1.

Enzim restriksi eksonuklease

- Definisi
- Contoh 1 (nama dan cara potong beserta asalnya)
Jawaban :
Definisi : Enzim restriksi eksonuklease adalah enzim yang mampu memotong
molekul asam nukleat single strand atau beberapa oligonukleotida pendek yang
hanya mengenali salah satu ujung asam nukleat, yaitu ujung 5′ atau ujung 3′.
Enzim restriksi eksonuklease penting dalam perbaikan DNA, rekombinan
genetik, pencegahan terjadinya mutasi, stabilitas genom dan lain-lain.
Contoh :
Eksonuklease ditemukan di archaea, bakteri dan eukariota. Di E. coli, ada 17
eksonuklease yang berbeda yang hadir termasuk poliminas DNA 1, 2 dan 3.
Beberapa DNA polymerase menunjukkan aktivitas proofreding eksonuklease 3’
sampai 5’.

Enzim EcoRI
Singakatan Kepanjangan Deskripsi
E Escherichia Genus
co coli Spesies
R RY13 Strain
I Urutan penemuan Urutan enzim ditemukan pada bakteri
2. Enzim restriksi endonuclease
- Definisi
- Contoh 1 (nama dan cara potong beserta asalnya)
Jawaban :
Definisi : Enzim restriksi endonuklease adalah enzim yang berperan untuk
memperoleh suatu urutan DNA dengan memotong genom DNA menjadi
fragmen-fragmen dengan cara memotong ikatan fosfodiester pada untaian DNA.
Contoh :

Enzim EcoRI
Singakatan Kepanjangan Deskripsi
E Escherichia Genus
co coli Spesies
R RY13 Strain
I Urutan penemuan Urutan enzim ditemukan pada bakteri
3. Cara pemotongan berujung tumpul (blunt atau flush end)
Jawaban :
Definisi : Enzim ini memotong secara simetris antara kedua utas DNA
sehingga menciptakan ujung tumpul.
Contoh :
Enzim SmaI
Singakatan Kepanjangan Deskripsi
S Serratia Genus
ma marcescens Spesies
I Urutan penemuan Urutan enzim ditemukan pada bakteri

4. Cara pemotongan berujung lancip atau lengket (sticky atau cohesive ends)
Jawaban :
Definisi : merupakan pola yang lebih mudah melekat (annealing) dengan
pasangan DNAnya sebab adanya ikatan basa antara ujung-ujung yang
menggantung.
 Ujung menggantung 5’ : enzim ini memotong secara asimetris pada situs
pemotongan memanjang pada ujung 5’. Contoh enzim yang menghasilkan
ujung menggantung 5’ adalah BamHI (Bacillus amyloliquefaciens)
endonuclease restriksi tipe II.
 Ujung menggantung 3’ : Enzim restriksi ini juga memotong secara
asimetris pada situs pengenalan, tetapi menghasilkan hasil pemotongan
memanjang pada ujung 3’. Contoh enzim yang menghasilkan pola seperti
ini adalah KpnI (Klebsiella pneumoniciae).