ASPEK-ASPEK MOLEKULER PEMBELAHAN SEL DAN REPLIKASI DNA

Pembelahan Sel : adalah suatu proses membelah atau membaginya satu sel induk menjadi dua
atau lebih sel anak dan bertujuan untuk pertumbuhan dan perkembangan, mengganti sel-sel yang
telah rusak atau mati, berkembang biak, serta variasi individu baru.
 Sel yang membelah disebut dengan sel induk
 Hasil dari pembelahan sel induk dinamakan dengan sel anak

Macam-macam cara pembelahan sel :

1. Pembelahan Sel Secara Amitosis (Pembelahan Biner)

Pembelahan amitosis atau pembelahan biner merupakan proses pembelahan secara
langsung. Pembelahan sel amitosis adalah proses pembelahan dari 1 sel menjadi 2 sel tanpa
melalui fase-fase atau tahap-tahap pembelahan sel. Pembelahan biner dimulai dengan
pembelahan inti sel menjadi dua, kemudian diikuti pembelahan sitoplasma dan sel terbelah
menjadi dua sel anakan.
Setiap terjadi pembelahan biner, satu sel akan membelah menjadi dua sel yang identik (sama
satu sama lain). Sel anak mewarisi sifat induknya sehingga pembelahan amitosis menghasilkan
turunan yang sifat sel anaknya identik dengan sel induknya. Pembelahan biner tergolong
pembelahan sel organisme tingkat rendah.
Pembelahan biner banyak dilakukan organisme uniseluler (bersel satu), seperti bakteri,
Amoeba, parameciu, dan mikroalga (alga bersel satu yang bersifat mikroskopis(alga biru)).
Pembelahan biner dapat terjadi pada organisme Prokariotik (tidak mempunyai membran inti
sel seperti, bakteri ) atau Eukariotik (tidak mempunyai membran inti sel ).
TAHAPAN PEMBELAHAN BINER / AMITOSIS PROSES PEMBELAHAN SEL PADA AMOEBA
Organisme tingkat rendah
Sel induk

Tumbuh membelah

Sel Anak

PROSES PEMBELAHAN SEL ORGANISME TINGKAT RENDAH BAKTERI

2. Pembelahan Mitosis (Tidak Terjadi Reduksi Jumlah Kromosom)
Pembelahan mitosis adalah proses pembelahan inti sel menjadi dua inti sel baru melalui
tahap-tahap tertentu dan menghasilkan sel anak dengan jumlah dan jenis kromosom yang sama
dengan sel induknya. Dari satu sel lalu menjadi dua sel anak identik, masing-masing sel anak
mewarisi kromosom yang sama banyak dengan kromosom induknya. Jika sel induk memiliki
2n kromosom, setiap sel anak juga memiliki 2n kromosom.
Pembelahan mitosis dimulai saat inti sel membelah, setelah diikuti pembelahan
sitoplasma.Mitosis merupakan pembelahan sel yang terjadi pada organisme eukariot.
Pembelahan sel secara mitosis terjadi pada jaringan somatik. Mitosis merupakan periode
pembelahan sel yang berlangsung pada jaringan titik tumbuh (meristem), seperti pada ujung
akar atau pucuk tanaman.
Fase mitosis tersebut terjadi pada sel tumbuhan maupun hewan. Pada makhuk hidup
seperti halnya hewan dan manusia, proses pembelahan sel secara mitosis terjadi pada bagian
sel-sel meristem somatis (bagian-bagian dari sel tubuh yang realtif masih muda) yang akan
mengalami suatu proses pertumbuhan dan perkembangan. Sedangkan pada tumbuhan yang
memiliki dan mampu berbunga, pertumbuhan dan perkembangan terbesar akan terjadi pada
bagian-bagain ujung akar dan juga bagian-bagian ujung batang. Proses pembelahan sel secara
mitosis juga terjadi pada bagian sel-sel meristem yang ada pada kedua tempat tersebut.

Pembelahan mitosis disebut juga pembelahan biasa yang memiliki ciri-ciri antara lain:
1. Pembelahan berlangsung satu kali
2. Jumlah sel anak yang dihasilkan adalah dua buah
3. Jumlah kromosom sel anak sama dengan jumlah kromosom pada induknya, yaitu 2n
(diploid)
4. Sifat sel anak sama dengan sifat pada induknya
5. Terjadi pada sel tubuh (sel somatik) misalnya pada jaringan embryonal antara lain ujung
akar, ujung batang, lingkaran kambium
6. Tujuan pembelahan mitosis adalah untuk memperbanyak sel-sel seperti pertumbuhan atau
perbaikan sel yang rusak
7. Melewati tahapan pembelahan yaitu interfase, profase, metafase, anafase,dan telofase,
namun secara umum tahap-tahap tersebut akan kembalike tahap semula sehingga
membentuk suatu siklus sel.
Tahap-Tahap Pembelahan Mitosis meliputi fase-fase berikut :
1. Fase interfase disebut juga fase istirahat karena tidak menampakkan tanda-tanda
pembelahan. Pada fase ini terjadi peristiwa pertumbuhan dan pengumpulan energi yang
besar untuk persiapan pembelahan sel. Proses interfase memerlukan waktu yang paling
lama. Interfase dapat dibedakan menjadi tiga, antara lain:
a. fase pertumbuhan primer
b. fase sintesis, pada fase ini terjadi sintesa DNA dan organel sel
c. fase pertumbuhan sekunder
Selama interfase, kromosom tidak kelihatan karena benang-benang kromatin tidak
berpilin. Interaksi antara DNA, RNA, dan protein terjadi selama tahap-tahap tertentu dari
interfase
2. Fase Mitotik merupakan fase terjadinya replikasi kromosom. Fase inimeliputi, tahap-
tahap berikut :
a. Profase pada tahap ini bagian dari benang-benang kromatin akan terjadi suatu proses
memendek dan juga menebal dan akan membentuk sebuah kromosom. Kemudian,
pada setiap bagian kromosom akan melakukan proses membelah dan juga memanjang
menjadi dua bagian, yakni pada masing-masing anak dari kromosom yang sering
disebut dengan kromatid, dan pada bagian dinding inti akan mulai melakukan proses
melebur.
Ciri-ciri yang dimiliki oleh tahap profase adalah sebagai berikut :
Di bagian dalam karioteka (membran inti))
 Pada bagian-bagian dari nukleolusakan menghilang.
 Terjadi proses pembentukan pada kromosom yang terbentuk dari benang-benang
kromosom.
 Pada bagian karioteka (yang sering disebut dengan membran inti) akan
menghilang dan terjadi proses pemecahan.
 Terjadi proses duplikasi (penggandaan) pada bagian-bagian dari kromosom dan
kemudian menjadi kromatid.
 Selanjutnya kromatid hasil dari duplikasi (penggandaan) akan melakukan suatu
proses pelekatan pada bagian dari sentromer.
Di bagian luar karioteka (membran inti)
 Akan terlihat dua pasang sentriol (ini biasanya terjadi khusus pada sel hewan saja)
yang kemudian dikelilingi oleh aster, yang terbentuk menjadi sentrosom.
 Pada bagian sentriol akan mengalami pergerakan menuju ke bagian kutub yang
mempunyai arah berlawanan karena aster. Aster merupakan benang-benang
spindel yang akan membentuk suatu bangunan menyerupai bentuk bintang.
 Benang-benang spindel tersebut akan melakukan proses pengikatan kromosom-
kromosom pada bagian konetokor pada sebuah sentrosom.
b. Metaphase pada tahap ini, bagian dari benang-benang yang terdiri dari sepasang
kromatid akan menuju ke bagian-bagian tengah dari sel dan akan langsung
menempatkan dirinya pada bagian bidang tengah dari sel-sel tersebut. Bidang ini biasa
disebut dengan bidang ekuator. Bidang ekuator merupakan suatu bidang tempat
terjadinya proses pembelahan sel.
Ciri-ciri yang dimiliki oleh tahap metafase adalah sebagai berikut :
 Terjadi suatu proses peleburan karioteka (membran inti) secara sempurna.
 Benang-benang spindel akan menempati daerah-daerah bekas inti.
 Kromatid akan melakukan pergerakan menuju ke arah bidang ekuator atau
disebut dengan bidang pembelahan dan kemudian sentromernya akan terikat
dengan benang-benang spindel.
 Kromatid akan berjajar di sepanjang bidang ekuator atau bidang pembelahan
c. Anaphase pada tahap ini, pada kedua bagian kromatid akan memisahkan dirinya dari
pasangannya dan akan melakukan pergerakan menuju ke bagian ujung atau bagian
kutub sel-sel yang mempunyai arah saling berlawanan. Mulai pada waktu tersebut,
pada bagian kromatid akan berlaku sebagai kromosom yang baru.
Ciri-ciri yang dimiliki oleh tahap anafase adalah sebagai berikut :
 Bagian sentromer akan membelah menjadi dua bagian dan bagian kromatid akan
berpisah.
  Pada Benang-benang spindel antar bagian kromosom dan juga bagian sentriol
akan memendek sehingga masing-masing kromosom akan tertarik ke bagian
kutub yang mempunyai arah berlawanan.
 Tarikan pada benang-benang spindel di bagian kromosom adalah sebagai akibat
dari proses kontraksi pada bagian mikrotubulus.
 Kromosom sudah sampai pada masing-masing bagian kutubnya.
 Serat-serat antara kromosom akan mengalami perenggangan sehingga bagian sel
akan menjadi memanjang.
d. Telophase pada tahap ini, pada setiap bagian dari kutub akan terbentuk kromosom-
kromom yang memiliki sifat identik. Maka bagian dari dinding inti sel-sel akan
mengalami proses pembentukan kembali. Pada bagian dari plasma sel yang akan
terbagi menjadi dua bagian yang sama biasa disebut dengan tahap sitokinesis.
Tahap sitokinesis yang terjadi pada sel hewan ditandai dengan proses terbentuknya
bagian dari membran sel. Sedangkan yang terjadi pada pada sel tumbuhan, biasanya
ditandai dengan proses terbentuknya bagian dari dinding sel
Ciri-ciri yang dimiliki oleh tahap telofase adalah sebagai berikut :
 Pada bagian benang-benang spindel yang memiliki fungsi sebagai pengantung
kromosom akan hilang (aster akan menghilang).
 Pada bagian karioteka (membran inti) akan terbentuk kembali pada setiap bagain-
bagian kutub dari sel dan juga akan melingkupi pada bagian kromosom.
 Kromosom akan mengalami sebuah proses yang dinamakan dekondensasi yang
menjadi kromatin.
 Bagian nukleolus akan mengalami pembentukan kembali.
 Bagian matrik pada sitoplasma akan kembali dalam kondisi yang jernih.
 Terjadi suatu proses penebalan pada bagian dari plasma (proses ini biasa disebut
sebagai plasmakinesis) pada bagian-bagian bidang ekuator yang memiliki peran
sebagai langkah awal dalam proses sitokinesis.
 Terbentuk selaput-selaput pemisah pada bagian -bagian bidang ekuator / bidang
pembelahan (sebagai proses sitokinesis) dan juga akan terbentuk dua buah sel-sel
anak yang baru.
Tahapan Fase Mitosis

Kromosom
induk =
kromosom anak
2n=2n (diploid)
Satu sel
menjadi dua sel

2n 1=2

2n
 PEMBELAHAN SEL PADA ORGANISME TINGKAT TINGGI (EUKARIOT)
Fase interfase
G1(tumbuh) = pembesaran ukuran nucleus,
penambahan volume sitoplasma, pembentukan
DNA, pembentukan enzim untuk replikasi DNA,
pembentukan protein (berlangsung 5-6 jam).
S (sintesis) = replikasi DNA beserta protein
histon (berlangsung selama 6-12 jam).
G2 (pertumbuhan sekunder) = tumbuh dan
persiapan pembelahan mitosis, berlangsung 3-4
jam.

Fase Miotic
3. Pembelahan Meiosis (Terjadi Reduksi Jumlah Kromosom) = tahap-tahap pembelahan
Pembelahan meiosis adalah suatu proses terjadinya pembelahan sel pada sel-sel kelamin
dari organisme-organisme yang melakukan proses reproduksi dengan cara generatif atau
seksual. Pembelahan meiosis biasanya sering disebut dengan proses pembelahan sel secara
reduksi, karena proses yang dihasilkan adalah sel-sel anakan dengan jumlah kromosom
setengah / separuh dari kromosom indukannya. Peristiwa pindah silang (crossing over) tersebut
yang terjadi pada tahap profase I adalah penyebab terjadinya perbedaan antara sifat yang
dimilki pada sel-sel hasil pembelahan sel secara meiosis.
 Tujuan pembelahan untuk mempertahankan agar sejumlah bagian kromosom dari generasi
ke generasi yang saling turun temurun akan selalu tetap sehingga itu dapat membantu
mempertahankan terhadap eksistensi dari jenis-jenis yang ada.
Pembelahan meiosis terjadi melalui 2 proses yakni meiosis I dan meiosis II. Pada proses
meiosis I, biasanya akan terjadi proses reduksi pada kromosom, karena yang sudah terjadi
merupakan proses pembagian pada kromosom yang memiliki sifat homolog, sedangkan pada
proses meiosis II, merupakan pembelahan sel secara mitosis, karena yang akan terjadi adalah
tahapan pembagian pada kromatid bersaudara yang akan menjadi kromosom.
A. Tahap Meiosis I
1. Profase I pada tahap ini, benang-benang kromatin akan mengalami proses pemendekan
dan penebalan sehingga bisa membentuk sebuah kromosom. Pada setiap bagian dari
kromosom terdiri dari dua bagian kromatid yang akan bergabung dengan homolognya
sendiri. Proses tersebut biasanya dinamakan dengan proses sinapsis. Pada tahapan
profase I, terbagi menjadi beberapa bagian subfase yang berdasarkan struktur dan juga
tingkah laku dari kromosom. Berikut ini adapun ciri dari masing-masing subfase :
a. Leptonema / Leptoten adalah tahapan terjadinya penggandaan kromosom menjadi
kromatid kembar (sister chromatids).
b. Zigonema / Zigoten adalah tahapan terjadinya tiap kromosom homolog berpasangan
membentuk struktur bivalen yang dinamakan sinapsis. Tiap kromosom mengalami
penggandaan menjadi dua kromatid kembar yang mana tiap bivalen terdapat empat
kromatid kembar. Kompleks empat kromatid tersebut dinamakan tetrad.
c. Pakinema/Pakiten adalah tahapan terjadinya penampakan visual pertama kalinya
struktur tetrad. Tahapan ini juga mulai terjadi pindah silang (crossing over), yakni
pertukaran materi genetik antara kromatid paternal (ayah) dengan kromatid maternal
(ibu).
 d. Diplonema/Diploten tahapan terjadinya penampakan secara visual tempat terjadinya
pindah silang yang disebut kiasma (jamak = kiasmata), Selain itu, juga akan terjadi
proses peningkatan seperti pada aktivitas-aktivitas transkripsi untuk melakukan proses
sintesis pada RNA.
e. Diakinesis adalah tahapan terjadinya perpindahan kiasma bergeser ke ujung kromosom.
Tiap kromatid anggota tetrad semakin pendek, menebal, dan bergerak ke arah bidang
ekuator sel. Nukleolus dan membran nukleus menghilang. Mikrotubulus / benang
spindel yang keluar dari sentriol semakin memanjang dan menempel pada kinetokor.
2. Metafase I pada fase ini, maka kromosom akan bergerak menuju bagian bidang ekuator
atau bidang pembelahan, dan pada kromosom yang memiliki sifat homolog akan tetap
saling bergandengan, dan juga chiasma akan tetap ada.
3. Anafase I pada fase ini, maka kromosom yang memiliki sifat homolog akan berpisah
dan juga bergerak ke bagian kutub yang saling berseberangan, chiasma dan proses
pindah silang (crossing over) akan selesai
4. Telofase I pada fase ini, akan terjadi proses sitokinesis sehingga akan terbentuk 2 buah
sel yang masing-masing pada bagian yang memiliki satu buah inti dengan bagian
sebelah dari kromosom yang memiliki sifat homolog. Pada setiap bagian kromosom
yang memiliki sifat homolog terdiri dari dua buah kromatid yang pada bagian
sentromernya masih saling bergabung satu dengan yang lainnya.

B. Tahap Meiosis II
Pada tahap meiosis II akan melewati beberapa fase, yakni sebagai berikut :
1. Profase II
Pada fase ini, biasanya diawali dengan proses pembelahan sel pada dua buah sentriol
sehingga bisa menjadi dua buah bagian dan juga akan bergerak menuju bagian kutub
yang saling berlawanan arah. Kemudian, mikrotubulus akan membentuk benang-
benang spindel dan juga membentuk membran inti. Selanjutnya nukleolus akan lenyap.
2. Metaphase II
Pada fase ini, bagian kromatid akan bergerak menuju ke bagian bidang ekuator atau
bidang pembelahan. Bagian sentromer yang terikat oleh benang-benang spindel yang
berasal dari bagian sentriol.
3. Anafase II
Pada fase ini, bagian kromatid yang berpisah akan membentuk sebuah kromosom
dengan bagian sentromernya sendiri-sendiri, selanjutnya akan bergerak menuju ke
bagian kutub yang saling berlawanan arah. Pada fase ini juga akan terbentuk sebuah
kromosom rekombinasi.
4. Telophase II
Pada fase ini, bagian kromosom yang telah sampai pada bagian kutub, dan selanjutnya
akan mengalami proses dekondensasi yang akan menjadi kromatin dan juga akan
terbentuk bagian selaput inti di bagian sekeliling oleh mikrotubulus. Proses berikutnya
adalah terjadi juga proses sitokinesis sehingga akan terjadi pembentukan 4 buah sel yang
baru.
Gambar Tahapan Fase Pembelahan Meiosis

TAHAP FASE PEMBELAHAN MEIOSIS

REPLIKASI DNA
Replikasi DNA adalah proses penggandaan DNA yang terjadi di dalam inti sel sebelum sel itu
membelah diri atau bisa diartikan sebagai proses perbanyakan rantai double helix DNA dengan
masing-masing untai DNA yang ada bertindak sebagai cetakan (template) untuk untai
komplementer yang baru. Tujuan dari replikasi untuk menggandakan DNA yang nantinya akan
diberikan kepada sel baru yang terbentuk.
Model Replikasi DNA

Model Replikasi DNA

Sebelum mekanisme replikasi DNA dapat dibuktikan secara eksperimental oleh Matthew dan
Franklin Sthal pada tahun 1958, ada tiga hipotesis yang berkembang mengenai mekanisme replikasi
DNA, antara lain model replikasi secara:
Semikonservatif : dikemukakan oleh Watson dan Crick, dimana setiap molekul untaian ganda
DNA anakan terdiri atas satu untaian-tunggal DNA induk dan satu untaian-tunggal DNA hasil
sintesis baru.
Konservatif. : Molekul DNA untaian-ganda induk tetap bergabung sedangkan kedua untaian
DNA anakan terdiri atas molekul hasil sintesis baru.
Dispersif, : menyatakan bahwa molekul DNA induk mengalami fragmentasi sehingga DNA
anakan terdiri atas campuran molekul lama (berasal dari DNA induk) dan molekul hasil sintesis
baru.
TAHAP REPLIKASI DNA
1. DENATURASI
Denaturasi akan berawal dari titik yang disebut ori (origins of replication) yang ditandai
adanya buble of replication, pembukaan ikatan hidrogen yang menyebabkan pembukaan
untaian DNA induk akan membentuk suatu struktur yang disebut garpu replikasi (replication
fork ) Dari awalan garpu replikasi inilah DNA iduk sebagai template akan terbuka secara
bertahap dan kemudian direplikasi. untaian DNA induk akan mengalami denaturasi yaitu
proses pemutusan ikatan hidrogen antara basa-basa nitrogen penyusun DNA, ikatan hidrogen
A-T dan G-C akan diputuskan melalui proses enzimatik oleh enzim gyrase pada prokariot,
 sedangkan pada eukariot oleh enzim helicase. Setelah untaian DNA induk terbuka maka agar
untai yang telah terbuka tidak berikatan kembali maka untai DNA induk akan diikat oleh
protein (Single Strand Binding ).
2. INISIASI SINTESIS DNA
Tahap pertama replikasi DNA adalah pemutusan ikatan basa nitrogen untuk membuka rantai
ganda DNA menggunakan enzim Helicase. Titik inisiasi dimana pemisahan dimulai disebut
“origin of replication”. Struktur ini disebut dengan Replication Fork (struktur yang terbentuk
ketika DNA mengalami replikasi karena kerja enzim helicas). Strand yang telah terpisah
kemudian diikat oleh Single Strand Binding protein (protein yang berfungsi melindungi untai
tunggal DNA agar tidak bergabung kembali setelah dipisahkan oleh helicase (menstabilkan
untai tunggal DNA) )untuk mencegah strand DNA menyatu kembali.
3. PEMANJANGAN UNTAIAN DNA
Lagging strand ialah untaian DNA yang terletak pada sisi yang berseberangan dengan leading
strand (untaian DNA yang disintesis dengan arah 5'→3' secara berkesinambungan oleh enzim
DNA polymerase) pada garpu replikasi. Untaian ini disintesis dalam segmen-segmen yang
disebut fragmen Okazaki. Perpanjangan pada “untaian DNA” oleh DNA polymerase
berlangsung sejalan dengan pembukaan untai DNA oleh helikase. Perpanjangan pada “untaian
DNA” diawali dengan penempelan RNA primer dengan bantuan primase lalu diikuti
perpanjangan oleh DNA polymerase. Maka pada untai “lagging strand” terbentuk fragmen-
fragmen DNA yang dipisahkan oleh RNA primer.
4. LIGASI FRAGMEN DNA
Ligasi adalah proses penyambungan antara satu fragmen DNA dengan fragmen DNA lainnya.
DNA yang akan disisipkan biasanya disambungkan dengan vektor pengklonan. Dalam proses
penggabungan (ligasi) antara dua molekul DNA memerlukan enzim sebagai perekat. Ada dua
enzim yang biasa digunakan untuk menggabungkan antara dua molekul DNA, yaitu enzim
yang dihasilkan oleh bakteri E. coli yang telah terinfeksi virus T4.
5. TERMINASI SINTESIS DNA (PEMUTUSAN)
Proses diakhirinya replikasi dengan dihapusnya primer, diganti dengan DNA oleh DNA
polimerase, kemudian disambungkan oleh enzim ligase. Replikasi akan berhenti ketika DNA
polymerase mencapai akhir strand.

Gambar Replikasi DNA

(1) Lagging strand (10) Protein
(2) Leading strand pengikat untaian
tunggal
(3) DNA polymerase
(11) Topoisomerase
(4) Enzim DNA ligase
(5) Primer
(6) Primase;
(7) Fragmen Okazaki
(8) Molekul DNA polymerase;
(9) Enzim helicase
 GAMBAR JALANNYA REPLIKASI DNA

Komponen Penting dalam Replikasi

No Nama Enzim Keterangan Fungsi

1 Helikase (DnaB) memutuskan ikatan-ikatan hidrogen yang menyatukan kedua untaian DNA
sehingga terbentuk garpu/cabang replikasi

2 Topoisomerase mengurangi ketegangan superheliks DNA dengan menciptakan istirahat

sementara pada satu atau kedua untai DNA

3 Primase mensintesis RNA-primer

menghentikan perkembangan garpu/cabang replikasi untuk

mencegahleading strand melampaui lagging strand

mengawali pembentukan DNA baru pada leading strand atau DNA fragmen
Okazaki pada lagging strand oleh DNA Polimerase

4 DNA polimerase enzim utama yang mengkatalisi proses polimerisasi nukleotida menjadi
untaian DNA

menambahkan nukleotida bebas hanya pada ujung 3' dari rantai yang baru
terbentuk, sehingga terjadinya elongasi (pemanjangan) pada rantai baru
dengan arah dari ujung 5' ke ujung 3'

menggunakan gugus OH 3' bebas pada RNA-primer untuk mensintesis

DNA dengan arah 5'→3'
hanya bisa menambahkan nukleotida ke ujung 3' yang sudah ada, karena itu
butuh primer sehingga nukleotida dapat ditambahkan

5 DNA ligase menggabung fragmen-fragmen okazaki (lagging strand) saat proses

replikasi menyambung potongan-potongan DNA yang baru disintesis
TUGAS BIOMOLEKULER ASPEK -ASPEK MOLEKULER PEMBELAHAN SEL DAN
REPLIKASI DNA
Disusun oleh :
NIRANDA RISTANIA
1625010013
AGROTEKNOLOGI A