Material Reference for

SARS-CoV-2 Molecular Testing

WEBINAR INA EQAS, 29 AGUSTUS 2020

Olly Riani Agustini

PT. Diastika Biotekindo
PCR TESTING as a GOLD STANDARD….
 Peran Penting Pemeriksaan RT PCR SARS-CoV-2

Terjamin Mutunya

FOLLOW EPIDEMIOLOGY
DIAGNOSIS UP DASAR
KEBIJAKAN
Kemenkes Ketika pasien
menetapkan bahwa dinyatakan Study
PCR adalah test sembuh, maka Epidemiologi
Konfirmasi harus Swab 2x sebagai Dasar
berturut dengan penyusunan
hasil Negatif Kebijakan
https://covid19.kemkes.go.id/protokol-covid-19/kmk-no-hk-01-07-menkes-413-2020-ttg-pedoman-pencegahan-dan-
pengendalian-covid-19
 Situasi saat ini_Pemantapan Mutu
SARS-CoV-2

Pra Analysis : Menggunakan TCM,

SOP Pengumpulan, dilakukan dgn
Pengelolaan spesimen, Mengirimkan :
Penyimpanan reagen,
K3, Pencatatan & § 5 Spesimen
Pelaporan Positif pertama
Analisis : PMI PME § 10 Spesimen Negatif
Internal Control (dari pertama dikirim ke
kit deteksi) PusLitbangkes
Pasca Analisis :
Pencatatan, Utk pemeriksaan PCR :
Pelaporan, - 10 Spesimen Negatif
Dokumentasi
- 20 Spesimen Positif
Dikirim keduanya ke Litbangkes
Biomedis dan TekDasKes

KMK_No._HK.01.07-MENKES-413-2020_ttg_Pedoman_Pencegahan_dan_Pengendalian_COVID-19 ( Rev 5 ; hal 87-88 )

 TUJUAN PENGGUNAAN QC PADA MOLECULAR
SARS-CoV-2 TESTING
• Methods Validation (LoD)
– Assay manufacturers
– Labs set up assays as new.
– Labs change assays or add another assays.
• Lot to lot validation
– Like core labs, when reagent lot is changed
• External run control
– To use it every batch to verify result.
https://www.mlo-online.com/management/qa-qc/article/21146852/quality-control-for-
sarscov2-testing
 Frekwensi & Jumlah Kontrol
1 SARS-Cov-2 Testing
q WHO merekomendasikan
bahwa pengujian QC dilakukan dengan setiap proses dan
telah mencatat bahwa, "setiap pengujian amplifikasi asam
nukleat (NAAT) harus mencakup kontrol eksternal dan
internal dan laboratorium didorong untuk berpartisipasi
dalam kualitas eksternal. skema penilaian saat tersedia. ”

q Mikrobiologi College of American Pathologists (CAP) (MIC 65200)

untuk (QC Harian - Pengujian Berbasis Molekuler), “tes kuantitatif dan
kualitatif berbasis molekuler, kontrol dijalankan setidaknya setiap hari,
atau lebih sering jika ditentukan di instruksi pabrik, prosedur
laboratorium, dan ketika terjadi perubahan yang dapat mempengaruhi
hasil pasien. ”
ACHIEVE.
ELEVATE. Biorad Quality Systems Division

One Stop Solution for QC Management

• 3rd party control
• External Quality Assurance Service
( EQAS )
• URT™
Complete QC data management
• Unity™
Inter-laboratory comparison program

7
ACHIEVE.
ELEVATE.

8
ACHIEVE.
ELEVATE. What are the products?
● For Research Use Only

● This standard and negative are designed for use on

molecular diagnostic tests that detect SARS-CoV-2
nucleic acid from human specimens. The products are
not designed for use with either antigen diagnostic tests
or serological diagnostic tests.

● Molecular diagnostic tests

● Serological diagnostic tests (ex. ELISA, CLIA)
● Rapid diagnostics tests

10
ACHIEVE.
ELEVATE. Validate the Entire Process of a Molecular Assay

11
ACHIEVE.
ELEVATE.

Bentuk : Liquichek , frozen

12
ACHIEVE.
ELEVATE.

Bentuk : Liquichek , frozen

13
ACHIEVE.
ELEVATE. 5 of 5 gene targets for COVID-19!!

14
ACHIEVE.
ELEVATE. Introduction

The SARS CoV-2 Standard and SARS CoV-2 Negative

contain genomic DNA allowing laboratories to validate
the entire process of a molecular assay including
extraction, amplification, and detection.

15
ACHIEVE.
ELEVATE. Molecular diagnostic workflow

Assay Result
Patient Sample Sample Prep Assay
setup Analysis
Extraction DNA
PCR( for LDTs)
*Application :STD,RV, HPV

Automation
Real Time PCR

Sequencing

Manual Microarray

RNA

RT PCR → QPCR
PCR

16
ACHIEVE.
ELEVATE.

17
ACHIEVE.
ELEVATE. Indication for Use
TUJUAN PENGGUNAAN QC PADA MOLECULAR
SARS-CoV-2 TESTING

• Methods Validation (LoD)

– Assay manufacturers
– Labs set up assays as new.
– Labs change assays or add another assays.
• Lot to lot validation
– Like core labs, when reagent lot is changed
• External run control
– To use it every batch to verify result.

18 https://www.mlo-online.com/management/qa-
qc/article/21146852/quality-control-for-sarscov2-testing
ACHIEVE. Teknik pengerjaan bahan SARS-CoV-2
ELEVATE.
Standard / Negative
Misal : biasanya untuk Covid pengambilan sample dgn Swab

• Masukan swab kering ke dalam tabung mikro yang telah diisi 1 mL Lysis
Buffer
• Vortex selama 1 menit
• Spin Down
• Inkubasi pada suhu ruang selama 10 menit

§ Ambil RNA 200 uL untuk Deteksi

Dimulai dari sinilah

pengambilan bahan
Standard nya

19
 ACHIEVE.
ELEVATE. Efisiensi pemakaian Standard :

200.000 copies
/ mL
Of each Gen Target
&
75.000 copies/mL
Of gDNA

200 µl 10 µl

Ekstraksi Deteksi qPCR

40.000 copiesGenTarget 2.000 copies
GenTarget
300 µl
20 60.000 copies each Gen Target
22.500 copies gDNA
ACHIEVE.
ELEVATE. QC dapat dikatakan Masuk / Baik , jika :

• Memberikan Grafik yang jelas pada hasil analysis

• Hasil Standard/Positif -> CT value sebelum siklus ke
….. ( tergantung dari kit deteksi )
• Hasil Negatif -> Flat / NO CT

21
 TAKE HOME MESSAGE
ACHIEVE.
ELEVATE.

q Pemeriksaan PCR SARS-CoV-2 saat ini menjadi tes Confirmatory,

Sehingga harus terjamin kualitas hasilnya
q SARS-CoV-2 merupakan virus yang baru , sehingga diperlukan sebuah
Quality Control yang memiliki latar belakang gDNA dan berkualitas
sehingga dapat benar memonitor proses pemeriksaan PCR , mulai
dari Ekstraksi-Amplifikasi dan deteksi
q Quality Control saat pandemic seperti ini tidak bisa diabaikan , justru
harus jadi perhatian dan dilakukan untuk sebuah ketepatan diagnosa

22
ACHIEVE.
ELEVATE.

VIROTROL SARS CoV2

VIROCLEAR SARS CoV2

23
ACHIEVE.
ELEVATE. Quality Controls for Serological Tests

24
ACHIEVE.
ELEVATE.

Thank you!
#staysafe
#stayhealthy
#keepdoingQC
25 #Like & Subsscribe PDS Patklin
ACHIEVE.
ELEVATE.
UNTUK PERTANYAAN DAN INFORMASI, SILAHKAN HUB :

Group Product Manager ( Olly Riani ); riani@diastika.co.id +62878 7760 3035

Sales Manager ( Nurningsih ); nurningsih@diastika.co.id +62812 8049 2588

PIC Area Jakarta Pusat - Jakarta Utara - Kalimantan ( Ade) +62857 1144 9055
ade.feriyatna@diastika.co.id

PIC Area Jakarta Barat - Banten - Sumatera Bawah (Wibi) +62812 5812 2719
wibi.aldi@diastika.co.id

PIC Area Jakarta Selatan - Bogor (Hadi) +62812 1280 0410

marahadi@diastika.co.id

PIC Area Jawa Barat - Jawa Tengah (Zaki) +62813 2277 9370
zaki@diastika.co.id

PIC Area Jawa Timur - Bali - NTT - NTB (Priyo) +62822 6088 8748
priyo@diastika.co.id
26