Ekobiologi patogen:
Pengembangan perspektif
Inovasi dan2(2),
Pertanian penerapannya ...
2009: 111-130
EKOBIOLOGI PATOGEN:
PERSPEKTIF DAN PENERAPANNYA DALAM
PENGENDALIAN PENYAKIT1)
Suhardi
Balai Penelitian Tanaman Hias
Jalan Raya Ciherang, Kotak Pos 8 SDL, Segunung Pacet
Cianjur 43252
PENDAHULUAN
Salah satu aspek dalam ilmu penyakit tum-
buhan ialah ekobiologi patogen. Eko-
biologi menyangkut pengaruh lingkungan
terhadap tingkah laku patogen pada tiap
tahap perkembangannya, dan ini perlu di-
ketahui untuk menentukan metode pe-
ngendalian penyakit yang efektif dan efi-
sien serta sedikit mungkin menimbulkan
kerusakan lingkungan.
Identifikasi penyebab suatu penyakit
(etiologi) merupakan suatu langkah dalam
studi penyakit dan sebagai titik awal untuk
menentukan langkah-langkah selanjutnya.
Jika terjadi epidemi penyakit “baru” pada
suatu komoditas pertanian yang penting
dan telah menimbulkan kerusakan yang
cukup berarti atau diduga akan menim-
bulkan masalah yang besar, maka langkah
pertama yang harus dilakukan ialah me-
nentukan organisme penyebabnya. Jika
terdapat acuan metode pengendaliannya
di luar negeri tempat penyakit tersebut
pernah menimbulkan kerugian yang besar
dan telah banyak diteliti, pemerintah dan
masyarakat perlu segera mengambil tin-
dakan agar penyakit tidak meluas ke daerah
1)
Naskah disarikan dari bahan Orasi Profesor
Riset yang disampaikan pada tanggal 5 Januari
2006 di Bogor.
111
lain dan menimbulkan kerugian yang lebih
besar. Sebagai contoh adalah kejadian
nematoda sista kuning (Globodera rosto-
chiensis) pada tanaman kentang yang
muncul secara tiba-tiba di Jawa Timur
(Mulyadi et al. 2003), namun masih ter-
batas penyebarannya di Indonesia (Dar-
yanto 2003).
Pendekatan dalam pengendalian pe-
nyakit tanaman dipengaruhi oleh berbagai
faktor, antara lain penyebab penyakit,
potensi kehilangan hasil, nilai komersial
komoditas, serta ketersediaan teknologi
dan dana. Namun yang pasti, pendekatan
pengendalian penyakit yang dipilih diha-
rapkan mampu menyelamatkan kehilangan
hasil yang mungkin terjadi akibat suatu
penyakit. Biaya pengendalian yang
dikeluarkan, baik sarana maupun tenaga,
seharusnya tidak lebih besar dari nilai
ekonomi produk yang dapat diselamatkan,
baik di tingkat petani perorangan, masya-
rakat tani, konsumen maupun pengambil
kebijakan.
Sepanjang hidup tanaman, mulai biji
berkecambah sampai panen, suatu jenis ta-
naman dikolonisasi oleh beberapa orga-
nisme secara bersamaan waktunya, tum-
pang tindih atau berurutan sesuai dengan
sifat parasitismenya, apakah lebih cocok
pada stadia awal pertumbuhan atau pada
akhir pertumbuhan tanaman; apakah lebih
112
cocok menyerang daun, batang, akar atau
buah. Bahkan beberapa jenis patogen pada
buah-buahan dan sayuran hanya ber-
kembang bila buah atau sayuran tersebut
telah dipetik atau mencapai tingkat ke-
masakan fisiologis tertentu.
Identifikasi. Identifikasi penyebab
penyakit atau diagnosis merupakan ta-
hapan awal yang perlu dilakukan dalam
pengendalian penyakit. Penyakit utama
tanaman umumnya telah dikenal oleh
petugas lapangan dan petani, walaupun
mungkin memiliki nama yang berbeda.
Kekeliruan dalam diagnosis penyebab
penyakit sering terjadi karena gejala pe-
nyakit yang sama dapat disebabkan oleh
dua kelompok mikroorganisme yang sa-
ngat berbeda.
Prosedur baku untuk diagnosis pe-
nyakit, yaitu postulat Koch, tidak selalu
dapat diikuti secara lengkap karena bebe-
rapa patogen tidak dapat dibiakkan dalam
media buatan (parasit obligat), atau dapat
ditumbuhkan namun tidak dapat mem-
bentuk spora untuk studi morfologinya.
Namun dengan kemajuan teknologi mole-
kuler, identifikasi dapat dilakukan untuk
membedakan spesies bahkan subspesies.
Kehilangan hasil. Potensi kehilangan
hasil produk tanaman oleh patogen, baik
kuantitatif maupun kualitatif, merupakan
salah satu aspek dalam pengkajian pe-
ngendalian penyakit tanaman. Data kuan-
titatif kehilangan hasil sangat sedikit dan
jarang akurat, apalagi bila kehilangan hasil
tersebut dikaitkan dengan nilai ekonomi
dan status suatu komoditas. Kehilangan
hasil umbi kentang 25% oleh serangan
Phytophthora infestans (Mont.) de Bary,
penyebab penyakit hawar daun, tidak sa-
ma nilai dan dampak sosialnya dibanding-
kan dengan kehilangan hasil padi 25% oleh
serangan Pyricularia oryzae Cav. penye-
bab penyakit blas.
Suhardi
Kehilangan hasil produk pertanian,
baik kuantitatif maupun kualitatif, sangat
dirasakan oleh petani yang pertanam-
annya rusak oleh penyakit. Pengetahuan
tentang aspek kehilangan hasil secara tepat
dari pihak-pihak terkait merupakan suatu
keharusan untuk dapat mengembangkan
program perlindungan tanaman yang
rasional dan ekonomis, baik pengendalian
menggunakan fungisida, kultivar tahan,
teknik budi daya maupun cara terintegrasi.
Nilai kehilangan hasil produk pertanian
oleh penyakit harus dapat diperkirakan
sehingga dapat dibandingkan dengan
biaya pengendaliannya (James 1983).
Secara kuantitatif, data kehilangan hasil
produk pertanian relatif mudah dihitung
pada skala percobaan, dengan cara mem-
bandingkan hasil pada petak-petak dengan
tingkat kerusakan yang berbeda-beda se-
hingga diketahui korelasi antara intensitas
kerusakan dan produksi per satuan luas
yang ditanami. Sebagai contoh, potensi
kehilangan hasil bawang merah oleh
serangan Colletotrichum gloeospo-
rioides Penz. penyebab antraknose, dapat
mencapai 24-100% (Suhardi 1995), se-
dangkan pada bawang bombay berkisar
antara 50-100% bila tidak ada upaya
pencegahan dan atau pengendaliannya
(Ebenebe 1980).
Penyakit pascapanen pada komoditas
hortikultura hingga kini belum mendapat
perhatian yang memadai. Di Amerika
Serikat, diperkirakan lebih kurang 24%
buah-buahan dan sayuran yang dipanen
terbuang percuma karena penyakit (Wil-
son et al. 1994). Angka tersebut biasanya
didasarkan pada satu tahap dalam sistem
penanganan pascapanen. Belum ada se-
orang pun yang menghitung kehilangan
hasil secara akumulatif pada buah-buahan
dan sayuran selama panen, penanganan
segar, penyimpanan, pengangkutan, penja-
Ekobiologi patogen: perspektif dan penerapannya ...
jaan di pasar swalayan atau pasar tradi-
sional, dan penyajian di rumah tangga. Di
negara sedang berkembang, fasilitas pe-
nanganan pascapanen sangat minim dan
tuntutan mutu masih rendah sehingga di-
duga kehilangan hasil mencapai 50% atau
lebih.
Stadia panen dan periode bebas pe-
nyakit menentukan besarnya kehilangan
hasil suatu komoditas pertanian. Sebagai
contoh, infeksi bercak daun (Isariopsis
griseola Sacc.) pada tanaman buncis
kurang berpengaruh terhadap hasil panen
bila tanaman dipanen muda, namun
menurunkan bobot biji sampai 33% bila
dipanen bijinya (Suhardi 1980a). Dalam
kasus hawar daun kentang, 50-100% hasil
akan hilang apabila selama 2 bulan pertama
setelah tanam, pada 75% anak daun ter-
dapat sekurang-kurangnya satu bercak.
Apabila serangan berat terjadi 3 bulan
setelah tanam maka lebih kurang 20% hasil
akan hilang. Namun, apabila 75% dari anak-
anak daun tidak terserang sampai 2 minggu
sebelum panen maka hasil yang hilang
hanya 5% (Robert dan Boothroyd 1972).
Secara tidak langsung, kehilangan hasil
juga dirasakan oleh masyarakat yang ter-
kait dengan produk yang bersangkutan.
Apabila suatu komoditas pertanian meru-
pakan makanan pokok masyarakat di suatu
negara maka penyakit dapat menyebabkan
kelangkaan pangan, kelaparan, dan urbani-
sasi atau migrasi penduduk untuk mencari
kehidupan yang lebih baik, seperti yang
pernah terjadi di Irlandia saat epidemi pe-
nyakit hawar daun pada tanaman kentang
pada tahun 1884-1886.
Pertimbangan pengendalian penyakit.
Nilai komersial komoditas merupakan
salah satu pertimbangan dalam pengen-
dalian hama dan penyakit. Untuk komo-
ditas hortikultura, sering terjadi harga
begitu tinggi pada saat persediaan produk
113
terbatas, namun saat produk melimpah
maka harga jatuh. Pada saat harga suatu
produk pertanian rendah, pengendalian
penyakit tidak dilakukan atau hanya se-
kedarnya untuk menekan biaya serendah
mungkin. Bahkan pada saat harga produk
sangat murah, tanaman sering dibiarkan
dan panen pun tidak dilakukan karena
biaya panen tidak sebanding dengan nilai
jual hasil panen. Sebaliknya pada saat harga
produk tinggi, pemeliharaan tanaman dila-
kukan secara intensif dan berbagai upaya
pengendalian hama dan penyakit dilakukan
untuk menyelamatkan hasil, dan kadang-
kadang tanpa memperhatikan residu
pestisida yang digunakan yang mungkin
berbahaya bagi konsumen.
Pada tanaman hias yang mengutama-
kan nilai estetika, nilai komersial suatu ta-
naman akan merosot tajam bila terdapat
sedikit kerusakan pada bagian yang di-
peragakan, baik karena penyakit atau se-
bab lain. Oleh karena itu, hama dan pe-
nyakit dikendalikan dengan intensif agar
tidak terjadi kerusakan sama sekali (zero
tolerance). Tanaman hias langka koleksi
para penghobi memerlukan perhatian
ekstra untuk mencegah timbulnya pe-
nyakit. Efek samping dari adanya ke-
rusakan pada tanaman hias adalah ter-
pacunya pembentukan gas etilen yang
selanjutnya akan mempercepat pengu-
ningan bagian tanaman yang terserang,
seperti penyakit bercak hitam pada ta-
naman mawar yang memperpendek umur
daun yang pada akhirnya menurunkan
kualitas bunga, baik ukuran maupun va-
selife-nya.
Teknologi pengendalian suatu penya-
kit, terutama penyakit baru pada komoditas
pertanian penting, kadang tidak tersedia
dan petani tidak siap menghadapi masalah
tersebut, demikian pula pemerintah. Lang-
kah yang bisa dilakukan segera untuk
114
mengatasi masalah tersebut ialah meng-
adopsi pengetahuan dan teknologi dari
luar negeri sambil mengembangkan tekno-
logi yang sesuai dengan lingkungan sosial
dan budaya setempat.
Ketersediaan dana untuk pengendalian
hama dan penyakit dan biaya operasional
lainnya sering menjadi kendala pada
petani hortikultura. Keinginan petani kecil
(kepemilikan lahan < 0,2 ha) ialah ke-
mudahan dalam memperoleh kredit lunak
dengan suku bunga rendah dari lembaga
perbankan, atau adanya koperasi tani yang
menyediakan modal atau sarana pertanian
dengan mudah, termasuk untuk pembelian
pestisida.
Pestisida merupakan sarana produksi
penting yang belum dapat ditinggalkan
dalam budi daya komoditas hortikultura.
Dewasa ini, penggunaan pestisida diang-
gap masih berlebihan sehingga mengaki-
batkan hilangnya kesempatan bagi petani
untuk menangkap peluang imbalan eko-
nomi yang lebih tinggi (Adiyoga dan
Soetrisno 1997). Menurut Nurmalinda et
al. (1994), biaya pembelian pestisida
mencapai 34% dari total biaya produksi
bawang merah yang ditumpangsarikan
dengan cabai.
Selain harga pestisida makin mahal,
penggunaan pestisida yang berlebihan
dan tidak bijaksana dapat mencemari
lingkungan dan meninggalkan residu pada
produk yang dihasilkan. Penerapan Pe-
ngendalian Hama Terpadu (PHT) mem-
berikan dampak positif bagi petani ditinjau
dari segi penghematan biaya produksi,
mutu produk, dan kelestarian lingkungan.
Pada budi daya tumpang sari bawang
merah-cabai, PHT dapat menurunkan
residu fungisida sampai di bawah ambang
batas yang membahayakan, baik pada
Suhardi
bawang merah maupun cabai (Setiawati
dan Suwandi 1998; Setiawati 2000).
EKOBIOLOGI PATOGEN
Patogen lahir, tumbuh, istirahat, dan mati
seperti halnya makhluk hidup lain. Biologi
patogen mencakup seluruh fase dalam
siklus hidupnya. Kelahiran suatu patogen
ditandai dengan terbentuknya organ
perkembangbiakan yang dapat berupa
spora, sel bakteri, atau pertikel virus.
Tiap tahap mulai dari kelahiran sampai
kematian dipengaruhi oleh faktor-faktor
luar, sehingga pengetahuan yang memadai
tentang ekobiologi patogen sangat diper-
lukan untuk merancang strategi pengen-
dalian penyakit. Faktor lingkungan yang
berpengaruh terhadap biologi patogen da-
pat dikelompokkan menjadi faktor abiotik
dan biotik.
Faktor lingkungan abiotik antara lain
mencakup unsur-unsur cuaca seperti
hujan (frekuensi dan intensitas hujan),
kebasahan daun (leaf wetness), kelem-
bapan udara, suhu, angin, dan cahaya
matahari. Bila patogen hidup di tanah maka
kimia tanah (pH) dan fisika tanah (tekstur
dan struktur) dapat berpengaruh terhadap
biologi patogen dan intensitas penyakit
yang ditimbulkan. Faktor biotik yang ber-
pengaruh terhadap patogen ialah tanaman
(inang dan bukan inang, derajat resistensi),
mikroorganisme lain (vektor, antagonis dan
simbion), serta manusia.
Perkembangan penyakit selain di-
pengaruhi oleh faktor lingkungan juga
ditentukan oleh sifat pertumbuhan pa-
togen. Faktor lingkungan secara serentak
berpengaruh terhadap tanaman dan pa-
togen.
Ekobiologi patogen: perspektif dan penerapannya ...
Pengaruh Lingkungan
Lingkungan Abiotik
Hujan
Air hujan merupakan media pemencaran
yang efektif bagi spora yang dibentuk di
dalam badan buah di mana spora terbenam
dalam lumpur yang lengket (mucilagi-
neous matrix). Peranan air yang pertama
ialah menjadikan substansi pengikat spora
mengembang dan yang kedua memen-
carkan spora bersama dengan air yang
memercik atau yang mengalir ke bawah dan
jatuh ke tanah. Di atas tanah, pemencaran
spora terutama terjadi melalui aliran air
permukaan atau percikan air yang me-
nimpa permukaan tanah yang mengandung
spora patogen.
Efektivitas pemencaran spora oleh air
dipengaruhi oleh ukuran tetesan, kece-
patan jatuh, dan ketebalan cairan pada per-
mukaan tanaman inang. Tetesan air de-
ngan diameter 300-700 µm mampu mem-
bawa spora, namun yang paling efektif
ialah yang berdiameter >1.000 µm. Tetesan
air dengan diameter <100 µm akan me-
nguap dengan cepat kecuali bila kelem-
bapan relatif udara 100% ( Fitt et al. 1989).
Sifat permukaan tempat tetesan air
jatuh juga mempengaruhi efisiensi pe-
mencaran spora yang telah lepas dari
badan buah. Mulsa plastik meningkatkan
efisiensi pemencaran spora antraknose
pada tanaman arben dibanding mulsa
jerami dan pertanaman yang ditumbuhi
gulma (Yang dan TeBeest 1992). Hujan
yang berlangsung lama disertai angin
kencang merupakan kondisi yang cocok
bagi terjadinya epidemi antraknose pada
bawang merah (Suhardi 1996a).
115
Lama permukaan daun basah
Lama permukaan daun basah sangat ber-
peran dalam perkecambahan spora dan
proses infeksi pada sebagian besar pato-
gen. Makin lama permukaan daun basah,
makin besar peluang terjadinya infeksi
(Chakraborty et al. 1990; Wilson et al. 1990;
Winarto dan Suhardi 1997). Paling tidak
diperlukan 5-6 jam permukaan daun basah
agar timbul gejala penyakit.
Kelembapan udara
Hampir semua jamur patogenik memerlu-
kan kelembapan relatif yang tinggi selama
proses pembentukan spora dan perkem-
bangan penyakit. Spora C. gloeosporioi-
des penyebab antraknose pada buah
mangga, kakao, dan karet dibentuk saat
kelembapan relatif udara >95% (Fitzell dan
Peak 1984; Purwantara 1988a). Jumlah
spora yang berkecambah pada kelemba-
pan 99% lebih kurang separuh dibanding
pada kelembapan 100%, dan pada ke-
lembapan 97% perkecambahan spora tidak
berarti (Wastie 1972).
Pada kelembapan yang rendah, viabi-
litas spora cepat menurun atau bahkan mati.
Viabilitas spora di udara pada umumnya
pendek, terutama pada atmosfir dengan
kelembapan relatif rendah.
Suhu
Sama seperti kelembapan, suhu berpe-
ngaruh besar pada proses pembentukan
spora, perkecambahan, infeksi, dan per-
kembangan penyakit. Perkecambahan
spora P. infestans penyebab penyakit
116
hawar daun pada tanaman kentang dan
tomat sangat bergantung pada suhu. Pada
suhu di bawah 18°C, spora berkecambah
tidak langsung membentuk beberapa spora
kembara (zoospora), sementara pada suhu
di atas 20°C spora berkecambah langsung
membentuk buluh kecambah (Suhardi
1982). Di pegunungan, perkecambahan tak
langsung terjadi pada bulan-bulan dengan
suhu rata-rata < 20°C dan banyak hujan.
Pada bulan-bulan tersebut, jumlah spora
yang dihasilkan lebih banyak dibanding
pada bulan lainnya (Suhardi 1983).
Angin
Angin merupakan agens pemencaran
spora jamur patogenik, terutama spora
yang dibentuk di atas permukaan daun
seperti embun bulu (downy mildew),
embung tepung (powdery mildew), bercak
daun (leaf spot), dan karat (rust). Angin
merupakan agens pembawa spora yang
efektif karena ukuran spora yang relatif
kecil dan ringan. Namun, efektivitas angin
sebagai agens pemencaran spora dibatasi
oleh sifat spora yang tidak tahan terhadap
kelembapan rendah dan sinar ultraviolet
(UV), terutama untuk kelompok spora yang
dibentuk di atas badan buah serta yang
mempunyai dinding sel tipis dan hialin.
Cahaya matahari
Sinar matahari, terutama sinar UV ber-
pengaruh terhadap viabilitas spora jamur.
Purwantara (1988b) melaporkan, spora C.
gloeosporioides yang telah terpisah dari
badan buahnya lebih cepat mati dibanding
yang masih terdapat dalam badan buah,
baik karena sinar matahari langsung
maupun sinar UV. Penyinaran matahari
Suhardi
langsung selama 5 jam mematikan spora
lepas, namun bila masih di dalam badan
buah, spora akan mati setelah 7 jam
penyinaran. Di bawah sinar UV (254 nm),
spora lepas akan mati setelah 0,3 jam
penyinaran, sedangkan yang masih di
dalam badan buah akan mati setelah
terkena sinar UV selama 2,6 jam. Spora
yang telah berkecambah akan mati setelah
penyinaran matahari langsung selama 2
jam.
Lingkungan Biotik
Tanaman inang dan bukan inang
Tiap spesies tanaman merupakan inang
bagi sejumlah kecil mikroorganisme dari
yang jumlahnya ribuan. Spora yang jatuh
ke permukaan tanaman bukan inang akan
mati, sebaliknya spora yang jatuh ke ta-
naman inang akan terus berkembang bila
lingkungan menguntungkan.
Tingkat resistensi tanaman
Tanaman inang mempunyai respons yang
berbeda terhadap patogen, mulai dari imun
sampai sangat rentan. Tanaman imun sama
dengan tanaman bukan inang. Tanaman
toleran merupakan respons tanaman yang
dapat menerima kehadiran penyakit namun
tetap berproduksi dengan wajar (accept-
able).
Asosiasi patogen dengan organisme
lain
Patogen, baik yang menginfeksi bagian
tanaman di atas permukaan tanah maupun
yang di dalam tanah, selalu berhubungan
Ekobiologi patogen: perspektif dan penerapannya ...
dengan organisme lain sebagai simbion,
antagonis, atau bentuk hubungan lainnya.
Di antara mikroorganisme yang hidup di
permukaan daun (phyloplane), terdapat
mikroorganisme antagonis yang dapat
menghambat perkecambahan spora pa-
togen. Di antara antagonis yang hidup
secara epifit pada daun mawar, Xantho-
monas maltophilia dapat menghambat
pertumbuhan penyakit embun tepung dan
bercak hitam (Winarto 1998a, 1998b;
Suhardi et al. 2002).
Demikian pula pada permukaan akar
terdapat berbagai spesies mikroorganisme,
termasuk bakteri antagonis. Hsu et al.
(1992) melaporkan bahwa pada permukaan
perakaran tomat terdapat 103-104 sel bakteri
antagonis per gram akar basah. Populasi
bakteri akan meningkat bila tanah diberi
perlakuan amonium sulfat, tepung tulang,
dan sebagainya.
Manusia
Manusia (petani) mempunyai peran pen-
ting dalam mempengaruhi epidemiologi
penyakit, baik secara langsung maupun
tidak langsung. Tindakan kultur teknis
seperti pola tanam, pengolahan tanah,
pemupukan, dan pengairan dapat ber-
pengaruh positif atau negatif terhadap
perkembangan penyakit. Jones et al. (1985)
melaporkan bahwa jumlah bercak daun
krisan bertambah dengan meningkatnya
takaran pemupukan nitrogen dan fosfat.
Beberapa Aspek Biologi Patogen
Tipe perkembangan penyakit
Ada dua tipe perkembangan penyakit pen-
ting terutama yang disebabkan oleh jamur,
117
yaitu yang mempunyai tipe perkembangan
cepat dan lambat. Patogen yang mempu-
nyai tipe perkembangan cepat menghasil-
kan sejumlah besar spora secara berulang
(polycyclic). Tipe perkembangan penyakit
yang lambat baru akan menyebarkan spora
bila tanaman telah mati (monocyclic).
Variabilitas virulensi
Patogen yang menyerang tanaman dengan
tingkat keragaman genetik yang rendah
cenderung memunculkan ras fisiologi,
strain atau patovar baru yang kompatibel
dengan konstitusi genetik tanaman ter-
sebut. Di Jawa Barat, isolat P. infestans asal
tanaman kentang terdiri atas tidak kurang
dari 9 ras fisiologis (Suhardi 1982). Se-
mentara itu, populasi Colletotrichum
lindemuthianum penyebab antraknose
pada buncis di Jawa Barat terdiri atas ras a
dan ras g (Suhardi 1980b).
Patogen yang perkembangannya lam-
bat dengan siklus tunggal (monocyclic),
selama periode tanam umumnya mempu-
nyai variabilitas yang kecil. Fusarium
oxysporum f.sp. lycopersici merupakan
satu contoh yang di Jawa hanya terdapat
satu ras fisiologi yaitu ras 1 (Suhardi dan
Bustaman 1979). Walaupun demikian,
dalam populasi ras 1 tersebut terdapat dua
galur yang memiliki virulensi yang ber-
beda.
Variabilitas patogen yang resisten
terhadap bahan kimia yang digunakan
dalam pengendalian penyakit juga banyak
dijumpai dalam praktek, terutama sejak
fungisida sistemik digunakan secara terus-
menerus sehingga mendorong timbulnya
resistensi patogen yang bersangkutan.
Kecepatan munculnya populasi patogen
yang resisten terhadap fungisida antara
lain bergantung pada patogen yang ber-
118
sangkutan, tekanan seleksi fungisida, dan
lingkungan tempat interaksi tersebut
berlangsung. Menurut Northover dan
Matteoni (1986), Botrytis cinerea Pers.
menjadi resisten terhadap benomil setelah
aplikasi 7 kali di lapangan, sedangkan ter-
hadap iprodion setelah 10 kali aplikasi atau
lebih, dan terhadap vinclozolin setelah
aplikasi 4 tahun.
Infeksi laten
Infeksi laten (latent infection) merupakan
fenomena penting pada penyakit tanaman.
Daun dan buah muda merupakan stadium
yang paling rentan terhadap infeksi jamur,
walaupun gejala penyakit terlihat setelah
bagian tersebut mencapai tingkat ketuaan
tertentu.
Winarto dan Suhardi (1997) melaporkan
bahwa tunas tanaman mawar stadium-1
(tunas dengan 0-1 daun telah membuka)
paling rentan terhadap infeksi Diplo-
carpon rosae, namun gejala bercak hitam
baru tampak setelah daun membuka
sempurna. Pada tanaman krisan, daun
tengah dan pucuk lebih rentan terhadap
Pseudomonas cichorii dibanding daun-
daun bawah (Jones et al. 1985). Ada
anggapan yang kurang tepat bahwa tanda
ketuaan daun adalah adanya bercak-
bercak pada seluruh permukaannya, pa-
dahal sesungguhnya ada serangan pato-
gen yang memacu proses penuaan daun.
Infeksi mendorong pembentukan etilen
dan menyebabkan daun menguning.
Pada buah-buahan, baik buah impor
maupun lokal, buah yang semula mulus
saat dibeli setelah beberapa hari menjadi
berbercak dan bahkan busuk pada per-
mukaannya. Proses fisiologis buah setelah
panen, selama transportasi, sortasi, penge-
pakan, penyimpanan, dan penyajian terus
Suhardi
berlangsung. Busuk buah cabai biasanya
dijumpai pada buah yang tua (berwarna
merah). Namun menurut laporan Astuti
dan Suhardi (1986), buah cabai muda lebih
rentan terhadap antraknose dibanding
buah yang tua.
Kelangsungaan hidup patogen
Di dalam tanah, viabilitas spora pada
umumnya tidak bertahan lama karena
mengalami lisis di bawah tekanan pe-
ngaruh bakteri dan Actinomycetes anta-
gonis. Namun, beberapa bentuk spora spe-
sies patogen dapat berfungsi untuk mem-
pertahankan hidup di luar tanaman inang-
nya. Ciri spora yang berfungsi untuk per-
tahanan ialah mempunyai dinding yang
tebal dan kuat, misalnya sklerotia dan
klamidospora. Menurut Patterson (1991),
klamidospora Alternaria solani Sor. dapat
bertahan hidup selama 12 bulan dan meru-
pakan inokulum primer yang menimbulkan
penyakit busuk leher maupun bercak daun
pada tanaman tomat. Patogen dapat
melangsungkan hidupnya pada tanaman
lain dan menimbulkan penyakit yang sama
dengan tanaman inang utama, atau dalam
bentuk miselium dan menempel pada gulma
tanpa menimbulkan luka sama sekali (Raid
dan Pennypacker 1989; Suhardi 1995,
1997).
PENGENDALIAN PENYAKIT
Pada dasarnya terdapat empat cara pe-
ngendalian penyakit, yaitu eksklusi, era-
dikasi, proteksi, dan resistensi. Eksklusi
adalah metode untuk mencegah masuknya
patogen ke suatu wilayah (negara, pulau,
wilayah dalam satu pulau, petak perta-
naman, atau rumah kaca). Eradikasi ada-
Ekobiologi patogen: perspektif dan penerapannya ...
lah metode pemusnahan patogen dari
tapak hidupnya; proteksi adalah metode
pengendalian penyakit dengan cara me-
lindungi tanaman dari infeksi patogen; dan
resistensi adalah metode pengendalian
penyakit dengan cara menanam kultivar
yang resisten terhadap penyakit. Pengeta-
huan ekobiologi patogen dapat diterapkan
untuk pengendalian penyakit, baik secara
eksklusi, eradikasi, proteksi maupun
resistensi.
Pengendalian Penyakit Prapanen
Tidak ada satu metode pun yang paling
baik dan dapat digunakan untuk meme-
cahkan masalah penyakit secara tuntas.
Tiap metode pengendalian memiliki keter-
batasan dan kelemahan yang perlu diper-
timbangkan dengan cermat. Kultur teknis
dapat berpengaruh positif atau negatif
terhadap insiden dan keparahan penyakit
sehingga perlu dipertimbangkan dalam
budi daya tanaman.
Budi daya tanaman sehat merupakan
cara pengendalian hama dan penyakit yang
efektif, murah, dan aman. Pada hakikatnya,
budi daya tanaman sehat merupakan
integrasi berbagai cara yang dapat me-
nurunkan populasi awal patogen (initial
population) atau menghambat laju per-
kembangannya (infection rate). Sebagai
sebuah strategi, epidemiologi akan mene-
tapkan langkah yang mesti dilakukan
untuk meminimalkan kerugian yang dide-
rita oleh petani.
Lingkungan yang mempengaruhi pa-
togen dan penyakit yang ditimbulkan ada
yang tidak dapat diatur, namun dapat
diprakirakan seperti lingkungan makro.
Sementara lingkungan mikro dan meso di
antara tajuk tanaman dan di dalam tanah
dapat dikendalikan melalui kultur teknis,
119
yang pada gilirannya akan mempengaruhi
tanaman dan semua stadia perkembangan
penyakit.
Dalam pengendalian satu jenis penya-
kit pada satu macam tanaman inang, per-
timbangan pengambilan keputusan yang
ditempuh tidak begitu kompleks. Dalam
pengendalian penyakit hawar daun pada
tanaman kentang, misalnya, dapat dila-
kukan dengan menggunakan bibit sehat,
mengatur waktu tanam (Suhardi 1983),
menanam kultivar tahan (Mooi et al. 1980;
Suhardi 1984), dan menggunakan fungisida
(Departemen Pertanian 1999).
Bibit kentang impor bersertifikat meru-
pakan penguras devisa yang cukup besar,
karena tidak kurang dari 30.000 ton bibit
didatangkan dari luar negeri tiap tahun.
Ada satu keuntungan apabila bibit dibuat
di dalam negeri, karena di daerah tropika
tidak terjadi infeksi patogen pada umbi
(Sato 1979; Suhardi 1982).
Peramalan (forecasting) penyakit ber-
dasarkan prinsip-prinsip yang benar dapat
meningkatkan efektivitas dan efisiensi
perlakuan pengendalian. Peramalan le-
dakan penyakit hawar daun (late blight
atau leaf blight) pada tanaman kentang
telah dikembangkan di negara maju di ma-
na kentang merupakan makanan pokok
(Zadoks dan Schein 1979). Ada dua sistem
pendekatan peramalan. Sistem pertama
didasarkan pada curah hujan harian dan
suhu maksimum-minimum. Awal serangan
diramalkan terjadi 7-14 hari setelah ke-
jadian pertama dari 10 hari berturut-turut
hari baik bagi hawar daun (blight-favour-
able days = bfd) dengan suhu rata-rata
harian selama 5 hari di bawah 25,5°C dan
total curah hujan selama 10 hari terakhir ≥
30 mm. Hari-hari pada saat suhu minimum
di bawah 7,2°C merupakan kondisi yang
tidak cocok bagi penyakit. Sistem kedua
didasarkan pada kelembapan relatif dan
120
suhu sebagai nilai keparahan (severity
value). Nilai tersebut menunjukkan hu-
bungan yang spesifik antara lama periode
kelembapan ≥ 90% dan suhu rata-rata
selama periode tersebut. Kemunculan
penyakit pertama terjadi 7-14 hari setelah
18-20 hari nilai keparahan sejak tanaman
tumbuh.
Aplikasi fungisida berdasarkan model
tersebut dapat diadopsi di Indonesia de-
ngan modifikasi, mengingat ada korelasi
yang kuat antara insiden dan perkem-
bangan penyakit hawar daun dan cuaca
(Suhardi 1983). Modifikasi diperlukan
dengan mempertimbangkan faktor teknis
dan sosiologis mengingat luas lahan usa-
ha tani yang sempit (meskipun beberapa
petani memiliki lahan usaha tani > 5 ha),
penanaman tidak serempak, pengetahuan
petani yang terbatas, dan inokulum pe-
nyakit yang tersedia sepanjang tahun (dari
tanaman kentang dan tomat).
Menurut Polley (1983), terdapat lima
syarat utama yang harus dipenuhi sebelum
membuat suatu peramalan penyakit yang
berhasil guna. Kelima syarat tersebut
adalah: (1) penyakit merupakan faktor
pembatas produksi yang secara ekonomi
signifikan, baik secara kualitas maupun
kuantitas; (2) metode pengendalian harus
tersedia dengan biaya yang secara eko-
nomis dapat diterima; (3) penyakit bervari-
asi tiap musim, baik saat gejala pertama
muncul maupun laju perkembangan selan-
jutnya; (4) kriteria atau model yang digu-
nakan dalam membuat suatu prediksi harus
didasarkan pada penelitian yang benar di
laboratorium dan di lapangan, dan diuji
selama beberapa tahun untuk menetapkan
ketepatannya dan kegunaannya di semua
lokasi; dan (5) petani harus mempunyai
kemampuan dan peralatan, agar dapat
secara luwes mengambil keuntungan dari
Suhardi
peringatan dini dan melakukan tindakan
pengendalian secara tepat.
Tingkat kesulitan pengendalian pe-
nyakit meningkat apabila dalam satu per-
tanaman terdapat lebih dari satu patogen,
dan hal itu selalu terjadi. Pada kentang,
pada waktu dan ruang yang sama, tanaman
tidak hanya diserang hawar daun, tetapi
juga penyakit lain seperti bakteri layu (P.
solanacearum), kudis (Streptomyces
scabies), virus (PLRV, PVX, PVY, dan
sebagainya), nematoda (Meloidogyne
spp.), termasuk nematoda sista kuning, dan
serangga (Phthorimaea operculella, Li-
riomyza spp., dan sebagainya).
Pengelolaan tanaman (crop manage-
ment) lebih berarti untuk meningkatkan
efektivitas dan efisiensi pengelolaan tiap
hama dan penyakit, yang meliputi pe-
milihan lahan dan bibit, penentuan waktu
tanam, pemeliharaan tanaman, panen, dan
penanganan pascapanen. Pada tiap tahap
pengelolaan tanaman, hama dan penyakit
tertentu memiliki kesempatan menginfeksi
tanaman sesuai dengan sifat biologisnya.
Dalam sistem usaha tani, tidak jarang
petani menanam lebih dari satu komoditas
pada waktu dan tempat yang sama. Di
dataran tinggi, banyak petani yang me-
nanam sayuran secara tumpang sari,
seperti wortel sebagai tanaman utama yang
ditumpangsarikan dengan petsai dan ba-
wang daun. Pengolahan tanah dilakukan
secara minimal. Setelah tanah diolah lalu
dibuat guludan dan benih wortel disebar
merata, kadang-kadang dicampur benih
petsai, atau petsai ditanam sebelum ta-
naman wortel tumbuh. Di pinggir guludan
ditanam bawang daun atau komoditas lain
terutama untuk mencegah tanah guludan
longsor saat hujan dan membawa serta
benih yang belum tumbuh.
Ekobiologi patogen: perspektif dan penerapannya ...
Pengelolaan penyakit dalam sistem
tumpang sari kelihatannya lebih rumit di-
banding sistem monokultur karena kom-
ponennya paling tidak tiga komoditas, dan
tiap komoditas memiliki hama dan penyakit
yang berbeda. Namun kenyataannya tidak
serumit yang dibayangkan. Wortel yang
ditanam paling awal dipanen paling akhir
dengan tingkat serangan hama dan pe-
nyakit yang rendah, karena kultivar yang
ditanam toleran terhadap hama dan
penyakit. Bibit wortel biasanya diperoleh
dari petani lain atau membibitkan sendiri
dengan menyeleksi pertanaman sebelum-
nya. Cara ini telah dilakukan berulang-
ulang selama puluhan tahun sehingga
diperoleh kultivar yang merupakan land
race setempat. Petsai yang dipanen umur
20 hari setelah tanam rata-rata terserang
penyakit dengan intensitas rendah, kare-
na di samping merupakan land race, petsai
dipanen muda sehingga penyakit belum
berkembang. Demikian pula dengan
bawang daun pada sistem tumpang sari
tersebut, tingkat kerusakannya cukup
rendah.
Pengaruh tanaman komponen tum-
pang sari terhadap intensitas serangan
penyakit dapat positif atau negatif. Tum-
pang sari cabai-tomat-jagung meningkat-
kan intensitas serangan bercak daun Cer-
cospora (Cercospora capsici Heald &
Wolf.) dan busuk buah (Colletotrichum
spp.) (Suhardi dan Wasito 1990), sebagai
akibat meningkatnya kelembapan di antara
tanaman cabai yang dikelilingi oleh ta-
naman yang lebih tinggi. Pengaruh lain dari
tanaman komponen tumpang sari dilapor-
kan oleh Marwoto dan Rohana (1988),
yang menyatakan bahwa tanaman Tagetes
patula L. (tanaman hias) dan Crotalaria
(orok-orok, sebagai pupuk hijau) mampu
menekan intensitas serangan Meloido-
gyne spp. pada tanaman cabai, sementara
121
pada tanaman tomat dan kubis, serangan
penyakit meningkat.
Dalam skala usaha tani yang lebih luas,
tanaman bawang merah ditumpanggilirkan
dengan cabai, seperti di pantura Jawa.
Menurut Koster (1990), pola tanam
bawang merah di Brebes (±16.000 ha)
ditentukan oleh ketersediaan air untuk
penyiraman, kebiasaan petani, dan risiko
yang berkaitan dengan modal. Di Brebes,
bawang merah ditanam setelah padi
dengan pola tanam yang berbeda antara
satu tempat dan tempat lain.
Kebijakan pemerintah daerah diper-
lukan dalam pengaturan pola tanam. Dari
sudut pandang pengendalian penyakit,
keharusan petani menanam padi sekali
setahun setelah sayuran/palawija dapat
menurunkan populasi awal berbagai
patogen. Tanaman padi yang ditanam satu
kali pada bulan Oktober-Januari cukup
memadai untuk mengurangi populasi awal
patogen bawang merah dan atau cabai
dalam tanah.
Waktu tanam merupakan strategi yang
efektif untuk mengurangi populasi awal
dan laju perkembangan patogen, yaitu bila
cuaca diprakirakan tidak kondusif bagi
patogen berdasarkan pengalaman masa
lalu. Menurut Grubben (1990), budi daya
bawang merah dengan risiko terkecil ialah
pada musim kemarau sepanjang air masih
mencukupi untuk penyiraman.
Pada umumnya jamur patogenik tidak
dapat berkembang optimal bila tidak ter-
dapat hujan dan kelembapan udara rendah.
Di Jawa, hal tersebut terjadi pada musim
kemarau, Maret-September, yang meru-
pakan saat paling baik untuk bertanam
bawang merah. Menurut Suhardi et al.
(1993), pada awal musim kemarau, pada
saat frekuensi dan intensitas hujan rendah
tetapi kelembapan dan suhu udara masih
tinggi, A. porri pada tanaman bawang
122
merah berkembang cepat. Hujan lebat dan
berlangsung berhari-hari merupakan kon-
disi lingkungan yang kondusif bagi per-
kembangan C. gloeosporioides, semen-
tara pada bulan tidak ada hujan, kedua
penyakit dapat diabaikan.
Pemeliharaan tanaman, termasuk pe-
mupukan dan penyiraman dapat mempe-
ngaruhi tingkat insiden dan keparahan
penyakit tanaman bawang merah dan
cabai. Menurut Suryaningsih dan Asandhi
(1992), pemupukan berimbang dapat
mengurangi serangan A. porri, sedangkan
pemupukan N yang tinggi dan bersifat
asam mendorong perkembangan layu
Fusarium (F. oxysporum f.sp. cepae).
Penyiraman kadang-kadang dilakukan
bukan karena tanaman butuh air, tetapi
untuk mencuci daun yang kotor setelah
hujan. Secara teoritis, koloid tanah yang
menempel pada permukaan daun dapat
membawa spora patogen yang telah jatuh
ke tanah, dan tetap melekat pada permu-
kaan apabila dibiarkan mengering.
Peramalan penyakit mempunyai tujuan
utama untuk mengurangi penggunaan
fungisida. Dalam upaya pengendalian
penyakit antraknose (C. gloeosporioides)
pada cabai, Sastrahidayat et al. (1994)
melaporkan bahwa laju infeksi ditentukan
secara nyata oleh kelembapan relatif (R2 =
0,62). Namun kelembapan merupakan
faktor iklim yang tidak dapat dikendali-
kan, sehingga untuk menurunkan laju in-
feksi harus dilakukan dengan mengguna-
kan fungisida atau kultivar cabai yang re-
sisten. Menurut Suhardi (1996b), per-
kembangan penyakit antraknose pada
bawang merah dipengaruhi oleh curah
hujan (+) dan lama penyinaran (-). Bila
curah hujan tinggi dan berkepanjangan
maka intensitas serangan naik, dan bila lama
penyinaran naik maka intensitas penyakit
turun. Hujan berperan sebagai agens pe-
Suhardi
mencaran patogen, sementara spora pato-
gen tidak tahan terhadap sinar matahari.
Penyemprotan fungisida untuk me-
ngendalikan penyakit dapat diperbaiki
dengan melakukan pemantauan insiden
munculnya penyakit. Langkah tersebut
bila disinergikan dengan pengalaman masa
lalu akan meningkatkan efisiensi penyem-
protan, misalnya dalam menentukan awal
penyemprotan fungisida. Namun, perkem-
bangan penyakit selanjutnya ditentukan
oleh keadaan iklim yang berpengaruh
terhadap efisiensi selanjutnya. Menurut
Suhardi (1998), efektivitas dan efisiensi
penentuan awal penyemprotan ditentukan
oleh lingkungan dan kultivar. Pada musim
hujan, ketiga penyakit pada bawang me-
rah, yaitu bercak ungu (A. porri), antrak-
nose (C. gloeosporioides), dan layu (F.
oxysporum f.sp. cepae) menyerang secara
bersamaan dan menimbulkan kerusakan
yang parah. Pada musim kemarau, penyakit
yang muncul hanya bercak ungu dengan
intensitas serangan rendah pada 50 hari
setelah tanam.
Penyemprotan fungisida berdasarkan
pemantauan gejala dapat meningkatkan
efisiensi penggunaan fungisida. Suhardi
et al. (1993) melaporkan bahwa penyem-
protan fungisida yang dimulai saat gejala
muncul menghemat 83% biaya bila hari-
hari berikutnya tidak kondusif bagi perkem-
bangan penyakit. Menurut Suhardi dan
Hadisutrisno (1994), penundaan penyem-
protan fungisida sampai penyakit muncul
dapat meningkatkan efisiensi sampai 87%
pada kultivar toleran (cv. Sumenep) dan
82% pada kultivar yang rentan (cv. Bima).
Pengendalian hayati menggunakan
mikroorganisme antagonis telah banyak
dilaporkan (Mulya 1997; Soetanto dan
Termarshuizen 2001; Djatnika et al. 2003a,
2003b; Hanudin dan Marwoto 2003).
Namun, laporan keberhasilan sebagian be-
Ekobiologi patogen: perspektif dan penerapannya ...
sar berasal dari percobaan skala labo-
ratorium atau semi-lapangan. Fenomena ini
disebabkan oleh beberapa faktor, antara
lain hilangnya efikasi di bawah kondisi
lapangan dan skala luas, atau kesulitan
teknis dan legal menyangkut uji skala
komersial.
Bacillus subtilis (Ehrenberg) Cohn me-
rupakan bakteri epifit dan penghuni tanah
yang banyak dimanfaatkan untuk pe-
ngendalian penyakit. Pada tanaman bun-
cis, B. subtilis menghambat pembentukan
pustul karat daun sebesar 95% apabila
diberikan 2-120 jam sebelum infeksi
Urumyces phaseoli (Reben.) Wint., namun
bila disemprotkan setelah terjadi infeksi
tidak dapat menekan perkembangan
penyakit (Baker et al. 1983). Di lapangan,
efektivitas B. subtilis terhadap karat daun
buncis lebih besar dibandingkan dengan
penyemprotan mankozeb dengan interval
7 hari (Baker et al. 1985).
Aplikasi agens hayati seperti B. sub-
tilis dapat dengan disemprotkan, disiram-
kan ke atas permukaan tanah, atau dicam-
purkan dengan bahan pelapis benih, ber-
gantung pada patogen yang akan dikenda-
likan. Perlakuan biji kacang tanah dengan
B. subtilis dapat meningkatkan perkecam-
bahan biji, memperbaiki nodulasi Rhizo-
bium spp., meningkatkan nutrisi tanaman,
mengurangi serangan kanker akar yang
disebabkan oleh Rhizoctonia solani, dan
memperbaiki pertumbuhan akar (Turner
dan Backman 1991). Merriman et al. (1974)
melaporkan bahwa perlakuan benih de-
ngan pelet yang mengandung B. subtilis
dan Streptomyces griceus meningkatkan
hasil wortel masing-masing 48% dan 15%,
serta anakan dan hasil barley, oat, dan
gandum.
Di atas permukaan daun juga terdapat
mikroorganisme yang dapat dimanfaatkan
untuk pengendalian penyakit. Belanger et
123
al. (1994) melaporkan bahwa Sporotrix
flocculosa (Traquir) Shaw&Jarvis yang
hidup sebagai epifit pada permukaan daun
mawar dapat dimanfaatkan sebagai agens
hayati penyakit embun tepung (Sphaero-
theca pannosa var. rosae) dalam skala
komersial.
Penerapan pengendalian penyakit de-
ngan menggunakan agens hayati secara
luas adalah penggunaan kompos yang
diperkaya dengan mikroorganisme anta-
gonis, terutama untuk mengendalikan pe-
nyakit rebah kecambah (damping-off) pada
tanaman pot atau di persemaian. Menurut
Hoitink et al. (1991), agens hayati yang
secara alami mengkolonisasi kompos
setelah puncak proses pengomposan ialah
Bacillus spp., Enterobacter spp., Flavo-
bacterium balustinum Harrison, Pseudo-
monas spp., Streptomyces spp., Tricho-
derma spp., dan Gliocladium virens (Mill.)
Giddens & Foster. Mikroorganisme ter-
sebut dapat ditambahkan ke dalam kompos
yang telah jadi untuk mencegah penyakit
yang disebabkan oleh Fusarium spp.,
Pythium spp., dan Phytophthora spp.
Pengendalian Penyakit
Pascapanen
Pengendalian penyakit pascapanen sa-
ngat kurang mendapat perhatian di Indo-
nesia. Pada umumnya patogen pascapa-
nen juga merupakan penyebab penyakit
di lapangan.
Bila dilacak dari proses produksi maka
pengendalian perlu dilakukan selama pro-
duk masih di lapangan (prapanen), pada
saat panen, dan pascapanen. Pada umum-
nya patogen pascapanen memiliki sifat
infeksi laten, yang gejalanya muncul
setelah buah mencapai tingkat kemasakan
tertentu. Namun, infeksi juga dapat ber-
124
langsung selama sortasi, pengangkutan,
pengepakan, dan penyimpanan di gudang.
Perlakuan prapanen terutama ditujukan
untuk patogen yang mempunyai periode
laten dalam siklus hidupnya. Hal ini di-
sebabkan patogen dalam bentuk awal
(spora berkecambah dan telah membentuk
apresorium) bertahan di bawah epidermis
kulit buah. Di lapangan, tindakan yang
dapat mengurangi penyakit pascapanen
ialah perlakuan fungisida, pemberong-
songan, sanitasi, eradikasi, dan kultur
teknis. Sementara perlakuan pascapanen
meliputi pencucian, pengeringan (curing),
sortasi, pengkelasan, perlakuan fungisida
dan biofungisida (Korsten et al. 1997),
pelilinan (Pusey et al. 1986), penyimpanan
dingin, modifikasi atmosfer (Wilson et al.
1994), dan perlakuan panas (Barkai-Golan
dan Phillips 1991). Mencegah timbulnya
luka saat panen, sortasi, dan pengkelasan
dapat mengurangi infeksi buah oleh
patogen (Huang et al. 1991).
ARAH KEBIJAKAN DALAM
PENGENDALIAN PENYAKIT
Berbeda dengan pengendalian hama se-
rangga yang berpedoman pada nilai
ambang kendali untuk meningkatkan efi-
siensi penggunaan insektisida, pengen-
dalian penyakit dengan fungisida lebih
mempertimbangkan aspek lingkungan
(cuaca) yang berpengaruh terhadap insi-
den dan perkembangan penyakit. Pe-
nyemprotan fungisida yang dimulai pada
saat penyakit sudah mencapai intensitas
tertentu merupakan tindakan yang ter-
lambat, kecuali digunakan fungisida
sistemik yang sangat efektif. Sistem pe-
ramalan ledakan penyakit perlu dikem-
bangkan berdasarkan penelitian eko-
biologi patogen dalam periode waktu yang
Suhardi
cukup lama, sehingga ditemukan model
yang teruji di lapangan.
Pemantauan yang merupakan salah
satu langkah dalam penerapan PHT, tidak
hanya perlu dilakukan oleh petani di lahan
garapannya untuk menentukan tindakan
yang diperlukan sesuai dengan peng-
alamannya, tetapi juga perlu dilaksanakan
oleh petugas lapangan di wilayah kerja-
nya secara periodik. Pemantauan bertuju-
an untuk: (1) menetapkan penyakit (pa-
togen) yang paling penting yang dapat
berubah tiap saat; (2) mengetahui kondi-
si yang menentukan epidemi sehingga
dapat dibuat model peringatan secara
sederhana; (3) menentukan kultivar yang
paling mudah terserang dan yang paling
tahan; dan (4) mendeteksi perubahan
virulensi patogen sehingga dapat disa-
rankan kepada petani kultivar yang ke-
mungkinan akan tetap tahan.
Metode pengamatan, pelaporan, dan
analisis yang berkaitan dengan insiden
dan intensitas hama dan penyakit perlu
terus dikembangkan, tidak hanya untuk
padi dan tanaman pangan lainnya, tetapi
juga untuk komoditas hortikultura. Buku
panduan pengamatan sederhana perlu
disusun dan dikembangkan untuk pe-
gangan petugas lapangan. Pelatihan un-
tuk meningkatkan keterampilan petugas
dalam pengamatan dan pelaporan perlu
diadakan secara rutin. Mutu laporan ten-
tang adanya serangan penyakit bergan-
tung pada kecakapan dan pengalaman
petugas serta frekuensi kunjungan ke
lapangan.
Analisis data hubungan antara in-
tensitas serangan penyakit dengan kondisi
lingkungan, pola tanam, dan kultur teknis
sangat bermanfaat dalam mengantisipasi
ledakan penyakit. Pelaporan secara sub-
jektif mengenai intensitas serangan yang
meliputi skala normal, di atas atau di bawah
Ekobiologi patogen: perspektif dan penerapannya ...
normal dapat dipakai sepanjang dilakukan
secara teratur dan berdasarkan keadaan
yang sesungguhnya di lapangan. Laporan
tentang keadaan hama dan penyakit ta-
naman di suatu wilayah serta rekomendasi
tindakan yang harus dilakukan oleh petani
perlu disiarkan melalui radio pemerintah
daerah atau swasta.
Pemerintah pusat dan daerah, per-
kebunan, koperasi usaha tani selayaknya
mempunyai kemampuan yang lebih besar
dalam pengelolaan penyakit dibanding
petani secara individual. Mereka dapat
mengintegrasikan kemampuan sistem
pengelolaan untuk semua komoditas di
banyak usaha tani yang masing-masing
mempunyai masalah yang berbeda, baik
iklim, tanah, hama maupun penyakit.
Peran yang lebih besar dari pemerintah
diperlukan dalam: (1) investasi untuk me-
ngembangkan metode pengendalian se-
cara sistemik (control system); (2) investasi
peralatan dan mobilisasi umum yang dapat
digunakan secara lebih baik; (3) menyewa
spesialis (konsultan) untuk mengoptimal-
kan metode pengendalian; dan (4) tindakan
regulasi yang berkaitan dengan perlin-
dungan tanaman di dalam negeri. Dengan
wewenang yang makin besar, pemerintah
pusat/daerah, perkebunan, atau kelompok
usaha tani akan lebih mudah menegakkan
peraturan dan melaksanakannya. Langkah
yang paling nyata dari wewenang tersebut
ialah Peraturan Pemerintah (PP) nomor 12
Tahun 1992 tentang Sistem Budidaya
Tanaman, di mana pengendalian hama dan
penyakit menganut prinsip keterpaduan
(pengelolaan hama terpadu = PHT), dan
PP nomor 14 Tahun 2002 tentang Karan-
tina Tumbuhan untuk mencegah masuk-
nya penyakit baru ke dalam wilayah In-
donesia.
Betapa pun lengkapnya peraturan pe-
merintah dan aturan pelaksanaannya,
125
akhirnya terpulang kepada kita semua. Lalu
lintas bahan tanaman begitu terbuka dalam
era perdagangan bebas, yang memung-
kinkan masuknya OPT ke dalam wilayah
Indonesia. Kasus nematoda sista kuning
menjadi contoh yang jelas bahwa penyakit,
baik yang disebabkan oleh nematoda, ja-
mur, bakteri maupun virus mudah lolos dan
menjadi endemis di negara kita yang sa-
ngat luas wilayahnya.
KESIMPULAN
1. Pengetahuan ekobiologi patogen me-
megang peranan yang strategis dalam
pengendalian penyakit yang berwa-
wasan lingkungan, baik penyakit pra-
panen maupun pascapanen.
2. Sepanjang hidup tanaman, mulai biji
berkecambah hingga panen, suatu ta-
naman dikolonisasi oleh beberapa
organisme secara bersamaan waktunya
atau berurutan sesuai dengan sifat
parasitismenya, apakah lebih cocok
pada stadia awal pertumbuhan atau
pada akhir pertumbuhan tanaman;
apakah lebih cocok menyerang daun,
batang, akar, atau buahnya. Bahkan
beberapa jenis patogen pada buah-
buahan berkembang setelah buah
dipetik dan mencapai tingkat kema-
sakan fisiologis tertentu.
3. Patogen, baik yang menginfeksi bagian
tanaman yang ada di atas permukaan
tanah maupun yang di dalam tanah, se-
lalu berhubungan dengan organisme
lain sebagai simbion, antagonis, atau
bentuk hubungan lainnya. Pemelihara-
an tanaman selama proses produksi ha-
rus mengupayakan agar semua agens
antagonis tetap berfungsi secara alami.
4. Penyakit penting yang menyerang su-
atu komoditas pertanian merupakan
126
fenomena yang dinamis dan berdi-
mensi ruang dan waktu. Penyakit se-
bagaimana halnya komponen ekosis-
tem akan berubah bila lingkungan
berubah. Pemantauan dinamika po-
pulasi penyakit memegang peranan
penting dalam upaya pengendalian-
nya.
5. Patogen yang tergolong parasit lemah
menginfeksi tanaman melalui luka atau
pada saat kondisi tanaman lemah akibat
kekurangan air atau unsur hara. Luka
yang terjadi selama proses produksi
dan pascapanen harus diupayakan
sekecil mugkin untuk mengurangi
infeksi dan perkembangan penyakit.
6. Patogen tanaman mempunyai kemam-
puan besar untuk beradaptasi terhadap
lingkungan, baik lingkungan biotik (ta-
naman resisten) maupun kimia (pes-
tisida). Penanaman kultivar resisten
secara bergilir dengan konstitusi ge-
netik yang berbeda, serta penggunaan
fungisida yang mempunyai mekanisme
berlainan tiap waktu tertentu mening-
katkan daya guna kultivar atau fungi-
sida terhadap penyakit bertahan lama.
DAFTAR PUSTAKA
Adiyoga,W. dan T.A. Soetrisno. 1997.
Keunggulan komparatif dan insentif
ekonomi usaha tani bawang merah. J.
Hort. 7 (1): 614-621.
Astuti,E.B. dan Suhardi. 1986. Pengaruh
suhu penyimpanan dan kematangan
buah terhadap serangan antraknose
pada lombok. Buletin Penelitian Horti-
kultura 13 (1): 40-50.
Baker, C.J., J.R. Stanley, C.A. Thomas, M.
Sasser, and J.S. MacFall. 1983. Inhi-
bitory effect of Bacillus subtilis on
Uromyces phaseoli and on develop-
Suhardi
ment of rust pustules on bean leaves.
Phytopathology 73: 1148-1152.
Baker, C.J., J.R. Stanley, and N. Mock. 1985.
Biocontrol of bean rust by Bacillus
subtilis under field condition. Plant
Dis. 69: 770-772.
Barkai-Golan, R. and D.J. Phillips. 1991.
Postharvest heat treatment of fresh
fruits and vegetables for decay control.
Plant Dis. 75: 1085-1089.
Belanger, R.R., C. Labbe, and W.R. Jarvis.
1994. Commercial-scale control of rose
powdery mildew with a fungal anta-
gonist. Plant Dis. 78: 420-424.
Chakraborty, S., D. Ratcliff, and F.J.
McKay. 1990. Effect of leaf surface
wetness on disease severity. Plant Dis.
74: 379-384.
Daryanto. 2003. Status penyebaran dan
kerugian nematoda sista kuning pada
tanaman kentang. Makalah Lokakarya
Nematoda Sista Kuning, Yogyakarta
11-12 Desember 2003. 8 hlm.
Departemen Pertanian. 1999. Pestisida
untuk Pertanian dan Kehutanan. Ko-
misi Pestisida, Departemen Pertanian,
Jakarta. 279 hlm.
Djatnika, I., C. Hermanto, dan Eliza. 2003a.
Pengendalian penyakit layu fusarium
pada tanaman pisang dengan Pseu-
domonas fluorescens dan Gliocladium
sp. J. Hort. 13(3): 205-211.
Djatnika, I., Sunyoto, dan Eliza. 2003b.
Peranan Pseudomonas fluorescens
MR96 pada penyakit layu Fusarium
tanaman pisang. J. Hort. 13(3): 212-218.
Ebenebe, E.C. 1980. Onion twister disease
caused by Glomerella cingulata in
Northern Negeria. Plant Dis. 64: 1030-
1032.
Fitt, B.D.L., H.A. McCartney, and P.J.
Walklate. 1989. The role of rain in
dispersal of pathogen inoculum. Ann.
Rev. Phytopatol. 27: 241-270.
Ekobiologi patogen: perspektif dan penerapannya ...
Fitzell, R.D. and C.M. Peak. 1984. The
epidemiology of anthracnose disease
of mango: Inoculum sources, spore
production, and dispersal. Ann. Appl.
Biol. 104: 53-59.
Grubben, G.J.H. 1990. Timing of vegetable
production in Indonesia. Buletin Peneli-
tian Hortikultura (Edisi Khusus)XVIII
(1): 43-53.
Hanudin dan B. Marwoto. 2003. Pe-
ngendalian penyakit layu bakteri dan
akar gada pada tanaman tomat dan
caisin menggunakan Pseudomonas
fluorescens. J. Hort. 13(1): 58-66.
Hoitink, H.A., Y. Inbar, and M.J. Boehm.
1991. Status of compost-amended
potting mixes naturally suppresive to
soil-borne diseases of floriculture
crops. Plant Dis. 75: 869-873.
Hsu, ST, C.C. Chen, H.Y Liu, and K.C.
Tzeng. 1992. Colonization of roots and
control of bacterial wilt of tomato by
fluorescent pseudomonads. p. 305-311.
In G.L. Hartman and A.C. Hayward
(Eds.). Bacterial Wilt. ACIAR Proc. no.
45: 381 pp.
Huang, Y., B.J. Deverall, and S.C. Morris.
1991. Promotion of infection of orange
fruits by Penicillium digitatum with a
strain of Pseudomonas cepacia.
Phytopathology 81: 615-618.
James, W.C. 1983. Crop loss assessment.
In CMI, Plant Pathologist’s Packet
Book. Commonwelth Agriculture
Bureaux, England.
Jones, J.B., A.R. Chase, B.K. Harbough,
and B.C. Raju. 1985. Effect of leaf
wetness, fertilizer rate, leaf age, and
light intensity before inoculation on
bacterial spot of chrysanthemum. Plant
Dis. 69: 782-784.
Korsten,L., E.E. De Villiers, F.C. Wehner,
and J.M. Kotze. 1997. Field sprays of
Bacillus subtilis and fungicides for
127
control of preharvest fruit diseases of
avocado in South Africa. Plant Dis. 81:
455-459
Koster, W.G. 1990. Exploratory survey on
shallot in rice-based cropping system
in Brebes. Buletin Penelitian Horti-
kultura (Edisi Khusus) XVIII (1): 19-30.
Marwoto, B. dan D. Rohana. 1988. Pe-
ngaruh berbagai tanaman sayuran
terhadap produksi cabai dan serangan
Meloidogyne spp. dalam sistem tum-
pang sari. Buletin Penelitian Horti-
kultura XVI (1): 54-59.
Merriman, P.R., R.D. Price, J.F. Kallmogan,
T. Piggott, and E.H. Ridge. 1974. Effect
of seed inoculation with Bacillus
subtilis and Streptomyces griceus on
the growth of cereal and carrots. Aust.
J. Agric. Res. 25: 219-226.
Mooi, J.C., H. Vermeulen, and Suhardi.
1980. Recommendation for future
screening of potato cultivars for re-
sistance to late blight (Phytophthora
infestans) in Indonesia. Buletin Pene-
litian Hortikultura VIII (4): 19-25.
Mulya, K. 1997. Penekanan perkembangan
penyakit layu bakteri tomat oleh
Pseudomonas fluorescens PfG 32. J.
Hort. 7 (2): 685-691.
Mulyadi, B. Rahayu, B. Triman, dan S.
Indarti. 2003. Identifikasi nematoda
sista kuning (Globodera rostochien-
sis) pada kentang di Batu, Jawa Timur.
Jurnal Perlindungan Tanaman Industri
9 (1): 46-53.
Northover, J. and J.A. Matteoni. 1986. Re-
sistance of Botrytis cinerea to be-
nomyl and iprodion in vineyards and
greenhouse after exposure to the
fungicide alone or mixed with captan.
Plant Dis. Reptr. 70: 398-402
Nurmalinda, T.A. Sutrisno, A. Hidayat, dan
Suwandi. 1994. Analisis biaya dan
pendapatan petani bawang merah pada
128
lahan bekas tanaman tebu. Buletin
Penelitian Hortikultura XXVI (3): 61-66.
Patterson, C.L. 1991. Importance of
chlamidospores as primary inoculum
for Alternaria solani Incitant of collar
rot and early blight on tomato. Plant
Dis. 75: 274-278.
Polley, R.W. 1983. Disease forecasting.
p.122-129. In Plant Pathologist’s
Pocketbook (2nd). CAB, England.
Purwantara, A. 1988a. Perkecambahan
spora Colletotrichum gloeosporioides
penyebab bercak daun, mati pucuk dan
busuk buah pada kakao. Seminar Ilmiah
PFI, Segunung, 24 Agustus 1988. hlm.
112-125.
Purwantara, A. 1988b. Pengaruh penyi-
naran matahari dan ultraviolet 254 nm
serta temperatur terhadap viabilitas
spora Colletotrichum gloeosporioi-
des. Seminar Ilmiah PFI, Segunung, 24
Agustus 1988. hlm. 100-111.
Pusey, P.L., C.L. Wilson, M.W. Hotchkiss,
and J.L. Franklin. 1986. Compatibility
of Bacillus subtilis for postharvest
control of peach brown rot with
commercial fruit waxes, dicloran and
cold storage conditions. Plant Dis. 70:
587-590.
Raid, R.N. and S.P. Pennypacker. 1989.
Weeds as host of Colletotrichum
coccodes. Plant Dis. 71: 643-646.
Robert, D.A. and C.W. Boothroyd. 1972.
Fundamental of Plant Pathology. W.H.
Freeman and Co., San Fransisco etc.
402 pp.
Sastrahidayat, I.R., A.L. Abadi, dan S.
Djauhari. 1994. Peramalan penyakit
antraknose pada tanaman cabai besar.
hlm. 195-209. In U. Kasumbogo et al.
Prosiding Seminar Hasil Pendukung
Pengendalian Hama Terpadu, Lem-
bang, 27-28 Januari 1944.
Suhardi
Sato, N. 1979. Effect of soil temperature on
field infection of potato tubers by
Phytophthora infestans. Phytopatho-
logy 69: 989-993.
Setiawati, W. dan Suwandi. 1998. Pene-
rapan Pengendalian Hama Utama pada
Tanaman Bawang Merah dan Cabai
secara Terpadu. Laporan Kerja Sama
Penelitian Balai Penelitian Tanaman
Sayuran-ARMP. 84 hlm.
Setiawati, W. 2000. Analisis Pengaruh Pe-
nerapan Pengendalian Hama Terpadu
pada Komoditas Bawang Merah dan
Cabai. Laporan PAATP-Badan Litbang
Pertanian, Jakarta. 35 hlm.
Soetanto, L. dan A.J. Termarshuizen. 2001.
Potensi Pseudomonas fluorescens P60
sebagai agens hayati jamur-jamur
patogen tular tanah. hlm.183-186.
Prosiding Kongres Nasional XVI dan
Seminar Ilmiah PFI, Bogor 22-24
Agustus 2001.
Suhardi dan M. Bustaman. 1979. Penelitian
pendahuluan ras fisiologis Fusarium
oxysporum f.sp.lycopersici pada ta-
naman tomat (Lycopersicum esculen-
tum L.). Makalah Kongres Nasional V
dan Seminar Ilmiah PFI, Malang. 5 hlm.
Suhardi. 1980a. Taksiran kehilangan hasil
buncis oleh penyakit-penyakit daun.
Buletin Penelitian Hortikultura VIII (6):
15-18.
Suhardi. 1980b. Cendawan penyebab pe-
nyakit tanaman buncis di Jawa Barat.
Hortikultura 18: 401-409.
Suhardi. 1982. Beberapa Aspek Ekobiologi
Phytophthora infestans (Mont.) de
Bary dan Respons Tanaman Kentang
Terhadapnya. Tesis, Fakultas Pasca-
sarjana Institut Pertanian Bogor.
Suhardi. 1983. Dinamika populasi penyakit
busuk daun Phytophthora infestans
(Mont.) de Bary pada tanaman kentang
Ekobiologi patogen: perspektif dan penerapannya ...
di Kebun Percobaan Segunung. Bu-
letin Penelitian Hortikultura X (1): 36-
44.
Suhardi. 1984. Status resistensi beberapa
kultivar kentang (Solanum tuberosum
L.) terhadap Phytophthora infestans.
Buletin Penelitian Hortikultura XV (1):
24-28.
Suhardi dan A. Wasito. 1990. Pengaruh in-
terval penyemprotan fungisida dan
sistem tanam terhadap insidensi Cer-
cospora capsici Heald&Wolf dan
busuk buah cabai (Capsicum annuum
L.). Buletin Penelitian Hortikultura XIX
(3): 87-93.
Suhardi, T. Koestoni, dan A. Thomas. 1993.
Pengujian teknologi PHT pada bawang
merah berdasarkan nilai ambang kendali
dan modifikasi tipe nozel alat semprot.
Buletin Penelitian Hortikultura XXVI
(4): 100-107.
Suhardi dan B. Hadisutrisno. 1994. Efi-
siensi penggunaan fungisida pada va-
rietas bawang merah yang toleran ter-
hadap penyakit. hlm. 373-384. Pro-
siding Seminar Hasil Penelitian Pen-
dukung PHT, Lembang, 27-28 Januari
1994.
Suhardi. 1995. Kajian Antraknose pada
Bawang Merah: Khususnya tentang
Pengaruh Lingkungan terhadap Per-
kembangan Penyakit. Disertasi. Univer-
sitas Gadjah Mada, Yogyakarta. 165
hlm.
Suhardi. 1996a. Pengaruh fungisida ter-
hadap pemencaran dan perkembangan
antraknose pada bawang merah. J.
Hort. 6(1): 40-48.
Suhardi. 1996b. Pengaruh waktu tanam dan
perlakuan fungisida terhadap inten-
sitas serangan antraknose pada ba-
wang merah. J. Hort. 6(2): 172-179.
Suhardi. 1997. Inang pengganti dari
Colletotrichum gloeosporioides pe-
129
nyebab antraknose pada bawang
merah. hlm. 491-493. Prosiding Kongres
Nasional XIV dan Seminar Ilmiah,
Palembang, 27-29 Oktober 1997.
Suhardi. 1998. Pengaruh penyemprotan
awal fungisida terhadap intensitas
penyakit pada baberapa varietas ba-
wang merah. J. Hort. 8(1): 1021-1030.
Suhardi, T.R. Omoy, dan B. Winarto. 2002.
Keefektifan Xanthomonas maltophi-
lia, fungisida, dan tipe cerat terhadap
penyakit embun tepung pada tanaman
mawar di rumah plastik. J. Hort. 12(1):
50-54.
Suryaningsih, E. dan A.A. Asandhi. 1992.
Pengaruh pemupukan sistem berim-
bang terhadap serangan penyakit
cendawan pada bawang merah (Allium
ascalonicum L.) cv. Bima. Buletin
Penelitian Hortikultura XXIV(2): 19-26.
Turner, J.T. and P.A. Backman. 1991.
Factors relating to peanut yield in-
creases after seed treatment with Ba-
cillus subtilis. Plant Dis. 75: 347-353.
Wastie, R.L. 1972. Secondary leaf fall of
Hevea brasiliensis: Factor affecting the
production, dermination and viability
of Colletotrichum gloeosporioides.
Ann. Appl. Biol. 72: 273-282.
Wilson, L.L., L.V. Madden, and M.A. Ellis.
1990. Influence of temperature and
wetness duration on infection of
imature and mature strawberry fruit by
Colletotrichum acutatum. Phyto-
pathology 80: 111-116.
Wilson, C.L., A.E. Ghaouth, E. Chalutz, S.
Droby, C. Stevens, J.Y. Lu, V. Khan, and
J. Arul 1994. Potential of induced re-
sistance to control postharvest di-
seases of fruits and vegetables. Plant
Dis. 78: 837-844.
Winarto, B. and Suhardi. 1997. Pengaruh
tingkat pertumbuhan dan periode
lembap terhadap serangan Diplo-
130
carpon rosae pada mawar. J. Hort. 7(3):
795-801.
Winarto, B. 1998a. Pengaruh konsentrasi
dan interval aplikasi bakteri antagonis
terhadap penyakit embun tepung pa-
da tanaman mawar. J. Hort. 8(3): 1184-
1190.
Winarto, B. 1998b. Pengaruh kombinasi
bakteri antagonis, konsentrasi dan
interval aplikasinya terhadap bercak
hitam (Diplocarpon rosae Wolf.). hlm.
Suhardi
159-171. Risalah Seminar Nasional
Tanaman Hias. Pusat Penelitian dan
Pengembangan Hortikultura, Jakarta.
Yang, X.B. and D.O. TeBeest. 1992. Rain
dispersal of Colletotrichum gloeo-
sporioides in simulated rice field con-
dition. Phytopatology 82: 1219-1222.
Zadoks, J.C. and R.D. Schein. 1979. Epi-
demiology and Plant Disease Mana-
gement. Oxford Univ. Press, New York
etc. 427 pp.