Struktur Nukleus, Mitokondria dan Kloroplast

Dwi Ari Pujianto

Departemen Biologi FKUI

Major intracellular compartment of an animal cell
Specialization of thylakoid membrane
Specialization of membrane function
Skema hipothesis asal usul (evolusi) beberapa organel
 Famili organel berdasarkan evolusinya

1. Nukleus dan cytosol
komunikasi lewat nuclear pore complexes

2. Organel yg masuk dlm jalur secretory and endocytic
ER, Golgi apparatus,
Endosomes, lysosomes, transport vesicles yg bermigrasi antar organel, peroxisomes

3. Mitokondria/Plastids (pada tumbuhan)

= Topologically equivalent
 Nukleus

Nuclear envelope

- Melingkupi DNA & membatasi nuclear compartment

- Terdiri atas 2 membran konsentris yang
- Terdapat pori-pori nukleus yg menembus membran

- Inner nuclear membrane
-mengandung protein spesifik yg bertindak sebagai

anchoring site untuk kromatin & nuclear lamina
(protein yang mensuport nuclear envelope)
- Outer nuclear membrane
-menyambung dengan ER membran
-Banyak terdapat ribosom yg terlibat dlm sintesa prot
- protein product ditransport ke ruang diantara
inner dan outer nucleus membrane (perinuclear space)

-Trafik 2 arah terjadi antara nukleus dan sitosol

-Histone, DNA dan RNA polimerase, gene regulatory prot
masuk nukleus
-tRNA & mRNA
keluar ke sitosol
 Nuclear Pore Complexes (NPCs)

• Terdapat pada semua sel eukariotik

• Setiap NPC
± 125 million daltons & tersusun ± 30 NPC protein (nucleoporin)
• Nucleoporins tersusun dalam multiple copies & berbentuk oktagonal
• Pada nuclear envelope mamalia terdapat 3000-4000 NPCs

• Seiap NPC
dapat mentransport sampai 500 makromolekul / detik

• Dapat mentransport dlm 2 arah pada waktu yang bersamaan
• Setiap NPC mengandung 1 atau lebih aqueous passages
Molekul yg larut dlm air
dapat berdifusi secara pasif

• Laju difusi tergantung ukuran molekul
≤ 5 kDa berdifusi cepat

≥ 60 kDa Sulit masuk melalui difusi pasif

• Size limit ini disebabkan oleh struktur NPC
unstructure region at central pore
• Molekul dengan MW 100-200 kDa
transport aktif
 NPC Subunits

• Column subunits
form the bulk of the pore wall

• Annular subunits
Centrally located

• Lumenal subunits
contain transmembrane protein,

anchored to the nuclear membrane

• Ring subunits
Form the cytosolic and nuclear faces of

the NPC
Susunan NPCs pada nuclear envelope
 Gated diffusion barrier of the NPC

Unstructured region form

a tangled meshwork
block passive diffusion of
large macromolecules
 Active import through NPCs

Transport Macromolekul

NPC vs Organel lain

NPCs
melalui aqueous pore

Organel lain
Prot transporter

NPCs
fully folded protein

Prot transporter
Unfolded prot
 Mitokondria

• Berbentuk silinder memanjang dengan diameter : 0.5-1 um

•Organel dengan double membrane
spesialisasi sebagai ATP synthesis
• Menggunakan energi dari transport elektron, phosphorilasi oksidatif dan fotosintesis
• Walaupun mempunyai DNA tersendiri, ribosom dan komponen lain untuk
sintesa protein
Sebagian besar protein disandi di dlm nukleus dan diimport
dari sitosol

• Terdapat 2 subkompartemen pada mitokondria

- internal matrix space
- intermembrane space

• Kedua subkompartemen dibentuk oleh 2 membran mitokondria yg konsentris

- Inner membrane, melingkupi matrik space dan membentuk
invaginasi yg ekstensif
cristae

- Outer membrane, kontak dengan sitosol

 Kloroplast

Kloroplast
2 subkompart + 1 subkompart extra yg disebut thylakoid space

yang dikelilingi oleh thylakoid membrane

Tiap subkompartemen mengandung set protein tertentu

 The structure of mitochondrion

Enzymes for oxidation of pyruvate,

Fatty acid, citric acid cycle, mito DNA
Enzyme for expession of mito DNA

Proteins for oxidation reaction, ATP synthase,

Transport protein

Chanel-forming proteins (a porin, VDAC)

Enzymes involved in mitochondrial lipid
Synthesis, etc

Several enzymes for ATP passing out of

the matrix to phosphorylate other nucleotides
 Protein translocators on matochondria membrane

• The TOM (Translocase of the outer mitochodrial membrane)

• TIM complexes (Translocase of the inner mitochondrial membrane)

(TIM23 & TIM22)

• SAM complex (sorting and assembly machinery)
Help protein to fold

properly

• OXA complex (Oxidase assembly protein)
mediate insertion of inner

membrane protein that are synthesized within mitochondria

• Hsp70
Chaperone protein
act as a motor to pull the precursor protein into
the matrix space
Protein translocators in the mitochondrial membrane
Energy-generating metabolim in mitochondria
STRUKTUR KLOROPLAS
Reaksi fotosintesis di dalam kloroplast
 References
• Karp G. Cell Biology. 6th Ed. John Wiley &
Son Inc.

• Albert B, Johnson A, Lewis J, Raff M,

Robert K, Walter P. Molecular Biology of
The Cell. 5th Ed. Garland Science, USA