Bab 14 Ribosom Dan Sintesis Protein S1-Rev-02

BIOLOGI SEL
RIBOSOM
RETNO WIDOWATI
FAKULTAS BIOLOGI
UNIVERSITAS NASIONAL
mRNA Translation (Basic).flv

RIBOSOM
• Organel sel tempat terjadinya sintesis protein
melalui proses yang disebut translasi.
• Ditemukan dalam sel prokariot dan eukariot.
Biologi Sel ‐ Retno Widowati http://classes.midlandstech.edu/carterp/Courses/bio101/chap14/chap14.htm

Fungsi Ribosom Bebas
• POLIPEPTIDA YANG DISINTESIS OLEH RIBOSOM BEBAS
• Ribosom bebas adalah ribosom yang tidak melekat pada RE
kasar. Polipeptida yang dihasilkan pada translasi diribosom
bebas adalah :
• Protein yang ditujukan berada di sitosol
• Misalnya : Enzim‐enzim untuk glikolisis
• Protein sitoskeleton
• Protein perifer pada membran plasma bagian dalam
• Misalnya : spectrin dan ankyrin
• Protein yang dikirim ke inti
• Protein yang akan bergabung dengan peroksisom, kloroplas,
dan mitokondria.
Biologi Sel ‐ Retno Widowati
RIBOSOM
• Merupakan suatu mesin yang secara akurat
mentranslasi kode genetik linier via mRNA ke
urutan linier asam amino hingga menghasilkan
protein
SINTESIS PROTEIN PADA PROKARIOT
Protein Synthesis by Translation of mRNA Animation.flv
Protein Synthesis Animation Video.flv

LOKASI RIBOSOM
• Semua sel mengandung ribosom, karena
pertumbuhan sel membutuhkan sintesis
protein baru secara berkelanjutan
• Di dalam sel eukariot, ribosom ditemukan di
sitoplasma, retikulum endoplasma kasar,
membran nukleus, mitokondria dan
kloroplasts .
http://biology.tutorvista.com/animal‐and‐plant‐cells/ribosomes.html
http://www.buzzle.com/articles/smooth‐
endoplasmic‐reticulum‐function.html
• Micrograph of rough
endoplasmic reticulum
network around the nucleus
(shown in lower right‐hand
side of the picture). Dark
small circles in the network
are mitochondria.
STRUKTUR RIBOSOM
• Terdiri dari 2 subunit : Subunit Besar dan
Subunit Kecil.
http://mol‐biol4masters.masters.grkraj.org/html/Protein_Synthesis5‐
Ribosome_as_Translation_Machine.htm
http://liberary‐online.blogspot.co.id/2014/09/ribosomes.html
• Sub unit kecil terbagi
menjadi daerah Head
(kepala), Base (dasar),
Cleft (celah), dan
Plattform
• Sub unit besar terbagi
menjadi daerah Stalk
(tangkai), Central
protuberance (tonjolan
central), Valley
(lembah), dan Ridge
(bukit)
http://mol‐
biol4masters.masters.grkraj.org/html/Protein_
Synthesis5‐
Ribosome_as_Translation_Machine.htm
Ukuran Ribosom
• Ukuran ribosom ditentukan melalui analisis
sedimentasi, yaitu berdasarkan kecepatan
molekul tersedimentasi dalam larutan pekat
(misalnya sukrosa) ketika disentrifugasi pada
kecepatan yang sangat tinggi (70.000 x g).
• Koefisien sedimentasi dinyatakan dengan S (S
singkatan dari Svedberg, orang pertama yang
mencipkatan ultrasentrifugasi).
Ukuran Ribosom
• Ribosom sel prokariot = 70S. Setiap ribosom
terdiri dari subunit kecil 30S dan subunit
besar 50S.
• Ribosom sel eukariot = 80S. Setiap ribosom
terdiri dari sebunit kecil 40S dan subunit
besar 60S).
• Ribosom dalam kloroplas dan mitokondria
sel eukariot = 70S juga terdiri dari subunit
kecil dan besar.
KOMPONEN RIBOSOM
• Ribosom terdiri dari molekul‐molekul RNA yang disebut
rRNA (ribosomal RNA) dan protein.
• Pada semua organisme ada dua macam ribosom. Yaitu

ribosom sub unit kecil dan ribosom sub unit besar.
• Pada sub unit kecil, jumlah basa RNA nya lebih sedikit dan

proteinnya lebih kecil, dibandingkan dengan sub unit besar.
• Ribosom sub unit kecil dan sub unit besar akan bergabung

menjadi satu disebut MONOMER bila sintesis protein aktif
dilakukan. Bila sintesis protein telah selesai, maka monomer
ribosom akan kembali berdisosiasi.
KOMPONEN RIBOSOM
• Komponen protein dan rRNA pada ribosom pada

prokariot dan eukariot
http://medicalentrance.blogspot.
co.id/2009_09_01_archive.html
rRNA 16 S pada prokariot dan eukariot
Ribosomal RNA
http://www.biologyexams4u.com/2013/02/difference‐between‐70s‐
Biologi Sel ‐ Retno Widowati and‐80s‐ribosomes.html#.VvnvgDHr6KF
Ukuran dan komposisi ribosom
sel prokariot dan eukariot
Eukariot Prokariot
Monomer
Koefisien sedimentasi 80 S 70 S
Ukuran dimensi 32 nm x 22 nm 29 nm x 21 nm
Berat molekul 4,5 x 106 Da 2,7x106 Da
Jumlah rRNA 4 3
Jumlah protein 70 55
Sub unit kecil
Berat molekul 1,5 x 106 Da 0,9 x 106 Da
rRNA 18 S 16 S
Jumlah nukleotida 1900 1542
Sub unit besar
Berat molekul 3,0 x 106 Da 1,55 x 106 Da
rRNA 5 S ; 5,8 S ; 28 S 5 S ; 23S
Jumlah nukleotida 120 ; 160 ; 5100 120 ; 2904
Ribosom Organel Sel
• Pada sitoplasma eukariot, ribosom ada dua keadaan,
ada yang melekat pada RE dan ribosom bebas. Secara
prinsip tidak ada yang berbeda antara ribosom yang
bebas dengan ribosom yang melekat pada RE.
• Selain ribosom di sitoplasma terdapat pula ribosom
pada organel‐organel sel. Hal ini disebabkan adanya
sifat semi otonom dari mitokondria dan kloroplast
yang memiliki DNA yang bisa ditranskripsi dan
ditranslasi. Karakteristik ribosom organel terdapat
pada tabel berikut.
Karakteristik Ribosom Organel
Koefisien sedimentasi
Partikel rRNA
Ribosom kloroplast
Monomer 70 S
Sub unit besar 50 S 5 S dan 23 S
Sub unit kecil 30 S 16 S
Ribosom mitokondria hewan
Monomer 50 – 60 S
Sub unit besar 40 – 45 S 16 – 18 S
Sub unit kecil 30 – 35 S 12 – 13 S
Ribosom mitokondria ragi, fungi, protista
Monomer 70 – 80 S
Sub unit besar 50 – 55 S 21 – 24 S
Sub unit kecil 32 – 38 S 14 – 16 S
Ribosom mitokondria tumbuhan tinggi
Monomer 70 – 80 S
Sub unit besar 50 – 60 S > 23 S
Sub unit kecil 40 – 44 S > 16 S
PEMBENTUKAN RIBOSOM
• Masing‐masing subunit ribosom disintesis di
nukleolus dalam nukleus.
• Protein ribosom di proses melalui transkripsi di
nukleus, lalu ditranslasi di sitoplasma.
• Protein‐protein penyusun ribosom dari sitoplasma
masuk ke dalam nukleus.
• RNA ribosom ditranskripsi di dalam nukleus.
• rRibosom setelah setelah selesai prosesing bergabung
dengan protein ribosom membentuk ribosom subunit
besar dan subunit kecil.
• Subunit ribosom keluar dari nukleus menuju
sitoplasma siap melakukan translasi
Sintesis Ribosomal RNA
Produk transkripsi
Prokariot
RNA polimerase tRNA; mRNA; rRNA
Eukariot
RNA polimerase I rRNA : 5,8 S; 18 S; 28 S
RNA polimerase II mRNA
RNA polimerase III rRNA 5 S; tRNA
Gen rRNA
• Dalam kehidupan sel, dibutuhkan banyak
sekali ribosom. Hal itu menjadikan gen rRNA
memiliki beberapa kopi gen dalam genom
sel, baik prokariot maupun eukariot.
Hal ini disebut reiteration.
• Pada E. coli diperkirakan jumlah kopi gen

rRNA antara 5 –10, setara dengan 0,4 %
genom.
http://www.cell.com/trends/plant‐science/fulltext/S1360‐
1385%2899%2901501‐0?large_figure=true
Excision of rRNAs and tRNAs from
30S precursor RNA
• In E. coli, the rrn operon is transcribed into a 30S

precursor RNA, containing 3 rRNAs and 2 tRNAs
http://www.bx.psu.edu/~ross/workmg/RNAPr
Biologi Sel ‐ Retno Widowati ocessingCh12.htm
• Ribosom prokariot
• Pada prokariot, di antara gen‐gen yang menyandikan
rRNA dengan berbagai ukuran terdapat urutan
nukleotida yang tidak berfungsi (spacer) serta gen tRNA
(Gambar). Setelah gen rRNA telah selesai ditranskripsi
dilakukan prosesing untuk memisahkan rRNA dengan
tRNA dan spacer.
• Hasil prosesing ini tidak ditranslasi menjadi protein.
• Ribosom prokariot
• Protein ribosom sub unit kecil prokariot diidentifikasi
sebagai protein S1, S2, S3 … S21.
• Protein sub unit besar diidentifikasi sebagai protein L1,
L2, L3 …. L34, tetapi hanya 31 protein yang berbeda
(dari 34 protein) .
• Protein‐protein ribosom tetap mengikuti prosedur
transkripsi dan translasi seperti protein lainnya.
• Protein‐protein ribosom akan melekat pada rRNA pada
tempatnya masing‐masing sesuai dengan yang
seharusnya.
Gen penyandi rRNA bakteri
Transkripsi dan prosesing rRNA prokariotik
Gen rRNA Sel Eukariot
• DNA ribosom (rDNA) adalah urutan DNA yang
mengkode RNA ribosom.
• rDNA eukariota terdiri dari pengulangan tandem
dari segmen Unit, sebuah operon, terdiri dari
NTS, ETS, 18S, ITS1, 5.8S, ITS2, dan 28S.
• rDNA memiliki gen lain, coding untuk 5S rRNA,
yang terletak di genom di sebagian besar
eukariota.
• 5S rDNA juga hadir dalam mengulangi tandem
Tandem Gen rRNA
• Segmen gen rRNA eukariotik mengandung 18S, 5.8S, dan 28S
dan membentuk cluster tandem berulang; 5S rRNA
dikodekan secara terpisah.
• NTS, nontranscribed spacer, ETS, external transcribed spacer,
ITS, Internal Transcribes Spacer 1 and 2, numbered from 5'
end.
https://en.wikipedia.org/wiki/Ribosomal_DNA
Gen rRNA Sel Eukariot
• Dalam inti, wilayah rDNA kromosom
divisualisasikan sebagai nucleolus yang membentuk
loop kromosom diperluas dengan rDNA.
• rDNA ini daerah juga disebut daerah organizer
nucleolus (Nucleolar Organizing Region (NOR),
karena mereka menimbulkan nukleolus.
• Dalam genom manusia ada 5 kromosom dengan
daerah organizer nucleolus: kromosom akrosentrik
13,14,15,21 dan 22.
Biologi Sel ‐ Retno Widowati http://staff.um.edu.mt/acus1/Nucleolus.htm

• Collecting nucleolus (SNuk) made up by the NOR of 6
chromosomes (pair A, I and K). The small dot‐like
structures (arrows) are telomeric heterochromatin.
Scale bar represents 10 µm.
http://www.nenno.it/phaseolus‐polytene‐chromosomes/nor
http://vle.du.ac.in/mod/book/print.php?id=9345
• The 3 pairs of NO‐chromosomes (red) with loci of the ribosomal
18S‐25S rDNA probe (yellow‐green) corresponding to the NOR
(arrow heads). Detached short arms are indicated by double‐
headed arrows. The scale bar represents 10 µm.
See also: Ribosomal RNA genes (rDNA)
http://www.nenno.it/phaseolus‐polytene‐chromosomes/rdna
Peta daerah ribosomal DNA (Deak 2008)
Transkripsi dan prosesing rRNA eukariotik
Pembentukan rRNA eukariot
• Ribosom eukariot
• Pada daerah NOR terdapat banyak kopi
gen rRNA 45 S. Pada saat transkripsi,
terlihat seperti bentuk bulu ayam atau
pohon natal yang disebut sebagai unit
matriks.
• Pada bentuk bulu ayam itu setiap
untainya merupakan fibril‐fibril RNA
yang ditranskripsi. Unit matriks ini disela
dengan spacer yang tidak ditranskripsi.
• Walaupun gen rRNA 5 S tidak berada

dalam NOR namun gennya pun berkopi http://www.sciencephoto.com/media/
209651/view
banyak.
Pembentukan rRNA eukariot Biologi Sel ‐ Retno Widowati
Sintesis dan pembentukan komponen ribosom
eukariot
http://vle.du.ac.in/mod/book/print.php?id=9345
PEMBENTUKAN RIBOSOM
http://course1.winona.edu/sberg/ILLUST/fig16‐29.jpg
NOR
• Chromosomes are treated with silver nitrate solution which
binds to the Nucleolar Organizing Regions (NOR), i.e., the
secondary constrictions (stalks) of acrocentric chromosomes
http://web.udl.es/usuaris/e465086
9/docencia/practiques_on‐
line/cariotips/nous_cariotips/metod
es/nor‐staining.html
Bacterial ribosome translating RNA into protein.flv
• http://www.uic.edu/classes/phar/phar331/lectur
e3/
• http://www.bx.psu.edu/~ross/workmg/RNAProc
essingCh12.htm
• http://www.desertbruchid.net/4_GB_LectureNot
es_f/4_GB_11_DNA_Spr2003.html
• http://classes.midlandstech.edu/carterp/Courses
/bio101/chap14/chap14.htm
• http://vle.du.ac.in/mod/book/print.php?id=9345

Bab 14 Ribosom Dan Sintesis Protein S1-Rev-02

Diunggah oleh

Informasi Dokumen

Judul Asli

Hak Cipta

Format Tersedia

Bagikan dokumen Ini

Bagikan atau Tanam Dokumen

Opsi Berbagi

Apakah menurut Anda dokumen ini bermanfaat?

Apakah konten ini tidak pantas?

Hak Cipta:

Format Tersedia

Bab 14 Ribosom Dan Sintesis Protein S1-Rev-02

Diunggah oleh

Hak Cipta:

Format Tersedia

BIOLOGI SEL

mRNA Translation (Basic).flv

Biologi Sel ‐ Retno Widowati http://classes.midlandstech.edu/carterp/Courses/bio101/chap14/chap14.htm

Protein Synthesis Animation Video.flv

• Pada semua organisme ada dua macam ribosom. Yaitu

• Pada sub unit kecil, jumlah basa RNA nya lebih sedikit dan

• Ribosom sub unit kecil dan sub unit besar akan bergabung

• Komponen protein dan rRNA pada ribosom pada

• Pada E. coli diperkirakan jumlah kopi gen

• In E. coli, the rrn operon is transcribed into a 30S

• Hasil prosesing ini tidak ditranslasi menjadi protein.

Biologi Sel ‐ Retno Widowati http://staff.um.edu.mt/acus1/Nucleolus.htm

• Walaupun gen rRNA 5 S tidak berada

Anda mungkin juga menyukai