ANGGOTA KELOMPOK:
SANDRIAKANA 155090101111001
DINDA SHERLYNDRA H 155090101111002
AYU TRI AGUSTIN 155090101111003
LINA ALIFAH 155090101111004
HARY ISNANTO 155090101111005
JURUSAN BIOLOGI
FAKULTAS MATEMATIKA DAN ILMU PENGETAHUAN ALAM
UNIVERSITAS BRAWIJAYA
MALANG
2017
BAB I
PENDAHULUAN
1.2 Tujuan
Tujuan dari penelitian ini yaitu
1. Menganalisis peranan microRNA terhadap regulasi gen dalam keadaan normal
2. Menganalisis peranan microRNA pada kanker
BAB II
TINJAUAN PUSTAKA
MicroRNA merupakan bagian dari RNA yang tidak dikode / diterjemahkan (non-coding
RNA) yang terdiri dari 19-24 nukelotida yang mengtur stabilitas dan translasi mRNA. microRNA
(microRNA) dibentuk dari microRNA primer (pri-microRNA) yang ditranskrissikan oleh RNA
polimerasi II dengan ekor cap dan poli A. kemudian microRNA primer dirombak dengan bantuan
ribonuklease III Drosha dan protein pengikat DNA untaian ganda. Pasha/DCGR8 menjadi
struktur pre0microRNA berbentuk seperti jepit rambut yang mengandung 70-100 nukleotida,
kemudian diekspor ke sitoplasma oleh exportin 5/Ran GTP. Setelah itu, enzim ribonukleasi III
memproses pre-microRNA menjadi microRNA dupleks yang besarnya 19-24 nukleotida. Enzim
tersebut juga mengawali pembentukan RNA induces silencing complex dengan cara mengikat
dupleks microRNA. microRNA dapat ditranskripsikan sebagai unit tunggal atau sebagai cluster.
microRNA yang ditranskripsikan sebagai cluster disebut sebagai polycistronis microRNA
(Bhagavathi dan Czader, 2010).
MicroRNAs (microRNA) mengatur fungsi fisiologis dimana mengatur program transkripsi
dan translasi, dank arena hal tersebut microRNA juga mengatur proses patologis seperti,
perkembangan sel, differensiasi sel, proliferasi, apoptosis sel dan perkembangan tumor. Beberapa
penelitian menunjukkan adanya peran microRNA dalam pembentukan tumor, dimana diketahui
bahwa microRNA berperan sebagai onkogenik yang meningkatkan jumlah gen microRNA dan
mempengaruhi perubahan tingkat microRNA. MicroRNA terlibat dalam inisiasi, perkembangan
dan metastase pembentukan beberapa jenis tumor (Oliveto dkk., 2017).
(Oliveto dkk., 2017)
Gambar 1. Daftar tumor supresor microRNAs dan OncomiRs pada kanke
Mikro RNA (microRNA) dapat digunakan sebagai biomarker diagnotik dan prognostik
untuk pertumbuhan kanker dan metastasis. Pasien kanker yang telah didiagnosa kanker, pada
awalnya memiliki prognosis dan tingkat kelangsungan hidup yang lebih baik. MicroRNA relative
stabil karena ukurannya yang kecil dikembangakan dengan menganalisis ekspresi microRNA
yang dapat digunakan untuk alat menentukan keadaan kanker. microRNA bukan hanya digunakan
untuk menganalisis jaringan normal dan jaringan kanker saja, namun juga dapat digunakan untuk
membedakan subtipe yang bervariasi dari kanker payudara. Beberapa penelitian menunjukkan
bahwa Peningkatan miR-200 berkorelasi dengan tipe luminal sedangkan miR-205dan miR-145
yang rendah pada triple basal berhubungan pada kanker payudara negatif (Chan dan Wang,
2015).
Beberapa laporan lain menujukkan bahwa ekspresi microRNA mendiagnosa hasil kanker
yang terkait dengan progresi dan prognosis leukemia limfositik kronis (CLL). Kanker paru-paru,
diturunkan oleh miR-155 dan let-7a-2 dan dilaporkan memprediksi prognosis buruk [126].
Semakin banyak milRNA sebagai biomarker prognostic. Mikro RNA-7 dapat digunakan untuk
memprediksi keseluruhan pasien dan kelangsungan hidup bebas kambuhan pada kanker lambung.
Kandungan miR-191 yang rendah dan kadar miR-193a yang tinggi menunjukkan adanya
hubungan dengan kelangsungan hidup lebih pendek pada pasien melanoma. MiR-21 merupakan
sebuah oncomiR yang berfungsi sebagai indikator prognosis buruk di berbagai bidang jenis
kanker, termasuk kanker payudara, kanker hati, kanker paru-paru, dan kanker kolorektal. Induksi
hipoksia diidentifikasi sebagai penanda prognostic pasien kanker payudara. Ekspresi miR-210
yang tinggi terbukti memiliki korelasi terbalik dengan penyakit bebas dan kelangsungan hidup
secara keseluruhan untuk pasien kanker payudara. Beberapa studi melaporkan bahwa microRNA
tertentu dapat digunakan sebagai biomarker untuk memprediksi metastasis kanker. Tumor primer
dengan tingkat miR-335 dan miR-126 yang rendah memungkian adanya pengembangan
metastasis di lokasi sekunder di Indonesia pada pasien kanker payudara (Chan dan Wang, 2015).
Selain itu, microRNA juga dapat digunakan sebagai target dan alat terapeutik. Fakta
bahwa satu microRNA memiliki beberapa gen target membutuhkan pertimbangan saat
menggunakan microRNA sebagai terapi. Keuntungannya adalah kemampuannya untuk
menargetkan beberapa jalur terkait. Kelemahannya adalah penargetan dan kekhawatiran
spesifisitas. Setidaknya ada dua kemungkinan pendekatan untuk memanipulasi ekspresi
microRNA pada sel kanker. Khususnya, 1) terapi dasar microRNA: Pengenalan microRNA
antisense (AntimiRs) untuk memblokir fungsi mioplon onkogenik / metastasis- mempromosikan
microRNA atau re-introduksi sintetis microRNA (miR meniru) untuk meniru represor tumor atau
metastasis repressor microRNA yang berkurang atau hilang pada sel kanker. 2) Induksi ekspresi
microRNA: Strategi ini melibatkan penggunaan obat untuk mengendalikan ekspresi microRNA
dengan mengatur transkripsi atau pemrosesannya. Stabilitas dan pengiriman efektif ke lokasi
target tetap tantangan utama untuk terapi berbasis microRNA dan terapi mereka. Namun,
microRNA terapeutik akan secara sistemik dikirim ke aliran darah, beberapa modifikasi perlu
dibuat agar tidak disaring pada ginjal (molekul kurang dari 52 kDa akan disaring dan
diekskresikan dalam urin. Ukuran diperkirakan tidak dimodifikasi dsRNA adalah 7 ~ 20 kDa)
dan dihapus atau rusak oleh nukleases dan sel imun fagositik seperti makrofag. Beberapa
modifikasi kimia telah digunakan secara in vivo sampai saat ini (Chan dan Wang, 2015).
Dua bahan kimia modifikasi utama adalah 2'-O-methyl-group (OMe) yang dimodifikasi
oleh Oligonukleotida dan asam nukleat terkunci (LNA) yang dimodifikasi oligonukleoti, telah
banyak diterapkan untuk meningkatkan stabilitas oligonukleotida. Selain itu, modifikasi
oligonukleotida pada akhir 3 'menggunakan kolesterol telah ditunjukkan untuk meningkatkan
serapan seluler mereka. Re-introduksi miR-15a / 16-1 menyebabkan apoptosis sel pada leukemia
MEG01 dan menekan pertumbuhan tumor dalam model xenograft. Kanker payudara
menunjukkan potensinya dalam aplikasi terapeutik untuk membungkam metastasis miR, miR-
10b, dengan model tikus. Pengobatan sistemik pada tikus pembawa tumor dengan miR-10b
antagomir, 2'-O-methyl-group (OMe) yang sudah dimodifikasi, kolesterol terkonjugasi antisense
miR bisa menekan metastasis kanker payudara. Beberapa pengiriman miom-34a secara sistemik
campur dengan atelokolin mampu menghambat perkembangan kanker usus manusia. Selain itu,
terdapat peneliti lain yang mengembangkan LPH (asam liposom-polycation-hyaluronic)
formulasi nanopartikel yang sudah dimodifikasi dengan tumor-targeting single chain antibody
fragmen (scFv) untuk pengiriman miom-34a secara sistemik dalam sebuah murine dengan model
metastasis paru B6F10 dan terlihat berkurangnya tumor di paru. Sampai saat ini, miR-34a
meniru MRX34 adalah mimikri microRNA pertama yang maju pada percobaan klinis manusia
(Chan dan Wang, 2015).
Beberapa peneliti menunjukkan adanya kemungkinan penggunaan microRNA lain sebagai
bahan pembantu. Ekspresi berlebihan miR-205 pada payudara SKBR3 sel kanker dapat
meningkatkan daya tanggap terhadap tirosin Penghambat kinase Gefitinib dan Laptatinib dengan
menekan HER3. Cara lain untuk meningkatkan ekspresi endogen dari microRNA yang menarik
adalah dengan penggunaan Adeno Assosiation virus (AAV). Salah satu keuntungan utama
menggunakan AAV Sebagai vektor virus untuk tranport adalah ketersediaan sebuah nomor
serotipe AAV yang berbeda, yang memungkinkan terjadinya potensi spesifitas jaringan karena
sifat serotipe masing-masing. Tranport AAV dimediasi miR-26a tumorigenesis yang mereda pada
kanker hati dengan model tikus. Laporan lain menunjukkan bahwa memanipulasi ekspresi
microRNA bisa menjadi pendekatan untuk pengobatan dan terapi kanker berbasis microRNA
dalam kombinasi obat kanker lainnya juga bisa diperhatikan untuk meningkatkan rejimen baru
(Chan dan Wang, 2015).
BAB III
METODE
Eucaryotic Initiation Factor 6 (eIF6) berasosiasi dengan subunit ribosom 60S dan mampu
coimmunoprecipitate dengan kompleks Ago2-Dicer-TRBP. eIF6 bertindak sebagai faktor anti-
asosiasi, dengan mengikat subunit ribosom 60S akan mencegah pembentukan 80S aktif yang
diatur oleh modifikasi post-translational. Studi dilakukan pada sel manusia dan C. Elegans yang
memberikan suatu kesimpulan bahwa miRISC yang dikaitkan dengan eIF6, dapat mendelesi
pembentukan polysome dan mengganggu pembentukan ribosom 80S (Oliveto dkk, 2017).
Tahap pasca inisiasi, telah dibuktikan bahwa beberapa microRNA sepenuhnya berinteraksi
dengan polysom, sehingga selain menghambat translasi, target microRNA juga aktif
ditranslasikan. Sebagian besar microRNA berinteraksi dengan polysom khususnya let-7 yang
mampu melakukan penumpukan dengan polyribosom. Ketika translasi diblokir, dengan adanya
tekanan hipertonik atau perlakuan puromisin, microRNA tidak lagi berinteraksi dengan polysom,
yang berbeda dari target mRNA nya. Pada tahap ini microRNA terpisah dari polyribosom dan
terjadi reduksi elongasi translasi atau penurunan tahap pasca inisiasi. Kemampuan microRNA
dalam menghambat translasi juga dapat bergantung pada kekuatannya berinteraksi dengan
polyribosom, yaitu jumlah microRNA spesifik dalam polysom relatif terhadap jumlah totalnya
(Oliveto dkk, 2017).
Keterlibatan microRNA pada kanker berasal dari penelitian tentang leukemia limfositik kronis
(CLL). Croce dkk., menemukan bahwa dua microRNA, yaitu miR-15a dan miR-16-1 berasal dari
RNA polisistronik yang sama, yang ditranskripsi oleh daerah spesifik pada kromosom 13. Pada
kromosom 13 dari penderita CLL tersebut, sering ditemukan delesi miR-15a dan miR-16-1.
Analisis keseluruhan CLL pasien menunjukkan bahwa 69% terjadi delesi pada miR-15-a dan
miR-16-1. Croce dkk. juga menemukan bahwa terjadi lokalisasi gen microRNA ke fragile site
dan atau daerah genom yang sering menunjukkan perubahan kromosom (Oliveto dkk., 2017).
Pemetaan lengkap terhadap gen microRNA pada manusia mengungkapkan bahwa sebagian besar
microRNA dikaitkan dengan fragile site, breakpoint translokasi spesifik kanker, sequence
repetitif, dan CpG island (Reddy, 2015). Temuan tersebut menunjukkan bahwa microRNA
merupakan gen kelas baru yang penting dalam regulasi patogenesis kanker dan perkembangannya
(Oliveto dkk., 2017).
Adanya polimorfisme nukleotida tunggal (Single Nucleotide Polymorphism) telah terbukti
dapat mempengaruhi target microRNA pada jalur yang berhubungan dengan kanker. SNP dapat
meningkatkan interaksi dengan target microRNA sehingga meningkatkan fungsi regulatory
microRNA sebagai gen penekan tumor (supresor tumor). Sebaliknya, SNP juga dapat
menyebabkan peningkatan ekspresi microRNA, yang kemudian bertindak sebagai onkogen
(Reddy, 2015).
Sama seperti gen pengkode protein klasik, gen microRNA dapat diubah oleh metilasi
promotor, amplifikasi kromosom, delesi dan aktivasi transkripsi. Perubahan genetik mungkin
saja dapat melibatkan microRNA machinery atau perubahan target binding site, pemrosesan
microRNA dan pengeditan post-transkripsinya. Pada kanker, disregulasi microRNA dapat
bertindak sebagai microRNA onkogen (oncomiR) berdasarkan kemampuan microRNA untuk
menekan ekspresi gen supresor tumor. Disregulasi microRNA dapat juga bertindak sebagai
microRNA supresor tumor berdasarkan kemampuan microRNA untuk menekan ekspresi okogen
(Gambar 8) (Oliveto dkk., 2017).
Penghambatan atau stimulasi yang dilakukan oleh oncomiR atau microRNA supresor tumor
dapat memodulasi proliferasi sel kanker, pertumbuhan tumor, pembentukan metastasis, dan
ketahanan hidup sel (cell survival) (Oliveto dkk., 2017). Metastasis merupakan proses multistep
yang memerlukan sel kanker untuk 1) terlepas dari tumor primer dan melakukan invasi melalui
membran basal ke jaringan terdekat, 2) memasuki pembuluh darah, 3) bertahan dalam sistem
sirkulasi, 4) keluar dari sistem sirkulasi pada metastatic sites, dan 5) tumbuh di lingkungan baru
dan membentuk tumor metastatis (Gambar 9) (Chan & Wang, 2015).
Umumnya, pada kanker terjadi overekspresi oncomiR (yang memodulasi protein penekan
tumor) dan delesi microRNA supresor tumor (yang menargetkan oncoprotein). Supresor tumor
berupa miR-15a dan miR-16-1 yang targetnya adalah Bcl-2, diregulasi dalam beberapa jenis
kanker, seperti mesothelioma, CLL, dan karsinoma prostat. Supresor tumor berupa let-7 memiliki
target yaitu RAS dan Myc. Sementara itu, oncomiR miR-21 mengalami overekspresi pada kanker
payudara, kanker usus besar, dan glioblastoma, dan menargetkan PTEN pada kanker non-small
cell lung. Selanjutnya, cluster microRNA yang paling banyak dipelajari antara lain, miR17-92
yang mampu menginduksi limfomagenesis pada sel B spesifik dari tikus transgenik, dan miR19,
miR20a, dan miR-92 yang mendukung perkembangan sel T pada tikus model (Oliveto dkk.,
2017).
Selain berfungsi sebagai supresor tumor atau onkogen, microRNA juga terlibat dalam migrasi
sel dan pembentukan metastasis. Pada kanker payudara, miR-10b meningkatkan invasi dan
migrasi sel dengan menargetkan HOXD10 dan memunculkan ekspresi gen RHOC pro-metastatik.
Contoh lainnya adalah miR-335 dan miR-126 yang bertindak sebagai regulator negatif metastasis
dan invasi tumor di paru-paru dan kanker payudara. Sebaliknya, miR-34a hilang di beberapa
tumor dan terlibat dalam jalur p53. Selain itu, miR-34a mampu menghambat migrasi dan invasi
dengan menurunkan ekspresi MET dalam sel HCC (Oliveto dkk., 2017).
. Kasus kanker paru-paru dan kanker hati mampu menunjukkan bahwa miR-30a dapat
menghambat EMT dengan menargetkan Snail sedangkan pada kanker lambung miR-30a melalui
penargetan vimentin mampu menekan motilitas sel. miR-204 atau miR-211 mampu menghambat
menghambat EMT dengan menargetkan TGF- 2 dan Slug. Dalam kasus kanker payudara,
ketika miR-9 menargetkan E-cadherin amka maningkatkan metastasis kanker payudara
sedangkan pada kasus kanker usus besar, miR-9 yang diaktifkan oleh PROX-1 dapat
menyebabkan down regulation pada E-cadherin (gambar 10) (Chang dan Wang, 2015).
BAB V
PENUTUP
5.1 Kesimpulan
Peranan microRNA terhadap regulasi gen pada keadaan normal yaitu microRNA berperan
dalam perkembangan, differensiasi sel, apoptosis dan dapat mengatur pematangan microRNA
lainnya. Selain itu, microRNA juga menghambat translasi saat sel sedang berproliferasi dan
memperantarai atau meningkatkan aktivasi saat sel sedang beristirahat. Interaksi antara
microRNA dengan RISC dapat menekan translasi (represi) atau degradasi microRNA. Represi
translasi dilakukan dengan 3 tahap yaitu inisiasi, post-inisiasi dan elongasi. Peranan microRNA
pada kanker yaitu sebagai supresor tumor atau onkogen. Hal ini dikarenakan microRNA
mempengaruhi pertumbuhan dan perkembangan tumor, invasi, kemampuan metastasis dan
angigenesis sel kanker.
DAFTAR PUSTAKA
Bhagavathi S. dan Magdalena Czader. 2010. MicroRNAs in Benign and Malignant
Hematopoiesis. Arch Pathol Lab Med 134: 1276-80.
Chan, Sih Hsuan dan Lu-Hai Wang. 2015. Regulation of Cancer Metastasis by microRNA.
Journal of Biomedical Science. Vol. 22: 9
Chen, bing., Hongbin Li, Xiao Zeng, Pengbo Yang, Xinyu Liu, Xia Zhao, dan Shufang Liang.
2012. Roles Of MicroRNA On Cancer Cell Metabolism. Journal of Translational
Medicine. Vol 10:228.
Moretti F, Thermann R, dan Hentze MW. 2010. Mechanism Of Translational Regulation By Mir-
2 From Sites In The 5 Untranslated Region Or The Open Reading Frame. RNA. Vol 16:
2493-2502.
Oliveto, Stefania,, dkk. 2017. Role of microRNAs in Translation Regulation and Cancer. World
Journal of Biological Chemsitry. Vol. 8(1): 45-56
Reddy, B Kladhar. 2015. MicroRNA (microRNA) in Cancer. Cancer Cell International. Vol. 15:
38
Zhou H, Rigoutsos I. 2014. Mir-103a-3p Targets The 5 UTR Of GPRC5A In Pancreatic Cells.
World J Biol Chem. Vol 20: 1431-1439.