BAHAN DISKUSI BIOKIMIA II

Struktur asam nukleat

1. Jelaskan bagian pada struktur DNA yang menyimpan informasi genetik.
2. DNA berperan sebagai pembawa sifat (blue print) bagi makhluk hidup melalui
proses ..
3. Informasi genetik diturunkan dari generasi ke generasi atau dari sel ke sel lain
melalui mekanisme ..
4. Urutan nukleotida pada untai DNA (pilih:sense/antisense) sama dengan
mRNA dimana T tidak ada (diganti U). Jelaskan konsepnya.
5. Sesuai dengan fungsinya sebagai penyimpan informasi genetik, DNA sangat
stabil. Jelaskan berbagai hal penunjang kestabilan tersebut.
6. Jelaskan struktur untai ganda DNA menurut Watson-Crick
Replikasi
1. Jelaskan peran DNA ligase, primer, helikase, SSB, fragmen Okazaki dan DNA
polimerase dalam replikasi DNA.
2. Komponen apa pada no 1 yang digunakan pada proses PCR?
3. Diskusikan perbedaan dan persamaan antara penggandaan DNA in vivo
(replikasi) dan penggandaan DNA in vitro (PCR).
4. Bagaimana strategi replikasi kromosom sehingga proses replikasi kromosom
yang sangat panjang hanya berlangsung dalam waktu bilangan detik.
5. What are the differences between DNA dependent DNA polymerase and RNA
dependent DNA polymerase?
6. What enzymes work in the
- leading strand synthesis?
- lagging strand synthesis?
Transkripsi
1. Pada proses transkripsi, disintesis molekul RNA sesuai cetakan yang terdapat
pada ..
2. RNA polimerase sebagai enzim spektakular,jelaskan.
3. Jelaskan susunan enzim RNA polimerase dan perannya masing2.
Hubungan kodon dan antikodon
1. Jelaskan aturan pasangan basa pada DNA. Apakah aturan pasangan basa
tersebut berlaku pada pasangan antara kodon-antikodon? Mengapa demikian
dan jelaskan akibatnya?
2. Apakah yang dimaksud: sandi genetik terdegenerasi? jelaskan makna
biologisnya.
3. Jelaskan tentang hipotesis wobble.
4. Apakah yang dimaksud dengan ORF?
Translasi
1. Tertulis urutan DNA penyandi protein sbb:
5 ATGCCGTTAGACCGTTAGCGGACCTGAT 3
a. Urutan tsb merupakan coding strand atau non-coding strand?

b. Tulis urutan yang berperan sebagai template pada transkripsi.

c. Tulis arah proses transkripsi & translasi, dan arah produknya.
4. Molekul tRNA:
a. Struktur umum?
b. Bagian pengikat asam amino, bagian pengikat mRNA?
c. Maksud tRNA sebagai mol adaptor pada translasi?
5. Start codon pada ORF adalah ATG:
a. Mengapa demikian?
6. ATG (penyandi Met) di awal ORF ditranslate sebagai fMet, jelaskan makna
kimianya.

Untai sense (coding)

5-ATG-TCC-GCA-CGG-CCT-3

DNA:

3-TAC-AGG-CGT-GCC-GGA-5
Untai antisense (cetakan)

Transkripsi

mRNA:

5-AUG-UCC-GCA-CGG-CCU-3

Translasi

Protein:

NH3-Met-Ser-Ala-Arg-Pro-CO2-