilojoule (Kj) sama dengan 1000 joule atau 0.239 kcal.
K
asam amino ketogenik Asam amino yang berasal dari tulang
karbon, seluruhnya atau sebagian , mendegradasi asetil CoA atau asetoasetil CoA, hanya
leusin dan lisin yang soleli ketogenik
ketogenic amino acids,
ketose monosakarida yang memiliki gugus keton biasanya sebagai mengoksidasi karbon.
kilobase Unit dari panjang basa setara dengan 1000 pasang basa yang terdiri dari
double-stranded molekul asam amino atau 1000 basa untuk molekul single-stranded.
kilocalorie
(kcal), kilocalori Suatu unit energi yang setara dengan 1000 kalori, atau
4.184 joule.
kinase Merupakan enzim yang mengkatalis grup posforil menjadi substrat yang
digunakan sebagai donor posforil pada ATPkinesin A protein with ATPase activity that
moves cellular organelles along microtubule tracks in anterograde transport.
Klenow fragments Sebagai pencerna produk proteolitik dari DNA polimerase I yang
menahan polimerase dan aktivitas 3' ke 5' eksonuklease.
Krebs cycle, siklus Krebs lihat siklus asam sitrat.
L
lac operon Operon yang mengkode gen menjadi metabolisme laktosa.
lac repressor protein regulator yang mengikat bagian dari lac operon yang dengan
demikian menghambat ekspresi struktural gen dari operon; Inhibisi ini dibebaskan ketika
protein represor mengikat allolaktosa, merupakan induser dari lac operon
hal 38 (10605040, Agung Kusumanto)
lactic acid fermentation, fermentasi asam laktat Metabolisme anaerobic dari glukosa
untuk menghasilkan asam laktat yang bersamaan dengan produksi ATP.
Lagging strand Sebuah helaian DNA yang baru tersintesis pada percabangan replikasi
yang menandakan sintesis fragmen-fragmen Okazaki. Lihat juga leading strand.
lateral diffusion, difusi lateral Kemampuan molekul-molekul lipid dan protein untuk
berpindah secara lateral pada membran secara spontan dan berkesinambungan.
Leading strand Sebuah helaian DNA yag baru tersintesis pada percabangan replikasi
yang tersintesis secara terusmenerus. Lihat juga lagging strand.
Leber's hereditary optic neuropathy, kelainan hereditas optik Leber Sebuah bentuk
warisan kebutaan maternal dalam rangka mutasi pada reduktase NADH-Q; salah satu dari
penyakit mitokondria.
Lectins protein nabati dengan affinitas tinggi untuk residu gula-gula spesifik; pada
umumnya merupakan pengenal-pengenal penting pada molekul-molekul yang
mengandung karbohidrat
Leghemoglobin Sebuah hemoglobin homolog yang ditemukan pada tanaman polongpolongan yang juga merupakan tempat simbiosis bakteri nitrogen-fixing; leghemoglobin
mengikat oksigen, yang kemudian melindungi enzim nitrogenase dari inaktivasi.
Leptin Sebuah hormon polipeptida, dikeluarkan oleh sel-sel pengsintesis dan penghasil
lemak dalam proporsinya secara langsung pada jumlah lemak yang menggenerasi sinyalsinyal satiasi.
Lesch-Nyhan syndrome, sindrom Lesch-Nyhan Sebuah penyakit yang dihasilkan dari
hilangnya sebuah enzim dalam alur pengaman untuk purin-purin; terdeteksi dengan
keterbelakangan mental, rasa permusuhan ekstrim, mutilai diri.
Lever arm, lengan pengungkit sebuah helix penjang yang mengungkit fragmen S1
myosin untuk mengikat rantai ringan; memperbesar perubahan-perubahan kecil structural
pada situs ikatan nukleotida dari myosin untuk mencapai perpindahan 110- sepanjang
filamen aktin.
Ligand sebuah molekul kecil yang mengikat pada sebentuk protein, termasuk perubahan
struktur spesial. Contohnya, steroid adalah ligand untuk reseptor hormon steroid.
Ligand-gated channel sebuah saluran membran penghantar yang terbuka melalui
pengikatan satu atau lebih molekul-molekul pada domain pengikat ligand dari protein
saluran.
reaksi ligasi Reaksi yang membentuk ikatan-ikatan dengan
menggunakan energi dari hidrolisis ATP.
ligation reactions,
Light (L) chain, rantai ringan L Sebuah polipeptida 25-kd yang merupakan salah satu
dari dua tipe rantai yang ditemukan dalam immunoglobulin G. Setiap L chain
mengandung sebuah region variable dan region konstan.
Light-harvesting complex, kompleks pengumpul cahaya Sebuah kompleks pigmenpigmen penyerap cahaya yang secara utuh melingkupi pusat reaksi fotosintesis;
mengumpulkan energi cahaya yang terserap menuju pusat reaksi
Hal 39 (10605042, Mahendra Primajati)
light meromyosin (LMM). Bersama dengan meromiosin besar, satu dari produk
pencernaan triptik yang berasal dari myosin; membentuk filament tetapi tidak memiliki
enzim ATPase atau aktifitas pelekatan aktin.
light reactions, reaksi terang Terjadi di kloroplas, merupakan reaksi yang memerlukan
cahaya untuk menciptakan potensial reduksi dan memproduksi oksigen.
linking number, angka penghubung Merupakan perangkat DNA sirkuler, yang sama
dengan jumlah helai DNA yang mengelilingi helix axis.
lipid bilayer. Suatu lapisan biomolekul yang terbentuk dari molekul amfipatik yang
terdiri dari sisi hidrofobik yang terletak di bagian dalam lapisan dan sisi hidrofilik yang
merupakan bagian yang suka air.
lipoic acid (6, 8-dithiooctanoic acid). Merupakan kelompok asil yang berfungsi sebagai
kofaktor enzim dihidrogenase; dihubungkan secara kovalen ke residu lisin yang spesifik
dalam protein enzim, ia juga berfungsi sebagai pembuka dan penutup ikatan, melalui
pengubahan siklus katalisis.
Lipolysis, lipolisis merupakan enzim hidrolisis dari triasilgliserol menjadi asam lemak
bebas dan gliserol.
lipoprotein particles, partikel lipoprotein Partikel yang memiliki inti lipida hidrofob dan
dikelilingi oleh lapisan asam lemak yang polar dan protein spesifik, yang memiliki
peranan dalam transport kolesterol dan triacylglycerol.
liposomes. Vesikula lemak yang memiliki daerah terlarut yang ditutupi oleh lapisan
lemak ganda bilayer.
long terminal repeat. Rangkaian yang diulang pada kedua sisi ujung dari DNA
retroviral.
Lovastatin. sebuah inhibitor kompetitif dari HMG-CoA reductase, kunci pengaturan
enzim didalam biosintesis kolesterol; digunaka secara terapi untuk menurunkan tingkat
kolesterol. Juga disebut mevinolin.
low-density lipoprotein (LDL). Pembawa utama kolesterol dalam darah; terdiri dari
sebuah inti dari molekul kolesterol yang diesterifikasi dikelilingi oleh sebuah lapisan dari
fosfolipid, kolesterol yang tidak di esterifikasi, dan apoprotein B-100; sumber utama dari
kolesterol untuk sel lainnya daripada hati atau usus.
lysogenic bacteriophage. Virus pemakan bakteri yang memiliki DNA yang bersatu
kedalam sel inang oleh rekombinasi tempat spesifik dan memiliki sifat ditunjukkan.
lysogenic bacterium. Sel bakteri yang memiliki kromosom yang mengandung prophage.
lytic bacteriophage. Phage yang bereplikasi ke dalam inangnya kemudian mengalami
lisis atau inangnya hancur.
Hal 40 (10605043, Nailulkamal Djamas)
magnetosomes Rangkaian partikel intraseluler berukuran kecil yang mengandung medan
magnet magnetite (Fe3O4) dan terdapat pada beberapa bakteria untuk mendeteksi medan
magnet bumi.
main chain Pengulangan bagian secara berurutan pada struktur primer polipeptida;
setiap unit terdiri atas suatu rantai yang meliputi atom -karbon seperti halnya kelompok
CO dan NH pada residu asam amino.
main olfactory epithelium Daerah spesifik pada hidung yang mengandung hampir
sejuta sensor saraf dan berfungsi untuk mendeteksi bau.
major groove Suatu lekukan pada B-DNA yang memiliki lebar sebesar 12 dan
memiliki kedalaman sebesar 8,5 yang dihasilkan dari kenyataan bahwa ikatan glikosida
pada pasangan basa tidak terbagi secara diametris satu dengan yang lain.
major histocompatibility complex (MHC) Membran protein integral yang berikatan
dan terletak pada permukaan peptida suatu sel dan merupakan hasil turunan pencernaan
protein dari sitosol (protein MHC kelas I) atau dari bagian endosomal (protein MHC
kelas II). Peptida asing yang berikatan dengan protein MHC kelas I menandakan
penghancuran pada protein oleh penghancur berupa T-sel sedangkan peptida asing yang
berikatan dengan protein MHC kelas II akan menghasilkan sinyal bagi T-sel pembantu
yang dapat menstimulasi produksi B-limfosit.
malate-aspartate shuttle Rangkaian reversibel yang terdapat pada hati dan jantung dan
digunakan untuk mengangkut elektron dari NADH pada sitoplasma ke NAD+ pada
mitokondria.
malate synthase suatu enzim pada siklus glikolisis yang mengkatalisasi terbentuknya
oksaloasetat dari glikolisis dan Asetil KoA.
manganese center Sisi pada generasi oksigen di dalam proses fotosintesis tumbuhan
hijau. Pusat tersebut adalah suatu kompleks yang mengandung empat ion mangan, yang
mendonorkan elektron pada P680 bermuatan positif. Setelah mendonorkan empat
elektron, pusat mangan mengoksidasi dua molekul air untuk melepaskan elektronelektron dan membentuk suatu molekul tunggal yang terdiri dari oksigen molekular dan
empat proton.
maple syrup disease Suatu penyakit yang dihasilkan dari ketidakmampuan untuk
mengoksidasi cabang rantai asam amino dan ditandai dengan penurunan kondisi mental
dan fisik serta urin yang berbau seperti sirup maple.
matrix-assisted laser desorption-ionization time of flight spectrometry (MALDITOF) Suatu teknik yang digunakan untuk mendeterminasi suatu massa protein. Sampel
protein terdapat di dalam matrix dan terionisasi oleh aplikasi suatu sinar laser. Medan
listrik memindahkan ion-ion melewati saluran yang mengambang menuju sebuah
detektor. Ion terkecil akan tiba terlebih dahulu di detektor.
maximal velocity Tingkat tertinggi pada reaksi katalisasi enzim di mana konsentrasi
enzim dan substrat yang dicampurkan bersifat konstan.
McArdle disease Suatu penyakit yang disebabkan oleh kekurangan fosforilasi oksigen
pada otot; glikogen terdapat pada jumlah yang meningkat namun memiliki struktur yang
sama; ciri-ciri klinis meliputi ketidakmampuan untuk melakukan olahraga yang bersifat
berat.
Hal 41 (10605044, Winda Agustiani)
megasynthases Kelas besar, enzim multifungsi, termasuk asam lemak sintase, yang
berperan dalam jalur sintetik step-by-step
melting temperature Suhu dimana struktur molekul biologi kedua atau yang lebih tinggi
hilang; untuk asam nukleat, suhu leleh didefinisikan sebagai suhu dimana setengah dari
struktur helix hilang
membrane asymmetry Ditujukan pada fakta bahwa dua fasa penting membran berpisah
satu sama lain secara biologis.
membranes Struktur seperti kain tersusun atas lipida dan protein, umumnya hanya
sedikit molekul tebal, yang membentuk batasan tertutup diantara kompartemen yang
berbeda; membran memisahkan lingkungan berair.
messenger RNA (mRNA) Template untuk sintesis protein; urutan basa mRNA saling
melengkapi gen yang terdapat di DNA.
metabolism Penyatuan besar jaringan pada jalur kimiawi yang memungkinkan sebuah
sel mengekstraksi ebergi dari lingkungan dan menggunakan energi tersebut untuk
keperluan biosintesis.
metabolon Nama untuk multienzim kompleks yang besar yang memfasilitasi saluran
substrat diantara sisi aktif.
metabotrophic glutamate receptor Sebuah reseptor 7TM yang mengikat
neurotransmitter glutamat; sebuah versi kerucut yang bagian atasnya terpotong dari
protein yang sama yang mendeteksi rasa, masa umami glutamat.
metal ion catalysis Katalisis dimana logam berperan sebagai katalis elektrofilik dengan
menstabilkan serangan negatif pada reaksi intermediet, menghasilkan sebuah nukleofili
dengan meningkatkan keasaman molekul disekitarnya, atau meningkatkan pengikatan
energi inetraksi enzim-substrat dengan cara berikatan dengan substrat.
methotrexate Sebuah inhibitor kompetitif dari dihidrofolat reduktase, sebuah enzim yang
dibutuhkan dalam regenerasi koenzim tetrahidrofolat, yang sangat penting dalam sintesis
thymidylate; methotrexate digunakan sebagai agen pengobatan kemoterapi. Disebut juga
amethopterin.
mevalonate Sutu pelopor dalam sintesis kolesterol; formasinya dengan HMG-CoA
reduktase membentuk langkah dalam biosintesis kolesterol.
micelle Suatu struktur globular dibentuk oleh molekul amphipathic dimana bagian
hidrofilik terdedah ke dalam air dan bagian hidrofobik terpisah di dalam, jauh dari air.
2-microglobulin (Suatu immunoglobulin yang tersusun atas subunit protein MHC
manusi kelas I; 12-kd polipeptida ini berikatan nonkovalen terhadap rantai 44-kd.)
Michaelis constant Konsentrasi substrat dimana setengah sisi aktif dari enzim terpenuhi;
sebuah perbandingan tingkat konstan untuk reaksi model.
E+SESE+P
k1k2
k-1
Konstanta didefinisikan sebagai KM = k-1+ k2/k1. Di bawah kondisi dimana k-1 is lebih
besar daripada k2, KM sama dengan konstanta disosiasi kompleks enzim-substrat dan
merupakan sebuah pengukuran afinitas enzim terhadap substrat.
Hal 42 (10605045, Hanifah)
mikrosom vesikula tertutup yang dibentuk dari penempelan fragmenfragmen oleh subsekuen RE.
microsomes,
antibodi monoklonal suatu antibodi yang diderivat dari klonsejumlah sel yang diturunkan dari sel yang sama dan identik. Normalnya antigen-antigen
dengan spesifitas umum bersifat heterogen karena dihasilkan oleh beragam grup sel.
Penggabungan dari satu sel penghasil antigen dengan sel myeloma immortal
memfasilitasi produksi sejumlah besar dari antibodi protein yang homogen. Antibodiantibodi ini merupakan analisis berharga dan reagen-reagen yang dapat dipersiapkan
dengan mudah.
monoclonal antibody,
monosaccharides Single aldehid atau ketone yang mempunyai 2 atau lebih gugus
hidroksi; karbohidrat paling sederhana.
mosaic protein protein yang diproduksi oleh gen dipertemukan dengan pengocokan
exon; exon memproduksi unit struktur dari suatu protein.
MotA and MotB sepasang protein bakteri yang membentuk cincin disekitar basa pada
flagellum dan, berhubungan dengan FliG, membentuk channel proton yang menentukan
rotasi dari flagellum tersebut.
multidrug resistance suatu fenomena yang diamati pada sel kanker dimana ketika sel
kanker tahan terhadap satu obat membuatnya tahan terhadap obat yang lain; dikarenakan
aktivitas dari pompa ATP yang disebut dengan the multidrug-resistance protein (MDR),
yang mengandung daerah ABC.
multienzyme complex suatu rantai polipeptida yang memiliki wilayah untuk dua atau
lebih aktivitas enzim.
multifunctional enzymes enzim yang secara fungsi berhubungan yang secara kovalen
berhubungan dengan suatu cara.
mutagen Suatu gangguan pada untai basa pada DNA dan menyebabkan mutasi; biasanya
disebabkan oleh bahan kimia tapi jug bisa disebabkan karena sumber energi seperti sinar
ultraviolet.
mutarotation untuk karbohidrat, perubahan didalam dari anomer dan melalui
terbukanya struktur cincin; biasanya diukur melalui perubahan pada optikal rotasi.
mutase suatu enzim yang mengkatalis pergantian shift molekul didalam suatu grup
kimia.
mutations variasi yang merubah pengertian dari suatu materi genetic; dibutuhkan untuk
evolusi.
myofibrils Fibril di dalam sitosol dari otot tulang belakang yang memberikan sel bentuk;
unit fungsional dari suatu miofibril adalah sarcomere.
myoglobin protei tempat menyimpan oksigen di otot pada hewan vertebrateA;
mempunyai stuktur yang sama dengan hemoglobin subunit.
myosin protein yang membentuk filamen yang tebal dari suatu otot; memperlihatkan
akifitas ATPase pada bagian kepala yang bulat, dengan, konjungsi dengan kemampuan
reversibel untuk berikatan dengan aktin pada bagian fibernya, menyediakan tenaga untuk
kntraksi otot.
N
N-acetylglutamate suatu carbamoyl phosphate synthetase allosteric activator dari
mamalia, yang mengkatalis sintesis urea.
Hal 44 (10605053, Raja Yulita I. S.)
NAD-binding domain, domain Pengikat NAD Motif struktural dari NAD+ terhubung
dengan dehidrogenase yang membentuk sisi pengikatan pada NAD+ dan mengandung 4
heliks dan 6 rantai pararel
NAD+ and NADH (nicotinamide adenine dinucleotide) Suatu pembawa elektron yang
penting dalam pembakaran molekul; elektron dibawa oleh bagian dari nicotinamide pada
koenzim
NADH-Q oxidoreductase Komponen besar dari rantai pernapasan yang mentransfer
elektron dari NADH ke ubiquinone yang dalam proses pompa proton melewati membran
dalam mitokondria menghasilkan tenaga bermotif proton. Juga disebut NADH
dehidrogenase atau complex I.
NADP+ and NADPH (nicotinamide adenine dinucleotide phosphate) merupakan
elektron donor untuk biosintesis reduktif; berbeda dengan NAD+ dan NADH dalam hal
fosfat yang menempel di posisi 3 pada ribosa adenin
native form, bentuk dasar konformasi fungsional yang stabil dari makromolekul
biologis.
neck linker, penghubung leher Bagian pendek dari kinesin yang berikatan dengan
kepala domain dari Kinesin ketika ATP berikatan dan dilepaskan ketika sisi pengikatan
nukleotida kosong atau diisi ADP.
negative selection, seleksi negatif Proses seleksi dari perkembangan sel T dimana sel T
yang berikatan dengan kompleks MHC berafinitas tinggi pada sel pemunculan antigen
mengalami apoptosis pada peptidanya.
nerve impulse, Impuls saraf Peningkatan potensial membran dan perubahan
konduktansi ion sodium dan potassium yang diakibatkan oleh perubahan permeabilitas
membran axon terhadap ion-ion tersebut. Juga disebut potensial aksi.
neurotransmitter Suatu molekul kecil yang mampu berdifusi, seperti asetilkolin, yang
menjadi media bagi impuls saraf untuk melewati sinaps.
nicotinate Vitamin yang merupakan komponen kunci dari koenzim NAD+, NADH,
NADP+, dan NADPH untuk transfer elektron. Juga disebut niacine.
nitrogen fixation, fiksasi nitrogen Konversi nitrogen diatomik menjadi amonia; langkah
pertama dari aliran nitrogen menjadi asam amino, nukleotida, dan komponen-komponen
lain yang mengandung nitrogen pada organisme.
nitrogenase complex, kompleks nitrogenase Komplek enzim yang mengkatalis reduksi
nitrogen diatomik menjadi amonia; ditemukan pada bekteri dan alga hijau-biru.
nociceptor Suatu neuron terspesialisasi yang mentransmisi sinyal untuk pusat
pemrosesan rasa sakit pada sumsum tulang belakang dan otak sebagai respon dari adanya
awal /permulaan kerusakan jaringan.
nonclaret disjunctional (ncd), pemisahan non claret Salah satu anggota dari famili
protein kinesin yang, berbeda dengan kebanyakan anggota famili lainnya, bergerak
menuju ujung mikrotubulus yang bermuatan negatif.
Hal 45 (10605054, Tera Dria Kispa)
inhibitor non kompetitif penurunan nilai aktivasi enzim
ketika sebuah enzim berikatan dengan substrat dan inhibitor secara bersamaan.Inhibitor
nonkompetitif menurunkan banyaknya enzim tetapi tidak menurunkan kemampuan
noncompetitive inhibition,
Northern blotting analog dengan Southern blotting, sebuah teknik yang mencampur
fragmen RNA yang dipisahkan dengan elektroforesis, memindahkan lembaran
nitoselulosa, memindahkan DNA yang bersifat radioaktif untuk melengkapi urutan, dan
divisualkan dengan autoradiografi; teknik yang dapat digunakan untuk mengidentifikasi
lokasi fragmen RNA yang diurutkan dengan urutan khusus
aturan N-terminal tempat setengah hidup dari protein sitosol alami
adalah N-terminal asam amino
N-terminal rule,
grup fosfat.A nitrogenous purine or pyrimidine base linked to a sugar, which is in turn
linked to one or more phosphate groups.
nucleotide-excision repair Sebuah cara untuk memperbaiki DNA, dimana satu
rangkaian DNA pada area yang rusak dipindahkan dan diganti.
nucleotide kinases Enzim yang mentransfer grup fosforil dari satu nukleotida ke
nukleotida yang lain, seperti pada reaksi dari ATP dengan UMP untuk membentuk UDP
dan ADP.
O
obligate anaerobes Organisme yang tidak dapat bertahan jika terdapat oksigen dalam
lingkungannya. Hidupnya biasanya tergantung pada proses fermentasi sebagai sumber
dari energi selular.
odorants Molekul kecil pada udara yang berikatan dengan reseptor pada epithelium
olfaktori yang membangkitkan persepsi penciuman.
Okazaki fragments Rantai pendek dari DNA (diperkirakan sekitar 1000 nukleotida)
yang terbentuk dari lagging strand pada percabangan replikasi dari sintesis DNA yang
kemudian akan tersambung;memungkinkan polimerasi dengan arah 5 ke 3 pada level
nukleotida, sementara pertumbuhan secara keseluruhan dari arah 3 ke 5.
olfaction Kemampuan penciuman.
oligomycin Antibiotik yang menghambat sintesis ATP (dengan konsekuensi juga
menghambat rantai respirasi) dengan cara menginterferensi dengan mengalirkan proton
ke komplek ATP sintase.
oligosaccharides Karbohidrat yang terbentuk dari 2 sampai 12 unit monosakarida.
oncogene Gen yang ekspresinya berkontribusi pada perkembangan sel kanker.
one-carbon metabolism Reaksi biokimia dimana senyawa utrunan tetrahidrofolat
bertindak sebagi donor satu dari variasi unit satu karbon, mulai dari level oksidasi grup
metil sampai grup formil;termasuk juga reaksi yang melibatkan unit karbon yang
teroksidasi penuh, karbon dioksida, dan kariernya, biotin.
operator Segmen DNA yang berdampingan dengan sebuah grup dari strukturak DNA
dan merupakan urutan target dari protein represor; sebuah unit regulasi dan ekspresi gen
yang terdiri dari strukturak gen dan elemen regulator yang dikenal oleh satu atau lebih
produk gen terregulasi.
Hal 47 (10605057, Novita Yustinadiar)
operon model model gene regulasi dari prokariot yang mengandung untai opertor dan
berhubungan dengan struktur genenya.
opsin suatu reseptor 7TM dari sel kerucut, pada saat berikatan dengan 11-cis-retinal
membentuk rhodopsin, menyerap cahaya yang terlihat untuk menginisiasi jalur proses
pensinyalan.
optical rotation pergantian arah polarisasi dari suatu cahaya linier dalam melewati
larutan optis aktif; bisa digunkan sebagai indicator konformasi rantai utama dari protein.
optical trap suatu cara untuk mengukur gaya yang ditimbulkan oleh satu molekul
myosin pada filamen aktin. Pada alat ini, laser difokuskan pada sebuah manik - manik,
yang terikat pada aktin filamen. Bead terjebak ditengah - tengah. Kekuatan dari laser
untuk memegang beam bisa dirubah - rubah dengan merubah intensitasnya. Tenaga yang
dikeluarkan molekul myosin pada akti filamen kemudian diukur sebagai kekuatan yang
dibutuhkan untuk menahan bead tetap pagda jebakan optik.
organic fluorophosphates tersusun atas diisopropylfluorophosphate, dimana neghambat
acetylcholinesterase untuk membentuk kompleks enzim phosphoryl yang stabil pada
serine residu di sisi aktif nya.
orotidylate bahan dasar nukleotida untuk uridylate dan cytidylate dibentuk oleh reaksi
dari orotate dengan 5- phosphoribosyl-1-pyrophosphate (PRPP).
orthologs molekul homolog, yang timbuk didalam spesies yang berbeda dan mempunyai
kemiripan ataupun kesamaan fungsi.
osmosis pergerakan dari pelarut melewati membran dalam arah untuk menyamakan
konsentrasi dari dua larutan di sisi membran.
osteomalacia keadaan diman tulang menjadi rapuh dan lemah akibat kekurangan viamin
D, terjadi pad orang dewas.
overlap peptides peptida yang dihasilkan dari degradsi protein dengan 2 cara untai
subsequently ; untai dari hasil degradasi yang pertama diproses sering dan mnulsul proses
dari untai dua atau lebih, hal ini akan membuat stabil unatai yang lain.
-oxidation oksidasi dari C-3 carbon atom adalah sampai dengan gugus fungsi; ipada
degradasi dari molekul fatty acyl CoA, untai yang dioksidasi dan dihidrsi, dan direaksi
oksidasi yang merubah methylene pada C-3 menjadi -keto group.
oxidation-reduction reaction Raksi yang mengadakan transfer electron.
oxidative phosphorylation proses dimana ATP dibentuk hasil dari transfer electron dari
NADH atau FADH2 menjadi O2 oleh beberapa seri pembawa electron .
oxyanion hole suatu wilayah dari enzim proteolytic khusus yang menstabilkan oxyanion
dan secara bersamaan terbentuk reaksi tetrahedral intermediet.
Hal 48 (10605058, Leo M. Taufik)
oxygen-dissociation curve Kurva oksigen yang berikatan dengan protein terhadap
tekanan parsial oksigen.
P
P680 Pasangan molekul spesial pada fotosistem II pada tumbuhan hijau; Penyerapan
cahaya yang dilakukan oleh P680 akan menghasilkan transfer elektron dari air menuju
plastoquinone,dimana plastoquinone menghasilkan perbedaan kosentrasi proton.
P700 Pasangan molekul spesial pada fotosistem I pada tumbuhan hijau; Penyerapan
cahaya yang dilakukan oleh P700 akan menghasilkan transfer elektron yang berguna
untuk menghasilkan ferredoxin dan terutama NADPH.
P960 Dimer molekul klorofil-b dari bakteri, disebut juga pasangan spesial, menyerap
peptide,
peptida. Dua atau lebih asam amino yang digabungkan oleh ikatan peptida
ikatan peptida. Suatu pertalian kovalen yang terjadi antara gugus akarboksil pada suatu kelompok asam amino dan gugus a-amino kelompok lainnya.juga
diketahui suatu ikatan amida
peptide bond,
phorbol esters Polisiklik alcohol yang berasal dari minyak kroton yang menyerupai
diasilgliserol dan secara tidak sesuai menstimulasi protein kinase C; phorbol ester
adalah promotor tumor
fosfatase Enzim yang mengkatalis pelepasan gugus fosforil dari subtrat
dengan hidrolisis
phosphatase,
serius atau suatu perkembangan spesifik lainnya. Disebut pula dengan apoptosis.
promoter sites, daerah promotor urutan DNA spesifik, biasanya pada urutan awal
DNA yang menspesifikasi daerah tersebut dan sebagian dari transkripsi DNA yang
bersangkutan
propeller twisting pilinan pasangan basa pada kristal DNA berbentuk ko planar;
memperbanyak penumpukan basa dalam suatu untaian DNA.
Hal 54 (10605065, Monita Krisna P.)
protein kinase A suatu protein kinase yang terdiri dari 2 katalis subunit dan dua subunit
regulasi yang menghambat subunit katalis; dalam pengikatan dari cAMP, regulatory
subunit berpisah dari katalis subunit, yang kemudian menjadi aktif.
protein kinase C protein kinase yang menjadi aktif ketika terikat pada diacylglycerol.
protein kinases suatu kelas enzyme yang mentransfer gugus phosphoryl dari ATP ke
proteins; protein kinases sering ditemukan di jalur regulatory.
protein phosphatase 1 suatu protein fosfat yang distimulus oleh insulin yang
menghambat degradasi glikogen dan menstimulus sintesis glikogen.
protein phosphatase 2A suatu fosfatase yang responsif terhadap insulin yang
mengaktifkan acetyl CoA carboxylase untuk menstimulus sintesis asam lemak.
protein phosphatases Enzime yang menghidrolisis phosphorylated serine dan threonine
residu pada protein lain; protein phosphatase 1 membalikan efek regulatory dari kinases
pada metabolisme glikogen.
proteoglycans Protein yang mengandung satu atu lebih ikatan kovalen dengan rantai
glycosaminoglycan; cartilage proteoglycan mengndung keratan sulfate dan chondroitin
yang berhubungan dengan tulang punggung polypeptide.
proteome representasi fungsional dari genom yang didalamnya termasuk tipe, fungsi dan
interaksi dari protein yang ada di dalam sel; proteome bukan karakteristik yang tepat bagi
sel tapi akan bervariasi, Tergantung faktor seperti tingkatan pertumbuhan atau status
hormonal.
proton gradient distribusi yang tidak merata dari proton sepanjang lapisan membran
impermeable terhadap proton; gradien tersebut bisa digunakan untuk memberikan bahan
bakar pada proses biokimia, seperti sintesis ATP.
proton-motive force energi yang diwariskan dalam bentuk gradien proton menstabilkan
selama rantai respiratory digunakan; terdiri dari membran potensial dan juga gradien
kimia.
proto-oncogene sinyal transduksi protein yang biasanya meregulasi sel untuk tumbuh
dalam berbagai cara; ketika proto-oncogenes bermutasi, mereka menjadi oncogenes dan
berkontribusi untuk pertumbuhan sel kanker.
protoporphyrin suatu susunan organic dari gugus prosthetik dari heme; terdiri dari 4
cincin pirol digabungkan dengan jembatan methylene dan mengandung banyak variasi
rantai samping.
pseudogenes urutan DNA yang merepresentasikan gene asli tapi tidak mengkode produk
yang fungsional.
pseudosubstrate urutan asam amino yang merepresentasikan substrat sebenarnya untuk
suatu enzim kecuali pada bagian asam amino yang penting telah diubah, mengubahnya
menjadi inhibitor; pengikatan dari pseudosubstrates yang teregulasi seringkali digunakan
untuk mengontrol aktivitas enzim.
Hal 55 (10605066, Qoriatur R.)
P-type ATPases. Jenis kelompok enzim yang menggunakan energi dalam proses
hidrolisis untuk memindahkan ion-ion melintasi membran: disebut "P-type ATPases"
karena mekanisme reaksinya termasuk kedalam jenis phosphoaspartate intermediate.
pulsed-field electrophoresis. Merupakan teknik elektroforesis untuk memisahkan
molekul-molekul DNA. Medan elektrik/listriknya, sekitar 200 degree antara satu molekul
dengan molekul lainnya, digunakan pada sebuah mode pengganti. Molekul yang panjang
diorientasikan kembali secara lebih lambat daripada molekul yang pendek dan oleh
karena itu tidak dapat mengikuti medan listrik dengan cepat.
Pump Sebuah jalur protein pada sebuah membran yang dapat menghantarkan molekul
dari kompartemen(bagian) yang satu ke kompartemen yang lain dengan arah yang
berlawanan dengan gradien konsentrasi; pompa melalui siklus penyesuian bentuk yang
mengubah afinitas (daya tarik) pada tempat pengikatan untuk mentransportasikan
molekul, dan eversion molekul selama dalam siklus, dikemudikan/ditentukan oleh
pengeluaran energi bebas. Disebut juga transport aktif.
pur repressor. Sebuah protein regulator pada pur operon, yang mengkode gen yang
berperan dalam biosintesis purin; pur operon berikatan dengan operator DNA hanya
ketika berikatan dengan molekul kecil (guanin atau hiposantin) yang disebut dengan
corepressor.
Purine. Sebuah basa nitrogen yang mengandung sebuah cincin pirimidin yang berfusi
dengan lima cincin imidazole; turunan purin, adenin dan guanin nukletida dan asam
nukleat.
Puromycin . Merupakan antibiotik, sebuah analog pada terminal aminoacyl-adenosine
bagian dari aminoacyltRNA; pada proses translasi, hal ini menyebabkan rantai akhir
menjadi prematur ketika kelompok amino berikatan dengan kelompok karboksil pada
pembentukan rantai polipeptida dan mengakibatkan pemisahan dari kompleks ribosom.
Pyranose. Cincin yang terdiri dari enam nomor heterosiklik yang dibentuk ketika prose
perubahan monosakarida menjadi hemiasetal atau hemiketal; keenam nomor tersebut,
kandungan oksigennya menyerupai pyran.
pyridine nucleotides. Nukleotida, sama seperti NAD+, NADH, NADP+, and NADPH,
yang bekerja pada reaksi reduksi; fungsional groupnya adalah nikotinamida, turunan dari
piridin.
pyridoxal phosphate. Kelompok prosthetic, turunan dari vitamin B6 (pyridoxine) yang
memegan peranan utama pada reaksi transmisi.
Pyrimidine. Basa nitrogen yaitu enam nomor cincin heterosiklik yang mengandung dua
atom nitrogen dan empat karbon atom; turunan pirimidin terdiri dari sitosin, urasil, dan
timin yang terdapat pada nukleotida dan asam nukleat.
pyrimidine dimers. Merujuk pada mutasi yang memiliki cahaya ultraviolet yang
menyebabkan hubungan kovalen pada dua residu pirimidin.
Pyrrole. Lima nomor cincin heterosiklik diene yang terdiri dari heteroatom yaitu
nitrogen.
Pyruvate. Komponen penting dalam metabolisme; sebuah prekursor untuk alanin dan
glukosa dan dapat diubah menjadi laktat pada glikolisis an aerobik; dapat juga dioksidasi
menjadi acetyl CoA, yang dapat dioksidasi lebih besar menjadi sejumlah energi aerobic,
diubah menjadi lemak, atau digunakan untuk mensintesis kolesterol dan steroid lainnya.
Hal 56 (10605067, Vicka Kharisma) (10605052, Adrial R. 55-74)
Piruvat karboksilase sebuah biotin - enzim bebas yang dapat mengkatalisis formasi
oksaloasetat dari piruvat dan CO2 yang membutuhkan ATP; berperan penting dalam
proses glukoneogenesis dan penambahan dalam siklus asam sitrat
Kompleks piruvat karboksilase sebuah kompleks enzim mitokondria yang besar,
yang dapat mengkatalisis dekarboksilase oksidasi dari piruvat menjadi asetil CoA ; reaksi
ini termasuk reaksi irreversible yang menghubungkan antara reaksi glikolisis dan siklus
asam sitrat
Q
pembacaan susunan Kumpulan dari nukleotida yang tidak tumpangtindih yang dibaca sebagai kodon selama proses sintesis protein; pembacaan susunan
dimulai dari inisiasi kodon AUG
reading frame,
release factor Factor pembebas satu dari set dari protein yang mengenali stop kodon di
dalam mRNA di daerah A dari ribossom, yang menyebabkan pelepasan dari protein yang
telah lengkap dari tRNA di daerah P dari ribosom.
repair Perbaikan rrestorasi dari struktur dan urutan normal dari gen setelah terjadi
kerusakan oleh sinar ultrabviolet atau bahan kimia.
replication fork Tempat dari sintesis DNA dimana strand parental dipisahkan dan strand
anak yang komplementer terhadap tiap orangtua disintesis
hal 58 (10605070, Ardha Apriyanto) (106050
replicon Suatu segmen DNA yang membawa replikasi asal-usul dan dapat meniru secara
autonomous; plasmid bakteri merupakan replicon.
repressor Sebuah protein yang mengikat urutan operator dan menghalangi transkripsi
gen-gen structural di operon.
resistance transfer factor Sebuah urutan DNA yang memperkenankan sebuah plasmid
membawa gen-gen untuk perlawanan obat untuk ditransfer ke bakteri lain dengan
konjugasi.
resonance structures Pola ikatan kovalen alternatif untuk sebuah molekul yang mungkin
sama atau hamper sama.
respiration Suatu proses menghasilkan ATP dimana suatu campuran anorganik, seperti
O2, berperan sebagai penerima electron terakhir; donor electron dapat berupa campuran
organik maupun anorganik.
respiratory chain Jalur perjalanan electron-elektron dari NADH atau FADH2 menjadi
O2; terdiri atas tiga komplek yang memompa proton sebagai sebuah hasil transpor
electron dua electron pembawa yang bergerak. Disebut juga rantai transpor elektron.
respiratory control Rangkaian atau koordinasi erat dari oksidasi kofaktor tereduksi
(NADH dan FADH2 pada rantai transpor electron dan fosforilasi ADP menjadi ATP di
mitokondria; seperti kontrol yang memastikan bahwa nilai siklus asam sitrat, dimana
kofaktor tereduksi dihasilkan, cocok dengan permintaan ATP.
restriction enzymes Enzim endonuklease yang mengenali urutan basa spesifik pada
DNA untai ganda dan memotong kedua untai rangkap pada tempat yang spesifik.
restriction-fragment-length polymorphism (RFLP) Keanekaragaman genetik dalam
suatu populasi diindikasikan dengan mutasi pada tempat yang spesifik dalam DNA;
seperti mutasi mengubah posisi perbatasan fragmen-fragmen pada analisi elektroforesis
gel.
restriction-modification system Sebuah sistem yang pada setiap enzim restriksi yang
dibuat oleh suatu sel prokariot, juga dibuat metilase yang menandai DNA inang dan
mencegah degradasinya.
retinal Group prostetik dari rhodopsin yang menyerap cahaya dan mengalami isomerisasi
dari 11-cis-retinal menjadi all-trans-retinal, memulai jalur transduksi sinyal visual.
retrograde transport Transpor di dalam sitoplasma yang digerakkan oleh dynein yang
menggerakkan organel dari perifer ke tengah sel.
retrovirus Suatu virus yang mengandung sebuah genom RNA tetapi yang bereplikasi
melalui pertengahan untai ganda DNA yang disatukan dengan genom sel inang.
reverse transcriptase Sebuah enzim yang mensintesis DNA dengan menggunakan
template RNA.
Hal 59 (10605071, Shinta Asarina)
rho protein ATP-tergantung pada enzim helicase bakteri yang merusak hibrida/
campuran dari RNA-DNA pada gelembung transkripsi, dan karena itu mengakhiri
transkripsi.
rhodopsin Photoreceptor pada sel batang. Terbuat dari protein opsin dan gugus prosthetic
11-cis-retinal.
rhodopsin kinase Enzim yang memphosphorilasi rhodopsin yang diaktivasi pada
bermacam-macam residu serine dan threonine untuk menyediakan tempat berikatan
untuk protein inhibitor arrestin.
riboflavin Komponen vitamin dari coenzyme electron-transfer FAD, FADH2, FMN, dan
FMNH2. Disebut juga vitamin B2.
ribonucleoproteins Kompleks makromolekul yang aktivitas optimalnya tergantung pada
ada tidaknya RNAs spesifik dan protein; ribosom adalah ribonucleoprotein.
ribonucleotide Nukleotida yang mengandung basa purin atau pirimidin yang secara
kovalen berikatan dengan ribose, yang kemudian berikatan pada satu atau lebih gugus
phosphate.
ribonucleotide reductase Enzyme yang mengkatalisis proses reduksi dari keempat
ribonucleotida menjadi deoxyribonucleotida.
ribose Monosakarida yang memiliki 5 karbon (C5H10O5) yang menyusun moiety
karbohidrat dari ATP, ribonucleosida dan ribonucleotida yang lain, dan cofactor seperti
NAD dan coenzim A.
ribosomal RNA Komponen RNA pada ribosom, tempat sintesis protein.
ribosome Kumpulan banyak ribonucleoprotein yang mengkatalisis pembentukan ikatan
peptide: mesin molecular yang mengkoordinasi sintesis protein.
ribozymes Molekul RNA yang menunjukan aktivitas enzimatik.
rickets Penyakit yang disebabkan oleh kurangnya pembentukan vitamin D, yang
menyebabkan kurangnya pembentukan kalsium pada kartilago dan tulang.
Rieske center Pusat 2Fe-2S yang tidak biasa karena salah satu ion Fe nya tersusun dari
dua residu histidin, bukan dari dua residu sisteina.
rifamycin Antibiotic yang diisolasi dari streptomyces yang menghalangi inisiasi sintesis
RNA dengan cara memblok pembentukan ikatan pertama phosphodiester.
RNA editing Perubahan dalam informasi yang terdiri dari RNA oleh proses selain
pembelahan/ penguraian RNA yanr terjadi setelah transkripsi.
RNA enzymes Molekul RNA yang berperan sebagai enzim. Disebut juga ribozymes.
RNA polymerases Salah satu enzim yang mensintesis molekul RNA yang melengkapi
DNA template.
Hal 60 (10605072, Inggita Utami)
RNA primers, RNA primer Bagian kecil dari RNAyang didasari oleh sepasang rantai
template DNA dan bekerja seperti primer dari sintesis DNA primer tunggal; RNA yang
digeser sebelumnya dan menggantinya dengan DNA.
RNA processing, RNA pengolah Beberapa perubahan dari RNA molekul terdahulu;
seperti penyambungan atau poliadenilasi, dan hasilnya adalah molekul RNA dewasa.
RNA world, RNA dunia Teori evolusi dimasa kini dimana molekul RNA menjalankan
kedua hal yaitu sebagai materi genetik dan sebagai katalis untuk reaksi biokimia.
rod Fotoreseptor sel tipis dimana berfungsi pada pencahayaan yang redup tetapi tidak
berwarna.
rotenone, rotenone Racun pada tumbuhan yang menghambat transfer elektron pada
NADH-Q enzim pereduksi yang kompleks, digunakan pada ikan dan racun serangga.
rubisco (ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase), ribulosa 1,5-bisfosfat
karboksilase/oksigenase Enzim yang mengkatalis reaksi karbon dioksida dengan
ribulosa 1,5-bisfosfat terhadap dua molekul 3-Fosfogliserat.
S
S1 fragments, S1 fragmen Proteolitik hasil pencernaan dari miosin sebagai pembangkit
tenaga unit dari molekul miosin utuh; S1 fragmen mengandung ATPase dan bagian aktin
yang mengikat.
SI heads Proteolitik hasil pencernaan dari miosin sebagai pembangkit tenaga unit dari
molekul miosin utuh; mengandung ATPase dan bagian aktin yang mengikat; SI kepala
lebih kecil dari pada meromiosin berat
S-adenosylmethionine Pengaktif donor metil yang tersusun dari kelompok adenosil
yang menghubungkan atom sulfur dengan methionin
salting out, Penggaraman Teknik pemurnian protein berdasarkan daya larut oleh
berbagai protein yang rendah pada konsentrasi garam tertinggi; akibatnya protein berbeda
akan mengendap pada bermacam-macam konsentrasi garam.
salvage pathway, Jalur singkat penyelamatan Secara umum, jalur singkat mensintesis
hasil akhir komponen yang terkandung; nukleotida dapat tersintesis pada Jalur singkat
Sanger dideoxy method, metoda Sanger Dideoxy Teknik mengurutkan DNA yang
bekerja mengontrol terhentinya replikasi enzim pada molekul untuk diuraikan. DNA
polymerase I digunakan dengan primer, empat deoksinukleosid trifosfat dan 2,3dideoksi analog yang satu dengan yang lainnya. Fragmen dari jarak yang bervariasi
menghasilkan produk dideoksi yang analog pada 3end. Empat bagian dari rantai fragmen
berakhir (satu untuk setiap analog) kemudian ditampilkan dengan elektroforesis dan
autoradiografi, dan rantai dasar dapat dibaca dari empat baris gel.
Sequence Templates. residu konservasi, yaitu struktur dan fungsi serta karakteristik
khusus protein.
sequential displacement reaction, reaksi pemindahan rangkaian. Suatu reaksi
mempunyai reaktan multiple yang semua substratnya berikatan dengan enzim sebelum
beberapa hasil reaksi dibebaskan. Demikian halnya dengan reaksi dua substrat, gambaran
kompleks pada enzim dan bentuk kedua substrat.
Sequential Model. Sebuah model yang menggambarkan enzim allostrik pada pengikat
dari satu substrat yang mempengaruhi afinitas substrat dari bagian aktif tetangganya
tanpa menyebabkan transisi arah segala enzim.
Serine Proteases. Suatu ruang dari enzim protein degradasi yang aktifitasnya bergantung
pada kehadiran serine di bagian yang aktif, simotripsin dan tripsin contohnya.
reseptor tujuh transmembran
helix Suatu ruang dari tipe protein integral membrane oleh transduksi di bagian
intramembran yang terdiri dari tujuh daerah, reseptor ini selalu berpasangan dengan
protein G.
seven-transmembrane-helix (7TM) receptors,
SH2 Domain (Src Homology Domain). Daerah yang terdapt kurang lebih 100 asam
amino yang berikatan dengan phospotirosin.
SH3 Domain (Src Homology Domain). Daerah yang mengikat bidang proline-rich pada
polipeptida.
Sheet, . Kondisi motif struktur di dalam protein yang dua atau lebih strand
dihubungkan sebagai tumpukan rantai, distabilitasi oleh antar rantai ikatan hidrogen,
strand yang arahnya sama dengan bentuk penutup lipatan , sedangkan seperti strandrunning berlawanan arah dari antiparalel penutup lipatan.
rangkaian Shine-Dalgarno. Pada RNAm daerah prolinerich sekitar 10 nukleotida pada sisi 5 dari kodon inisiator yang berpasangan dengan 3
berakhir 16S RNA di 30S subunit ribosomal, membantu menentukan translasi awal pada
molekul RNAm.
Shine-Dalgarno sequence,
side chain, bagian rantai sisi Khusus ikatan grup R sebuah atom carbon asam amino.
Siemen. Timbal balik ohm, yang ukuran daya tahannya mengalir dari tempat elektrik.
sukrosa Disakarida dari glukosa dan fruktosa ( biasanya dikenal sebagai gula )
yang dengan mudah diangkut dan disimpan oleh sel tumbuhan.
sucrose,
supercoiling Berarti kemampuan dari DNA sirkular tertutup untuk menggulung dirinya.
Superhelix Gulungan dari sebuah DNA rangkap dua yang terbentuk ketika terlekuk
saling silang pada aksisnya.
superoksida dismutase Sebuah enzim yang
mengscavenges radikal superoksida dengan mengkatalisis perubahan dari dua senyawa
radikal tersebut menjadi hidrogen peroksida dan oksigen molekuler; menjaga melawan
serangan oleh spesies yang reaktif terhadap oksigen.
superoxide dismutase,
Svedberg Unit Unit pengukur sedimentasi dari suatu makromolekul; unit Svedberg
setara dengan 10-13 sekon.
simporter Sistem transpor dimana sebuah molekul dibawa melalui
membran dengan arah yang sama seperti ion, yang akan kembali dikeluarkan melewati
membran selama transpor aktif yang memerlukan ATP.
symporter,
sintase Enzim pengkatalisis reaksi sintesis dimana dua unit bergabung tanpa
menggunakan langsung nukleotida trifosfat.
synthase,
Tata box Dapat ditemukan didekat semua gen-gen eukariotik, sebuah elemen promotor
membangun mRNA. Tata box dipusatkan antara 30 dan 90 aliran residu dari tempat
transkripsi dimulai dan memiliki sekuens consensus 5-TATAAAA-3.
Tata-box binding protein associated factor ( TAF ) Satu kelompok protein, sebagian
besar terdiri dari Bromodomain, yang mengikat Tata-box-binding protein untuk
membentuk kompleks yang dibutuhkan untuk transkripi RNA.
Taxol Senyawa kimia yang diisolasi dari pohon cemara pasifik yang menstabilkan
tubulin didalam mikrotubulus dan meningkatkan polimerasi; digunakan dalam
kemoterapi untuk turut serta dalam proluferasi pemisahan sel dengan cepat.
Hal 67 (10605079, Salli Marindha)
Tay-Sachs disease Penyakit keturunan yang disebabkan kekurangan enzim (-Nacetylhexosaminidase) yang bertanggung jawab untuk mendegradasi zat tertentu
sehingga terjadi penimbunan zat tersebut pada otak (ganglion) dan otak menjadi rusak.
Karakteristik klinisnya yaitu penuruna kondisi tubuh, penurunan mental, dementia, dan
meninggal pada masa balita (kurang lebih 3 tahun).
T cell Limfosit yang memiliki reseptor (sel T reseptor) yang mengenali antigen hanya
jika terikat pada protein MHC (major histocompability complex). Terdapat dua tipe utama
pada T sel yaitu sel T sitotoksik (killer T cells) dan sel T helper.
T-cell-mediated immunity Salah satu pengenalan respon sistem imun, dimana T sel
akan memeriksa permukaan seluruh sel dan T sel membunuh atau memusnahkan protein
asing yang disintesis oleh pathogen intercellular.
T-cell receptor Suatu reseptor yang mengenali peptide yang ditunjukkan oleh MHC
protein pada sel target. Reseptor terdiri dari 43-kd ikatan rantai yang dibedakan menjadi
dua yaitu ikatan sulfide dan spanning membrane plasma. Kombinasi yang konstan dan
wilayah yang berubah-ubah di antara variasi reseptor sel T diikuti sel T untuk mengenali
epitopes yang berbeda dalam jumlah yang banyak.
telomerase Suatu kebalikan dari enzim transcriptase yang terdapat pada template, yaitu
enzim yang mengkatalisis pemanjangan telomere.
telomere Akhir atau ujung dari kromosom, DNA pada telomere terdiri atas pengulangan
rangkaian atau ururtan hexanukleotida yang merupakan karakteristik dari organism.
template Pada DNA atau RNA, suatu sequence langsung diproduksi (transkripsi) untuk
melengkapi suatu sequence.
template strand Untai dari DNA atau utas DNA yang melengkapi transkripsi dari RNA.
terminal Glycosylation Penambahan karbohidrat kepada protein dan pengolahan atau
pemprosesan dari karbohidrat yang ada pada golgi kompleks.
termination Akhir dari tahap seluruh reaksi polimerisasi biologi. Proses polimerasi
diberhentikan dalam respon pada spesifik signal termiinasi untuk molekul biologi saat
disintesis
tertiary structure Pada protein, susunan ruang dari sisa asam aminomemiliki jarak yang
cukup jauh pun jauh satu sama lainpada sequence linear, dan juga memiliki ikatan
sulfida.
tetracycline Suatu antibiotic yang mengikat subunit 30S ribosom pada prokariotik dan
menghalangi pengikatan acyl-tRNA-molecul tampak pada kompleks ribosom.
tetrahydrofolate (tetrahydropteroyglutamate) pembawa aktivitasi satu unit karbon.
tetrodotoxin Racun berbahaya yang ada pada ikan kembung (puffer fish) yang
menghalangi atau menutup perantaraan (konduksi) impuls saraf sepanjanf akson dan
merangsang membrane pada serabut saraf sepanjang akson dan merangsang membran
pada serabut saraf, kelumpuhan alat penapasan.
Hal 68 (10605082, Novita Fajriah)
Tetroses monosakarida yang memiliki 4 atom karbon
Thalassemias penyakit genetic yang ditandai oleh sistesis yang kurang sempurna dari
satu atau lebih rantai hemoglobin.
Thermogenesis regulasi tidak berpasangan dari fosforilasi oksidatif sebagai cara
penurunan panas untuk menjaga suhu tubuh.
Thermogenin protein pada membrane mitokondria (protein tidak berpasangan) yang
berperan dalam termogenesis dengan membentuk jalur untuk aliran proton kedalam
mitokondria, dengan demikian penurunan panas dilakukan tanpa sintesis ATP.
Thiamine komponen vitamin dari koemzim pirofosfat tiamin. Disebut juga vitamin B1.
Thiamine Pyrofosfat koenzim yang tersusun atas tiamin (vitamin B1), The coenzyme
form of thiamine (vitamin B1), menyusun pembentukan cincin tiazol yang dihubungkan
dengan jembatan metilen untuk menggantikan pirimidin; kofaktor dalam reaksi enzimatik
yang berikatan dengan atom karbon karbonil yang membelah atau disintesis..
Thioester intermediate suatu ester yang atom nonkarbonil oksigennya digantikan oleh
Molekul dari DNA yang berbeda antara satu dengan yang lainnya hanya
dalam jumlah ikatannya.
topoisomers
suatu enzim yang merubah unit dihidroksi aseton tiga-karbon dari suatu
ketose menjadi akseptor aldose; salahsatu bagian enzim nonoksidatif dalam suatu jalur
pentosa phospat.
transaldolase
transducin protein G merupakan protein sinyal yang sepasang dari eksitasi visual;
diaktivasi oleh rhodopsin, memicu aktivasi dari cGMP fosfodiestrase, yang selanjutnya
memicu ke sebuah impuls saraf.
transfer RNA, RNA transfer Molekul adaptor dalam proses sintesis protein;
mengandung suatu tempat pengenalan terhadap asam amino dan tempat pengenal
cetakan, atau antikodon.
Transferase Suatu enzim yang mengkatalis suatu kelompok transfer, sering
membutuhkan adanya kofaktor.
transformation,
transisi Suatu mutasi yang dihasilkan dari substitusi satu basa pirimidin
dengan yang lainnya atau satu basa purin dengan basa yang lainnya.
transition,
keadaan transisi Suatu jenis bahan kimia yang memiliki energi bebas
yang sangat tinggi dan konsentrasi yang sangat rendah dalam suatu jalur dari substrat
menjadi produk.
transition state,
treanslokase enzim yang membawa molekul dari satu bagian sel ke bagian
sel lainnya ; translokase ATP-ADP memfasilitasi pergantian ATP dan ADP antara
mitokondria dan sitosol
translocase,
Transposase Enzim di inti yang dikode oleh serangkaian insersi ( IS) atau transposan ;
membuat potongan yang membingungkan dalam sisi pendonor dan penerima,
memudahkan insersi ( IS) kedalam gen bakteri
transposisi pergerakan dari satu kromosom ke kromosom lain atau dari
satu lokasi ke lokasi lain dalam satu kromosom
transposition,
Transposon elemen genetik aktif dari bakteri yang memudahkan gen untuk ditransfer
selama dalam rentetan non homolog
transversion,
atau sebaliknya
triacylgliserol gliserol yang mempunyai rantai asam lemak hasil
esterifikasi dari masing-masing ikatan hidroksilnya ; tersimpan dalam bentuk lemak ;
dikenal pula sebagai lemak murni atau trigliserida
triacylglycerols,
turn, dalam protein, elemen struktural yang terbentuk dari 4 asam amino, dimana
gugus CO dan NH dari residu 1 terikat oleh ikatan hidrogen ke gugus NH dan CO dari
residu 4, membuat rantai polipeptida untuk mengubah arahnya.
turnover number jumlah dari molekul substrat yang diubah menjadi produk oleh
molekul enzim dalam satu unuit waktu ketika enzim terlarut dalam substrat; setara
dengan konstanta kinetik k2.
two-dimensional gel electrophoresis suatu cara untuk menganalisis protein sampel
dimana awalnya sampel dipecah dalam satu dimensi dengan pengfokusan isoelektrik dan
selanjutnya diikuti dengan pemecahan dalam dimensi dua yang sejajar dengan yang awal,
oleh eletroforesis gel SDS-polyacrylamide electrophoresis.
U
ubiquinone and ubiquinol lihat coenzyme Q.
ubiquitin terdapat pada semua eukariot, protein yang berukuran kecil dan terdapat dalam
jumlah banyak, ketika menempel pada protein lain, protein lain itu akan ditandai untuk
penghancuran proteolitik.
ultracentrifugation sentrifugasi kecepatan tinggi yang digunakan untuk memisahkan
biomolekul dan menentukan massanya.
uncoupling protein protein membran mitokondria yang berperan dalam termogenesis
dengan membuat jalur bagi aliran proton ke mitokondria yang akan menyebabkan panas
tanpa sintesis ATP. Juga disebut termogenin.
urea cycle jalur siklus yang merubah asam amonia berlebih menjadi urea untuk
disekresikan; jalur metabolisme pertama yang ditemukan.
Hal 72 (10605087, Gilang Ramadhan)
uricotelic, urikotelik Merunut kepada organisme yang menghasilkan amonia yang telah
diubah menjadi asam urat purin untuk disekresikan; burung dan reptil terestrial termasuk
urikotelik.
uridine diphosphate glucose (UDP-glucose), glukosa uridin difosfat Bentuk glukosa
yang sudah teraktivasi di dalam sintesis glikogen; dibentuk dari Glukosa 1-fosfat dan
UTP.
V
van der Waals interaction, interaksi van der Waals Tarikan antara 2 molekul yang
berdasarkan elektron asimetris transien di sekeliling sebuah atom yang menginduksi
asimetri yang komplemen di molekul di dekatnya.
variable region, area variabel Rangkaian asam amino residu-108 yang ditemukan di
ujung terminal-N dari immunoglobin tipe rantai ringan dan berat dari immunoglobin G;
Urutan dari area ini bervariasi untuk tiap tipe antibodi yang diketahui; bagian dari
segmen ini (region hipervariabel) membentuk tempat penempelan (binding site) antigen
dari immunoglobin.
Hal 73
Vitamins: Substansi organik yang dibutuhkan dalam jumlah kecil yang digunakan dalam
beberapa reaksi penting biokimia
VLDLs (very low density lipoproteins): partikel lipoprotein ,yang diseimbangkan oleh
apolipoprotein B-100 dan E, yang menyalurkan kelebihan triacylglycerides dan kolestrol
dari hati ke jaringan lain
Voltage-gated channel: pompa antar membran yang terbuka akibat depolarisasi
membran; misal: pompa natrium-kalium
Von-Gierke disease: infeksi pada hati dan ginjal yang diakibatkan oleh penyebaran
glukosa 6-fosfat yang tidak sempurna, misal: glikogen yang dihasilkan dalam jumlah
yang tidak normal (sangat besar) akan mengakibatkan pembesaran pada hati dan
mengakibatkan kerusakan pada fungsi hati
W
Watson-Crisk helix: lihat B-DNA helix
Western blotting: salah satu teknik immunoassay yang digunakan untuk mendeteksi
protein spesifik dalam cairan tubuh, misal: elektroforesis suatu sample menggunakan
SDS-poliakrilamid akan menyebabkan protein sample bergerak di sepanjang lembaran
polimer (plat elektroforesis), kemudian antibodi spesifik dalam protein tersebut akan
muncul sebagai noda titik (menunjukkan jenis protein spesifik), sedangkan antibodiantibodi lain akan berguna dalam memvisualisasikan kompleks antigen-antibodi.
Wobble hypothesis: dugaan bahwa kebebasan sterik pada pasangan basa ke-3 dari kodon
mRNA dengan antikodon dari molekul RNA transfer membiarkan lebih dari 1 kodon
diterjemahkan oleh 1 molekul tRNA khusus.
X
Xeroderma pigmentosa: kelainan pada kulit yang jarang terjadi, ditandai oleh
kepekaan/kesensitifan terhadap sinar ultraviolet dan cenderung menjadi kanker;
disebabkan oleh kerusakan pada enzim exinuclease yang memegang kontrol dalam
penghilangan sebagian kecil pirimidin
X-Ray crystallography: suatu teknik untuk menentukan struktur 3 dimensi dari kristal
atom protein dengan cara menguji pola difraksi penyinaran x-ray pada kristal tersebut
Y
Yeast artifical chromosome (YAC): molekul DNA yang dapat digunakan untuk
menggandakan bagian rantai DNA dengan panjang antara 100-1000 kilo basa;
mengandung sentromer, rangkaian DNA yang dapat bereplikasi secara otomatis, sepasang
telomer, penanda gen tertentu, dan bagian dari rangkaian rantai yang akan digandakan.
Hal 74
skema Z dari fotosintesis Jalur aliran elektron antara
fotosintesis I dan II; disebut begitu karena diagram redox dari P680 sampai dengan
P700+ terlihat seperti huruf Z.
Z scheme of photosynthesis,
Z-DNA Sebuah lengan kiri dari dobel helix yang di dalamnya tulang punggung fosfat
berzigzag; dapat terbentuk oleh oligonukleotida dengan mengganti urutan dari purin dan
pirimidin.
kluster seng Ditemukan di dalam pasangan dalam keluarga besar reseptor
nuklir dari protein, sebuah motif tempelan DNA yang di dalamnya sebuah ion seng
dikoordinasi menjadi rantai empat sisi sistein.
zinc clusters,
zinc finger,
ditemukan sebagai anggota dari keluarga hormone reseptor nuklir, yang terdiri dari
delapan residu sistein: empat yang pertama menempel sebuah seng dan empat berikutnya
menempel yang lainnya.
protease seng Sebuah kelas dari enzim pengurai protein yang
mengkatalis aktivitas yang bergantung pada sebuah ion seng; karboksipeptidase A adalah
sebuah protease seng.
zinc proteases,
ion zwitter Sebuah ion dipolar (dari bahasa jerman zwitter, diantara);
pada pH netral, asam amina memiliki sebuah grup amino terprotonasi dan sebuah grup
karboksil terdisosiasi dan adalah demikian ion zwitter.
zwitterions,
Zymogen Sebuah target awal yang secara katalis tidak aktif dari sebuah enzim
----