JAWABAN LATIHAN

HANDOUT 1
1. Ilmu komputer adalah ilmu pengetahuan yang berisi tentang teori,
metodologi,desain dan imlementasi ,berhubungan dengan komputasi
,komputer,dan algoritmanya dalam perspektif perangkat lunak (software) maupun
perangkat lunak (hardware).
2. Artificial Inteligence dan Robotik adalah riset untuk membuat komputer dapat
meniru kecerdasan manusia. Contoh dalam kehidupan nyata adalah Netflix yaitu
sebuah layanan kontenon-demand yang menggunakan teknologi prediktif untuk
menawarkan rekomendasi berdasarkan reaksi,minat, pilihan,dan perilaku
konsumen. Contoh lainnya adalah Tesla sebuah teknologi mobil terbaik yang
meniadakan tenaga manusia yang dilengkapi fitur mengemudi
sendiri,kemampuan prediktif, dan inovasi teknologi mutlak.
3. Bioinformatika adalah ilmu yang mempelajari penerapan teknik komputasional
untuk mengelola danmenganalisis informasi biologis. Contoh dalam kehidupan
nyata bioinformatik adalah penggunaan bioinformatika untuk identifikasi Agent
penyakit baru diantaranya seperti SARS.
Golongan Bioinformatika:
 Biophysics
Biologi molekul sendiri merupakan pengembangan yang lahir dari
biophysics. Biophysics adalah sebuah bidang interdisipliner yang
mengaplikasikan teknik-teknik dari ilmu Fisika untuk memahami struktur dan
fungsi biologi (British Biophysical Society). Sesuai dengan definisi di atas,
bidang ini merupakan suatu bidang yang luas. Namun secara langsung disiplin
ilmu ini terkait dengan Bioinformatika karena penggunaan teknik-teknik dari
ilmu Fisika untuk memahami struktur membutuhkan penggunaan TI.
 Computational Biology
Computational biology merupakan bagian dari Bioinformatika (dalam arti
yang paling luas) yang paling dekat dengan bidang Biologi umum klasik. Fokus
dari computational biology adalah gerak evolusi, populasi, dan biologi teoritis
daripada biomedis dalam molekul dan sel. Tak dapat dielakkan bahwa Biologi
Molekul cukup penting dalam computational biology, namun itu bukanlah inti
dari disiplin ilmu ini. Pada penerapan computational biology, model-model
statistika untuk fenomena biologi lebih disukai dipakai dibandingkan dengan
model sebenarnya. Dalam beberapa hal cara tersebut cukup baik mengingat pada
kasus tertentu eksperimen langsung pada fenomena biologi cukup sulit. Tidak
semua dari computational biology merupakan Bioinformatika, seperti contohnya
Model Matematika bukan merupakan Bioinformatika, bahkan meskipun
dikaitkan dengan masalah biologi.
 Medical Informatics
Menurut Aamir Zakaria [ZAKARIA2004] Pengertian dari medical
informatics adalah "sebuah disiplin ilmu yang baru yang didefinisikan sebagai
pembelajaran, penemuan, dan implementasi dari struktur dan algoritma untuk
meningkatkan komunikasi, pengertian dan manajemen informasi medis." Medical
informatics lebih memperhatikan struktur dan algoritma untuk pengolahan data
medis, dibandingkan dengan data itu sendiri. Disiplin ilmu ini, untuk alasan
praktis, kemungkinan besar berkaitan dengan data-data yang didapatkan pada
level biologi yang lebih "rumit" --yaitu informasi dari sistem-sistem superselular,
tepat pada level populasi—di mana sebagian besar dari Bioinformatika lebih
memperhatikan informasi dari sistem dan struktur biomolekul dan selular.
 Cheminformatics
Cheminformatics adalah kombinasi dari sintesis kimia, penyaringan biologis,
dan pendekatan data-mining yang digunakan untuk penemuan dan pengembangan
obat (Cambridge Healthech Institute's Sixth Annual Cheminformatics
conference). Pengertian disiplin ilmu yang disebutkan di atas lebih merupakan
identifikasi dari salah satu aktivitas yang paling populer dibandingkan dengan
berbagai bidang studi yang mungkin ada di bawah bidang ini. Salah satu contoh
penemuan obat yang paling sukses sepanjang sejarah adalah penisilin, dapat
menggambarkan cara untuk menemukan dan mengembangkan obatobatan hingga
sekarang --meskipun terlihat aneh--. Cara untuk menemukan dan
mengembangkan obat adalah hasil dari kesempatan, observasi, dan banyak proses
kimia yang intensif dan lambat. Sampai beberapa waktu yang lalu, disain obat
dianggap harus selalu menggunakan kerja yang intensif, proses uji dan gagal
(trial-error process). Kemungkinan penggunaan TI untuk merencanakan secara
cerdas dan dengan mengotomatiskan proses-proses yang terkait dengan sintesis
kimiawi dari komponenkomponen pengobatan merupakan suatu prospek yang
sangat menarik bagi ahli kimia dan ahli biokimia. Penghargaan untuk
menghasilkan obat yang dapat dipasarkan secara lebih cepat sangatlah besar,
sehingga target inilah yang merupakan inti dari cheminformatics.
Ruang lingkup akademis dari cheminformatics ini sangat luas. Contoh bidang
minatnya antara lain: Synthesis Planning, Reaction and Structure Retrieval, 3-D
Structure Retrieval, Modelling, Computational Chemistry, Visualisation Tools
and Utilities.
 Genomics
Genomics adalah bidang ilmu yang ada sebelum selesainya sekuen genom,
kecuali dalam bentuk yang paling kasar. Genomics adalah setiap usaha untuk
menganalisa atau membandingkan seluruh komplemen genetik dari satu spesies
atau lebih. Secara logis tentu saja mungkin untuk membandingkan genom-genom
dengan membandingkan kurang lebih suatu himpunan bagian dari gen di dalam
genom yang representatif.
 Mathematical Biology
Mathematical biology lebih mudah dibedakan dengan Bioinformatika
daripada computational biology dengan Bioinformatika. Mathematical biology
juga menangani masalah-masalah biologi, namun metode yang digunakan untuk
menangani masalah tersebut tidak perlu secara numerik dan tidak perlu
diimplementasikan dalam software maupun hardware. Bahkan metode yang
dipakai tidak perlu "menyelesaikan" masalah apapun; dalam mathematical
biology bisa dianggap beralasan untuk mempublikasikan sebuah hasil yang hanya
menyatakan bahwa suatu masalah biologi berada pada kelas umum tertentu.
Menurut Alex Kasman [KASMAN2004] Secara umum mathematical biology
melingkupi semua ketertarikan teoritis yang tidak perlu merupakan sesuatu yang
beralgoritma, dan tidak perlu dalam bentuk molekul, dan tidak perlu berguna
dalam menganalisis data yang terkumpul.
 Proteomics
Istilah proteomics pertama kali digunakan untuk menggambarkan himpunan
dari protein-protein yang tersusun (encoded) oleh genom. Ilmu yang mempelajari
proteome, yang disebut proteomics, pada saat ini tidak hanya memperhatikan
semua protein di dalam sel yang diberikan, tetapi juga himpunan dari semua
bentuk isoform dan modifikasi dari semua protein, interaksi diantaranya,
deskripsi struktural dari protein-protein dan kompleks-kompleks orde tingkat
tinggi dari protein, dan mengenai masalah tersebut hampir semua pasca genom.
 Michael J. Dunn [DUNN2004], Pemimpin Redaksi dari Proteomics
mendefiniskan kata "proteome" sebagai: "The PROTEin complement of the
genOME". Dan mendefinisikan proteomics berkaitan dengan: "studi kuantitatif
dan kualitatif dari ekspresi gen di level dari protein-protein fungsional itu
sendiri". Yaitu: "sebuah antarmuka antara biokimia protein dengan biologi
molekul". Mengkarakterisasi sebanyak puluhan ribu protein-protein yang
dinyatakan dalam sebuah tipe sel yang diberikan pada waktu tertentu --apakah
untuk mengukur berat molekul atau nilai-nilai isoelektrik protein-protein
tersebut-- melibatkan tempat penyimpanan dan perbandingan dari data yang
memiliki jumlah yang sangat besar, tak terhindarkan lagi akan memerlukan
Bioinformatika.
 Pharmacogenomics
Pharmacogenomics adalah aplikasi dari pendekatan genomik dan teknologi
pada identifikasi dari target-target obat. Contohnya meliputi menjaring semua
genom untuk penerima yang potensial dengan menggunakan cara Bioinformatika,
atau dengan menyelidiki bentuk pola dari ekspresi gen di dalam baik patogen
maupun induk selama terjadinya infeksi, atau maupun dengan memeriksa
karakteristik pola-pola ekspresi yang ditemukan dalam tumor atau contoh dari
pasien untuk kepentingan diagnosa (kemungkinan untuk mengejar target
potensial terapi kanker).
Istilah pharmacogenomics digunakan lebih untuk urusan yang lebih "trivial"
-- tetapi dapat diargumentasikan lebih berguna-- dari aplikasi pendekatan
Bioinformatika pada pengkatalogan dan pemrosesan informasi yang berkaitan
dengan ilmu Farmasi dan Genetika, untuk contohnya adalah pengumpulan
informasi pasien dalam database.
 Pharmacogenetics
Tiap individu mempunyai respon yang berbeda-beda terhadap berbagai
pengaruh obat; sebagian ada yang positif, sebagian ada yang sedikit perubahan
yang tampak pada kondisi mereka dan ada juga yang mendapatkan efek samping
atau reaksi alergi. Sebagian dari reaksi-reaksi ini diketahui mempunyai dasar
genetik. Pharmacogenetics adalah bagian dari pharmacogenomics yang
menggunakan metode genomik/Bioinformatika untuk mengidentifikasi
hubungan-hubungan genomik, contohnya SNP (Single Nucleotide
Polymorphisms), karakteristik dari profil respons pasien tertentu dan
 menggunakan informasi-informasi tersebut untuk memberitahu administrasi dan
pengembangan terapi pengobatan. Secara menakjubkan pendekatan tersebut telah
digunakan untuk "menghidupkan kembali" obat-obatan yang sebelumnya
dianggap tidak efektif, namun ternyata diketahui manjur pada sekelompok pasien
tertentu.
Disiplin ilmu ini juga dapat digunakan untuk mengoptimalkan dosis
kemoterapi pada pasien-pasien tertentu. Gambaran dari sebagian bidang-bidang
yang terkait dengan Bioinformatika di atas memperlihatkan bahwa
Bioinformatika mempunyai ruang lingkup yang sangat luas dan mempunyai
peran yang sangat besar dalam bidangnya. Bahkan pada bidang pelayanan
kesehatan Bioinformatika menimbulkan disiplin ilmu baru yang menyebabkan
peningkatan pelayanan kesehatan.

4. Tokoh-tokoh dan Jasanya dalamIlmu Komputer

Peralatan Mekanik (Mulai tahun 1623)
 Tahun 1642, Blaise Pascal (1623-1662), menemukan kalkulator roda numerik
(numerical wheel calculator) yang digunakannya untuk perhitungan pajak. Kotak
persegi kuningan ini yang dinamakan Pascaline, menggunakan delapan roda putar
bergerigiuntuk menjumlahkan bilangan hingga delapan digit. Alat inimerupakan
alat penghitung bilangan berbasis sepuluh. Kelemahan alat ini adalah hanya
terbatas untuk melakukanpenjumlahan.
 Tahun 1694, seorang matematikawan dan filsuf Jerman,Gottfred Wilhem von
Leibniz (1646-1716) memperbaiki Pascaline dengan membuat mesin yang dapat
mengalikan. Alat mekanik ini bekerja dengan menggunakan roda-roda gerigi.
Peralatan Mekanik (Mulai tahun 1623)
 Tahun 1820, kalkulator mekanik mulai populer. Charles Xavier Thomas de
Colmar menemukan mesin yang dapat melakukan empat fungsi aritmatik dasar.
Kalkulator. mekanik Colmar, arithometer, mempresentasikan pendekatan yang
lebih praktis dalam kalkulasi karena alat tersebut dapat melakukan penjumlahan,
pengurangan, perkalian, dan pembagian.
 Tahun 1822 Charles Babbage mengusulkan suatu mesin untuk melakukan
perhitungan persamaan differensial. Mesin tersebut dinamakan Mesin
Differensial. Dengan menggunakan tenaga uap, mesin tersebut dapat menyimpan
program dan dapat melakukan kalkulasi serta mencetak hasilnya secara otomatis.
 Charles Babbage (1791-1871) inilah merupakan tokoh awal mula komputer yang
sebenarnya yang kita sebut sebagai“Bapak Komputer”
 Tahun 1832 Charles Babbage membuat komputer general-purpose yang pertama,
yang disebut Analytical Engine, dibantu oleh asistennya bernama Augusta Ada
King(1815-1842). Desain dasar dari Analytical Engine menggunakan kartu-kartu
perforasi/kartu plong (berlubang-lubang) yang berisi instruksi operasi bagi mesin
tersebut.
Alat Mekanik Elektronik
 Tahun 1889, Herman Hollerith (1860-1929) juga menerapkan prinsip kartu
perforasi/kartu plong (punch card) untuk melakukan penghitungan bagi Biro
Sensus Amerika Serikat. Hollerith menggunakan kartu perforasi untuk
memasukkan data sensus yang kemudian diolah oleh alat tersebut secara
mekanik. Sebuah kartu dapat menyimpan hingga 80 variabel. Selain memiliki
keuntungan dalam bidang kecepatan, kartu tersebut berfungsi sebagai media
penyimpan data. Tingkat kesalahan perhitungan juga dapat ditekan secara drastis.
Tahun 1896 Ia mendirikan Tabulating Machine Company pada tahun 1896 yang
kemudian menjadi International Business Machine (1924) Kartu perforasi
digunakan oleh kalangan bisnis dn pemerintahan untuk permrosesan data hingga
tahun 1960.
 Tahun 1931 Vannevar Bush (1890-1974) membuat sebuah kalkulator untuk
menyelesaikan persamaan differensial. Mesin tersebut dapat menyelesaikan
persamaan differensial kompleks yang selama ini dianggap rumit oleh kalangan
akademisi. Mesin tersebut sangat besar dan berat karena ratusan gerigi dan poros
yang dibutuhkan untuk melakukan perhitungan.
Alat Elektronik
 Tahun 1903, John V. Atanasoff dan Clifford Berry mencoba membuat komputer
elektrik yang menerapkan aljabar Boolean pada sirkuit elektrik. Pendekatan ini
didasarkan pada hasil kerja George Boole (1815-1864) berupa sistem biner
aljabar, yang menyatakan bahwa setiap persamaan matematik dapat dinyatakan
sebagai benar atau salah. Dengan mengaplikasikan kondisi benar- salah ke dalam
sirkuit listrik dalam bentuk terhubung-terputus, Atanasoff dan Berry membuat
komputer elektrik pertama di tahun 1940.
 Tahun 1941, Konrad Zuse, seorang insinyur Jerman membangun sebuah
komputer, Z3, untuk mendesain pesawat terbang dan peluru kendali. Howard H.
 Aiken (1900-1973), berhasil memproduksi kalkulator elektronik untuk US Navy.
Kalkulator tersebut berukuran panjang setengah lapangan bola kaki dan memiliki
rentang kabel sepanjang 500 mil. The Harvd-IBM Automatic Sequence
Controlled Calculator, atau Mark I, merupakan komputer relai elektronik.
 Tahun 1946, Electronic Numerical Integrator and Computer (ENIAC), yang
dibuat oleh kerjasama antara pemerintah Amerika Serikat dan University of
Pennsylvania. Terdiri dari 18.000 tabung vakum, 70.000 resistor, dan 5 juta titik
solder, merupakan mesin yang sangat besar yang mengkonsumsi daya sebesar
160kW. Komputer ini dirancang oleh John Presper Eckert (1919-1995) dan John
W. Mauchly (1907-1980), ENIAC merupakan komputer serbaguna (general
purpose computer) yang bekerja 1000 kali lebih cepat dibandingkan Mark I.
 Tahun 1945 Von Neumann mendesain Electronic Discrete Variable Automatic
Computer (EDVAC) pada dengan sebuah memori untuk menampung baik
program ataupun data. Teknik ini memungkinkan komputer untuk berhenti pada
suatu saat dan kemudian melanjutkan pekerjaannya kembali. Kunci utama
arsitektur von Neumann adalah unit pemrosesan sentral (CPU), yang
memungkinkan seluruh fungsi komputer untuk dikoordinasikan melalui satu
sumber tunggal.
 Tahun 1951, UNIVAC I (Universal Automatic Computer I) yang dibuat oleh
perusahaan Remington Rand, menjadi komputer komersial pertama yang
memanfaatkan model arsitektur von Neumann tersebut.
 Tahun 1958, Jack Kilby, seorang insinyur di Texas Instrument,mengembangkan
sirkuit terintegrasi (IC : integrated circuit) sehingga komputer menjadi semakin
kecil karena komponen-komponen dapat dipadatkan dalam chip.
 Tahun 1960 Sprery-Rand membuat komputer bernama LARC (Livermore
Advanced Research Computer)
 Tahun 1961 IBM membuat super komputer bernama Stretch. Komputerkomputer
ini, yang dikembangkan untuk laboratorium energi atom, dapat menangani
sejumlah besar data, sebuah kemampuan yang sangat dibutuhkan oleh peneliti
atom.
 Tahun 1971 Chip Intel 4004 yang dibuat pada membawa kemajuan pada IC
dengan meletakkan seluruh komponen dari sebuah komputer (central processing
unit, memori, dan kendali input/output) dalam sebuah chip yang sangat kecil.
 Tahun 1981, IBM memperkenalkan penggunaan Personal Computer (PC) untuk
penggunaan di rumah, kantor, dan sekolah.